logo

Genes within 1Mb (chr6:139200990:C:T):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000024862 CCDC28A 427481 sc-eQTL 1.96e-01 0.126 0.097 0.179 B L1
ENSG00000051620 HEBP2 797459 sc-eQTL 3.52e-01 0.0692 0.0741 0.179 B L1
ENSG00000112406 HECA 65910 sc-eQTL 5.79e-01 -0.0525 0.0946 0.179 B L1
ENSG00000135597 REPS1 212729 sc-eQTL 9.67e-01 -0.00346 0.0837 0.179 B L1
ENSG00000146386 ABRACL 172245 sc-eQTL 5.65e-01 -0.0283 0.0491 0.179 B L1
ENSG00000164440 TXLNB -91008 sc-eQTL 4.31e-01 -0.0948 0.12 0.179 B L1
ENSG00000164442 CITED2 -173658 sc-eQTL 4.05e-02 0.155 0.0751 0.179 B L1
ENSG00000226571 AL592429.2 -70372 sc-eQTL 7.77e-01 -0.024 0.0843 0.179 B L1
ENSG00000024862 CCDC28A 427481 sc-eQTL 3.37e-02 0.227 0.106 0.179 CD4T L1
ENSG00000051620 HEBP2 797459 sc-eQTL 7.95e-01 0.0188 0.072 0.179 CD4T L1
ENSG00000112406 HECA 65910 sc-eQTL 6.28e-01 -0.0434 0.0894 0.179 CD4T L1
ENSG00000135597 REPS1 212729 sc-eQTL 4.11e-01 -0.0578 0.0702 0.179 CD4T L1
ENSG00000146386 ABRACL 172245 sc-eQTL 1.20e-03 -0.165 0.0503 0.179 CD4T L1
ENSG00000164442 CITED2 -173658 sc-eQTL 4.96e-01 0.06 0.088 0.179 CD4T L1
ENSG00000231329 AL031772.1 -38663 sc-eQTL 8.72e-02 -0.148 0.0862 0.179 CD4T L1
ENSG00000024862 CCDC28A 427481 sc-eQTL 2.98e-01 0.121 0.116 0.179 CD8T L1
ENSG00000051620 HEBP2 797459 sc-eQTL 4.54e-01 -0.057 0.076 0.179 CD8T L1
ENSG00000112406 HECA 65910 sc-eQTL 1.83e-01 -0.111 0.0828 0.179 CD8T L1
ENSG00000135597 REPS1 212729 sc-eQTL 9.96e-01 -0.000432 0.0783 0.179 CD8T L1
ENSG00000146386 ABRACL 172245 sc-eQTL 2.34e-01 -0.053 0.0444 0.179 CD8T L1
ENSG00000164442 CITED2 -173658 sc-eQTL 7.28e-01 0.0295 0.0845 0.179 CD8T L1
ENSG00000231329 AL031772.1 -38663 sc-eQTL 5.15e-01 -0.067 0.103 0.179 CD8T L1
ENSG00000024862 CCDC28A 427481 sc-eQTL 4.89e-01 0.0827 0.119 0.176 DC L1
ENSG00000051620 HEBP2 797459 sc-eQTL 6.52e-01 -0.0379 0.0839 0.176 DC L1
ENSG00000112406 HECA 65910 sc-eQTL 2.23e-01 0.12 0.098 0.176 DC L1
ENSG00000135540 NHSL1 508419 sc-eQTL 9.60e-01 0.00545 0.11 0.176 DC L1
ENSG00000135597 REPS1 212729 sc-eQTL 7.63e-01 0.0293 0.0968 0.176 DC L1
ENSG00000146386 ABRACL 172245 sc-eQTL 4.75e-01 -0.0677 0.0947 0.176 DC L1
ENSG00000164442 CITED2 -173658 sc-eQTL 6.58e-01 0.0499 0.113 0.176 DC L1
ENSG00000225177 AL590617.2 508442 sc-eQTL 1.61e-01 0.16 0.114 0.176 DC L1
ENSG00000024862 CCDC28A 427481 sc-eQTL 9.03e-02 0.141 0.083 0.179 Mono L1
ENSG00000051620 HEBP2 797459 sc-eQTL 7.97e-01 0.0149 0.0578 0.179 Mono L1
ENSG00000112406 HECA 65910 sc-eQTL 8.02e-01 -0.0192 0.0763 0.179 Mono L1
ENSG00000135540 NHSL1 508419 sc-eQTL 8.65e-01 -0.0187 0.109 0.179 Mono L1
ENSG00000135597 REPS1 212729 sc-eQTL 8.21e-01 0.0145 0.064 0.179 Mono L1
ENSG00000146386 ABRACL 172245 sc-eQTL 3.37e-01 -0.0799 0.0831 0.179 Mono L1
ENSG00000164442 CITED2 -173658 sc-eQTL 8.00e-01 0.0223 0.0881 0.179 Mono L1
ENSG00000225177 AL590617.2 508442 sc-eQTL 6.57e-01 0.0505 0.114 0.179 Mono L1
ENSG00000024862 CCDC28A 427481 sc-eQTL 2.62e-01 0.115 0.103 0.178 NK L1
ENSG00000051620 HEBP2 797459 sc-eQTL 7.55e-01 -0.0283 0.0906 0.178 NK L1
ENSG00000112406 HECA 65910 sc-eQTL 3.52e-01 -0.0827 0.0887 0.178 NK L1
ENSG00000135597 REPS1 212729 sc-eQTL 5.83e-01 0.0465 0.0846 0.178 NK L1
ENSG00000146386 ABRACL 172245 sc-eQTL 1.06e-01 -0.0997 0.0614 0.178 NK L1
ENSG00000164442 CITED2 -173658 sc-eQTL 3.18e-01 -0.082 0.082 0.178 NK L1
ENSG00000024862 CCDC28A 427481 sc-eQTL 8.88e-01 -0.0173 0.122 0.179 Other_T L1
ENSG00000051620 HEBP2 797459 sc-eQTL 7.56e-01 -0.0246 0.079 0.179 Other_T L1
ENSG00000112406 HECA 65910 sc-eQTL 2.16e-01 -0.11 0.0883 0.179 Other_T L1
ENSG00000135597 REPS1 212729 sc-eQTL 6.45e-01 -0.0439 0.0953 0.179 Other_T L1
ENSG00000146386 ABRACL 172245 sc-eQTL 2.11e-01 -0.078 0.0622 0.179 Other_T L1
ENSG00000164442 CITED2 -173658 sc-eQTL 8.84e-01 -0.0106 0.0731 0.179 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000024862 CCDC28A 427481 sc-eQTL 2.18e-01 -0.177 0.143 0.181 B_Activated L2
ENSG00000051620 HEBP2 797459 sc-eQTL 5.88e-01 -0.0684 0.126 0.181 B_Activated L2
ENSG00000112406 HECA 65910 sc-eQTL 4.33e-01 -0.108 0.137 0.181 B_Activated L2
ENSG00000135597 REPS1 212729 sc-eQTL 1.72e-02 0.34 0.141 0.181 B_Activated L2
ENSG00000146386 ABRACL 172245 sc-eQTL 1.49e-01 0.187 0.129 0.181 B_Activated L2
ENSG00000164440 TXLNB -91008 sc-eQTL 1.89e-01 -0.146 0.111 0.181 B_Activated L2
ENSG00000164442 CITED2 -173658 sc-eQTL 8.94e-02 -0.237 0.139 0.181 B_Activated L2
ENSG00000226571 AL592429.2 -70372 sc-eQTL 3.02e-01 0.144 0.139 0.181 B_Activated L2
ENSG00000024862 CCDC28A 427481 sc-eQTL 7.20e-01 0.0435 0.121 0.176 B_Intermediate L2
ENSG00000051620 HEBP2 797459 sc-eQTL 9.85e-01 -0.00159 0.0841 0.176 B_Intermediate L2
ENSG00000112406 HECA 65910 sc-eQTL 8.73e-01 0.0168 0.105 0.176 B_Intermediate L2
ENSG00000135597 REPS1 212729 sc-eQTL 3.35e-01 0.109 0.113 0.176 B_Intermediate L2
ENSG00000146386 ABRACL 172245 sc-eQTL 3.66e-01 -0.0872 0.0963 0.176 B_Intermediate L2
ENSG00000164440 TXLNB -91008 sc-eQTL 5.33e-01 0.0738 0.118 0.176 B_Intermediate L2
ENSG00000164442 CITED2 -173658 sc-eQTL 7.04e-03 0.291 0.107 0.176 B_Intermediate L2
ENSG00000226571 AL592429.2 -70372 sc-eQTL 6.45e-01 0.0543 0.118 0.176 B_Intermediate L2
ENSG00000024862 CCDC28A 427481 sc-eQTL 2.38e-01 0.145 0.123 0.179 B_Memory L2
ENSG00000051620 HEBP2 797459 sc-eQTL 8.79e-02 0.158 0.0921 0.179 B_Memory L2
ENSG00000112406 HECA 65910 sc-eQTL 3.91e-01 -0.0914 0.106 0.179 B_Memory L2
ENSG00000135597 REPS1 212729 sc-eQTL 9.51e-02 -0.192 0.115 0.179 B_Memory L2
ENSG00000146386 ABRACL 172245 sc-eQTL 2.11e-01 -0.114 0.091 0.179 B_Memory L2
ENSG00000164440 TXLNB -91008 sc-eQTL 7.14e-01 0.0428 0.116 0.179 B_Memory L2
ENSG00000164442 CITED2 -173658 sc-eQTL 9.80e-01 -0.00274 0.107 0.179 B_Memory L2
ENSG00000226571 AL592429.2 -70372 sc-eQTL 2.10e-01 -0.165 0.131 0.179 B_Memory L2
ENSG00000024862 CCDC28A 427481 sc-eQTL 5.35e-01 0.072 0.116 0.179 B_Naive1 L2
ENSG00000051620 HEBP2 797459 sc-eQTL 2.31e-01 0.0977 0.0813 0.179 B_Naive1 L2
ENSG00000112406 HECA 65910 sc-eQTL 9.80e-01 -0.00257 0.101 0.179 B_Naive1 L2
ENSG00000135597 REPS1 212729 sc-eQTL 9.36e-01 -0.00749 0.0936 0.179 B_Naive1 L2
ENSG00000146386 ABRACL 172245 sc-eQTL 6.82e-01 0.0269 0.0654 0.179 B_Naive1 L2
ENSG00000164440 TXLNB -91008 sc-eQTL 3.92e-01 -0.105 0.122 0.179 B_Naive1 L2
ENSG00000164442 CITED2 -173658 sc-eQTL 3.38e-01 0.0855 0.089 0.179 B_Naive1 L2
ENSG00000226571 AL592429.2 -70372 sc-eQTL 8.23e-02 -0.203 0.116 0.179 B_Naive1 L2
ENSG00000024862 CCDC28A 427481 sc-eQTL 6.82e-01 -0.0466 0.114 0.178 B_Naive2 L2
ENSG00000051620 HEBP2 797459 sc-eQTL 8.24e-01 0.0172 0.0776 0.178 B_Naive2 L2
ENSG00000112406 HECA 65910 sc-eQTL 6.91e-01 -0.0426 0.107 0.178 B_Naive2 L2
ENSG00000135597 REPS1 212729 sc-eQTL 5.34e-01 -0.0635 0.102 0.178 B_Naive2 L2
ENSG00000146386 ABRACL 172245 sc-eQTL 8.91e-01 0.0103 0.0751 0.178 B_Naive2 L2
ENSG00000164440 TXLNB -91008 sc-eQTL 8.62e-01 -0.0207 0.119 0.178 B_Naive2 L2
ENSG00000164442 CITED2 -173658 sc-eQTL 4.93e-01 0.0832 0.121 0.178 B_Naive2 L2
ENSG00000226571 AL592429.2 -70372 sc-eQTL 3.84e-01 -0.0969 0.111 0.178 B_Naive2 L2
ENSG00000024862 CCDC28A 427481 sc-eQTL 4.20e-01 0.0942 0.117 0.18 CD4_CTL L2
ENSG00000051620 HEBP2 797459 sc-eQTL 4.68e-01 -0.0732 0.101 0.18 CD4_CTL L2
ENSG00000112406 HECA 65910 sc-eQTL 6.65e-01 0.0511 0.118 0.18 CD4_CTL L2
ENSG00000135597 REPS1 212729 sc-eQTL 9.10e-01 -0.013 0.114 0.18 CD4_CTL L2
ENSG00000146386 ABRACL 172245 sc-eQTL 2.46e-01 -0.121 0.104 0.18 CD4_CTL L2
ENSG00000164442 CITED2 -173658 sc-eQTL 5.47e-01 0.0632 0.105 0.18 CD4_CTL L2
ENSG00000231329 AL031772.1 -38663 sc-eQTL 4.94e-01 0.074 0.108 0.18 CD4_CTL L2
ENSG00000024862 CCDC28A 427481 sc-eQTL 3.86e-01 0.0983 0.113 0.179 CD4_Naive L2
ENSG00000051620 HEBP2 797459 sc-eQTL 8.57e-01 0.0128 0.0706 0.179 CD4_Naive L2
ENSG00000112406 HECA 65910 sc-eQTL 9.98e-01 0.000245 0.0881 0.179 CD4_Naive L2
ENSG00000135597 REPS1 212729 sc-eQTL 1.99e-01 -0.1 0.0778 0.179 CD4_Naive L2
ENSG00000146386 ABRACL 172245 sc-eQTL 1.48e-02 -0.127 0.0518 0.179 CD4_Naive L2
ENSG00000164442 CITED2 -173658 sc-eQTL 5.53e-01 0.053 0.0892 0.179 CD4_Naive L2
ENSG00000231329 AL031772.1 -38663 sc-eQTL 6.19e-01 -0.0449 0.0903 0.179 CD4_Naive L2
ENSG00000024862 CCDC28A 427481 sc-eQTL 5.32e-02 0.21 0.108 0.179 CD4_TCM L2
ENSG00000051620 HEBP2 797459 sc-eQTL 3.85e-01 0.0707 0.0811 0.179 CD4_TCM L2
ENSG00000112406 HECA 65910 sc-eQTL 4.42e-01 -0.0672 0.0872 0.179 CD4_TCM L2
ENSG00000135597 REPS1 212729 sc-eQTL 3.88e-01 0.0715 0.0827 0.179 CD4_TCM L2
ENSG00000146386 ABRACL 172245 sc-eQTL 1.85e-03 -0.196 0.0623 0.179 CD4_TCM L2
ENSG00000164442 CITED2 -173658 sc-eQTL 8.46e-01 0.0184 0.0947 0.179 CD4_TCM L2
ENSG00000231329 AL031772.1 -38663 sc-eQTL 2.84e-01 -0.11 0.102 0.179 CD4_TCM L2
ENSG00000024862 CCDC28A 427481 sc-eQTL 1.92e-01 0.159 0.122 0.179 CD4_TEM L2
ENSG00000051620 HEBP2 797459 sc-eQTL 3.79e-01 -0.0733 0.0832 0.179 CD4_TEM L2
ENSG00000112406 HECA 65910 sc-eQTL 6.46e-01 0.0438 0.0951 0.179 CD4_TEM L2
ENSG00000135597 REPS1 212729 sc-eQTL 9.27e-01 0.00949 0.104 0.179 CD4_TEM L2
ENSG00000146386 ABRACL 172245 sc-eQTL 1.24e-01 -0.114 0.0735 0.179 CD4_TEM L2
ENSG00000164442 CITED2 -173658 sc-eQTL 4.91e-01 0.0668 0.0969 0.179 CD4_TEM L2
ENSG00000231329 AL031772.1 -38663 sc-eQTL 4.43e-01 -0.078 0.101 0.179 CD4_TEM L2
ENSG00000024862 CCDC28A 427481 sc-eQTL 4.72e-01 0.0895 0.124 0.179 CD8_CTL L2
ENSG00000051620 HEBP2 797459 sc-eQTL 1.85e-01 -0.118 0.0885 0.179 CD8_CTL L2
ENSG00000112406 HECA 65910 sc-eQTL 1.56e-01 -0.128 0.0902 0.179 CD8_CTL L2
ENSG00000135597 REPS1 212729 sc-eQTL 4.34e-02 -0.195 0.0961 0.179 CD8_CTL L2
ENSG00000146386 ABRACL 172245 sc-eQTL 2.32e-01 -0.0937 0.0782 0.179 CD8_CTL L2
ENSG00000164442 CITED2 -173658 sc-eQTL 9.65e-01 -0.00397 0.0914 0.179 CD8_CTL L2
ENSG00000231329 AL031772.1 -38663 sc-eQTL 8.51e-01 -0.0206 0.11 0.179 CD8_CTL L2
ENSG00000024862 CCDC28A 427481 sc-eQTL 9.36e-01 -0.00968 0.12 0.179 CD8_Naive L2
ENSG00000051620 HEBP2 797459 sc-eQTL 5.35e-01 0.0477 0.0768 0.179 CD8_Naive L2
ENSG00000112406 HECA 65910 sc-eQTL 4.99e-01 -0.0629 0.0928 0.179 CD8_Naive L2
ENSG00000135597 REPS1 212729 sc-eQTL 7.99e-01 0.0238 0.0931 0.179 CD8_Naive L2
ENSG00000146386 ABRACL 172245 sc-eQTL 7.11e-01 -0.0181 0.0488 0.179 CD8_Naive L2
ENSG00000164442 CITED2 -173658 sc-eQTL 6.70e-01 0.0421 0.0987 0.179 CD8_Naive L2
ENSG00000231329 AL031772.1 -38663 sc-eQTL 8.44e-01 0.0223 0.113 0.179 CD8_Naive L2
ENSG00000024862 CCDC28A 427481 sc-eQTL 7.34e-01 0.0449 0.132 0.181 CD8_TCM L2
ENSG00000051620 HEBP2 797459 sc-eQTL 3.31e-01 -0.0901 0.0925 0.181 CD8_TCM L2
ENSG00000112406 HECA 65910 sc-eQTL 2.66e-01 -0.107 0.0962 0.181 CD8_TCM L2
ENSG00000135597 REPS1 212729 sc-eQTL 8.25e-02 0.174 0.0995 0.181 CD8_TCM L2
ENSG00000146386 ABRACL 172245 sc-eQTL 3.56e-01 -0.0923 0.0997 0.181 CD8_TCM L2
ENSG00000164442 CITED2 -173658 sc-eQTL 7.20e-01 0.0369 0.103 0.181 CD8_TCM L2
ENSG00000231329 AL031772.1 -38663 sc-eQTL 1.22e-01 -0.167 0.108 0.181 CD8_TCM L2
ENSG00000024862 CCDC28A 427481 sc-eQTL 8.35e-02 0.217 0.124 0.171 CD8_TEM L2
ENSG00000051620 HEBP2 797459 sc-eQTL 8.68e-01 -0.019 0.114 0.171 CD8_TEM L2
ENSG00000112406 HECA 65910 sc-eQTL 2.21e-01 -0.143 0.117 0.171 CD8_TEM L2
ENSG00000135597 REPS1 212729 sc-eQTL 1.28e-01 -0.186 0.122 0.171 CD8_TEM L2
ENSG00000146386 ABRACL 172245 sc-eQTL 2.65e-02 -0.208 0.093 0.171 CD8_TEM L2
ENSG00000164442 CITED2 -173658 sc-eQTL 9.98e-01 -0.00031 0.102 0.171 CD8_TEM L2
ENSG00000231329 AL031772.1 -38663 sc-eQTL 7.20e-01 -0.0418 0.116 0.171 CD8_TEM L2
ENSG00000024862 CCDC28A 427481 sc-eQTL 4.87e-01 0.0913 0.131 0.182 MAIT L2
ENSG00000051620 HEBP2 797459 sc-eQTL 2.78e-01 -0.0988 0.0909 0.182 MAIT L2
ENSG00000112406 HECA 65910 sc-eQTL 6.35e-01 0.0475 0.0998 0.182 MAIT L2
ENSG00000135597 REPS1 212729 sc-eQTL 8.56e-01 0.0195 0.108 0.182 MAIT L2
ENSG00000146386 ABRACL 172245 sc-eQTL 8.39e-01 -0.016 0.0791 0.182 MAIT L2
ENSG00000164442 CITED2 -173658 sc-eQTL 3.73e-01 -0.083 0.0929 0.182 MAIT L2
ENSG00000024862 CCDC28A 427481 sc-eQTL 5.70e-01 0.0685 0.12 0.178 NK_CD56bright L2
ENSG00000051620 HEBP2 797459 sc-eQTL 6.42e-01 -0.0477 0.103 0.178 NK_CD56bright L2
ENSG00000112406 HECA 65910 sc-eQTL 2.80e-01 -0.118 0.109 0.178 NK_CD56bright L2
ENSG00000135597 REPS1 212729 sc-eQTL 7.16e-01 -0.0371 0.102 0.178 NK_CD56bright L2
ENSG00000146386 ABRACL 172245 sc-eQTL 5.81e-01 -0.0519 0.0939 0.178 NK_CD56bright L2
ENSG00000164442 CITED2 -173658 sc-eQTL 1.10e-01 -0.161 0.1 0.178 NK_CD56bright L2
ENSG00000024862 CCDC28A 427481 sc-eQTL 7.91e-01 -0.0293 0.11 0.177 NK_CD56dim L2
ENSG00000051620 HEBP2 797459 sc-eQTL 7.23e-01 -0.0348 0.098 0.177 NK_CD56dim L2
ENSG00000112406 HECA 65910 sc-eQTL 5.24e-01 -0.0606 0.095 0.177 NK_CD56dim L2
ENSG00000135597 REPS1 212729 sc-eQTL 2.52e-01 0.103 0.0898 0.177 NK_CD56dim L2
ENSG00000146386 ABRACL 172245 sc-eQTL 2.25e-01 -0.0739 0.0608 0.177 NK_CD56dim L2
ENSG00000164442 CITED2 -173658 sc-eQTL 2.62e-01 -0.0911 0.0811 0.177 NK_CD56dim L2
ENSG00000024862 CCDC28A 427481 sc-eQTL 7.39e-02 0.228 0.127 0.178 NK_HLA L2
ENSG00000051620 HEBP2 797459 sc-eQTL 5.64e-01 -0.0629 0.109 0.178 NK_HLA L2
ENSG00000112406 HECA 65910 sc-eQTL 9.57e-01 -0.00648 0.12 0.178 NK_HLA L2
ENSG00000135597 REPS1 212729 sc-eQTL 3.76e-01 -0.104 0.118 0.178 NK_HLA L2
ENSG00000146386 ABRACL 172245 sc-eQTL 8.50e-02 -0.167 0.0964 0.178 NK_HLA L2
ENSG00000164442 CITED2 -173658 sc-eQTL 6.78e-01 -0.0431 0.104 0.178 NK_HLA L2
ENSG00000024862 CCDC28A 427481 sc-eQTL 7.06e-02 0.206 0.114 0.177 NK_cytokine L2
ENSG00000051620 HEBP2 797459 sc-eQTL 7.56e-01 0.0307 0.0985 0.177 NK_cytokine L2
ENSG00000112406 HECA 65910 sc-eQTL 8.70e-01 -0.0161 0.0985 0.177 NK_cytokine L2
ENSG00000135597 REPS1 212729 sc-eQTL 8.10e-01 0.0245 0.102 0.177 NK_cytokine L2
ENSG00000146386 ABRACL 172245 sc-eQTL 2.32e-01 -0.0782 0.0653 0.177 NK_cytokine L2
ENSG00000164442 CITED2 -173658 sc-eQTL 9.29e-01 -0.00766 0.0856 0.177 NK_cytokine L2
ENSG00000024862 CCDC28A 427481 sc-eQTL 4.54e-01 -0.107 0.142 0.181 PB L2
ENSG00000051620 HEBP2 797459 sc-eQTL 4.14e-01 -0.103 0.126 0.181 PB L2
ENSG00000112406 HECA 65910 sc-eQTL 5.97e-01 0.0821 0.155 0.181 PB L2
ENSG00000135597 REPS1 212729 sc-eQTL 9.19e-01 -0.0141 0.138 0.181 PB L2
ENSG00000146386 ABRACL 172245 sc-eQTL 3.18e-01 -0.0961 0.0959 0.181 PB L2
ENSG00000164440 TXLNB -91008 sc-eQTL 9.52e-01 -0.00843 0.141 0.181 PB L2
ENSG00000164442 CITED2 -173658 sc-eQTL 5.59e-01 -0.062 0.106 0.181 PB L2
ENSG00000226571 AL592429.2 -70372 sc-eQTL 7.92e-01 -0.0375 0.142 0.181 PB L2
ENSG00000024862 CCDC28A 427481 sc-eQTL 7.08e-03 -0.337 0.124 0.183 Pro_T L2
ENSG00000051620 HEBP2 797459 sc-eQTL 9.22e-01 -0.00979 0.1 0.183 Pro_T L2
ENSG00000112406 HECA 65910 sc-eQTL 1.34e-01 -0.148 0.0988 0.183 Pro_T L2
ENSG00000135597 REPS1 212729 sc-eQTL 5.97e-01 -0.0619 0.117 0.183 Pro_T L2
ENSG00000146386 ABRACL 172245 sc-eQTL 5.98e-02 -0.142 0.0748 0.183 Pro_T L2
ENSG00000164442 CITED2 -173658 sc-eQTL 4.10e-01 -0.074 0.0897 0.183 Pro_T L2
ENSG00000024862 CCDC28A 427481 sc-eQTL 9.43e-01 0.00857 0.12 0.179 Treg L2
ENSG00000051620 HEBP2 797459 sc-eQTL 9.00e-01 -0.0103 0.0818 0.179 Treg L2
ENSG00000112406 HECA 65910 sc-eQTL 9.45e-01 -0.00685 0.0995 0.179 Treg L2
ENSG00000135597 REPS1 212729 sc-eQTL 5.68e-01 -0.0589 0.103 0.179 Treg L2
ENSG00000146386 ABRACL 172245 sc-eQTL 4.11e-02 -0.178 0.0868 0.179 Treg L2
ENSG00000164442 CITED2 -173658 sc-eQTL 4.25e-01 -0.0782 0.0977 0.179 Treg L2
ENSG00000231329 AL031772.1 -38663 sc-eQTL 5.19e-02 -0.217 0.111 0.179 Treg L2
ENSG00000024862 CCDC28A 427481 sc-eQTL 4.85e-02 0.237 0.119 0.173 cDC L2
ENSG00000051620 HEBP2 797459 sc-eQTL 9.41e-01 -0.00643 0.0863 0.173 cDC L2
ENSG00000112406 HECA 65910 sc-eQTL 6.89e-02 0.208 0.113 0.173 cDC L2
ENSG00000135540 NHSL1 508419 sc-eQTL 7.93e-01 -0.0294 0.112 0.173 cDC L2
ENSG00000135597 REPS1 212729 sc-eQTL 4.80e-01 -0.0913 0.129 0.173 cDC L2
ENSG00000146386 ABRACL 172245 sc-eQTL 6.07e-02 -0.197 0.105 0.173 cDC L2
ENSG00000164442 CITED2 -173658 sc-eQTL 2.77e-01 0.122 0.112 0.173 cDC L2
ENSG00000225177 AL590617.2 508442 sc-eQTL 1.40e-01 0.182 0.123 0.173 cDC L2
ENSG00000024862 CCDC28A 427481 sc-eQTL 2.88e-02 0.202 0.0919 0.179 cMono_IL1B L2
ENSG00000051620 HEBP2 797459 sc-eQTL 8.32e-01 0.0142 0.0668 0.179 cMono_IL1B L2
ENSG00000112406 HECA 65910 sc-eQTL 9.11e-01 0.00856 0.0768 0.179 cMono_IL1B L2
ENSG00000135540 NHSL1 508419 sc-eQTL 6.57e-01 0.0498 0.112 0.179 cMono_IL1B L2
ENSG00000135597 REPS1 212729 sc-eQTL 5.52e-01 0.0595 0.0998 0.179 cMono_IL1B L2
ENSG00000146386 ABRACL 172245 sc-eQTL 7.13e-01 -0.0309 0.084 0.179 cMono_IL1B L2
ENSG00000164442 CITED2 -173658 sc-eQTL 2.90e-01 0.0928 0.0876 0.179 cMono_IL1B L2
ENSG00000225177 AL590617.2 508442 sc-eQTL 1.00e+00 3.63e-06 0.117 0.179 cMono_IL1B L2
ENSG00000024862 CCDC28A 427481 sc-eQTL 1.55e-01 0.15 0.105 0.179 cMono_S100A L2
ENSG00000051620 HEBP2 797459 sc-eQTL 1.90e-01 -0.0947 0.072 0.179 cMono_S100A L2
ENSG00000112406 HECA 65910 sc-eQTL 3.93e-01 -0.0762 0.0892 0.179 cMono_S100A L2
ENSG00000135540 NHSL1 508419 sc-eQTL 5.74e-01 0.0636 0.113 0.179 cMono_S100A L2
ENSG00000135597 REPS1 212729 sc-eQTL 4.76e-01 -0.0765 0.107 0.179 cMono_S100A L2
ENSG00000146386 ABRACL 172245 sc-eQTL 1.05e-01 -0.151 0.0925 0.179 cMono_S100A L2
ENSG00000164442 CITED2 -173658 sc-eQTL 9.47e-01 -0.00614 0.0922 0.179 cMono_S100A L2
ENSG00000225177 AL590617.2 508442 sc-eQTL 5.96e-01 0.0658 0.124 0.179 cMono_S100A L2
ENSG00000024862 CCDC28A 427481 sc-eQTL 7.51e-02 0.266 0.149 0.161 gdT L2
ENSG00000051620 HEBP2 797459 sc-eQTL 6.78e-01 -0.0595 0.143 0.161 gdT L2
ENSG00000112406 HECA 65910 sc-eQTL 8.39e-01 0.0291 0.143 0.161 gdT L2
ENSG00000135597 REPS1 212729 sc-eQTL 3.12e-01 -0.149 0.147 0.161 gdT L2
ENSG00000146386 ABRACL 172245 sc-eQTL 2.61e-03 -0.33 0.108 0.161 gdT L2
ENSG00000164442 CITED2 -173658 sc-eQTL 9.05e-01 -0.0153 0.128 0.161 gdT L2
ENSG00000024862 CCDC28A 427481 sc-eQTL 8.82e-01 -0.0185 0.124 0.173 intMono L2
ENSG00000051620 HEBP2 797459 sc-eQTL 7.66e-01 0.0248 0.0833 0.173 intMono L2
ENSG00000112406 HECA 65910 sc-eQTL 7.18e-01 0.0368 0.102 0.173 intMono L2
ENSG00000135540 NHSL1 508419 sc-eQTL 8.48e-01 0.0216 0.112 0.173 intMono L2
ENSG00000135597 REPS1 212729 sc-eQTL 9.48e-01 0.00763 0.116 0.173 intMono L2
ENSG00000146386 ABRACL 172245 sc-eQTL 4.10e-01 -0.0872 0.106 0.173 intMono L2
ENSG00000164442 CITED2 -173658 sc-eQTL 5.44e-01 -0.0625 0.103 0.173 intMono L2
ENSG00000225177 AL590617.2 508442 sc-eQTL 8.53e-01 0.0233 0.126 0.173 intMono L2
ENSG00000024862 CCDC28A 427481 sc-eQTL 5.46e-01 -0.0693 0.115 0.172 ncMono L2
ENSG00000051620 HEBP2 797459 sc-eQTL 3.20e-01 0.0681 0.0683 0.172 ncMono L2
ENSG00000112406 HECA 65910 sc-eQTL 7.58e-01 0.0324 0.105 0.172 ncMono L2
ENSG00000135540 NHSL1 508419 sc-eQTL 7.12e-01 0.0408 0.11 0.172 ncMono L2
ENSG00000135597 REPS1 212729 sc-eQTL 2.35e-01 0.0986 0.0828 0.172 ncMono L2
ENSG00000146386 ABRACL 172245 sc-eQTL 6.84e-02 -0.182 0.0993 0.172 ncMono L2
ENSG00000164442 CITED2 -173658 sc-eQTL 1.45e-01 -0.124 0.0845 0.172 ncMono L2
ENSG00000225177 AL590617.2 508442 sc-eQTL 1.11e-01 -0.195 0.122 0.172 ncMono L2
ENSG00000024862 CCDC28A 427481 sc-eQTL 4.19e-01 -0.113 0.139 0.169 pDC L2
ENSG00000051620 HEBP2 797459 sc-eQTL 5.19e-01 -0.0699 0.108 0.169 pDC L2
ENSG00000112406 HECA 65910 sc-eQTL 8.12e-01 -0.028 0.118 0.169 pDC L2
ENSG00000135540 NHSL1 508419 sc-eQTL 6.62e-01 -0.0472 0.108 0.169 pDC L2
ENSG00000135597 REPS1 212729 sc-eQTL 9.06e-01 -0.0129 0.109 0.169 pDC L2
ENSG00000146386 ABRACL 172245 sc-eQTL 8.51e-01 -0.0225 0.119 0.169 pDC L2
ENSG00000164442 CITED2 -173658 sc-eQTL 4.34e-01 0.11 0.14 0.169 pDC L2
ENSG00000225177 AL590617.2 508442 sc-eQTL 2.70e-01 -0.119 0.108 0.169 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000024862 CCDC28A 427481 sc-eQTL 8.51e-01 0.0224 0.119 0.179 B_Memory LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 797459 sc-eQTL 7.94e-01 -0.0216 0.0826 0.179 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112406 HECA 65910 sc-eQTL 6.80e-01 -0.0438 0.106 0.179 B_Memory LOneK1K
ENSG00000135597 REPS1 212729 sc-eQTL 8.78e-01 0.017 0.11 0.179 B_Memory LOneK1K
ENSG00000146386 ABRACL 172245 sc-eQTL 3.99e-01 -0.0644 0.0761 0.179 B_Memory LOneK1K
ENSG00000164440 TXLNB -91008 sc-eQTL 5.94e-01 -0.0673 0.126 0.179 B_Memory LOneK1K
ENSG00000164442 CITED2 -173658 sc-eQTL 3.39e-01 0.103 0.107 0.179 B_Memory LOneK1K
ENSG00000226571 AL592429.2 -70372 sc-eQTL 6.53e-01 0.056 0.124 0.179 B_Memory LOneK1K
ENSG00000024862 CCDC28A 427481 sc-eQTL 5.94e-01 0.0574 0.107 0.179 B_Naive LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 797459 sc-eQTL 1.76e-01 0.101 0.0742 0.179 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112406 HECA 65910 sc-eQTL 8.32e-01 -0.0214 0.1 0.179 B_Naive LOneK1K
ENSG00000135597 REPS1 212729 sc-eQTL 7.29e-01 -0.0297 0.0857 0.179 B_Naive LOneK1K
ENSG00000146386 ABRACL 172245 sc-eQTL 7.80e-01 0.0168 0.0601 0.179 B_Naive LOneK1K
ENSG00000164440 TXLNB -91008 sc-eQTL 3.96e-01 -0.107 0.126 0.179 B_Naive LOneK1K
ENSG00000164442 CITED2 -173658 sc-eQTL 3.09e-01 0.0929 0.0912 0.179 B_Naive LOneK1K
ENSG00000226571 AL592429.2 -70372 sc-eQTL 9.64e-02 -0.178 0.107 0.179 B_Naive LOneK1K
ENSG00000024862 CCDC28A 427481 sc-eQTL 1.49e-02 0.207 0.0844 0.179 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 797459 sc-eQTL 7.12e-01 0.0236 0.0637 0.179 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112406 HECA 65910 sc-eQTL 8.15e-01 -0.018 0.0767 0.179 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000135540 NHSL1 508419 sc-eQTL 5.54e-01 0.0665 0.112 0.179 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000135597 REPS1 212729 sc-eQTL 8.60e-01 0.0163 0.0923 0.179 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000146386 ABRACL 172245 sc-eQTL 3.31e-01 -0.0799 0.0819 0.179 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000164442 CITED2 -173658 sc-eQTL 3.99e-01 0.0758 0.0897 0.179 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000225177 AL590617.2 508442 sc-eQTL 4.95e-01 0.0821 0.12 0.179 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000024862 CCDC28A 427481 sc-eQTL 1.50e-01 -0.163 0.113 0.177 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 797459 sc-eQTL 4.13e-01 0.0496 0.0604 0.177 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112406 HECA 65910 sc-eQTL 7.14e-01 0.0355 0.0967 0.177 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000135540 NHSL1 508419 sc-eQTL 4.55e-01 0.0804 0.107 0.177 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000135597 REPS1 212729 sc-eQTL 7.34e-01 0.0228 0.067 0.177 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000146386 ABRACL 172245 sc-eQTL 2.46e-01 -0.114 0.0978 0.177 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000164442 CITED2 -173658 sc-eQTL 1.07e-01 -0.136 0.084 0.177 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000225177 AL590617.2 508442 sc-eQTL 4.16e-01 -0.0967 0.119 0.177 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000024862 CCDC28A 427481 sc-eQTL 1.61e-01 0.15 0.106 0.177 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 797459 sc-eQTL 7.77e-01 -0.0263 0.0928 0.177 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112406 HECA 65910 sc-eQTL 5.80e-01 -0.0506 0.0912 0.177 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000135597 REPS1 212729 sc-eQTL 7.06e-01 0.0337 0.0891 0.177 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000146386 ABRACL 172245 sc-eQTL 7.81e-02 -0.101 0.0571 0.177 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000164442 CITED2 -173658 sc-eQTL 4.36e-01 -0.0648 0.083 0.177 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000051620 \N 797459 2.67e-07 1.3e-07 4.69e-08 1.86e-07 9.16e-08 9.76e-08 1.53e-07 5.4e-08 1.45e-07 4.94e-08 1.54e-07 8.68e-08 1.52e-07 6.76e-08 6.04e-08 7.36e-08 3.87e-08 1.27e-07 5.82e-08 4.1e-08 1.13e-07 1.27e-07 1.44e-07 2.95e-08 1.46e-07 1.14e-07 1.07e-07 9.65e-08 1.12e-07 1.02e-07 9.7e-08 3.64e-08 3.35e-08 8e-08 7.36e-08 3.62e-08 4.95e-08 9.26e-08 6.37e-08 3.71e-08 5.37e-08 1.4e-07 5.08e-08 1.81e-08 5.15e-08 1.99e-08 1.22e-07 3.83e-09 4.85e-08