Genes within 1Mb (chr6:133666353:A:T):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD


Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000028839 TBPL1 -285817 sc-eQTL 4.06e-01 0.0866 0.104 0.205 B L1
ENSG00000112303 VNN2 902894 sc-eQTL 1.54e-01 0.111 0.0777 0.205 B L1
ENSG00000112306 RPS12 851784 sc-eQTL 8.42e-01 0.00941 0.0472 0.205 B L1
ENSG00000118515 SGK1 -651759 sc-eQTL 2.10e-01 0.0912 0.0725 0.205 B L1
ENSG00000146409 SLC18B1 853014 sc-eQTL 5.02e-01 0.0667 0.0992 0.205 B L1
ENSG00000028839 TBPL1 -285817 sc-eQTL 5.04e-01 0.0518 0.0775 0.205 CD4T L1
ENSG00000112303 VNN2 902894 sc-eQTL 4.52e-01 -0.0525 0.0697 0.205 CD4T L1
ENSG00000112306 RPS12 851784 sc-eQTL 9.11e-01 0.00533 0.0475 0.205 CD4T L1
ENSG00000118515 SGK1 -651759 sc-eQTL 3.17e-01 -0.0638 0.0637 0.205 CD4T L1
ENSG00000146409 SLC18B1 853014 sc-eQTL 4.59e-01 0.0711 0.0959 0.205 CD4T L1
ENSG00000028839 TBPL1 -285817 sc-eQTL 1.97e-01 -0.0986 0.0762 0.205 CD8T L1
ENSG00000112303 VNN2 902894 sc-eQTL 8.42e-01 0.0186 0.0932 0.205 CD8T L1
ENSG00000112306 RPS12 851784 sc-eQTL 7.11e-01 0.0118 0.0318 0.205 CD8T L1
ENSG00000118515 SGK1 -651759 sc-eQTL 7.43e-01 -0.0161 0.0491 0.205 CD8T L1
ENSG00000146409 SLC18B1 853014 sc-eQTL 9.86e-01 0.00171 0.0963 0.205 CD8T L1
ENSG00000028839 TBPL1 -285817 sc-eQTL 4.48e-02 -0.24 0.119 0.207 DC L1
ENSG00000093134 VNN3 931588 sc-eQTL 9.17e-01 -0.00963 0.0924 0.207 DC L1
ENSG00000112299 VNN1 952298 sc-eQTL 9.58e-01 -0.00532 0.0998 0.207 DC L1
ENSG00000112303 VNN2 902894 sc-eQTL 5.80e-01 -0.0591 0.107 0.207 DC L1
ENSG00000112306 RPS12 851784 sc-eQTL 2.86e-03 0.177 0.0585 0.207 DC L1
ENSG00000118515 SGK1 -651759 sc-eQTL 7.37e-01 0.0233 0.0694 0.207 DC L1
ENSG00000146409 SLC18B1 853014 sc-eQTL 9.10e-01 0.0108 0.0947 0.207 DC L1
ENSG00000286438 AL591115.1 563225 sc-eQTL 1.03e-01 0.14 0.0856 0.207 DC L1
ENSG00000286887 AL355881.1 -629948 sc-eQTL 2.43e-01 0.125 0.107 0.207 DC L1
ENSG00000028839 TBPL1 -285817 sc-eQTL 7.63e-01 0.0245 0.081 0.205 Mono L1
ENSG00000093134 VNN3 931588 sc-eQTL 3.82e-01 0.0813 0.0929 0.205 Mono L1
ENSG00000112299 VNN1 952298 sc-eQTL 5.05e-01 -0.0668 0.1 0.205 Mono L1
ENSG00000112303 VNN2 902894 sc-eQTL 4.17e-01 0.0574 0.0706 0.205 Mono L1
ENSG00000112306 RPS12 851784 sc-eQTL 3.06e-01 0.0434 0.0423 0.205 Mono L1
ENSG00000118515 SGK1 -651759 sc-eQTL 2.63e-01 0.067 0.0596 0.205 Mono L1
ENSG00000146409 SLC18B1 853014 sc-eQTL 3.86e-02 -0.173 0.083 0.205 Mono L1
ENSG00000286887 AL355881.1 -629948 sc-eQTL 5.69e-01 0.047 0.0823 0.205 Mono L1
ENSG00000028839 TBPL1 -285817 sc-eQTL 7.56e-01 -0.0278 0.0894 0.204 NK L1
ENSG00000112303 VNN2 902894 sc-eQTL 3.33e-03 -0.299 0.101 0.204 NK L1
ENSG00000112306 RPS12 851784 sc-eQTL 3.96e-01 -0.0361 0.0425 0.204 NK L1
ENSG00000118515 SGK1 -651759 sc-eQTL 6.55e-01 -0.0352 0.0787 0.204 NK L1
ENSG00000028839 TBPL1 -285817 sc-eQTL 9.59e-01 0.00552 0.106 0.205 Other_T L1
ENSG00000112303 VNN2 902894 sc-eQTL 4.97e-01 0.0688 0.101 0.205 Other_T L1
ENSG00000112306 RPS12 851784 sc-eQTL 7.77e-01 0.0114 0.0401 0.205 Other_T L1
ENSG00000118515 SGK1 -651759 sc-eQTL 8.89e-01 0.0103 0.0738 0.205 Other_T L1
ENSG00000146409 SLC18B1 853014 sc-eQTL 8.24e-02 0.19 0.109 0.205 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000028839 TBPL1 -285817 sc-eQTL 2.78e-01 -0.139 0.127 0.194 B_Activated L2
ENSG00000112303 VNN2 902894 sc-eQTL 7.40e-01 -0.0387 0.116 0.194 B_Activated L2
ENSG00000112306 RPS12 851784 sc-eQTL 3.46e-01 0.0588 0.0622 0.194 B_Activated L2
ENSG00000118515 SGK1 -651759 sc-eQTL 6.46e-01 -0.0511 0.111 0.194 B_Activated L2
ENSG00000146409 SLC18B1 853014 sc-eQTL 9.46e-01 0.00747 0.109 0.194 B_Activated L2
ENSG00000028839 TBPL1 -285817 sc-eQTL 4.33e-01 -0.093 0.119 0.206 B_Intermediate L2
ENSG00000112303 VNN2 902894 sc-eQTL 3.44e-01 0.0972 0.102 0.206 B_Intermediate L2
ENSG00000112306 RPS12 851784 sc-eQTL 8.93e-01 -0.00847 0.0629 0.206 B_Intermediate L2
ENSG00000118515 SGK1 -651759 sc-eQTL 1.34e-01 0.163 0.108 0.206 B_Intermediate L2
ENSG00000146409 SLC18B1 853014 sc-eQTL 8.61e-01 0.0199 0.113 0.206 B_Intermediate L2
ENSG00000028839 TBPL1 -285817 sc-eQTL 8.45e-01 0.022 0.112 0.207 B_Memory L2
ENSG00000112303 VNN2 902894 sc-eQTL 1.18e-01 0.166 0.106 0.207 B_Memory L2
ENSG00000112306 RPS12 851784 sc-eQTL 3.77e-01 -0.0452 0.0511 0.207 B_Memory L2
ENSG00000118515 SGK1 -651759 sc-eQTL 6.67e-03 0.253 0.0922 0.207 B_Memory L2
ENSG00000146409 SLC18B1 853014 sc-eQTL 6.22e-01 0.0526 0.107 0.207 B_Memory L2
ENSG00000028839 TBPL1 -285817 sc-eQTL 6.09e-01 0.0537 0.105 0.205 B_Naive1 L2
ENSG00000112303 VNN2 902894 sc-eQTL 1.29e-01 0.148 0.0973 0.205 B_Naive1 L2
ENSG00000112306 RPS12 851784 sc-eQTL 4.56e-01 -0.0416 0.0556 0.205 B_Naive1 L2
ENSG00000118515 SGK1 -651759 sc-eQTL 7.27e-01 0.0304 0.0871 0.205 B_Naive1 L2
ENSG00000146409 SLC18B1 853014 sc-eQTL 7.73e-01 0.0311 0.108 0.205 B_Naive1 L2
ENSG00000028839 TBPL1 -285817 sc-eQTL 2.27e-01 0.135 0.112 0.206 B_Naive2 L2
ENSG00000112303 VNN2 902894 sc-eQTL 9.85e-01 -0.00204 0.11 0.206 B_Naive2 L2
ENSG00000112306 RPS12 851784 sc-eQTL 1.00e-01 -0.0952 0.0576 0.206 B_Naive2 L2
ENSG00000118515 SGK1 -651759 sc-eQTL 9.00e-01 -0.0128 0.102 0.206 B_Naive2 L2
ENSG00000146409 SLC18B1 853014 sc-eQTL 4.90e-01 0.0763 0.111 0.206 B_Naive2 L2
ENSG00000028839 TBPL1 -285817 sc-eQTL 6.78e-01 -0.0459 0.111 0.202 CD4_CTL L2
ENSG00000112303 VNN2 902894 sc-eQTL 3.34e-01 0.107 0.111 0.202 CD4_CTL L2
ENSG00000112306 RPS12 851784 sc-eQTL 5.01e-01 -0.0345 0.0511 0.202 CD4_CTL L2
ENSG00000118515 SGK1 -651759 sc-eQTL 8.43e-01 -0.0176 0.0888 0.202 CD4_CTL L2
ENSG00000146409 SLC18B1 853014 sc-eQTL 7.96e-01 -0.0267 0.103 0.202 CD4_CTL L2
ENSG00000028839 TBPL1 -285817 sc-eQTL 4.42e-01 0.0683 0.0886 0.205 CD4_Naive L2
ENSG00000112303 VNN2 902894 sc-eQTL 2.84e-01 -0.0863 0.0803 0.205 CD4_Naive L2
ENSG00000112306 RPS12 851784 sc-eQTL 3.11e-01 0.0529 0.0521 0.205 CD4_Naive L2
ENSG00000118515 SGK1 -651759 sc-eQTL 4.10e-01 -0.0528 0.0639 0.205 CD4_Naive L2
ENSG00000146409 SLC18B1 853014 sc-eQTL 3.12e-01 0.102 0.1 0.205 CD4_Naive L2
ENSG00000028839 TBPL1 -285817 sc-eQTL 1.55e-01 0.134 0.0938 0.205 CD4_TCM L2
ENSG00000112303 VNN2 902894 sc-eQTL 7.79e-01 0.0263 0.0935 0.205 CD4_TCM L2
ENSG00000112306 RPS12 851784 sc-eQTL 9.36e-01 0.00388 0.0485 0.205 CD4_TCM L2
ENSG00000118515 SGK1 -651759 sc-eQTL 7.58e-01 0.0209 0.0679 0.205 CD4_TCM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 853014 sc-eQTL 9.77e-01 0.00328 0.112 0.205 CD4_TCM L2
ENSG00000028839 TBPL1 -285817 sc-eQTL 1.84e-01 -0.146 0.11 0.205 CD4_TEM L2
ENSG00000112303 VNN2 902894 sc-eQTL 3.43e-01 0.1 0.106 0.205 CD4_TEM L2
ENSG00000112306 RPS12 851784 sc-eQTL 9.26e-01 0.00405 0.0434 0.205 CD4_TEM L2
ENSG00000118515 SGK1 -651759 sc-eQTL 3.53e-01 0.0692 0.0744 0.205 CD4_TEM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 853014 sc-eQTL 6.66e-01 -0.0466 0.108 0.205 CD4_TEM L2
ENSG00000028839 TBPL1 -285817 sc-eQTL 8.81e-01 -0.0147 0.0978 0.205 CD8_CTL L2
ENSG00000112303 VNN2 902894 sc-eQTL 4.00e-01 0.0875 0.104 0.205 CD8_CTL L2
ENSG00000112306 RPS12 851784 sc-eQTL 4.13e-01 -0.0456 0.0555 0.205 CD8_CTL L2
ENSG00000118515 SGK1 -651759 sc-eQTL 7.55e-01 0.0294 0.0939 0.205 CD8_CTL L2
ENSG00000146409 SLC18B1 853014 sc-eQTL 4.31e-01 -0.085 0.108 0.205 CD8_CTL L2
ENSG00000028839 TBPL1 -285817 sc-eQTL 4.81e-01 -0.0732 0.104 0.205 CD8_Naive L2
ENSG00000112303 VNN2 902894 sc-eQTL 9.30e-01 -0.00836 0.0955 0.205 CD8_Naive L2
ENSG00000112306 RPS12 851784 sc-eQTL 5.86e-02 0.103 0.0542 0.205 CD8_Naive L2
ENSG00000118515 SGK1 -651759 sc-eQTL 5.71e-01 -0.0389 0.0686 0.205 CD8_Naive L2
ENSG00000146409 SLC18B1 853014 sc-eQTL 9.94e-01 -0.000789 0.11 0.205 CD8_Naive L2
ENSG00000028839 TBPL1 -285817 sc-eQTL 6.50e-01 0.0541 0.119 0.204 CD8_TCM L2
ENSG00000112303 VNN2 902894 sc-eQTL 4.68e-01 -0.0794 0.109 0.204 CD8_TCM L2
ENSG00000112306 RPS12 851784 sc-eQTL 6.06e-01 0.0275 0.0533 0.204 CD8_TCM L2
ENSG00000118515 SGK1 -651759 sc-eQTL 1.39e-01 -0.13 0.0878 0.204 CD8_TCM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 853014 sc-eQTL 8.22e-01 0.0263 0.117 0.204 CD8_TCM L2
ENSG00000028839 TBPL1 -285817 sc-eQTL 3.71e-01 -0.0962 0.107 0.208 CD8_TEM L2
ENSG00000112303 VNN2 902894 sc-eQTL 5.55e-01 -0.0689 0.117 0.208 CD8_TEM L2
ENSG00000112306 RPS12 851784 sc-eQTL 5.61e-01 -0.0365 0.0627 0.208 CD8_TEM L2
ENSG00000118515 SGK1 -651759 sc-eQTL 8.40e-01 -0.0208 0.103 0.208 CD8_TEM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 853014 sc-eQTL 2.81e-02 0.259 0.117 0.208 CD8_TEM L2
ENSG00000028839 TBPL1 -285817 sc-eQTL 6.00e-01 0.0582 0.111 0.203 MAIT L2
ENSG00000112303 VNN2 902894 sc-eQTL 3.49e-01 0.101 0.107 0.203 MAIT L2
ENSG00000112306 RPS12 851784 sc-eQTL 6.90e-01 -0.0211 0.0528 0.203 MAIT L2
ENSG00000118515 SGK1 -651759 sc-eQTL 4.09e-01 0.0614 0.0742 0.203 MAIT L2
ENSG00000146409 SLC18B1 853014 sc-eQTL 2.32e-01 0.132 0.11 0.203 MAIT L2
ENSG00000028839 TBPL1 -285817 sc-eQTL 3.66e-01 -0.109 0.12 0.2 NK_CD56bright L2
ENSG00000112303 VNN2 902894 sc-eQTL 1.61e-01 -0.159 0.113 0.2 NK_CD56bright L2
ENSG00000112306 RPS12 851784 sc-eQTL 8.64e-01 -0.0108 0.0633 0.2 NK_CD56bright L2
ENSG00000118515 SGK1 -651759 sc-eQTL 5.01e-01 0.0638 0.0945 0.2 NK_CD56bright L2
ENSG00000028839 TBPL1 -285817 sc-eQTL 2.02e-01 0.123 0.0957 0.205 NK_CD56dim L2
ENSG00000112303 VNN2 902894 sc-eQTL 7.74e-02 -0.194 0.109 0.205 NK_CD56dim L2
ENSG00000112306 RPS12 851784 sc-eQTL 4.57e-01 -0.0325 0.0436 0.205 NK_CD56dim L2
ENSG00000118515 SGK1 -651759 sc-eQTL 7.03e-01 -0.0369 0.0967 0.205 NK_CD56dim L2
ENSG00000028839 TBPL1 -285817 sc-eQTL 8.06e-01 0.0304 0.124 0.203 NK_HLA L2
ENSG00000112303 VNN2 902894 sc-eQTL 3.10e-01 -0.116 0.114 0.203 NK_HLA L2
ENSG00000112306 RPS12 851784 sc-eQTL 5.31e-01 -0.0333 0.0531 0.203 NK_HLA L2
ENSG00000118515 SGK1 -651759 sc-eQTL 6.50e-01 -0.0478 0.105 0.203 NK_HLA L2
ENSG00000028839 TBPL1 -285817 sc-eQTL 4.25e-01 -0.0797 0.0996 0.205 NK_cytokine L2
ENSG00000112303 VNN2 902894 sc-eQTL 6.05e-02 -0.203 0.108 0.205 NK_cytokine L2
ENSG00000112306 RPS12 851784 sc-eQTL 4.44e-01 -0.0451 0.0588 0.205 NK_cytokine L2
ENSG00000118515 SGK1 -651759 sc-eQTL 4.16e-01 -0.0797 0.0979 0.205 NK_cytokine L2
ENSG00000028839 TBPL1 -285817 sc-eQTL 6.26e-01 0.0633 0.13 0.226 PB L2
ENSG00000112303 VNN2 902894 sc-eQTL 3.88e-02 -0.231 0.111 0.226 PB L2
ENSG00000112306 RPS12 851784 sc-eQTL 8.93e-01 -0.00866 0.0641 0.226 PB L2
ENSG00000118515 SGK1 -651759 sc-eQTL 5.22e-02 0.2 0.102 0.226 PB L2
ENSG00000146409 SLC18B1 853014 sc-eQTL 2.54e-01 0.137 0.119 0.226 PB L2
ENSG00000028839 TBPL1 -285817 sc-eQTL 4.48e-01 0.0837 0.11 0.207 Pro_T L2
ENSG00000112303 VNN2 902894 sc-eQTL 2.71e-01 -0.116 0.105 0.207 Pro_T L2
ENSG00000112306 RPS12 851784 sc-eQTL 8.26e-01 0.0088 0.04 0.207 Pro_T L2
ENSG00000118515 SGK1 -651759 sc-eQTL 3.35e-01 0.0773 0.08 0.207 Pro_T L2
ENSG00000146409 SLC18B1 853014 sc-eQTL 6.64e-02 0.189 0.103 0.207 Pro_T L2
ENSG00000028839 TBPL1 -285817 sc-eQTL 4.89e-01 0.0773 0.111 0.205 Treg L2
ENSG00000112303 VNN2 902894 sc-eQTL 4.55e-01 -0.0662 0.0884 0.205 Treg L2
ENSG00000112306 RPS12 851784 sc-eQTL 9.98e-01 -0.000101 0.0391 0.205 Treg L2
ENSG00000118515 SGK1 -651759 sc-eQTL 4.48e-01 -0.0626 0.0824 0.205 Treg L2
ENSG00000146409 SLC18B1 853014 sc-eQTL 3.11e-01 0.112 0.11 0.205 Treg L2
ENSG00000028839 TBPL1 -285817 sc-eQTL 6.67e-01 -0.0549 0.127 0.19 cDC L2
ENSG00000093134 VNN3 931588 sc-eQTL 5.09e-01 0.0656 0.0992 0.19 cDC L2
ENSG00000112299 VNN1 952298 sc-eQTL 9.35e-01 0.00956 0.117 0.19 cDC L2
ENSG00000112303 VNN2 902894 sc-eQTL 2.63e-01 -0.127 0.113 0.19 cDC L2
ENSG00000112306 RPS12 851784 sc-eQTL 1.41e-01 0.0825 0.0558 0.19 cDC L2
ENSG00000118515 SGK1 -651759 sc-eQTL 4.87e-01 0.0658 0.0945 0.19 cDC L2
ENSG00000146409 SLC18B1 853014 sc-eQTL 7.68e-01 0.0328 0.111 0.19 cDC L2
ENSG00000286438 AL591115.1 563225 sc-eQTL 2.50e-01 0.102 0.0886 0.19 cDC L2
ENSG00000286887 AL355881.1 -629948 sc-eQTL 5.21e-01 0.0702 0.109 0.19 cDC L2
ENSG00000028839 TBPL1 -285817 sc-eQTL 4.61e-01 0.0679 0.0919 0.205 cMono_IL1B L2
ENSG00000093134 VNN3 931588 sc-eQTL 2.68e-01 0.109 0.0984 0.205 cMono_IL1B L2
ENSG00000112299 VNN1 952298 sc-eQTL 8.11e-01 -0.0239 0.0995 0.205 cMono_IL1B L2
ENSG00000112303 VNN2 902894 sc-eQTL 3.93e-01 0.068 0.0794 0.205 cMono_IL1B L2
ENSG00000112306 RPS12 851784 sc-eQTL 7.06e-02 0.0797 0.0439 0.205 cMono_IL1B L2
ENSG00000118515 SGK1 -651759 sc-eQTL 3.84e-01 0.0574 0.0658 0.205 cMono_IL1B L2
ENSG00000146409 SLC18B1 853014 sc-eQTL 1.00e-01 -0.14 0.0847 0.205 cMono_IL1B L2
ENSG00000286887 AL355881.1 -629948 sc-eQTL 4.82e-01 0.0625 0.0887 0.205 cMono_IL1B L2
ENSG00000028839 TBPL1 -285817 sc-eQTL 3.87e-01 0.0904 0.104 0.205 cMono_S100A L2
ENSG00000093134 VNN3 931588 sc-eQTL 8.59e-01 -0.0167 0.0942 0.205 cMono_S100A L2
ENSG00000112299 VNN1 952298 sc-eQTL 2.40e-01 -0.12 0.102 0.205 cMono_S100A L2
ENSG00000112303 VNN2 902894 sc-eQTL 6.66e-01 -0.029 0.0669 0.205 cMono_S100A L2
ENSG00000112306 RPS12 851784 sc-eQTL 5.59e-01 0.0282 0.0482 0.205 cMono_S100A L2
ENSG00000118515 SGK1 -651759 sc-eQTL 2.39e-01 0.0649 0.055 0.205 cMono_S100A L2
ENSG00000146409 SLC18B1 853014 sc-eQTL 1.32e-01 -0.134 0.0888 0.205 cMono_S100A L2
ENSG00000286887 AL355881.1 -629948 sc-eQTL 2.39e-01 0.103 0.087 0.205 cMono_S100A L2
ENSG00000028839 TBPL1 -285817 sc-eQTL 1.31e-01 -0.227 0.15 0.185 gdT L2
ENSG00000112303 VNN2 902894 sc-eQTL 2.39e-03 0.43 0.139 0.185 gdT L2
ENSG00000112306 RPS12 851784 sc-eQTL 7.05e-01 -0.0207 0.0547 0.185 gdT L2
ENSG00000118515 SGK1 -651759 sc-eQTL 2.91e-02 -0.224 0.102 0.185 gdT L2
ENSG00000146409 SLC18B1 853014 sc-eQTL 8.05e-01 0.035 0.141 0.185 gdT L2
ENSG00000028839 TBPL1 -285817 sc-eQTL 7.25e-01 -0.038 0.108 0.207 intMono L2
ENSG00000093134 VNN3 931588 sc-eQTL 9.56e-01 0.00578 0.104 0.207 intMono L2
ENSG00000112299 VNN1 952298 sc-eQTL 1.77e-01 0.139 0.103 0.207 intMono L2
ENSG00000112303 VNN2 902894 sc-eQTL 3.83e-01 -0.0913 0.104 0.207 intMono L2
ENSG00000112306 RPS12 851784 sc-eQTL 1.30e-01 0.0688 0.0453 0.207 intMono L2
ENSG00000118515 SGK1 -651759 sc-eQTL 7.22e-01 0.0273 0.0765 0.207 intMono L2
ENSG00000146409 SLC18B1 853014 sc-eQTL 4.53e-01 0.0832 0.111 0.207 intMono L2
ENSG00000286887 AL355881.1 -629948 sc-eQTL 6.11e-01 -0.0539 0.106 0.207 intMono L2
ENSG00000028839 TBPL1 -285817 sc-eQTL 9.60e-01 0.00587 0.115 0.195 ncMono L2
ENSG00000093134 VNN3 931588 sc-eQTL 6.41e-01 -0.0515 0.11 0.195 ncMono L2
ENSG00000112299 VNN1 952298 sc-eQTL 6.87e-01 -0.0441 0.109 0.195 ncMono L2
ENSG00000112303 VNN2 902894 sc-eQTL 1.96e-01 -0.136 0.105 0.195 ncMono L2
ENSG00000112306 RPS12 851784 sc-eQTL 9.66e-01 0.00226 0.0528 0.195 ncMono L2
ENSG00000118515 SGK1 -651759 sc-eQTL 1.85e-01 0.0988 0.0743 0.195 ncMono L2
ENSG00000146409 SLC18B1 853014 sc-eQTL 5.61e-01 -0.0542 0.0931 0.195 ncMono L2
ENSG00000286887 AL355881.1 -629948 sc-eQTL 1.39e-01 -0.146 0.098 0.195 ncMono L2
ENSG00000028839 TBPL1 -285817 sc-eQTL 7.73e-02 -0.243 0.137 0.195 pDC L2
ENSG00000093134 VNN3 931588 sc-eQTL 2.86e-01 -0.0989 0.0923 0.195 pDC L2
ENSG00000112299 VNN1 952298 sc-eQTL 2.94e-01 -0.099 0.0939 0.195 pDC L2
ENSG00000112303 VNN2 902894 sc-eQTL 7.46e-01 -0.0364 0.112 0.195 pDC L2
ENSG00000112306 RPS12 851784 sc-eQTL 5.03e-04 0.264 0.0743 0.195 pDC L2
ENSG00000118515 SGK1 -651759 sc-eQTL 8.65e-01 0.0134 0.0785 0.195 pDC L2
ENSG00000146409 SLC18B1 853014 sc-eQTL 4.38e-01 -0.0888 0.114 0.195 pDC L2
ENSG00000286438 AL591115.1 563225 sc-eQTL 8.78e-02 0.186 0.108 0.195 pDC L2
ENSG00000286887 AL355881.1 -629948 sc-eQTL 8.10e-01 -0.0233 0.0971 0.195 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000028839 TBPL1 -285817 sc-eQTL 4.94e-01 -0.0772 0.113 0.205 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 902894 sc-eQTL 6.60e-02 0.18 0.0974 0.205 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 851784 sc-eQTL 7.58e-01 -0.0172 0.0559 0.205 B_Memory LOneK1K
ENSG00000118515 SGK1 -651759 sc-eQTL 3.01e-02 0.189 0.0865 0.205 B_Memory LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 853014 sc-eQTL 8.89e-01 0.0144 0.103 0.205 B_Memory LOneK1K
ENSG00000028839 TBPL1 -285817 sc-eQTL 1.19e-01 0.163 0.104 0.205 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 902894 sc-eQTL 5.04e-01 0.0613 0.0915 0.205 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 851784 sc-eQTL 2.62e-01 -0.0622 0.0553 0.205 B_Naive LOneK1K
ENSG00000118515 SGK1 -651759 sc-eQTL 6.24e-01 0.0421 0.0858 0.205 B_Naive LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 853014 sc-eQTL 4.38e-01 0.0812 0.104 0.205 B_Naive LOneK1K
ENSG00000028839 TBPL1 -285817 sc-eQTL 5.31e-01 0.0525 0.0837 0.205 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000093134 VNN3 931588 sc-eQTL 3.92e-01 0.0812 0.0948 0.205 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112299 VNN1 952298 sc-eQTL 6.24e-01 -0.0486 0.099 0.205 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 902894 sc-eQTL 6.15e-01 0.033 0.0655 0.205 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 851784 sc-eQTL 9.72e-02 0.0743 0.0446 0.205 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000118515 SGK1 -651759 sc-eQTL 2.52e-01 0.0701 0.061 0.205 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 853014 sc-eQTL 2.25e-02 -0.181 0.0789 0.205 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000286887 AL355881.1 -629948 sc-eQTL 2.71e-01 0.0923 0.0836 0.205 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000028839 TBPL1 -285817 sc-eQTL 9.04e-01 -0.0131 0.109 0.205 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000093134 VNN3 931588 sc-eQTL 6.50e-01 -0.0479 0.105 0.205 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112299 VNN1 952298 sc-eQTL 8.91e-01 -0.0144 0.105 0.205 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 902894 sc-eQTL 4.01e-01 -0.0829 0.0984 0.205 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 851784 sc-eQTL 9.64e-01 -0.00189 0.0418 0.205 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000118515 SGK1 -651759 sc-eQTL 3.93e-01 0.0541 0.0632 0.205 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 853014 sc-eQTL 7.87e-01 0.0275 0.102 0.205 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000286887 AL355881.1 -629948 sc-eQTL 2.55e-01 -0.104 0.0916 0.205 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000028839 TBPL1 -285817 sc-eQTL 6.99e-01 -0.0343 0.0884 0.205 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 902894 sc-eQTL 7.95e-03 -0.277 0.103 0.205 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 851784 sc-eQTL 4.42e-01 -0.033 0.0428 0.205 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000118515 SGK1 -651759 sc-eQTL 4.93e-01 -0.0608 0.0885 0.205 NK_CD56dim LOneK1K


Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000146409 SLC18B1 853014 eQTL 0.0491 0.0541 0.0275 0.0 0.0 0.187


Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina