logo

Genes within 1Mb (chr6:133706700:T:C):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000028839 TBPL1 -245470 sc-eQTL 1.61e-01 0.174 0.124 0.139 B L1
ENSG00000112303 VNN2 943241 sc-eQTL 5.66e-02 0.177 0.0925 0.139 B L1
ENSG00000112306 RPS12 892131 sc-eQTL 9.02e-01 0.00692 0.0564 0.139 B L1
ENSG00000118515 SGK1 -611412 sc-eQTL 1.32e-01 0.131 0.0865 0.139 B L1
ENSG00000146409 SLC18B1 893361 sc-eQTL 6.08e-01 -0.0609 0.119 0.139 B L1
ENSG00000028839 TBPL1 -245470 sc-eQTL 9.82e-01 0.00205 0.0923 0.139 CD4T L1
ENSG00000112303 VNN2 943241 sc-eQTL 5.32e-01 -0.052 0.083 0.139 CD4T L1
ENSG00000112306 RPS12 892131 sc-eQTL 6.09e-01 -0.0289 0.0565 0.139 CD4T L1
ENSG00000118515 SGK1 -611412 sc-eQTL 1.81e-02 -0.179 0.0749 0.139 CD4T L1
ENSG00000146409 SLC18B1 893361 sc-eQTL 5.50e-01 -0.0684 0.114 0.139 CD4T L1
ENSG00000028839 TBPL1 -245470 sc-eQTL 5.95e-01 -0.0473 0.0889 0.139 CD8T L1
ENSG00000112303 VNN2 943241 sc-eQTL 6.78e-01 0.0451 0.108 0.139 CD8T L1
ENSG00000112306 RPS12 892131 sc-eQTL 9.55e-01 0.0021 0.0371 0.139 CD8T L1
ENSG00000118515 SGK1 -611412 sc-eQTL 2.92e-01 -0.0601 0.057 0.139 CD8T L1
ENSG00000146409 SLC18B1 893361 sc-eQTL 5.09e-01 0.074 0.112 0.139 CD8T L1
ENSG00000028839 TBPL1 -245470 sc-eQTL 5.72e-01 -0.0787 0.139 0.14 DC L1
ENSG00000093134 VNN3 971935 sc-eQTL 5.40e-01 0.0658 0.107 0.14 DC L1
ENSG00000112299 VNN1 992645 sc-eQTL 3.24e-01 0.114 0.116 0.14 DC L1
ENSG00000112303 VNN2 943241 sc-eQTL 7.38e-01 0.0414 0.124 0.14 DC L1
ENSG00000112306 RPS12 892131 sc-eQTL 4.66e-02 0.138 0.0688 0.14 DC L1
ENSG00000118515 SGK1 -611412 sc-eQTL 4.25e-01 0.0643 0.0805 0.14 DC L1
ENSG00000146409 SLC18B1 893361 sc-eQTL 6.32e-01 0.0527 0.11 0.14 DC L1
ENSG00000286438 AL591115.1 603572 sc-eQTL 8.20e-01 -0.0228 0.1 0.14 DC L1
ENSG00000286887 AL355881.1 -589601 sc-eQTL 1.53e-01 0.178 0.124 0.14 DC L1
ENSG00000028839 TBPL1 -245470 sc-eQTL 2.30e-01 0.115 0.0957 0.139 Mono L1
ENSG00000093134 VNN3 971935 sc-eQTL 7.95e-01 -0.0287 0.11 0.139 Mono L1
ENSG00000112299 VNN1 992645 sc-eQTL 2.61e-01 -0.133 0.118 0.139 Mono L1
ENSG00000112303 VNN2 943241 sc-eQTL 4.92e-01 0.0576 0.0837 0.139 Mono L1
ENSG00000112306 RPS12 892131 sc-eQTL 6.17e-01 0.0251 0.0502 0.139 Mono L1
ENSG00000118515 SGK1 -611412 sc-eQTL 4.12e-01 0.0582 0.0708 0.139 Mono L1
ENSG00000146409 SLC18B1 893361 sc-eQTL 1.87e-02 -0.232 0.098 0.139 Mono L1
ENSG00000286887 AL355881.1 -589601 sc-eQTL 9.43e-01 0.00694 0.0976 0.139 Mono L1
ENSG00000028839 TBPL1 -245470 sc-eQTL 1.91e-01 -0.138 0.105 0.139 NK L1
ENSG00000112303 VNN2 943241 sc-eQTL 1.84e-02 -0.284 0.12 0.139 NK L1
ENSG00000112306 RPS12 892131 sc-eQTL 3.06e-01 -0.0513 0.05 0.139 NK L1
ENSG00000118515 SGK1 -611412 sc-eQTL 8.02e-01 0.0232 0.0927 0.139 NK L1
ENSG00000028839 TBPL1 -245470 sc-eQTL 5.96e-01 0.0663 0.125 0.139 Other_T L1
ENSG00000112303 VNN2 943241 sc-eQTL 3.07e-01 0.122 0.119 0.139 Other_T L1
ENSG00000112306 RPS12 892131 sc-eQTL 5.45e-01 0.0286 0.0472 0.139 Other_T L1
ENSG00000118515 SGK1 -611412 sc-eQTL 8.77e-01 -0.0134 0.0869 0.139 Other_T L1
ENSG00000146409 SLC18B1 893361 sc-eQTL 7.59e-01 0.0396 0.129 0.139 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000028839 TBPL1 -245470 sc-eQTL 7.33e-01 0.0537 0.157 0.128 B_Activated L2
ENSG00000112303 VNN2 943241 sc-eQTL 6.21e-01 0.071 0.143 0.128 B_Activated L2
ENSG00000112306 RPS12 892131 sc-eQTL 7.39e-01 0.0256 0.0768 0.128 B_Activated L2
ENSG00000118515 SGK1 -611412 sc-eQTL 9.32e-01 0.0117 0.137 0.128 B_Activated L2
ENSG00000146409 SLC18B1 893361 sc-eQTL 4.94e-01 0.0921 0.134 0.128 B_Activated L2
ENSG00000028839 TBPL1 -245470 sc-eQTL 7.20e-01 -0.0505 0.141 0.139 B_Intermediate L2
ENSG00000112303 VNN2 943241 sc-eQTL 5.90e-01 0.0657 0.122 0.139 B_Intermediate L2
ENSG00000112306 RPS12 892131 sc-eQTL 5.10e-01 -0.0491 0.0744 0.139 B_Intermediate L2
ENSG00000118515 SGK1 -611412 sc-eQTL 3.17e-02 0.276 0.127 0.139 B_Intermediate L2
ENSG00000146409 SLC18B1 893361 sc-eQTL 7.56e-01 0.0417 0.134 0.139 B_Intermediate L2
ENSG00000028839 TBPL1 -245470 sc-eQTL 8.14e-01 -0.0315 0.134 0.14 B_Memory L2
ENSG00000112303 VNN2 943241 sc-eQTL 6.39e-03 0.342 0.124 0.14 B_Memory L2
ENSG00000112306 RPS12 892131 sc-eQTL 7.08e-01 -0.0229 0.0609 0.14 B_Memory L2
ENSG00000118515 SGK1 -611412 sc-eQTL 1.45e-03 0.352 0.109 0.14 B_Memory L2
ENSG00000146409 SLC18B1 893361 sc-eQTL 3.83e-01 -0.111 0.127 0.14 B_Memory L2
ENSG00000028839 TBPL1 -245470 sc-eQTL 2.44e-01 0.144 0.123 0.139 B_Naive1 L2
ENSG00000112303 VNN2 943241 sc-eQTL 2.10e-01 0.144 0.115 0.139 B_Naive1 L2
ENSG00000112306 RPS12 892131 sc-eQTL 2.96e-01 -0.0686 0.0654 0.139 B_Naive1 L2
ENSG00000118515 SGK1 -611412 sc-eQTL 9.83e-01 -0.00223 0.103 0.139 B_Naive1 L2
ENSG00000146409 SLC18B1 893361 sc-eQTL 2.97e-01 -0.132 0.126 0.139 B_Naive1 L2
ENSG00000028839 TBPL1 -245470 sc-eQTL 5.73e-02 0.251 0.131 0.139 B_Naive2 L2
ENSG00000112303 VNN2 943241 sc-eQTL 9.56e-01 -0.00712 0.129 0.139 B_Naive2 L2
ENSG00000112306 RPS12 892131 sc-eQTL 1.23e-01 -0.105 0.068 0.139 B_Naive2 L2
ENSG00000118515 SGK1 -611412 sc-eQTL 8.73e-01 0.0193 0.121 0.139 B_Naive2 L2
ENSG00000146409 SLC18B1 893361 sc-eQTL 7.39e-01 -0.0435 0.131 0.139 B_Naive2 L2
ENSG00000028839 TBPL1 -245470 sc-eQTL 9.20e-01 -0.0132 0.131 0.134 CD4_CTL L2
ENSG00000112303 VNN2 943241 sc-eQTL 7.80e-01 -0.0368 0.131 0.134 CD4_CTL L2
ENSG00000112306 RPS12 892131 sc-eQTL 1.99e-01 -0.0779 0.0605 0.134 CD4_CTL L2
ENSG00000118515 SGK1 -611412 sc-eQTL 8.37e-01 -0.0216 0.105 0.134 CD4_CTL L2
ENSG00000146409 SLC18B1 893361 sc-eQTL 1.71e-01 0.167 0.122 0.134 CD4_CTL L2
ENSG00000028839 TBPL1 -245470 sc-eQTL 5.69e-01 0.0599 0.105 0.139 CD4_Naive L2
ENSG00000112303 VNN2 943241 sc-eQTL 6.28e-01 -0.0463 0.0953 0.139 CD4_Naive L2
ENSG00000112306 RPS12 892131 sc-eQTL 8.81e-01 0.00929 0.0619 0.139 CD4_Naive L2
ENSG00000118515 SGK1 -611412 sc-eQTL 1.00e-01 -0.124 0.0753 0.139 CD4_Naive L2
ENSG00000146409 SLC18B1 893361 sc-eQTL 8.76e-01 -0.0186 0.119 0.139 CD4_Naive L2
ENSG00000028839 TBPL1 -245470 sc-eQTL 8.37e-01 -0.0229 0.111 0.139 CD4_TCM L2
ENSG00000112303 VNN2 943241 sc-eQTL 9.79e-01 -0.00296 0.11 0.139 CD4_TCM L2
ENSG00000112306 RPS12 892131 sc-eQTL 6.89e-01 -0.0229 0.0572 0.139 CD4_TCM L2
ENSG00000118515 SGK1 -611412 sc-eQTL 3.78e-01 -0.0707 0.0799 0.139 CD4_TCM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 893361 sc-eQTL 1.83e-01 -0.176 0.132 0.139 CD4_TCM L2
ENSG00000028839 TBPL1 -245470 sc-eQTL 1.43e-02 -0.316 0.128 0.139 CD4_TEM L2
ENSG00000112303 VNN2 943241 sc-eQTL 8.02e-01 0.0314 0.125 0.139 CD4_TEM L2
ENSG00000112306 RPS12 892131 sc-eQTL 9.77e-01 0.00148 0.0511 0.139 CD4_TEM L2
ENSG00000118515 SGK1 -611412 sc-eQTL 8.71e-01 0.0143 0.0878 0.139 CD4_TEM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 893361 sc-eQTL 4.45e-01 0.0971 0.127 0.139 CD4_TEM L2
ENSG00000028839 TBPL1 -245470 sc-eQTL 7.22e-01 -0.0411 0.115 0.139 CD8_CTL L2
ENSG00000112303 VNN2 943241 sc-eQTL 1.32e-01 0.184 0.122 0.139 CD8_CTL L2
ENSG00000112306 RPS12 892131 sc-eQTL 5.77e-01 -0.0367 0.0656 0.139 CD8_CTL L2
ENSG00000118515 SGK1 -611412 sc-eQTL 7.20e-01 0.0398 0.111 0.139 CD8_CTL L2
ENSG00000146409 SLC18B1 893361 sc-eQTL 7.50e-01 -0.0405 0.127 0.139 CD8_CTL L2
ENSG00000028839 TBPL1 -245470 sc-eQTL 7.89e-01 0.0324 0.121 0.139 CD8_Naive L2
ENSG00000112303 VNN2 943241 sc-eQTL 3.59e-01 -0.102 0.111 0.139 CD8_Naive L2
ENSG00000112306 RPS12 892131 sc-eQTL 1.56e-01 0.0902 0.0633 0.139 CD8_Naive L2
ENSG00000118515 SGK1 -611412 sc-eQTL 2.10e-01 -0.1 0.0795 0.139 CD8_Naive L2
ENSG00000146409 SLC18B1 893361 sc-eQTL 4.45e-01 -0.0974 0.127 0.139 CD8_Naive L2
ENSG00000028839 TBPL1 -245470 sc-eQTL 3.51e-01 -0.131 0.14 0.137 CD8_TCM L2
ENSG00000112303 VNN2 943241 sc-eQTL 5.45e-01 -0.0779 0.129 0.137 CD8_TCM L2
ENSG00000112306 RPS12 892131 sc-eQTL 7.49e-01 -0.0201 0.0627 0.137 CD8_TCM L2
ENSG00000118515 SGK1 -611412 sc-eQTL 2.21e-02 -0.236 0.102 0.137 CD8_TCM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 893361 sc-eQTL 9.14e-01 -0.0148 0.137 0.137 CD8_TCM L2
ENSG00000028839 TBPL1 -245470 sc-eQTL 5.14e-01 -0.0845 0.129 0.142 CD8_TEM L2
ENSG00000112303 VNN2 943241 sc-eQTL 6.20e-01 0.0697 0.14 0.142 CD8_TEM L2
ENSG00000112306 RPS12 892131 sc-eQTL 7.77e-01 -0.0214 0.0755 0.142 CD8_TEM L2
ENSG00000118515 SGK1 -611412 sc-eQTL 9.06e-01 0.0147 0.124 0.142 CD8_TEM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 893361 sc-eQTL 3.51e-02 0.299 0.141 0.142 CD8_TEM L2
ENSG00000028839 TBPL1 -245470 sc-eQTL 4.19e-01 0.105 0.13 0.136 MAIT L2
ENSG00000112303 VNN2 943241 sc-eQTL 3.99e-01 0.106 0.125 0.136 MAIT L2
ENSG00000112306 RPS12 892131 sc-eQTL 5.72e-01 -0.035 0.0617 0.136 MAIT L2
ENSG00000118515 SGK1 -611412 sc-eQTL 1.55e-01 0.123 0.0865 0.136 MAIT L2
ENSG00000146409 SLC18B1 893361 sc-eQTL 8.97e-01 0.0167 0.129 0.136 MAIT L2
ENSG00000028839 TBPL1 -245470 sc-eQTL 3.32e-01 -0.135 0.139 0.136 NK_CD56bright L2
ENSG00000112303 VNN2 943241 sc-eQTL 4.38e-01 -0.102 0.131 0.136 NK_CD56bright L2
ENSG00000112306 RPS12 892131 sc-eQTL 9.19e-01 0.00741 0.0731 0.136 NK_CD56bright L2
ENSG00000118515 SGK1 -611412 sc-eQTL 3.10e-01 0.111 0.109 0.136 NK_CD56bright L2
ENSG00000028839 TBPL1 -245470 sc-eQTL 9.44e-01 0.00791 0.113 0.14 NK_CD56dim L2
ENSG00000112303 VNN2 943241 sc-eQTL 1.16e-01 -0.202 0.128 0.14 NK_CD56dim L2
ENSG00000112306 RPS12 892131 sc-eQTL 3.97e-01 -0.0434 0.0512 0.14 NK_CD56dim L2
ENSG00000118515 SGK1 -611412 sc-eQTL 3.96e-01 0.0963 0.113 0.14 NK_CD56dim L2
ENSG00000028839 TBPL1 -245470 sc-eQTL 9.57e-01 0.00765 0.142 0.142 NK_HLA L2
ENSG00000112303 VNN2 943241 sc-eQTL 1.80e-01 -0.175 0.13 0.142 NK_HLA L2
ENSG00000112306 RPS12 892131 sc-eQTL 9.25e-01 -0.00574 0.0609 0.142 NK_HLA L2
ENSG00000118515 SGK1 -611412 sc-eQTL 9.83e-01 0.00252 0.12 0.142 NK_HLA L2
ENSG00000028839 TBPL1 -245470 sc-eQTL 2.54e-02 -0.263 0.117 0.14 NK_cytokine L2
ENSG00000112303 VNN2 943241 sc-eQTL 1.92e-01 -0.167 0.128 0.14 NK_cytokine L2
ENSG00000112306 RPS12 892131 sc-eQTL 8.82e-01 -0.0104 0.0698 0.14 NK_cytokine L2
ENSG00000118515 SGK1 -611412 sc-eQTL 8.27e-01 0.0255 0.116 0.14 NK_cytokine L2
ENSG00000028839 TBPL1 -245470 sc-eQTL 5.49e-01 0.0959 0.16 0.156 PB L2
ENSG00000112303 VNN2 943241 sc-eQTL 6.99e-02 -0.251 0.137 0.156 PB L2
ENSG00000112306 RPS12 892131 sc-eQTL 6.31e-01 0.038 0.0789 0.156 PB L2
ENSG00000118515 SGK1 -611412 sc-eQTL 4.62e-01 0.094 0.127 0.156 PB L2
ENSG00000146409 SLC18B1 893361 sc-eQTL 9.32e-01 -0.0127 0.148 0.156 PB L2
ENSG00000028839 TBPL1 -245470 sc-eQTL 5.09e-01 0.0879 0.133 0.139 Pro_T L2
ENSG00000112303 VNN2 943241 sc-eQTL 9.10e-02 -0.215 0.126 0.139 Pro_T L2
ENSG00000112306 RPS12 892131 sc-eQTL 7.94e-01 0.0126 0.0482 0.139 Pro_T L2
ENSG00000118515 SGK1 -611412 sc-eQTL 9.82e-01 0.00217 0.0966 0.139 Pro_T L2
ENSG00000146409 SLC18B1 893361 sc-eQTL 8.42e-01 0.0248 0.125 0.139 Pro_T L2
ENSG00000028839 TBPL1 -245470 sc-eQTL 5.39e-01 0.0811 0.132 0.139 Treg L2
ENSG00000112303 VNN2 943241 sc-eQTL 9.69e-02 -0.173 0.104 0.139 Treg L2
ENSG00000112306 RPS12 892131 sc-eQTL 7.66e-01 0.0138 0.0463 0.139 Treg L2
ENSG00000118515 SGK1 -611412 sc-eQTL 7.78e-01 -0.0276 0.0976 0.139 Treg L2
ENSG00000146409 SLC18B1 893361 sc-eQTL 6.27e-01 -0.0636 0.131 0.139 Treg L2
ENSG00000028839 TBPL1 -245470 sc-eQTL 6.83e-01 0.0603 0.147 0.127 cDC L2
ENSG00000093134 VNN3 971935 sc-eQTL 9.44e-01 0.00811 0.115 0.127 cDC L2
ENSG00000112299 VNN1 992645 sc-eQTL 4.72e-01 0.0973 0.135 0.127 cDC L2
ENSG00000112303 VNN2 943241 sc-eQTL 5.75e-01 -0.0738 0.131 0.127 cDC L2
ENSG00000112306 RPS12 892131 sc-eQTL 3.41e-01 0.0619 0.0648 0.127 cDC L2
ENSG00000118515 SGK1 -611412 sc-eQTL 1.34e-01 0.164 0.109 0.127 cDC L2
ENSG00000146409 SLC18B1 893361 sc-eQTL 1.98e-01 0.166 0.128 0.127 cDC L2
ENSG00000286438 AL591115.1 603572 sc-eQTL 4.71e-01 0.0741 0.103 0.127 cDC L2
ENSG00000286887 AL355881.1 -589601 sc-eQTL 2.75e-01 0.138 0.126 0.127 cDC L2
ENSG00000028839 TBPL1 -245470 sc-eQTL 1.41e-01 0.159 0.108 0.139 cMono_IL1B L2
ENSG00000093134 VNN3 971935 sc-eQTL 9.77e-01 -0.0034 0.116 0.139 cMono_IL1B L2
ENSG00000112299 VNN1 992645 sc-eQTL 4.53e-01 -0.0878 0.117 0.139 cMono_IL1B L2
ENSG00000112303 VNN2 943241 sc-eQTL 2.14e-01 0.116 0.0932 0.139 cMono_IL1B L2
ENSG00000112306 RPS12 892131 sc-eQTL 2.90e-01 0.055 0.0518 0.139 cMono_IL1B L2
ENSG00000118515 SGK1 -611412 sc-eQTL 3.54e-01 0.0718 0.0773 0.139 cMono_IL1B L2
ENSG00000146409 SLC18B1 893361 sc-eQTL 1.65e-01 -0.139 0.0998 0.139 cMono_IL1B L2
ENSG00000286887 AL355881.1 -589601 sc-eQTL 7.88e-01 -0.0281 0.104 0.139 cMono_IL1B L2
ENSG00000028839 TBPL1 -245470 sc-eQTL 4.28e-01 0.0978 0.123 0.139 cMono_S100A L2
ENSG00000093134 VNN3 971935 sc-eQTL 7.26e-01 -0.039 0.111 0.139 cMono_S100A L2
ENSG00000112299 VNN1 992645 sc-eQTL 2.55e-01 -0.137 0.12 0.139 cMono_S100A L2
ENSG00000112303 VNN2 943241 sc-eQTL 8.51e-01 -0.0148 0.0791 0.139 cMono_S100A L2
ENSG00000112306 RPS12 892131 sc-eQTL 5.70e-01 0.0323 0.0569 0.139 cMono_S100A L2
ENSG00000118515 SGK1 -611412 sc-eQTL 2.89e-01 0.0691 0.0649 0.139 cMono_S100A L2
ENSG00000146409 SLC18B1 893361 sc-eQTL 3.92e-02 -0.216 0.104 0.139 cMono_S100A L2
ENSG00000286887 AL355881.1 -589601 sc-eQTL 1.13e-01 0.163 0.102 0.139 cMono_S100A L2
ENSG00000028839 TBPL1 -245470 sc-eQTL 2.74e-01 -0.191 0.174 0.124 gdT L2
ENSG00000112303 VNN2 943241 sc-eQTL 7.60e-03 0.439 0.162 0.124 gdT L2
ENSG00000112306 RPS12 892131 sc-eQTL 3.44e-01 -0.0599 0.0631 0.124 gdT L2
ENSG00000118515 SGK1 -611412 sc-eQTL 1.74e-01 -0.162 0.119 0.124 gdT L2
ENSG00000146409 SLC18B1 893361 sc-eQTL 9.05e-01 -0.0196 0.164 0.124 gdT L2
ENSG00000028839 TBPL1 -245470 sc-eQTL 7.18e-01 0.0452 0.125 0.142 intMono L2
ENSG00000093134 VNN3 971935 sc-eQTL 7.29e-01 -0.0418 0.121 0.142 intMono L2
ENSG00000112299 VNN1 992645 sc-eQTL 8.60e-01 0.0211 0.119 0.142 intMono L2
ENSG00000112303 VNN2 943241 sc-eQTL 7.85e-01 -0.0331 0.121 0.142 intMono L2
ENSG00000112306 RPS12 892131 sc-eQTL 4.12e-01 0.0433 0.0527 0.142 intMono L2
ENSG00000118515 SGK1 -611412 sc-eQTL 7.35e-01 -0.03 0.0886 0.142 intMono L2
ENSG00000146409 SLC18B1 893361 sc-eQTL 9.22e-01 0.0125 0.128 0.142 intMono L2
ENSG00000286887 AL355881.1 -589601 sc-eQTL 1.57e-01 -0.174 0.122 0.142 intMono L2
ENSG00000028839 TBPL1 -245470 sc-eQTL 4.86e-01 0.092 0.132 0.138 ncMono L2
ENSG00000093134 VNN3 971935 sc-eQTL 4.04e-01 0.105 0.126 0.138 ncMono L2
ENSG00000112299 VNN1 992645 sc-eQTL 3.97e-01 0.106 0.125 0.138 ncMono L2
ENSG00000112303 VNN2 943241 sc-eQTL 3.98e-01 -0.102 0.12 0.138 ncMono L2
ENSG00000112306 RPS12 892131 sc-eQTL 1.54e-01 0.086 0.06 0.138 ncMono L2
ENSG00000118515 SGK1 -611412 sc-eQTL 7.50e-02 0.152 0.0847 0.138 ncMono L2
ENSG00000146409 SLC18B1 893361 sc-eQTL 3.83e-01 -0.0931 0.106 0.138 ncMono L2
ENSG00000286887 AL355881.1 -589601 sc-eQTL 9.40e-01 0.00842 0.113 0.138 ncMono L2
ENSG00000028839 TBPL1 -245470 sc-eQTL 7.87e-01 -0.0412 0.152 0.144 pDC L2
ENSG00000093134 VNN3 971935 sc-eQTL 8.82e-01 0.0151 0.102 0.144 pDC L2
ENSG00000112299 VNN1 992645 sc-eQTL 7.54e-01 -0.0325 0.104 0.144 pDC L2
ENSG00000112303 VNN2 943241 sc-eQTL 6.54e-01 0.0553 0.123 0.144 pDC L2
ENSG00000112306 RPS12 892131 sc-eQTL 8.87e-03 0.22 0.083 0.144 pDC L2
ENSG00000118515 SGK1 -611412 sc-eQTL 7.82e-01 0.0239 0.0863 0.144 pDC L2
ENSG00000146409 SLC18B1 893361 sc-eQTL 3.23e-01 -0.124 0.125 0.144 pDC L2
ENSG00000286438 AL591115.1 603572 sc-eQTL 9.21e-01 0.0119 0.12 0.144 pDC L2
ENSG00000286887 AL355881.1 -589601 sc-eQTL 9.68e-01 -0.00425 0.107 0.144 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000028839 TBPL1 -245470 sc-eQTL 7.81e-01 -0.037 0.133 0.139 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 943241 sc-eQTL 1.11e-02 0.293 0.114 0.139 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 892131 sc-eQTL 6.64e-01 -0.0288 0.0661 0.139 B_Memory LOneK1K
ENSG00000118515 SGK1 -611412 sc-eQTL 6.05e-04 0.35 0.101 0.139 B_Memory LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 893361 sc-eQTL 9.90e-01 0.00157 0.121 0.139 B_Memory LOneK1K
ENSG00000028839 TBPL1 -245470 sc-eQTL 3.32e-02 0.262 0.122 0.139 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 943241 sc-eQTL 3.84e-01 0.0942 0.108 0.139 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 892131 sc-eQTL 2.34e-01 -0.0779 0.0652 0.139 B_Naive LOneK1K
ENSG00000118515 SGK1 -611412 sc-eQTL 9.77e-01 0.00291 0.101 0.139 B_Naive LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 893361 sc-eQTL 5.90e-01 -0.0666 0.123 0.139 B_Naive LOneK1K
ENSG00000028839 TBPL1 -245470 sc-eQTL 1.80e-01 0.133 0.0986 0.139 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000093134 VNN3 971935 sc-eQTL 8.94e-01 -0.015 0.112 0.139 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112299 VNN1 992645 sc-eQTL 2.44e-01 -0.136 0.117 0.139 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 943241 sc-eQTL 6.88e-01 0.0311 0.0773 0.139 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 892131 sc-eQTL 2.70e-01 0.0585 0.0529 0.139 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000118515 SGK1 -611412 sc-eQTL 2.08e-01 0.0909 0.072 0.139 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 893361 sc-eQTL 3.05e-02 -0.203 0.0934 0.139 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000286887 AL355881.1 -589601 sc-eQTL 5.07e-01 0.0657 0.0989 0.139 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000028839 TBPL1 -245470 sc-eQTL 6.90e-01 0.0507 0.127 0.14 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000093134 VNN3 971935 sc-eQTL 5.64e-01 0.0712 0.123 0.14 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112299 VNN1 992645 sc-eQTL 4.62e-01 0.0898 0.122 0.14 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 943241 sc-eQTL 7.50e-01 -0.0367 0.115 0.14 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 892131 sc-eQTL 4.07e-01 0.0405 0.0488 0.14 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000118515 SGK1 -611412 sc-eQTL 3.56e-01 0.0683 0.0738 0.14 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 893361 sc-eQTL 8.91e-01 -0.0164 0.119 0.14 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000286887 AL355881.1 -589601 sc-eQTL 2.79e-01 -0.116 0.107 0.14 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000028839 TBPL1 -245470 sc-eQTL 1.44e-01 -0.152 0.104 0.14 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 943241 sc-eQTL 2.60e-02 -0.274 0.122 0.14 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 892131 sc-eQTL 2.17e-01 -0.0623 0.0503 0.14 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000118515 SGK1 -611412 sc-eQTL 4.45e-01 0.0797 0.104 0.14 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000146409 SLC18B1 893361 eQTL 0.0268 0.0697 0.0314 0.0 0.0 0.135

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina