logo

Genes within 1Mb (chr6:139197366:T:TTTTG):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000024862 CCDC28A 423857 sc-eQTL 2.09e-01 -0.115 0.0915 0.207 B L1
ENSG00000051620 HEBP2 793835 sc-eQTL 1.91e-01 -0.0915 0.0698 0.207 B L1
ENSG00000112406 HECA 62286 sc-eQTL 8.79e-01 -0.0136 0.0893 0.207 B L1
ENSG00000135597 REPS1 209105 sc-eQTL 2.37e-02 -0.178 0.078 0.207 B L1
ENSG00000146386 ABRACL 168621 sc-eQTL 2.85e-01 -0.0496 0.0462 0.207 B L1
ENSG00000164440 TXLNB -94632 sc-eQTL 7.20e-02 -0.204 0.113 0.207 B L1
ENSG00000164442 CITED2 -177282 sc-eQTL 2.09e-01 -0.0899 0.0713 0.207 B L1
ENSG00000226571 AL592429.2 -73996 sc-eQTL 1.52e-01 0.114 0.0792 0.207 B L1
ENSG00000024862 CCDC28A 423857 sc-eQTL 1.01e-01 -0.167 0.101 0.207 CD4T L1
ENSG00000051620 HEBP2 793835 sc-eQTL 6.44e-02 -0.126 0.068 0.207 CD4T L1
ENSG00000112406 HECA 62286 sc-eQTL 2.57e-01 -0.0965 0.0849 0.207 CD4T L1
ENSG00000135597 REPS1 209105 sc-eQTL 4.36e-01 -0.0522 0.0669 0.207 CD4T L1
ENSG00000146386 ABRACL 168621 sc-eQTL 2.12e-02 0.113 0.0485 0.207 CD4T L1
ENSG00000164442 CITED2 -177282 sc-eQTL 9.03e-02 -0.142 0.0833 0.207 CD4T L1
ENSG00000231329 AL031772.1 -42287 sc-eQTL 1.56e-01 -0.117 0.0823 0.207 CD4T L1
ENSG00000024862 CCDC28A 423857 sc-eQTL 5.34e-01 -0.0694 0.111 0.207 CD8T L1
ENSG00000051620 HEBP2 793835 sc-eQTL 3.63e-02 -0.152 0.0723 0.207 CD8T L1
ENSG00000112406 HECA 62286 sc-eQTL 3.21e-01 -0.0793 0.0796 0.207 CD8T L1
ENSG00000135597 REPS1 209105 sc-eQTL 3.26e-01 0.0738 0.0749 0.207 CD8T L1
ENSG00000146386 ABRACL 168621 sc-eQTL 7.06e-02 0.0771 0.0424 0.207 CD8T L1
ENSG00000164442 CITED2 -177282 sc-eQTL 6.26e-02 -0.151 0.0805 0.207 CD8T L1
ENSG00000231329 AL031772.1 -42287 sc-eQTL 3.40e-02 -0.208 0.0976 0.207 CD8T L1
ENSG00000024862 CCDC28A 423857 sc-eQTL 4.01e-02 -0.227 0.11 0.214 DC L1
ENSG00000051620 HEBP2 793835 sc-eQTL 4.71e-03 -0.219 0.0765 0.214 DC L1
ENSG00000112406 HECA 62286 sc-eQTL 8.60e-01 -0.0161 0.0915 0.214 DC L1
ENSG00000135540 NHSL1 504795 sc-eQTL 3.83e-01 0.0889 0.102 0.214 DC L1
ENSG00000135597 REPS1 209105 sc-eQTL 4.46e-01 -0.0686 0.0899 0.214 DC L1
ENSG00000146386 ABRACL 168621 sc-eQTL 3.35e-02 0.187 0.0872 0.214 DC L1
ENSG00000164442 CITED2 -177282 sc-eQTL 4.26e-01 -0.0834 0.105 0.214 DC L1
ENSG00000225177 AL590617.2 504818 sc-eQTL 6.43e-01 -0.0493 0.106 0.214 DC L1
ENSG00000024862 CCDC28A 423857 sc-eQTL 8.03e-01 -0.0204 0.0817 0.207 Mono L1
ENSG00000051620 HEBP2 793835 sc-eQTL 7.91e-01 -0.015 0.0565 0.207 Mono L1
ENSG00000112406 HECA 62286 sc-eQTL 5.11e-01 -0.0491 0.0745 0.207 Mono L1
ENSG00000135540 NHSL1 504795 sc-eQTL 4.27e-01 0.085 0.107 0.207 Mono L1
ENSG00000135597 REPS1 209105 sc-eQTL 3.92e-01 -0.0535 0.0624 0.207 Mono L1
ENSG00000146386 ABRACL 168621 sc-eQTL 5.60e-02 0.155 0.0807 0.207 Mono L1
ENSG00000164442 CITED2 -177282 sc-eQTL 3.47e-01 0.081 0.0859 0.207 Mono L1
ENSG00000225177 AL590617.2 504818 sc-eQTL 7.40e-01 -0.037 0.111 0.207 Mono L1
ENSG00000024862 CCDC28A 423857 sc-eQTL 8.83e-02 -0.172 0.1 0.208 NK L1
ENSG00000051620 HEBP2 793835 sc-eQTL 2.76e-01 -0.0968 0.0886 0.208 NK L1
ENSG00000112406 HECA 62286 sc-eQTL 6.72e-01 -0.0369 0.0871 0.208 NK L1
ENSG00000135597 REPS1 209105 sc-eQTL 2.76e-01 -0.0904 0.0828 0.208 NK L1
ENSG00000146386 ABRACL 168621 sc-eQTL 9.09e-03 0.157 0.0596 0.208 NK L1
ENSG00000164442 CITED2 -177282 sc-eQTL 3.77e-01 -0.0712 0.0804 0.208 NK L1
ENSG00000024862 CCDC28A 423857 sc-eQTL 1.52e-01 -0.167 0.116 0.207 Other_T L1
ENSG00000051620 HEBP2 793835 sc-eQTL 2.44e-02 -0.169 0.0744 0.207 Other_T L1
ENSG00000112406 HECA 62286 sc-eQTL 7.89e-01 -0.0226 0.0844 0.207 Other_T L1
ENSG00000135597 REPS1 209105 sc-eQTL 1.29e-01 -0.138 0.0902 0.207 Other_T L1
ENSG00000146386 ABRACL 168621 sc-eQTL 5.99e-02 0.111 0.0589 0.207 Other_T L1
ENSG00000164442 CITED2 -177282 sc-eQTL 3.82e-01 -0.0608 0.0694 0.207 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000024862 CCDC28A 423857 sc-eQTL 5.14e-01 -0.0891 0.136 0.204 B_Activated L2
ENSG00000051620 HEBP2 793835 sc-eQTL 8.13e-01 -0.0283 0.12 0.204 B_Activated L2
ENSG00000112406 HECA 62286 sc-eQTL 9.32e-01 0.0111 0.13 0.204 B_Activated L2
ENSG00000135597 REPS1 209105 sc-eQTL 6.04e-02 -0.255 0.135 0.204 B_Activated L2
ENSG00000146386 ABRACL 168621 sc-eQTL 1.10e-01 -0.197 0.122 0.204 B_Activated L2
ENSG00000164440 TXLNB -94632 sc-eQTL 3.05e-01 -0.108 0.105 0.204 B_Activated L2
ENSG00000164442 CITED2 -177282 sc-eQTL 1.44e-01 0.194 0.132 0.204 B_Activated L2
ENSG00000226571 AL592429.2 -73996 sc-eQTL 6.83e-01 0.0542 0.133 0.204 B_Activated L2
ENSG00000024862 CCDC28A 423857 sc-eQTL 7.94e-01 -0.0299 0.115 0.208 B_Intermediate L2
ENSG00000051620 HEBP2 793835 sc-eQTL 1.28e-01 -0.121 0.079 0.208 B_Intermediate L2
ENSG00000112406 HECA 62286 sc-eQTL 2.09e-01 -0.125 0.099 0.208 B_Intermediate L2
ENSG00000135597 REPS1 209105 sc-eQTL 9.29e-01 0.00959 0.107 0.208 B_Intermediate L2
ENSG00000146386 ABRACL 168621 sc-eQTL 2.05e-01 0.115 0.0909 0.208 B_Intermediate L2
ENSG00000164440 TXLNB -94632 sc-eQTL 1.73e-01 -0.152 0.111 0.208 B_Intermediate L2
ENSG00000164442 CITED2 -177282 sc-eQTL 1.80e-01 -0.138 0.102 0.208 B_Intermediate L2
ENSG00000226571 AL592429.2 -73996 sc-eQTL 2.11e-01 0.139 0.111 0.208 B_Intermediate L2
ENSG00000024862 CCDC28A 423857 sc-eQTL 7.04e-02 -0.211 0.116 0.207 B_Memory L2
ENSG00000051620 HEBP2 793835 sc-eQTL 4.02e-01 -0.0737 0.0877 0.207 B_Memory L2
ENSG00000112406 HECA 62286 sc-eQTL 7.10e-01 -0.0376 0.101 0.207 B_Memory L2
ENSG00000135597 REPS1 209105 sc-eQTL 5.74e-01 0.0615 0.109 0.207 B_Memory L2
ENSG00000146386 ABRACL 168621 sc-eQTL 6.06e-01 0.0447 0.0865 0.207 B_Memory L2
ENSG00000164440 TXLNB -94632 sc-eQTL 4.27e-01 -0.0877 0.11 0.207 B_Memory L2
ENSG00000164442 CITED2 -177282 sc-eQTL 9.12e-01 -0.0112 0.101 0.207 B_Memory L2
ENSG00000226571 AL592429.2 -73996 sc-eQTL 2.94e-01 0.131 0.124 0.207 B_Memory L2
ENSG00000024862 CCDC28A 423857 sc-eQTL 6.26e-01 -0.0535 0.109 0.207 B_Naive1 L2
ENSG00000051620 HEBP2 793835 sc-eQTL 1.74e-01 -0.104 0.0767 0.207 B_Naive1 L2
ENSG00000112406 HECA 62286 sc-eQTL 3.23e-01 -0.0944 0.0953 0.207 B_Naive1 L2
ENSG00000135597 REPS1 209105 sc-eQTL 1.60e-01 -0.124 0.088 0.207 B_Naive1 L2
ENSG00000146386 ABRACL 168621 sc-eQTL 2.36e-01 -0.0733 0.0616 0.207 B_Naive1 L2
ENSG00000164440 TXLNB -94632 sc-eQTL 2.89e-01 -0.123 0.115 0.207 B_Naive1 L2
ENSG00000164442 CITED2 -177282 sc-eQTL 4.69e-01 -0.061 0.0841 0.207 B_Naive1 L2
ENSG00000226571 AL592429.2 -73996 sc-eQTL 7.24e-01 0.039 0.11 0.207 B_Naive1 L2
ENSG00000024862 CCDC28A 423857 sc-eQTL 8.60e-01 -0.019 0.108 0.206 B_Naive2 L2
ENSG00000051620 HEBP2 793835 sc-eQTL 7.46e-01 0.0238 0.0736 0.206 B_Naive2 L2
ENSG00000112406 HECA 62286 sc-eQTL 2.33e-01 0.121 0.101 0.206 B_Naive2 L2
ENSG00000135597 REPS1 209105 sc-eQTL 2.84e-01 -0.104 0.0964 0.206 B_Naive2 L2
ENSG00000146386 ABRACL 168621 sc-eQTL 7.48e-02 -0.126 0.0706 0.206 B_Naive2 L2
ENSG00000164440 TXLNB -94632 sc-eQTL 5.43e-01 0.0686 0.113 0.206 B_Naive2 L2
ENSG00000164442 CITED2 -177282 sc-eQTL 3.09e-01 -0.117 0.115 0.206 B_Naive2 L2
ENSG00000226571 AL592429.2 -73996 sc-eQTL 7.75e-01 -0.0303 0.106 0.206 B_Naive2 L2
ENSG00000024862 CCDC28A 423857 sc-eQTL 5.37e-01 -0.0699 0.113 0.205 CD4_CTL L2
ENSG00000051620 HEBP2 793835 sc-eQTL 4.32e-02 -0.197 0.0968 0.205 CD4_CTL L2
ENSG00000112406 HECA 62286 sc-eQTL 5.80e-01 -0.0632 0.114 0.205 CD4_CTL L2
ENSG00000135597 REPS1 209105 sc-eQTL 1.28e-01 -0.169 0.11 0.205 CD4_CTL L2
ENSG00000146386 ABRACL 168621 sc-eQTL 1.82e-01 0.135 0.101 0.205 CD4_CTL L2
ENSG00000164442 CITED2 -177282 sc-eQTL 7.03e-01 -0.0388 0.102 0.205 CD4_CTL L2
ENSG00000231329 AL031772.1 -42287 sc-eQTL 6.88e-02 -0.19 0.104 0.205 CD4_CTL L2
ENSG00000024862 CCDC28A 423857 sc-eQTL 3.95e-02 -0.219 0.106 0.207 CD4_Naive L2
ENSG00000051620 HEBP2 793835 sc-eQTL 1.70e-01 -0.091 0.0662 0.207 CD4_Naive L2
ENSG00000112406 HECA 62286 sc-eQTL 4.35e-01 -0.0648 0.0827 0.207 CD4_Naive L2
ENSG00000135597 REPS1 209105 sc-eQTL 6.47e-01 -0.0337 0.0735 0.207 CD4_Naive L2
ENSG00000146386 ABRACL 168621 sc-eQTL 6.63e-01 0.0216 0.0495 0.207 CD4_Naive L2
ENSG00000164442 CITED2 -177282 sc-eQTL 2.29e-02 -0.19 0.083 0.207 CD4_Naive L2
ENSG00000231329 AL031772.1 -42287 sc-eQTL 9.94e-02 -0.14 0.0844 0.207 CD4_Naive L2
ENSG00000024862 CCDC28A 423857 sc-eQTL 8.64e-01 0.018 0.104 0.207 CD4_TCM L2
ENSG00000051620 HEBP2 793835 sc-eQTL 9.89e-03 -0.199 0.0765 0.207 CD4_TCM L2
ENSG00000112406 HECA 62286 sc-eQTL 2.10e-01 -0.105 0.0832 0.207 CD4_TCM L2
ENSG00000135597 REPS1 209105 sc-eQTL 3.11e-01 -0.0802 0.079 0.207 CD4_TCM L2
ENSG00000146386 ABRACL 168621 sc-eQTL 8.99e-03 0.158 0.0599 0.207 CD4_TCM L2
ENSG00000164442 CITED2 -177282 sc-eQTL 8.92e-02 -0.154 0.09 0.207 CD4_TCM L2
ENSG00000231329 AL031772.1 -42287 sc-eQTL 8.05e-02 -0.171 0.0972 0.207 CD4_TCM L2
ENSG00000024862 CCDC28A 423857 sc-eQTL 9.27e-02 -0.2 0.118 0.207 CD4_TEM L2
ENSG00000051620 HEBP2 793835 sc-eQTL 8.02e-01 -0.0204 0.0811 0.207 CD4_TEM L2
ENSG00000112406 HECA 62286 sc-eQTL 5.25e-01 -0.059 0.0925 0.207 CD4_TEM L2
ENSG00000135597 REPS1 209105 sc-eQTL 7.86e-01 -0.0275 0.101 0.207 CD4_TEM L2
ENSG00000146386 ABRACL 168621 sc-eQTL 1.23e-01 0.111 0.0715 0.207 CD4_TEM L2
ENSG00000164442 CITED2 -177282 sc-eQTL 3.91e-01 -0.081 0.0942 0.207 CD4_TEM L2
ENSG00000231329 AL031772.1 -42287 sc-eQTL 8.36e-01 -0.0204 0.0988 0.207 CD4_TEM L2
ENSG00000024862 CCDC28A 423857 sc-eQTL 6.09e-01 -0.0628 0.123 0.207 CD8_CTL L2
ENSG00000051620 HEBP2 793835 sc-eQTL 1.53e-01 -0.125 0.0872 0.207 CD8_CTL L2
ENSG00000112406 HECA 62286 sc-eQTL 6.13e-01 0.0452 0.0892 0.207 CD8_CTL L2
ENSG00000135597 REPS1 209105 sc-eQTL 4.80e-01 0.0676 0.0955 0.207 CD8_CTL L2
ENSG00000146386 ABRACL 168621 sc-eQTL 4.82e-02 0.152 0.0766 0.207 CD8_CTL L2
ENSG00000164442 CITED2 -177282 sc-eQTL 9.86e-01 -0.00157 0.0901 0.207 CD8_CTL L2
ENSG00000231329 AL031772.1 -42287 sc-eQTL 3.37e-03 -0.314 0.106 0.207 CD8_CTL L2
ENSG00000024862 CCDC28A 423857 sc-eQTL 3.62e-01 -0.105 0.115 0.207 CD8_Naive L2
ENSG00000051620 HEBP2 793835 sc-eQTL 2.69e-02 -0.163 0.073 0.207 CD8_Naive L2
ENSG00000112406 HECA 62286 sc-eQTL 1.68e-01 -0.123 0.0888 0.207 CD8_Naive L2
ENSG00000135597 REPS1 209105 sc-eQTL 6.52e-01 0.0404 0.0894 0.207 CD8_Naive L2
ENSG00000146386 ABRACL 168621 sc-eQTL 7.66e-01 0.014 0.0469 0.207 CD8_Naive L2
ENSG00000164442 CITED2 -177282 sc-eQTL 6.66e-02 -0.173 0.0941 0.207 CD8_Naive L2
ENSG00000231329 AL031772.1 -42287 sc-eQTL 3.07e-01 -0.111 0.108 0.207 CD8_Naive L2
ENSG00000024862 CCDC28A 423857 sc-eQTL 4.54e-01 -0.096 0.128 0.206 CD8_TCM L2
ENSG00000051620 HEBP2 793835 sc-eQTL 4.33e-01 -0.0707 0.0899 0.206 CD8_TCM L2
ENSG00000112406 HECA 62286 sc-eQTL 9.52e-01 -0.00568 0.0937 0.206 CD8_TCM L2
ENSG00000135597 REPS1 209105 sc-eQTL 4.23e-01 0.078 0.0972 0.206 CD8_TCM L2
ENSG00000146386 ABRACL 168621 sc-eQTL 8.77e-01 0.0151 0.097 0.206 CD8_TCM L2
ENSG00000164442 CITED2 -177282 sc-eQTL 7.99e-01 -0.0254 0.0997 0.206 CD8_TCM L2
ENSG00000231329 AL031772.1 -42287 sc-eQTL 8.24e-01 0.0235 0.105 0.206 CD8_TCM L2
ENSG00000024862 CCDC28A 423857 sc-eQTL 8.38e-01 -0.0242 0.119 0.208 CD8_TEM L2
ENSG00000051620 HEBP2 793835 sc-eQTL 3.34e-01 -0.104 0.108 0.208 CD8_TEM L2
ENSG00000112406 HECA 62286 sc-eQTL 2.05e-01 -0.141 0.111 0.208 CD8_TEM L2
ENSG00000135597 REPS1 209105 sc-eQTL 9.45e-01 0.008 0.116 0.208 CD8_TEM L2
ENSG00000146386 ABRACL 168621 sc-eQTL 7.94e-01 -0.0233 0.0891 0.208 CD8_TEM L2
ENSG00000164442 CITED2 -177282 sc-eQTL 4.69e-01 0.0701 0.0967 0.208 CD8_TEM L2
ENSG00000231329 AL031772.1 -42287 sc-eQTL 7.02e-01 -0.0422 0.11 0.208 CD8_TEM L2
ENSG00000024862 CCDC28A 423857 sc-eQTL 4.61e-01 -0.0939 0.127 0.208 MAIT L2
ENSG00000051620 HEBP2 793835 sc-eQTL 6.61e-02 -0.162 0.0876 0.208 MAIT L2
ENSG00000112406 HECA 62286 sc-eQTL 4.44e-01 -0.0741 0.0966 0.208 MAIT L2
ENSG00000135597 REPS1 209105 sc-eQTL 3.66e-01 -0.0941 0.104 0.208 MAIT L2
ENSG00000146386 ABRACL 168621 sc-eQTL 4.96e-01 -0.0522 0.0765 0.208 MAIT L2
ENSG00000164442 CITED2 -177282 sc-eQTL 8.83e-01 -0.0133 0.0902 0.208 MAIT L2
ENSG00000024862 CCDC28A 423857 sc-eQTL 7.66e-01 -0.0345 0.116 0.204 NK_CD56bright L2
ENSG00000051620 HEBP2 793835 sc-eQTL 5.30e-01 -0.0622 0.0988 0.204 NK_CD56bright L2
ENSG00000112406 HECA 62286 sc-eQTL 9.20e-01 0.0106 0.105 0.204 NK_CD56bright L2
ENSG00000135597 REPS1 209105 sc-eQTL 9.95e-01 0.000648 0.0982 0.204 NK_CD56bright L2
ENSG00000146386 ABRACL 168621 sc-eQTL 6.38e-03 0.245 0.0888 0.204 NK_CD56bright L2
ENSG00000164442 CITED2 -177282 sc-eQTL 3.23e-01 0.0959 0.0968 0.204 NK_CD56bright L2
ENSG00000024862 CCDC28A 423857 sc-eQTL 1.63e-01 -0.152 0.108 0.209 NK_CD56dim L2
ENSG00000051620 HEBP2 793835 sc-eQTL 5.98e-01 -0.051 0.0966 0.209 NK_CD56dim L2
ENSG00000112406 HECA 62286 sc-eQTL 9.44e-01 -0.00655 0.0936 0.209 NK_CD56dim L2
ENSG00000135597 REPS1 209105 sc-eQTL 5.44e-02 -0.17 0.088 0.209 NK_CD56dim L2
ENSG00000146386 ABRACL 168621 sc-eQTL 2.22e-02 0.137 0.0593 0.209 NK_CD56dim L2
ENSG00000164442 CITED2 -177282 sc-eQTL 1.62e-01 -0.112 0.0798 0.209 NK_CD56dim L2
ENSG00000024862 CCDC28A 423857 sc-eQTL 3.32e-01 -0.121 0.124 0.203 NK_HLA L2
ENSG00000051620 HEBP2 793835 sc-eQTL 1.02e-01 -0.173 0.105 0.203 NK_HLA L2
ENSG00000112406 HECA 62286 sc-eQTL 1.80e-01 -0.156 0.116 0.203 NK_HLA L2
ENSG00000135597 REPS1 209105 sc-eQTL 5.80e-01 -0.0636 0.115 0.203 NK_HLA L2
ENSG00000146386 ABRACL 168621 sc-eQTL 1.24e-01 0.145 0.094 0.203 NK_HLA L2
ENSG00000164442 CITED2 -177282 sc-eQTL 7.62e-01 -0.0307 0.101 0.203 NK_HLA L2
ENSG00000024862 CCDC28A 423857 sc-eQTL 9.93e-03 -0.284 0.109 0.209 NK_cytokine L2
ENSG00000051620 HEBP2 793835 sc-eQTL 2.47e-01 -0.111 0.0954 0.209 NK_cytokine L2
ENSG00000112406 HECA 62286 sc-eQTL 6.21e-01 -0.0473 0.0956 0.209 NK_cytokine L2
ENSG00000135597 REPS1 209105 sc-eQTL 7.29e-01 -0.0342 0.0987 0.209 NK_cytokine L2
ENSG00000146386 ABRACL 168621 sc-eQTL 1.14e-01 0.1 0.0632 0.209 NK_cytokine L2
ENSG00000164442 CITED2 -177282 sc-eQTL 5.76e-01 -0.0465 0.083 0.209 NK_cytokine L2
ENSG00000024862 CCDC28A 423857 sc-eQTL 3.16e-01 0.144 0.143 0.211 PB L2
ENSG00000051620 HEBP2 793835 sc-eQTL 3.60e-02 0.266 0.125 0.211 PB L2
ENSG00000112406 HECA 62286 sc-eQTL 4.35e-01 0.122 0.156 0.211 PB L2
ENSG00000135597 REPS1 209105 sc-eQTL 2.52e-01 0.159 0.138 0.211 PB L2
ENSG00000146386 ABRACL 168621 sc-eQTL 1.47e-03 0.303 0.0931 0.211 PB L2
ENSG00000164440 TXLNB -94632 sc-eQTL 7.49e-01 -0.0455 0.142 0.211 PB L2
ENSG00000164442 CITED2 -177282 sc-eQTL 1.52e-01 -0.153 0.106 0.211 PB L2
ENSG00000226571 AL592429.2 -73996 sc-eQTL 8.41e-01 -0.0288 0.144 0.211 PB L2
ENSG00000024862 CCDC28A 423857 sc-eQTL 3.12e-01 -0.124 0.122 0.202 Pro_T L2
ENSG00000051620 HEBP2 793835 sc-eQTL 4.56e-01 -0.0726 0.0974 0.202 Pro_T L2
ENSG00000112406 HECA 62286 sc-eQTL 1.29e-01 0.146 0.0958 0.202 Pro_T L2
ENSG00000135597 REPS1 209105 sc-eQTL 2.50e-01 -0.13 0.113 0.202 Pro_T L2
ENSG00000146386 ABRACL 168621 sc-eQTL 1.23e-01 0.113 0.0727 0.202 Pro_T L2
ENSG00000164442 CITED2 -177282 sc-eQTL 8.80e-01 0.0131 0.0872 0.202 Pro_T L2
ENSG00000024862 CCDC28A 423857 sc-eQTL 4.01e-01 -0.0962 0.114 0.207 Treg L2
ENSG00000051620 HEBP2 793835 sc-eQTL 2.80e-01 -0.0846 0.0781 0.207 Treg L2
ENSG00000112406 HECA 62286 sc-eQTL 9.23e-01 0.00917 0.0952 0.207 Treg L2
ENSG00000135597 REPS1 209105 sc-eQTL 2.78e-01 -0.107 0.0983 0.207 Treg L2
ENSG00000146386 ABRACL 168621 sc-eQTL 9.79e-02 0.139 0.0834 0.207 Treg L2
ENSG00000164442 CITED2 -177282 sc-eQTL 8.73e-01 -0.015 0.0937 0.207 Treg L2
ENSG00000231329 AL031772.1 -42287 sc-eQTL 8.62e-02 0.183 0.106 0.207 Treg L2
ENSG00000024862 CCDC28A 423857 sc-eQTL 1.70e-01 -0.153 0.111 0.21 cDC L2
ENSG00000051620 HEBP2 793835 sc-eQTL 1.56e-02 -0.192 0.0788 0.21 cDC L2
ENSG00000112406 HECA 62286 sc-eQTL 8.03e-02 -0.185 0.105 0.21 cDC L2
ENSG00000135540 NHSL1 504795 sc-eQTL 6.93e-01 0.0411 0.104 0.21 cDC L2
ENSG00000135597 REPS1 209105 sc-eQTL 9.96e-01 0.000607 0.12 0.21 cDC L2
ENSG00000146386 ABRACL 168621 sc-eQTL 1.26e-01 0.149 0.0973 0.21 cDC L2
ENSG00000164442 CITED2 -177282 sc-eQTL 7.39e-01 0.0347 0.104 0.21 cDC L2
ENSG00000225177 AL590617.2 504818 sc-eQTL 8.70e-01 -0.0188 0.115 0.21 cDC L2
ENSG00000024862 CCDC28A 423857 sc-eQTL 5.30e-01 -0.0563 0.0894 0.207 cMono_IL1B L2
ENSG00000051620 HEBP2 793835 sc-eQTL 5.92e-01 -0.0345 0.0642 0.207 cMono_IL1B L2
ENSG00000112406 HECA 62286 sc-eQTL 1.67e-01 -0.102 0.0736 0.207 cMono_IL1B L2
ENSG00000135540 NHSL1 504795 sc-eQTL 1.30e-01 0.163 0.107 0.207 cMono_IL1B L2
ENSG00000135597 REPS1 209105 sc-eQTL 5.22e-01 -0.0616 0.096 0.207 cMono_IL1B L2
ENSG00000146386 ABRACL 168621 sc-eQTL 1.26e-02 0.2 0.0797 0.207 cMono_IL1B L2
ENSG00000164442 CITED2 -177282 sc-eQTL 7.64e-01 0.0254 0.0845 0.207 cMono_IL1B L2
ENSG00000225177 AL590617.2 504818 sc-eQTL 5.35e-01 -0.07 0.113 0.207 cMono_IL1B L2
ENSG00000024862 CCDC28A 423857 sc-eQTL 8.48e-01 0.0196 0.103 0.207 cMono_S100A L2
ENSG00000051620 HEBP2 793835 sc-eQTL 8.79e-01 0.0107 0.0702 0.207 cMono_S100A L2
ENSG00000112406 HECA 62286 sc-eQTL 9.41e-01 0.00639 0.0867 0.207 cMono_S100A L2
ENSG00000135540 NHSL1 504795 sc-eQTL 2.22e-01 -0.134 0.109 0.207 cMono_S100A L2
ENSG00000135597 REPS1 209105 sc-eQTL 7.51e-01 0.033 0.104 0.207 cMono_S100A L2
ENSG00000146386 ABRACL 168621 sc-eQTL 2.21e-02 0.206 0.0892 0.207 cMono_S100A L2
ENSG00000164442 CITED2 -177282 sc-eQTL 2.33e-01 0.107 0.0891 0.207 cMono_S100A L2
ENSG00000225177 AL590617.2 504818 sc-eQTL 9.92e-01 -0.00126 0.12 0.207 cMono_S100A L2
ENSG00000024862 CCDC28A 423857 sc-eQTL 1.75e-01 -0.177 0.13 0.224 gdT L2
ENSG00000051620 HEBP2 793835 sc-eQTL 1.02e-02 -0.317 0.122 0.224 gdT L2
ENSG00000112406 HECA 62286 sc-eQTL 6.41e-01 0.0579 0.124 0.224 gdT L2
ENSG00000135597 REPS1 209105 sc-eQTL 7.52e-02 -0.227 0.127 0.224 gdT L2
ENSG00000146386 ABRACL 168621 sc-eQTL 1.45e-02 0.234 0.0946 0.224 gdT L2
ENSG00000164442 CITED2 -177282 sc-eQTL 7.04e-01 -0.0423 0.111 0.224 gdT L2
ENSG00000024862 CCDC28A 423857 sc-eQTL 2.36e-01 -0.143 0.12 0.207 intMono L2
ENSG00000051620 HEBP2 793835 sc-eQTL 9.10e-01 -0.00913 0.0808 0.207 intMono L2
ENSG00000112406 HECA 62286 sc-eQTL 7.86e-01 0.0268 0.0989 0.207 intMono L2
ENSG00000135540 NHSL1 504795 sc-eQTL 5.06e-01 -0.0726 0.109 0.207 intMono L2
ENSG00000135597 REPS1 209105 sc-eQTL 6.28e-01 -0.0546 0.113 0.207 intMono L2
ENSG00000146386 ABRACL 168621 sc-eQTL 9.58e-02 0.171 0.102 0.207 intMono L2
ENSG00000164442 CITED2 -177282 sc-eQTL 1.96e-01 0.129 0.0994 0.207 intMono L2
ENSG00000225177 AL590617.2 504818 sc-eQTL 3.12e-01 -0.124 0.122 0.207 intMono L2
ENSG00000024862 CCDC28A 423857 sc-eQTL 8.59e-01 0.0196 0.11 0.206 ncMono L2
ENSG00000051620 HEBP2 793835 sc-eQTL 4.77e-02 -0.129 0.0649 0.206 ncMono L2
ENSG00000112406 HECA 62286 sc-eQTL 4.86e-01 0.0701 0.1 0.206 ncMono L2
ENSG00000135540 NHSL1 504795 sc-eQTL 3.79e-01 0.093 0.105 0.206 ncMono L2
ENSG00000135597 REPS1 209105 sc-eQTL 5.87e-01 -0.0432 0.0796 0.206 ncMono L2
ENSG00000146386 ABRACL 168621 sc-eQTL 9.78e-02 0.158 0.0953 0.206 ncMono L2
ENSG00000164442 CITED2 -177282 sc-eQTL 1.60e-01 0.114 0.081 0.206 ncMono L2
ENSG00000225177 AL590617.2 504818 sc-eQTL 8.45e-01 -0.023 0.117 0.206 ncMono L2
ENSG00000024862 CCDC28A 423857 sc-eQTL 4.55e-01 -0.0944 0.126 0.201 pDC L2
ENSG00000051620 HEBP2 793835 sc-eQTL 6.89e-02 -0.178 0.0972 0.201 pDC L2
ENSG00000112406 HECA 62286 sc-eQTL 4.80e-01 0.0756 0.107 0.201 pDC L2
ENSG00000135540 NHSL1 504795 sc-eQTL 5.35e-01 0.0608 0.0977 0.201 pDC L2
ENSG00000135597 REPS1 209105 sc-eQTL 4.96e-01 -0.0676 0.099 0.201 pDC L2
ENSG00000146386 ABRACL 168621 sc-eQTL 7.67e-01 -0.0321 0.108 0.201 pDC L2
ENSG00000164442 CITED2 -177282 sc-eQTL 1.92e-01 -0.166 0.127 0.201 pDC L2
ENSG00000225177 AL590617.2 504818 sc-eQTL 9.87e-02 -0.162 0.0974 0.201 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000024862 CCDC28A 423857 sc-eQTL 1.50e-01 -0.158 0.109 0.207 B_Memory LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 793835 sc-eQTL 1.31e-01 -0.115 0.0755 0.207 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112406 HECA 62286 sc-eQTL 5.57e-01 -0.0573 0.0974 0.207 B_Memory LOneK1K
ENSG00000135597 REPS1 209105 sc-eQTL 6.75e-01 -0.0424 0.101 0.207 B_Memory LOneK1K
ENSG00000146386 ABRACL 168621 sc-eQTL 3.37e-01 0.0673 0.0699 0.207 B_Memory LOneK1K
ENSG00000164440 TXLNB -94632 sc-eQTL 7.83e-02 -0.204 0.115 0.207 B_Memory LOneK1K
ENSG00000164442 CITED2 -177282 sc-eQTL 4.32e-01 -0.0774 0.0983 0.207 B_Memory LOneK1K
ENSG00000226571 AL592429.2 -73996 sc-eQTL 2.82e-02 0.25 0.113 0.207 B_Memory LOneK1K
ENSG00000024862 CCDC28A 423857 sc-eQTL 4.85e-01 -0.0715 0.102 0.207 B_Naive LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 793835 sc-eQTL 3.47e-01 -0.0668 0.0709 0.207 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112406 HECA 62286 sc-eQTL 7.86e-01 -0.026 0.0958 0.207 B_Naive LOneK1K
ENSG00000135597 REPS1 209105 sc-eQTL 3.68e-02 -0.17 0.0808 0.207 B_Naive LOneK1K
ENSG00000146386 ABRACL 168621 sc-eQTL 4.88e-02 -0.112 0.0568 0.207 B_Naive LOneK1K
ENSG00000164440 TXLNB -94632 sc-eQTL 8.56e-01 -0.0218 0.12 0.207 B_Naive LOneK1K
ENSG00000164442 CITED2 -177282 sc-eQTL 2.90e-01 -0.0922 0.0869 0.207 B_Naive LOneK1K
ENSG00000226571 AL592429.2 -73996 sc-eQTL 9.06e-01 0.0121 0.102 0.207 B_Naive LOneK1K
ENSG00000024862 CCDC28A 423857 sc-eQTL 7.77e-01 -0.0234 0.0823 0.207 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 793835 sc-eQTL 6.78e-01 -0.0255 0.0614 0.207 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112406 HECA 62286 sc-eQTL 3.48e-01 -0.0693 0.0737 0.207 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000135540 NHSL1 504795 sc-eQTL 6.24e-01 0.053 0.108 0.207 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000135597 REPS1 209105 sc-eQTL 9.04e-01 -0.0107 0.0888 0.207 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000146386 ABRACL 168621 sc-eQTL 1.52e-02 0.191 0.0779 0.207 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000164442 CITED2 -177282 sc-eQTL 6.16e-01 0.0434 0.0865 0.207 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000225177 AL590617.2 504818 sc-eQTL 6.30e-01 -0.0559 0.116 0.207 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000024862 CCDC28A 423857 sc-eQTL 9.76e-01 0.00329 0.111 0.209 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 793835 sc-eQTL 1.78e-01 -0.0797 0.0589 0.209 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112406 HECA 62286 sc-eQTL 7.44e-01 0.031 0.0946 0.209 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000135540 NHSL1 504795 sc-eQTL 8.08e-01 0.0256 0.105 0.209 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000135597 REPS1 209105 sc-eQTL 9.93e-02 -0.108 0.0651 0.209 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000146386 ABRACL 168621 sc-eQTL 1.05e-01 0.155 0.0953 0.209 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000164442 CITED2 -177282 sc-eQTL 2.72e-01 0.0907 0.0824 0.209 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000225177 AL590617.2 504818 sc-eQTL 7.78e-01 -0.0328 0.116 0.209 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000024862 CCDC28A 423857 sc-eQTL 5.12e-02 -0.203 0.104 0.209 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 793835 sc-eQTL 2.49e-01 -0.104 0.0903 0.209 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112406 HECA 62286 sc-eQTL 6.56e-01 -0.0397 0.0891 0.209 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000135597 REPS1 209105 sc-eQTL 2.63e-01 -0.0974 0.0868 0.209 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000146386 ABRACL 168621 sc-eQTL 3.14e-02 0.12 0.0556 0.209 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000164442 CITED2 -177282 sc-eQTL 3.72e-01 -0.0725 0.0811 0.209 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000051620 HEBP2 793835 eQTL 0.0358 -0.0493 0.0235 0.0 0.0 0.228
ENSG00000112406 HECA 62286 eQTL 5.3e-10 0.0704 0.0112 0.0 0.0 0.228
ENSG00000146386 ABRACL 168621 eQTL 0.00128 0.0896 0.0277 0.0 0.0 0.228
ENSG00000231329 AL031772.1 -42287 eQTL 0.0034 -0.0637 0.0217 0.00109 0.0 0.228

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000112406 HECA 62286 3.54e-05 1.04e-05 9.7e-07 6.77e-06 2.06e-06 8.25e-06 1.57e-05 9.61e-07 7.7e-06 5.12e-06 1.04e-05 4.98e-06 1.3e-05 3.95e-06 2.82e-06 6.67e-06 3.86e-06 9.3e-06 2.23e-06 2.26e-06 4.57e-06 8.17e-06 1.03e-05 3.36e-06 1.49e-05 2.46e-06 5.26e-06 3.68e-06 1.24e-05 7.92e-06 3.68e-06 8.91e-07 7.34e-07 3.24e-06 3.56e-06 1.11e-06 1.26e-06 5e-07 1.38e-06 1.26e-06 9.74e-07 1.39e-05 2.14e-06 1.62e-07 7.85e-07 1.82e-06 1.91e-06 4.11e-07 4.39e-07
ENSG00000146386 ABRACL 168621 5.01e-06 2.49e-06 3.67e-07 2.42e-06 4.75e-07 1.53e-06 2.37e-06 3.82e-07 1.71e-06 1.09e-06 1.93e-06 1.29e-06 3.27e-06 1.47e-06 9.75e-07 1.54e-06 9.77e-07 2.24e-06 5.54e-07 6.46e-07 7.69e-07 3.05e-06 3.09e-06 9.81e-07 3.5e-06 1.2e-06 1.5e-06 1.64e-06 2.64e-06 2.46e-06 8.22e-07 2.96e-07 2.61e-07 1.87e-06 1.27e-06 5.39e-07 8.92e-07 2.26e-07 7.65e-07 3.79e-07 2.44e-07 3.36e-06 5e-07 1.99e-07 3.41e-07 7.78e-07 6.26e-07 8.41e-08 5.77e-08
ENSG00000231329 AL031772.1 -42287 4.85e-05 1.24e-05 1.21e-06 8.31e-06 2.38e-06 1.19e-05 1.98e-05 1.25e-06 9.83e-06 5.41e-06 1.24e-05 5.9e-06 1.58e-05 3.95e-06 3.64e-06 8.42e-06 4.9e-06 1.11e-05 2.6e-06 2.76e-06 5.87e-06 1e-05 1.33e-05 3.52e-06 2.07e-05 3.49e-06 6.69e-06 4.78e-06 1.44e-05 9.25e-06 4.81e-06 1.09e-06 7.03e-07 3.53e-06 4.73e-06 2.07e-06 1.63e-06 7.41e-07 1.62e-06 1.34e-06 1.04e-06 1.71e-05 2.68e-06 1.8e-07 8.47e-07 1.96e-06 2.18e-06 6.95e-07 6.03e-07