logo

Genes within 1Mb (chr6:134945898:T:C):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000028839 TBPL1 993728 sc-eQTL 3.93e-01 0.13 0.152 0.079 B L1
ENSG00000112339 HBS1L -157158 sc-eQTL 1.04e-01 0.151 0.0926 0.079 B L1
ENSG00000118515 SGK1 627786 sc-eQTL 9.86e-01 -0.00187 0.106 0.079 B L1
ENSG00000135541 AHI1 -551867 sc-eQTL 2.48e-02 0.346 0.153 0.079 B L1
ENSG00000171408 PDE7B -905803 sc-eQTL 1.07e-01 -0.186 0.115 0.079 B L1
ENSG00000286313 AL360178.1 -935044 sc-eQTL 2.61e-01 -0.169 0.15 0.079 B L1
ENSG00000028839 TBPL1 993728 sc-eQTL 5.68e-01 0.0652 0.114 0.079 CD4T L1
ENSG00000112339 HBS1L -157158 sc-eQTL 9.72e-04 0.269 0.0805 0.079 CD4T L1
ENSG00000118513 MYB -235410 sc-eQTL 6.76e-01 0.0383 0.0914 0.079 CD4T L1
ENSG00000118515 SGK1 627786 sc-eQTL 4.08e-01 0.0776 0.0937 0.079 CD4T L1
ENSG00000135541 AHI1 -551867 sc-eQTL 1.91e-02 0.318 0.135 0.079 CD4T L1
ENSG00000286313 AL360178.1 -935044 sc-eQTL 9.84e-01 0.00267 0.13 0.079 CD4T L1
ENSG00000028839 TBPL1 993728 sc-eQTL 3.03e-02 0.238 0.109 0.079 CD8T L1
ENSG00000112339 HBS1L -157158 sc-eQTL 1.05e-04 0.363 0.0919 0.079 CD8T L1
ENSG00000118513 MYB -235410 sc-eQTL 1.53e-01 0.151 0.105 0.079 CD8T L1
ENSG00000118515 SGK1 627786 sc-eQTL 2.35e-01 -0.0842 0.0706 0.079 CD8T L1
ENSG00000135541 AHI1 -551867 sc-eQTL 6.56e-02 0.256 0.138 0.079 CD8T L1
ENSG00000028839 TBPL1 993728 sc-eQTL 8.34e-01 0.0375 0.179 0.074 DC L1
ENSG00000112339 HBS1L -157158 sc-eQTL 1.21e-01 0.241 0.155 0.074 DC L1
ENSG00000118513 MYB -235410 sc-eQTL 5.18e-01 -0.0733 0.113 0.074 DC L1
ENSG00000118515 SGK1 627786 sc-eQTL 8.69e-01 -0.0171 0.103 0.074 DC L1
ENSG00000135541 AHI1 -551867 sc-eQTL 9.21e-01 -0.0104 0.105 0.074 DC L1
ENSG00000171408 PDE7B -905803 sc-eQTL 7.70e-01 0.0449 0.154 0.074 DC L1
ENSG00000286313 AL360178.1 -935044 sc-eQTL 2.90e-01 -0.152 0.144 0.074 DC L1
ENSG00000286887 AL355881.1 649597 sc-eQTL 6.25e-01 0.0783 0.16 0.074 DC L1
ENSG00000028839 TBPL1 993728 sc-eQTL 9.49e-01 0.00781 0.121 0.079 Mono L1
ENSG00000112339 HBS1L -157158 sc-eQTL 1.32e-01 0.181 0.12 0.079 Mono L1
ENSG00000118515 SGK1 627786 sc-eQTL 6.79e-01 -0.0371 0.0894 0.079 Mono L1
ENSG00000135541 AHI1 -551867 sc-eQTL 7.84e-01 -0.0375 0.136 0.079 Mono L1
ENSG00000171408 PDE7B -905803 sc-eQTL 5.32e-02 0.226 0.116 0.079 Mono L1
ENSG00000286887 AL355881.1 649597 sc-eQTL 2.70e-01 -0.136 0.123 0.079 Mono L1
ENSG00000028839 TBPL1 993728 sc-eQTL 8.31e-01 -0.0278 0.13 0.077 NK L1
ENSG00000112339 HBS1L -157158 sc-eQTL 2.81e-01 0.115 0.106 0.077 NK L1
ENSG00000118515 SGK1 627786 sc-eQTL 2.56e-01 0.13 0.114 0.077 NK L1
ENSG00000135541 AHI1 -551867 sc-eQTL 7.09e-01 0.0557 0.149 0.077 NK L1
ENSG00000028839 TBPL1 993728 sc-eQTL 3.69e-01 0.136 0.151 0.079 Other_T L1
ENSG00000112339 HBS1L -157158 sc-eQTL 2.95e-03 0.294 0.0978 0.079 Other_T L1
ENSG00000118515 SGK1 627786 sc-eQTL 4.68e-01 0.076 0.105 0.079 Other_T L1
ENSG00000135541 AHI1 -551867 sc-eQTL 7.54e-01 0.0487 0.156 0.079 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000028839 TBPL1 993728 sc-eQTL 6.05e-01 0.0904 0.174 0.089 B_Activated L2
ENSG00000112339 HBS1L -157158 sc-eQTL 2.49e-02 0.405 0.179 0.089 B_Activated L2
ENSG00000118515 SGK1 627786 sc-eQTL 7.19e-01 -0.0547 0.152 0.089 B_Activated L2
ENSG00000135541 AHI1 -551867 sc-eQTL 8.18e-01 0.0394 0.171 0.089 B_Activated L2
ENSG00000171408 PDE7B -905803 sc-eQTL 9.96e-01 0.000877 0.157 0.089 B_Activated L2
ENSG00000286313 AL360178.1 -935044 sc-eQTL 7.76e-01 0.0363 0.128 0.089 B_Activated L2
ENSG00000028839 TBPL1 993728 sc-eQTL 5.36e-01 0.109 0.176 0.079 B_Intermediate L2
ENSG00000112339 HBS1L -157158 sc-eQTL 8.80e-01 -0.0236 0.156 0.079 B_Intermediate L2
ENSG00000118515 SGK1 627786 sc-eQTL 9.03e-01 -0.0196 0.162 0.079 B_Intermediate L2
ENSG00000135541 AHI1 -551867 sc-eQTL 7.75e-01 0.0483 0.169 0.079 B_Intermediate L2
ENSG00000171408 PDE7B -905803 sc-eQTL 6.97e-01 0.0577 0.148 0.079 B_Intermediate L2
ENSG00000286313 AL360178.1 -935044 sc-eQTL 7.01e-01 -0.0598 0.156 0.079 B_Intermediate L2
ENSG00000028839 TBPL1 993728 sc-eQTL 6.66e-01 -0.0722 0.167 0.075 B_Memory L2
ENSG00000112339 HBS1L -157158 sc-eQTL 7.11e-01 0.0559 0.151 0.075 B_Memory L2
ENSG00000118515 SGK1 627786 sc-eQTL 3.77e-01 0.124 0.14 0.075 B_Memory L2
ENSG00000135541 AHI1 -551867 sc-eQTL 1.74e-01 0.227 0.166 0.075 B_Memory L2
ENSG00000171408 PDE7B -905803 sc-eQTL 6.46e-01 -0.0699 0.152 0.075 B_Memory L2
ENSG00000286313 AL360178.1 -935044 sc-eQTL 8.40e-01 0.0283 0.14 0.075 B_Memory L2
ENSG00000028839 TBPL1 993728 sc-eQTL 4.52e-01 0.114 0.151 0.079 B_Naive1 L2
ENSG00000112339 HBS1L -157158 sc-eQTL 2.83e-02 0.288 0.13 0.079 B_Naive1 L2
ENSG00000118515 SGK1 627786 sc-eQTL 7.72e-01 0.0366 0.126 0.079 B_Naive1 L2
ENSG00000135541 AHI1 -551867 sc-eQTL 3.99e-02 0.327 0.158 0.079 B_Naive1 L2
ENSG00000171408 PDE7B -905803 sc-eQTL 8.54e-02 -0.236 0.137 0.079 B_Naive1 L2
ENSG00000286313 AL360178.1 -935044 sc-eQTL 9.33e-01 0.0136 0.162 0.079 B_Naive1 L2
ENSG00000028839 TBPL1 993728 sc-eQTL 3.81e-01 0.142 0.162 0.079 B_Naive2 L2
ENSG00000112339 HBS1L -157158 sc-eQTL 4.34e-01 -0.117 0.149 0.079 B_Naive2 L2
ENSG00000118515 SGK1 627786 sc-eQTL 1.42e-01 -0.217 0.147 0.079 B_Naive2 L2
ENSG00000135541 AHI1 -551867 sc-eQTL 2.09e-02 0.381 0.164 0.079 B_Naive2 L2
ENSG00000171408 PDE7B -905803 sc-eQTL 4.29e-01 -0.121 0.153 0.079 B_Naive2 L2
ENSG00000286313 AL360178.1 -935044 sc-eQTL 3.71e-01 -0.14 0.157 0.079 B_Naive2 L2
ENSG00000028839 TBPL1 993728 sc-eQTL 3.73e-01 0.143 0.16 0.082 CD4_CTL L2
ENSG00000112339 HBS1L -157158 sc-eQTL 9.86e-01 0.00296 0.165 0.082 CD4_CTL L2
ENSG00000118513 MYB -235410 sc-eQTL 7.61e-01 -0.0339 0.111 0.082 CD4_CTL L2
ENSG00000118515 SGK1 627786 sc-eQTL 9.24e-01 -0.0123 0.129 0.082 CD4_CTL L2
ENSG00000135541 AHI1 -551867 sc-eQTL 3.72e-01 0.138 0.154 0.082 CD4_CTL L2
ENSG00000286313 AL360178.1 -935044 sc-eQTL 2.29e-01 0.156 0.129 0.082 CD4_CTL L2
ENSG00000028839 TBPL1 993728 sc-eQTL 8.55e-01 -0.0239 0.13 0.079 CD4_Naive L2
ENSG00000112339 HBS1L -157158 sc-eQTL 7.84e-03 0.239 0.0892 0.079 CD4_Naive L2
ENSG00000118513 MYB -235410 sc-eQTL 3.35e-01 0.092 0.0952 0.079 CD4_Naive L2
ENSG00000118515 SGK1 627786 sc-eQTL 1.14e-01 0.148 0.0932 0.079 CD4_Naive L2
ENSG00000135541 AHI1 -551867 sc-eQTL 1.02e-02 0.356 0.138 0.079 CD4_Naive L2
ENSG00000286313 AL360178.1 -935044 sc-eQTL 6.83e-01 -0.0576 0.141 0.079 CD4_Naive L2
ENSG00000028839 TBPL1 993728 sc-eQTL 5.39e-01 0.0867 0.141 0.079 CD4_TCM L2
ENSG00000112339 HBS1L -157158 sc-eQTL 1.55e-03 0.358 0.112 0.079 CD4_TCM L2
ENSG00000118513 MYB -235410 sc-eQTL 7.98e-01 0.0285 0.111 0.079 CD4_TCM L2
ENSG00000118515 SGK1 627786 sc-eQTL 7.37e-01 -0.0342 0.102 0.079 CD4_TCM L2
ENSG00000135541 AHI1 -551867 sc-eQTL 3.01e-02 0.317 0.145 0.079 CD4_TCM L2
ENSG00000286313 AL360178.1 -935044 sc-eQTL 3.15e-01 0.16 0.159 0.079 CD4_TCM L2
ENSG00000028839 TBPL1 993728 sc-eQTL 6.97e-01 -0.064 0.164 0.079 CD4_TEM L2
ENSG00000112339 HBS1L -157158 sc-eQTL 8.36e-02 0.239 0.138 0.079 CD4_TEM L2
ENSG00000118513 MYB -235410 sc-eQTL 3.19e-01 0.121 0.122 0.079 CD4_TEM L2
ENSG00000118515 SGK1 627786 sc-eQTL 8.85e-01 0.0161 0.111 0.079 CD4_TEM L2
ENSG00000135541 AHI1 -551867 sc-eQTL 9.14e-01 -0.0166 0.154 0.079 CD4_TEM L2
ENSG00000286313 AL360178.1 -935044 sc-eQTL 9.47e-01 0.0103 0.153 0.079 CD4_TEM L2
ENSG00000028839 TBPL1 993728 sc-eQTL 3.78e-01 0.125 0.142 0.079 CD8_CTL L2
ENSG00000112339 HBS1L -157158 sc-eQTL 5.12e-02 0.259 0.132 0.079 CD8_CTL L2
ENSG00000118513 MYB -235410 sc-eQTL 7.22e-02 0.21 0.116 0.079 CD8_CTL L2
ENSG00000118515 SGK1 627786 sc-eQTL 5.11e-02 0.265 0.135 0.079 CD8_CTL L2
ENSG00000135541 AHI1 -551867 sc-eQTL 3.47e-02 0.316 0.149 0.079 CD8_CTL L2
ENSG00000028839 TBPL1 993728 sc-eQTL 9.33e-02 0.262 0.155 0.079 CD8_Naive L2
ENSG00000112339 HBS1L -157158 sc-eQTL 5.39e-03 0.342 0.122 0.079 CD8_Naive L2
ENSG00000118513 MYB -235410 sc-eQTL 1.21e-01 0.18 0.116 0.079 CD8_Naive L2
ENSG00000118515 SGK1 627786 sc-eQTL 2.66e-01 -0.115 0.103 0.079 CD8_Naive L2
ENSG00000135541 AHI1 -551867 sc-eQTL 7.59e-01 0.0465 0.151 0.079 CD8_Naive L2
ENSG00000028839 TBPL1 993728 sc-eQTL 4.65e-01 0.128 0.174 0.076 CD8_TCM L2
ENSG00000112339 HBS1L -157158 sc-eQTL 1.44e-02 0.364 0.147 0.076 CD8_TCM L2
ENSG00000118513 MYB -235410 sc-eQTL 5.40e-01 -0.0862 0.141 0.076 CD8_TCM L2
ENSG00000118515 SGK1 627786 sc-eQTL 1.80e-01 -0.173 0.129 0.076 CD8_TCM L2
ENSG00000135541 AHI1 -551867 sc-eQTL 8.62e-01 0.0288 0.166 0.076 CD8_TCM L2
ENSG00000028839 TBPL1 993728 sc-eQTL 5.01e-01 0.107 0.158 0.082 CD8_TEM L2
ENSG00000112339 HBS1L -157158 sc-eQTL 4.27e-02 0.329 0.161 0.082 CD8_TEM L2
ENSG00000118513 MYB -235410 sc-eQTL 1.44e-01 -0.189 0.129 0.082 CD8_TEM L2
ENSG00000118515 SGK1 627786 sc-eQTL 1.77e-01 -0.205 0.151 0.082 CD8_TEM L2
ENSG00000135541 AHI1 -551867 sc-eQTL 1.29e-01 0.259 0.17 0.082 CD8_TEM L2
ENSG00000028839 TBPL1 993728 sc-eQTL 6.28e-01 0.0783 0.161 0.08 MAIT L2
ENSG00000112339 HBS1L -157158 sc-eQTL 6.62e-01 0.0639 0.146 0.08 MAIT L2
ENSG00000118515 SGK1 627786 sc-eQTL 7.68e-01 0.0319 0.108 0.08 MAIT L2
ENSG00000135541 AHI1 -551867 sc-eQTL 8.82e-01 0.0245 0.165 0.08 MAIT L2
ENSG00000028839 TBPL1 993728 sc-eQTL 2.11e-01 -0.214 0.171 0.08 NK_CD56bright L2
ENSG00000112339 HBS1L -157158 sc-eQTL 4.25e-02 0.302 0.148 0.08 NK_CD56bright L2
ENSG00000118515 SGK1 627786 sc-eQTL 9.97e-02 0.221 0.133 0.08 NK_CD56bright L2
ENSG00000135541 AHI1 -551867 sc-eQTL 3.22e-01 0.151 0.152 0.08 NK_CD56bright L2
ENSG00000028839 TBPL1 993728 sc-eQTL 6.64e-01 0.0612 0.141 0.078 NK_CD56dim L2
ENSG00000112339 HBS1L -157158 sc-eQTL 4.34e-01 0.101 0.129 0.078 NK_CD56dim L2
ENSG00000118515 SGK1 627786 sc-eQTL 1.95e-01 -0.184 0.141 0.078 NK_CD56dim L2
ENSG00000135541 AHI1 -551867 sc-eQTL 5.85e-01 0.0908 0.166 0.078 NK_CD56dim L2
ENSG00000028839 TBPL1 993728 sc-eQTL 7.27e-01 -0.0594 0.17 0.082 NK_HLA L2
ENSG00000112339 HBS1L -157158 sc-eQTL 4.23e-01 -0.126 0.156 0.082 NK_HLA L2
ENSG00000118515 SGK1 627786 sc-eQTL 1.95e-01 0.187 0.144 0.082 NK_HLA L2
ENSG00000135541 AHI1 -551867 sc-eQTL 5.81e-01 -0.0908 0.164 0.082 NK_HLA L2
ENSG00000028839 TBPL1 993728 sc-eQTL 9.21e-01 -0.0143 0.144 0.078 NK_cytokine L2
ENSG00000112339 HBS1L -157158 sc-eQTL 2.87e-01 0.148 0.139 0.078 NK_cytokine L2
ENSG00000118515 SGK1 627786 sc-eQTL 3.08e-01 0.144 0.141 0.078 NK_cytokine L2
ENSG00000135541 AHI1 -551867 sc-eQTL 4.62e-01 -0.114 0.154 0.078 NK_cytokine L2
ENSG00000028839 TBPL1 993728 sc-eQTL 4.81e-01 -0.152 0.215 0.074 PB L2
ENSG00000112339 HBS1L -157158 sc-eQTL 1.56e-01 0.242 0.169 0.074 PB L2
ENSG00000118515 SGK1 627786 sc-eQTL 4.35e-01 -0.134 0.172 0.074 PB L2
ENSG00000135541 AHI1 -551867 sc-eQTL 1.74e-01 0.311 0.227 0.074 PB L2
ENSG00000171408 PDE7B -905803 sc-eQTL 6.86e-01 -0.0624 0.154 0.074 PB L2
ENSG00000286313 AL360178.1 -935044 sc-eQTL 7.84e-01 0.0428 0.156 0.074 PB L2
ENSG00000028839 TBPL1 993728 sc-eQTL 7.38e-01 -0.0542 0.162 0.078 Pro_T L2
ENSG00000112339 HBS1L -157158 sc-eQTL 3.84e-01 0.112 0.128 0.078 Pro_T L2
ENSG00000118515 SGK1 627786 sc-eQTL 5.79e-01 -0.0653 0.118 0.078 Pro_T L2
ENSG00000135541 AHI1 -551867 sc-eQTL 8.26e-01 -0.0364 0.165 0.078 Pro_T L2
ENSG00000028839 TBPL1 993728 sc-eQTL 2.22e-01 0.206 0.168 0.079 Treg L2
ENSG00000112339 HBS1L -157158 sc-eQTL 5.19e-02 0.283 0.145 0.079 Treg L2
ENSG00000118513 MYB -235410 sc-eQTL 6.84e-01 0.0514 0.126 0.079 Treg L2
ENSG00000118515 SGK1 627786 sc-eQTL 5.86e-01 -0.068 0.125 0.079 Treg L2
ENSG00000135541 AHI1 -551867 sc-eQTL 8.73e-01 -0.0251 0.157 0.079 Treg L2
ENSG00000286313 AL360178.1 -935044 sc-eQTL 2.45e-01 -0.172 0.148 0.079 Treg L2
ENSG00000028839 TBPL1 993728 sc-eQTL 9.78e-01 0.00506 0.184 0.073 cDC L2
ENSG00000112339 HBS1L -157158 sc-eQTL 6.72e-02 0.332 0.181 0.073 cDC L2
ENSG00000118513 MYB -235410 sc-eQTL 5.09e-01 0.0869 0.131 0.073 cDC L2
ENSG00000118515 SGK1 627786 sc-eQTL 5.29e-01 0.0859 0.136 0.073 cDC L2
ENSG00000135541 AHI1 -551867 sc-eQTL 8.05e-01 -0.0393 0.159 0.073 cDC L2
ENSG00000171408 PDE7B -905803 sc-eQTL 9.27e-01 -0.0142 0.155 0.073 cDC L2
ENSG00000286313 AL360178.1 -935044 sc-eQTL 3.31e-01 0.137 0.14 0.073 cDC L2
ENSG00000286887 AL355881.1 649597 sc-eQTL 1.56e-01 0.223 0.157 0.073 cDC L2
ENSG00000028839 TBPL1 993728 sc-eQTL 5.03e-01 0.0927 0.138 0.079 cMono_IL1B L2
ENSG00000112339 HBS1L -157158 sc-eQTL 1.22e-01 0.209 0.134 0.079 cMono_IL1B L2
ENSG00000118515 SGK1 627786 sc-eQTL 5.92e-01 -0.0531 0.099 0.079 cMono_IL1B L2
ENSG00000135541 AHI1 -551867 sc-eQTL 9.80e-01 -0.00354 0.143 0.079 cMono_IL1B L2
ENSG00000171408 PDE7B -905803 sc-eQTL 3.16e-01 0.139 0.139 0.079 cMono_IL1B L2
ENSG00000286887 AL355881.1 649597 sc-eQTL 6.29e-01 -0.0645 0.133 0.079 cMono_IL1B L2
ENSG00000028839 TBPL1 993728 sc-eQTL 6.00e-01 -0.084 0.16 0.079 cMono_S100A L2
ENSG00000112339 HBS1L -157158 sc-eQTL 3.58e-01 0.138 0.15 0.079 cMono_S100A L2
ENSG00000118515 SGK1 627786 sc-eQTL 1.45e-01 -0.123 0.0841 0.079 cMono_S100A L2
ENSG00000135541 AHI1 -551867 sc-eQTL 3.68e-01 -0.143 0.158 0.079 cMono_S100A L2
ENSG00000171408 PDE7B -905803 sc-eQTL 8.69e-02 0.252 0.147 0.079 cMono_S100A L2
ENSG00000286887 AL355881.1 649597 sc-eQTL 8.31e-03 -0.35 0.132 0.079 cMono_S100A L2
ENSG00000028839 TBPL1 993728 sc-eQTL 5.44e-01 -0.126 0.207 0.079 gdT L2
ENSG00000112339 HBS1L -157158 sc-eQTL 4.05e-01 0.152 0.182 0.079 gdT L2
ENSG00000118515 SGK1 627786 sc-eQTL 6.80e-01 -0.0585 0.142 0.079 gdT L2
ENSG00000135541 AHI1 -551867 sc-eQTL 6.41e-01 -0.0855 0.183 0.079 gdT L2
ENSG00000028839 TBPL1 993728 sc-eQTL 8.77e-01 0.025 0.161 0.076 intMono L2
ENSG00000112339 HBS1L -157158 sc-eQTL 3.38e-01 -0.162 0.169 0.076 intMono L2
ENSG00000118515 SGK1 627786 sc-eQTL 8.58e-01 -0.0205 0.114 0.076 intMono L2
ENSG00000135541 AHI1 -551867 sc-eQTL 4.20e-01 -0.132 0.163 0.076 intMono L2
ENSG00000171408 PDE7B -905803 sc-eQTL 5.31e-01 0.0934 0.149 0.076 intMono L2
ENSG00000286887 AL355881.1 649597 sc-eQTL 8.93e-01 -0.0214 0.158 0.076 intMono L2
ENSG00000028839 TBPL1 993728 sc-eQTL 2.96e-01 -0.177 0.169 0.077 ncMono L2
ENSG00000112339 HBS1L -157158 sc-eQTL 8.65e-01 0.0264 0.155 0.077 ncMono L2
ENSG00000118515 SGK1 627786 sc-eQTL 8.72e-01 -0.0176 0.109 0.077 ncMono L2
ENSG00000135541 AHI1 -551867 sc-eQTL 4.39e-01 0.125 0.161 0.077 ncMono L2
ENSG00000171408 PDE7B -905803 sc-eQTL 5.32e-01 0.0871 0.139 0.077 ncMono L2
ENSG00000286887 AL355881.1 649597 sc-eQTL 9.21e-02 -0.243 0.143 0.077 ncMono L2
ENSG00000028839 TBPL1 993728 sc-eQTL 3.62e-01 -0.183 0.201 0.076 pDC L2
ENSG00000112339 HBS1L -157158 sc-eQTL 4.63e-02 0.326 0.162 0.076 pDC L2
ENSG00000118513 MYB -235410 sc-eQTL 5.68e-01 0.081 0.142 0.076 pDC L2
ENSG00000118515 SGK1 627786 sc-eQTL 6.37e-01 -0.0541 0.114 0.076 pDC L2
ENSG00000135541 AHI1 -551867 sc-eQTL 9.27e-01 -0.0122 0.132 0.076 pDC L2
ENSG00000171408 PDE7B -905803 sc-eQTL 5.99e-01 -0.0866 0.164 0.076 pDC L2
ENSG00000286313 AL360178.1 -935044 sc-eQTL 3.78e-02 -0.329 0.157 0.076 pDC L2
ENSG00000286887 AL355881.1 649597 sc-eQTL 2.12e-01 -0.176 0.141 0.076 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000028839 TBPL1 993728 sc-eQTL 9.83e-02 0.269 0.162 0.079 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112339 HBS1L -157158 sc-eQTL 2.00e-01 0.175 0.136 0.079 B_Memory LOneK1K
ENSG00000118515 SGK1 627786 sc-eQTL 6.86e-01 -0.0512 0.126 0.079 B_Memory LOneK1K
ENSG00000135541 AHI1 -551867 sc-eQTL 5.93e-01 0.085 0.159 0.079 B_Memory LOneK1K
ENSG00000171408 PDE7B -905803 sc-eQTL 9.26e-01 -0.0125 0.134 0.079 B_Memory LOneK1K
ENSG00000286313 AL360178.1 -935044 sc-eQTL 4.27e-01 -0.123 0.154 0.079 B_Memory LOneK1K
ENSG00000028839 TBPL1 993728 sc-eQTL 3.29e-01 0.148 0.152 0.079 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112339 HBS1L -157158 sc-eQTL 1.95e-01 0.162 0.125 0.079 B_Naive LOneK1K
ENSG00000118515 SGK1 627786 sc-eQTL 7.84e-01 -0.0342 0.125 0.079 B_Naive LOneK1K
ENSG00000135541 AHI1 -551867 sc-eQTL 9.66e-03 0.414 0.159 0.079 B_Naive LOneK1K
ENSG00000171408 PDE7B -905803 sc-eQTL 7.94e-02 -0.233 0.132 0.079 B_Naive LOneK1K
ENSG00000286313 AL360178.1 -935044 sc-eQTL 5.59e-01 -0.0948 0.162 0.079 B_Naive LOneK1K
ENSG00000028839 TBPL1 993728 sc-eQTL 9.58e-01 0.00666 0.126 0.079 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112339 HBS1L -157158 sc-eQTL 1.16e-01 0.194 0.123 0.079 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000118515 SGK1 627786 sc-eQTL 5.68e-01 -0.0527 0.0923 0.079 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000135541 AHI1 -551867 sc-eQTL 6.12e-01 -0.0705 0.139 0.079 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000171408 PDE7B -905803 sc-eQTL 4.53e-02 0.242 0.12 0.079 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000286887 AL355881.1 649597 sc-eQTL 2.78e-01 -0.137 0.126 0.079 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000028839 TBPL1 993728 sc-eQTL 8.04e-01 -0.0406 0.164 0.078 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112339 HBS1L -157158 sc-eQTL 8.24e-01 -0.0332 0.149 0.078 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000118515 SGK1 627786 sc-eQTL 7.91e-01 0.0253 0.0952 0.078 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000135541 AHI1 -551867 sc-eQTL 5.41e-01 -0.0928 0.152 0.078 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000171408 PDE7B -905803 sc-eQTL 2.85e-01 0.146 0.137 0.078 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000286887 AL355881.1 649597 sc-eQTL 2.19e-01 -0.17 0.138 0.078 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000028839 TBPL1 993728 sc-eQTL 9.86e-01 -0.00233 0.129 0.078 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112339 HBS1L -157158 sc-eQTL 5.62e-01 0.0666 0.115 0.078 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000118515 SGK1 627786 sc-eQTL 4.73e-01 0.0926 0.129 0.078 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000135541 AHI1 -551867 sc-eQTL 7.19e-01 0.0553 0.154 0.078 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000118514 ALDH8A1 -4217 eQTL 1.5e-13 0.639 0.0852 0.0 0.0 0.0613

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000118514 ALDH8A1 -4217 3.49e-05 3.25e-05 6.4e-06 1.56e-05 5.94e-06 1.46e-05 4.55e-05 4.84e-06 3.18e-05 1.58e-05 3.92e-05 1.79e-05 4.85e-05 1.4e-05 7.05e-06 1.92e-05 1.77e-05 2.59e-05 7.86e-06 6.93e-06 1.56e-05 3.37e-05 3.27e-05 9.41e-06 4.56e-05 8.28e-06 1.44e-05 1.3e-05 3.26e-05 2.61e-05 2.07e-05 1.64e-06 2.61e-06 7.18e-06 1.21e-05 5.78e-06 3.11e-06 3.14e-06 4.95e-06 3.36e-06 1.67e-06 3.78e-05 3.63e-06 3.84e-07 2.63e-06 4.06e-06 4.11e-06 1.73e-06 1.54e-06