Genes within 1Mb (chr6:134904815:C:CCGCA):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD


Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000028839 TBPL1 952645 sc-eQTL 8.58e-01 0.0227 0.127 0.122 B L1
ENSG00000112339 HBS1L -198241 sc-eQTL 9.97e-01 -0.000341 0.0778 0.122 B L1
ENSG00000118515 SGK1 586703 sc-eQTL 8.83e-01 0.013 0.0887 0.122 B L1
ENSG00000135541 AHI1 -592950 sc-eQTL 7.70e-01 -0.0379 0.129 0.122 B L1
ENSG00000171408 PDE7B -946886 sc-eQTL 2.51e-01 0.111 0.0964 0.122 B L1
ENSG00000286313 AL360178.1 -976127 sc-eQTL 7.91e-01 -0.0333 0.125 0.122 B L1
ENSG00000028839 TBPL1 952645 sc-eQTL 3.89e-01 -0.0802 0.0928 0.122 CD4T L1
ENSG00000112339 HBS1L -198241 sc-eQTL 2.64e-02 -0.149 0.0666 0.122 CD4T L1
ENSG00000118513 MYB -276493 sc-eQTL 9.95e-02 -0.123 0.0741 0.122 CD4T L1
ENSG00000118515 SGK1 586703 sc-eQTL 2.12e-02 -0.175 0.0756 0.122 CD4T L1
ENSG00000135541 AHI1 -592950 sc-eQTL 8.08e-01 0.027 0.111 0.122 CD4T L1
ENSG00000286313 AL360178.1 -976127 sc-eQTL 6.63e-01 -0.0462 0.106 0.122 CD4T L1
ENSG00000028839 TBPL1 952645 sc-eQTL 6.40e-01 -0.0428 0.0915 0.122 CD8T L1
ENSG00000112339 HBS1L -198241 sc-eQTL 3.79e-01 -0.0695 0.0788 0.122 CD8T L1
ENSG00000118513 MYB -276493 sc-eQTL 9.05e-01 -0.0105 0.0874 0.122 CD8T L1
ENSG00000118515 SGK1 586703 sc-eQTL 1.88e-01 -0.0773 0.0585 0.122 CD8T L1
ENSG00000135541 AHI1 -592950 sc-eQTL 7.40e-01 0.0383 0.116 0.122 CD8T L1
ENSG00000028839 TBPL1 952645 sc-eQTL 8.29e-01 0.0301 0.139 0.126 DC L1
ENSG00000112339 HBS1L -198241 sc-eQTL 2.57e-01 -0.137 0.121 0.126 DC L1
ENSG00000118513 MYB -276493 sc-eQTL 6.39e-01 -0.0414 0.0881 0.126 DC L1
ENSG00000118515 SGK1 586703 sc-eQTL 8.48e-01 -0.0154 0.0805 0.126 DC L1
ENSG00000135541 AHI1 -592950 sc-eQTL 7.99e-01 0.0208 0.0818 0.126 DC L1
ENSG00000171408 PDE7B -946886 sc-eQTL 7.46e-01 0.0389 0.12 0.126 DC L1
ENSG00000286313 AL360178.1 -976127 sc-eQTL 9.27e-01 -0.0103 0.112 0.126 DC L1
ENSG00000286887 AL355881.1 608514 sc-eQTL 8.77e-01 0.0193 0.125 0.126 DC L1
ENSG00000028839 TBPL1 952645 sc-eQTL 2.24e-01 -0.119 0.0974 0.122 Mono L1
ENSG00000112339 HBS1L -198241 sc-eQTL 9.05e-01 0.0116 0.0969 0.122 Mono L1
ENSG00000118515 SGK1 586703 sc-eQTL 5.80e-02 0.136 0.0715 0.122 Mono L1
ENSG00000135541 AHI1 -592950 sc-eQTL 3.36e-01 -0.106 0.11 0.122 Mono L1
ENSG00000171408 PDE7B -946886 sc-eQTL 2.97e-01 -0.0988 0.0945 0.122 Mono L1
ENSG00000286887 AL355881.1 608514 sc-eQTL 7.76e-01 0.0282 0.0993 0.122 Mono L1
ENSG00000028839 TBPL1 952645 sc-eQTL 6.29e-01 -0.0518 0.107 0.122 NK L1
ENSG00000112339 HBS1L -198241 sc-eQTL 3.52e-01 -0.0817 0.0876 0.122 NK L1
ENSG00000118515 SGK1 586703 sc-eQTL 7.59e-02 -0.167 0.0936 0.122 NK L1
ENSG00000135541 AHI1 -592950 sc-eQTL 9.25e-01 -0.0116 0.123 0.122 NK L1
ENSG00000028839 TBPL1 952645 sc-eQTL 3.90e-01 0.107 0.124 0.122 Other_T L1
ENSG00000112339 HBS1L -198241 sc-eQTL 8.43e-01 0.0164 0.0824 0.122 Other_T L1
ENSG00000118515 SGK1 586703 sc-eQTL 7.25e-01 -0.0304 0.0865 0.122 Other_T L1
ENSG00000135541 AHI1 -592950 sc-eQTL 2.24e-01 0.156 0.128 0.122 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000028839 TBPL1 952645 sc-eQTL 2.18e-01 -0.176 0.143 0.125 B_Activated L2
ENSG00000112339 HBS1L -198241 sc-eQTL 3.77e-01 -0.131 0.149 0.125 B_Activated L2
ENSG00000118515 SGK1 586703 sc-eQTL 5.17e-01 0.0809 0.125 0.125 B_Activated L2
ENSG00000135541 AHI1 -592950 sc-eQTL 5.78e-01 0.078 0.14 0.125 B_Activated L2
ENSG00000171408 PDE7B -946886 sc-eQTL 1.54e-01 0.183 0.128 0.125 B_Activated L2
ENSG00000286313 AL360178.1 -976127 sc-eQTL 8.07e-01 -0.0256 0.105 0.125 B_Activated L2
ENSG00000028839 TBPL1 952645 sc-eQTL 1.73e-01 -0.188 0.137 0.122 B_Intermediate L2
ENSG00000112339 HBS1L -198241 sc-eQTL 4.51e-01 0.0919 0.122 0.122 B_Intermediate L2
ENSG00000118515 SGK1 586703 sc-eQTL 6.37e-01 0.0596 0.126 0.122 B_Intermediate L2
ENSG00000135541 AHI1 -592950 sc-eQTL 7.29e-01 -0.0458 0.132 0.122 B_Intermediate L2
ENSG00000171408 PDE7B -946886 sc-eQTL 8.81e-01 -0.0174 0.116 0.122 B_Intermediate L2
ENSG00000286313 AL360178.1 -976127 sc-eQTL 2.82e-01 -0.131 0.121 0.122 B_Intermediate L2
ENSG00000028839 TBPL1 952645 sc-eQTL 6.99e-01 -0.0509 0.132 0.123 B_Memory L2
ENSG00000112339 HBS1L -198241 sc-eQTL 5.93e-01 -0.0633 0.118 0.123 B_Memory L2
ENSG00000118515 SGK1 586703 sc-eQTL 6.40e-01 0.0516 0.11 0.123 B_Memory L2
ENSG00000135541 AHI1 -592950 sc-eQTL 7.17e-01 -0.0477 0.131 0.123 B_Memory L2
ENSG00000171408 PDE7B -946886 sc-eQTL 1.92e-01 0.155 0.119 0.123 B_Memory L2
ENSG00000286313 AL360178.1 -976127 sc-eQTL 8.26e-01 -0.0243 0.11 0.123 B_Memory L2
ENSG00000028839 TBPL1 952645 sc-eQTL 5.91e-01 0.069 0.128 0.122 B_Naive1 L2
ENSG00000112339 HBS1L -198241 sc-eQTL 2.93e-01 0.117 0.111 0.122 B_Naive1 L2
ENSG00000118515 SGK1 586703 sc-eQTL 5.38e-01 0.0657 0.107 0.122 B_Naive1 L2
ENSG00000135541 AHI1 -592950 sc-eQTL 2.89e-01 -0.143 0.135 0.122 B_Naive1 L2
ENSG00000171408 PDE7B -946886 sc-eQTL 9.69e-01 -0.0045 0.116 0.122 B_Naive1 L2
ENSG00000286313 AL360178.1 -976127 sc-eQTL 8.16e-01 -0.0319 0.137 0.122 B_Naive1 L2
ENSG00000028839 TBPL1 952645 sc-eQTL 6.08e-01 -0.0692 0.135 0.122 B_Naive2 L2
ENSG00000112339 HBS1L -198241 sc-eQTL 4.35e-01 -0.0969 0.124 0.122 B_Naive2 L2
ENSG00000118515 SGK1 586703 sc-eQTL 5.44e-01 -0.0747 0.123 0.122 B_Naive2 L2
ENSG00000135541 AHI1 -592950 sc-eQTL 8.63e-01 0.0238 0.138 0.122 B_Naive2 L2
ENSG00000171408 PDE7B -946886 sc-eQTL 4.71e-01 0.0921 0.128 0.122 B_Naive2 L2
ENSG00000286313 AL360178.1 -976127 sc-eQTL 7.45e-01 0.0425 0.13 0.122 B_Naive2 L2
ENSG00000028839 TBPL1 952645 sc-eQTL 2.10e-01 0.167 0.133 0.118 CD4_CTL L2
ENSG00000112339 HBS1L -198241 sc-eQTL 4.32e-01 0.107 0.136 0.118 CD4_CTL L2
ENSG00000118513 MYB -276493 sc-eQTL 2.76e-01 0.1 0.092 0.118 CD4_CTL L2
ENSG00000118515 SGK1 586703 sc-eQTL 5.54e-01 -0.0632 0.107 0.118 CD4_CTL L2
ENSG00000135541 AHI1 -592950 sc-eQTL 8.21e-01 -0.029 0.128 0.118 CD4_CTL L2
ENSG00000286313 AL360178.1 -976127 sc-eQTL 9.34e-01 0.00897 0.108 0.118 CD4_CTL L2
ENSG00000028839 TBPL1 952645 sc-eQTL 7.45e-02 -0.189 0.105 0.122 CD4_Naive L2
ENSG00000112339 HBS1L -198241 sc-eQTL 2.34e-02 -0.167 0.0732 0.122 CD4_Naive L2
ENSG00000118513 MYB -276493 sc-eQTL 1.69e-01 -0.107 0.0777 0.122 CD4_Naive L2
ENSG00000118515 SGK1 586703 sc-eQTL 2.62e-03 -0.229 0.075 0.122 CD4_Naive L2
ENSG00000135541 AHI1 -592950 sc-eQTL 6.58e-01 0.0507 0.114 0.122 CD4_Naive L2
ENSG00000286313 AL360178.1 -976127 sc-eQTL 9.74e-01 0.00383 0.115 0.122 CD4_Naive L2
ENSG00000028839 TBPL1 952645 sc-eQTL 4.68e-01 0.0821 0.113 0.122 CD4_TCM L2
ENSG00000112339 HBS1L -198241 sc-eQTL 3.56e-01 -0.0845 0.0914 0.122 CD4_TCM L2
ENSG00000118513 MYB -276493 sc-eQTL 7.00e-01 -0.0345 0.0893 0.122 CD4_TCM L2
ENSG00000118515 SGK1 586703 sc-eQTL 9.29e-02 -0.136 0.0809 0.122 CD4_TCM L2
ENSG00000135541 AHI1 -592950 sc-eQTL 2.29e-01 -0.142 0.117 0.122 CD4_TCM L2
ENSG00000286313 AL360178.1 -976127 sc-eQTL 3.45e-01 -0.12 0.127 0.122 CD4_TCM L2
ENSG00000028839 TBPL1 952645 sc-eQTL 1.41e-01 0.192 0.13 0.122 CD4_TEM L2
ENSG00000112339 HBS1L -198241 sc-eQTL 9.43e-01 -0.00795 0.11 0.122 CD4_TEM L2
ENSG00000118513 MYB -276493 sc-eQTL 3.78e-01 -0.0855 0.0967 0.122 CD4_TEM L2
ENSG00000118515 SGK1 586703 sc-eQTL 1.07e-01 -0.142 0.0879 0.122 CD4_TEM L2
ENSG00000135541 AHI1 -592950 sc-eQTL 5.79e-01 0.0679 0.122 0.122 CD4_TEM L2
ENSG00000286313 AL360178.1 -976127 sc-eQTL 8.66e-02 0.208 0.121 0.122 CD4_TEM L2
ENSG00000028839 TBPL1 952645 sc-eQTL 9.96e-01 -0.00066 0.117 0.122 CD8_CTL L2
ENSG00000112339 HBS1L -198241 sc-eQTL 3.23e-01 -0.108 0.109 0.122 CD8_CTL L2
ENSG00000118513 MYB -276493 sc-eQTL 3.54e-01 -0.0895 0.0964 0.122 CD8_CTL L2
ENSG00000118515 SGK1 586703 sc-eQTL 4.84e-02 -0.221 0.111 0.122 CD8_CTL L2
ENSG00000135541 AHI1 -592950 sc-eQTL 8.00e-01 -0.0314 0.124 0.122 CD8_CTL L2
ENSG00000028839 TBPL1 952645 sc-eQTL 2.61e-01 0.138 0.123 0.122 CD8_Naive L2
ENSG00000112339 HBS1L -198241 sc-eQTL 2.68e-01 -0.108 0.0974 0.122 CD8_Naive L2
ENSG00000118513 MYB -276493 sc-eQTL 8.85e-01 -0.0132 0.0917 0.122 CD8_Naive L2
ENSG00000118515 SGK1 586703 sc-eQTL 5.09e-01 -0.0537 0.0813 0.122 CD8_Naive L2
ENSG00000135541 AHI1 -592950 sc-eQTL 7.92e-01 -0.0315 0.119 0.122 CD8_Naive L2
ENSG00000028839 TBPL1 952645 sc-eQTL 5.09e-01 0.0933 0.141 0.123 CD8_TCM L2
ENSG00000112339 HBS1L -198241 sc-eQTL 4.72e-01 -0.087 0.121 0.123 CD8_TCM L2
ENSG00000118513 MYB -276493 sc-eQTL 5.94e-01 -0.0606 0.114 0.123 CD8_TCM L2
ENSG00000118515 SGK1 586703 sc-eQTL 4.24e-01 -0.0835 0.104 0.123 CD8_TCM L2
ENSG00000135541 AHI1 -592950 sc-eQTL 1.27e-01 -0.204 0.133 0.123 CD8_TCM L2
ENSG00000028839 TBPL1 952645 sc-eQTL 7.37e-01 0.0419 0.125 0.123 CD8_TEM L2
ENSG00000112339 HBS1L -198241 sc-eQTL 4.20e-01 -0.104 0.128 0.123 CD8_TEM L2
ENSG00000118513 MYB -276493 sc-eQTL 8.52e-01 0.019 0.102 0.123 CD8_TEM L2
ENSG00000118515 SGK1 586703 sc-eQTL 4.85e-01 -0.0835 0.119 0.123 CD8_TEM L2
ENSG00000135541 AHI1 -592950 sc-eQTL 7.43e-01 -0.0441 0.135 0.123 CD8_TEM L2
ENSG00000028839 TBPL1 952645 sc-eQTL 4.27e-01 0.104 0.13 0.121 MAIT L2
ENSG00000112339 HBS1L -198241 sc-eQTL 5.87e-01 0.0642 0.118 0.121 MAIT L2
ENSG00000118515 SGK1 586703 sc-eQTL 2.37e-01 -0.103 0.0868 0.121 MAIT L2
ENSG00000135541 AHI1 -592950 sc-eQTL 4.16e-02 0.271 0.132 0.121 MAIT L2
ENSG00000028839 TBPL1 952645 sc-eQTL 5.48e-01 0.0846 0.14 0.124 NK_CD56bright L2
ENSG00000112339 HBS1L -198241 sc-eQTL 7.07e-01 -0.0461 0.123 0.124 NK_CD56bright L2
ENSG00000118515 SGK1 586703 sc-eQTL 5.79e-01 0.0612 0.11 0.124 NK_CD56bright L2
ENSG00000135541 AHI1 -592950 sc-eQTL 3.16e-01 -0.126 0.125 0.124 NK_CD56bright L2
ENSG00000028839 TBPL1 952645 sc-eQTL 5.71e-01 -0.0651 0.115 0.121 NK_CD56dim L2
ENSG00000112339 HBS1L -198241 sc-eQTL 2.39e-01 -0.124 0.105 0.121 NK_CD56dim L2
ENSG00000118515 SGK1 586703 sc-eQTL 7.10e-02 -0.208 0.115 0.121 NK_CD56dim L2
ENSG00000135541 AHI1 -592950 sc-eQTL 8.57e-01 0.0245 0.135 0.121 NK_CD56dim L2
ENSG00000028839 TBPL1 952645 sc-eQTL 3.39e-01 -0.137 0.142 0.119 NK_HLA L2
ENSG00000112339 HBS1L -198241 sc-eQTL 9.36e-01 -0.0105 0.132 0.119 NK_HLA L2
ENSG00000118515 SGK1 586703 sc-eQTL 5.75e-01 -0.068 0.121 0.119 NK_HLA L2
ENSG00000135541 AHI1 -592950 sc-eQTL 7.04e-01 0.0524 0.138 0.119 NK_HLA L2
ENSG00000028839 TBPL1 952645 sc-eQTL 4.30e-01 -0.0935 0.118 0.121 NK_cytokine L2
ENSG00000112339 HBS1L -198241 sc-eQTL 8.15e-01 -0.0269 0.115 0.121 NK_cytokine L2
ENSG00000118515 SGK1 586703 sc-eQTL 5.02e-01 -0.0782 0.116 0.121 NK_cytokine L2
ENSG00000135541 AHI1 -592950 sc-eQTL 9.76e-01 0.0038 0.127 0.121 NK_cytokine L2
ENSG00000028839 TBPL1 952645 sc-eQTL 6.91e-01 -0.0654 0.164 0.13 PB L2
ENSG00000112339 HBS1L -198241 sc-eQTL 5.64e-01 0.0753 0.13 0.13 PB L2
ENSG00000118515 SGK1 586703 sc-eQTL 9.30e-01 0.0115 0.131 0.13 PB L2
ENSG00000135541 AHI1 -592950 sc-eQTL 6.48e-02 -0.321 0.172 0.13 PB L2
ENSG00000171408 PDE7B -946886 sc-eQTL 4.47e-01 0.0895 0.117 0.13 PB L2
ENSG00000286313 AL360178.1 -976127 sc-eQTL 7.22e-01 -0.0424 0.119 0.13 PB L2
ENSG00000028839 TBPL1 952645 sc-eQTL 8.00e-01 0.0334 0.132 0.124 Pro_T L2
ENSG00000112339 HBS1L -198241 sc-eQTL 7.38e-01 0.035 0.104 0.124 Pro_T L2
ENSG00000118515 SGK1 586703 sc-eQTL 3.96e-01 0.0814 0.0956 0.124 Pro_T L2
ENSG00000135541 AHI1 -592950 sc-eQTL 7.86e-01 -0.0365 0.134 0.124 Pro_T L2
ENSG00000028839 TBPL1 952645 sc-eQTL 7.99e-01 -0.0343 0.134 0.122 Treg L2
ENSG00000112339 HBS1L -198241 sc-eQTL 2.32e-03 -0.351 0.114 0.122 Treg L2
ENSG00000118513 MYB -276493 sc-eQTL 1.36e-01 -0.15 0.1 0.122 Treg L2
ENSG00000118515 SGK1 586703 sc-eQTL 3.78e-02 -0.206 0.0983 0.122 Treg L2
ENSG00000135541 AHI1 -592950 sc-eQTL 6.03e-01 0.0653 0.125 0.122 Treg L2
ENSG00000286313 AL360178.1 -976127 sc-eQTL 6.56e-01 0.0526 0.118 0.122 Treg L2
ENSG00000028839 TBPL1 952645 sc-eQTL 1.40e-01 0.208 0.141 0.127 cDC L2
ENSG00000112339 HBS1L -198241 sc-eQTL 1.80e-01 -0.188 0.14 0.127 cDC L2
ENSG00000118513 MYB -276493 sc-eQTL 2.37e-01 -0.12 0.101 0.127 cDC L2
ENSG00000118515 SGK1 586703 sc-eQTL 4.98e-01 -0.0713 0.105 0.127 cDC L2
ENSG00000135541 AHI1 -592950 sc-eQTL 5.47e-01 0.0737 0.122 0.127 cDC L2
ENSG00000171408 PDE7B -946886 sc-eQTL 4.15e-01 0.0974 0.119 0.127 cDC L2
ENSG00000286313 AL360178.1 -976127 sc-eQTL 3.35e-01 0.104 0.108 0.127 cDC L2
ENSG00000286887 AL355881.1 608514 sc-eQTL 5.52e-01 -0.0724 0.121 0.127 cDC L2
ENSG00000028839 TBPL1 952645 sc-eQTL 3.73e-01 -0.0977 0.11 0.122 cMono_IL1B L2
ENSG00000112339 HBS1L -198241 sc-eQTL 1.03e-01 0.175 0.107 0.122 cMono_IL1B L2
ENSG00000118515 SGK1 586703 sc-eQTL 2.21e-02 0.179 0.0777 0.122 cMono_IL1B L2
ENSG00000135541 AHI1 -592950 sc-eQTL 6.67e-01 -0.0488 0.113 0.122 cMono_IL1B L2
ENSG00000171408 PDE7B -946886 sc-eQTL 4.05e-01 -0.092 0.11 0.122 cMono_IL1B L2
ENSG00000286887 AL355881.1 608514 sc-eQTL 4.19e-01 0.0857 0.106 0.122 cMono_IL1B L2
ENSG00000028839 TBPL1 952645 sc-eQTL 4.29e-01 -0.0991 0.125 0.122 cMono_S100A L2
ENSG00000112339 HBS1L -198241 sc-eQTL 7.68e-01 0.0347 0.118 0.122 cMono_S100A L2
ENSG00000118515 SGK1 586703 sc-eQTL 6.09e-02 0.124 0.0657 0.122 cMono_S100A L2
ENSG00000135541 AHI1 -592950 sc-eQTL 7.16e-01 -0.0452 0.124 0.122 cMono_S100A L2
ENSG00000171408 PDE7B -946886 sc-eQTL 9.71e-01 -0.00423 0.116 0.122 cMono_S100A L2
ENSG00000286887 AL355881.1 608514 sc-eQTL 3.62e-01 0.0955 0.105 0.122 cMono_S100A L2
ENSG00000028839 TBPL1 952645 sc-eQTL 2.06e-01 0.208 0.164 0.118 gdT L2
ENSG00000112339 HBS1L -198241 sc-eQTL 6.05e-01 -0.0751 0.145 0.118 gdT L2
ENSG00000118515 SGK1 586703 sc-eQTL 6.60e-01 0.0495 0.112 0.118 gdT L2
ENSG00000135541 AHI1 -592950 sc-eQTL 8.99e-02 0.245 0.144 0.118 gdT L2
ENSG00000028839 TBPL1 952645 sc-eQTL 3.53e-01 -0.117 0.126 0.124 intMono L2
ENSG00000112339 HBS1L -198241 sc-eQTL 2.49e-01 -0.153 0.132 0.124 intMono L2
ENSG00000118515 SGK1 586703 sc-eQTL 6.74e-01 0.0376 0.0894 0.124 intMono L2
ENSG00000135541 AHI1 -592950 sc-eQTL 1.05e-01 -0.206 0.127 0.124 intMono L2
ENSG00000171408 PDE7B -946886 sc-eQTL 8.57e-01 0.021 0.117 0.124 intMono L2
ENSG00000286887 AL355881.1 608514 sc-eQTL 6.08e-01 -0.0636 0.124 0.124 intMono L2
ENSG00000028839 TBPL1 952645 sc-eQTL 2.89e-01 0.143 0.134 0.124 ncMono L2
ENSG00000112339 HBS1L -198241 sc-eQTL 1.16e-01 -0.193 0.122 0.124 ncMono L2
ENSG00000118515 SGK1 586703 sc-eQTL 8.37e-01 0.0179 0.0869 0.124 ncMono L2
ENSG00000135541 AHI1 -592950 sc-eQTL 3.74e-01 -0.114 0.128 0.124 ncMono L2
ENSG00000171408 PDE7B -946886 sc-eQTL 2.53e-01 0.127 0.11 0.124 ncMono L2
ENSG00000286887 AL355881.1 608514 sc-eQTL 9.40e-01 -0.00863 0.115 0.124 ncMono L2
ENSG00000028839 TBPL1 952645 sc-eQTL 9.00e-01 0.0193 0.153 0.121 pDC L2
ENSG00000112339 HBS1L -198241 sc-eQTL 2.74e-01 -0.137 0.125 0.121 pDC L2
ENSG00000118513 MYB -276493 sc-eQTL 9.62e-01 0.00521 0.108 0.121 pDC L2
ENSG00000118515 SGK1 586703 sc-eQTL 8.80e-01 0.0132 0.0872 0.121 pDC L2
ENSG00000135541 AHI1 -592950 sc-eQTL 8.26e-01 -0.0221 0.101 0.121 pDC L2
ENSG00000171408 PDE7B -946886 sc-eQTL 3.40e-01 0.12 0.125 0.121 pDC L2
ENSG00000286313 AL360178.1 -976127 sc-eQTL 9.91e-01 0.00134 0.122 0.121 pDC L2
ENSG00000286887 AL355881.1 608514 sc-eQTL 4.20e-01 0.0871 0.108 0.121 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000028839 TBPL1 952645 sc-eQTL 3.61e-01 -0.121 0.132 0.122 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112339 HBS1L -198241 sc-eQTL 8.60e-01 0.0195 0.111 0.122 B_Memory LOneK1K
ENSG00000118515 SGK1 586703 sc-eQTL 7.04e-01 0.039 0.102 0.122 B_Memory LOneK1K
ENSG00000135541 AHI1 -592950 sc-eQTL 6.46e-01 0.0592 0.129 0.122 B_Memory LOneK1K
ENSG00000171408 PDE7B -946886 sc-eQTL 4.65e-01 0.0797 0.109 0.122 B_Memory LOneK1K
ENSG00000286313 AL360178.1 -976127 sc-eQTL 2.86e-01 -0.134 0.125 0.122 B_Memory LOneK1K
ENSG00000028839 TBPL1 952645 sc-eQTL 9.63e-01 0.00597 0.128 0.122 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112339 HBS1L -198241 sc-eQTL 8.64e-01 0.0181 0.105 0.122 B_Naive LOneK1K
ENSG00000118515 SGK1 586703 sc-eQTL 7.31e-01 0.0362 0.105 0.122 B_Naive LOneK1K
ENSG00000135541 AHI1 -592950 sc-eQTL 4.49e-01 -0.103 0.135 0.122 B_Naive LOneK1K
ENSG00000171408 PDE7B -946886 sc-eQTL 6.71e-01 0.0476 0.112 0.122 B_Naive LOneK1K
ENSG00000286313 AL360178.1 -976127 sc-eQTL 8.55e-01 0.0249 0.136 0.122 B_Naive LOneK1K
ENSG00000028839 TBPL1 952645 sc-eQTL 2.12e-01 -0.126 0.101 0.122 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112339 HBS1L -198241 sc-eQTL 1.52e-01 0.141 0.0981 0.122 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000118515 SGK1 586703 sc-eQTL 2.54e-02 0.164 0.0729 0.122 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000135541 AHI1 -592950 sc-eQTL 5.34e-01 -0.069 0.111 0.122 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000171408 PDE7B -946886 sc-eQTL 1.56e-01 -0.137 0.0963 0.122 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000286887 AL355881.1 608514 sc-eQTL 5.65e-01 0.0581 0.101 0.122 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000028839 TBPL1 952645 sc-eQTL 8.05e-01 -0.0315 0.128 0.123 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112339 HBS1L -198241 sc-eQTL 8.08e-03 -0.305 0.114 0.123 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000118515 SGK1 586703 sc-eQTL 8.65e-01 -0.0126 0.0744 0.123 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000135541 AHI1 -592950 sc-eQTL 5.25e-02 -0.229 0.118 0.123 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000171408 PDE7B -946886 sc-eQTL 1.28e-01 0.163 0.107 0.123 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000286887 AL355881.1 608514 sc-eQTL 7.92e-01 -0.0285 0.108 0.123 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000028839 TBPL1 952645 sc-eQTL 3.23e-01 -0.105 0.106 0.121 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112339 HBS1L -198241 sc-eQTL 2.78e-01 -0.103 0.0947 0.121 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000118515 SGK1 586703 sc-eQTL 9.21e-02 -0.179 0.106 0.121 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000135541 AHI1 -592950 sc-eQTL 7.75e-01 0.0364 0.127 0.121 NK_CD56dim LOneK1K


Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000112339 HBS1L -198241 eQTL 0.434 -0.0186 0.0238 0.00109 0.0 0.0957
ENSG00000118513 MYB -276493 eQTL 0.0611 -0.0757 0.0404 0.00114 0.0 0.0957
ENSG00000118514 ALDH8A1 -45300 eQTL 4.37e-06 -0.304 0.0658 0.0 0.0 0.0957


Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000118514 ALDH8A1 -45300 0.000117 0.000118 2e-05 1.69e-05 5.6e-06 2.03e-05 5.77e-05 7.57e-06 4.81e-05 1.64e-05 4.55e-05 2.01e-05 6.9e-05 2.34e-05 9.91e-06 5.57e-05 4.08e-05 3.25e-05 1.04e-05 1.13e-05 2.66e-05 6.97e-05 4.56e-05 1.27e-05 0.000112 1.38e-05 2.57e-05 2.25e-05 5.37e-05 1.77e-05 3.02e-05 2.68e-06 6.08e-06 9.11e-06 1.36e-05 6.68e-06 4.49e-06 3.52e-06 6e-06 3.56e-06 2.07e-06 7.09e-05 1.17e-05 5.78e-07 3.06e-06 3.75e-06 7.62e-06 1.42e-06 1.53e-06