Genes within 1Mb (chr6:139202158:A:G):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD


Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000024862 CCDC28A 428649 sc-eQTL 3.25e-01 -0.0922 0.0935 0.194 B L1
ENSG00000051620 HEBP2 798627 sc-eQTL 3.71e-01 -0.064 0.0714 0.194 B L1
ENSG00000112406 HECA 67078 sc-eQTL 6.98e-01 0.0354 0.0911 0.194 B L1
ENSG00000135597 REPS1 213897 sc-eQTL 1.94e-01 -0.104 0.0802 0.194 B L1
ENSG00000146386 ABRACL 173413 sc-eQTL 7.52e-01 -0.015 0.0473 0.194 B L1
ENSG00000164440 TXLNB -89840 sc-eQTL 1.53e-01 -0.166 0.115 0.194 B L1
ENSG00000164442 CITED2 -172490 sc-eQTL 3.51e-01 -0.0681 0.0729 0.194 B L1
ENSG00000226571 AL592429.2 -69204 sc-eQTL 1.10e-01 0.129 0.0807 0.194 B L1
ENSG00000024862 CCDC28A 428649 sc-eQTL 3.74e-01 -0.0919 0.103 0.194 CD4T L1
ENSG00000051620 HEBP2 798627 sc-eQTL 3.33e-01 -0.0671 0.0692 0.194 CD4T L1
ENSG00000112406 HECA 67078 sc-eQTL 4.94e-01 -0.0589 0.086 0.194 CD4T L1
ENSG00000135597 REPS1 213897 sc-eQTL 4.50e-01 -0.0511 0.0676 0.194 CD4T L1
ENSG00000146386 ABRACL 173413 sc-eQTL 2.80e-02 0.109 0.0491 0.194 CD4T L1
ENSG00000164442 CITED2 -172490 sc-eQTL 3.13e-01 -0.0855 0.0846 0.194 CD4T L1
ENSG00000231329 AL031772.1 -37495 sc-eQTL 4.95e-01 -0.0571 0.0835 0.194 CD4T L1
ENSG00000024862 CCDC28A 428649 sc-eQTL 8.03e-01 0.0284 0.113 0.194 CD8T L1
ENSG00000051620 HEBP2 798627 sc-eQTL 2.18e-01 -0.0914 0.074 0.194 CD8T L1
ENSG00000112406 HECA 67078 sc-eQTL 2.53e-01 -0.0927 0.081 0.194 CD8T L1
ENSG00000135597 REPS1 213897 sc-eQTL 7.73e-02 0.135 0.0758 0.194 CD8T L1
ENSG00000146386 ABRACL 173413 sc-eQTL 2.18e-02 0.0993 0.043 0.194 CD8T L1
ENSG00000164442 CITED2 -172490 sc-eQTL 2.26e-01 -0.0999 0.0823 0.194 CD8T L1
ENSG00000231329 AL031772.1 -37495 sc-eQTL 1.26e-01 -0.153 0.0998 0.194 CD8T L1
ENSG00000024862 CCDC28A 428649 sc-eQTL 2.90e-02 -0.247 0.112 0.2 DC L1
ENSG00000051620 HEBP2 798627 sc-eQTL 2.32e-02 -0.18 0.0789 0.2 DC L1
ENSG00000112406 HECA 67078 sc-eQTL 5.55e-01 -0.0552 0.0935 0.2 DC L1
ENSG00000135540 NHSL1 509587 sc-eQTL 4.19e-01 0.0842 0.104 0.2 DC L1
ENSG00000135597 REPS1 213897 sc-eQTL 9.90e-01 0.00115 0.0921 0.2 DC L1
ENSG00000146386 ABRACL 173413 sc-eQTL 4.96e-02 0.177 0.0894 0.2 DC L1
ENSG00000164442 CITED2 -172490 sc-eQTL 6.82e-01 -0.0439 0.107 0.2 DC L1
ENSG00000225177 AL590617.2 509610 sc-eQTL 5.47e-01 -0.0656 0.109 0.2 DC L1
ENSG00000024862 CCDC28A 428649 sc-eQTL 9.40e-01 -0.00629 0.0835 0.194 Mono L1
ENSG00000051620 HEBP2 798627 sc-eQTL 9.05e-01 0.00689 0.0578 0.194 Mono L1
ENSG00000112406 HECA 67078 sc-eQTL 8.61e-01 -0.0134 0.0762 0.194 Mono L1
ENSG00000135540 NHSL1 509587 sc-eQTL 5.01e-01 0.0735 0.109 0.194 Mono L1
ENSG00000135597 REPS1 213897 sc-eQTL 5.94e-01 -0.0341 0.0638 0.194 Mono L1
ENSG00000146386 ABRACL 173413 sc-eQTL 2.58e-01 0.094 0.0829 0.194 Mono L1
ENSG00000164442 CITED2 -172490 sc-eQTL 1.37e-01 0.131 0.0875 0.194 Mono L1
ENSG00000225177 AL590617.2 509610 sc-eQTL 7.43e-01 -0.0372 0.113 0.194 Mono L1
ENSG00000024862 CCDC28A 428649 sc-eQTL 6.53e-01 -0.0461 0.103 0.195 NK L1
ENSG00000051620 HEBP2 798627 sc-eQTL 9.80e-01 0.00226 0.0904 0.195 NK L1
ENSG00000112406 HECA 67078 sc-eQTL 7.03e-01 0.0338 0.0886 0.195 NK L1
ENSG00000135597 REPS1 213897 sc-eQTL 3.06e-01 -0.0863 0.0842 0.195 NK L1
ENSG00000146386 ABRACL 173413 sc-eQTL 2.29e-02 0.14 0.0609 0.195 NK L1
ENSG00000164442 CITED2 -172490 sc-eQTL 4.21e-01 -0.0659 0.0818 0.195 NK L1
ENSG00000024862 CCDC28A 428649 sc-eQTL 4.71e-01 -0.0861 0.119 0.194 Other_T L1
ENSG00000051620 HEBP2 798627 sc-eQTL 2.85e-01 -0.0824 0.0769 0.194 Other_T L1
ENSG00000112406 HECA 67078 sc-eQTL 8.79e-01 -0.0132 0.0864 0.194 Other_T L1
ENSG00000135597 REPS1 213897 sc-eQTL 1.18e-01 -0.145 0.0924 0.194 Other_T L1
ENSG00000146386 ABRACL 173413 sc-eQTL 1.22e-01 0.0939 0.0605 0.194 Other_T L1
ENSG00000164442 CITED2 -172490 sc-eQTL 5.73e-01 -0.0402 0.0712 0.194 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000024862 CCDC28A 428649 sc-eQTL 7.37e-01 -0.0464 0.138 0.194 B_Activated L2
ENSG00000051620 HEBP2 798627 sc-eQTL 8.05e-01 -0.0299 0.121 0.194 B_Activated L2
ENSG00000112406 HECA 67078 sc-eQTL 7.87e-01 0.0355 0.131 0.194 B_Activated L2
ENSG00000135597 REPS1 213897 sc-eQTL 2.58e-01 -0.156 0.137 0.194 B_Activated L2
ENSG00000146386 ABRACL 173413 sc-eQTL 4.15e-02 -0.253 0.123 0.194 B_Activated L2
ENSG00000164440 TXLNB -89840 sc-eQTL 3.74e-01 -0.0949 0.106 0.194 B_Activated L2
ENSG00000164442 CITED2 -172490 sc-eQTL 3.07e-01 0.137 0.134 0.194 B_Activated L2
ENSG00000226571 AL592429.2 -69204 sc-eQTL 6.26e-01 0.0654 0.134 0.194 B_Activated L2
ENSG00000024862 CCDC28A 428649 sc-eQTL 8.37e-01 -0.024 0.116 0.195 B_Intermediate L2
ENSG00000051620 HEBP2 798627 sc-eQTL 3.63e-01 -0.0735 0.0805 0.195 B_Intermediate L2
ENSG00000112406 HECA 67078 sc-eQTL 5.42e-01 -0.0615 0.101 0.195 B_Intermediate L2
ENSG00000135597 REPS1 213897 sc-eQTL 9.72e-01 -0.0038 0.109 0.195 B_Intermediate L2
ENSG00000146386 ABRACL 173413 sc-eQTL 8.22e-02 0.161 0.092 0.195 B_Intermediate L2
ENSG00000164440 TXLNB -89840 sc-eQTL 1.93e-01 -0.147 0.113 0.195 B_Intermediate L2
ENSG00000164442 CITED2 -172490 sc-eQTL 2.16e-01 -0.129 0.104 0.195 B_Intermediate L2
ENSG00000226571 AL592429.2 -69204 sc-eQTL 2.31e-02 0.256 0.112 0.195 B_Intermediate L2
ENSG00000024862 CCDC28A 428649 sc-eQTL 1.41e-01 -0.175 0.118 0.194 B_Memory L2
ENSG00000051620 HEBP2 798627 sc-eQTL 5.03e-01 -0.0597 0.0891 0.194 B_Memory L2
ENSG00000112406 HECA 67078 sc-eQTL 7.69e-01 -0.0301 0.102 0.194 B_Memory L2
ENSG00000135597 REPS1 213897 sc-eQTL 3.76e-01 0.0984 0.111 0.194 B_Memory L2
ENSG00000146386 ABRACL 173413 sc-eQTL 8.77e-01 -0.0136 0.0879 0.194 B_Memory L2
ENSG00000164440 TXLNB -89840 sc-eQTL 3.06e-01 -0.115 0.112 0.194 B_Memory L2
ENSG00000164442 CITED2 -172490 sc-eQTL 6.44e-01 0.0476 0.103 0.194 B_Memory L2
ENSG00000226571 AL592429.2 -69204 sc-eQTL 3.70e-01 0.113 0.126 0.194 B_Memory L2
ENSG00000024862 CCDC28A 428649 sc-eQTL 9.80e-01 -0.0028 0.112 0.194 B_Naive1 L2
ENSG00000051620 HEBP2 798627 sc-eQTL 2.30e-01 -0.0944 0.0784 0.194 B_Naive1 L2
ENSG00000112406 HECA 67078 sc-eQTL 3.68e-01 -0.0879 0.0974 0.194 B_Naive1 L2
ENSG00000135597 REPS1 213897 sc-eQTL 5.73e-01 -0.051 0.0903 0.194 B_Naive1 L2
ENSG00000146386 ABRACL 173413 sc-eQTL 6.66e-01 -0.0273 0.0632 0.194 B_Naive1 L2
ENSG00000164440 TXLNB -89840 sc-eQTL 6.86e-01 -0.0479 0.118 0.194 B_Naive1 L2
ENSG00000164442 CITED2 -172490 sc-eQTL 9.10e-01 -0.00974 0.0861 0.194 B_Naive1 L2
ENSG00000226571 AL592429.2 -69204 sc-eQTL 6.54e-01 0.0506 0.113 0.194 B_Naive1 L2
ENSG00000024862 CCDC28A 428649 sc-eQTL 4.51e-01 -0.0826 0.109 0.193 B_Naive2 L2
ENSG00000051620 HEBP2 798627 sc-eQTL 2.12e-01 0.0935 0.0746 0.193 B_Naive2 L2
ENSG00000112406 HECA 67078 sc-eQTL 1.16e-01 0.162 0.103 0.193 B_Naive2 L2
ENSG00000135597 REPS1 213897 sc-eQTL 4.60e-01 -0.0728 0.0983 0.193 B_Naive2 L2
ENSG00000146386 ABRACL 173413 sc-eQTL 6.36e-01 -0.0343 0.0724 0.193 B_Naive2 L2
ENSG00000164440 TXLNB -89840 sc-eQTL 6.45e-01 0.0529 0.115 0.193 B_Naive2 L2
ENSG00000164442 CITED2 -172490 sc-eQTL 3.41e-01 -0.111 0.117 0.193 B_Naive2 L2
ENSG00000226571 AL592429.2 -69204 sc-eQTL 4.83e-01 -0.0754 0.107 0.193 B_Naive2 L2
ENSG00000024862 CCDC28A 428649 sc-eQTL 9.55e-01 -0.00654 0.115 0.195 CD4_CTL L2
ENSG00000051620 HEBP2 798627 sc-eQTL 3.07e-01 -0.101 0.0988 0.195 CD4_CTL L2
ENSG00000112406 HECA 67078 sc-eQTL 9.73e-01 -0.00391 0.116 0.195 CD4_CTL L2
ENSG00000135597 REPS1 213897 sc-eQTL 7.24e-02 -0.201 0.111 0.195 CD4_CTL L2
ENSG00000146386 ABRACL 173413 sc-eQTL 1.62e-01 0.143 0.102 0.195 CD4_CTL L2
ENSG00000164442 CITED2 -172490 sc-eQTL 8.14e-01 0.0242 0.103 0.195 CD4_CTL L2
ENSG00000231329 AL031772.1 -37495 sc-eQTL 1.04e-01 -0.172 0.105 0.195 CD4_CTL L2
ENSG00000024862 CCDC28A 428649 sc-eQTL 2.01e-01 -0.139 0.108 0.194 CD4_Naive L2
ENSG00000051620 HEBP2 798627 sc-eQTL 4.70e-01 -0.0489 0.0677 0.194 CD4_Naive L2
ENSG00000112406 HECA 67078 sc-eQTL 6.57e-01 -0.0375 0.0844 0.194 CD4_Naive L2
ENSG00000135597 REPS1 213897 sc-eQTL 7.45e-01 -0.0244 0.0749 0.194 CD4_Naive L2
ENSG00000146386 ABRACL 173413 sc-eQTL 3.88e-01 0.0435 0.0503 0.194 CD4_Naive L2
ENSG00000164442 CITED2 -172490 sc-eQTL 1.37e-01 -0.127 0.0852 0.194 CD4_Naive L2
ENSG00000231329 AL031772.1 -37495 sc-eQTL 2.79e-01 -0.0938 0.0864 0.194 CD4_Naive L2
ENSG00000024862 CCDC28A 428649 sc-eQTL 4.55e-01 0.0797 0.106 0.194 CD4_TCM L2
ENSG00000051620 HEBP2 798627 sc-eQTL 1.18e-01 -0.124 0.0788 0.194 CD4_TCM L2
ENSG00000112406 HECA 67078 sc-eQTL 5.50e-01 -0.051 0.0852 0.194 CD4_TCM L2
ENSG00000135597 REPS1 213897 sc-eQTL 4.56e-01 -0.0602 0.0807 0.194 CD4_TCM L2
ENSG00000146386 ABRACL 173413 sc-eQTL 2.01e-02 0.144 0.0614 0.194 CD4_TCM L2
ENSG00000164442 CITED2 -172490 sc-eQTL 4.03e-01 -0.0774 0.0923 0.194 CD4_TCM L2
ENSG00000231329 AL031772.1 -37495 sc-eQTL 2.06e-01 -0.126 0.0995 0.194 CD4_TCM L2
ENSG00000024862 CCDC28A 428649 sc-eQTL 1.04e-01 -0.197 0.121 0.194 CD4_TEM L2
ENSG00000051620 HEBP2 798627 sc-eQTL 8.55e-01 0.0151 0.0826 0.194 CD4_TEM L2
ENSG00000112406 HECA 67078 sc-eQTL 1.44e-01 -0.138 0.0939 0.194 CD4_TEM L2
ENSG00000135597 REPS1 213897 sc-eQTL 3.43e-01 -0.0974 0.103 0.194 CD4_TEM L2
ENSG00000146386 ABRACL 173413 sc-eQTL 2.50e-01 0.0842 0.0731 0.194 CD4_TEM L2
ENSG00000164442 CITED2 -172490 sc-eQTL 6.62e-01 -0.0422 0.0962 0.194 CD4_TEM L2
ENSG00000231329 AL031772.1 -37495 sc-eQTL 5.07e-01 -0.0668 0.101 0.194 CD4_TEM L2
ENSG00000024862 CCDC28A 428649 sc-eQTL 3.75e-01 0.111 0.124 0.194 CD8_CTL L2
ENSG00000051620 HEBP2 798627 sc-eQTL 9.96e-01 0.000398 0.0889 0.194 CD8_CTL L2
ENSG00000112406 HECA 67078 sc-eQTL 8.00e-01 0.023 0.0906 0.194 CD8_CTL L2
ENSG00000135597 REPS1 213897 sc-eQTL 2.50e-01 0.112 0.0967 0.194 CD8_CTL L2
ENSG00000146386 ABRACL 173413 sc-eQTL 1.49e-02 0.19 0.0774 0.194 CD8_CTL L2
ENSG00000164442 CITED2 -172490 sc-eQTL 9.68e-01 -0.00367 0.0914 0.194 CD8_CTL L2
ENSG00000231329 AL031772.1 -37495 sc-eQTL 1.83e-02 -0.257 0.108 0.194 CD8_CTL L2
ENSG00000024862 CCDC28A 428649 sc-eQTL 7.34e-01 -0.04 0.118 0.194 CD8_Naive L2
ENSG00000051620 HEBP2 798627 sc-eQTL 1.02e-01 -0.123 0.0747 0.194 CD8_Naive L2
ENSG00000112406 HECA 67078 sc-eQTL 1.81e-01 -0.121 0.0904 0.194 CD8_Naive L2
ENSG00000135597 REPS1 213897 sc-eQTL 1.79e-01 0.122 0.0906 0.194 CD8_Naive L2
ENSG00000146386 ABRACL 173413 sc-eQTL 4.04e-01 0.0399 0.0477 0.194 CD8_Naive L2
ENSG00000164442 CITED2 -172490 sc-eQTL 4.20e-01 -0.0779 0.0964 0.194 CD8_Naive L2
ENSG00000231329 AL031772.1 -37495 sc-eQTL 4.53e-01 -0.083 0.11 0.194 CD8_Naive L2
ENSG00000024862 CCDC28A 428649 sc-eQTL 3.37e-01 -0.126 0.131 0.192 CD8_TCM L2
ENSG00000051620 HEBP2 798627 sc-eQTL 7.89e-01 -0.0247 0.0921 0.192 CD8_TCM L2
ENSG00000112406 HECA 67078 sc-eQTL 7.12e-01 0.0355 0.0958 0.192 CD8_TCM L2
ENSG00000135597 REPS1 213897 sc-eQTL 7.42e-01 0.0328 0.0996 0.192 CD8_TCM L2
ENSG00000146386 ABRACL 173413 sc-eQTL 6.79e-01 0.0411 0.0992 0.192 CD8_TCM L2
ENSG00000164442 CITED2 -172490 sc-eQTL 7.91e-01 0.0271 0.102 0.192 CD8_TCM L2
ENSG00000231329 AL031772.1 -37495 sc-eQTL 2.70e-01 0.119 0.107 0.192 CD8_TCM L2
ENSG00000024862 CCDC28A 428649 sc-eQTL 9.07e-01 -0.0141 0.121 0.201 CD8_TEM L2
ENSG00000051620 HEBP2 798627 sc-eQTL 9.22e-01 -0.0108 0.11 0.201 CD8_TEM L2
ENSG00000112406 HECA 67078 sc-eQTL 1.13e-01 -0.179 0.112 0.201 CD8_TEM L2
ENSG00000135597 REPS1 213897 sc-eQTL 8.27e-01 0.0257 0.118 0.201 CD8_TEM L2
ENSG00000146386 ABRACL 173413 sc-eQTL 8.42e-01 -0.0181 0.0906 0.201 CD8_TEM L2
ENSG00000164442 CITED2 -172490 sc-eQTL 3.44e-01 0.0931 0.0982 0.201 CD8_TEM L2
ENSG00000231329 AL031772.1 -37495 sc-eQTL 5.76e-01 -0.0627 0.112 0.201 CD8_TEM L2
ENSG00000024862 CCDC28A 428649 sc-eQTL 3.62e-01 -0.118 0.129 0.197 MAIT L2
ENSG00000051620 HEBP2 798627 sc-eQTL 5.47e-01 -0.054 0.0895 0.197 MAIT L2
ENSG00000112406 HECA 67078 sc-eQTL 4.57e-01 -0.073 0.098 0.197 MAIT L2
ENSG00000135597 REPS1 213897 sc-eQTL 4.28e-01 -0.0837 0.106 0.197 MAIT L2
ENSG00000146386 ABRACL 173413 sc-eQTL 3.60e-01 -0.0711 0.0776 0.197 MAIT L2
ENSG00000164442 CITED2 -172490 sc-eQTL 7.89e-01 0.0245 0.0915 0.197 MAIT L2
ENSG00000024862 CCDC28A 428649 sc-eQTL 7.63e-01 -0.0359 0.119 0.191 NK_CD56bright L2
ENSG00000051620 HEBP2 798627 sc-eQTL 8.15e-01 0.0238 0.101 0.191 NK_CD56bright L2
ENSG00000112406 HECA 67078 sc-eQTL 7.39e-01 0.0361 0.108 0.191 NK_CD56bright L2
ENSG00000135597 REPS1 213897 sc-eQTL 5.08e-01 0.0668 0.101 0.191 NK_CD56bright L2
ENSG00000146386 ABRACL 173413 sc-eQTL 1.99e-02 0.215 0.0916 0.191 NK_CD56bright L2
ENSG00000164442 CITED2 -172490 sc-eQTL 7.34e-01 0.0338 0.0995 0.191 NK_CD56bright L2
ENSG00000024862 CCDC28A 428649 sc-eQTL 5.59e-01 -0.0647 0.111 0.196 NK_CD56dim L2
ENSG00000051620 HEBP2 798627 sc-eQTL 5.03e-01 0.0659 0.0982 0.196 NK_CD56dim L2
ENSG00000112406 HECA 67078 sc-eQTL 7.53e-01 0.0299 0.0952 0.196 NK_CD56dim L2
ENSG00000135597 REPS1 213897 sc-eQTL 3.75e-02 -0.187 0.0893 0.196 NK_CD56dim L2
ENSG00000146386 ABRACL 173413 sc-eQTL 5.09e-03 0.17 0.06 0.196 NK_CD56dim L2
ENSG00000164442 CITED2 -172490 sc-eQTL 2.91e-01 -0.086 0.0813 0.196 NK_CD56dim L2
ENSG00000024862 CCDC28A 428649 sc-eQTL 5.31e-01 -0.0798 0.127 0.192 NK_HLA L2
ENSG00000051620 HEBP2 798627 sc-eQTL 4.72e-01 -0.0779 0.108 0.192 NK_HLA L2
ENSG00000112406 HECA 67078 sc-eQTL 4.77e-01 -0.0846 0.119 0.192 NK_HLA L2
ENSG00000135597 REPS1 213897 sc-eQTL 4.07e-01 -0.0973 0.117 0.192 NK_HLA L2
ENSG00000146386 ABRACL 173413 sc-eQTL 2.36e-01 0.114 0.0961 0.192 NK_HLA L2
ENSG00000164442 CITED2 -172490 sc-eQTL 9.38e-01 0.00807 0.103 0.192 NK_HLA L2
ENSG00000024862 CCDC28A 428649 sc-eQTL 2.33e-01 -0.136 0.113 0.196 NK_cytokine L2
ENSG00000051620 HEBP2 798627 sc-eQTL 6.67e-01 -0.0422 0.098 0.196 NK_cytokine L2
ENSG00000112406 HECA 67078 sc-eQTL 7.60e-01 0.03 0.098 0.196 NK_cytokine L2
ENSG00000135597 REPS1 213897 sc-eQTL 5.99e-01 -0.0533 0.101 0.196 NK_cytokine L2
ENSG00000146386 ABRACL 173413 sc-eQTL 5.51e-01 0.0389 0.0651 0.196 NK_cytokine L2
ENSG00000164442 CITED2 -172490 sc-eQTL 5.73e-01 -0.048 0.0851 0.196 NK_cytokine L2
ENSG00000024862 CCDC28A 428649 sc-eQTL 3.01e-01 0.153 0.147 0.189 PB L2
ENSG00000051620 HEBP2 798627 sc-eQTL 9.99e-03 0.335 0.128 0.189 PB L2
ENSG00000112406 HECA 67078 sc-eQTL 7.31e-01 0.0556 0.161 0.189 PB L2
ENSG00000135597 REPS1 213897 sc-eQTL 1.74e-01 0.194 0.142 0.189 PB L2
ENSG00000146386 ABRACL 173413 sc-eQTL 2.42e-04 0.358 0.0944 0.189 PB L2
ENSG00000164440 TXLNB -89840 sc-eQTL 8.77e-01 -0.0227 0.146 0.189 PB L2
ENSG00000164442 CITED2 -172490 sc-eQTL 1.71e-01 -0.151 0.109 0.189 PB L2
ENSG00000226571 AL592429.2 -69204 sc-eQTL 9.67e-01 -0.00613 0.148 0.189 PB L2
ENSG00000024862 CCDC28A 428649 sc-eQTL 5.65e-01 -0.0725 0.126 0.191 Pro_T L2
ENSG00000051620 HEBP2 798627 sc-eQTL 8.34e-01 -0.0211 0.1 0.191 Pro_T L2
ENSG00000112406 HECA 67078 sc-eQTL 1.79e-01 0.133 0.0988 0.191 Pro_T L2
ENSG00000135597 REPS1 213897 sc-eQTL 7.43e-02 -0.208 0.116 0.191 Pro_T L2
ENSG00000146386 ABRACL 173413 sc-eQTL 2.87e-01 0.0802 0.0752 0.191 Pro_T L2
ENSG00000164442 CITED2 -172490 sc-eQTL 8.70e-01 -0.0147 0.0898 0.191 Pro_T L2
ENSG00000024862 CCDC28A 428649 sc-eQTL 6.83e-01 -0.0476 0.117 0.194 Treg L2
ENSG00000051620 HEBP2 798627 sc-eQTL 5.99e-01 -0.0419 0.0796 0.194 Treg L2
ENSG00000112406 HECA 67078 sc-eQTL 8.02e-01 -0.0244 0.0969 0.194 Treg L2
ENSG00000135597 REPS1 213897 sc-eQTL 8.57e-01 -0.0181 0.1 0.194 Treg L2
ENSG00000146386 ABRACL 173413 sc-eQTL 1.17e-01 0.134 0.0849 0.194 Treg L2
ENSG00000164442 CITED2 -172490 sc-eQTL 8.42e-01 -0.019 0.0953 0.194 Treg L2
ENSG00000231329 AL031772.1 -37495 sc-eQTL 2.91e-03 0.322 0.107 0.194 Treg L2
ENSG00000024862 CCDC28A 428649 sc-eQTL 2.17e-01 -0.14 0.113 0.195 cDC L2
ENSG00000051620 HEBP2 798627 sc-eQTL 1.83e-01 -0.109 0.0812 0.195 cDC L2
ENSG00000112406 HECA 67078 sc-eQTL 6.15e-02 -0.202 0.107 0.195 cDC L2
ENSG00000135540 NHSL1 509587 sc-eQTL 7.58e-01 0.0326 0.106 0.195 cDC L2
ENSG00000135597 REPS1 213897 sc-eQTL 8.51e-01 0.0229 0.122 0.195 cDC L2
ENSG00000146386 ABRACL 173413 sc-eQTL 8.05e-02 0.174 0.099 0.195 cDC L2
ENSG00000164442 CITED2 -172490 sc-eQTL 5.10e-01 0.0698 0.106 0.195 cDC L2
ENSG00000225177 AL590617.2 509610 sc-eQTL 5.77e-01 -0.0652 0.117 0.195 cDC L2
ENSG00000024862 CCDC28A 428649 sc-eQTL 8.22e-01 -0.0205 0.0914 0.194 cMono_IL1B L2
ENSG00000051620 HEBP2 798627 sc-eQTL 9.72e-01 0.00228 0.0656 0.194 cMono_IL1B L2
ENSG00000112406 HECA 67078 sc-eQTL 2.81e-01 -0.0813 0.0753 0.194 cMono_IL1B L2
ENSG00000135540 NHSL1 509587 sc-eQTL 1.30e-01 0.166 0.109 0.194 cMono_IL1B L2
ENSG00000135597 REPS1 213897 sc-eQTL 2.64e-01 -0.11 0.0979 0.194 cMono_IL1B L2
ENSG00000146386 ABRACL 173413 sc-eQTL 7.67e-02 0.146 0.082 0.194 cMono_IL1B L2
ENSG00000164442 CITED2 -172490 sc-eQTL 4.03e-01 0.0723 0.0862 0.194 cMono_IL1B L2
ENSG00000225177 AL590617.2 509610 sc-eQTL 6.81e-01 -0.0474 0.115 0.194 cMono_IL1B L2
ENSG00000024862 CCDC28A 428649 sc-eQTL 8.93e-01 -0.0141 0.105 0.194 cMono_S100A L2
ENSG00000051620 HEBP2 798627 sc-eQTL 9.77e-01 0.00206 0.0719 0.194 cMono_S100A L2
ENSG00000112406 HECA 67078 sc-eQTL 5.12e-01 0.0584 0.0887 0.194 cMono_S100A L2
ENSG00000135540 NHSL1 509587 sc-eQTL 3.02e-01 -0.116 0.112 0.194 cMono_S100A L2
ENSG00000135597 REPS1 213897 sc-eQTL 3.40e-01 0.102 0.106 0.194 cMono_S100A L2
ENSG00000146386 ABRACL 173413 sc-eQTL 1.25e-01 0.142 0.0921 0.194 cMono_S100A L2
ENSG00000164442 CITED2 -172490 sc-eQTL 7.95e-02 0.16 0.091 0.194 cMono_S100A L2
ENSG00000225177 AL590617.2 509610 sc-eQTL 9.82e-01 -0.00286 0.123 0.194 cMono_S100A L2
ENSG00000024862 CCDC28A 428649 sc-eQTL 4.88e-01 -0.0928 0.134 0.212 gdT L2
ENSG00000051620 HEBP2 798627 sc-eQTL 1.38e-01 -0.189 0.126 0.212 gdT L2
ENSG00000112406 HECA 67078 sc-eQTL 5.02e-01 0.0852 0.127 0.212 gdT L2
ENSG00000135597 REPS1 213897 sc-eQTL 1.17e-01 -0.206 0.13 0.212 gdT L2
ENSG00000146386 ABRACL 173413 sc-eQTL 2.56e-03 0.294 0.0958 0.212 gdT L2
ENSG00000164442 CITED2 -172490 sc-eQTL 9.54e-01 -0.00661 0.114 0.212 gdT L2
ENSG00000024862 CCDC28A 428649 sc-eQTL 6.17e-01 -0.0615 0.123 0.193 intMono L2
ENSG00000051620 HEBP2 798627 sc-eQTL 8.66e-01 0.0139 0.0824 0.193 intMono L2
ENSG00000112406 HECA 67078 sc-eQTL 5.81e-01 0.0557 0.101 0.193 intMono L2
ENSG00000135540 NHSL1 509587 sc-eQTL 6.76e-01 -0.0464 0.111 0.193 intMono L2
ENSG00000135597 REPS1 213897 sc-eQTL 3.94e-01 -0.0978 0.115 0.193 intMono L2
ENSG00000146386 ABRACL 173413 sc-eQTL 1.71e-01 0.143 0.104 0.193 intMono L2
ENSG00000164442 CITED2 -172490 sc-eQTL 1.87e-01 0.134 0.101 0.193 intMono L2
ENSG00000225177 AL590617.2 509610 sc-eQTL 6.84e-01 -0.0507 0.125 0.193 intMono L2
ENSG00000024862 CCDC28A 428649 sc-eQTL 5.58e-01 0.0661 0.113 0.192 ncMono L2
ENSG00000051620 HEBP2 798627 sc-eQTL 2.29e-01 -0.0807 0.067 0.192 ncMono L2
ENSG00000112406 HECA 67078 sc-eQTL 4.53e-01 0.0774 0.103 0.192 ncMono L2
ENSG00000135540 NHSL1 509587 sc-eQTL 4.09e-01 0.0893 0.108 0.192 ncMono L2
ENSG00000135597 REPS1 213897 sc-eQTL 9.90e-01 -0.00107 0.0816 0.192 ncMono L2
ENSG00000146386 ABRACL 173413 sc-eQTL 4.40e-01 0.076 0.0981 0.192 ncMono L2
ENSG00000164442 CITED2 -172490 sc-eQTL 1.69e-01 0.115 0.083 0.192 ncMono L2
ENSG00000225177 AL590617.2 509610 sc-eQTL 8.70e-01 -0.0198 0.12 0.192 ncMono L2
ENSG00000024862 CCDC28A 428649 sc-eQTL 3.13e-01 -0.13 0.128 0.186 pDC L2
ENSG00000051620 HEBP2 798627 sc-eQTL 1.05e-01 -0.162 0.0992 0.186 pDC L2
ENSG00000112406 HECA 67078 sc-eQTL 6.30e-01 0.0526 0.109 0.186 pDC L2
ENSG00000135540 NHSL1 509587 sc-eQTL 4.91e-01 0.0686 0.0994 0.186 pDC L2
ENSG00000135597 REPS1 213897 sc-eQTL 8.53e-01 -0.0188 0.101 0.186 pDC L2
ENSG00000146386 ABRACL 173413 sc-eQTL 3.23e-01 -0.109 0.11 0.186 pDC L2
ENSG00000164442 CITED2 -172490 sc-eQTL 2.08e-01 -0.163 0.129 0.186 pDC L2
ENSG00000225177 AL590617.2 509610 sc-eQTL 3.45e-01 -0.0945 0.0997 0.186 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000024862 CCDC28A 428649 sc-eQTL 2.49e-01 -0.128 0.111 0.194 B_Memory LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 798627 sc-eQTL 2.26e-01 -0.0935 0.077 0.194 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112406 HECA 67078 sc-eQTL 8.64e-01 -0.017 0.0992 0.194 B_Memory LOneK1K
ENSG00000135597 REPS1 213897 sc-eQTL 9.83e-01 -0.00215 0.103 0.194 B_Memory LOneK1K
ENSG00000146386 ABRACL 173413 sc-eQTL 4.56e-01 0.0532 0.0712 0.194 B_Memory LOneK1K
ENSG00000164440 TXLNB -89840 sc-eQTL 1.21e-01 -0.183 0.117 0.194 B_Memory LOneK1K
ENSG00000164442 CITED2 -172490 sc-eQTL 6.64e-01 -0.0435 0.1 0.194 B_Memory LOneK1K
ENSG00000226571 AL592429.2 -69204 sc-eQTL 9.04e-03 0.302 0.115 0.194 B_Memory LOneK1K
ENSG00000024862 CCDC28A 428649 sc-eQTL 5.03e-01 -0.07 0.104 0.194 B_Naive LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 798627 sc-eQTL 5.60e-01 -0.0422 0.0723 0.194 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112406 HECA 67078 sc-eQTL 8.91e-01 -0.0134 0.0976 0.194 B_Naive LOneK1K
ENSG00000135597 REPS1 213897 sc-eQTL 2.52e-01 -0.0953 0.0829 0.194 B_Naive LOneK1K
ENSG00000146386 ABRACL 173413 sc-eQTL 3.31e-01 -0.0567 0.0582 0.194 B_Naive LOneK1K
ENSG00000164440 TXLNB -89840 sc-eQTL 9.73e-01 -0.00417 0.122 0.194 B_Naive LOneK1K
ENSG00000164442 CITED2 -172490 sc-eQTL 5.37e-01 -0.0548 0.0887 0.194 B_Naive LOneK1K
ENSG00000226571 AL592429.2 -69204 sc-eQTL 8.76e-01 -0.0162 0.104 0.194 B_Naive LOneK1K
ENSG00000024862 CCDC28A 428649 sc-eQTL 9.70e-01 -0.00314 0.0843 0.194 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 798627 sc-eQTL 9.73e-01 0.00213 0.0628 0.194 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112406 HECA 67078 sc-eQTL 7.09e-01 -0.0282 0.0756 0.194 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000135540 NHSL1 509587 sc-eQTL 6.78e-01 0.046 0.11 0.194 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000135597 REPS1 213897 sc-eQTL 9.89e-01 0.00128 0.0909 0.194 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000146386 ABRACL 173413 sc-eQTL 1.11e-01 0.129 0.0804 0.194 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000164442 CITED2 -172490 sc-eQTL 2.91e-01 0.0936 0.0883 0.194 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000225177 AL590617.2 509610 sc-eQTL 6.55e-01 -0.0531 0.119 0.194 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000024862 CCDC28A 428649 sc-eQTL 7.52e-01 0.0358 0.113 0.196 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 798627 sc-eQTL 5.78e-01 -0.0338 0.0605 0.196 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112406 HECA 67078 sc-eQTL 5.37e-01 0.0599 0.0968 0.196 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000135540 NHSL1 509587 sc-eQTL 9.89e-01 0.00147 0.108 0.196 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000135597 REPS1 213897 sc-eQTL 3.27e-01 -0.0657 0.0669 0.196 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000146386 ABRACL 173413 sc-eQTL 2.86e-01 0.105 0.0979 0.196 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000164442 CITED2 -172490 sc-eQTL 2.41e-01 0.099 0.0843 0.196 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000225177 AL590617.2 509610 sc-eQTL 9.49e-01 0.00768 0.119 0.196 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000024862 CCDC28A 428649 sc-eQTL 5.81e-01 -0.0587 0.106 0.196 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 798627 sc-eQTL 9.84e-01 0.00183 0.0921 0.196 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112406 HECA 67078 sc-eQTL 7.13e-01 0.0333 0.0906 0.196 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000135597 REPS1 213897 sc-eQTL 2.03e-01 -0.113 0.0882 0.196 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000146386 ABRACL 173413 sc-eQTL 4.30e-02 0.115 0.0566 0.196 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000164442 CITED2 -172490 sc-eQTL 4.75e-01 -0.059 0.0825 0.196 NK_CD56dim LOneK1K


Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000112406 HECA 67078 eQTL 7.11e-10 0.0747 0.012 0.0 0.0 0.215
ENSG00000146386 ABRACL 173413 eQTL 0.0469 0.0592 0.0298 0.0 0.0 0.215
ENSG00000231329 AL031772.1 -37495 eQTL 0.00465 -0.0659 0.0232 0.0 0.0 0.215


Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000112406 HECA 67078 6.7e-06 9.64e-06 6.39e-07 4.11e-06 1.58e-06 3.09e-06 9.17e-06 1.24e-06 5.67e-06 3.3e-06 8.95e-06 4.41e-06 1.13e-05 3.74e-06 1.45e-06 4.31e-06 3.77e-06 3.79e-06 1.87e-06 1.51e-06 2.84e-06 7.11e-06 5.57e-06 1.99e-06 1.18e-05 2.08e-06 2.87e-06 1.69e-06 6.53e-06 7.53e-06 4.17e-06 4.16e-07 7.39e-07 1.84e-06 2.74e-06 1.22e-06 1.02e-06 5.44e-07 1.41e-06 8.28e-07 4.41e-07 8.54e-06 8.16e-07 1.49e-07 4.54e-07 1.16e-06 1.16e-06 6.3e-07 3.89e-07
ENSG00000146386 ABRACL 173413 1.4e-06 2.46e-06 3.43e-07 1.3e-06 3.73e-07 6.47e-07 1.41e-06 4.04e-07 1.75e-06 6.36e-07 2.06e-06 1.26e-06 2.72e-06 4.46e-07 4.55e-07 9.92e-07 1.12e-06 1.12e-06 5.99e-07 5.15e-07 7.8e-07 1.89e-06 1.14e-06 5.57e-07 2.43e-06 6.68e-07 9.37e-07 8.91e-07 1.59e-06 1.3e-06 8.13e-07 2.85e-07 2.85e-07 6.44e-07 6.99e-07 4.62e-07 7.24e-07 3.46e-07 5.12e-07 2.33e-07 3.03e-07 1.95e-06 4.07e-07 1.98e-07 1.85e-07 1.26e-07 2.16e-07 3.75e-08 1.69e-07
ENSG00000231329 AL031772.1 -37495 1.09e-05 1.38e-05 1.49e-06 7.23e-06 2.39e-06 5.36e-06 1.27e-05 2.19e-06 1.06e-05 5.36e-06 1.41e-05 6.43e-06 2e-05 4.33e-06 3.4e-06 6.63e-06 6.29e-06 8.43e-06 3.04e-06 2.82e-06 5.11e-06 1.04e-05 1.02e-05 3.38e-06 2.11e-05 3.9e-06 5.24e-06 4.18e-06 1.21e-05 1.02e-05 7.63e-06 9.88e-07 1.27e-06 3.01e-06 5.33e-06 2.65e-06 1.67e-06 1.87e-06 2.14e-06 9.82e-07 8.2e-07 1.51e-05 1.46e-06 1.47e-07 6.86e-07 1.62e-06 1.4e-06 7.42e-07 5.27e-07