Genes within 1Mb (chr6:133703489:G:A):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD


Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000028839 TBPL1 -248681 sc-eQTL 1.61e-01 0.176 0.125 0.139 B L1
ENSG00000112303 VNN2 940030 sc-eQTL 4.58e-02 0.187 0.0929 0.139 B L1
ENSG00000112306 RPS12 888920 sc-eQTL 7.78e-01 0.016 0.0567 0.139 B L1
ENSG00000118515 SGK1 -614623 sc-eQTL 1.29e-01 0.133 0.087 0.139 B L1
ENSG00000146409 SLC18B1 890150 sc-eQTL 7.87e-01 -0.0323 0.119 0.139 B L1
ENSG00000028839 TBPL1 -248681 sc-eQTL 9.28e-01 -0.00833 0.0922 0.139 CD4T L1
ENSG00000112303 VNN2 940030 sc-eQTL 4.54e-01 -0.0622 0.0829 0.139 CD4T L1
ENSG00000112306 RPS12 888920 sc-eQTL 5.80e-01 -0.0313 0.0564 0.139 CD4T L1
ENSG00000118515 SGK1 -614623 sc-eQTL 1.66e-02 -0.181 0.0748 0.139 CD4T L1
ENSG00000146409 SLC18B1 890150 sc-eQTL 7.31e-01 -0.0394 0.114 0.139 CD4T L1
ENSG00000028839 TBPL1 -248681 sc-eQTL 5.69e-01 -0.0509 0.0891 0.139 CD8T L1
ENSG00000112303 VNN2 940030 sc-eQTL 4.62e-01 0.0799 0.109 0.139 CD8T L1
ENSG00000112306 RPS12 888920 sc-eQTL 9.22e-01 -0.00364 0.0372 0.139 CD8T L1
ENSG00000118515 SGK1 -614623 sc-eQTL 2.19e-01 -0.0703 0.0571 0.139 CD8T L1
ENSG00000146409 SLC18B1 890150 sc-eQTL 4.33e-01 0.088 0.112 0.139 CD8T L1
ENSG00000028839 TBPL1 -248681 sc-eQTL 5.78e-01 -0.0796 0.143 0.137 DC L1
ENSG00000093134 VNN3 968724 sc-eQTL 5.19e-01 0.071 0.11 0.137 DC L1
ENSG00000112299 VNN1 989434 sc-eQTL 2.77e-01 0.129 0.119 0.137 DC L1
ENSG00000112303 VNN2 940030 sc-eQTL 8.36e-01 0.0263 0.127 0.137 DC L1
ENSG00000112306 RPS12 888920 sc-eQTL 2.13e-02 0.163 0.0704 0.137 DC L1
ENSG00000118515 SGK1 -614623 sc-eQTL 4.44e-01 0.0634 0.0826 0.137 DC L1
ENSG00000146409 SLC18B1 890150 sc-eQTL 4.75e-01 0.0806 0.113 0.137 DC L1
ENSG00000286438 AL591115.1 600361 sc-eQTL 9.92e-01 -0.00108 0.103 0.137 DC L1
ENSG00000286887 AL355881.1 -592812 sc-eQTL 1.76e-01 0.173 0.127 0.137 DC L1
ENSG00000028839 TBPL1 -248681 sc-eQTL 2.55e-01 0.109 0.0954 0.139 Mono L1
ENSG00000093134 VNN3 968724 sc-eQTL 8.49e-01 -0.021 0.11 0.139 Mono L1
ENSG00000112299 VNN1 989434 sc-eQTL 3.70e-01 -0.106 0.118 0.139 Mono L1
ENSG00000112303 VNN2 940030 sc-eQTL 3.05e-01 0.0856 0.0832 0.139 Mono L1
ENSG00000112306 RPS12 888920 sc-eQTL 6.02e-01 0.0261 0.05 0.139 Mono L1
ENSG00000118515 SGK1 -614623 sc-eQTL 4.88e-01 0.049 0.0705 0.139 Mono L1
ENSG00000146409 SLC18B1 890150 sc-eQTL 2.91e-02 -0.215 0.0978 0.139 Mono L1
ENSG00000286887 AL355881.1 -592812 sc-eQTL 9.92e-01 0.00102 0.0972 0.139 Mono L1
ENSG00000028839 TBPL1 -248681 sc-eQTL 1.16e-01 -0.164 0.104 0.139 NK L1
ENSG00000112303 VNN2 940030 sc-eQTL 3.00e-02 -0.26 0.119 0.139 NK L1
ENSG00000112306 RPS12 888920 sc-eQTL 3.57e-01 -0.046 0.0498 0.139 NK L1
ENSG00000118515 SGK1 -614623 sc-eQTL 6.08e-01 0.0473 0.0922 0.139 NK L1
ENSG00000028839 TBPL1 -248681 sc-eQTL 7.03e-01 0.0479 0.125 0.139 Other_T L1
ENSG00000112303 VNN2 940030 sc-eQTL 3.55e-01 0.11 0.119 0.139 Other_T L1
ENSG00000112306 RPS12 888920 sc-eQTL 5.07e-01 0.0314 0.0473 0.139 Other_T L1
ENSG00000118515 SGK1 -614623 sc-eQTL 8.87e-01 -0.0124 0.0871 0.139 Other_T L1
ENSG00000146409 SLC18B1 890150 sc-eQTL 4.85e-01 0.0906 0.129 0.139 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000028839 TBPL1 -248681 sc-eQTL 5.24e-01 0.104 0.163 0.125 B_Activated L2
ENSG00000112303 VNN2 940030 sc-eQTL 6.05e-01 0.0768 0.148 0.125 B_Activated L2
ENSG00000112306 RPS12 888920 sc-eQTL 6.26e-01 0.0388 0.0795 0.125 B_Activated L2
ENSG00000118515 SGK1 -614623 sc-eQTL 9.36e-01 -0.0114 0.142 0.125 B_Activated L2
ENSG00000146409 SLC18B1 890150 sc-eQTL 3.71e-01 0.125 0.139 0.125 B_Activated L2
ENSG00000028839 TBPL1 -248681 sc-eQTL 7.61e-01 -0.044 0.145 0.139 B_Intermediate L2
ENSG00000112303 VNN2 940030 sc-eQTL 4.47e-01 0.0951 0.125 0.139 B_Intermediate L2
ENSG00000112306 RPS12 888920 sc-eQTL 4.87e-01 -0.0533 0.0765 0.139 B_Intermediate L2
ENSG00000118515 SGK1 -614623 sc-eQTL 3.75e-02 0.275 0.131 0.139 B_Intermediate L2
ENSG00000146409 SLC18B1 890150 sc-eQTL 6.17e-01 0.0691 0.138 0.139 B_Intermediate L2
ENSG00000028839 TBPL1 -248681 sc-eQTL 9.39e-01 -0.0105 0.137 0.14 B_Memory L2
ENSG00000112303 VNN2 940030 sc-eQTL 2.99e-03 0.381 0.127 0.14 B_Memory L2
ENSG00000112306 RPS12 888920 sc-eQTL 6.76e-01 -0.0261 0.0624 0.14 B_Memory L2
ENSG00000118515 SGK1 -614623 sc-eQTL 6.07e-04 0.388 0.111 0.14 B_Memory L2
ENSG00000146409 SLC18B1 890150 sc-eQTL 3.15e-01 -0.131 0.13 0.14 B_Memory L2
ENSG00000028839 TBPL1 -248681 sc-eQTL 4.72e-01 0.0888 0.123 0.139 B_Naive1 L2
ENSG00000112303 VNN2 940030 sc-eQTL 3.09e-01 0.117 0.115 0.139 B_Naive1 L2
ENSG00000112306 RPS12 888920 sc-eQTL 4.07e-01 -0.0544 0.0655 0.139 B_Naive1 L2
ENSG00000118515 SGK1 -614623 sc-eQTL 8.69e-01 -0.017 0.103 0.139 B_Naive1 L2
ENSG00000146409 SLC18B1 890150 sc-eQTL 3.76e-01 -0.112 0.126 0.139 B_Naive1 L2
ENSG00000028839 TBPL1 -248681 sc-eQTL 1.37e-01 0.197 0.132 0.139 B_Naive2 L2
ENSG00000112303 VNN2 940030 sc-eQTL 9.30e-01 0.0114 0.13 0.139 B_Naive2 L2
ENSG00000112306 RPS12 888920 sc-eQTL 2.34e-01 -0.0816 0.0683 0.139 B_Naive2 L2
ENSG00000118515 SGK1 -614623 sc-eQTL 8.18e-01 0.0279 0.121 0.139 B_Naive2 L2
ENSG00000146409 SLC18B1 890150 sc-eQTL 7.42e-01 -0.0431 0.131 0.139 B_Naive2 L2
ENSG00000028839 TBPL1 -248681 sc-eQTL 8.17e-01 -0.0306 0.132 0.134 CD4_CTL L2
ENSG00000112303 VNN2 940030 sc-eQTL 8.18e-01 -0.0303 0.132 0.134 CD4_CTL L2
ENSG00000112306 RPS12 888920 sc-eQTL 2.08e-01 -0.0767 0.0607 0.134 CD4_CTL L2
ENSG00000118515 SGK1 -614623 sc-eQTL 7.17e-01 -0.0384 0.106 0.134 CD4_CTL L2
ENSG00000146409 SLC18B1 890150 sc-eQTL 1.99e-01 0.158 0.122 0.134 CD4_CTL L2
ENSG00000028839 TBPL1 -248681 sc-eQTL 6.93e-01 0.0415 0.105 0.139 CD4_Naive L2
ENSG00000112303 VNN2 940030 sc-eQTL 5.38e-01 -0.0587 0.0951 0.139 CD4_Naive L2
ENSG00000112306 RPS12 888920 sc-eQTL 9.88e-01 0.000893 0.0618 0.139 CD4_Naive L2
ENSG00000118515 SGK1 -614623 sc-eQTL 9.27e-02 -0.127 0.0751 0.139 CD4_Naive L2
ENSG00000146409 SLC18B1 890150 sc-eQTL 8.16e-01 0.0277 0.119 0.139 CD4_Naive L2
ENSG00000028839 TBPL1 -248681 sc-eQTL 7.57e-01 -0.0345 0.111 0.139 CD4_TCM L2
ENSG00000112303 VNN2 940030 sc-eQTL 8.04e-01 -0.0274 0.11 0.139 CD4_TCM L2
ENSG00000112306 RPS12 888920 sc-eQTL 6.49e-01 -0.0261 0.0573 0.139 CD4_TCM L2
ENSG00000118515 SGK1 -614623 sc-eQTL 3.44e-01 -0.0758 0.08 0.139 CD4_TCM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 890150 sc-eQTL 1.92e-01 -0.173 0.132 0.139 CD4_TCM L2
ENSG00000028839 TBPL1 -248681 sc-eQTL 4.71e-03 -0.365 0.128 0.139 CD4_TEM L2
ENSG00000112303 VNN2 940030 sc-eQTL 9.18e-01 0.0129 0.125 0.139 CD4_TEM L2
ENSG00000112306 RPS12 888920 sc-eQTL 8.32e-01 -0.0109 0.0513 0.139 CD4_TEM L2
ENSG00000118515 SGK1 -614623 sc-eQTL 9.73e-01 0.00294 0.0882 0.139 CD4_TEM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 890150 sc-eQTL 4.57e-01 0.0949 0.127 0.139 CD4_TEM L2
ENSG00000028839 TBPL1 -248681 sc-eQTL 6.00e-01 -0.0606 0.116 0.139 CD8_CTL L2
ENSG00000112303 VNN2 940030 sc-eQTL 3.77e-02 0.254 0.121 0.139 CD8_CTL L2
ENSG00000112306 RPS12 888920 sc-eQTL 5.47e-01 -0.0396 0.0656 0.139 CD8_CTL L2
ENSG00000118515 SGK1 -614623 sc-eQTL 8.56e-01 0.0202 0.111 0.139 CD8_CTL L2
ENSG00000146409 SLC18B1 890150 sc-eQTL 9.17e-01 -0.0133 0.127 0.139 CD8_CTL L2
ENSG00000028839 TBPL1 -248681 sc-eQTL 9.73e-01 0.00403 0.121 0.139 CD8_Naive L2
ENSG00000112303 VNN2 940030 sc-eQTL 5.75e-01 -0.0623 0.111 0.139 CD8_Naive L2
ENSG00000112306 RPS12 888920 sc-eQTL 1.63e-01 0.0886 0.0633 0.139 CD8_Naive L2
ENSG00000118515 SGK1 -614623 sc-eQTL 1.24e-01 -0.123 0.0794 0.139 CD8_Naive L2
ENSG00000146409 SLC18B1 890150 sc-eQTL 5.82e-01 -0.0702 0.128 0.139 CD8_Naive L2
ENSG00000028839 TBPL1 -248681 sc-eQTL 3.71e-01 -0.129 0.143 0.137 CD8_TCM L2
ENSG00000112303 VNN2 940030 sc-eQTL 5.41e-01 -0.0807 0.132 0.137 CD8_TCM L2
ENSG00000112306 RPS12 888920 sc-eQTL 7.22e-01 -0.0229 0.0643 0.137 CD8_TCM L2
ENSG00000118515 SGK1 -614623 sc-eQTL 1.94e-02 -0.248 0.105 0.137 CD8_TCM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 890150 sc-eQTL 8.81e-01 -0.0211 0.141 0.137 CD8_TCM L2
ENSG00000028839 TBPL1 -248681 sc-eQTL 7.06e-01 -0.0485 0.128 0.142 CD8_TEM L2
ENSG00000112303 VNN2 940030 sc-eQTL 4.41e-01 0.107 0.139 0.142 CD8_TEM L2
ENSG00000112306 RPS12 888920 sc-eQTL 8.09e-01 -0.0181 0.0749 0.142 CD8_TEM L2
ENSG00000118515 SGK1 -614623 sc-eQTL 6.31e-01 0.059 0.123 0.142 CD8_TEM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 890150 sc-eQTL 5.52e-02 0.271 0.14 0.142 CD8_TEM L2
ENSG00000028839 TBPL1 -248681 sc-eQTL 5.81e-01 0.0719 0.13 0.136 MAIT L2
ENSG00000112303 VNN2 940030 sc-eQTL 5.33e-01 0.0785 0.126 0.136 MAIT L2
ENSG00000112306 RPS12 888920 sc-eQTL 3.95e-01 -0.0527 0.0618 0.136 MAIT L2
ENSG00000118515 SGK1 -614623 sc-eQTL 2.51e-01 0.1 0.0869 0.136 MAIT L2
ENSG00000146409 SLC18B1 890150 sc-eQTL 6.30e-01 0.0627 0.13 0.136 MAIT L2
ENSG00000028839 TBPL1 -248681 sc-eQTL 2.77e-01 -0.153 0.141 0.136 NK_CD56bright L2
ENSG00000112303 VNN2 940030 sc-eQTL 3.90e-01 -0.114 0.133 0.136 NK_CD56bright L2
ENSG00000112306 RPS12 888920 sc-eQTL 7.95e-01 -0.0193 0.074 0.136 NK_CD56bright L2
ENSG00000118515 SGK1 -614623 sc-eQTL 2.92e-01 0.117 0.11 0.136 NK_CD56bright L2
ENSG00000028839 TBPL1 -248681 sc-eQTL 8.62e-01 -0.0196 0.113 0.14 NK_CD56dim L2
ENSG00000112303 VNN2 940030 sc-eQTL 1.94e-01 -0.167 0.128 0.14 NK_CD56dim L2
ENSG00000112306 RPS12 888920 sc-eQTL 4.91e-01 -0.0352 0.0511 0.14 NK_CD56dim L2
ENSG00000118515 SGK1 -614623 sc-eQTL 1.62e-01 0.158 0.113 0.14 NK_CD56dim L2
ENSG00000028839 TBPL1 -248681 sc-eQTL 9.24e-01 -0.0136 0.142 0.142 NK_HLA L2
ENSG00000112303 VNN2 940030 sc-eQTL 2.16e-01 -0.162 0.13 0.142 NK_HLA L2
ENSG00000112306 RPS12 888920 sc-eQTL 7.23e-01 -0.0216 0.0609 0.142 NK_HLA L2
ENSG00000118515 SGK1 -614623 sc-eQTL 9.19e-01 -0.0123 0.12 0.142 NK_HLA L2
ENSG00000028839 TBPL1 -248681 sc-eQTL 2.51e-02 -0.263 0.117 0.14 NK_cytokine L2
ENSG00000112303 VNN2 940030 sc-eQTL 2.26e-01 -0.156 0.128 0.14 NK_cytokine L2
ENSG00000112306 RPS12 888920 sc-eQTL 8.36e-01 -0.0145 0.0697 0.14 NK_cytokine L2
ENSG00000118515 SGK1 -614623 sc-eQTL 7.15e-01 0.0424 0.116 0.14 NK_cytokine L2
ENSG00000028839 TBPL1 -248681 sc-eQTL 4.26e-01 0.128 0.16 0.156 PB L2
ENSG00000112303 VNN2 940030 sc-eQTL 1.12e-01 -0.221 0.138 0.156 PB L2
ENSG00000112306 RPS12 888920 sc-eQTL 7.88e-01 0.0214 0.0793 0.156 PB L2
ENSG00000118515 SGK1 -614623 sc-eQTL 2.71e-01 0.141 0.127 0.156 PB L2
ENSG00000146409 SLC18B1 890150 sc-eQTL 8.48e-01 0.0286 0.149 0.156 PB L2
ENSG00000028839 TBPL1 -248681 sc-eQTL 4.53e-01 0.0999 0.133 0.139 Pro_T L2
ENSG00000112303 VNN2 940030 sc-eQTL 1.37e-01 -0.189 0.127 0.139 Pro_T L2
ENSG00000112306 RPS12 888920 sc-eQTL 5.53e-01 0.0287 0.0482 0.139 Pro_T L2
ENSG00000118515 SGK1 -614623 sc-eQTL 9.47e-01 0.00647 0.0968 0.139 Pro_T L2
ENSG00000146409 SLC18B1 890150 sc-eQTL 6.81e-01 0.0515 0.125 0.139 Pro_T L2
ENSG00000028839 TBPL1 -248681 sc-eQTL 2.39e-01 0.156 0.132 0.139 Treg L2
ENSG00000112303 VNN2 940030 sc-eQTL 7.65e-02 -0.185 0.104 0.139 Treg L2
ENSG00000112306 RPS12 888920 sc-eQTL 7.28e-01 0.0161 0.0464 0.139 Treg L2
ENSG00000118515 SGK1 -614623 sc-eQTL 7.50e-01 -0.0312 0.0977 0.139 Treg L2
ENSG00000146409 SLC18B1 890150 sc-eQTL 8.62e-01 -0.0228 0.131 0.139 Treg L2
ENSG00000028839 TBPL1 -248681 sc-eQTL 6.83e-01 0.0603 0.147 0.127 cDC L2
ENSG00000093134 VNN3 968724 sc-eQTL 9.44e-01 0.00811 0.115 0.127 cDC L2
ENSG00000112299 VNN1 989434 sc-eQTL 4.72e-01 0.0973 0.135 0.127 cDC L2
ENSG00000112303 VNN2 940030 sc-eQTL 5.75e-01 -0.0738 0.131 0.127 cDC L2
ENSG00000112306 RPS12 888920 sc-eQTL 3.41e-01 0.0619 0.0648 0.127 cDC L2
ENSG00000118515 SGK1 -614623 sc-eQTL 1.34e-01 0.164 0.109 0.127 cDC L2
ENSG00000146409 SLC18B1 890150 sc-eQTL 1.98e-01 0.166 0.128 0.127 cDC L2
ENSG00000286438 AL591115.1 600361 sc-eQTL 4.71e-01 0.0741 0.103 0.127 cDC L2
ENSG00000286887 AL355881.1 -592812 sc-eQTL 2.75e-01 0.138 0.126 0.127 cDC L2
ENSG00000028839 TBPL1 -248681 sc-eQTL 1.33e-01 0.162 0.108 0.139 cMono_IL1B L2
ENSG00000093134 VNN3 968724 sc-eQTL 1.00e+00 3.74e-05 0.116 0.139 cMono_IL1B L2
ENSG00000112299 VNN1 989434 sc-eQTL 4.80e-01 -0.0828 0.117 0.139 cMono_IL1B L2
ENSG00000112303 VNN2 940030 sc-eQTL 1.61e-01 0.131 0.0932 0.139 cMono_IL1B L2
ENSG00000112306 RPS12 888920 sc-eQTL 2.97e-01 0.0543 0.0519 0.139 cMono_IL1B L2
ENSG00000118515 SGK1 -614623 sc-eQTL 4.21e-01 0.0625 0.0775 0.139 cMono_IL1B L2
ENSG00000146409 SLC18B1 890150 sc-eQTL 2.28e-01 -0.121 0.1 0.139 cMono_IL1B L2
ENSG00000286887 AL355881.1 -592812 sc-eQTL 7.62e-01 -0.0317 0.104 0.139 cMono_IL1B L2
ENSG00000028839 TBPL1 -248681 sc-eQTL 5.26e-01 0.0781 0.123 0.139 cMono_S100A L2
ENSG00000093134 VNN3 968724 sc-eQTL 5.32e-01 -0.0696 0.111 0.139 cMono_S100A L2
ENSG00000112299 VNN1 989434 sc-eQTL 3.23e-01 -0.119 0.12 0.139 cMono_S100A L2
ENSG00000112303 VNN2 940030 sc-eQTL 8.74e-01 0.0126 0.079 0.139 cMono_S100A L2
ENSG00000112306 RPS12 888920 sc-eQTL 6.10e-01 0.029 0.0569 0.139 cMono_S100A L2
ENSG00000118515 SGK1 -614623 sc-eQTL 2.45e-01 0.0756 0.0649 0.139 cMono_S100A L2
ENSG00000146409 SLC18B1 890150 sc-eQTL 3.39e-02 -0.223 0.104 0.139 cMono_S100A L2
ENSG00000286887 AL355881.1 -592812 sc-eQTL 8.27e-02 0.178 0.102 0.139 cMono_S100A L2
ENSG00000028839 TBPL1 -248681 sc-eQTL 3.33e-01 -0.176 0.181 0.121 gdT L2
ENSG00000112303 VNN2 940030 sc-eQTL 7.81e-03 0.456 0.169 0.121 gdT L2
ENSG00000112306 RPS12 888920 sc-eQTL 3.87e-01 -0.0571 0.0658 0.121 gdT L2
ENSG00000118515 SGK1 -614623 sc-eQTL 2.17e-01 -0.154 0.124 0.121 gdT L2
ENSG00000146409 SLC18B1 890150 sc-eQTL 9.06e-01 0.0202 0.17 0.121 gdT L2
ENSG00000028839 TBPL1 -248681 sc-eQTL 8.92e-01 0.0171 0.126 0.142 intMono L2
ENSG00000093134 VNN3 968724 sc-eQTL 9.69e-01 -0.00477 0.121 0.142 intMono L2
ENSG00000112299 VNN1 989434 sc-eQTL 7.61e-01 0.0364 0.12 0.142 intMono L2
ENSG00000112303 VNN2 940030 sc-eQTL 8.08e-01 -0.0296 0.122 0.142 intMono L2
ENSG00000112306 RPS12 888920 sc-eQTL 4.32e-01 0.0416 0.0529 0.142 intMono L2
ENSG00000118515 SGK1 -614623 sc-eQTL 5.81e-01 -0.0491 0.0889 0.142 intMono L2
ENSG00000146409 SLC18B1 890150 sc-eQTL 9.38e-01 0.01 0.129 0.142 intMono L2
ENSG00000286887 AL355881.1 -592812 sc-eQTL 1.40e-01 -0.182 0.123 0.142 intMono L2
ENSG00000028839 TBPL1 -248681 sc-eQTL 6.37e-01 0.0643 0.136 0.136 ncMono L2
ENSG00000093134 VNN3 968724 sc-eQTL 3.45e-01 0.123 0.129 0.136 ncMono L2
ENSG00000112299 VNN1 989434 sc-eQTL 3.61e-01 0.118 0.128 0.136 ncMono L2
ENSG00000112303 VNN2 940030 sc-eQTL 4.96e-01 -0.0844 0.124 0.136 ncMono L2
ENSG00000112306 RPS12 888920 sc-eQTL 1.17e-01 0.0971 0.0617 0.136 ncMono L2
ENSG00000118515 SGK1 -614623 sc-eQTL 9.34e-02 0.147 0.0872 0.136 ncMono L2
ENSG00000146409 SLC18B1 890150 sc-eQTL 4.25e-01 -0.0876 0.109 0.136 ncMono L2
ENSG00000286887 AL355881.1 -592812 sc-eQTL 8.52e-01 0.0216 0.116 0.136 ncMono L2
ENSG00000028839 TBPL1 -248681 sc-eQTL 7.90e-01 -0.0421 0.158 0.141 pDC L2
ENSG00000093134 VNN3 968724 sc-eQTL 8.61e-01 0.0186 0.106 0.141 pDC L2
ENSG00000112299 VNN1 989434 sc-eQTL 8.02e-01 -0.027 0.108 0.141 pDC L2
ENSG00000112303 VNN2 940030 sc-eQTL 7.59e-01 0.0393 0.128 0.141 pDC L2
ENSG00000112306 RPS12 888920 sc-eQTL 3.35e-03 0.256 0.0859 0.141 pDC L2
ENSG00000118515 SGK1 -614623 sc-eQTL 9.16e-01 0.00944 0.0897 0.141 pDC L2
ENSG00000146409 SLC18B1 890150 sc-eQTL 3.96e-01 -0.111 0.13 0.141 pDC L2
ENSG00000286438 AL591115.1 600361 sc-eQTL 7.75e-01 0.0358 0.125 0.141 pDC L2
ENSG00000286887 AL355881.1 -592812 sc-eQTL 9.53e-01 -0.00652 0.111 0.141 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000028839 TBPL1 -248681 sc-eQTL 8.44e-01 -0.027 0.136 0.139 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 940030 sc-eQTL 5.53e-03 0.327 0.117 0.139 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 888920 sc-eQTL 7.77e-01 -0.0192 0.0677 0.139 B_Memory LOneK1K
ENSG00000118515 SGK1 -614623 sc-eQTL 6.18e-04 0.358 0.103 0.139 B_Memory LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 890150 sc-eQTL 8.37e-01 0.0257 0.124 0.139 B_Memory LOneK1K
ENSG00000028839 TBPL1 -248681 sc-eQTL 9.60e-02 0.206 0.123 0.139 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 940030 sc-eQTL 4.42e-01 0.0834 0.108 0.139 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 888920 sc-eQTL 3.57e-01 -0.0605 0.0654 0.139 B_Naive LOneK1K
ENSG00000118515 SGK1 -614623 sc-eQTL 9.29e-01 -0.00902 0.101 0.139 B_Naive LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 890150 sc-eQTL 6.58e-01 -0.0549 0.124 0.139 B_Naive LOneK1K
ENSG00000028839 TBPL1 -248681 sc-eQTL 1.87e-01 0.13 0.0985 0.139 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000093134 VNN3 968724 sc-eQTL 8.81e-01 -0.0168 0.112 0.139 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112299 VNN1 989434 sc-eQTL 3.02e-01 -0.121 0.117 0.139 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 940030 sc-eQTL 4.61e-01 0.057 0.0772 0.139 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 888920 sc-eQTL 2.98e-01 0.0552 0.0529 0.139 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000118515 SGK1 -614623 sc-eQTL 2.56e-01 0.082 0.072 0.139 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 890150 sc-eQTL 4.77e-02 -0.186 0.0935 0.139 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000286887 AL355881.1 -592812 sc-eQTL 5.49e-01 0.0594 0.0988 0.139 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000028839 TBPL1 -248681 sc-eQTL 9.62e-01 -0.00601 0.127 0.14 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000093134 VNN3 968724 sc-eQTL 3.86e-01 0.107 0.123 0.14 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112299 VNN1 989434 sc-eQTL 3.44e-01 0.116 0.122 0.14 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 940030 sc-eQTL 8.87e-01 -0.0164 0.115 0.14 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 888920 sc-eQTL 3.38e-01 0.047 0.0489 0.14 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000118515 SGK1 -614623 sc-eQTL 3.49e-01 0.0694 0.074 0.14 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 890150 sc-eQTL 9.54e-01 0.00686 0.119 0.14 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000286887 AL355881.1 -592812 sc-eQTL 2.83e-01 -0.116 0.107 0.14 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000028839 TBPL1 -248681 sc-eQTL 8.64e-02 -0.177 0.103 0.14 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 940030 sc-eQTL 4.76e-02 -0.243 0.122 0.14 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 888920 sc-eQTL 2.93e-01 -0.0528 0.0501 0.14 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000118515 SGK1 -614623 sc-eQTL 2.42e-01 0.121 0.103 0.14 NK_CD56dim LOneK1K


Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000146409 SLC18B1 890150 eQTL 0.0142 0.0773 0.0315 0.0 0.0 0.133


Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina