logo

Genes within 1Mb (chr6:139183198:T:C):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000024862 CCDC28A 409689 sc-eQTL 1.65e-01 -0.128 0.0918 0.237 B L1
ENSG00000051620 HEBP2 779667 sc-eQTL 3.28e-01 -0.0689 0.0702 0.237 B L1
ENSG00000112406 HECA 48118 sc-eQTL 9.44e-01 -0.00634 0.0897 0.237 B L1
ENSG00000135597 REPS1 194937 sc-eQTL 1.38e-01 -0.117 0.0788 0.237 B L1
ENSG00000146386 ABRACL 154453 sc-eQTL 3.58e-01 -0.0428 0.0465 0.237 B L1
ENSG00000164440 TXLNB -108800 sc-eQTL 1.84e-01 -0.151 0.114 0.237 B L1
ENSG00000164442 CITED2 -191450 sc-eQTL 6.80e-01 -0.0296 0.0718 0.237 B L1
ENSG00000226571 AL592429.2 -88164 sc-eQTL 1.91e-01 0.104 0.0796 0.237 B L1
ENSG00000024862 CCDC28A 409689 sc-eQTL 1.19e-01 -0.159 0.102 0.237 CD4T L1
ENSG00000051620 HEBP2 779667 sc-eQTL 3.15e-01 -0.069 0.0684 0.237 CD4T L1
ENSG00000112406 HECA 48118 sc-eQTL 2.52e-01 -0.0975 0.0849 0.237 CD4T L1
ENSG00000135597 REPS1 194937 sc-eQTL 4.34e-01 -0.0524 0.0669 0.237 CD4T L1
ENSG00000146386 ABRACL 154453 sc-eQTL 3.21e-01 0.0488 0.049 0.237 CD4T L1
ENSG00000164442 CITED2 -191450 sc-eQTL 9.38e-02 -0.14 0.0833 0.237 CD4T L1
ENSG00000231329 AL031772.1 -56455 sc-eQTL 5.24e-02 -0.16 0.0819 0.237 CD4T L1
ENSG00000024862 CCDC28A 409689 sc-eQTL 3.14e-01 -0.112 0.111 0.237 CD8T L1
ENSG00000051620 HEBP2 779667 sc-eQTL 4.29e-02 -0.147 0.0724 0.237 CD8T L1
ENSG00000112406 HECA 48118 sc-eQTL 2.10e-01 -0.1 0.0796 0.237 CD8T L1
ENSG00000135597 REPS1 194937 sc-eQTL 2.20e-01 0.0921 0.0749 0.237 CD8T L1
ENSG00000146386 ABRACL 154453 sc-eQTL 1.82e-01 0.0571 0.0426 0.237 CD8T L1
ENSG00000164442 CITED2 -191450 sc-eQTL 8.15e-02 -0.141 0.0807 0.237 CD8T L1
ENSG00000231329 AL031772.1 -56455 sc-eQTL 2.30e-01 -0.118 0.0984 0.237 CD8T L1
ENSG00000024862 CCDC28A 409689 sc-eQTL 1.20e-01 -0.174 0.112 0.241 DC L1
ENSG00000051620 HEBP2 779667 sc-eQTL 3.73e-03 -0.227 0.0774 0.241 DC L1
ENSG00000112406 HECA 48118 sc-eQTL 5.82e-01 -0.0511 0.0925 0.241 DC L1
ENSG00000135540 NHSL1 490627 sc-eQTL 7.26e-01 -0.0362 0.103 0.241 DC L1
ENSG00000135597 REPS1 194937 sc-eQTL 3.86e-01 -0.079 0.091 0.241 DC L1
ENSG00000146386 ABRACL 154453 sc-eQTL 1.90e-01 0.117 0.0889 0.241 DC L1
ENSG00000164442 CITED2 -191450 sc-eQTL 3.51e-01 -0.0988 0.106 0.241 DC L1
ENSG00000225177 AL590617.2 490650 sc-eQTL 6.83e-01 0.0441 0.108 0.241 DC L1
ENSG00000024862 CCDC28A 409689 sc-eQTL 8.33e-01 -0.0173 0.0818 0.237 Mono L1
ENSG00000051620 HEBP2 779667 sc-eQTL 3.91e-01 0.0486 0.0565 0.237 Mono L1
ENSG00000112406 HECA 48118 sc-eQTL 3.65e-01 -0.0676 0.0745 0.237 Mono L1
ENSG00000135540 NHSL1 490627 sc-eQTL 7.70e-01 0.0314 0.107 0.237 Mono L1
ENSG00000135597 REPS1 194937 sc-eQTL 1.77e-01 -0.0845 0.0624 0.237 Mono L1
ENSG00000146386 ABRACL 154453 sc-eQTL 4.92e-02 0.16 0.0808 0.237 Mono L1
ENSG00000164442 CITED2 -191450 sc-eQTL 8.30e-01 0.0185 0.0862 0.237 Mono L1
ENSG00000225177 AL590617.2 490650 sc-eQTL 7.11e-01 0.0413 0.111 0.237 Mono L1
ENSG00000024862 CCDC28A 409689 sc-eQTL 1.25e-01 -0.154 0.0996 0.238 NK L1
ENSG00000051620 HEBP2 779667 sc-eQTL 4.56e-01 -0.0658 0.0881 0.238 NK L1
ENSG00000112406 HECA 48118 sc-eQTL 4.44e-01 -0.0663 0.0864 0.238 NK L1
ENSG00000135597 REPS1 194937 sc-eQTL 3.14e-01 -0.0829 0.0822 0.238 NK L1
ENSG00000146386 ABRACL 154453 sc-eQTL 4.31e-02 0.121 0.0596 0.238 NK L1
ENSG00000164442 CITED2 -191450 sc-eQTL 5.03e-01 -0.0536 0.0799 0.238 NK L1
ENSG00000024862 CCDC28A 409689 sc-eQTL 2.42e-01 -0.137 0.116 0.237 Other_T L1
ENSG00000051620 HEBP2 779667 sc-eQTL 6.10e-02 -0.141 0.0748 0.237 Other_T L1
ENSG00000112406 HECA 48118 sc-eQTL 3.85e-01 -0.0734 0.0844 0.237 Other_T L1
ENSG00000135597 REPS1 194937 sc-eQTL 1.65e-01 -0.126 0.0905 0.237 Other_T L1
ENSG00000146386 ABRACL 154453 sc-eQTL 5.03e-02 0.116 0.059 0.237 Other_T L1
ENSG00000164442 CITED2 -191450 sc-eQTL 6.31e-01 -0.0335 0.0696 0.237 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000024862 CCDC28A 409689 sc-eQTL 5.83e-01 -0.0756 0.137 0.23 B_Activated L2
ENSG00000051620 HEBP2 779667 sc-eQTL 6.67e-01 -0.0519 0.12 0.23 B_Activated L2
ENSG00000112406 HECA 48118 sc-eQTL 5.80e-01 0.0725 0.131 0.23 B_Activated L2
ENSG00000135597 REPS1 194937 sc-eQTL 2.14e-01 -0.17 0.137 0.23 B_Activated L2
ENSG00000146386 ABRACL 154453 sc-eQTL 3.17e-01 -0.124 0.124 0.23 B_Activated L2
ENSG00000164440 TXLNB -108800 sc-eQTL 3.79e-01 -0.0936 0.106 0.23 B_Activated L2
ENSG00000164442 CITED2 -191450 sc-eQTL 2.69e-01 0.148 0.133 0.23 B_Activated L2
ENSG00000226571 AL592429.2 -88164 sc-eQTL 3.72e-01 0.119 0.133 0.23 B_Activated L2
ENSG00000024862 CCDC28A 409689 sc-eQTL 8.16e-01 0.027 0.116 0.238 B_Intermediate L2
ENSG00000051620 HEBP2 779667 sc-eQTL 2.50e-01 -0.0921 0.0799 0.238 B_Intermediate L2
ENSG00000112406 HECA 48118 sc-eQTL 2.00e-01 -0.128 0.0998 0.238 B_Intermediate L2
ENSG00000135597 REPS1 194937 sc-eQTL 8.06e-01 0.0266 0.108 0.238 B_Intermediate L2
ENSG00000146386 ABRACL 154453 sc-eQTL 4.64e-01 0.0674 0.0919 0.238 B_Intermediate L2
ENSG00000164440 TXLNB -108800 sc-eQTL 3.41e-01 -0.107 0.112 0.238 B_Intermediate L2
ENSG00000164442 CITED2 -191450 sc-eQTL 9.52e-01 0.00621 0.104 0.238 B_Intermediate L2
ENSG00000226571 AL592429.2 -88164 sc-eQTL 4.33e-01 0.0881 0.112 0.238 B_Intermediate L2
ENSG00000024862 CCDC28A 409689 sc-eQTL 2.66e-02 -0.258 0.115 0.237 B_Memory L2
ENSG00000051620 HEBP2 779667 sc-eQTL 5.02e-01 -0.0591 0.0878 0.237 B_Memory L2
ENSG00000112406 HECA 48118 sc-eQTL 7.32e-01 -0.0346 0.101 0.237 B_Memory L2
ENSG00000135597 REPS1 194937 sc-eQTL 9.90e-01 -0.00138 0.109 0.237 B_Memory L2
ENSG00000146386 ABRACL 154453 sc-eQTL 6.78e-01 -0.036 0.0865 0.237 B_Memory L2
ENSG00000164440 TXLNB -108800 sc-eQTL 1.52e-01 -0.158 0.11 0.237 B_Memory L2
ENSG00000164442 CITED2 -191450 sc-eQTL 8.23e-01 0.0227 0.102 0.237 B_Memory L2
ENSG00000226571 AL592429.2 -88164 sc-eQTL 2.38e-01 0.147 0.124 0.237 B_Memory L2
ENSG00000024862 CCDC28A 409689 sc-eQTL 7.99e-01 -0.0281 0.11 0.237 B_Naive1 L2
ENSG00000051620 HEBP2 779667 sc-eQTL 2.08e-01 -0.0977 0.0773 0.237 B_Naive1 L2
ENSG00000112406 HECA 48118 sc-eQTL 6.83e-01 -0.0393 0.0962 0.237 B_Naive1 L2
ENSG00000135597 REPS1 194937 sc-eQTL 4.34e-01 -0.0697 0.0889 0.237 B_Naive1 L2
ENSG00000146386 ABRACL 154453 sc-eQTL 3.82e-01 -0.0545 0.0622 0.237 B_Naive1 L2
ENSG00000164440 TXLNB -108800 sc-eQTL 6.70e-01 -0.0498 0.117 0.237 B_Naive1 L2
ENSG00000164442 CITED2 -191450 sc-eQTL 8.82e-01 0.0126 0.0848 0.237 B_Naive1 L2
ENSG00000226571 AL592429.2 -88164 sc-eQTL 9.16e-01 -0.0117 0.111 0.237 B_Naive1 L2
ENSG00000024862 CCDC28A 409689 sc-eQTL 1.49e-01 -0.156 0.108 0.236 B_Naive2 L2
ENSG00000051620 HEBP2 779667 sc-eQTL 7.10e-01 0.0275 0.0739 0.236 B_Naive2 L2
ENSG00000112406 HECA 48118 sc-eQTL 4.21e-01 0.0819 0.102 0.236 B_Naive2 L2
ENSG00000135597 REPS1 194937 sc-eQTL 4.01e-01 -0.0816 0.097 0.236 B_Naive2 L2
ENSG00000146386 ABRACL 154453 sc-eQTL 9.24e-01 -0.00686 0.0715 0.236 B_Naive2 L2
ENSG00000164440 TXLNB -108800 sc-eQTL 2.87e-01 0.12 0.113 0.236 B_Naive2 L2
ENSG00000164442 CITED2 -191450 sc-eQTL 3.93e-01 -0.0986 0.115 0.236 B_Naive2 L2
ENSG00000226571 AL592429.2 -88164 sc-eQTL 9.89e-01 -0.00147 0.106 0.236 B_Naive2 L2
ENSG00000024862 CCDC28A 409689 sc-eQTL 1.70e-01 -0.152 0.11 0.236 CD4_CTL L2
ENSG00000051620 HEBP2 779667 sc-eQTL 2.15e-01 -0.119 0.0955 0.236 CD4_CTL L2
ENSG00000112406 HECA 48118 sc-eQTL 3.93e-01 -0.0958 0.112 0.236 CD4_CTL L2
ENSG00000135597 REPS1 194937 sc-eQTL 4.33e-02 -0.219 0.108 0.236 CD4_CTL L2
ENSG00000146386 ABRACL 154453 sc-eQTL 1.60e-01 0.139 0.0986 0.236 CD4_CTL L2
ENSG00000164442 CITED2 -191450 sc-eQTL 9.33e-01 -0.00834 0.0996 0.236 CD4_CTL L2
ENSG00000231329 AL031772.1 -56455 sc-eQTL 1.68e-02 -0.244 0.101 0.236 CD4_CTL L2
ENSG00000024862 CCDC28A 409689 sc-eQTL 2.08e-02 -0.246 0.106 0.237 CD4_Naive L2
ENSG00000051620 HEBP2 779667 sc-eQTL 5.33e-01 -0.0416 0.0666 0.237 CD4_Naive L2
ENSG00000112406 HECA 48118 sc-eQTL 4.52e-01 -0.0625 0.083 0.237 CD4_Naive L2
ENSG00000135597 REPS1 194937 sc-eQTL 4.70e-01 -0.0533 0.0736 0.237 CD4_Naive L2
ENSG00000146386 ABRACL 154453 sc-eQTL 6.22e-01 -0.0245 0.0496 0.237 CD4_Naive L2
ENSG00000164442 CITED2 -191450 sc-eQTL 3.06e-02 -0.182 0.0834 0.237 CD4_Naive L2
ENSG00000231329 AL031772.1 -56455 sc-eQTL 7.62e-02 -0.151 0.0846 0.237 CD4_Naive L2
ENSG00000024862 CCDC28A 409689 sc-eQTL 7.79e-01 0.0294 0.105 0.237 CD4_TCM L2
ENSG00000051620 HEBP2 779667 sc-eQTL 1.19e-01 -0.121 0.0775 0.237 CD4_TCM L2
ENSG00000112406 HECA 48118 sc-eQTL 1.92e-01 -0.109 0.0834 0.237 CD4_TCM L2
ENSG00000135597 REPS1 194937 sc-eQTL 3.89e-01 -0.0685 0.0793 0.237 CD4_TCM L2
ENSG00000146386 ABRACL 154453 sc-eQTL 2.62e-01 0.0685 0.0609 0.237 CD4_TCM L2
ENSG00000164442 CITED2 -191450 sc-eQTL 7.53e-02 -0.161 0.0901 0.237 CD4_TCM L2
ENSG00000231329 AL031772.1 -56455 sc-eQTL 8.11e-02 -0.171 0.0974 0.237 CD4_TCM L2
ENSG00000024862 CCDC28A 409689 sc-eQTL 1.38e-01 -0.177 0.119 0.237 CD4_TEM L2
ENSG00000051620 HEBP2 779667 sc-eQTL 6.60e-01 -0.0358 0.0812 0.237 CD4_TEM L2
ENSG00000112406 HECA 48118 sc-eQTL 3.29e-01 -0.0906 0.0925 0.237 CD4_TEM L2
ENSG00000135597 REPS1 194937 sc-eQTL 8.36e-01 0.0209 0.101 0.237 CD4_TEM L2
ENSG00000146386 ABRACL 154453 sc-eQTL 1.35e-01 0.107 0.0717 0.237 CD4_TEM L2
ENSG00000164442 CITED2 -191450 sc-eQTL 3.81e-01 -0.0829 0.0944 0.237 CD4_TEM L2
ENSG00000231329 AL031772.1 -56455 sc-eQTL 3.63e-01 -0.09 0.0987 0.237 CD4_TEM L2
ENSG00000024862 CCDC28A 409689 sc-eQTL 9.54e-01 -0.00696 0.122 0.237 CD8_CTL L2
ENSG00000051620 HEBP2 779667 sc-eQTL 2.66e-01 -0.0967 0.0868 0.237 CD8_CTL L2
ENSG00000112406 HECA 48118 sc-eQTL 9.00e-01 0.0112 0.0887 0.237 CD8_CTL L2
ENSG00000135597 REPS1 194937 sc-eQTL 2.69e-01 0.105 0.0947 0.237 CD8_CTL L2
ENSG00000146386 ABRACL 154453 sc-eQTL 2.78e-02 0.168 0.0759 0.237 CD8_CTL L2
ENSG00000164442 CITED2 -191450 sc-eQTL 9.78e-01 0.00249 0.0895 0.237 CD8_CTL L2
ENSG00000231329 AL031772.1 -56455 sc-eQTL 1.59e-02 -0.257 0.106 0.237 CD8_CTL L2
ENSG00000024862 CCDC28A 409689 sc-eQTL 9.57e-02 -0.192 0.115 0.237 CD8_Naive L2
ENSG00000051620 HEBP2 779667 sc-eQTL 8.94e-02 -0.125 0.0734 0.237 CD8_Naive L2
ENSG00000112406 HECA 48118 sc-eQTL 1.27e-01 -0.136 0.0887 0.237 CD8_Naive L2
ENSG00000135597 REPS1 194937 sc-eQTL 9.72e-01 -0.00319 0.0895 0.237 CD8_Naive L2
ENSG00000146386 ABRACL 154453 sc-eQTL 9.92e-01 -0.000478 0.0469 0.237 CD8_Naive L2
ENSG00000164442 CITED2 -191450 sc-eQTL 7.39e-02 -0.169 0.0941 0.237 CD8_Naive L2
ENSG00000231329 AL031772.1 -56455 sc-eQTL 7.43e-01 -0.0356 0.109 0.237 CD8_Naive L2
ENSG00000024862 CCDC28A 409689 sc-eQTL 4.48e-01 -0.0974 0.128 0.236 CD8_TCM L2
ENSG00000051620 HEBP2 779667 sc-eQTL 3.61e-01 -0.0823 0.0899 0.236 CD8_TCM L2
ENSG00000112406 HECA 48118 sc-eQTL 8.24e-01 -0.0209 0.0937 0.236 CD8_TCM L2
ENSG00000135597 REPS1 194937 sc-eQTL 6.91e-01 0.0388 0.0974 0.236 CD8_TCM L2
ENSG00000146386 ABRACL 154453 sc-eQTL 9.07e-01 -0.0114 0.0971 0.236 CD8_TCM L2
ENSG00000164442 CITED2 -191450 sc-eQTL 7.56e-01 -0.0311 0.0997 0.236 CD8_TCM L2
ENSG00000231329 AL031772.1 -56455 sc-eQTL 6.53e-01 0.0474 0.105 0.236 CD8_TCM L2
ENSG00000024862 CCDC28A 409689 sc-eQTL 3.65e-01 -0.108 0.119 0.235 CD8_TEM L2
ENSG00000051620 HEBP2 779667 sc-eQTL 2.64e-01 -0.121 0.108 0.235 CD8_TEM L2
ENSG00000112406 HECA 48118 sc-eQTL 1.05e-01 -0.181 0.111 0.235 CD8_TEM L2
ENSG00000135597 REPS1 194937 sc-eQTL 8.31e-01 -0.0248 0.116 0.235 CD8_TEM L2
ENSG00000146386 ABRACL 154453 sc-eQTL 6.39e-01 0.042 0.0894 0.235 CD8_TEM L2
ENSG00000164442 CITED2 -191450 sc-eQTL 7.53e-01 0.0306 0.0972 0.235 CD8_TEM L2
ENSG00000231329 AL031772.1 -56455 sc-eQTL 7.23e-01 -0.0393 0.111 0.235 CD8_TEM L2
ENSG00000024862 CCDC28A 409689 sc-eQTL 5.34e-01 -0.0791 0.127 0.238 MAIT L2
ENSG00000051620 HEBP2 779667 sc-eQTL 4.99e-02 -0.172 0.0874 0.238 MAIT L2
ENSG00000112406 HECA 48118 sc-eQTL 1.68e-01 -0.133 0.0962 0.238 MAIT L2
ENSG00000135597 REPS1 194937 sc-eQTL 5.80e-01 -0.0577 0.104 0.238 MAIT L2
ENSG00000146386 ABRACL 154453 sc-eQTL 9.96e-01 0.000351 0.0765 0.238 MAIT L2
ENSG00000164442 CITED2 -191450 sc-eQTL 9.04e-01 -0.0109 0.0901 0.238 MAIT L2
ENSG00000024862 CCDC28A 409689 sc-eQTL 7.83e-01 -0.0322 0.117 0.233 NK_CD56bright L2
ENSG00000051620 HEBP2 779667 sc-eQTL 5.78e-01 -0.0554 0.0994 0.233 NK_CD56bright L2
ENSG00000112406 HECA 48118 sc-eQTL 8.31e-01 -0.0226 0.106 0.233 NK_CD56bright L2
ENSG00000135597 REPS1 194937 sc-eQTL 5.88e-01 -0.0535 0.0986 0.233 NK_CD56bright L2
ENSG00000146386 ABRACL 154453 sc-eQTL 6.42e-02 0.168 0.0902 0.233 NK_CD56bright L2
ENSG00000164442 CITED2 -191450 sc-eQTL 4.68e-01 0.0709 0.0974 0.233 NK_CD56bright L2
ENSG00000024862 CCDC28A 409689 sc-eQTL 9.35e-02 -0.181 0.108 0.239 NK_CD56dim L2
ENSG00000051620 HEBP2 779667 sc-eQTL 8.30e-01 -0.0207 0.0961 0.239 NK_CD56dim L2
ENSG00000112406 HECA 48118 sc-eQTL 5.58e-01 -0.0546 0.0931 0.239 NK_CD56dim L2
ENSG00000135597 REPS1 194937 sc-eQTL 8.22e-02 -0.153 0.0877 0.239 NK_CD56dim L2
ENSG00000146386 ABRACL 154453 sc-eQTL 5.63e-02 0.114 0.0593 0.239 NK_CD56dim L2
ENSG00000164442 CITED2 -191450 sc-eQTL 4.49e-01 -0.0604 0.0796 0.239 NK_CD56dim L2
ENSG00000024862 CCDC28A 409689 sc-eQTL 6.41e-01 -0.0573 0.123 0.233 NK_HLA L2
ENSG00000051620 HEBP2 779667 sc-eQTL 2.05e-01 -0.132 0.104 0.233 NK_HLA L2
ENSG00000112406 HECA 48118 sc-eQTL 2.69e-01 -0.127 0.115 0.233 NK_HLA L2
ENSG00000135597 REPS1 194937 sc-eQTL 4.19e-01 -0.0917 0.113 0.233 NK_HLA L2
ENSG00000146386 ABRACL 154453 sc-eQTL 8.44e-02 0.161 0.0925 0.233 NK_HLA L2
ENSG00000164442 CITED2 -191450 sc-eQTL 8.39e-01 -0.0203 0.0996 0.233 NK_HLA L2
ENSG00000024862 CCDC28A 409689 sc-eQTL 1.09e-01 -0.177 0.11 0.239 NK_cytokine L2
ENSG00000051620 HEBP2 779667 sc-eQTL 3.71e-01 -0.0852 0.0952 0.239 NK_cytokine L2
ENSG00000112406 HECA 48118 sc-eQTL 7.32e-01 -0.0326 0.0953 0.239 NK_cytokine L2
ENSG00000135597 REPS1 194937 sc-eQTL 9.26e-01 0.00921 0.0984 0.239 NK_cytokine L2
ENSG00000146386 ABRACL 154453 sc-eQTL 6.10e-01 0.0324 0.0634 0.239 NK_cytokine L2
ENSG00000164442 CITED2 -191450 sc-eQTL 5.02e-01 -0.0556 0.0827 0.239 NK_cytokine L2
ENSG00000024862 CCDC28A 409689 sc-eQTL 1.75e-01 0.187 0.137 0.248 PB L2
ENSG00000051620 HEBP2 779667 sc-eQTL 2.16e-03 0.37 0.118 0.248 PB L2
ENSG00000112406 HECA 48118 sc-eQTL 7.82e-01 0.0418 0.151 0.248 PB L2
ENSG00000135597 REPS1 194937 sc-eQTL 1.88e-01 0.176 0.133 0.248 PB L2
ENSG00000146386 ABRACL 154453 sc-eQTL 2.08e-04 0.338 0.0881 0.248 PB L2
ENSG00000164440 TXLNB -108800 sc-eQTL 7.62e-01 -0.0416 0.137 0.248 PB L2
ENSG00000164442 CITED2 -191450 sc-eQTL 4.54e-02 -0.205 0.101 0.248 PB L2
ENSG00000226571 AL592429.2 -88164 sc-eQTL 4.81e-01 -0.0975 0.138 0.248 PB L2
ENSG00000024862 CCDC28A 409689 sc-eQTL 2.05e-01 -0.154 0.121 0.233 Pro_T L2
ENSG00000051620 HEBP2 779667 sc-eQTL 9.91e-01 -0.00111 0.0971 0.233 Pro_T L2
ENSG00000112406 HECA 48118 sc-eQTL 1.05e-01 0.155 0.0954 0.233 Pro_T L2
ENSG00000135597 REPS1 194937 sc-eQTL 5.42e-01 -0.069 0.113 0.233 Pro_T L2
ENSG00000146386 ABRACL 154453 sc-eQTL 5.95e-02 0.137 0.0723 0.233 Pro_T L2
ENSG00000164442 CITED2 -191450 sc-eQTL 8.17e-01 0.0201 0.0868 0.233 Pro_T L2
ENSG00000024862 CCDC28A 409689 sc-eQTL 5.00e-01 -0.0772 0.114 0.237 Treg L2
ENSG00000051620 HEBP2 779667 sc-eQTL 6.56e-01 -0.0349 0.0781 0.237 Treg L2
ENSG00000112406 HECA 48118 sc-eQTL 9.93e-01 -0.000781 0.0951 0.237 Treg L2
ENSG00000135597 REPS1 194937 sc-eQTL 5.30e-01 -0.0619 0.0983 0.237 Treg L2
ENSG00000146386 ABRACL 154453 sc-eQTL 1.10e-01 0.134 0.0833 0.237 Treg L2
ENSG00000164442 CITED2 -191450 sc-eQTL 9.09e-01 0.0107 0.0935 0.237 Treg L2
ENSG00000231329 AL031772.1 -56455 sc-eQTL 4.13e-01 0.0876 0.107 0.237 Treg L2
ENSG00000024862 CCDC28A 409689 sc-eQTL 5.31e-01 -0.0701 0.112 0.237 cDC L2
ENSG00000051620 HEBP2 779667 sc-eQTL 9.16e-02 -0.135 0.0796 0.237 cDC L2
ENSG00000112406 HECA 48118 sc-eQTL 1.08e-01 -0.17 0.106 0.237 cDC L2
ENSG00000135540 NHSL1 490627 sc-eQTL 6.82e-01 -0.0428 0.104 0.237 cDC L2
ENSG00000135597 REPS1 194937 sc-eQTL 7.01e-01 -0.0461 0.12 0.237 cDC L2
ENSG00000146386 ABRACL 154453 sc-eQTL 4.44e-01 0.0751 0.098 0.237 cDC L2
ENSG00000164442 CITED2 -191450 sc-eQTL 5.75e-01 0.0584 0.104 0.237 cDC L2
ENSG00000225177 AL590617.2 490650 sc-eQTL 5.95e-01 0.0611 0.115 0.237 cDC L2
ENSG00000024862 CCDC28A 409689 sc-eQTL 8.01e-01 0.0225 0.0895 0.237 cMono_IL1B L2
ENSG00000051620 HEBP2 779667 sc-eQTL 5.25e-01 0.0409 0.0643 0.237 cMono_IL1B L2
ENSG00000112406 HECA 48118 sc-eQTL 2.24e-01 -0.0899 0.0737 0.237 cMono_IL1B L2
ENSG00000135540 NHSL1 490627 sc-eQTL 2.52e-01 0.123 0.107 0.237 cMono_IL1B L2
ENSG00000135597 REPS1 194937 sc-eQTL 3.73e-01 -0.0856 0.096 0.237 cMono_IL1B L2
ENSG00000146386 ABRACL 154453 sc-eQTL 1.62e-02 0.193 0.0798 0.237 cMono_IL1B L2
ENSG00000164442 CITED2 -191450 sc-eQTL 5.82e-01 -0.0466 0.0845 0.237 cMono_IL1B L2
ENSG00000225177 AL590617.2 490650 sc-eQTL 8.29e-01 -0.0243 0.113 0.237 cMono_IL1B L2
ENSG00000024862 CCDC28A 409689 sc-eQTL 7.23e-01 0.0366 0.103 0.237 cMono_S100A L2
ENSG00000051620 HEBP2 779667 sc-eQTL 7.51e-01 0.0224 0.0707 0.237 cMono_S100A L2
ENSG00000112406 HECA 48118 sc-eQTL 9.81e-01 0.00208 0.0873 0.237 cMono_S100A L2
ENSG00000135540 NHSL1 490627 sc-eQTL 2.88e-01 -0.118 0.11 0.237 cMono_S100A L2
ENSG00000135597 REPS1 194937 sc-eQTL 3.10e-01 0.106 0.104 0.237 cMono_S100A L2
ENSG00000146386 ABRACL 154453 sc-eQTL 2.20e-02 0.207 0.0899 0.237 cMono_S100A L2
ENSG00000164442 CITED2 -191450 sc-eQTL 7.82e-01 0.025 0.0901 0.237 cMono_S100A L2
ENSG00000225177 AL590617.2 490650 sc-eQTL 3.23e-01 0.12 0.121 0.237 cMono_S100A L2
ENSG00000024862 CCDC28A 409689 sc-eQTL 2.56e-01 -0.151 0.133 0.245 gdT L2
ENSG00000051620 HEBP2 779667 sc-eQTL 5.79e-03 -0.346 0.124 0.245 gdT L2
ENSG00000112406 HECA 48118 sc-eQTL 8.54e-01 -0.0233 0.126 0.245 gdT L2
ENSG00000135597 REPS1 194937 sc-eQTL 4.42e-02 -0.262 0.129 0.245 gdT L2
ENSG00000146386 ABRACL 154453 sc-eQTL 1.65e-02 0.234 0.0965 0.245 gdT L2
ENSG00000164442 CITED2 -191450 sc-eQTL 6.56e-01 -0.0507 0.113 0.245 gdT L2
ENSG00000024862 CCDC28A 409689 sc-eQTL 1.24e-01 -0.183 0.119 0.233 intMono L2
ENSG00000051620 HEBP2 779667 sc-eQTL 9.52e-01 0.00478 0.0801 0.233 intMono L2
ENSG00000112406 HECA 48118 sc-eQTL 5.93e-01 0.0523 0.0978 0.233 intMono L2
ENSG00000135540 NHSL1 490627 sc-eQTL 6.15e-01 -0.0543 0.108 0.233 intMono L2
ENSG00000135597 REPS1 194937 sc-eQTL 7.44e-01 -0.0365 0.112 0.233 intMono L2
ENSG00000146386 ABRACL 154453 sc-eQTL 2.63e-02 0.225 0.101 0.233 intMono L2
ENSG00000164442 CITED2 -191450 sc-eQTL 5.45e-01 0.0599 0.0987 0.233 intMono L2
ENSG00000225177 AL590617.2 490650 sc-eQTL 9.61e-01 0.00586 0.121 0.233 intMono L2
ENSG00000024862 CCDC28A 409689 sc-eQTL 9.53e-01 -0.00655 0.111 0.235 ncMono L2
ENSG00000051620 HEBP2 779667 sc-eQTL 3.13e-01 -0.0668 0.0661 0.235 ncMono L2
ENSG00000112406 HECA 48118 sc-eQTL 5.33e-01 0.0634 0.101 0.235 ncMono L2
ENSG00000135540 NHSL1 490627 sc-eQTL 1.44e-01 0.156 0.106 0.235 ncMono L2
ENSG00000135597 REPS1 194937 sc-eQTL 2.40e-01 -0.0945 0.0801 0.235 ncMono L2
ENSG00000146386 ABRACL 154453 sc-eQTL 1.90e-01 0.127 0.0965 0.235 ncMono L2
ENSG00000164442 CITED2 -191450 sc-eQTL 9.22e-01 0.00808 0.0822 0.235 ncMono L2
ENSG00000225177 AL590617.2 490650 sc-eQTL 1.77e-01 -0.16 0.118 0.235 ncMono L2
ENSG00000024862 CCDC28A 409689 sc-eQTL 5.26e-01 -0.0782 0.123 0.229 pDC L2
ENSG00000051620 HEBP2 779667 sc-eQTL 5.82e-02 -0.181 0.0947 0.229 pDC L2
ENSG00000112406 HECA 48118 sc-eQTL 9.62e-01 -0.00494 0.104 0.229 pDC L2
ENSG00000135540 NHSL1 490627 sc-eQTL 9.35e-01 -0.00783 0.0954 0.229 pDC L2
ENSG00000135597 REPS1 194937 sc-eQTL 4.85e-01 -0.0675 0.0965 0.229 pDC L2
ENSG00000146386 ABRACL 154453 sc-eQTL 3.89e-01 -0.0909 0.105 0.229 pDC L2
ENSG00000164442 CITED2 -191450 sc-eQTL 8.97e-02 -0.21 0.123 0.229 pDC L2
ENSG00000225177 AL590617.2 490650 sc-eQTL 1.52e-01 -0.137 0.0952 0.229 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000024862 CCDC28A 409689 sc-eQTL 3.13e-01 -0.112 0.111 0.237 B_Memory LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 779667 sc-eQTL 1.20e-01 -0.119 0.0764 0.237 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112406 HECA 48118 sc-eQTL 4.86e-01 -0.0688 0.0986 0.237 B_Memory LOneK1K
ENSG00000135597 REPS1 194937 sc-eQTL 6.59e-01 -0.0452 0.102 0.237 B_Memory LOneK1K
ENSG00000146386 ABRACL 154453 sc-eQTL 6.74e-01 0.0299 0.0709 0.237 B_Memory LOneK1K
ENSG00000164440 TXLNB -108800 sc-eQTL 4.33e-02 -0.236 0.116 0.237 B_Memory LOneK1K
ENSG00000164442 CITED2 -191450 sc-eQTL 9.36e-01 -0.00805 0.0996 0.237 B_Memory LOneK1K
ENSG00000226571 AL592429.2 -88164 sc-eQTL 4.88e-02 0.227 0.115 0.237 B_Memory LOneK1K
ENSG00000024862 CCDC28A 409689 sc-eQTL 1.60e-01 -0.144 0.102 0.237 B_Naive LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 779667 sc-eQTL 4.29e-01 -0.0564 0.0712 0.237 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112406 HECA 48118 sc-eQTL 9.22e-01 0.00938 0.0961 0.237 B_Naive LOneK1K
ENSG00000135597 REPS1 194937 sc-eQTL 2.10e-01 -0.103 0.0816 0.237 B_Naive LOneK1K
ENSG00000146386 ABRACL 154453 sc-eQTL 2.62e-01 -0.0644 0.0573 0.237 B_Naive LOneK1K
ENSG00000164440 TXLNB -108800 sc-eQTL 8.05e-01 0.0298 0.12 0.237 B_Naive LOneK1K
ENSG00000164442 CITED2 -191450 sc-eQTL 6.75e-01 -0.0367 0.0874 0.237 B_Naive LOneK1K
ENSG00000226571 AL592429.2 -88164 sc-eQTL 9.39e-01 -0.00782 0.103 0.237 B_Naive LOneK1K
ENSG00000024862 CCDC28A 409689 sc-eQTL 7.37e-01 0.0277 0.0822 0.237 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 779667 sc-eQTL 5.44e-01 0.0372 0.0612 0.237 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112406 HECA 48118 sc-eQTL 3.17e-01 -0.0738 0.0736 0.237 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000135540 NHSL1 490627 sc-eQTL 8.84e-01 0.0157 0.108 0.237 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000135597 REPS1 194937 sc-eQTL 9.38e-01 0.00694 0.0887 0.237 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000146386 ABRACL 154453 sc-eQTL 2.81e-02 0.172 0.078 0.237 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000164442 CITED2 -191450 sc-eQTL 7.87e-01 -0.0234 0.0864 0.237 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000225177 AL590617.2 490650 sc-eQTL 4.57e-01 0.0862 0.116 0.237 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000024862 CCDC28A 409689 sc-eQTL 4.89e-01 -0.0776 0.112 0.237 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 779667 sc-eQTL 5.56e-01 -0.0353 0.0598 0.237 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112406 HECA 48118 sc-eQTL 9.90e-01 -0.00124 0.0957 0.237 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000135540 NHSL1 490627 sc-eQTL 6.75e-01 0.0447 0.106 0.237 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000135597 REPS1 194937 sc-eQTL 3.11e-02 -0.142 0.0655 0.237 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000146386 ABRACL 154453 sc-eQTL 7.98e-02 0.169 0.0963 0.237 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000164442 CITED2 -191450 sc-eQTL 8.11e-01 -0.02 0.0835 0.237 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000225177 AL590617.2 490650 sc-eQTL 6.99e-01 -0.0456 0.118 0.237 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000024862 CCDC28A 409689 sc-eQTL 1.01e-01 -0.17 0.103 0.239 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 779667 sc-eQTL 3.75e-01 -0.08 0.09 0.239 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112406 HECA 48118 sc-eQTL 3.98e-01 -0.0749 0.0885 0.239 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000135597 REPS1 194937 sc-eQTL 3.66e-01 -0.0784 0.0864 0.239 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000146386 ABRACL 154453 sc-eQTL 1.57e-01 0.079 0.0556 0.239 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000164442 CITED2 -191450 sc-eQTL 5.30e-01 -0.0507 0.0807 0.239 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000051620 HEBP2 779667 eQTL 0.0497 -0.0426 0.0217 0.0 0.0 0.253
ENSG00000112406 HECA 48118 eQTL 9.65e-11 0.0676 0.0103 0.00133 0.0013 0.253
ENSG00000146386 ABRACL 154453 eQTL 0.00289 0.0765 0.0256 0.0 0.0 0.253
ENSG00000231329 AL031772.1 -56455 eQTL 0.00111 -0.0654 0.02 0.00228 0.00193 0.253

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000112406 HECA 48118 7.83e-06 9.73e-06 1.28e-06 5.02e-06 2.22e-06 4.21e-06 1.14e-05 1.51e-06 8.81e-06 5.06e-06 1.23e-05 5.23e-06 1.62e-05 3.77e-06 2.6e-06 6.06e-06 4.38e-06 6.43e-06 2.58e-06 2.68e-06 4.52e-06 9e-06 7.56e-06 3.2e-06 1.42e-05 2.85e-06 4.6e-06 3.69e-06 1.13e-05 1.05e-05 5.15e-06 5.43e-07 1.23e-06 2.93e-06 3.75e-06 2.65e-06 1.64e-06 1.86e-06 1.63e-06 9.79e-07 8.05e-07 1.18e-05 8.97e-07 1.58e-07 7.64e-07 1.32e-06 1.06e-06 7.28e-07 4.02e-07
ENSG00000146386 ABRACL 154453 2.66e-06 3.14e-06 3.1e-07 2.02e-06 4.59e-07 7.5e-07 2.48e-06 6.09e-07 1.93e-06 9.88e-07 3.01e-06 1.45e-06 5.39e-06 1.37e-06 9.11e-07 1.31e-06 1.32e-06 2.32e-06 1.22e-06 1.13e-06 9.51e-07 3.09e-06 2.51e-06 1.07e-06 4.08e-06 1.22e-06 1.27e-06 1.8e-06 2.85e-06 2.87e-06 1.99e-06 2.82e-07 5.69e-07 1.26e-06 1.43e-06 9.91e-07 7.89e-07 4.38e-07 8.54e-07 3.46e-07 3.57e-07 4.15e-06 4.42e-07 1.95e-07 3.99e-07 3.3e-07 4.87e-07 2.26e-07 1.56e-07