logo

Genes within 1Mb (chr6:139194003:G:A):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000024862 CCDC28A 420494 sc-eQTL 5.55e-01 -0.059 0.0997 0.15 B L1
ENSG00000051620 HEBP2 790472 sc-eQTL 3.30e-01 -0.0741 0.0759 0.15 B L1
ENSG00000112406 HECA 58923 sc-eQTL 9.37e-01 -0.00772 0.097 0.15 B L1
ENSG00000135597 REPS1 205742 sc-eQTL 5.07e-01 -0.0569 0.0856 0.15 B L1
ENSG00000146386 ABRACL 165258 sc-eQTL 8.48e-01 0.00964 0.0503 0.15 B L1
ENSG00000164440 TXLNB -97995 sc-eQTL 4.37e-02 -0.248 0.122 0.15 B L1
ENSG00000164442 CITED2 -180645 sc-eQTL 2.83e-01 -0.0833 0.0775 0.15 B L1
ENSG00000226571 AL592429.2 -77359 sc-eQTL 1.98e-02 0.2 0.0853 0.15 B L1
ENSG00000024862 CCDC28A 420494 sc-eQTL 3.12e-01 -0.111 0.11 0.15 CD4T L1
ENSG00000051620 HEBP2 790472 sc-eQTL 1.11e-01 -0.118 0.0735 0.15 CD4T L1
ENSG00000112406 HECA 58923 sc-eQTL 2.06e-01 -0.116 0.0915 0.15 CD4T L1
ENSG00000135597 REPS1 205742 sc-eQTL 6.42e-01 -0.0336 0.0722 0.15 CD4T L1
ENSG00000146386 ABRACL 165258 sc-eQTL 1.34e-01 0.0792 0.0527 0.15 CD4T L1
ENSG00000164442 CITED2 -180645 sc-eQTL 1.89e-01 -0.119 0.0901 0.15 CD4T L1
ENSG00000231329 AL031772.1 -45650 sc-eQTL 1.26e-01 -0.136 0.0887 0.15 CD4T L1
ENSG00000024862 CCDC28A 420494 sc-eQTL 5.40e-01 0.0741 0.121 0.15 CD8T L1
ENSG00000051620 HEBP2 790472 sc-eQTL 2.85e-02 -0.172 0.0782 0.15 CD8T L1
ENSG00000112406 HECA 58923 sc-eQTL 7.61e-02 -0.153 0.0858 0.15 CD8T L1
ENSG00000135597 REPS1 205742 sc-eQTL 1.84e-01 0.108 0.081 0.15 CD8T L1
ENSG00000146386 ABRACL 165258 sc-eQTL 4.68e-02 0.0917 0.0459 0.15 CD8T L1
ENSG00000164442 CITED2 -180645 sc-eQTL 1.57e-01 -0.124 0.0875 0.15 CD8T L1
ENSG00000231329 AL031772.1 -45650 sc-eQTL 1.60e-01 -0.15 0.106 0.15 CD8T L1
ENSG00000024862 CCDC28A 420494 sc-eQTL 1.17e-02 -0.3 0.118 0.155 DC L1
ENSG00000051620 HEBP2 790472 sc-eQTL 8.54e-02 -0.144 0.0836 0.155 DC L1
ENSG00000112406 HECA 58923 sc-eQTL 7.82e-01 -0.0273 0.0986 0.155 DC L1
ENSG00000135540 NHSL1 501432 sc-eQTL 9.81e-01 -0.00261 0.11 0.155 DC L1
ENSG00000135597 REPS1 205742 sc-eQTL 3.28e-01 0.095 0.0969 0.155 DC L1
ENSG00000146386 ABRACL 165258 sc-eQTL 1.14e-01 0.15 0.0945 0.155 DC L1
ENSG00000164442 CITED2 -180645 sc-eQTL 8.18e-01 -0.0261 0.113 0.155 DC L1
ENSG00000225177 AL590617.2 501455 sc-eQTL 8.88e-01 -0.0161 0.115 0.155 DC L1
ENSG00000024862 CCDC28A 420494 sc-eQTL 7.94e-01 -0.023 0.0879 0.15 Mono L1
ENSG00000051620 HEBP2 790472 sc-eQTL 9.03e-01 -0.00743 0.0609 0.15 Mono L1
ENSG00000112406 HECA 58923 sc-eQTL 5.50e-01 -0.048 0.0802 0.15 Mono L1
ENSG00000135540 NHSL1 501432 sc-eQTL 8.77e-01 0.0178 0.115 0.15 Mono L1
ENSG00000135597 REPS1 205742 sc-eQTL 5.36e-01 0.0417 0.0672 0.15 Mono L1
ENSG00000146386 ABRACL 165258 sc-eQTL 2.82e-01 0.0942 0.0874 0.15 Mono L1
ENSG00000164442 CITED2 -180645 sc-eQTL 3.18e-01 0.0926 0.0924 0.15 Mono L1
ENSG00000225177 AL590617.2 501455 sc-eQTL 8.54e-01 -0.022 0.12 0.15 Mono L1
ENSG00000024862 CCDC28A 420494 sc-eQTL 2.81e-01 -0.118 0.109 0.15 NK L1
ENSG00000051620 HEBP2 790472 sc-eQTL 4.82e-01 -0.0675 0.0959 0.15 NK L1
ENSG00000112406 HECA 58923 sc-eQTL 4.63e-01 -0.0692 0.0941 0.15 NK L1
ENSG00000135597 REPS1 205742 sc-eQTL 7.39e-01 -0.03 0.0897 0.15 NK L1
ENSG00000146386 ABRACL 165258 sc-eQTL 1.06e-01 0.105 0.0651 0.15 NK L1
ENSG00000164442 CITED2 -180645 sc-eQTL 6.69e-01 -0.0372 0.087 0.15 NK L1
ENSG00000024862 CCDC28A 420494 sc-eQTL 7.14e-01 -0.0462 0.126 0.15 Other_T L1
ENSG00000051620 HEBP2 790472 sc-eQTL 1.27e-01 -0.124 0.081 0.15 Other_T L1
ENSG00000112406 HECA 58923 sc-eQTL 4.02e-01 -0.0765 0.0911 0.15 Other_T L1
ENSG00000135597 REPS1 205742 sc-eQTL 2.75e-01 -0.107 0.0979 0.15 Other_T L1
ENSG00000146386 ABRACL 165258 sc-eQTL 3.40e-01 0.0614 0.0641 0.15 Other_T L1
ENSG00000164442 CITED2 -180645 sc-eQTL 5.38e-01 -0.0464 0.0752 0.15 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000024862 CCDC28A 420494 sc-eQTL 7.28e-01 0.0508 0.146 0.145 B_Activated L2
ENSG00000051620 HEBP2 790472 sc-eQTL 6.95e-01 0.0503 0.128 0.145 B_Activated L2
ENSG00000112406 HECA 58923 sc-eQTL 4.17e-01 0.113 0.139 0.145 B_Activated L2
ENSG00000135597 REPS1 205742 sc-eQTL 9.11e-01 0.0164 0.146 0.145 B_Activated L2
ENSG00000146386 ABRACL 165258 sc-eQTL 2.40e-01 -0.155 0.131 0.145 B_Activated L2
ENSG00000164440 TXLNB -97995 sc-eQTL 5.26e-01 -0.0716 0.113 0.145 B_Activated L2
ENSG00000164442 CITED2 -180645 sc-eQTL 3.24e-01 0.14 0.141 0.145 B_Activated L2
ENSG00000226571 AL592429.2 -77359 sc-eQTL 3.17e-01 0.142 0.141 0.145 B_Activated L2
ENSG00000024862 CCDC28A 420494 sc-eQTL 7.69e-01 0.0366 0.124 0.15 B_Intermediate L2
ENSG00000051620 HEBP2 790472 sc-eQTL 4.58e-01 -0.0639 0.0859 0.15 B_Intermediate L2
ENSG00000112406 HECA 58923 sc-eQTL 2.64e-01 -0.12 0.107 0.15 B_Intermediate L2
ENSG00000135597 REPS1 205742 sc-eQTL 9.30e-01 0.0101 0.116 0.15 B_Intermediate L2
ENSG00000146386 ABRACL 165258 sc-eQTL 2.19e-01 0.121 0.0984 0.15 B_Intermediate L2
ENSG00000164440 TXLNB -97995 sc-eQTL 3.81e-01 -0.106 0.121 0.15 B_Intermediate L2
ENSG00000164442 CITED2 -180645 sc-eQTL 1.39e-01 -0.164 0.111 0.15 B_Intermediate L2
ENSG00000226571 AL592429.2 -77359 sc-eQTL 4.23e-02 0.244 0.119 0.15 B_Intermediate L2
ENSG00000024862 CCDC28A 420494 sc-eQTL 1.95e-01 -0.162 0.125 0.149 B_Memory L2
ENSG00000051620 HEBP2 790472 sc-eQTL 6.65e-01 -0.0408 0.0941 0.149 B_Memory L2
ENSG00000112406 HECA 58923 sc-eQTL 5.70e-01 -0.0615 0.108 0.149 B_Memory L2
ENSG00000135597 REPS1 205742 sc-eQTL 6.49e-01 0.0534 0.117 0.149 B_Memory L2
ENSG00000146386 ABRACL 165258 sc-eQTL 7.02e-01 -0.0355 0.0928 0.149 B_Memory L2
ENSG00000164440 TXLNB -97995 sc-eQTL 7.13e-01 -0.0437 0.118 0.149 B_Memory L2
ENSG00000164442 CITED2 -180645 sc-eQTL 5.81e-01 0.0602 0.109 0.149 B_Memory L2
ENSG00000226571 AL592429.2 -77359 sc-eQTL 5.62e-01 0.0775 0.133 0.149 B_Memory L2
ENSG00000024862 CCDC28A 420494 sc-eQTL 6.58e-01 -0.0525 0.118 0.15 B_Naive1 L2
ENSG00000051620 HEBP2 790472 sc-eQTL 1.96e-01 -0.108 0.083 0.15 B_Naive1 L2
ENSG00000112406 HECA 58923 sc-eQTL 4.44e-01 -0.079 0.103 0.15 B_Naive1 L2
ENSG00000135597 REPS1 205742 sc-eQTL 5.32e-01 -0.0598 0.0955 0.15 B_Naive1 L2
ENSG00000146386 ABRACL 165258 sc-eQTL 4.92e-01 0.0459 0.0668 0.15 B_Naive1 L2
ENSG00000164440 TXLNB -97995 sc-eQTL 5.59e-01 -0.0732 0.125 0.15 B_Naive1 L2
ENSG00000164442 CITED2 -180645 sc-eQTL 8.15e-01 -0.0213 0.0911 0.15 B_Naive1 L2
ENSG00000226571 AL592429.2 -77359 sc-eQTL 2.53e-01 0.137 0.119 0.15 B_Naive1 L2
ENSG00000024862 CCDC28A 420494 sc-eQTL 3.82e-01 -0.102 0.117 0.148 B_Naive2 L2
ENSG00000051620 HEBP2 790472 sc-eQTL 2.04e-01 0.101 0.0796 0.148 B_Naive2 L2
ENSG00000112406 HECA 58923 sc-eQTL 3.99e-01 0.0927 0.11 0.148 B_Naive2 L2
ENSG00000135597 REPS1 205742 sc-eQTL 9.04e-01 -0.0127 0.105 0.148 B_Naive2 L2
ENSG00000146386 ABRACL 165258 sc-eQTL 7.07e-01 -0.029 0.0772 0.148 B_Naive2 L2
ENSG00000164440 TXLNB -97995 sc-eQTL 3.42e-01 -0.116 0.122 0.148 B_Naive2 L2
ENSG00000164442 CITED2 -180645 sc-eQTL 8.32e-02 -0.216 0.124 0.148 B_Naive2 L2
ENSG00000226571 AL592429.2 -77359 sc-eQTL 8.72e-01 0.0185 0.115 0.148 B_Naive2 L2
ENSG00000024862 CCDC28A 420494 sc-eQTL 6.48e-01 -0.0554 0.121 0.152 CD4_CTL L2
ENSG00000051620 HEBP2 790472 sc-eQTL 1.11e-01 -0.166 0.104 0.152 CD4_CTL L2
ENSG00000112406 HECA 58923 sc-eQTL 6.34e-01 -0.0582 0.122 0.152 CD4_CTL L2
ENSG00000135597 REPS1 205742 sc-eQTL 2.57e-01 -0.135 0.118 0.152 CD4_CTL L2
ENSG00000146386 ABRACL 165258 sc-eQTL 3.77e-02 0.224 0.107 0.152 CD4_CTL L2
ENSG00000164442 CITED2 -180645 sc-eQTL 9.70e-01 -0.00412 0.109 0.152 CD4_CTL L2
ENSG00000231329 AL031772.1 -45650 sc-eQTL 1.00e-01 -0.184 0.111 0.152 CD4_CTL L2
ENSG00000024862 CCDC28A 420494 sc-eQTL 1.85e-01 -0.153 0.115 0.15 CD4_Naive L2
ENSG00000051620 HEBP2 790472 sc-eQTL 2.01e-01 -0.0921 0.0718 0.15 CD4_Naive L2
ENSG00000112406 HECA 58923 sc-eQTL 2.76e-01 -0.0979 0.0895 0.15 CD4_Naive L2
ENSG00000135597 REPS1 205742 sc-eQTL 7.18e-01 -0.0288 0.0796 0.15 CD4_Naive L2
ENSG00000146386 ABRACL 165258 sc-eQTL 7.90e-01 0.0143 0.0536 0.15 CD4_Naive L2
ENSG00000164442 CITED2 -180645 sc-eQTL 1.16e-01 -0.143 0.0905 0.15 CD4_Naive L2
ENSG00000231329 AL031772.1 -45650 sc-eQTL 1.06e-01 -0.149 0.0915 0.15 CD4_Naive L2
ENSG00000024862 CCDC28A 420494 sc-eQTL 5.97e-01 0.0599 0.113 0.15 CD4_TCM L2
ENSG00000051620 HEBP2 790472 sc-eQTL 2.41e-02 -0.189 0.0833 0.15 CD4_TCM L2
ENSG00000112406 HECA 58923 sc-eQTL 1.86e-01 -0.12 0.0903 0.15 CD4_TCM L2
ENSG00000135597 REPS1 205742 sc-eQTL 5.91e-01 -0.0462 0.0859 0.15 CD4_TCM L2
ENSG00000146386 ABRACL 165258 sc-eQTL 5.44e-02 0.127 0.0655 0.15 CD4_TCM L2
ENSG00000164442 CITED2 -180645 sc-eQTL 4.94e-01 -0.0674 0.0982 0.15 CD4_TCM L2
ENSG00000231329 AL031772.1 -45650 sc-eQTL 2.86e-01 -0.113 0.106 0.15 CD4_TCM L2
ENSG00000024862 CCDC28A 420494 sc-eQTL 5.06e-02 -0.25 0.127 0.15 CD4_TEM L2
ENSG00000051620 HEBP2 790472 sc-eQTL 7.65e-01 -0.0262 0.0874 0.15 CD4_TEM L2
ENSG00000112406 HECA 58923 sc-eQTL 3.34e-01 -0.0966 0.0996 0.15 CD4_TEM L2
ENSG00000135597 REPS1 205742 sc-eQTL 8.11e-01 0.026 0.109 0.15 CD4_TEM L2
ENSG00000146386 ABRACL 165258 sc-eQTL 4.06e-01 0.0645 0.0775 0.15 CD4_TEM L2
ENSG00000164442 CITED2 -180645 sc-eQTL 4.29e-01 -0.0806 0.102 0.15 CD4_TEM L2
ENSG00000231329 AL031772.1 -45650 sc-eQTL 1.22e-01 -0.165 0.106 0.15 CD4_TEM L2
ENSG00000024862 CCDC28A 420494 sc-eQTL 8.51e-01 0.0248 0.132 0.15 CD8_CTL L2
ENSG00000051620 HEBP2 790472 sc-eQTL 2.34e-01 -0.112 0.094 0.15 CD8_CTL L2
ENSG00000112406 HECA 58923 sc-eQTL 7.43e-01 -0.0316 0.0961 0.15 CD8_CTL L2
ENSG00000135597 REPS1 205742 sc-eQTL 8.42e-02 0.177 0.102 0.15 CD8_CTL L2
ENSG00000146386 ABRACL 165258 sc-eQTL 9.91e-03 0.213 0.082 0.15 CD8_CTL L2
ENSG00000164442 CITED2 -180645 sc-eQTL 8.47e-01 -0.0188 0.097 0.15 CD8_CTL L2
ENSG00000231329 AL031772.1 -45650 sc-eQTL 2.56e-02 -0.258 0.115 0.15 CD8_CTL L2
ENSG00000024862 CCDC28A 420494 sc-eQTL 9.93e-01 0.00105 0.125 0.15 CD8_Naive L2
ENSG00000051620 HEBP2 790472 sc-eQTL 6.39e-02 -0.148 0.0795 0.15 CD8_Naive L2
ENSG00000112406 HECA 58923 sc-eQTL 1.64e-01 -0.135 0.0964 0.15 CD8_Naive L2
ENSG00000135597 REPS1 205742 sc-eQTL 4.04e-01 0.0811 0.0969 0.15 CD8_Naive L2
ENSG00000146386 ABRACL 165258 sc-eQTL 4.37e-01 0.0396 0.0508 0.15 CD8_Naive L2
ENSG00000164442 CITED2 -180645 sc-eQTL 3.87e-01 -0.0891 0.103 0.15 CD8_Naive L2
ENSG00000231329 AL031772.1 -45650 sc-eQTL 5.31e-01 -0.0739 0.118 0.15 CD8_Naive L2
ENSG00000024862 CCDC28A 420494 sc-eQTL 6.92e-01 -0.0544 0.137 0.146 CD8_TCM L2
ENSG00000051620 HEBP2 790472 sc-eQTL 2.93e-01 -0.102 0.0963 0.146 CD8_TCM L2
ENSG00000112406 HECA 58923 sc-eQTL 7.62e-01 -0.0305 0.101 0.146 CD8_TCM L2
ENSG00000135597 REPS1 205742 sc-eQTL 4.44e-01 0.0801 0.104 0.146 CD8_TCM L2
ENSG00000146386 ABRACL 165258 sc-eQTL 8.49e-01 0.0199 0.104 0.146 CD8_TCM L2
ENSG00000164442 CITED2 -180645 sc-eQTL 7.37e-01 -0.0359 0.107 0.146 CD8_TCM L2
ENSG00000231329 AL031772.1 -45650 sc-eQTL 6.54e-02 0.207 0.112 0.146 CD8_TCM L2
ENSG00000024862 CCDC28A 420494 sc-eQTL 7.14e-01 0.0469 0.128 0.153 CD8_TEM L2
ENSG00000051620 HEBP2 790472 sc-eQTL 7.79e-01 -0.0327 0.116 0.153 CD8_TEM L2
ENSG00000112406 HECA 58923 sc-eQTL 2.16e-02 -0.273 0.118 0.153 CD8_TEM L2
ENSG00000135597 REPS1 205742 sc-eQTL 7.79e-01 -0.035 0.125 0.153 CD8_TEM L2
ENSG00000146386 ABRACL 165258 sc-eQTL 9.95e-01 -0.000662 0.096 0.153 CD8_TEM L2
ENSG00000164442 CITED2 -180645 sc-eQTL 6.55e-01 0.0467 0.104 0.153 CD8_TEM L2
ENSG00000231329 AL031772.1 -45650 sc-eQTL 8.84e-01 -0.0173 0.119 0.153 CD8_TEM L2
ENSG00000024862 CCDC28A 420494 sc-eQTL 5.68e-01 -0.0775 0.136 0.152 MAIT L2
ENSG00000051620 HEBP2 790472 sc-eQTL 2.46e-01 -0.109 0.0939 0.152 MAIT L2
ENSG00000112406 HECA 58923 sc-eQTL 2.13e-01 -0.128 0.103 0.152 MAIT L2
ENSG00000135597 REPS1 205742 sc-eQTL 2.98e-01 -0.116 0.111 0.152 MAIT L2
ENSG00000146386 ABRACL 165258 sc-eQTL 1.51e-01 -0.117 0.0813 0.152 MAIT L2
ENSG00000164442 CITED2 -180645 sc-eQTL 5.21e-01 0.0618 0.0961 0.152 MAIT L2
ENSG00000024862 CCDC28A 420494 sc-eQTL 7.59e-01 -0.0391 0.127 0.147 NK_CD56bright L2
ENSG00000051620 HEBP2 790472 sc-eQTL 9.91e-01 -0.00122 0.108 0.147 NK_CD56bright L2
ENSG00000112406 HECA 58923 sc-eQTL 9.62e-01 -0.00545 0.115 0.147 NK_CD56bright L2
ENSG00000135597 REPS1 205742 sc-eQTL 5.20e-01 0.0692 0.107 0.147 NK_CD56bright L2
ENSG00000146386 ABRACL 165258 sc-eQTL 9.22e-03 0.256 0.0973 0.147 NK_CD56bright L2
ENSG00000164442 CITED2 -180645 sc-eQTL 3.00e-01 0.11 0.106 0.147 NK_CD56bright L2
ENSG00000024862 CCDC28A 420494 sc-eQTL 5.77e-01 -0.0654 0.117 0.151 NK_CD56dim L2
ENSG00000051620 HEBP2 790472 sc-eQTL 9.30e-01 0.00919 0.104 0.151 NK_CD56dim L2
ENSG00000112406 HECA 58923 sc-eQTL 7.22e-01 -0.0358 0.101 0.151 NK_CD56dim L2
ENSG00000135597 REPS1 205742 sc-eQTL 4.77e-02 -0.188 0.0945 0.151 NK_CD56dim L2
ENSG00000146386 ABRACL 165258 sc-eQTL 2.29e-02 0.146 0.0638 0.151 NK_CD56dim L2
ENSG00000164442 CITED2 -180645 sc-eQTL 5.48e-01 -0.0518 0.086 0.151 NK_CD56dim L2
ENSG00000024862 CCDC28A 420494 sc-eQTL 6.16e-01 -0.0674 0.134 0.148 NK_HLA L2
ENSG00000051620 HEBP2 790472 sc-eQTL 1.44e-01 -0.167 0.114 0.148 NK_HLA L2
ENSG00000112406 HECA 58923 sc-eQTL 1.80e-01 -0.168 0.125 0.148 NK_HLA L2
ENSG00000135597 REPS1 205742 sc-eQTL 3.64e-01 -0.113 0.124 0.148 NK_HLA L2
ENSG00000146386 ABRACL 165258 sc-eQTL 5.63e-01 0.059 0.102 0.148 NK_HLA L2
ENSG00000164442 CITED2 -180645 sc-eQTL 7.62e-01 -0.033 0.109 0.148 NK_HLA L2
ENSG00000024862 CCDC28A 420494 sc-eQTL 6.51e-02 -0.221 0.119 0.151 NK_cytokine L2
ENSG00000051620 HEBP2 790472 sc-eQTL 3.45e-01 -0.0978 0.103 0.151 NK_cytokine L2
ENSG00000112406 HECA 58923 sc-eQTL 6.12e-01 -0.0526 0.103 0.151 NK_cytokine L2
ENSG00000135597 REPS1 205742 sc-eQTL 7.69e-01 0.0314 0.107 0.151 NK_cytokine L2
ENSG00000146386 ABRACL 165258 sc-eQTL 4.07e-01 0.0571 0.0687 0.151 NK_cytokine L2
ENSG00000164442 CITED2 -180645 sc-eQTL 5.77e-01 -0.0502 0.0898 0.151 NK_cytokine L2
ENSG00000024862 CCDC28A 420494 sc-eQTL 2.08e-01 0.194 0.153 0.156 PB L2
ENSG00000051620 HEBP2 790472 sc-eQTL 1.89e-01 0.18 0.136 0.156 PB L2
ENSG00000112406 HECA 58923 sc-eQTL 5.97e-01 0.089 0.168 0.156 PB L2
ENSG00000135597 REPS1 205742 sc-eQTL 3.94e-01 0.128 0.149 0.156 PB L2
ENSG00000146386 ABRACL 165258 sc-eQTL 9.18e-05 0.397 0.0977 0.156 PB L2
ENSG00000164440 TXLNB -97995 sc-eQTL 6.30e-01 -0.0737 0.153 0.156 PB L2
ENSG00000164442 CITED2 -180645 sc-eQTL 2.83e-01 -0.124 0.114 0.156 PB L2
ENSG00000226571 AL592429.2 -77359 sc-eQTL 7.83e-01 -0.0427 0.154 0.156 PB L2
ENSG00000024862 CCDC28A 420494 sc-eQTL 8.37e-01 0.0274 0.133 0.146 Pro_T L2
ENSG00000051620 HEBP2 790472 sc-eQTL 7.98e-01 -0.0271 0.106 0.146 Pro_T L2
ENSG00000112406 HECA 58923 sc-eQTL 6.77e-01 0.0436 0.104 0.146 Pro_T L2
ENSG00000135597 REPS1 205742 sc-eQTL 6.15e-01 -0.0618 0.123 0.146 Pro_T L2
ENSG00000146386 ABRACL 165258 sc-eQTL 3.97e-01 0.0672 0.0791 0.146 Pro_T L2
ENSG00000164442 CITED2 -180645 sc-eQTL 7.67e-01 -0.028 0.0944 0.146 Pro_T L2
ENSG00000024862 CCDC28A 420494 sc-eQTL 5.72e-01 -0.0699 0.123 0.15 Treg L2
ENSG00000051620 HEBP2 790472 sc-eQTL 3.68e-01 -0.076 0.0842 0.15 Treg L2
ENSG00000112406 HECA 58923 sc-eQTL 7.79e-01 -0.0289 0.103 0.15 Treg L2
ENSG00000135597 REPS1 205742 sc-eQTL 6.71e-01 -0.0452 0.106 0.15 Treg L2
ENSG00000146386 ABRACL 165258 sc-eQTL 4.53e-01 0.068 0.0904 0.15 Treg L2
ENSG00000164442 CITED2 -180645 sc-eQTL 6.40e-01 -0.0473 0.101 0.15 Treg L2
ENSG00000231329 AL031772.1 -45650 sc-eQTL 4.39e-02 0.232 0.114 0.15 Treg L2
ENSG00000024862 CCDC28A 420494 sc-eQTL 4.68e-02 -0.237 0.118 0.154 cDC L2
ENSG00000051620 HEBP2 790472 sc-eQTL 2.77e-01 -0.0934 0.0856 0.154 cDC L2
ENSG00000112406 HECA 58923 sc-eQTL 3.83e-02 -0.235 0.113 0.154 cDC L2
ENSG00000135540 NHSL1 501432 sc-eQTL 7.34e-01 -0.0379 0.111 0.154 cDC L2
ENSG00000135597 REPS1 205742 sc-eQTL 7.50e-01 0.041 0.128 0.154 cDC L2
ENSG00000146386 ABRACL 165258 sc-eQTL 5.08e-02 0.204 0.104 0.154 cDC L2
ENSG00000164442 CITED2 -180645 sc-eQTL 7.18e-01 0.0403 0.111 0.154 cDC L2
ENSG00000225177 AL590617.2 501455 sc-eQTL 9.11e-01 0.0137 0.123 0.154 cDC L2
ENSG00000024862 CCDC28A 420494 sc-eQTL 5.61e-01 -0.0558 0.096 0.15 cMono_IL1B L2
ENSG00000051620 HEBP2 790472 sc-eQTL 9.07e-01 -0.00811 0.069 0.15 cMono_IL1B L2
ENSG00000112406 HECA 58923 sc-eQTL 3.55e-01 -0.0734 0.0792 0.15 cMono_IL1B L2
ENSG00000135540 NHSL1 501432 sc-eQTL 3.14e-01 0.116 0.115 0.15 cMono_IL1B L2
ENSG00000135597 REPS1 205742 sc-eQTL 9.93e-01 -0.000879 0.103 0.15 cMono_IL1B L2
ENSG00000146386 ABRACL 165258 sc-eQTL 7.92e-02 0.152 0.0862 0.15 cMono_IL1B L2
ENSG00000164442 CITED2 -180645 sc-eQTL 5.32e-01 0.0569 0.0907 0.15 cMono_IL1B L2
ENSG00000225177 AL590617.2 501455 sc-eQTL 6.52e-01 -0.0546 0.121 0.15 cMono_IL1B L2
ENSG00000024862 CCDC28A 420494 sc-eQTL 9.53e-01 -0.00652 0.111 0.15 cMono_S100A L2
ENSG00000051620 HEBP2 790472 sc-eQTL 8.24e-01 -0.0169 0.0758 0.15 cMono_S100A L2
ENSG00000112406 HECA 58923 sc-eQTL 5.29e-01 -0.059 0.0935 0.15 cMono_S100A L2
ENSG00000135540 NHSL1 501432 sc-eQTL 6.92e-01 -0.0471 0.119 0.15 cMono_S100A L2
ENSG00000135597 REPS1 205742 sc-eQTL 7.33e-01 0.0384 0.112 0.15 cMono_S100A L2
ENSG00000146386 ABRACL 165258 sc-eQTL 1.68e-01 0.134 0.0971 0.15 cMono_S100A L2
ENSG00000164442 CITED2 -180645 sc-eQTL 7.73e-02 0.17 0.0959 0.15 cMono_S100A L2
ENSG00000225177 AL590617.2 501455 sc-eQTL 8.25e-01 0.0287 0.13 0.15 cMono_S100A L2
ENSG00000024862 CCDC28A 420494 sc-eQTL 5.72e-01 -0.081 0.143 0.152 gdT L2
ENSG00000051620 HEBP2 790472 sc-eQTL 2.53e-01 -0.156 0.136 0.152 gdT L2
ENSG00000112406 HECA 58923 sc-eQTL 9.80e-01 -0.00338 0.136 0.152 gdT L2
ENSG00000135597 REPS1 205742 sc-eQTL 3.90e-01 -0.121 0.14 0.152 gdT L2
ENSG00000146386 ABRACL 165258 sc-eQTL 3.51e-01 0.0989 0.106 0.152 gdT L2
ENSG00000164442 CITED2 -180645 sc-eQTL 2.84e-01 -0.131 0.122 0.152 gdT L2
ENSG00000024862 CCDC28A 420494 sc-eQTL 7.08e-01 -0.0482 0.129 0.149 intMono L2
ENSG00000051620 HEBP2 790472 sc-eQTL 7.12e-01 -0.0319 0.0863 0.149 intMono L2
ENSG00000112406 HECA 58923 sc-eQTL 3.35e-01 0.102 0.105 0.149 intMono L2
ENSG00000135540 NHSL1 501432 sc-eQTL 4.58e-01 -0.0864 0.116 0.149 intMono L2
ENSG00000135597 REPS1 205742 sc-eQTL 8.35e-01 0.0251 0.12 0.149 intMono L2
ENSG00000146386 ABRACL 165258 sc-eQTL 3.05e-01 0.113 0.109 0.149 intMono L2
ENSG00000164442 CITED2 -180645 sc-eQTL 7.38e-01 0.0357 0.107 0.149 intMono L2
ENSG00000225177 AL590617.2 501455 sc-eQTL 5.63e-01 -0.0756 0.13 0.149 intMono L2
ENSG00000024862 CCDC28A 420494 sc-eQTL 7.63e-01 0.0355 0.118 0.149 ncMono L2
ENSG00000051620 HEBP2 790472 sc-eQTL 3.95e-01 -0.0597 0.0701 0.149 ncMono L2
ENSG00000112406 HECA 58923 sc-eQTL 9.47e-01 0.00711 0.108 0.149 ncMono L2
ENSG00000135540 NHSL1 501432 sc-eQTL 4.92e-01 0.0778 0.113 0.149 ncMono L2
ENSG00000135597 REPS1 205742 sc-eQTL 7.06e-01 0.0322 0.0853 0.149 ncMono L2
ENSG00000146386 ABRACL 165258 sc-eQTL 6.88e-02 0.186 0.102 0.149 ncMono L2
ENSG00000164442 CITED2 -180645 sc-eQTL 1.57e-01 0.123 0.0868 0.149 ncMono L2
ENSG00000225177 AL590617.2 501455 sc-eQTL 6.69e-01 0.0538 0.126 0.149 ncMono L2
ENSG00000024862 CCDC28A 420494 sc-eQTL 1.31e-01 -0.208 0.137 0.144 pDC L2
ENSG00000051620 HEBP2 790472 sc-eQTL 3.03e-01 -0.11 0.107 0.144 pDC L2
ENSG00000112406 HECA 58923 sc-eQTL 7.06e-01 0.0441 0.117 0.144 pDC L2
ENSG00000135540 NHSL1 501432 sc-eQTL 6.74e-01 0.0449 0.107 0.144 pDC L2
ENSG00000135597 REPS1 205742 sc-eQTL 7.38e-01 0.0361 0.108 0.144 pDC L2
ENSG00000146386 ABRACL 165258 sc-eQTL 1.72e-01 -0.161 0.117 0.144 pDC L2
ENSG00000164442 CITED2 -180645 sc-eQTL 3.53e-01 -0.129 0.138 0.144 pDC L2
ENSG00000225177 AL590617.2 501455 sc-eQTL 2.38e-01 -0.126 0.107 0.144 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000024862 CCDC28A 420494 sc-eQTL 6.44e-01 -0.0547 0.118 0.15 B_Memory LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 790472 sc-eQTL 2.93e-01 -0.0863 0.0818 0.15 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112406 HECA 58923 sc-eQTL 6.85e-01 -0.0428 0.105 0.15 B_Memory LOneK1K
ENSG00000135597 REPS1 205742 sc-eQTL 8.76e-01 0.0171 0.109 0.15 B_Memory LOneK1K
ENSG00000146386 ABRACL 165258 sc-eQTL 6.36e-01 0.0359 0.0757 0.15 B_Memory LOneK1K
ENSG00000164440 TXLNB -97995 sc-eQTL 4.23e-01 -0.1 0.125 0.15 B_Memory LOneK1K
ENSG00000164442 CITED2 -180645 sc-eQTL 6.10e-01 -0.0543 0.106 0.15 B_Memory LOneK1K
ENSG00000226571 AL592429.2 -77359 sc-eQTL 1.07e-02 0.313 0.122 0.15 B_Memory LOneK1K
ENSG00000024862 CCDC28A 420494 sc-eQTL 3.07e-01 -0.113 0.11 0.15 B_Naive LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 790472 sc-eQTL 5.41e-01 -0.0469 0.0765 0.15 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112406 HECA 58923 sc-eQTL 7.14e-01 -0.038 0.103 0.15 B_Naive LOneK1K
ENSG00000135597 REPS1 205742 sc-eQTL 4.37e-01 -0.0685 0.0879 0.15 B_Naive LOneK1K
ENSG00000146386 ABRACL 165258 sc-eQTL 6.33e-01 -0.0295 0.0617 0.15 B_Naive LOneK1K
ENSG00000164440 TXLNB -97995 sc-eQTL 2.44e-01 -0.15 0.129 0.15 B_Naive LOneK1K
ENSG00000164442 CITED2 -180645 sc-eQTL 6.12e-01 -0.0476 0.0939 0.15 B_Naive LOneK1K
ENSG00000226571 AL592429.2 -77359 sc-eQTL 2.41e-01 0.129 0.11 0.15 B_Naive LOneK1K
ENSG00000024862 CCDC28A 420494 sc-eQTL 6.93e-01 -0.0352 0.089 0.15 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 790472 sc-eQTL 9.50e-01 -0.00413 0.0664 0.15 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112406 HECA 58923 sc-eQTL 4.74e-01 -0.0572 0.0798 0.15 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000135540 NHSL1 501432 sc-eQTL 7.80e-01 0.0326 0.117 0.15 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000135597 REPS1 205742 sc-eQTL 7.27e-01 0.0336 0.096 0.15 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000146386 ABRACL 165258 sc-eQTL 1.45e-01 0.124 0.085 0.15 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000164442 CITED2 -180645 sc-eQTL 3.26e-01 0.0918 0.0933 0.15 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000225177 AL590617.2 501455 sc-eQTL 6.73e-01 -0.0529 0.125 0.15 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000024862 CCDC28A 420494 sc-eQTL 8.89e-01 0.0166 0.119 0.151 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 790472 sc-eQTL 2.52e-01 -0.0727 0.0633 0.151 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112406 HECA 58923 sc-eQTL 5.33e-01 0.0634 0.101 0.151 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000135540 NHSL1 501432 sc-eQTL 5.65e-01 -0.065 0.113 0.151 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000135597 REPS1 205742 sc-eQTL 8.45e-01 0.0138 0.0703 0.151 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000146386 ABRACL 165258 sc-eQTL 7.10e-02 0.185 0.102 0.151 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000164442 CITED2 -180645 sc-eQTL 3.03e-01 0.0913 0.0884 0.151 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000225177 AL590617.2 501455 sc-eQTL 7.49e-01 0.04 0.125 0.151 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000024862 CCDC28A 420494 sc-eQTL 2.86e-01 -0.12 0.112 0.151 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 790472 sc-eQTL 4.44e-01 -0.0748 0.0975 0.151 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112406 HECA 58923 sc-eQTL 5.64e-01 -0.0555 0.0959 0.151 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000135597 REPS1 205742 sc-eQTL 5.99e-01 -0.0493 0.0937 0.151 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000146386 ABRACL 165258 sc-eQTL 7.45e-02 0.108 0.0601 0.151 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000164442 CITED2 -180645 sc-eQTL 6.52e-01 -0.0395 0.0874 0.151 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000112406 HECA 58923 eQTL 1.83e-10 0.0793 0.0123 0.0 0.0 0.177
ENSG00000146386 ABRACL 165258 eQTL 0.0221 0.07 0.0305 0.0 0.0 0.177
ENSG00000231329 AL031772.1 -45650 eQTL 0.0114 -0.0605 0.0239 0.0 0.0 0.177

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000112406 HECA 58923 7.68e-06 9.28e-06 1.34e-06 4.56e-06 2.38e-06 3.93e-06 1e-05 1.76e-06 7.74e-06 4.74e-06 1.07e-05 5.03e-06 1.26e-05 3.86e-06 2.23e-06 6.29e-06 3.7e-06 6.03e-06 2.61e-06 2.77e-06 4.74e-06 8.17e-06 7.17e-06 3.4e-06 1.29e-05 3.49e-06 4.56e-06 3.44e-06 9.12e-06 8.22e-06 4.57e-06 9.74e-07 1.17e-06 3.24e-06 3.62e-06 2.65e-06 1.87e-06 1.94e-06 2.02e-06 9.68e-07 1.11e-06 1.07e-05 1.19e-06 2.52e-07 8.27e-07 1.72e-06 1.46e-06 7.8e-07 4.64e-07
ENSG00000231329 AL031772.1 -45650 9.17e-06 9.98e-06 1.61e-06 6.11e-06 2.44e-06 4.35e-06 1.17e-05 2.19e-06 1e-05 5.35e-06 1.28e-05 5.73e-06 1.64e-05 3.56e-06 3.18e-06 6.74e-06 4.99e-06 8.11e-06 3.14e-06 2.89e-06 6.18e-06 1.04e-05 9.61e-06 3.7e-06 1.7e-05 4.3e-06 5.56e-06 4.73e-06 1.22e-05 1.1e-05 5.8e-06 9.92e-07 1.24e-06 3.69e-06 4.76e-06 2.82e-06 1.78e-06 2.06e-06 1.96e-06 1.21e-06 1.36e-06 1.3e-05 1.42e-06 2.96e-07 9.58e-07 1.75e-06 1.87e-06 6.58e-07 4.43e-07