logo

Genes within 1Mb (chr6:133724115:C:T):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000028839 TBPL1 -228055 sc-eQTL 5.56e-01 0.0821 0.139 0.12 B L1
ENSG00000112303 VNN2 960656 sc-eQTL 9.99e-02 0.171 0.104 0.12 B L1
ENSG00000112306 RPS12 909546 sc-eQTL 8.96e-01 -0.00824 0.063 0.12 B L1
ENSG00000118515 SGK1 -593997 sc-eQTL 1.94e-01 0.126 0.0968 0.12 B L1
ENSG00000146409 SLC18B1 910776 sc-eQTL 8.73e-01 -0.0213 0.133 0.12 B L1
ENSG00000028839 TBPL1 -228055 sc-eQTL 7.81e-01 0.0283 0.102 0.12 CD4T L1
ENSG00000112303 VNN2 960656 sc-eQTL 4.04e-01 -0.0764 0.0914 0.12 CD4T L1
ENSG00000112306 RPS12 909546 sc-eQTL 5.60e-01 -0.0363 0.0622 0.12 CD4T L1
ENSG00000118515 SGK1 -593997 sc-eQTL 4.53e-02 -0.167 0.0829 0.12 CD4T L1
ENSG00000146409 SLC18B1 910776 sc-eQTL 7.03e-01 -0.0481 0.126 0.12 CD4T L1
ENSG00000028839 TBPL1 -228055 sc-eQTL 4.36e-01 -0.0768 0.0983 0.12 CD8T L1
ENSG00000112303 VNN2 960656 sc-eQTL 1.41e-01 0.176 0.119 0.12 CD8T L1
ENSG00000112306 RPS12 909546 sc-eQTL 8.10e-01 -0.00987 0.041 0.12 CD8T L1
ENSG00000118515 SGK1 -593997 sc-eQTL 2.49e-01 -0.0728 0.063 0.12 CD8T L1
ENSG00000146409 SLC18B1 910776 sc-eQTL 3.61e-01 0.113 0.124 0.12 CD8T L1
ENSG00000028839 TBPL1 -228055 sc-eQTL 3.88e-01 -0.134 0.154 0.119 DC L1
ENSG00000093134 VNN3 989350 sc-eQTL 7.79e-01 0.0335 0.119 0.119 DC L1
ENSG00000112303 VNN2 960656 sc-eQTL 9.97e-01 -0.000502 0.138 0.119 DC L1
ENSG00000112306 RPS12 909546 sc-eQTL 3.04e-02 0.166 0.0763 0.119 DC L1
ENSG00000118515 SGK1 -593997 sc-eQTL 4.18e-01 0.0726 0.0894 0.119 DC L1
ENSG00000146409 SLC18B1 910776 sc-eQTL 5.38e-01 0.0753 0.122 0.119 DC L1
ENSG00000286438 AL591115.1 620987 sc-eQTL 8.64e-01 0.0191 0.111 0.119 DC L1
ENSG00000286887 AL355881.1 -572186 sc-eQTL 1.89e-01 0.182 0.138 0.119 DC L1
ENSG00000028839 TBPL1 -228055 sc-eQTL 1.20e-01 0.165 0.106 0.12 Mono L1
ENSG00000093134 VNN3 989350 sc-eQTL 9.06e-01 0.0144 0.122 0.12 Mono L1
ENSG00000112303 VNN2 960656 sc-eQTL 2.98e-01 0.0968 0.0927 0.12 Mono L1
ENSG00000112306 RPS12 909546 sc-eQTL 5.92e-01 0.0299 0.0557 0.12 Mono L1
ENSG00000118515 SGK1 -593997 sc-eQTL 3.37e-01 0.0755 0.0785 0.12 Mono L1
ENSG00000146409 SLC18B1 910776 sc-eQTL 6.90e-02 -0.2 0.109 0.12 Mono L1
ENSG00000286887 AL355881.1 -572186 sc-eQTL 5.94e-01 0.0578 0.108 0.12 Mono L1
ENSG00000028839 TBPL1 -228055 sc-eQTL 3.69e-01 -0.105 0.116 0.12 NK L1
ENSG00000112303 VNN2 960656 sc-eQTL 3.20e-02 -0.286 0.132 0.12 NK L1
ENSG00000112306 RPS12 909546 sc-eQTL 2.92e-01 -0.0584 0.0553 0.12 NK L1
ENSG00000118515 SGK1 -593997 sc-eQTL 7.30e-01 0.0354 0.102 0.12 NK L1
ENSG00000028839 TBPL1 -228055 sc-eQTL 8.60e-01 0.0242 0.137 0.12 Other_T L1
ENSG00000112303 VNN2 960656 sc-eQTL 1.75e-01 0.177 0.13 0.12 Other_T L1
ENSG00000112306 RPS12 909546 sc-eQTL 6.74e-01 0.0218 0.0518 0.12 Other_T L1
ENSG00000118515 SGK1 -593997 sc-eQTL 8.49e-01 -0.0182 0.0954 0.12 Other_T L1
ENSG00000146409 SLC18B1 910776 sc-eQTL 2.89e-01 0.151 0.142 0.12 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000028839 TBPL1 -228055 sc-eQTL 8.64e-01 0.0302 0.176 0.105 B_Activated L2
ENSG00000112303 VNN2 960656 sc-eQTL 5.44e-01 0.0974 0.16 0.105 B_Activated L2
ENSG00000112306 RPS12 909546 sc-eQTL 7.50e-01 0.0273 0.0858 0.105 B_Activated L2
ENSG00000118515 SGK1 -593997 sc-eQTL 8.31e-01 -0.0328 0.153 0.105 B_Activated L2
ENSG00000146409 SLC18B1 910776 sc-eQTL 7.09e-01 0.0563 0.15 0.105 B_Activated L2
ENSG00000028839 TBPL1 -228055 sc-eQTL 4.66e-01 -0.113 0.155 0.12 B_Intermediate L2
ENSG00000112303 VNN2 960656 sc-eQTL 5.18e-01 0.0871 0.134 0.12 B_Intermediate L2
ENSG00000112306 RPS12 909546 sc-eQTL 8.45e-02 -0.142 0.0818 0.12 B_Intermediate L2
ENSG00000118515 SGK1 -593997 sc-eQTL 2.56e-02 0.316 0.141 0.12 B_Intermediate L2
ENSG00000146409 SLC18B1 910776 sc-eQTL 2.98e-01 0.154 0.148 0.12 B_Intermediate L2
ENSG00000028839 TBPL1 -228055 sc-eQTL 9.55e-01 -0.0083 0.148 0.121 B_Memory L2
ENSG00000112303 VNN2 960656 sc-eQTL 3.49e-03 0.405 0.137 0.121 B_Memory L2
ENSG00000112306 RPS12 909546 sc-eQTL 5.15e-01 -0.044 0.0674 0.121 B_Memory L2
ENSG00000118515 SGK1 -593997 sc-eQTL 4.67e-03 0.347 0.121 0.121 B_Memory L2
ENSG00000146409 SLC18B1 910776 sc-eQTL 2.19e-01 -0.173 0.14 0.121 B_Memory L2
ENSG00000028839 TBPL1 -228055 sc-eQTL 9.42e-01 0.00982 0.136 0.12 B_Naive1 L2
ENSG00000112303 VNN2 960656 sc-eQTL 2.55e-01 0.144 0.127 0.12 B_Naive1 L2
ENSG00000112306 RPS12 909546 sc-eQTL 2.22e-01 -0.0882 0.072 0.12 B_Naive1 L2
ENSG00000118515 SGK1 -593997 sc-eQTL 7.40e-01 -0.0375 0.113 0.12 B_Naive1 L2
ENSG00000146409 SLC18B1 910776 sc-eQTL 5.36e-01 -0.0865 0.139 0.12 B_Naive1 L2
ENSG00000028839 TBPL1 -228055 sc-eQTL 2.37e-01 0.173 0.146 0.12 B_Naive2 L2
ENSG00000112303 VNN2 960656 sc-eQTL 8.26e-01 -0.0314 0.143 0.12 B_Naive2 L2
ENSG00000112306 RPS12 909546 sc-eQTL 5.45e-02 -0.145 0.0749 0.12 B_Naive2 L2
ENSG00000118515 SGK1 -593997 sc-eQTL 7.24e-01 0.0473 0.134 0.12 B_Naive2 L2
ENSG00000146409 SLC18B1 910776 sc-eQTL 8.06e-01 -0.0354 0.144 0.12 B_Naive2 L2
ENSG00000028839 TBPL1 -228055 sc-eQTL 8.43e-01 -0.0288 0.145 0.116 CD4_CTL L2
ENSG00000112303 VNN2 960656 sc-eQTL 5.80e-01 0.0805 0.145 0.116 CD4_CTL L2
ENSG00000112306 RPS12 909546 sc-eQTL 1.89e-01 -0.0882 0.0668 0.116 CD4_CTL L2
ENSG00000118515 SGK1 -593997 sc-eQTL 8.11e-01 -0.0279 0.116 0.116 CD4_CTL L2
ENSG00000146409 SLC18B1 910776 sc-eQTL 1.43e-01 0.198 0.135 0.116 CD4_CTL L2
ENSG00000028839 TBPL1 -228055 sc-eQTL 5.61e-01 0.0673 0.116 0.12 CD4_Naive L2
ENSG00000112303 VNN2 960656 sc-eQTL 5.64e-01 -0.0607 0.105 0.12 CD4_Naive L2
ENSG00000112306 RPS12 909546 sc-eQTL 8.50e-01 -0.0129 0.0682 0.12 CD4_Naive L2
ENSG00000118515 SGK1 -593997 sc-eQTL 1.37e-01 -0.124 0.0831 0.12 CD4_Naive L2
ENSG00000146409 SLC18B1 910776 sc-eQTL 8.34e-01 -0.0276 0.131 0.12 CD4_Naive L2
ENSG00000028839 TBPL1 -228055 sc-eQTL 9.53e-01 0.0073 0.124 0.12 CD4_TCM L2
ENSG00000112303 VNN2 960656 sc-eQTL 8.02e-01 -0.0308 0.123 0.12 CD4_TCM L2
ENSG00000112306 RPS12 909546 sc-eQTL 7.25e-01 -0.0224 0.0635 0.12 CD4_TCM L2
ENSG00000118515 SGK1 -593997 sc-eQTL 4.32e-01 -0.07 0.0888 0.12 CD4_TCM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 910776 sc-eQTL 4.07e-01 -0.122 0.147 0.12 CD4_TCM L2
ENSG00000028839 TBPL1 -228055 sc-eQTL 3.69e-02 -0.301 0.143 0.12 CD4_TEM L2
ENSG00000112303 VNN2 960656 sc-eQTL 7.10e-01 0.0519 0.139 0.12 CD4_TEM L2
ENSG00000112306 RPS12 909546 sc-eQTL 7.79e-01 -0.016 0.0571 0.12 CD4_TEM L2
ENSG00000118515 SGK1 -593997 sc-eQTL 6.08e-01 0.0504 0.0981 0.12 CD4_TEM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 910776 sc-eQTL 4.20e-01 0.114 0.142 0.12 CD4_TEM L2
ENSG00000028839 TBPL1 -228055 sc-eQTL 4.50e-01 -0.0971 0.128 0.12 CD8_CTL L2
ENSG00000112303 VNN2 960656 sc-eQTL 6.84e-03 0.366 0.134 0.12 CD8_CTL L2
ENSG00000112306 RPS12 909546 sc-eQTL 4.23e-01 -0.0585 0.0729 0.12 CD8_CTL L2
ENSG00000118515 SGK1 -593997 sc-eQTL 6.87e-01 0.0497 0.123 0.12 CD8_CTL L2
ENSG00000146409 SLC18B1 910776 sc-eQTL 8.81e-01 -0.0212 0.142 0.12 CD8_CTL L2
ENSG00000028839 TBPL1 -228055 sc-eQTL 9.73e-01 -0.00447 0.134 0.12 CD8_Naive L2
ENSG00000112303 VNN2 960656 sc-eQTL 8.67e-01 -0.0207 0.123 0.12 CD8_Naive L2
ENSG00000112306 RPS12 909546 sc-eQTL 3.14e-01 0.0709 0.0703 0.12 CD8_Naive L2
ENSG00000118515 SGK1 -593997 sc-eQTL 2.28e-01 -0.107 0.0882 0.12 CD8_Naive L2
ENSG00000146409 SLC18B1 910776 sc-eQTL 9.34e-01 0.0118 0.141 0.12 CD8_Naive L2
ENSG00000028839 TBPL1 -228055 sc-eQTL 3.74e-01 -0.138 0.155 0.118 CD8_TCM L2
ENSG00000112303 VNN2 960656 sc-eQTL 8.57e-01 -0.0258 0.143 0.118 CD8_TCM L2
ENSG00000112306 RPS12 909546 sc-eQTL 6.94e-01 0.0275 0.0697 0.118 CD8_TCM L2
ENSG00000118515 SGK1 -593997 sc-eQTL 2.09e-02 -0.265 0.114 0.118 CD8_TCM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 910776 sc-eQTL 5.07e-01 -0.101 0.153 0.118 CD8_TCM L2
ENSG00000028839 TBPL1 -228055 sc-eQTL 6.58e-01 -0.0612 0.138 0.121 CD8_TEM L2
ENSG00000112303 VNN2 960656 sc-eQTL 5.30e-01 0.0942 0.15 0.121 CD8_TEM L2
ENSG00000112306 RPS12 909546 sc-eQTL 7.80e-01 -0.0225 0.0805 0.121 CD8_TEM L2
ENSG00000118515 SGK1 -593997 sc-eQTL 9.27e-01 -0.0122 0.132 0.121 CD8_TEM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 910776 sc-eQTL 8.28e-02 0.264 0.151 0.121 CD8_TEM L2
ENSG00000028839 TBPL1 -228055 sc-eQTL 8.99e-01 -0.0182 0.144 0.117 MAIT L2
ENSG00000112303 VNN2 960656 sc-eQTL 3.16e-01 0.139 0.138 0.117 MAIT L2
ENSG00000112306 RPS12 909546 sc-eQTL 4.37e-01 -0.0531 0.0682 0.117 MAIT L2
ENSG00000118515 SGK1 -593997 sc-eQTL 1.07e-01 0.155 0.0955 0.117 MAIT L2
ENSG00000146409 SLC18B1 910776 sc-eQTL 4.72e-01 0.103 0.143 0.117 MAIT L2
ENSG00000028839 TBPL1 -228055 sc-eQTL 2.66e-01 -0.172 0.154 0.12 NK_CD56bright L2
ENSG00000112303 VNN2 960656 sc-eQTL 6.20e-01 -0.0721 0.145 0.12 NK_CD56bright L2
ENSG00000112306 RPS12 909546 sc-eQTL 9.40e-01 -0.0061 0.081 0.12 NK_CD56bright L2
ENSG00000118515 SGK1 -593997 sc-eQTL 2.89e-01 0.128 0.121 0.12 NK_CD56bright L2
ENSG00000028839 TBPL1 -228055 sc-eQTL 8.59e-01 0.0222 0.124 0.121 NK_CD56dim L2
ENSG00000112303 VNN2 960656 sc-eQTL 1.66e-01 -0.197 0.142 0.121 NK_CD56dim L2
ENSG00000112306 RPS12 909546 sc-eQTL 3.76e-01 -0.05 0.0564 0.121 NK_CD56dim L2
ENSG00000118515 SGK1 -593997 sc-eQTL 1.15e-01 0.197 0.124 0.121 NK_CD56dim L2
ENSG00000028839 TBPL1 -228055 sc-eQTL 6.67e-01 0.0673 0.156 0.121 NK_HLA L2
ENSG00000112303 VNN2 960656 sc-eQTL 2.68e-01 -0.16 0.144 0.121 NK_HLA L2
ENSG00000112306 RPS12 909546 sc-eQTL 9.18e-01 -0.00691 0.0671 0.121 NK_HLA L2
ENSG00000118515 SGK1 -593997 sc-eQTL 5.30e-01 -0.0834 0.133 0.121 NK_HLA L2
ENSG00000028839 TBPL1 -228055 sc-eQTL 1.51e-01 -0.189 0.131 0.121 NK_cytokine L2
ENSG00000112303 VNN2 960656 sc-eQTL 1.78e-01 -0.193 0.143 0.121 NK_cytokine L2
ENSG00000112306 RPS12 909546 sc-eQTL 7.59e-01 -0.0239 0.0777 0.121 NK_cytokine L2
ENSG00000118515 SGK1 -593997 sc-eQTL 9.05e-01 -0.0155 0.129 0.121 NK_cytokine L2
ENSG00000028839 TBPL1 -228055 sc-eQTL 2.04e-01 0.227 0.178 0.13 PB L2
ENSG00000112303 VNN2 960656 sc-eQTL 1.53e-01 -0.222 0.155 0.13 PB L2
ENSG00000112306 RPS12 909546 sc-eQTL 5.68e-01 0.0507 0.0885 0.13 PB L2
ENSG00000118515 SGK1 -593997 sc-eQTL 3.46e-01 0.135 0.143 0.13 PB L2
ENSG00000146409 SLC18B1 910776 sc-eQTL 6.14e-01 -0.084 0.166 0.13 PB L2
ENSG00000028839 TBPL1 -228055 sc-eQTL 7.22e-01 0.0521 0.146 0.122 Pro_T L2
ENSG00000112303 VNN2 960656 sc-eQTL 3.38e-01 -0.134 0.14 0.122 Pro_T L2
ENSG00000112306 RPS12 909546 sc-eQTL 2.97e-01 0.0553 0.0529 0.122 Pro_T L2
ENSG00000118515 SGK1 -593997 sc-eQTL 8.63e-01 0.0184 0.106 0.122 Pro_T L2
ENSG00000146409 SLC18B1 910776 sc-eQTL 9.55e-01 0.00769 0.137 0.122 Pro_T L2
ENSG00000028839 TBPL1 -228055 sc-eQTL 5.01e-01 0.0983 0.146 0.12 Treg L2
ENSG00000112303 VNN2 960656 sc-eQTL 1.36e-01 -0.172 0.115 0.12 Treg L2
ENSG00000112306 RPS12 909546 sc-eQTL 8.70e-01 0.00839 0.0512 0.12 Treg L2
ENSG00000118515 SGK1 -593997 sc-eQTL 8.79e-01 -0.0165 0.108 0.12 Treg L2
ENSG00000146409 SLC18B1 910776 sc-eQTL 9.93e-01 0.00124 0.145 0.12 Treg L2
ENSG00000028839 TBPL1 -228055 sc-eQTL 7.57e-01 0.0503 0.162 0.107 cDC L2
ENSG00000093134 VNN3 989350 sc-eQTL 8.91e-01 -0.0174 0.126 0.107 cDC L2
ENSG00000112303 VNN2 960656 sc-eQTL 3.91e-01 -0.124 0.144 0.107 cDC L2
ENSG00000112306 RPS12 909546 sc-eQTL 2.86e-01 0.0762 0.0712 0.107 cDC L2
ENSG00000118515 SGK1 -593997 sc-eQTL 1.34e-01 0.18 0.12 0.107 cDC L2
ENSG00000146409 SLC18B1 910776 sc-eQTL 5.53e-01 0.084 0.141 0.107 cDC L2
ENSG00000286438 AL591115.1 620987 sc-eQTL 2.28e-01 0.136 0.113 0.107 cDC L2
ENSG00000286887 AL355881.1 -572186 sc-eQTL 5.19e-01 0.0897 0.139 0.107 cDC L2
ENSG00000028839 TBPL1 -228055 sc-eQTL 6.75e-02 0.219 0.119 0.12 cMono_IL1B L2
ENSG00000093134 VNN3 989350 sc-eQTL 8.34e-01 0.0271 0.129 0.12 cMono_IL1B L2
ENSG00000112303 VNN2 960656 sc-eQTL 1.71e-01 0.143 0.104 0.12 cMono_IL1B L2
ENSG00000112306 RPS12 909546 sc-eQTL 3.13e-01 0.0583 0.0577 0.12 cMono_IL1B L2
ENSG00000118515 SGK1 -593997 sc-eQTL 2.82e-01 0.0928 0.086 0.12 cMono_IL1B L2
ENSG00000146409 SLC18B1 910776 sc-eQTL 2.91e-01 -0.118 0.111 0.12 cMono_IL1B L2
ENSG00000286887 AL355881.1 -572186 sc-eQTL 9.95e-01 0.000713 0.116 0.12 cMono_IL1B L2
ENSG00000028839 TBPL1 -228055 sc-eQTL 7.93e-01 0.0358 0.137 0.12 cMono_S100A L2
ENSG00000093134 VNN3 989350 sc-eQTL 9.77e-01 -0.00362 0.123 0.12 cMono_S100A L2
ENSG00000112303 VNN2 960656 sc-eQTL 9.04e-01 0.0106 0.0877 0.12 cMono_S100A L2
ENSG00000112306 RPS12 909546 sc-eQTL 9.21e-01 -0.00626 0.0632 0.12 cMono_S100A L2
ENSG00000118515 SGK1 -593997 sc-eQTL 9.71e-02 0.12 0.0718 0.12 cMono_S100A L2
ENSG00000146409 SLC18B1 910776 sc-eQTL 1.05e-01 -0.189 0.116 0.12 cMono_S100A L2
ENSG00000286887 AL355881.1 -572186 sc-eQTL 2.59e-02 0.254 0.113 0.12 cMono_S100A L2
ENSG00000028839 TBPL1 -228055 sc-eQTL 1.82e-01 -0.261 0.194 0.109 gdT L2
ENSG00000112303 VNN2 960656 sc-eQTL 1.42e-03 0.584 0.179 0.109 gdT L2
ENSG00000112306 RPS12 909546 sc-eQTL 3.49e-01 -0.0664 0.0706 0.109 gdT L2
ENSG00000118515 SGK1 -593997 sc-eQTL 1.90e-01 -0.175 0.133 0.109 gdT L2
ENSG00000146409 SLC18B1 910776 sc-eQTL 7.56e-01 0.0569 0.183 0.109 gdT L2
ENSG00000028839 TBPL1 -228055 sc-eQTL 5.82e-01 0.0765 0.139 0.122 intMono L2
ENSG00000093134 VNN3 989350 sc-eQTL 9.69e-01 -0.00517 0.134 0.122 intMono L2
ENSG00000112303 VNN2 960656 sc-eQTL 9.18e-01 0.0139 0.134 0.122 intMono L2
ENSG00000112306 RPS12 909546 sc-eQTL 4.84e-02 0.115 0.0579 0.122 intMono L2
ENSG00000118515 SGK1 -593997 sc-eQTL 7.10e-01 -0.0365 0.0982 0.122 intMono L2
ENSG00000146409 SLC18B1 910776 sc-eQTL 9.28e-01 0.0128 0.142 0.122 intMono L2
ENSG00000286887 AL355881.1 -572186 sc-eQTL 4.04e-01 -0.114 0.136 0.122 intMono L2
ENSG00000028839 TBPL1 -228055 sc-eQTL 5.94e-01 0.0788 0.148 0.118 ncMono L2
ENSG00000093134 VNN3 989350 sc-eQTL 7.14e-01 0.0517 0.141 0.118 ncMono L2
ENSG00000112303 VNN2 960656 sc-eQTL 4.52e-01 -0.101 0.134 0.118 ncMono L2
ENSG00000112306 RPS12 909546 sc-eQTL 9.80e-02 0.111 0.067 0.118 ncMono L2
ENSG00000118515 SGK1 -593997 sc-eQTL 8.56e-02 0.164 0.0947 0.118 ncMono L2
ENSG00000146409 SLC18B1 910776 sc-eQTL 9.59e-01 0.00607 0.119 0.118 ncMono L2
ENSG00000286887 AL355881.1 -572186 sc-eQTL 5.60e-01 0.0735 0.126 0.118 ncMono L2
ENSG00000028839 TBPL1 -228055 sc-eQTL 3.42e-01 -0.163 0.171 0.121 pDC L2
ENSG00000093134 VNN3 989350 sc-eQTL 9.82e-01 -0.0026 0.115 0.121 pDC L2
ENSG00000112303 VNN2 960656 sc-eQTL 8.16e-01 0.0326 0.139 0.121 pDC L2
ENSG00000112306 RPS12 909546 sc-eQTL 3.73e-03 0.275 0.0935 0.121 pDC L2
ENSG00000118515 SGK1 -593997 sc-eQTL 9.29e-01 -0.00866 0.0976 0.121 pDC L2
ENSG00000146409 SLC18B1 910776 sc-eQTL 7.34e-01 -0.0485 0.142 0.121 pDC L2
ENSG00000286438 AL591115.1 620987 sc-eQTL 7.27e-01 0.0475 0.136 0.121 pDC L2
ENSG00000286887 AL355881.1 -572186 sc-eQTL 3.26e-01 0.118 0.12 0.121 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000028839 TBPL1 -228055 sc-eQTL 6.22e-01 -0.0725 0.147 0.12 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 960656 sc-eQTL 6.26e-03 0.347 0.126 0.12 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 909546 sc-eQTL 3.22e-01 -0.0722 0.0728 0.12 B_Memory LOneK1K
ENSG00000118515 SGK1 -593997 sc-eQTL 1.45e-03 0.359 0.111 0.12 B_Memory LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 910776 sc-eQTL 8.17e-01 0.031 0.134 0.12 B_Memory LOneK1K
ENSG00000028839 TBPL1 -228055 sc-eQTL 3.24e-01 0.135 0.136 0.12 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 960656 sc-eQTL 5.20e-01 0.0771 0.12 0.12 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 909546 sc-eQTL 1.46e-01 -0.105 0.072 0.12 B_Naive LOneK1K
ENSG00000118515 SGK1 -593997 sc-eQTL 9.13e-01 -0.0123 0.112 0.12 B_Naive LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 910776 sc-eQTL 7.16e-01 -0.0497 0.137 0.12 B_Naive LOneK1K
ENSG00000028839 TBPL1 -228055 sc-eQTL 1.49e-01 0.158 0.109 0.12 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000093134 VNN3 989350 sc-eQTL 8.40e-01 0.0251 0.125 0.12 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 960656 sc-eQTL 3.99e-01 0.0726 0.0858 0.12 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 909546 sc-eQTL 4.89e-01 0.0408 0.0589 0.12 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000118515 SGK1 -593997 sc-eQTL 1.25e-01 0.123 0.0798 0.12 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 910776 sc-eQTL 1.19e-01 -0.163 0.104 0.12 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000286887 AL355881.1 -572186 sc-eQTL 3.24e-01 0.108 0.11 0.12 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000028839 TBPL1 -228055 sc-eQTL 6.50e-01 0.0641 0.141 0.121 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000093134 VNN3 989350 sc-eQTL 6.55e-01 0.0612 0.137 0.121 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 960656 sc-eQTL 8.76e-01 -0.0199 0.128 0.121 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 909546 sc-eQTL 1.95e-01 0.0702 0.0541 0.121 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000118515 SGK1 -593997 sc-eQTL 4.20e-01 0.0662 0.082 0.121 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 910776 sc-eQTL 7.54e-01 0.0413 0.132 0.121 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000286887 AL355881.1 -572186 sc-eQTL 6.58e-01 -0.0528 0.119 0.121 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000028839 TBPL1 -228055 sc-eQTL 2.26e-01 -0.139 0.115 0.121 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 960656 sc-eQTL 4.56e-02 -0.273 0.136 0.121 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 909546 sc-eQTL 2.53e-01 -0.0638 0.0557 0.121 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000118515 SGK1 -593997 sc-eQTL 4.91e-01 0.0796 0.115 0.121 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000146409 SLC18B1 910776 eQTL 0.0443 0.0674 0.0335 0.0 0.0 0.115

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina