Genes within 1Mb (chr6:139144725:T:C):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD


Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000024862 CCDC28A 371216 sc-eQTL 2.24e-01 -0.109 0.0891 0.241 B L1
ENSG00000051620 HEBP2 741194 sc-eQTL 3.51e-01 -0.0636 0.0681 0.241 B L1
ENSG00000112406 HECA 9645 sc-eQTL 9.39e-01 -0.00666 0.0869 0.241 B L1
ENSG00000135597 REPS1 156464 sc-eQTL 1.51e-01 -0.11 0.0764 0.241 B L1
ENSG00000146386 ABRACL 115980 sc-eQTL 3.45e-01 -0.0426 0.045 0.241 B L1
ENSG00000164440 TXLNB -147273 sc-eQTL 2.06e-01 -0.14 0.11 0.241 B L1
ENSG00000164442 CITED2 -229923 sc-eQTL 6.85e-01 -0.0283 0.0696 0.241 B L1
ENSG00000226571 AL592429.2 -126637 sc-eQTL 1.40e-01 0.114 0.077 0.241 B L1
ENSG00000024862 CCDC28A 371216 sc-eQTL 1.68e-01 -0.136 0.0986 0.241 CD4T L1
ENSG00000051620 HEBP2 741194 sc-eQTL 1.93e-01 -0.0864 0.0662 0.241 CD4T L1
ENSG00000112406 HECA 9645 sc-eQTL 2.88e-01 -0.0878 0.0824 0.241 CD4T L1
ENSG00000135597 REPS1 156464 sc-eQTL 6.39e-01 -0.0305 0.0649 0.241 CD4T L1
ENSG00000146386 ABRACL 115980 sc-eQTL 2.97e-01 0.0497 0.0475 0.241 CD4T L1
ENSG00000164442 CITED2 -229923 sc-eQTL 1.20e-01 -0.126 0.0809 0.241 CD4T L1
ENSG00000231329 AL031772.1 -94928 sc-eQTL 7.25e-02 -0.144 0.0796 0.241 CD4T L1
ENSG00000024862 CCDC28A 371216 sc-eQTL 3.19e-01 -0.108 0.108 0.241 CD8T L1
ENSG00000051620 HEBP2 741194 sc-eQTL 2.48e-02 -0.158 0.0701 0.241 CD8T L1
ENSG00000112406 HECA 9645 sc-eQTL 2.11e-01 -0.097 0.0773 0.241 CD8T L1
ENSG00000135597 REPS1 156464 sc-eQTL 2.09e-01 0.0917 0.0727 0.241 CD8T L1
ENSG00000146386 ABRACL 115980 sc-eQTL 2.33e-01 0.0495 0.0414 0.241 CD8T L1
ENSG00000164442 CITED2 -229923 sc-eQTL 8.98e-02 -0.133 0.0783 0.241 CD8T L1
ENSG00000231329 AL031772.1 -94928 sc-eQTL 1.75e-01 -0.13 0.0954 0.241 CD8T L1
ENSG00000024862 CCDC28A 371216 sc-eQTL 1.32e-01 -0.164 0.108 0.245 DC L1
ENSG00000051620 HEBP2 741194 sc-eQTL 2.40e-03 -0.23 0.0748 0.245 DC L1
ENSG00000112406 HECA 9645 sc-eQTL 6.45e-01 -0.0414 0.0896 0.245 DC L1
ENSG00000135540 NHSL1 452154 sc-eQTL 8.18e-01 -0.023 0.0997 0.245 DC L1
ENSG00000135597 REPS1 156464 sc-eQTL 4.22e-01 -0.0708 0.0881 0.245 DC L1
ENSG00000146386 ABRACL 115980 sc-eQTL 1.36e-01 0.129 0.0859 0.245 DC L1
ENSG00000164442 CITED2 -229923 sc-eQTL 4.94e-01 -0.0702 0.102 0.245 DC L1
ENSG00000225177 AL590617.2 452177 sc-eQTL 7.95e-01 0.0271 0.104 0.245 DC L1
ENSG00000024862 CCDC28A 371216 sc-eQTL 8.05e-01 -0.0196 0.0793 0.241 Mono L1
ENSG00000051620 HEBP2 741194 sc-eQTL 4.92e-01 0.0377 0.0548 0.241 Mono L1
ENSG00000112406 HECA 9645 sc-eQTL 4.68e-01 -0.0525 0.0723 0.241 Mono L1
ENSG00000135540 NHSL1 452154 sc-eQTL 7.39e-01 0.0345 0.104 0.241 Mono L1
ENSG00000135597 REPS1 156464 sc-eQTL 2.29e-01 -0.073 0.0605 0.241 Mono L1
ENSG00000146386 ABRACL 115980 sc-eQTL 7.52e-02 0.14 0.0784 0.241 Mono L1
ENSG00000164442 CITED2 -229923 sc-eQTL 8.06e-01 0.0205 0.0835 0.241 Mono L1
ENSG00000225177 AL590617.2 452177 sc-eQTL 8.57e-01 0.0195 0.108 0.241 Mono L1
ENSG00000024862 CCDC28A 371216 sc-eQTL 1.08e-01 -0.156 0.0967 0.242 NK L1
ENSG00000051620 HEBP2 741194 sc-eQTL 4.34e-01 -0.0671 0.0856 0.242 NK L1
ENSG00000112406 HECA 9645 sc-eQTL 5.21e-01 -0.0541 0.084 0.242 NK L1
ENSG00000135597 REPS1 156464 sc-eQTL 2.99e-01 -0.0832 0.0799 0.242 NK L1
ENSG00000146386 ABRACL 115980 sc-eQTL 6.13e-02 0.109 0.058 0.242 NK L1
ENSG00000164442 CITED2 -229923 sc-eQTL 5.58e-01 -0.0455 0.0777 0.242 NK L1
ENSG00000024862 CCDC28A 371216 sc-eQTL 2.79e-01 -0.123 0.113 0.241 Other_T L1
ENSG00000051620 HEBP2 741194 sc-eQTL 5.05e-02 -0.143 0.0726 0.241 Other_T L1
ENSG00000112406 HECA 9645 sc-eQTL 3.57e-01 -0.0756 0.082 0.241 Other_T L1
ENSG00000135597 REPS1 156464 sc-eQTL 1.23e-01 -0.136 0.0878 0.241 Other_T L1
ENSG00000146386 ABRACL 115980 sc-eQTL 7.07e-02 0.104 0.0574 0.241 Other_T L1
ENSG00000164442 CITED2 -229923 sc-eQTL 6.71e-01 -0.0288 0.0677 0.241 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000024862 CCDC28A 371216 sc-eQTL 6.54e-01 -0.0594 0.132 0.235 B_Activated L2
ENSG00000051620 HEBP2 741194 sc-eQTL 4.69e-01 -0.0841 0.116 0.235 B_Activated L2
ENSG00000112406 HECA 9645 sc-eQTL 4.40e-01 0.0976 0.126 0.235 B_Activated L2
ENSG00000135597 REPS1 156464 sc-eQTL 2.72e-01 -0.145 0.132 0.235 B_Activated L2
ENSG00000146386 ABRACL 115980 sc-eQTL 2.53e-01 -0.137 0.119 0.235 B_Activated L2
ENSG00000164440 TXLNB -147273 sc-eQTL 3.29e-01 -0.1 0.102 0.235 B_Activated L2
ENSG00000164442 CITED2 -229923 sc-eQTL 2.03e-01 0.164 0.128 0.235 B_Activated L2
ENSG00000226571 AL592429.2 -126637 sc-eQTL 2.55e-01 0.146 0.128 0.235 B_Activated L2
ENSG00000024862 CCDC28A 371216 sc-eQTL 8.12e-01 0.0267 0.112 0.242 B_Intermediate L2
ENSG00000051620 HEBP2 741194 sc-eQTL 2.28e-01 -0.0937 0.0775 0.242 B_Intermediate L2
ENSG00000112406 HECA 9645 sc-eQTL 3.05e-01 -0.0998 0.097 0.242 B_Intermediate L2
ENSG00000135597 REPS1 156464 sc-eQTL 9.65e-01 0.00455 0.105 0.242 B_Intermediate L2
ENSG00000146386 ABRACL 115980 sc-eQTL 4.00e-01 0.0751 0.0891 0.242 B_Intermediate L2
ENSG00000164440 TXLNB -147273 sc-eQTL 2.56e-01 -0.124 0.109 0.242 B_Intermediate L2
ENSG00000164442 CITED2 -229923 sc-eQTL 9.45e-01 -0.00699 0.101 0.242 B_Intermediate L2
ENSG00000226571 AL592429.2 -126637 sc-eQTL 3.52e-01 0.102 0.109 0.242 B_Intermediate L2
ENSG00000024862 CCDC28A 371216 sc-eQTL 3.93e-02 -0.233 0.112 0.241 B_Memory L2
ENSG00000051620 HEBP2 741194 sc-eQTL 5.11e-01 -0.0562 0.0853 0.241 B_Memory L2
ENSG00000112406 HECA 9645 sc-eQTL 6.07e-01 -0.0505 0.098 0.241 B_Memory L2
ENSG00000135597 REPS1 156464 sc-eQTL 9.49e-01 0.00677 0.106 0.241 B_Memory L2
ENSG00000146386 ABRACL 115980 sc-eQTL 5.60e-01 -0.049 0.084 0.241 B_Memory L2
ENSG00000164440 TXLNB -147273 sc-eQTL 2.24e-01 -0.13 0.107 0.241 B_Memory L2
ENSG00000164442 CITED2 -229923 sc-eQTL 7.06e-01 0.0372 0.0986 0.241 B_Memory L2
ENSG00000226571 AL592429.2 -126637 sc-eQTL 1.72e-01 0.165 0.121 0.241 B_Memory L2
ENSG00000024862 CCDC28A 371216 sc-eQTL 8.56e-01 -0.0194 0.107 0.241 B_Naive1 L2
ENSG00000051620 HEBP2 741194 sc-eQTL 2.71e-01 -0.0828 0.0751 0.241 B_Naive1 L2
ENSG00000112406 HECA 9645 sc-eQTL 5.12e-01 -0.0613 0.0933 0.241 B_Naive1 L2
ENSG00000135597 REPS1 156464 sc-eQTL 5.10e-01 -0.057 0.0863 0.241 B_Naive1 L2
ENSG00000146386 ABRACL 115980 sc-eQTL 3.87e-01 -0.0523 0.0603 0.241 B_Naive1 L2
ENSG00000164440 TXLNB -147273 sc-eQTL 8.95e-01 -0.0149 0.113 0.241 B_Naive1 L2
ENSG00000164442 CITED2 -229923 sc-eQTL 9.14e-01 0.00887 0.0823 0.241 B_Naive1 L2
ENSG00000226571 AL592429.2 -126637 sc-eQTL 9.87e-01 -0.00177 0.108 0.241 B_Naive1 L2
ENSG00000024862 CCDC28A 371216 sc-eQTL 1.64e-01 -0.146 0.104 0.24 B_Naive2 L2
ENSG00000051620 HEBP2 741194 sc-eQTL 8.34e-01 0.015 0.0715 0.24 B_Naive2 L2
ENSG00000112406 HECA 9645 sc-eQTL 3.84e-01 0.0857 0.0983 0.24 B_Naive2 L2
ENSG00000135597 REPS1 156464 sc-eQTL 4.86e-01 -0.0655 0.0939 0.24 B_Naive2 L2
ENSG00000146386 ABRACL 115980 sc-eQTL 7.96e-01 -0.0179 0.0692 0.24 B_Naive2 L2
ENSG00000164440 TXLNB -147273 sc-eQTL 3.79e-01 0.0964 0.109 0.24 B_Naive2 L2
ENSG00000164442 CITED2 -229923 sc-eQTL 4.48e-01 -0.0849 0.112 0.24 B_Naive2 L2
ENSG00000226571 AL592429.2 -126637 sc-eQTL 8.74e-01 -0.0163 0.103 0.24 B_Naive2 L2
ENSG00000024862 CCDC28A 371216 sc-eQTL 2.01e-01 -0.137 0.107 0.241 CD4_CTL L2
ENSG00000051620 HEBP2 741194 sc-eQTL 1.46e-01 -0.135 0.0923 0.241 CD4_CTL L2
ENSG00000112406 HECA 9645 sc-eQTL 4.49e-01 -0.0821 0.108 0.241 CD4_CTL L2
ENSG00000135597 REPS1 156464 sc-eQTL 5.54e-02 -0.201 0.104 0.241 CD4_CTL L2
ENSG00000146386 ABRACL 115980 sc-eQTL 1.72e-01 0.131 0.0955 0.241 CD4_CTL L2
ENSG00000164442 CITED2 -229923 sc-eQTL 9.98e-01 0.000223 0.0964 0.241 CD4_CTL L2
ENSG00000231329 AL031772.1 -94928 sc-eQTL 2.24e-02 -0.226 0.0982 0.241 CD4_CTL L2
ENSG00000024862 CCDC28A 371216 sc-eQTL 3.69e-02 -0.216 0.103 0.241 CD4_Naive L2
ENSG00000051620 HEBP2 741194 sc-eQTL 3.52e-01 -0.0602 0.0645 0.241 CD4_Naive L2
ENSG00000112406 HECA 9645 sc-eQTL 5.09e-01 -0.0532 0.0805 0.241 CD4_Naive L2
ENSG00000135597 REPS1 156464 sc-eQTL 6.66e-01 -0.0308 0.0714 0.241 CD4_Naive L2
ENSG00000146386 ABRACL 115980 sc-eQTL 7.07e-01 -0.0181 0.0481 0.241 CD4_Naive L2
ENSG00000164442 CITED2 -229923 sc-eQTL 4.24e-02 -0.165 0.0809 0.241 CD4_Naive L2
ENSG00000231329 AL031772.1 -94928 sc-eQTL 1.06e-01 -0.133 0.0821 0.241 CD4_Naive L2
ENSG00000024862 CCDC28A 371216 sc-eQTL 6.65e-01 0.0441 0.102 0.241 CD4_TCM L2
ENSG00000051620 HEBP2 741194 sc-eQTL 7.33e-02 -0.135 0.075 0.241 CD4_TCM L2
ENSG00000112406 HECA 9645 sc-eQTL 2.02e-01 -0.104 0.081 0.241 CD4_TCM L2
ENSG00000135597 REPS1 156464 sc-eQTL 3.85e-01 -0.0669 0.0769 0.241 CD4_TCM L2
ENSG00000146386 ABRACL 115980 sc-eQTL 2.73e-01 0.0649 0.0591 0.241 CD4_TCM L2
ENSG00000164442 CITED2 -229923 sc-eQTL 9.27e-02 -0.148 0.0875 0.241 CD4_TCM L2
ENSG00000231329 AL031772.1 -94928 sc-eQTL 8.14e-02 -0.166 0.0945 0.241 CD4_TCM L2
ENSG00000024862 CCDC28A 371216 sc-eQTL 9.71e-02 -0.192 0.115 0.241 CD4_TEM L2
ENSG00000051620 HEBP2 741194 sc-eQTL 5.64e-01 -0.0456 0.0787 0.241 CD4_TEM L2
ENSG00000112406 HECA 9645 sc-eQTL 2.78e-01 -0.0976 0.0897 0.241 CD4_TEM L2
ENSG00000135597 REPS1 156464 sc-eQTL 8.85e-01 0.0142 0.098 0.241 CD4_TEM L2
ENSG00000146386 ABRACL 115980 sc-eQTL 1.05e-01 0.113 0.0695 0.241 CD4_TEM L2
ENSG00000164442 CITED2 -229923 sc-eQTL 4.44e-01 -0.0703 0.0917 0.241 CD4_TEM L2
ENSG00000231329 AL031772.1 -94928 sc-eQTL 2.76e-01 -0.105 0.0958 0.241 CD4_TEM L2
ENSG00000024862 CCDC28A 371216 sc-eQTL 8.63e-01 -0.0204 0.118 0.241 CD8_CTL L2
ENSG00000051620 HEBP2 741194 sc-eQTL 1.79e-01 -0.113 0.084 0.241 CD8_CTL L2
ENSG00000112406 HECA 9645 sc-eQTL 8.53e-01 0.0159 0.086 0.241 CD8_CTL L2
ENSG00000135597 REPS1 156464 sc-eQTL 3.33e-01 0.0891 0.0919 0.241 CD8_CTL L2
ENSG00000146386 ABRACL 115980 sc-eQTL 4.37e-02 0.15 0.0738 0.241 CD8_CTL L2
ENSG00000164442 CITED2 -229923 sc-eQTL 9.97e-01 0.000286 0.0868 0.241 CD8_CTL L2
ENSG00000231329 AL031772.1 -94928 sc-eQTL 1.12e-02 -0.262 0.102 0.241 CD8_CTL L2
ENSG00000024862 CCDC28A 371216 sc-eQTL 8.59e-02 -0.192 0.111 0.241 CD8_Naive L2
ENSG00000051620 HEBP2 741194 sc-eQTL 4.96e-02 -0.14 0.071 0.241 CD8_Naive L2
ENSG00000112406 HECA 9645 sc-eQTL 1.04e-01 -0.14 0.086 0.241 CD8_Naive L2
ENSG00000135597 REPS1 156464 sc-eQTL 7.94e-01 0.0227 0.0867 0.241 CD8_Naive L2
ENSG00000146386 ABRACL 115980 sc-eQTL 9.61e-01 0.00221 0.0455 0.241 CD8_Naive L2
ENSG00000164442 CITED2 -229923 sc-eQTL 8.78e-02 -0.157 0.0914 0.241 CD8_Naive L2
ENSG00000231329 AL031772.1 -94928 sc-eQTL 6.90e-01 -0.042 0.105 0.241 CD8_Naive L2
ENSG00000024862 CCDC28A 371216 sc-eQTL 5.81e-01 -0.0686 0.124 0.241 CD8_TCM L2
ENSG00000051620 HEBP2 741194 sc-eQTL 3.09e-01 -0.0887 0.0871 0.241 CD8_TCM L2
ENSG00000112406 HECA 9645 sc-eQTL 9.79e-01 0.00245 0.0909 0.241 CD8_TCM L2
ENSG00000135597 REPS1 156464 sc-eQTL 6.38e-01 0.0445 0.0944 0.241 CD8_TCM L2
ENSG00000146386 ABRACL 115980 sc-eQTL 8.23e-01 -0.0211 0.0941 0.241 CD8_TCM L2
ENSG00000164442 CITED2 -229923 sc-eQTL 8.31e-01 -0.0206 0.0967 0.241 CD8_TCM L2
ENSG00000231329 AL031772.1 -94928 sc-eQTL 6.36e-01 0.0483 0.102 0.241 CD8_TCM L2
ENSG00000024862 CCDC28A 371216 sc-eQTL 5.20e-01 -0.0743 0.115 0.24 CD8_TEM L2
ENSG00000051620 HEBP2 741194 sc-eQTL 2.78e-01 -0.114 0.105 0.24 CD8_TEM L2
ENSG00000112406 HECA 9645 sc-eQTL 8.76e-02 -0.184 0.107 0.24 CD8_TEM L2
ENSG00000135597 REPS1 156464 sc-eQTL 9.49e-01 -0.00717 0.112 0.24 CD8_TEM L2
ENSG00000146386 ABRACL 115980 sc-eQTL 6.21e-01 0.0429 0.0866 0.24 CD8_TEM L2
ENSG00000164442 CITED2 -229923 sc-eQTL 5.76e-01 0.0527 0.0941 0.24 CD8_TEM L2
ENSG00000231329 AL031772.1 -94928 sc-eQTL 6.47e-01 -0.0491 0.107 0.24 CD8_TEM L2
ENSG00000024862 CCDC28A 371216 sc-eQTL 6.45e-01 -0.0569 0.123 0.242 MAIT L2
ENSG00000051620 HEBP2 741194 sc-eQTL 3.99e-02 -0.175 0.0848 0.242 MAIT L2
ENSG00000112406 HECA 9645 sc-eQTL 1.33e-01 -0.141 0.0933 0.242 MAIT L2
ENSG00000135597 REPS1 156464 sc-eQTL 6.01e-01 -0.053 0.101 0.242 MAIT L2
ENSG00000146386 ABRACL 115980 sc-eQTL 7.66e-01 -0.0221 0.0743 0.242 MAIT L2
ENSG00000164442 CITED2 -229923 sc-eQTL 9.95e-01 0.000583 0.0875 0.242 MAIT L2
ENSG00000024862 CCDC28A 371216 sc-eQTL 7.15e-01 -0.0413 0.113 0.238 NK_CD56bright L2
ENSG00000051620 HEBP2 741194 sc-eQTL 5.39e-01 -0.0593 0.0963 0.238 NK_CD56bright L2
ENSG00000112406 HECA 9645 sc-eQTL 9.61e-01 -0.00506 0.103 0.238 NK_CD56bright L2
ENSG00000135597 REPS1 156464 sc-eQTL 4.80e-01 -0.0676 0.0956 0.238 NK_CD56bright L2
ENSG00000146386 ABRACL 115980 sc-eQTL 5.38e-02 0.17 0.0874 0.238 NK_CD56bright L2
ENSG00000164442 CITED2 -229923 sc-eQTL 4.97e-01 0.0642 0.0945 0.238 NK_CD56bright L2
ENSG00000024862 CCDC28A 371216 sc-eQTL 7.63e-02 -0.186 0.104 0.244 NK_CD56dim L2
ENSG00000051620 HEBP2 741194 sc-eQTL 7.40e-01 -0.0311 0.0934 0.244 NK_CD56dim L2
ENSG00000112406 HECA 9645 sc-eQTL 6.58e-01 -0.0402 0.0905 0.244 NK_CD56dim L2
ENSG00000135597 REPS1 156464 sc-eQTL 8.92e-02 -0.146 0.0853 0.244 NK_CD56dim L2
ENSG00000146386 ABRACL 115980 sc-eQTL 6.77e-02 0.106 0.0577 0.244 NK_CD56dim L2
ENSG00000164442 CITED2 -229923 sc-eQTL 5.19e-01 -0.05 0.0774 0.244 NK_CD56dim L2
ENSG00000024862 CCDC28A 371216 sc-eQTL 7.17e-01 -0.0433 0.119 0.237 NK_HLA L2
ENSG00000051620 HEBP2 741194 sc-eQTL 1.80e-01 -0.136 0.101 0.237 NK_HLA L2
ENSG00000112406 HECA 9645 sc-eQTL 2.25e-01 -0.135 0.111 0.237 NK_HLA L2
ENSG00000135597 REPS1 156464 sc-eQTL 2.95e-01 -0.115 0.11 0.237 NK_HLA L2
ENSG00000146386 ABRACL 115980 sc-eQTL 1.97e-01 0.117 0.09 0.237 NK_HLA L2
ENSG00000164442 CITED2 -229923 sc-eQTL 7.86e-01 -0.0262 0.0966 0.237 NK_HLA L2
ENSG00000024862 CCDC28A 371216 sc-eQTL 9.96e-02 -0.177 0.107 0.244 NK_cytokine L2
ENSG00000051620 HEBP2 741194 sc-eQTL 3.95e-01 -0.0788 0.0924 0.244 NK_cytokine L2
ENSG00000112406 HECA 9645 sc-eQTL 7.65e-01 -0.0277 0.0926 0.244 NK_cytokine L2
ENSG00000135597 REPS1 156464 sc-eQTL 8.98e-01 0.0123 0.0956 0.244 NK_cytokine L2
ENSG00000146386 ABRACL 115980 sc-eQTL 7.69e-01 0.0181 0.0616 0.244 NK_cytokine L2
ENSG00000164442 CITED2 -229923 sc-eQTL 5.60e-01 -0.0469 0.0803 0.244 NK_cytokine L2
ENSG00000024862 CCDC28A 371216 sc-eQTL 1.75e-01 0.187 0.137 0.248 PB L2
ENSG00000051620 HEBP2 741194 sc-eQTL 2.16e-03 0.37 0.118 0.248 PB L2
ENSG00000112406 HECA 9645 sc-eQTL 7.82e-01 0.0418 0.151 0.248 PB L2
ENSG00000135597 REPS1 156464 sc-eQTL 1.88e-01 0.176 0.133 0.248 PB L2
ENSG00000146386 ABRACL 115980 sc-eQTL 2.08e-04 0.338 0.0881 0.248 PB L2
ENSG00000164440 TXLNB -147273 sc-eQTL 7.62e-01 -0.0416 0.137 0.248 PB L2
ENSG00000164442 CITED2 -229923 sc-eQTL 4.54e-02 -0.205 0.101 0.248 PB L2
ENSG00000226571 AL592429.2 -126637 sc-eQTL 4.81e-01 -0.0975 0.138 0.248 PB L2
ENSG00000024862 CCDC28A 371216 sc-eQTL 1.28e-01 -0.18 0.118 0.237 Pro_T L2
ENSG00000051620 HEBP2 741194 sc-eQTL 9.97e-01 -0.000379 0.0942 0.237 Pro_T L2
ENSG00000112406 HECA 9645 sc-eQTL 7.78e-02 0.164 0.0924 0.237 Pro_T L2
ENSG00000135597 REPS1 156464 sc-eQTL 2.88e-01 -0.116 0.109 0.237 Pro_T L2
ENSG00000146386 ABRACL 115980 sc-eQTL 6.47e-02 0.13 0.0701 0.237 Pro_T L2
ENSG00000164442 CITED2 -229923 sc-eQTL 4.48e-01 0.064 0.0841 0.237 Pro_T L2
ENSG00000024862 CCDC28A 371216 sc-eQTL 6.06e-01 -0.0574 0.111 0.241 Treg L2
ENSG00000051620 HEBP2 741194 sc-eQTL 4.91e-01 -0.0522 0.0758 0.241 Treg L2
ENSG00000112406 HECA 9645 sc-eQTL 8.85e-01 0.0133 0.0922 0.241 Treg L2
ENSG00000135597 REPS1 156464 sc-eQTL 8.73e-01 -0.0153 0.0955 0.241 Treg L2
ENSG00000146386 ABRACL 115980 sc-eQTL 1.24e-01 0.125 0.0809 0.241 Treg L2
ENSG00000164442 CITED2 -229923 sc-eQTL 8.57e-01 0.0164 0.0908 0.241 Treg L2
ENSG00000231329 AL031772.1 -94928 sc-eQTL 3.64e-01 0.0942 0.104 0.241 Treg L2
ENSG00000024862 CCDC28A 371216 sc-eQTL 4.97e-01 -0.0735 0.108 0.241 cDC L2
ENSG00000051620 HEBP2 741194 sc-eQTL 6.48e-02 -0.143 0.0767 0.241 cDC L2
ENSG00000112406 HECA 9645 sc-eQTL 1.24e-01 -0.158 0.102 0.241 cDC L2
ENSG00000135540 NHSL1 452154 sc-eQTL 7.89e-01 -0.0269 0.1 0.241 cDC L2
ENSG00000135597 REPS1 156464 sc-eQTL 7.21e-01 -0.0414 0.116 0.241 cDC L2
ENSG00000146386 ABRACL 115980 sc-eQTL 3.87e-01 0.0819 0.0945 0.241 cDC L2
ENSG00000164442 CITED2 -229923 sc-eQTL 4.03e-01 0.0839 0.1 0.241 cDC L2
ENSG00000225177 AL590617.2 452177 sc-eQTL 6.63e-01 0.0483 0.111 0.241 cDC L2
ENSG00000024862 CCDC28A 371216 sc-eQTL 9.01e-01 0.0108 0.0868 0.241 cMono_IL1B L2
ENSG00000051620 HEBP2 741194 sc-eQTL 6.69e-01 0.0267 0.0623 0.241 cMono_IL1B L2
ENSG00000112406 HECA 9645 sc-eQTL 3.11e-01 -0.0726 0.0715 0.241 cMono_IL1B L2
ENSG00000135540 NHSL1 452154 sc-eQTL 2.13e-01 0.13 0.104 0.241 cMono_IL1B L2
ENSG00000135597 REPS1 156464 sc-eQTL 3.97e-01 -0.0789 0.0931 0.241 cMono_IL1B L2
ENSG00000146386 ABRACL 115980 sc-eQTL 2.06e-02 0.181 0.0774 0.241 cMono_IL1B L2
ENSG00000164442 CITED2 -229923 sc-eQTL 7.27e-01 -0.0287 0.082 0.241 cMono_IL1B L2
ENSG00000225177 AL590617.2 452177 sc-eQTL 7.11e-01 -0.0406 0.109 0.241 cMono_IL1B L2
ENSG00000024862 CCDC28A 371216 sc-eQTL 7.56e-01 0.0312 0.1 0.241 cMono_S100A L2
ENSG00000051620 HEBP2 741194 sc-eQTL 8.77e-01 0.0106 0.0685 0.241 cMono_S100A L2
ENSG00000112406 HECA 9645 sc-eQTL 9.39e-01 0.00649 0.0846 0.241 cMono_S100A L2
ENSG00000135540 NHSL1 452154 sc-eQTL 2.60e-01 -0.121 0.107 0.241 cMono_S100A L2
ENSG00000135597 REPS1 156464 sc-eQTL 3.00e-01 0.105 0.101 0.241 cMono_S100A L2
ENSG00000146386 ABRACL 115980 sc-eQTL 3.42e-02 0.186 0.0873 0.241 cMono_S100A L2
ENSG00000164442 CITED2 -229923 sc-eQTL 8.15e-01 0.0205 0.0873 0.241 cMono_S100A L2
ENSG00000225177 AL590617.2 452177 sc-eQTL 4.30e-01 0.0927 0.117 0.241 cMono_S100A L2
ENSG00000024862 CCDC28A 371216 sc-eQTL 1.73e-01 -0.174 0.127 0.252 gdT L2
ENSG00000051620 HEBP2 741194 sc-eQTL 7.19e-03 -0.325 0.119 0.252 gdT L2
ENSG00000112406 HECA 9645 sc-eQTL 9.29e-01 -0.0109 0.122 0.252 gdT L2
ENSG00000135597 REPS1 156464 sc-eQTL 3.37e-02 -0.266 0.124 0.252 gdT L2
ENSG00000146386 ABRACL 115980 sc-eQTL 1.08e-02 0.239 0.0927 0.252 gdT L2
ENSG00000164442 CITED2 -229923 sc-eQTL 5.91e-01 -0.0588 0.109 0.252 gdT L2
ENSG00000024862 CCDC28A 371216 sc-eQTL 1.29e-01 -0.176 0.115 0.238 intMono L2
ENSG00000051620 HEBP2 741194 sc-eQTL 9.92e-01 -0.000777 0.0778 0.238 intMono L2
ENSG00000112406 HECA 9645 sc-eQTL 4.86e-01 0.0664 0.0951 0.238 intMono L2
ENSG00000135540 NHSL1 452154 sc-eQTL 5.22e-01 -0.0672 0.105 0.238 intMono L2
ENSG00000135597 REPS1 156464 sc-eQTL 7.08e-01 -0.0406 0.108 0.238 intMono L2
ENSG00000146386 ABRACL 115980 sc-eQTL 4.95e-02 0.194 0.098 0.238 intMono L2
ENSG00000164442 CITED2 -229923 sc-eQTL 5.85e-01 0.0525 0.096 0.238 intMono L2
ENSG00000225177 AL590617.2 452177 sc-eQTL 8.28e-01 -0.0257 0.118 0.238 intMono L2
ENSG00000024862 CCDC28A 371216 sc-eQTL 8.42e-01 0.0214 0.108 0.24 ncMono L2
ENSG00000051620 HEBP2 741194 sc-eQTL 3.12e-01 -0.0648 0.064 0.24 ncMono L2
ENSG00000112406 HECA 9645 sc-eQTL 4.85e-01 0.0686 0.0982 0.24 ncMono L2
ENSG00000135540 NHSL1 452154 sc-eQTL 1.20e-01 0.16 0.103 0.24 ncMono L2
ENSG00000135597 REPS1 156464 sc-eQTL 4.18e-01 -0.0631 0.0778 0.24 ncMono L2
ENSG00000146386 ABRACL 115980 sc-eQTL 1.69e-01 0.129 0.0934 0.24 ncMono L2
ENSG00000164442 CITED2 -229923 sc-eQTL 6.64e-01 0.0346 0.0796 0.24 ncMono L2
ENSG00000225177 AL590617.2 452177 sc-eQTL 1.84e-01 -0.152 0.114 0.24 ncMono L2
ENSG00000024862 CCDC28A 371216 sc-eQTL 5.11e-01 -0.0795 0.121 0.232 pDC L2
ENSG00000051620 HEBP2 741194 sc-eQTL 4.29e-02 -0.19 0.0928 0.232 pDC L2
ENSG00000112406 HECA 9645 sc-eQTL 9.89e-01 0.00141 0.102 0.232 pDC L2
ENSG00000135540 NHSL1 452154 sc-eQTL 8.54e-01 -0.0173 0.0937 0.232 pDC L2
ENSG00000135597 REPS1 156464 sc-eQTL 4.94e-01 -0.0649 0.0947 0.232 pDC L2
ENSG00000146386 ABRACL 115980 sc-eQTL 3.91e-01 -0.0889 0.103 0.232 pDC L2
ENSG00000164442 CITED2 -229923 sc-eQTL 1.21e-01 -0.189 0.121 0.232 pDC L2
ENSG00000225177 AL590617.2 452177 sc-eQTL 1.35e-01 -0.14 0.0934 0.232 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000024862 CCDC28A 371216 sc-eQTL 3.76e-01 -0.0954 0.107 0.241 B_Memory LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 741194 sc-eQTL 1.06e-01 -0.12 0.0741 0.241 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112406 HECA 9645 sc-eQTL 5.70e-01 -0.0545 0.0957 0.241 B_Memory LOneK1K
ENSG00000135597 REPS1 156464 sc-eQTL 5.92e-01 -0.0533 0.0992 0.241 B_Memory LOneK1K
ENSG00000146386 ABRACL 115980 sc-eQTL 7.10e-01 0.0256 0.0688 0.241 B_Memory LOneK1K
ENSG00000164440 TXLNB -147273 sc-eQTL 4.56e-02 -0.227 0.113 0.241 B_Memory LOneK1K
ENSG00000164442 CITED2 -229923 sc-eQTL 9.39e-01 -0.00744 0.0967 0.241 B_Memory LOneK1K
ENSG00000226571 AL592429.2 -126637 sc-eQTL 3.34e-02 0.238 0.111 0.241 B_Memory LOneK1K
ENSG00000024862 CCDC28A 371216 sc-eQTL 1.92e-01 -0.13 0.0992 0.241 B_Naive LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 741194 sc-eQTL 5.29e-01 -0.0435 0.069 0.241 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112406 HECA 9645 sc-eQTL 9.27e-01 -0.00849 0.0932 0.241 B_Naive LOneK1K
ENSG00000135597 REPS1 156464 sc-eQTL 2.67e-01 -0.0881 0.0792 0.241 B_Naive LOneK1K
ENSG00000146386 ABRACL 115980 sc-eQTL 2.45e-01 -0.0648 0.0555 0.241 B_Naive LOneK1K
ENSG00000164440 TXLNB -147273 sc-eQTL 6.67e-01 0.0502 0.117 0.241 B_Naive LOneK1K
ENSG00000164442 CITED2 -229923 sc-eQTL 6.85e-01 -0.0344 0.0847 0.241 B_Naive LOneK1K
ENSG00000226571 AL592429.2 -126637 sc-eQTL 9.18e-01 -0.0102 0.0996 0.241 B_Naive LOneK1K
ENSG00000024862 CCDC28A 371216 sc-eQTL 8.46e-01 0.0155 0.0797 0.241 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 741194 sc-eQTL 6.82e-01 0.0244 0.0594 0.241 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112406 HECA 9645 sc-eQTL 4.21e-01 -0.0576 0.0714 0.241 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000135540 NHSL1 452154 sc-eQTL 8.25e-01 0.0232 0.105 0.241 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000135597 REPS1 156464 sc-eQTL 8.79e-01 0.0131 0.086 0.241 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000146386 ABRACL 115980 sc-eQTL 3.69e-02 0.159 0.0757 0.241 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000164442 CITED2 -229923 sc-eQTL 8.97e-01 -0.0109 0.0838 0.241 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000225177 AL590617.2 452177 sc-eQTL 5.91e-01 0.0604 0.112 0.241 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000024862 CCDC28A 371216 sc-eQTL 6.38e-01 -0.0512 0.109 0.241 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 741194 sc-eQTL 5.25e-01 -0.0369 0.058 0.241 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112406 HECA 9645 sc-eQTL 9.03e-01 0.0113 0.0928 0.241 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000135540 NHSL1 452154 sc-eQTL 6.73e-01 0.0435 0.103 0.241 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000135597 REPS1 156464 sc-eQTL 4.97e-02 -0.126 0.0636 0.241 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000146386 ABRACL 115980 sc-eQTL 1.05e-01 0.152 0.0934 0.241 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000164442 CITED2 -229923 sc-eQTL 9.13e-01 -0.00882 0.081 0.241 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000225177 AL590617.2 452177 sc-eQTL 6.15e-01 -0.0574 0.114 0.241 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000024862 CCDC28A 371216 sc-eQTL 8.71e-02 -0.172 0.1 0.244 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000051620 HEBP2 741194 sc-eQTL 3.65e-01 -0.0794 0.0875 0.244 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112406 HECA 9645 sc-eQTL 4.74e-01 -0.0617 0.0861 0.244 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000135597 REPS1 156464 sc-eQTL 3.71e-01 -0.0754 0.0841 0.244 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000146386 ABRACL 115980 sc-eQTL 2.24e-01 0.066 0.0541 0.244 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000164442 CITED2 -229923 sc-eQTL 5.86e-01 -0.0428 0.0785 0.244 NK_CD56dim LOneK1K


Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000051620 HEBP2 741194 eQTL 0.0441 -0.0434 0.0215 0.0 0.0 0.258
ENSG00000112406 HECA 9645 eQTL 9.47e-11 0.0672 0.0103 0.00135 0.00132 0.258
ENSG00000146386 ABRACL 115980 eQTL 0.00791 0.0678 0.0255 0.0 0.0 0.258
ENSG00000231329 AL031772.1 -94928 eQTL 0.000711 -0.0675 0.0199 0.00318 0.0028 0.258


Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000112406 HECA 9645 4.67e-05 3.46e-05 6.45e-06 1.55e-05 5.91e-06 1.57e-05 4.74e-05 4.24e-06 3.11e-05 1.47e-05 3.92e-05 1.72e-05 5e-05 1.45e-05 6.84e-06 1.92e-05 1.86e-05 2.66e-05 7.91e-06 6.57e-06 1.59e-05 3.41e-05 3.46e-05 8.8e-06 4.44e-05 7.92e-06 1.39e-05 1.26e-05 3.51e-05 2.71e-05 2.03e-05 1.64e-06 2.41e-06 6.84e-06 1.16e-05 5.68e-06 2.98e-06 3.16e-06 4.43e-06 3.19e-06 1.7e-06 4.2e-05 4.04e-06 3.24e-07 2.59e-06 3.67e-06 4.09e-06 1.48e-06 1.52e-06
ENSG00000146386 ABRACL 115980 9.17e-06 5.38e-06 7.57e-07 3.48e-06 1.61e-06 3.4e-06 6.01e-06 1.01e-06 4.83e-06 2.81e-06 6.45e-06 2.83e-06 7.73e-06 1.86e-06 1.04e-06 4.81e-06 2e-06 3.84e-06 1.45e-06 1.15e-06 2.83e-06 5.98e-06 4.67e-06 1.34e-06 8.57e-06 1.93e-06 3.22e-06 1.55e-06 4.47e-06 5e-06 2.83e-06 4.03e-07 6.31e-07 1.75e-06 2.09e-06 9.58e-07 9.37e-07 4.36e-07 1.05e-06 5.49e-07 4.63e-07 7.98e-06 1.22e-06 1.69e-07 4.7e-07 7.77e-07 1.02e-06 4.41e-07 5.14e-07
ENSG00000231329 AL031772.1 -94928 1.1e-05 8.57e-06 1.36e-06 3.75e-06 1.9e-06 4.17e-06 9.06e-06 1.11e-06 5.86e-06 4.14e-06 9.14e-06 4.49e-06 1.06e-05 3.47e-06 1.47e-06 6.48e-06 3.67e-06 5.96e-06 2.11e-06 1.63e-06 3.45e-06 7.57e-06 5.83e-06 1.99e-06 1.06e-05 2.2e-06 4.49e-06 2.27e-06 6.75e-06 7.66e-06 3.51e-06 5.11e-07 7.27e-07 2.16e-06 2.56e-06 1.16e-06 1.08e-06 9.82e-07 8.52e-07 9.09e-07 7.24e-07 9.36e-06 1.42e-06 1.66e-07 7.17e-07 1.07e-06 1.12e-06 6.74e-07 5.79e-07