Genes within 1Mb (chr6:139179605:G:A):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD


Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000024862 CCDC28A 406096 sc-eQTL 2.58e-01 -0.102 0.0896 0.229 B L1
ENSG00000051620 HEBP2 776074 sc-eQTL 4.22e-01 -0.0552 0.0685 0.229 B L1
ENSG00000112406 HECA 44525 sc-eQTL 9.83e-01 -0.00183 0.0874 0.229 B L1
ENSG00000135597 REPS1 191344 sc-eQTL 1.32e-01 -0.116 0.0769 0.229 B L1
ENSG00000146386 ABRACL 150860 sc-eQTL 5.54e-01 -0.0269 0.0454 0.229 B L1
ENSG00000164440 TXLNB -112393 sc-eQTL 2.95e-01 -0.116 0.111 0.229 B L1
ENSG00000164442 CITED2 -195043 sc-eQTL 5.28e-01 -0.0443 0.07 0.229 B L1
ENSG00000226571 AL592429.2 -91757 sc-eQTL 6.42e-02 0.144 0.0773 0.229 B L1
ENSG00000024862 CCDC28A 406096 sc-eQTL 2.13e-01 -0.123 0.0988 0.229 CD4T L1
ENSG00000051620 HEBP2 776074 sc-eQTL 1.63e-01 -0.0928 0.0663 0.229 CD4T L1
ENSG00000112406 HECA 44525 sc-eQTL 3.44e-01 -0.0783 0.0825 0.229 CD4T L1
ENSG00000135597 REPS1 191344 sc-eQTL 6.89e-01 -0.0261 0.065 0.229 CD4T L1
ENSG00000146386 ABRACL 150860 sc-eQTL 2.90e-01 0.0505 0.0476 0.229 CD4T L1
ENSG00000164442 CITED2 -195043 sc-eQTL 3.74e-02 -0.169 0.0806 0.229 CD4T L1
ENSG00000231329 AL031772.1 -60048 sc-eQTL 1.09e-01 -0.129 0.0798 0.229 CD4T L1
ENSG00000024862 CCDC28A 406096 sc-eQTL 6.01e-01 -0.0568 0.108 0.229 CD8T L1
ENSG00000051620 HEBP2 776074 sc-eQTL 1.92e-02 -0.165 0.0701 0.229 CD8T L1
ENSG00000112406 HECA 44525 sc-eQTL 2.47e-01 -0.0899 0.0774 0.229 CD8T L1
ENSG00000135597 REPS1 191344 sc-eQTL 3.42e-01 0.0695 0.0729 0.229 CD8T L1
ENSG00000146386 ABRACL 150860 sc-eQTL 1.20e-01 0.0645 0.0413 0.229 CD8T L1
ENSG00000164442 CITED2 -195043 sc-eQTL 6.36e-02 -0.146 0.0783 0.229 CD8T L1
ENSG00000231329 AL031772.1 -60048 sc-eQTL 2.33e-01 -0.114 0.0956 0.229 CD8T L1
ENSG00000024862 CCDC28A 406096 sc-eQTL 2.12e-01 -0.135 0.108 0.232 DC L1
ENSG00000051620 HEBP2 776074 sc-eQTL 1.01e-02 -0.194 0.0747 0.232 DC L1
ENSG00000112406 HECA 44525 sc-eQTL 9.94e-01 0.000723 0.089 0.232 DC L1
ENSG00000135540 NHSL1 487034 sc-eQTL 9.87e-01 0.00164 0.0991 0.232 DC L1
ENSG00000135597 REPS1 191344 sc-eQTL 5.99e-01 -0.0461 0.0876 0.232 DC L1
ENSG00000146386 ABRACL 150860 sc-eQTL 1.71e-01 0.117 0.0854 0.232 DC L1
ENSG00000164442 CITED2 -195043 sc-eQTL 5.86e-01 -0.0555 0.102 0.232 DC L1
ENSG00000225177 AL590617.2 487057 sc-eQTL 6.59e-01 0.0457 0.104 0.232 DC L1
ENSG00000024862 CCDC28A 406096 sc-eQTL 3.77e-01 -0.0697 0.0787 0.229 Mono L1
ENSG00000051620 HEBP2 776074 sc-eQTL 3.52e-01 0.0508 0.0545 0.229 Mono L1
ENSG00000112406 HECA 44525 sc-eQTL 5.10e-01 -0.0474 0.0719 0.229 Mono L1
ENSG00000135540 NHSL1 487034 sc-eQTL 6.99e-01 0.0399 0.103 0.229 Mono L1
ENSG00000135597 REPS1 191344 sc-eQTL 7.18e-01 -0.0218 0.0604 0.229 Mono L1
ENSG00000146386 ABRACL 150860 sc-eQTL 6.04e-02 0.147 0.0779 0.229 Mono L1
ENSG00000164442 CITED2 -195043 sc-eQTL 9.61e-01 -0.00412 0.0831 0.229 Mono L1
ENSG00000225177 AL590617.2 487057 sc-eQTL 9.59e-01 -0.00557 0.107 0.229 Mono L1
ENSG00000024862 CCDC28A 406096 sc-eQTL 7.72e-02 -0.172 0.0967 0.23 NK L1
ENSG00000051620 HEBP2 776074 sc-eQTL 3.54e-01 -0.0795 0.0857 0.23 NK L1
ENSG00000112406 HECA 44525 sc-eQTL 4.17e-01 -0.0683 0.0841 0.23 NK L1
ENSG00000135597 REPS1 191344 sc-eQTL 2.89e-01 -0.0851 0.08 0.23 NK L1
ENSG00000146386 ABRACL 150860 sc-eQTL 6.52e-02 0.108 0.058 0.23 NK L1
ENSG00000164442 CITED2 -195043 sc-eQTL 5.91e-01 -0.0419 0.0778 0.23 NK L1
ENSG00000024862 CCDC28A 406096 sc-eQTL 2.42e-01 -0.133 0.113 0.229 Other_T L1
ENSG00000051620 HEBP2 776074 sc-eQTL 6.80e-02 -0.134 0.0728 0.229 Other_T L1
ENSG00000112406 HECA 44525 sc-eQTL 4.02e-01 -0.069 0.0821 0.229 Other_T L1
ENSG00000135597 REPS1 191344 sc-eQTL 1.25e-01 -0.135 0.088 0.229 Other_T L1
ENSG00000146386 ABRACL 150860 sc-eQTL 7.62e-02 0.102 0.0575 0.229 Other_T L1
ENSG00000164442 CITED2 -195043 sc-eQTL 5.28e-01 -0.0428 0.0678 0.229 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000024862 CCDC28A 406096 sc-eQTL 4.36e-01 -0.105 0.134 0.224 B_Activated L2
ENSG00000051620 HEBP2 776074 sc-eQTL 5.89e-01 -0.0637 0.118 0.224 B_Activated L2
ENSG00000112406 HECA 44525 sc-eQTL 6.16e-01 0.0643 0.128 0.224 B_Activated L2
ENSG00000135597 REPS1 191344 sc-eQTL 3.43e-01 -0.127 0.134 0.224 B_Activated L2
ENSG00000146386 ABRACL 150860 sc-eQTL 3.33e-01 -0.117 0.121 0.224 B_Activated L2
ENSG00000164440 TXLNB -112393 sc-eQTL 4.10e-01 -0.0856 0.104 0.224 B_Activated L2
ENSG00000164442 CITED2 -195043 sc-eQTL 1.56e-01 0.185 0.13 0.224 B_Activated L2
ENSG00000226571 AL592429.2 -91757 sc-eQTL 2.97e-01 0.136 0.13 0.224 B_Activated L2
ENSG00000024862 CCDC28A 406096 sc-eQTL 6.04e-01 0.0582 0.112 0.23 B_Intermediate L2
ENSG00000051620 HEBP2 776074 sc-eQTL 3.09e-01 -0.079 0.0775 0.23 B_Intermediate L2
ENSG00000112406 HECA 44525 sc-eQTL 4.93e-01 -0.0667 0.097 0.23 B_Intermediate L2
ENSG00000135597 REPS1 191344 sc-eQTL 7.97e-01 0.0269 0.105 0.23 B_Intermediate L2
ENSG00000146386 ABRACL 150860 sc-eQTL 4.40e-01 0.069 0.0891 0.23 B_Intermediate L2
ENSG00000164440 TXLNB -112393 sc-eQTL 4.47e-01 -0.0832 0.109 0.23 B_Intermediate L2
ENSG00000164442 CITED2 -195043 sc-eQTL 6.58e-01 -0.0445 0.1 0.23 B_Intermediate L2
ENSG00000226571 AL592429.2 -91757 sc-eQTL 3.03e-01 0.112 0.109 0.23 B_Intermediate L2
ENSG00000024862 CCDC28A 406096 sc-eQTL 1.35e-01 -0.17 0.113 0.228 B_Memory L2
ENSG00000051620 HEBP2 776074 sc-eQTL 8.30e-01 -0.0184 0.0856 0.228 B_Memory L2
ENSG00000112406 HECA 44525 sc-eQTL 9.14e-01 -0.0106 0.0984 0.228 B_Memory L2
ENSG00000135597 REPS1 191344 sc-eQTL 6.40e-01 -0.05 0.107 0.228 B_Memory L2
ENSG00000146386 ABRACL 150860 sc-eQTL 6.03e-01 -0.0439 0.0843 0.228 B_Memory L2
ENSG00000164440 TXLNB -112393 sc-eQTL 2.65e-01 -0.12 0.107 0.228 B_Memory L2
ENSG00000164442 CITED2 -195043 sc-eQTL 6.36e-01 0.0469 0.0989 0.228 B_Memory L2
ENSG00000226571 AL592429.2 -91757 sc-eQTL 1.72e-01 0.166 0.121 0.228 B_Memory L2
ENSG00000024862 CCDC28A 406096 sc-eQTL 7.27e-01 -0.0374 0.107 0.229 B_Naive1 L2
ENSG00000051620 HEBP2 776074 sc-eQTL 2.73e-01 -0.0824 0.0751 0.229 B_Naive1 L2
ENSG00000112406 HECA 44525 sc-eQTL 6.83e-01 -0.0382 0.0933 0.229 B_Naive1 L2
ENSG00000135597 REPS1 191344 sc-eQTL 3.23e-01 -0.0854 0.0862 0.229 B_Naive1 L2
ENSG00000146386 ABRACL 150860 sc-eQTL 8.61e-01 -0.0106 0.0604 0.229 B_Naive1 L2
ENSG00000164440 TXLNB -112393 sc-eQTL 8.81e-01 0.0169 0.113 0.229 B_Naive1 L2
ENSG00000164442 CITED2 -195043 sc-eQTL 8.40e-01 -0.0166 0.0823 0.229 B_Naive1 L2
ENSG00000226571 AL592429.2 -91757 sc-eQTL 6.92e-01 0.0429 0.108 0.229 B_Naive1 L2
ENSG00000024862 CCDC28A 406096 sc-eQTL 9.36e-02 -0.176 0.104 0.227 B_Naive2 L2
ENSG00000051620 HEBP2 776074 sc-eQTL 9.74e-01 0.00236 0.0718 0.227 B_Naive2 L2
ENSG00000112406 HECA 44525 sc-eQTL 4.08e-01 0.0818 0.0987 0.227 B_Naive2 L2
ENSG00000135597 REPS1 191344 sc-eQTL 5.53e-01 -0.0559 0.0942 0.227 B_Naive2 L2
ENSG00000146386 ABRACL 150860 sc-eQTL 8.13e-01 -0.0164 0.0694 0.227 B_Naive2 L2
ENSG00000164440 TXLNB -112393 sc-eQTL 3.45e-01 0.104 0.11 0.227 B_Naive2 L2
ENSG00000164442 CITED2 -195043 sc-eQTL 2.65e-01 -0.125 0.112 0.227 B_Naive2 L2
ENSG00000226571 AL592429.2 -91757 sc-eQTL 8.47e-01 0.0199 0.103 0.227 B_Naive2 L2
ENSG00000024862 CCDC28A 406096 sc-eQTL 1.03e-01 -0.175 0.107 0.23 CD4_CTL L2
ENSG00000051620 HEBP2 776074 sc-eQTL 1.40e-01 -0.137 0.0925 0.23 CD4_CTL L2
ENSG00000112406 HECA 44525 sc-eQTL 3.43e-01 -0.103 0.108 0.23 CD4_CTL L2
ENSG00000135597 REPS1 191344 sc-eQTL 6.11e-02 -0.197 0.105 0.23 CD4_CTL L2
ENSG00000146386 ABRACL 150860 sc-eQTL 1.22e-01 0.148 0.0956 0.23 CD4_CTL L2
ENSG00000164442 CITED2 -195043 sc-eQTL 9.81e-01 0.0023 0.0966 0.23 CD4_CTL L2
ENSG00000231329 AL031772.1 -60048 sc-eQTL 4.04e-02 -0.203 0.0986 0.23 CD4_CTL L2
ENSG00000024862 CCDC28A 406096 sc-eQTL 6.47e-02 -0.191 0.103 0.229 CD4_Naive L2
ENSG00000051620 HEBP2 776074 sc-eQTL 3.59e-01 -0.0594 0.0645 0.229 CD4_Naive L2
ENSG00000112406 HECA 44525 sc-eQTL 6.04e-01 -0.0418 0.0805 0.229 CD4_Naive L2
ENSG00000135597 REPS1 191344 sc-eQTL 6.49e-01 -0.0326 0.0715 0.229 CD4_Naive L2
ENSG00000146386 ABRACL 150860 sc-eQTL 6.89e-01 -0.0193 0.0481 0.229 CD4_Naive L2
ENSG00000164442 CITED2 -195043 sc-eQTL 1.62e-02 -0.195 0.0806 0.229 CD4_Naive L2
ENSG00000231329 AL031772.1 -60048 sc-eQTL 1.72e-01 -0.113 0.0823 0.229 CD4_Naive L2
ENSG00000024862 CCDC28A 406096 sc-eQTL 6.15e-01 0.0514 0.102 0.229 CD4_TCM L2
ENSG00000051620 HEBP2 776074 sc-eQTL 4.98e-02 -0.149 0.0753 0.229 CD4_TCM L2
ENSG00000112406 HECA 44525 sc-eQTL 2.72e-01 -0.0897 0.0814 0.229 CD4_TCM L2
ENSG00000135597 REPS1 191344 sc-eQTL 5.59e-01 -0.0452 0.0773 0.229 CD4_TCM L2
ENSG00000146386 ABRACL 150860 sc-eQTL 2.18e-01 0.0733 0.0593 0.229 CD4_TCM L2
ENSG00000164442 CITED2 -195043 sc-eQTL 4.06e-02 -0.181 0.0877 0.229 CD4_TCM L2
ENSG00000231329 AL031772.1 -60048 sc-eQTL 1.65e-01 -0.133 0.0952 0.229 CD4_TCM L2
ENSG00000024862 CCDC28A 406096 sc-eQTL 9.80e-02 -0.191 0.115 0.229 CD4_TEM L2
ENSG00000051620 HEBP2 776074 sc-eQTL 5.74e-01 -0.0442 0.0786 0.229 CD4_TEM L2
ENSG00000112406 HECA 44525 sc-eQTL 2.73e-01 -0.0984 0.0895 0.229 CD4_TEM L2
ENSG00000135597 REPS1 191344 sc-eQTL 5.79e-01 0.0543 0.0978 0.229 CD4_TEM L2
ENSG00000146386 ABRACL 150860 sc-eQTL 9.27e-02 0.117 0.0693 0.229 CD4_TEM L2
ENSG00000164442 CITED2 -195043 sc-eQTL 3.10e-01 -0.093 0.0914 0.229 CD4_TEM L2
ENSG00000231329 AL031772.1 -60048 sc-eQTL 2.00e-01 -0.123 0.0955 0.229 CD4_TEM L2
ENSG00000024862 CCDC28A 406096 sc-eQTL 6.50e-01 -0.0537 0.118 0.229 CD8_CTL L2
ENSG00000051620 HEBP2 776074 sc-eQTL 2.15e-01 -0.104 0.0841 0.229 CD8_CTL L2
ENSG00000112406 HECA 44525 sc-eQTL 8.25e-01 0.0191 0.086 0.229 CD8_CTL L2
ENSG00000135597 REPS1 191344 sc-eQTL 3.29e-01 0.09 0.0919 0.229 CD8_CTL L2
ENSG00000146386 ABRACL 150860 sc-eQTL 1.82e-02 0.175 0.0735 0.229 CD8_CTL L2
ENSG00000164442 CITED2 -195043 sc-eQTL 8.88e-01 0.0123 0.0868 0.229 CD8_CTL L2
ENSG00000231329 AL031772.1 -60048 sc-eQTL 6.47e-03 -0.281 0.102 0.229 CD8_CTL L2
ENSG00000024862 CCDC28A 406096 sc-eQTL 2.31e-01 -0.135 0.112 0.229 CD8_Naive L2
ENSG00000051620 HEBP2 776074 sc-eQTL 3.32e-02 -0.153 0.0712 0.229 CD8_Naive L2
ENSG00000112406 HECA 44525 sc-eQTL 1.76e-01 -0.118 0.0865 0.229 CD8_Naive L2
ENSG00000135597 REPS1 191344 sc-eQTL 8.79e-01 -0.0133 0.0871 0.229 CD8_Naive L2
ENSG00000146386 ABRACL 150860 sc-eQTL 7.01e-01 0.0176 0.0457 0.229 CD8_Naive L2
ENSG00000164442 CITED2 -195043 sc-eQTL 5.96e-02 -0.173 0.0916 0.229 CD8_Naive L2
ENSG00000231329 AL031772.1 -60048 sc-eQTL 9.91e-01 -0.00116 0.106 0.229 CD8_Naive L2
ENSG00000024862 CCDC28A 406096 sc-eQTL 8.01e-01 -0.0315 0.125 0.229 CD8_TCM L2
ENSG00000051620 HEBP2 776074 sc-eQTL 1.44e-01 -0.128 0.0871 0.229 CD8_TCM L2
ENSG00000112406 HECA 44525 sc-eQTL 9.64e-01 -0.00415 0.0912 0.229 CD8_TCM L2
ENSG00000135597 REPS1 191344 sc-eQTL 3.85e-01 0.0823 0.0946 0.229 CD8_TCM L2
ENSG00000146386 ABRACL 150860 sc-eQTL 9.63e-01 0.00434 0.0944 0.229 CD8_TCM L2
ENSG00000164442 CITED2 -195043 sc-eQTL 5.96e-01 -0.0515 0.097 0.229 CD8_TCM L2
ENSG00000231329 AL031772.1 -60048 sc-eQTL 6.03e-01 0.0533 0.102 0.229 CD8_TCM L2
ENSG00000024862 CCDC28A 406096 sc-eQTL 5.29e-01 -0.0733 0.116 0.226 CD8_TEM L2
ENSG00000051620 HEBP2 776074 sc-eQTL 4.18e-01 -0.0858 0.106 0.226 CD8_TEM L2
ENSG00000112406 HECA 44525 sc-eQTL 3.13e-02 -0.234 0.108 0.226 CD8_TEM L2
ENSG00000135597 REPS1 191344 sc-eQTL 9.17e-01 0.0118 0.114 0.226 CD8_TEM L2
ENSG00000146386 ABRACL 150860 sc-eQTL 4.15e-01 0.0713 0.0873 0.226 CD8_TEM L2
ENSG00000164442 CITED2 -195043 sc-eQTL 6.33e-01 0.0454 0.095 0.226 CD8_TEM L2
ENSG00000231329 AL031772.1 -60048 sc-eQTL 8.39e-01 -0.0219 0.108 0.226 CD8_TEM L2
ENSG00000024862 CCDC28A 406096 sc-eQTL 6.33e-01 -0.0591 0.124 0.229 MAIT L2
ENSG00000051620 HEBP2 776074 sc-eQTL 6.31e-02 -0.159 0.0851 0.229 MAIT L2
ENSG00000112406 HECA 44525 sc-eQTL 1.38e-01 -0.139 0.0935 0.229 MAIT L2
ENSG00000135597 REPS1 191344 sc-eQTL 5.02e-01 -0.0681 0.101 0.229 MAIT L2
ENSG00000146386 ABRACL 150860 sc-eQTL 6.65e-01 -0.0322 0.0744 0.229 MAIT L2
ENSG00000164442 CITED2 -195043 sc-eQTL 9.54e-01 0.00505 0.0876 0.229 MAIT L2
ENSG00000024862 CCDC28A 406096 sc-eQTL 4.53e-01 -0.0855 0.114 0.224 NK_CD56bright L2
ENSG00000051620 HEBP2 776074 sc-eQTL 6.05e-01 -0.0503 0.097 0.224 NK_CD56bright L2
ENSG00000112406 HECA 44525 sc-eQTL 9.94e-01 -0.000819 0.103 0.224 NK_CD56bright L2
ENSG00000135597 REPS1 191344 sc-eQTL 7.95e-01 -0.0251 0.0963 0.224 NK_CD56bright L2
ENSG00000146386 ABRACL 150860 sc-eQTL 3.97e-02 0.182 0.0879 0.224 NK_CD56bright L2
ENSG00000164442 CITED2 -195043 sc-eQTL 3.50e-01 0.0889 0.095 0.224 NK_CD56bright L2
ENSG00000024862 CCDC28A 406096 sc-eQTL 1.06e-01 -0.17 0.105 0.231 NK_CD56dim L2
ENSG00000051620 HEBP2 776074 sc-eQTL 8.11e-01 -0.0224 0.0935 0.231 NK_CD56dim L2
ENSG00000112406 HECA 44525 sc-eQTL 5.61e-01 -0.0526 0.0905 0.231 NK_CD56dim L2
ENSG00000135597 REPS1 191344 sc-eQTL 7.46e-02 -0.153 0.0852 0.231 NK_CD56dim L2
ENSG00000146386 ABRACL 150860 sc-eQTL 8.69e-02 0.0993 0.0577 0.231 NK_CD56dim L2
ENSG00000164442 CITED2 -195043 sc-eQTL 6.30e-01 -0.0374 0.0775 0.231 NK_CD56dim L2
ENSG00000024862 CCDC28A 406096 sc-eQTL 5.76e-01 -0.067 0.12 0.226 NK_HLA L2
ENSG00000051620 HEBP2 776074 sc-eQTL 2.82e-01 -0.11 0.102 0.226 NK_HLA L2
ENSG00000112406 HECA 44525 sc-eQTL 1.55e-01 -0.159 0.112 0.226 NK_HLA L2
ENSG00000135597 REPS1 191344 sc-eQTL 2.83e-01 -0.119 0.11 0.226 NK_HLA L2
ENSG00000146386 ABRACL 150860 sc-eQTL 1.74e-01 0.124 0.0906 0.226 NK_HLA L2
ENSG00000164442 CITED2 -195043 sc-eQTL 6.59e-01 -0.043 0.0972 0.226 NK_HLA L2
ENSG00000024862 CCDC28A 406096 sc-eQTL 6.20e-02 -0.201 0.107 0.231 NK_cytokine L2
ENSG00000051620 HEBP2 776074 sc-eQTL 2.22e-01 -0.113 0.0925 0.231 NK_cytokine L2
ENSG00000112406 HECA 44525 sc-eQTL 5.66e-01 -0.0534 0.0927 0.231 NK_cytokine L2
ENSG00000135597 REPS1 191344 sc-eQTL 8.21e-01 0.0217 0.0958 0.231 NK_cytokine L2
ENSG00000146386 ABRACL 150860 sc-eQTL 6.83e-01 0.0252 0.0617 0.231 NK_cytokine L2
ENSG00000164442 CITED2 -195043 sc-eQTL 4.51e-01 -0.0607 0.0805 0.231 NK_cytokine L2
ENSG00000024862 CCDC28A 406096 sc-eQTL 1.27e-01 0.211 0.137 0.233 PB L2
ENSG00000051620 HEBP2 776074 sc-eQTL 6.98e-03 0.328 0.12 0.233 PB L2
ENSG00000112406 HECA 44525 sc-eQTL 9.78e-01 -0.00425 0.151 0.233 PB L2
ENSG00000135597 REPS1 191344 sc-eQTL 2.29e-01 0.162 0.133 0.233 PB L2
ENSG00000146386 ABRACL 150860 sc-eQTL 7.86e-05 0.36 0.0877 0.233 PB L2
ENSG00000164440 TXLNB -112393 sc-eQTL 5.19e-01 -0.0887 0.137 0.233 PB L2
ENSG00000164442 CITED2 -195043 sc-eQTL 2.61e-02 -0.228 0.101 0.233 PB L2
ENSG00000226571 AL592429.2 -91757 sc-eQTL 3.80e-01 -0.122 0.138 0.233 PB L2
ENSG00000024862 CCDC28A 406096 sc-eQTL 1.61e-01 -0.166 0.118 0.224 Pro_T L2
ENSG00000051620 HEBP2 776074 sc-eQTL 9.72e-01 -0.00337 0.0946 0.224 Pro_T L2
ENSG00000112406 HECA 44525 sc-eQTL 1.48e-01 0.135 0.093 0.224 Pro_T L2
ENSG00000135597 REPS1 191344 sc-eQTL 5.86e-01 -0.06 0.11 0.224 Pro_T L2
ENSG00000146386 ABRACL 150860 sc-eQTL 4.52e-02 0.142 0.0703 0.224 Pro_T L2
ENSG00000164442 CITED2 -195043 sc-eQTL 6.52e-01 0.0381 0.0845 0.224 Pro_T L2
ENSG00000024862 CCDC28A 406096 sc-eQTL 5.97e-01 -0.0589 0.111 0.229 Treg L2
ENSG00000051620 HEBP2 776074 sc-eQTL 4.52e-01 -0.0573 0.0761 0.229 Treg L2
ENSG00000112406 HECA 44525 sc-eQTL 5.30e-01 0.0582 0.0925 0.229 Treg L2
ENSG00000135597 REPS1 191344 sc-eQTL 7.56e-01 -0.0298 0.0958 0.229 Treg L2
ENSG00000146386 ABRACL 150860 sc-eQTL 6.34e-02 0.151 0.081 0.229 Treg L2
ENSG00000164442 CITED2 -195043 sc-eQTL 7.48e-01 0.0293 0.0911 0.229 Treg L2
ENSG00000231329 AL031772.1 -60048 sc-eQTL 3.30e-01 0.102 0.104 0.229 Treg L2
ENSG00000024862 CCDC28A 406096 sc-eQTL 4.36e-01 -0.084 0.107 0.232 cDC L2
ENSG00000051620 HEBP2 776074 sc-eQTL 9.07e-02 -0.13 0.0766 0.232 cDC L2
ENSG00000112406 HECA 44525 sc-eQTL 2.05e-01 -0.13 0.102 0.232 cDC L2
ENSG00000135540 NHSL1 487034 sc-eQTL 8.72e-01 0.0162 0.1 0.232 cDC L2
ENSG00000135597 REPS1 191344 sc-eQTL 8.50e-01 -0.0219 0.115 0.232 cDC L2
ENSG00000146386 ABRACL 150860 sc-eQTL 2.24e-01 0.115 0.094 0.232 cDC L2
ENSG00000164442 CITED2 -195043 sc-eQTL 4.63e-01 0.0735 0.1 0.232 cDC L2
ENSG00000225177 AL590617.2 487057 sc-eQTL 5.39e-01 0.068 0.11 0.232 cDC L2
ENSG00000024862 CCDC28A 406096 sc-eQTL 7.61e-01 -0.0263 0.0863 0.229 cMono_IL1B L2
ENSG00000051620 HEBP2 776074 sc-eQTL 5.42e-01 0.0378 0.0619 0.229 cMono_IL1B L2
ENSG00000112406 HECA 44525 sc-eQTL 4.92e-01 -0.049 0.0712 0.229 cMono_IL1B L2
ENSG00000135540 NHSL1 487034 sc-eQTL 2.21e-01 0.127 0.103 0.229 cMono_IL1B L2
ENSG00000135597 REPS1 191344 sc-eQTL 8.11e-01 0.0222 0.0927 0.229 cMono_IL1B L2
ENSG00000146386 ABRACL 150860 sc-eQTL 1.41e-02 0.19 0.0769 0.229 cMono_IL1B L2
ENSG00000164442 CITED2 -195043 sc-eQTL 5.58e-01 -0.0478 0.0815 0.229 cMono_IL1B L2
ENSG00000225177 AL590617.2 487057 sc-eQTL 5.92e-01 -0.0583 0.109 0.229 cMono_IL1B L2
ENSG00000024862 CCDC28A 406096 sc-eQTL 8.09e-01 -0.0241 0.0996 0.229 cMono_S100A L2
ENSG00000051620 HEBP2 776074 sc-eQTL 8.36e-01 0.0142 0.0681 0.229 cMono_S100A L2
ENSG00000112406 HECA 44525 sc-eQTL 7.26e-01 -0.0296 0.0841 0.229 cMono_S100A L2
ENSG00000135540 NHSL1 487034 sc-eQTL 2.33e-01 -0.127 0.106 0.229 cMono_S100A L2
ENSG00000135597 REPS1 191344 sc-eQTL 2.76e-01 0.11 0.101 0.229 cMono_S100A L2
ENSG00000146386 ABRACL 150860 sc-eQTL 3.96e-02 0.18 0.0869 0.229 cMono_S100A L2
ENSG00000164442 CITED2 -195043 sc-eQTL 9.30e-01 0.00763 0.0869 0.229 cMono_S100A L2
ENSG00000225177 AL590617.2 487057 sc-eQTL 4.50e-01 0.0883 0.117 0.229 cMono_S100A L2
ENSG00000024862 CCDC28A 406096 sc-eQTL 2.27e-01 -0.154 0.127 0.233 gdT L2
ENSG00000051620 HEBP2 776074 sc-eQTL 1.74e-02 -0.287 0.119 0.233 gdT L2
ENSG00000112406 HECA 44525 sc-eQTL 8.92e-01 -0.0164 0.121 0.233 gdT L2
ENSG00000135597 REPS1 191344 sc-eQTL 2.39e-02 -0.281 0.123 0.233 gdT L2
ENSG00000146386 ABRACL 150860 sc-eQTL 5.85e-03 0.257 0.0918 0.233 gdT L2
ENSG00000164442 CITED2 -195043 sc-eQTL 4.60e-01 -0.0803 0.108 0.233 gdT L2
ENSG00000024862 CCDC28A 406096 sc-eQTL 1.28e-01 -0.175 0.115 0.224 intMono L2
ENSG00000051620 HEBP2 776074 sc-eQTL 9.77e-01 0.0022 0.0774 0.224 intMono L2
ENSG00000112406 HECA 44525 sc-eQTL 4.74e-01 0.0678 0.0946 0.224 intMono L2
ENSG00000135540 NHSL1 487034 sc-eQTL 5.74e-01 -0.0587 0.104 0.224 intMono L2
ENSG00000135597 REPS1 191344 sc-eQTL 9.95e-01 -0.000631 0.108 0.224 intMono L2
ENSG00000146386 ABRACL 150860 sc-eQTL 2.64e-02 0.217 0.0972 0.224 intMono L2
ENSG00000164442 CITED2 -195043 sc-eQTL 8.14e-01 0.0225 0.0955 0.224 intMono L2
ENSG00000225177 AL590617.2 487057 sc-eQTL 5.19e-01 -0.0755 0.117 0.224 intMono L2
ENSG00000024862 CCDC28A 406096 sc-eQTL 8.97e-01 0.014 0.108 0.231 ncMono L2
ENSG00000051620 HEBP2 776074 sc-eQTL 5.05e-01 -0.0429 0.0643 0.231 ncMono L2
ENSG00000112406 HECA 44525 sc-eQTL 5.91e-01 0.053 0.0985 0.231 ncMono L2
ENSG00000135540 NHSL1 487034 sc-eQTL 1.81e-01 0.139 0.103 0.231 ncMono L2
ENSG00000135597 REPS1 191344 sc-eQTL 5.48e-01 -0.047 0.078 0.231 ncMono L2
ENSG00000146386 ABRACL 150860 sc-eQTL 6.35e-02 0.174 0.0933 0.231 ncMono L2
ENSG00000164442 CITED2 -195043 sc-eQTL 7.72e-01 0.0232 0.0798 0.231 ncMono L2
ENSG00000225177 AL590617.2 487057 sc-eQTL 2.45e-01 -0.134 0.115 0.231 ncMono L2
ENSG00000024862 CCDC28A 406096 sc-eQTL 4.38e-01 -0.094 0.121 0.223 pDC L2
ENSG00000051620 HEBP2 776074 sc-eQTL 6.46e-02 -0.173 0.0932 0.223 pDC L2
ENSG00000112406 HECA 44525 sc-eQTL 9.07e-01 -0.012 0.103 0.223 pDC L2
ENSG00000135540 NHSL1 487034 sc-eQTL 7.41e-01 -0.0311 0.0938 0.223 pDC L2
ENSG00000135597 REPS1 191344 sc-eQTL 5.56e-01 -0.056 0.0949 0.223 pDC L2
ENSG00000146386 ABRACL 150860 sc-eQTL 2.96e-01 -0.109 0.103 0.223 pDC L2
ENSG00000164442 CITED2 -195043 sc-eQTL 1.78e-01 -0.164 0.121 0.223 pDC L2
ENSG00000225177 AL590617.2 487057 sc-eQTL 1.20e-01 -0.146 0.0935 0.223 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000024862 CCDC28A 406096 sc-eQTL 6.48e-01 -0.0492 0.108 0.229 B_Memory LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 776074 sc-eQTL 2.02e-01 -0.0951 0.0743 0.229 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112406 HECA 44525 sc-eQTL 8.54e-01 -0.0176 0.0959 0.229 B_Memory LOneK1K
ENSG00000135597 REPS1 191344 sc-eQTL 5.31e-01 -0.0624 0.0993 0.229 B_Memory LOneK1K
ENSG00000146386 ABRACL 150860 sc-eQTL 5.84e-01 0.0377 0.0688 0.229 B_Memory LOneK1K
ENSG00000164440 TXLNB -112393 sc-eQTL 7.78e-02 -0.201 0.113 0.229 B_Memory LOneK1K
ENSG00000164442 CITED2 -195043 sc-eQTL 7.55e-01 -0.0303 0.0967 0.229 B_Memory LOneK1K
ENSG00000226571 AL592429.2 -91757 sc-eQTL 3.76e-02 0.233 0.111 0.229 B_Memory LOneK1K
ENSG00000024862 CCDC28A 406096 sc-eQTL 1.32e-01 -0.15 0.0992 0.229 B_Naive LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 776074 sc-eQTL 5.64e-01 -0.0399 0.0691 0.229 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112406 HECA 44525 sc-eQTL 9.60e-01 0.00463 0.0932 0.229 B_Naive LOneK1K
ENSG00000135597 REPS1 191344 sc-eQTL 1.68e-01 -0.109 0.0791 0.229 B_Naive LOneK1K
ENSG00000146386 ABRACL 150860 sc-eQTL 4.66e-01 -0.0407 0.0557 0.229 B_Naive LOneK1K
ENSG00000164440 TXLNB -112393 sc-eQTL 4.58e-01 0.0867 0.117 0.229 B_Naive LOneK1K
ENSG00000164442 CITED2 -195043 sc-eQTL 4.99e-01 -0.0573 0.0847 0.229 B_Naive LOneK1K
ENSG00000226571 AL592429.2 -91757 sc-eQTL 6.55e-01 0.0445 0.0996 0.229 B_Naive LOneK1K
ENSG00000024862 CCDC28A 406096 sc-eQTL 6.10e-01 -0.0405 0.0793 0.229 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 776074 sc-eQTL 5.12e-01 0.0388 0.0591 0.229 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112406 HECA 44525 sc-eQTL 4.60e-01 -0.0526 0.0711 0.229 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000135540 NHSL1 487034 sc-eQTL 8.27e-01 0.0227 0.104 0.229 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000135597 REPS1 191344 sc-eQTL 3.33e-01 0.0828 0.0854 0.229 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000146386 ABRACL 150860 sc-eQTL 2.82e-02 0.166 0.0753 0.229 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000164442 CITED2 -195043 sc-eQTL 7.16e-01 -0.0304 0.0833 0.229 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000225177 AL590617.2 487057 sc-eQTL 7.75e-01 0.032 0.112 0.229 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000024862 CCDC28A 406096 sc-eQTL 6.38e-01 -0.051 0.108 0.228 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 776074 sc-eQTL 4.85e-01 -0.0404 0.0578 0.228 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112406 HECA 44525 sc-eQTL 8.39e-01 0.0188 0.0925 0.228 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000135540 NHSL1 487034 sc-eQTL 6.02e-01 0.0537 0.103 0.228 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000135597 REPS1 191344 sc-eQTL 2.11e-01 -0.08 0.0638 0.228 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000146386 ABRACL 150860 sc-eQTL 4.32e-02 0.189 0.0928 0.228 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000164442 CITED2 -195043 sc-eQTL 7.02e-01 -0.031 0.0807 0.228 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000225177 AL590617.2 487057 sc-eQTL 5.03e-01 -0.0763 0.114 0.228 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000024862 CCDC28A 406096 sc-eQTL 6.63e-02 -0.185 0.1 0.231 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 776074 sc-eQTL 3.22e-01 -0.0869 0.0875 0.231 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112406 HECA 44525 sc-eQTL 3.24e-01 -0.0851 0.0861 0.231 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000135597 REPS1 191344 sc-eQTL 3.99e-01 -0.0712 0.0841 0.231 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000146386 ABRACL 150860 sc-eQTL 2.33e-01 0.0648 0.0542 0.231 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000164442 CITED2 -195043 sc-eQTL 6.06e-01 -0.0406 0.0786 0.231 NK_CD56dim LOneK1K


Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000112406 HECA 44525 eQTL 4.24e-12 0.073 0.0104 0.0286 0.0265 0.25
ENSG00000146386 ABRACL 150860 eQTL 0.00517 0.0725 0.0259 0.0 0.0 0.25
ENSG00000231329 AL031772.1 -60048 eQTL 0.00161 -0.0639 0.0202 0.00177 0.00142 0.25


Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000112406 HECA 44525 3.08e-05 2.61e-05 4.17e-06 1.35e-05 3.55e-06 1.24e-05 3.25e-05 3.71e-06 2.47e-05 1.17e-05 3.02e-05 1.02e-05 3.85e-05 1.03e-05 5.5e-06 1.32e-05 1.2e-05 1.93e-05 5.99e-06 5.18e-06 1.12e-05 2.53e-05 2.35e-05 6.81e-06 3.13e-05 5.97e-06 9.85e-06 9.63e-06 2.28e-05 1.78e-05 1.44e-05 1.61e-06 2.23e-06 5.67e-06 9.06e-06 4.51e-06 2.54e-06 2.82e-06 3.63e-06 2.73e-06 1.63e-06 2.9e-05 2.86e-06 2.52e-07 1.98e-06 2.81e-06 3.46e-06 1.5e-06 1.32e-06
ENSG00000146386 ABRACL 150860 6.67e-06 7.87e-06 6.9e-07 4.6e-06 1.62e-06 3.43e-06 5.71e-06 1.05e-06 5.2e-06 3.05e-06 8.58e-06 3.6e-06 7.66e-06 3.22e-06 1.01e-06 4.06e-06 3.02e-06 3.93e-06 1.45e-06 1.15e-06 2.79e-06 5.45e-06 4.77e-06 1.89e-06 7.08e-06 2.16e-06 2.35e-06 1.76e-06 4.46e-06 5e-06 3.29e-06 5.5e-07 7.38e-07 2.16e-06 2.06e-06 1.17e-06 1.02e-06 4.51e-07 8.58e-07 5.82e-07 2.44e-07 7.28e-06 6.89e-07 1.67e-07 7.77e-07 1.28e-06 1.13e-06 7.05e-07 6.01e-07