logo

Genes within 1Mb (chr6:133724753:CT:C):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000028839 TBPL1 -227417 sc-eQTL 1.72e-01 0.174 0.127 0.137 B L1
ENSG00000112303 VNN2 961294 sc-eQTL 6.29e-02 0.178 0.095 0.137 B L1
ENSG00000112306 RPS12 910184 sc-eQTL 8.03e-01 0.0145 0.0579 0.137 B L1
ENSG00000118515 SGK1 -593359 sc-eQTL 1.53e-01 0.127 0.0889 0.137 B L1
ENSG00000146409 SLC18B1 911414 sc-eQTL 8.01e-01 -0.0308 0.122 0.137 B L1
ENSG00000028839 TBPL1 -227417 sc-eQTL 9.60e-01 -0.0048 0.0946 0.137 CD4T L1
ENSG00000112303 VNN2 961294 sc-eQTL 5.56e-01 -0.0502 0.0851 0.137 CD4T L1
ENSG00000112306 RPS12 910184 sc-eQTL 6.08e-01 -0.0298 0.0579 0.137 CD4T L1
ENSG00000118515 SGK1 -593359 sc-eQTL 1.89e-02 -0.182 0.0769 0.137 CD4T L1
ENSG00000146409 SLC18B1 911414 sc-eQTL 7.68e-01 -0.0346 0.117 0.137 CD4T L1
ENSG00000028839 TBPL1 -227417 sc-eQTL 5.27e-01 -0.0579 0.0913 0.137 CD8T L1
ENSG00000112303 VNN2 961294 sc-eQTL 5.37e-01 0.0688 0.111 0.137 CD8T L1
ENSG00000112306 RPS12 910184 sc-eQTL 9.87e-01 0.000633 0.0381 0.137 CD8T L1
ENSG00000118515 SGK1 -593359 sc-eQTL 2.65e-01 -0.0653 0.0585 0.137 CD8T L1
ENSG00000146409 SLC18B1 911414 sc-eQTL 3.73e-01 0.103 0.115 0.137 CD8T L1
ENSG00000028839 TBPL1 -227417 sc-eQTL 5.78e-01 -0.0796 0.143 0.137 DC L1
ENSG00000093134 VNN3 989988 sc-eQTL 5.19e-01 0.071 0.11 0.137 DC L1
ENSG00000112303 VNN2 961294 sc-eQTL 8.36e-01 0.0263 0.127 0.137 DC L1
ENSG00000112306 RPS12 910184 sc-eQTL 2.13e-02 0.163 0.0704 0.137 DC L1
ENSG00000118515 SGK1 -593359 sc-eQTL 4.44e-01 0.0634 0.0826 0.137 DC L1
ENSG00000146409 SLC18B1 911414 sc-eQTL 4.75e-01 0.0806 0.113 0.137 DC L1
ENSG00000286438 AL591115.1 621625 sc-eQTL 9.92e-01 -0.00108 0.103 0.137 DC L1
ENSG00000286887 AL355881.1 -571548 sc-eQTL 1.76e-01 0.173 0.127 0.137 DC L1
ENSG00000028839 TBPL1 -227417 sc-eQTL 2.54e-01 0.112 0.098 0.137 Mono L1
ENSG00000093134 VNN3 989988 sc-eQTL 7.68e-01 -0.0334 0.113 0.137 Mono L1
ENSG00000112303 VNN2 961294 sc-eQTL 3.16e-01 0.086 0.0855 0.137 Mono L1
ENSG00000112306 RPS12 910184 sc-eQTL 5.46e-01 0.0311 0.0513 0.137 Mono L1
ENSG00000118515 SGK1 -593359 sc-eQTL 5.09e-01 0.048 0.0725 0.137 Mono L1
ENSG00000146409 SLC18B1 911414 sc-eQTL 3.16e-02 -0.218 0.101 0.137 Mono L1
ENSG00000286887 AL355881.1 -571548 sc-eQTL 9.73e-01 0.00337 0.0999 0.137 Mono L1
ENSG00000028839 TBPL1 -227417 sc-eQTL 1.80e-01 -0.144 0.107 0.137 NK L1
ENSG00000112303 VNN2 961294 sc-eQTL 2.65e-02 -0.274 0.123 0.137 NK L1
ENSG00000112306 RPS12 910184 sc-eQTL 3.18e-01 -0.0513 0.0512 0.137 NK L1
ENSG00000118515 SGK1 -593359 sc-eQTL 7.45e-01 0.0308 0.0949 0.137 NK L1
ENSG00000028839 TBPL1 -227417 sc-eQTL 6.86e-01 0.0519 0.128 0.137 Other_T L1
ENSG00000112303 VNN2 961294 sc-eQTL 2.59e-01 0.138 0.122 0.137 Other_T L1
ENSG00000112306 RPS12 910184 sc-eQTL 5.19e-01 0.0312 0.0484 0.137 Other_T L1
ENSG00000118515 SGK1 -593359 sc-eQTL 8.43e-01 -0.0177 0.0891 0.137 Other_T L1
ENSG00000146409 SLC18B1 911414 sc-eQTL 5.16e-01 0.0862 0.132 0.137 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000028839 TBPL1 -227417 sc-eQTL 5.24e-01 0.104 0.163 0.125 B_Activated L2
ENSG00000112303 VNN2 961294 sc-eQTL 6.05e-01 0.0768 0.148 0.125 B_Activated L2
ENSG00000112306 RPS12 910184 sc-eQTL 6.26e-01 0.0388 0.0795 0.125 B_Activated L2
ENSG00000118515 SGK1 -593359 sc-eQTL 9.36e-01 -0.0114 0.142 0.125 B_Activated L2
ENSG00000146409 SLC18B1 911414 sc-eQTL 3.71e-01 0.125 0.139 0.125 B_Activated L2
ENSG00000028839 TBPL1 -227417 sc-eQTL 7.30e-01 -0.0499 0.144 0.137 B_Intermediate L2
ENSG00000112303 VNN2 961294 sc-eQTL 5.01e-01 0.0841 0.125 0.137 B_Intermediate L2
ENSG00000112306 RPS12 910184 sc-eQTL 4.69e-01 -0.0554 0.0764 0.137 B_Intermediate L2
ENSG00000118515 SGK1 -593359 sc-eQTL 4.30e-02 0.267 0.131 0.137 B_Intermediate L2
ENSG00000146409 SLC18B1 911414 sc-eQTL 6.03e-01 0.0717 0.138 0.137 B_Intermediate L2
ENSG00000028839 TBPL1 -227417 sc-eQTL 8.92e-01 -0.0187 0.137 0.138 B_Memory L2
ENSG00000112303 VNN2 961294 sc-eQTL 5.91e-03 0.355 0.128 0.138 B_Memory L2
ENSG00000112306 RPS12 910184 sc-eQTL 7.49e-01 -0.0201 0.0627 0.138 B_Memory L2
ENSG00000118515 SGK1 -593359 sc-eQTL 1.56e-03 0.36 0.112 0.138 B_Memory L2
ENSG00000146409 SLC18B1 911414 sc-eQTL 4.10e-01 -0.108 0.131 0.138 B_Memory L2
ENSG00000028839 TBPL1 -227417 sc-eQTL 3.65e-01 0.115 0.126 0.137 B_Naive1 L2
ENSG00000112303 VNN2 961294 sc-eQTL 3.46e-01 0.111 0.118 0.137 B_Naive1 L2
ENSG00000112306 RPS12 910184 sc-eQTL 4.11e-01 -0.0553 0.0672 0.137 B_Naive1 L2
ENSG00000118515 SGK1 -593359 sc-eQTL 8.94e-01 -0.0141 0.105 0.137 B_Naive1 L2
ENSG00000146409 SLC18B1 911414 sc-eQTL 3.97e-01 -0.11 0.13 0.137 B_Naive1 L2
ENSG00000028839 TBPL1 -227417 sc-eQTL 9.98e-02 0.223 0.135 0.137 B_Naive2 L2
ENSG00000112303 VNN2 961294 sc-eQTL 9.59e-01 -0.00676 0.133 0.137 B_Naive2 L2
ENSG00000112306 RPS12 910184 sc-eQTL 2.00e-01 -0.0899 0.07 0.137 B_Naive2 L2
ENSG00000118515 SGK1 -593359 sc-eQTL 8.53e-01 0.023 0.124 0.137 B_Naive2 L2
ENSG00000146409 SLC18B1 911414 sc-eQTL 8.44e-01 -0.0264 0.134 0.137 B_Naive2 L2
ENSG00000028839 TBPL1 -227417 sc-eQTL 8.03e-01 -0.0338 0.135 0.132 CD4_CTL L2
ENSG00000112303 VNN2 961294 sc-eQTL 8.87e-01 -0.0192 0.135 0.132 CD4_CTL L2
ENSG00000112306 RPS12 910184 sc-eQTL 2.25e-01 -0.0758 0.0623 0.132 CD4_CTL L2
ENSG00000118515 SGK1 -593359 sc-eQTL 6.86e-01 -0.0439 0.108 0.132 CD4_CTL L2
ENSG00000146409 SLC18B1 911414 sc-eQTL 1.19e-01 0.196 0.125 0.132 CD4_CTL L2
ENSG00000028839 TBPL1 -227417 sc-eQTL 6.27e-01 0.0524 0.108 0.137 CD4_Naive L2
ENSG00000112303 VNN2 961294 sc-eQTL 5.90e-01 -0.0528 0.0977 0.137 CD4_Naive L2
ENSG00000112306 RPS12 910184 sc-eQTL 8.84e-01 0.00925 0.0634 0.137 CD4_Naive L2
ENSG00000118515 SGK1 -593359 sc-eQTL 1.07e-01 -0.125 0.0772 0.137 CD4_Naive L2
ENSG00000146409 SLC18B1 911414 sc-eQTL 8.70e-01 0.02 0.122 0.137 CD4_Naive L2
ENSG00000028839 TBPL1 -227417 sc-eQTL 7.89e-01 -0.0306 0.114 0.137 CD4_TCM L2
ENSG00000112303 VNN2 961294 sc-eQTL 9.69e-01 0.00437 0.113 0.137 CD4_TCM L2
ENSG00000112306 RPS12 910184 sc-eQTL 7.18e-01 -0.0213 0.0587 0.137 CD4_TCM L2
ENSG00000118515 SGK1 -593359 sc-eQTL 3.75e-01 -0.073 0.082 0.137 CD4_TCM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 911414 sc-eQTL 2.33e-01 -0.162 0.136 0.137 CD4_TCM L2
ENSG00000028839 TBPL1 -227417 sc-eQTL 1.46e-02 -0.324 0.131 0.137 CD4_TEM L2
ENSG00000112303 VNN2 961294 sc-eQTL 8.13e-01 0.0303 0.128 0.137 CD4_TEM L2
ENSG00000112306 RPS12 910184 sc-eQTL 9.82e-01 0.00119 0.0525 0.137 CD4_TEM L2
ENSG00000118515 SGK1 -593359 sc-eQTL 9.45e-01 0.00619 0.0903 0.137 CD4_TEM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 911414 sc-eQTL 4.41e-01 0.101 0.13 0.137 CD4_TEM L2
ENSG00000028839 TBPL1 -227417 sc-eQTL 6.87e-01 -0.0479 0.119 0.137 CD8_CTL L2
ENSG00000112303 VNN2 961294 sc-eQTL 4.53e-02 0.251 0.125 0.137 CD8_CTL L2
ENSG00000112306 RPS12 910184 sc-eQTL 5.53e-01 -0.0401 0.0674 0.137 CD8_CTL L2
ENSG00000118515 SGK1 -593359 sc-eQTL 6.64e-01 0.0495 0.114 0.137 CD8_CTL L2
ENSG00000146409 SLC18B1 911414 sc-eQTL 9.58e-01 -0.00687 0.131 0.137 CD8_CTL L2
ENSG00000028839 TBPL1 -227417 sc-eQTL 7.99e-01 0.0316 0.124 0.137 CD8_Naive L2
ENSG00000112303 VNN2 961294 sc-eQTL 3.93e-01 -0.0974 0.114 0.137 CD8_Naive L2
ENSG00000112306 RPS12 910184 sc-eQTL 1.52e-01 0.0933 0.065 0.137 CD8_Naive L2
ENSG00000118515 SGK1 -593359 sc-eQTL 1.69e-01 -0.113 0.0816 0.137 CD8_Naive L2
ENSG00000146409 SLC18B1 911414 sc-eQTL 5.36e-01 -0.0811 0.131 0.137 CD8_Naive L2
ENSG00000028839 TBPL1 -227417 sc-eQTL 3.34e-01 -0.139 0.144 0.134 CD8_TCM L2
ENSG00000112303 VNN2 961294 sc-eQTL 5.54e-01 -0.0782 0.132 0.134 CD8_TCM L2
ENSG00000112306 RPS12 910184 sc-eQTL 7.92e-01 -0.017 0.0644 0.134 CD8_TCM L2
ENSG00000118515 SGK1 -593359 sc-eQTL 1.79e-02 -0.251 0.105 0.134 CD8_TCM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 911414 sc-eQTL 9.12e-01 -0.0156 0.141 0.134 CD8_TCM L2
ENSG00000028839 TBPL1 -227417 sc-eQTL 5.41e-01 -0.0809 0.132 0.139 CD8_TEM L2
ENSG00000112303 VNN2 961294 sc-eQTL 3.67e-01 0.129 0.143 0.139 CD8_TEM L2
ENSG00000112306 RPS12 910184 sc-eQTL 9.52e-01 -0.00463 0.0772 0.139 CD8_TEM L2
ENSG00000118515 SGK1 -593359 sc-eQTL 5.72e-01 0.0716 0.126 0.139 CD8_TEM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 911414 sc-eQTL 3.09e-02 0.314 0.144 0.139 CD8_TEM L2
ENSG00000028839 TBPL1 -227417 sc-eQTL 4.94e-01 0.0913 0.133 0.134 MAIT L2
ENSG00000112303 VNN2 961294 sc-eQTL 3.80e-01 0.113 0.129 0.134 MAIT L2
ENSG00000112306 RPS12 910184 sc-eQTL 6.02e-01 -0.0331 0.0634 0.134 MAIT L2
ENSG00000118515 SGK1 -593359 sc-eQTL 1.87e-01 0.118 0.0889 0.134 MAIT L2
ENSG00000146409 SLC18B1 911414 sc-eQTL 7.50e-01 0.0424 0.133 0.134 MAIT L2
ENSG00000028839 TBPL1 -227417 sc-eQTL 2.08e-01 -0.18 0.143 0.133 NK_CD56bright L2
ENSG00000112303 VNN2 961294 sc-eQTL 3.85e-01 -0.117 0.135 0.133 NK_CD56bright L2
ENSG00000112306 RPS12 910184 sc-eQTL 9.90e-01 0.000917 0.0751 0.133 NK_CD56bright L2
ENSG00000118515 SGK1 -593359 sc-eQTL 3.36e-01 0.108 0.112 0.133 NK_CD56bright L2
ENSG00000028839 TBPL1 -227417 sc-eQTL 9.79e-01 -0.00303 0.116 0.138 NK_CD56dim L2
ENSG00000112303 VNN2 961294 sc-eQTL 1.29e-01 -0.201 0.132 0.138 NK_CD56dim L2
ENSG00000112306 RPS12 910184 sc-eQTL 3.84e-01 -0.0458 0.0525 0.138 NK_CD56dim L2
ENSG00000118515 SGK1 -593359 sc-eQTL 2.72e-01 0.128 0.116 0.138 NK_CD56dim L2
ENSG00000028839 TBPL1 -227417 sc-eQTL 7.90e-01 0.0389 0.146 0.139 NK_HLA L2
ENSG00000112303 VNN2 961294 sc-eQTL 2.56e-01 -0.152 0.134 0.139 NK_HLA L2
ENSG00000112306 RPS12 910184 sc-eQTL 8.51e-01 -0.0117 0.0625 0.139 NK_HLA L2
ENSG00000118515 SGK1 -593359 sc-eQTL 9.60e-01 -0.00616 0.124 0.139 NK_HLA L2
ENSG00000028839 TBPL1 -227417 sc-eQTL 3.77e-02 -0.251 0.12 0.138 NK_cytokine L2
ENSG00000112303 VNN2 961294 sc-eQTL 2.51e-01 -0.152 0.132 0.138 NK_cytokine L2
ENSG00000112306 RPS12 910184 sc-eQTL 8.38e-01 -0.0146 0.0716 0.138 NK_cytokine L2
ENSG00000118515 SGK1 -593359 sc-eQTL 8.45e-01 0.0233 0.119 0.138 NK_cytokine L2
ENSG00000028839 TBPL1 -227417 sc-eQTL 4.12e-01 0.137 0.167 0.152 PB L2
ENSG00000112303 VNN2 961294 sc-eQTL 9.97e-02 -0.239 0.144 0.152 PB L2
ENSG00000112306 RPS12 910184 sc-eQTL 8.50e-01 0.0157 0.0825 0.152 PB L2
ENSG00000118515 SGK1 -593359 sc-eQTL 3.09e-01 0.136 0.133 0.152 PB L2
ENSG00000146409 SLC18B1 911414 sc-eQTL 9.33e-01 0.013 0.155 0.152 PB L2
ENSG00000028839 TBPL1 -227417 sc-eQTL 4.76e-01 0.0972 0.136 0.137 Pro_T L2
ENSG00000112303 VNN2 961294 sc-eQTL 1.32e-01 -0.197 0.13 0.137 Pro_T L2
ENSG00000112306 RPS12 910184 sc-eQTL 6.23e-01 0.0243 0.0494 0.137 Pro_T L2
ENSG00000118515 SGK1 -593359 sc-eQTL 9.38e-01 0.00769 0.0991 0.137 Pro_T L2
ENSG00000146409 SLC18B1 911414 sc-eQTL 6.80e-01 0.0529 0.128 0.137 Pro_T L2
ENSG00000028839 TBPL1 -227417 sc-eQTL 4.37e-01 0.105 0.135 0.137 Treg L2
ENSG00000112303 VNN2 961294 sc-eQTL 9.33e-02 -0.18 0.107 0.137 Treg L2
ENSG00000112306 RPS12 910184 sc-eQTL 7.35e-01 0.0161 0.0476 0.137 Treg L2
ENSG00000118515 SGK1 -593359 sc-eQTL 7.33e-01 -0.0342 0.1 0.137 Treg L2
ENSG00000146409 SLC18B1 911414 sc-eQTL 6.72e-01 -0.0569 0.134 0.137 Treg L2
ENSG00000028839 TBPL1 -227417 sc-eQTL 6.83e-01 0.0603 0.147 0.127 cDC L2
ENSG00000093134 VNN3 989988 sc-eQTL 9.44e-01 0.00811 0.115 0.127 cDC L2
ENSG00000112303 VNN2 961294 sc-eQTL 5.75e-01 -0.0738 0.131 0.127 cDC L2
ENSG00000112306 RPS12 910184 sc-eQTL 3.41e-01 0.0619 0.0648 0.127 cDC L2
ENSG00000118515 SGK1 -593359 sc-eQTL 1.34e-01 0.164 0.109 0.127 cDC L2
ENSG00000146409 SLC18B1 911414 sc-eQTL 1.98e-01 0.166 0.128 0.127 cDC L2
ENSG00000286438 AL591115.1 621625 sc-eQTL 4.71e-01 0.0741 0.103 0.127 cDC L2
ENSG00000286887 AL355881.1 -571548 sc-eQTL 2.75e-01 0.138 0.126 0.127 cDC L2
ENSG00000028839 TBPL1 -227417 sc-eQTL 1.30e-01 0.168 0.11 0.137 cMono_IL1B L2
ENSG00000093134 VNN3 989988 sc-eQTL 8.96e-01 -0.0156 0.119 0.137 cMono_IL1B L2
ENSG00000112303 VNN2 961294 sc-eQTL 1.68e-01 0.132 0.0956 0.137 cMono_IL1B L2
ENSG00000112306 RPS12 910184 sc-eQTL 2.56e-01 0.0606 0.0532 0.137 cMono_IL1B L2
ENSG00000118515 SGK1 -593359 sc-eQTL 4.15e-01 0.0648 0.0794 0.137 cMono_IL1B L2
ENSG00000146409 SLC18B1 911414 sc-eQTL 2.59e-01 -0.116 0.103 0.137 cMono_IL1B L2
ENSG00000286887 AL355881.1 -571548 sc-eQTL 8.19e-01 -0.0246 0.107 0.137 cMono_IL1B L2
ENSG00000028839 TBPL1 -227417 sc-eQTL 5.66e-01 0.0726 0.126 0.137 cMono_S100A L2
ENSG00000093134 VNN3 989988 sc-eQTL 6.22e-01 -0.0563 0.114 0.137 cMono_S100A L2
ENSG00000112303 VNN2 961294 sc-eQTL 9.45e-01 0.00563 0.081 0.137 cMono_S100A L2
ENSG00000112306 RPS12 910184 sc-eQTL 5.07e-01 0.0387 0.0583 0.137 cMono_S100A L2
ENSG00000118515 SGK1 -593359 sc-eQTL 2.84e-01 0.0714 0.0665 0.137 cMono_S100A L2
ENSG00000146409 SLC18B1 911414 sc-eQTL 3.06e-02 -0.232 0.107 0.137 cMono_S100A L2
ENSG00000286887 AL355881.1 -571548 sc-eQTL 1.13e-01 0.167 0.105 0.137 cMono_S100A L2
ENSG00000028839 TBPL1 -227417 sc-eQTL 3.33e-01 -0.176 0.181 0.121 gdT L2
ENSG00000112303 VNN2 961294 sc-eQTL 7.81e-03 0.456 0.169 0.121 gdT L2
ENSG00000112306 RPS12 910184 sc-eQTL 3.87e-01 -0.0571 0.0658 0.121 gdT L2
ENSG00000118515 SGK1 -593359 sc-eQTL 2.17e-01 -0.154 0.124 0.121 gdT L2
ENSG00000146409 SLC18B1 911414 sc-eQTL 9.06e-01 0.0202 0.17 0.121 gdT L2
ENSG00000028839 TBPL1 -227417 sc-eQTL 6.29e-01 0.0622 0.129 0.14 intMono L2
ENSG00000093134 VNN3 989988 sc-eQTL 8.30e-01 -0.0267 0.124 0.14 intMono L2
ENSG00000112303 VNN2 961294 sc-eQTL 8.58e-01 -0.0224 0.125 0.14 intMono L2
ENSG00000112306 RPS12 910184 sc-eQTL 3.82e-01 0.0475 0.0542 0.14 intMono L2
ENSG00000118515 SGK1 -593359 sc-eQTL 6.19e-01 -0.0454 0.0911 0.14 intMono L2
ENSG00000146409 SLC18B1 911414 sc-eQTL 7.74e-01 0.038 0.132 0.14 intMono L2
ENSG00000286887 AL355881.1 -571548 sc-eQTL 1.49e-01 -0.182 0.126 0.14 intMono L2
ENSG00000028839 TBPL1 -227417 sc-eQTL 6.37e-01 0.0643 0.136 0.136 ncMono L2
ENSG00000093134 VNN3 989988 sc-eQTL 3.45e-01 0.123 0.129 0.136 ncMono L2
ENSG00000112303 VNN2 961294 sc-eQTL 4.96e-01 -0.0844 0.124 0.136 ncMono L2
ENSG00000112306 RPS12 910184 sc-eQTL 1.17e-01 0.0971 0.0617 0.136 ncMono L2
ENSG00000118515 SGK1 -593359 sc-eQTL 9.34e-02 0.147 0.0872 0.136 ncMono L2
ENSG00000146409 SLC18B1 911414 sc-eQTL 4.25e-01 -0.0876 0.109 0.136 ncMono L2
ENSG00000286887 AL355881.1 -571548 sc-eQTL 8.52e-01 0.0216 0.116 0.136 ncMono L2
ENSG00000028839 TBPL1 -227417 sc-eQTL 7.90e-01 -0.0421 0.158 0.141 pDC L2
ENSG00000093134 VNN3 989988 sc-eQTL 8.61e-01 0.0186 0.106 0.141 pDC L2
ENSG00000112303 VNN2 961294 sc-eQTL 7.59e-01 0.0393 0.128 0.141 pDC L2
ENSG00000112306 RPS12 910184 sc-eQTL 3.35e-03 0.256 0.0859 0.141 pDC L2
ENSG00000118515 SGK1 -593359 sc-eQTL 9.16e-01 0.00944 0.0897 0.141 pDC L2
ENSG00000146409 SLC18B1 911414 sc-eQTL 3.96e-01 -0.111 0.13 0.141 pDC L2
ENSG00000286438 AL591115.1 621625 sc-eQTL 7.75e-01 0.0358 0.125 0.141 pDC L2
ENSG00000286887 AL355881.1 -571548 sc-eQTL 9.53e-01 -0.00652 0.111 0.141 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000028839 TBPL1 -227417 sc-eQTL 8.56e-01 -0.0249 0.137 0.137 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 961294 sc-eQTL 8.77e-03 0.31 0.117 0.137 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 910184 sc-eQTL 6.72e-01 -0.0287 0.0679 0.137 B_Memory LOneK1K
ENSG00000118515 SGK1 -593359 sc-eQTL 8.95e-04 0.348 0.103 0.137 B_Memory LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 911414 sc-eQTL 8.33e-01 0.0263 0.125 0.137 B_Memory LOneK1K
ENSG00000028839 TBPL1 -227417 sc-eQTL 6.61e-02 0.233 0.126 0.137 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 961294 sc-eQTL 5.23e-01 0.0709 0.111 0.137 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 910184 sc-eQTL 3.41e-01 -0.064 0.0671 0.137 B_Naive LOneK1K
ENSG00000118515 SGK1 -593359 sc-eQTL 9.51e-01 -0.00636 0.104 0.137 B_Naive LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 911414 sc-eQTL 7.18e-01 -0.0459 0.127 0.137 B_Naive LOneK1K
ENSG00000028839 TBPL1 -227417 sc-eQTL 1.96e-01 0.131 0.101 0.137 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000093134 VNN3 989988 sc-eQTL 8.24e-01 -0.0256 0.115 0.137 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 961294 sc-eQTL 4.83e-01 0.0556 0.0791 0.137 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 910184 sc-eQTL 2.39e-01 0.0639 0.0541 0.137 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000118515 SGK1 -593359 sc-eQTL 2.62e-01 0.0831 0.0738 0.137 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 911414 sc-eQTL 4.97e-02 -0.189 0.0958 0.137 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000286887 AL355881.1 -571548 sc-eQTL 5.44e-01 0.0616 0.101 0.137 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000028839 TBPL1 -227417 sc-eQTL 7.89e-01 0.0349 0.13 0.138 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000093134 VNN3 989988 sc-eQTL 4.74e-01 0.0906 0.126 0.138 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 961294 sc-eQTL 8.72e-01 -0.0191 0.118 0.138 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 910184 sc-eQTL 3.72e-01 0.0448 0.0501 0.138 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000118515 SGK1 -593359 sc-eQTL 3.96e-01 0.0645 0.0758 0.138 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 911414 sc-eQTL 9.69e-01 0.0048 0.122 0.138 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000286887 AL355881.1 -571548 sc-eQTL 3.10e-01 -0.112 0.11 0.138 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000028839 TBPL1 -227417 sc-eQTL 1.80e-01 -0.143 0.106 0.138 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 961294 sc-eQTL 3.94e-02 -0.26 0.125 0.138 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 910184 sc-eQTL 2.46e-01 -0.0599 0.0515 0.138 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000118515 SGK1 -593359 sc-eQTL 3.69e-01 0.0959 0.107 0.138 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000146409 SLC18B1 911414 eQTL 0.0194 0.0739 0.0316 0.0 0.0 0.134

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina