logo

Genes within 1Mb (chr6:133658589:C:T):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000028839 TBPL1 -293581 sc-eQTL 8.75e-01 -0.0282 0.18 0.06 B L1
ENSG00000112303 VNN2 895130 sc-eQTL 9.11e-01 -0.015 0.135 0.06 B L1
ENSG00000112306 RPS12 844020 sc-eQTL 4.82e-01 0.0573 0.0814 0.06 B L1
ENSG00000118515 SGK1 -659523 sc-eQTL 9.10e-01 -0.0142 0.126 0.06 B L1
ENSG00000146409 SLC18B1 845250 sc-eQTL 4.24e-01 0.137 0.171 0.06 B L1
ENSG00000028839 TBPL1 -293581 sc-eQTL 6.33e-01 0.0634 0.133 0.06 CD4T L1
ENSG00000112303 VNN2 895130 sc-eQTL 5.20e-01 -0.0771 0.12 0.06 CD4T L1
ENSG00000112306 RPS12 844020 sc-eQTL 2.99e-01 0.0844 0.0811 0.06 CD4T L1
ENSG00000118515 SGK1 -659523 sc-eQTL 3.88e-01 0.0944 0.109 0.06 CD4T L1
ENSG00000146409 SLC18B1 845250 sc-eQTL 3.85e-01 0.143 0.164 0.06 CD4T L1
ENSG00000028839 TBPL1 -293581 sc-eQTL 9.17e-02 -0.219 0.129 0.06 CD8T L1
ENSG00000112303 VNN2 895130 sc-eQTL 4.44e-01 -0.121 0.158 0.06 CD8T L1
ENSG00000112306 RPS12 844020 sc-eQTL 3.43e-01 0.0513 0.054 0.06 CD8T L1
ENSG00000118515 SGK1 -659523 sc-eQTL 5.88e-01 0.0452 0.0833 0.06 CD8T L1
ENSG00000146409 SLC18B1 845250 sc-eQTL 2.49e-01 -0.188 0.163 0.06 CD8T L1
ENSG00000028839 TBPL1 -293581 sc-eQTL 2.11e-01 -0.26 0.207 0.061 DC L1
ENSG00000093134 VNN3 923824 sc-eQTL 4.86e-01 -0.112 0.16 0.061 DC L1
ENSG00000112299 VNN1 944534 sc-eQTL 1.10e-01 -0.276 0.172 0.061 DC L1
ENSG00000112303 VNN2 895130 sc-eQTL 4.29e-01 -0.147 0.185 0.061 DC L1
ENSG00000112306 RPS12 844020 sc-eQTL 3.28e-02 0.22 0.103 0.061 DC L1
ENSG00000118515 SGK1 -659523 sc-eQTL 1.93e-01 -0.156 0.12 0.061 DC L1
ENSG00000146409 SLC18B1 845250 sc-eQTL 6.37e-01 -0.0775 0.164 0.061 DC L1
ENSG00000286438 AL591115.1 555461 sc-eQTL 5.31e-02 0.288 0.148 0.061 DC L1
ENSG00000286887 AL355881.1 -637712 sc-eQTL 8.83e-01 -0.0274 0.186 0.061 DC L1
ENSG00000028839 TBPL1 -293581 sc-eQTL 2.87e-01 -0.15 0.141 0.06 Mono L1
ENSG00000093134 VNN3 923824 sc-eQTL 2.62e-01 0.182 0.162 0.06 Mono L1
ENSG00000112299 VNN1 944534 sc-eQTL 7.70e-01 0.051 0.174 0.06 Mono L1
ENSG00000112303 VNN2 895130 sc-eQTL 8.08e-01 -0.03 0.123 0.06 Mono L1
ENSG00000112306 RPS12 844020 sc-eQTL 1.35e-01 0.11 0.0734 0.06 Mono L1
ENSG00000118515 SGK1 -659523 sc-eQTL 9.50e-01 0.00652 0.104 0.06 Mono L1
ENSG00000146409 SLC18B1 845250 sc-eQTL 2.34e-01 -0.174 0.145 0.06 Mono L1
ENSG00000286887 AL355881.1 -637712 sc-eQTL 8.98e-01 -0.0183 0.143 0.06 Mono L1
ENSG00000028839 TBPL1 -293581 sc-eQTL 8.60e-01 0.027 0.153 0.058 NK L1
ENSG00000112303 VNN2 895130 sc-eQTL 3.70e-02 -0.366 0.174 0.058 NK L1
ENSG00000112306 RPS12 844020 sc-eQTL 8.77e-01 -0.0113 0.0729 0.058 NK L1
ENSG00000118515 SGK1 -659523 sc-eQTL 9.04e-02 -0.228 0.134 0.058 NK L1
ENSG00000028839 TBPL1 -293581 sc-eQTL 2.84e-01 -0.195 0.181 0.06 Other_T L1
ENSG00000112303 VNN2 895130 sc-eQTL 3.65e-01 -0.157 0.173 0.06 Other_T L1
ENSG00000112306 RPS12 844020 sc-eQTL 9.70e-01 -0.00254 0.0686 0.06 Other_T L1
ENSG00000118515 SGK1 -659523 sc-eQTL 8.44e-01 0.0249 0.126 0.06 Other_T L1
ENSG00000146409 SLC18B1 845250 sc-eQTL 3.15e-01 0.188 0.187 0.06 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000028839 TBPL1 -293581 sc-eQTL 3.51e-01 -0.188 0.202 0.064 B_Activated L2
ENSG00000112303 VNN2 895130 sc-eQTL 5.36e-01 -0.114 0.184 0.064 B_Activated L2
ENSG00000112306 RPS12 844020 sc-eQTL 2.17e-01 0.122 0.0983 0.064 B_Activated L2
ENSG00000118515 SGK1 -659523 sc-eQTL 4.74e-01 -0.126 0.176 0.064 B_Activated L2
ENSG00000146409 SLC18B1 845250 sc-eQTL 6.02e-01 -0.0902 0.173 0.064 B_Activated L2
ENSG00000028839 TBPL1 -293581 sc-eQTL 4.05e-01 0.163 0.196 0.06 B_Intermediate L2
ENSG00000112303 VNN2 895130 sc-eQTL 3.01e-01 0.175 0.169 0.06 B_Intermediate L2
ENSG00000112306 RPS12 844020 sc-eQTL 1.62e-01 0.145 0.103 0.06 B_Intermediate L2
ENSG00000118515 SGK1 -659523 sc-eQTL 3.14e-01 -0.181 0.179 0.06 B_Intermediate L2
ENSG00000146409 SLC18B1 845250 sc-eQTL 5.58e-01 -0.11 0.187 0.06 B_Intermediate L2
ENSG00000028839 TBPL1 -293581 sc-eQTL 8.01e-01 -0.0468 0.185 0.06 B_Memory L2
ENSG00000112303 VNN2 895130 sc-eQTL 8.65e-01 0.0298 0.176 0.06 B_Memory L2
ENSG00000112306 RPS12 844020 sc-eQTL 8.16e-01 -0.0198 0.0846 0.06 B_Memory L2
ENSG00000118515 SGK1 -659523 sc-eQTL 6.49e-01 0.0706 0.155 0.06 B_Memory L2
ENSG00000146409 SLC18B1 845250 sc-eQTL 6.41e-01 0.0825 0.176 0.06 B_Memory L2
ENSG00000028839 TBPL1 -293581 sc-eQTL 5.57e-01 0.105 0.178 0.06 B_Naive1 L2
ENSG00000112303 VNN2 895130 sc-eQTL 6.94e-01 -0.0655 0.166 0.06 B_Naive1 L2
ENSG00000112306 RPS12 844020 sc-eQTL 9.83e-01 -0.00204 0.0948 0.06 B_Naive1 L2
ENSG00000118515 SGK1 -659523 sc-eQTL 9.39e-01 0.0114 0.148 0.06 B_Naive1 L2
ENSG00000146409 SLC18B1 845250 sc-eQTL 3.44e-01 0.173 0.183 0.06 B_Naive1 L2
ENSG00000028839 TBPL1 -293581 sc-eQTL 5.70e-01 -0.107 0.189 0.06 B_Naive2 L2
ENSG00000112303 VNN2 895130 sc-eQTL 7.06e-01 -0.0697 0.184 0.06 B_Naive2 L2
ENSG00000112306 RPS12 844020 sc-eQTL 8.05e-01 -0.0242 0.0976 0.06 B_Naive2 L2
ENSG00000118515 SGK1 -659523 sc-eQTL 5.52e-01 -0.103 0.172 0.06 B_Naive2 L2
ENSG00000146409 SLC18B1 845250 sc-eQTL 2.83e-01 0.2 0.186 0.06 B_Naive2 L2
ENSG00000028839 TBPL1 -293581 sc-eQTL 3.39e-01 -0.176 0.184 0.061 CD4_CTL L2
ENSG00000112303 VNN2 895130 sc-eQTL 2.09e-01 0.232 0.184 0.061 CD4_CTL L2
ENSG00000112306 RPS12 844020 sc-eQTL 2.03e-01 0.108 0.0849 0.061 CD4_CTL L2
ENSG00000118515 SGK1 -659523 sc-eQTL 8.06e-01 -0.0363 0.148 0.061 CD4_CTL L2
ENSG00000146409 SLC18B1 845250 sc-eQTL 1.41e-01 -0.253 0.171 0.061 CD4_CTL L2
ENSG00000028839 TBPL1 -293581 sc-eQTL 7.21e-01 0.0547 0.153 0.06 CD4_Naive L2
ENSG00000112303 VNN2 895130 sc-eQTL 1.32e-01 -0.209 0.138 0.06 CD4_Naive L2
ENSG00000112306 RPS12 844020 sc-eQTL 1.24e-01 0.138 0.0896 0.06 CD4_Naive L2
ENSG00000118515 SGK1 -659523 sc-eQTL 5.20e-01 0.071 0.11 0.06 CD4_Naive L2
ENSG00000146409 SLC18B1 845250 sc-eQTL 3.32e-01 0.168 0.173 0.06 CD4_Naive L2
ENSG00000028839 TBPL1 -293581 sc-eQTL 2.21e-02 0.369 0.16 0.06 CD4_TCM L2
ENSG00000112303 VNN2 895130 sc-eQTL 9.54e-01 0.00933 0.161 0.06 CD4_TCM L2
ENSG00000112306 RPS12 844020 sc-eQTL 2.50e-01 0.0958 0.0831 0.06 CD4_TCM L2
ENSG00000118515 SGK1 -659523 sc-eQTL 1.85e-01 0.155 0.116 0.06 CD4_TCM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 845250 sc-eQTL 4.18e-01 0.156 0.193 0.06 CD4_TCM L2
ENSG00000028839 TBPL1 -293581 sc-eQTL 5.73e-01 0.104 0.185 0.06 CD4_TEM L2
ENSG00000112303 VNN2 895130 sc-eQTL 1.22e-01 0.274 0.177 0.06 CD4_TEM L2
ENSG00000112306 RPS12 844020 sc-eQTL 7.86e-01 0.0198 0.0728 0.06 CD4_TEM L2
ENSG00000118515 SGK1 -659523 sc-eQTL 4.37e-01 0.0972 0.125 0.06 CD4_TEM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 845250 sc-eQTL 1.59e-02 -0.434 0.178 0.06 CD4_TEM L2
ENSG00000028839 TBPL1 -293581 sc-eQTL 6.82e-01 -0.0698 0.17 0.06 CD8_CTL L2
ENSG00000112303 VNN2 895130 sc-eQTL 3.10e-01 -0.183 0.18 0.06 CD8_CTL L2
ENSG00000112306 RPS12 844020 sc-eQTL 8.71e-01 -0.0158 0.0967 0.06 CD8_CTL L2
ENSG00000118515 SGK1 -659523 sc-eQTL 1.35e-01 -0.244 0.162 0.06 CD8_CTL L2
ENSG00000146409 SLC18B1 845250 sc-eQTL 1.75e-01 -0.254 0.187 0.06 CD8_CTL L2
ENSG00000028839 TBPL1 -293581 sc-eQTL 1.79e-01 -0.237 0.175 0.06 CD8_Naive L2
ENSG00000112303 VNN2 895130 sc-eQTL 7.67e-01 0.0479 0.162 0.06 CD8_Naive L2
ENSG00000112306 RPS12 844020 sc-eQTL 7.50e-02 0.165 0.092 0.06 CD8_Naive L2
ENSG00000118515 SGK1 -659523 sc-eQTL 5.54e-01 0.0689 0.116 0.06 CD8_Naive L2
ENSG00000146409 SLC18B1 845250 sc-eQTL 8.27e-01 0.0407 0.186 0.06 CD8_Naive L2
ENSG00000028839 TBPL1 -293581 sc-eQTL 1.86e-02 0.458 0.193 0.062 CD8_TCM L2
ENSG00000112303 VNN2 895130 sc-eQTL 4.35e-01 -0.141 0.18 0.062 CD8_TCM L2
ENSG00000112306 RPS12 844020 sc-eQTL 3.22e-01 0.0869 0.0875 0.062 CD8_TCM L2
ENSG00000118515 SGK1 -659523 sc-eQTL 9.34e-01 0.012 0.145 0.062 CD8_TCM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 845250 sc-eQTL 5.99e-01 0.101 0.192 0.062 CD8_TCM L2
ENSG00000028839 TBPL1 -293581 sc-eQTL 4.26e-01 -0.144 0.18 0.059 CD8_TEM L2
ENSG00000112303 VNN2 895130 sc-eQTL 2.85e-01 -0.209 0.195 0.059 CD8_TEM L2
ENSG00000112306 RPS12 844020 sc-eQTL 5.87e-01 -0.0572 0.105 0.059 CD8_TEM L2
ENSG00000118515 SGK1 -659523 sc-eQTL 1.99e-01 -0.222 0.172 0.059 CD8_TEM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 845250 sc-eQTL 3.10e-01 0.202 0.199 0.059 CD8_TEM L2
ENSG00000028839 TBPL1 -293581 sc-eQTL 5.99e-01 -0.1 0.19 0.061 MAIT L2
ENSG00000112303 VNN2 895130 sc-eQTL 7.96e-01 -0.0477 0.184 0.061 MAIT L2
ENSG00000112306 RPS12 844020 sc-eQTL 3.92e-01 0.0776 0.0904 0.061 MAIT L2
ENSG00000118515 SGK1 -659523 sc-eQTL 5.89e-01 -0.0689 0.127 0.061 MAIT L2
ENSG00000146409 SLC18B1 845250 sc-eQTL 7.79e-01 0.0534 0.19 0.061 MAIT L2
ENSG00000028839 TBPL1 -293581 sc-eQTL 8.54e-01 -0.0382 0.208 0.056 NK_CD56bright L2
ENSG00000112303 VNN2 895130 sc-eQTL 5.76e-02 -0.37 0.194 0.056 NK_CD56bright L2
ENSG00000112306 RPS12 844020 sc-eQTL 8.23e-01 0.0244 0.109 0.056 NK_CD56bright L2
ENSG00000118515 SGK1 -659523 sc-eQTL 7.81e-01 -0.0452 0.163 0.056 NK_CD56bright L2
ENSG00000028839 TBPL1 -293581 sc-eQTL 1.16e-01 0.257 0.163 0.058 NK_CD56dim L2
ENSG00000112303 VNN2 895130 sc-eQTL 3.72e-01 -0.168 0.187 0.058 NK_CD56dim L2
ENSG00000112306 RPS12 844020 sc-eQTL 9.45e-01 0.00514 0.0745 0.058 NK_CD56dim L2
ENSG00000118515 SGK1 -659523 sc-eQTL 1.13e-02 -0.415 0.163 0.058 NK_CD56dim L2
ENSG00000028839 TBPL1 -293581 sc-eQTL 8.04e-01 0.0537 0.216 0.057 NK_HLA L2
ENSG00000112303 VNN2 895130 sc-eQTL 5.16e-01 -0.129 0.199 0.057 NK_HLA L2
ENSG00000112306 RPS12 844020 sc-eQTL 2.75e-01 -0.101 0.0923 0.057 NK_HLA L2
ENSG00000118515 SGK1 -659523 sc-eQTL 7.79e-01 -0.0515 0.183 0.057 NK_HLA L2
ENSG00000028839 TBPL1 -293581 sc-eQTL 7.11e-01 0.0628 0.169 0.058 NK_cytokine L2
ENSG00000112303 VNN2 895130 sc-eQTL 1.93e-01 -0.24 0.184 0.058 NK_cytokine L2
ENSG00000112306 RPS12 844020 sc-eQTL 4.72e-01 -0.072 0.0999 0.058 NK_cytokine L2
ENSG00000118515 SGK1 -659523 sc-eQTL 3.91e-02 -0.342 0.165 0.058 NK_cytokine L2
ENSG00000028839 TBPL1 -293581 sc-eQTL 4.00e-01 -0.185 0.22 0.059 PB L2
ENSG00000112303 VNN2 895130 sc-eQTL 5.93e-01 -0.102 0.191 0.059 PB L2
ENSG00000112306 RPS12 844020 sc-eQTL 8.69e-01 -0.018 0.109 0.059 PB L2
ENSG00000118515 SGK1 -659523 sc-eQTL 4.75e-02 0.346 0.173 0.059 PB L2
ENSG00000146409 SLC18B1 845250 sc-eQTL 1.96e-01 0.263 0.202 0.059 PB L2
ENSG00000028839 TBPL1 -293581 sc-eQTL 7.75e-01 0.0555 0.194 0.061 Pro_T L2
ENSG00000112303 VNN2 895130 sc-eQTL 9.39e-01 0.0143 0.186 0.061 Pro_T L2
ENSG00000112306 RPS12 844020 sc-eQTL 7.45e-01 0.0228 0.0702 0.061 Pro_T L2
ENSG00000118515 SGK1 -659523 sc-eQTL 3.42e-01 0.134 0.14 0.061 Pro_T L2
ENSG00000146409 SLC18B1 845250 sc-eQTL 1.41e-02 0.443 0.179 0.061 Pro_T L2
ENSG00000028839 TBPL1 -293581 sc-eQTL 8.41e-01 -0.0384 0.191 0.06 Treg L2
ENSG00000112303 VNN2 895130 sc-eQTL 3.52e-01 0.141 0.151 0.06 Treg L2
ENSG00000112306 RPS12 844020 sc-eQTL 8.06e-01 0.0165 0.067 0.06 Treg L2
ENSG00000118515 SGK1 -659523 sc-eQTL 2.54e-01 -0.161 0.141 0.06 Treg L2
ENSG00000146409 SLC18B1 845250 sc-eQTL 2.62e-02 0.419 0.187 0.06 Treg L2
ENSG00000028839 TBPL1 -293581 sc-eQTL 3.46e-01 -0.202 0.214 0.054 cDC L2
ENSG00000093134 VNN3 923824 sc-eQTL 5.41e-01 0.102 0.167 0.054 cDC L2
ENSG00000112299 VNN1 944534 sc-eQTL 4.20e-01 -0.158 0.196 0.054 cDC L2
ENSG00000112303 VNN2 895130 sc-eQTL 1.94e-01 -0.249 0.191 0.054 cDC L2
ENSG00000112306 RPS12 844020 sc-eQTL 1.23e-01 0.146 0.0939 0.054 cDC L2
ENSG00000118515 SGK1 -659523 sc-eQTL 2.69e-01 -0.176 0.159 0.054 cDC L2
ENSG00000146409 SLC18B1 845250 sc-eQTL 5.06e-01 -0.124 0.187 0.054 cDC L2
ENSG00000286438 AL591115.1 555461 sc-eQTL 4.18e-01 0.121 0.149 0.054 cDC L2
ENSG00000286887 AL355881.1 -637712 sc-eQTL 7.56e-01 -0.0573 0.184 0.054 cDC L2
ENSG00000028839 TBPL1 -293581 sc-eQTL 4.67e-01 -0.118 0.161 0.06 cMono_IL1B L2
ENSG00000093134 VNN3 923824 sc-eQTL 1.36e-01 0.258 0.172 0.06 cMono_IL1B L2
ENSG00000112299 VNN1 944534 sc-eQTL 3.49e-01 0.164 0.174 0.06 cMono_IL1B L2
ENSG00000112303 VNN2 895130 sc-eQTL 7.08e-01 -0.0524 0.14 0.06 cMono_IL1B L2
ENSG00000112306 RPS12 844020 sc-eQTL 5.36e-02 0.149 0.0769 0.06 cMono_IL1B L2
ENSG00000118515 SGK1 -659523 sc-eQTL 7.69e-01 -0.034 0.116 0.06 cMono_IL1B L2
ENSG00000146409 SLC18B1 845250 sc-eQTL 2.77e-01 -0.163 0.149 0.06 cMono_IL1B L2
ENSG00000286887 AL355881.1 -637712 sc-eQTL 7.02e-01 0.0597 0.156 0.06 cMono_IL1B L2
ENSG00000028839 TBPL1 -293581 sc-eQTL 4.60e-01 0.135 0.183 0.06 cMono_S100A L2
ENSG00000093134 VNN3 923824 sc-eQTL 8.22e-01 0.0371 0.165 0.06 cMono_S100A L2
ENSG00000112299 VNN1 944534 sc-eQTL 9.71e-01 -0.00645 0.179 0.06 cMono_S100A L2
ENSG00000112303 VNN2 895130 sc-eQTL 4.68e-01 -0.0851 0.117 0.06 cMono_S100A L2
ENSG00000112306 RPS12 844020 sc-eQTL 3.52e-01 0.0787 0.0843 0.06 cMono_S100A L2
ENSG00000118515 SGK1 -659523 sc-eQTL 7.87e-01 -0.0261 0.0965 0.06 cMono_S100A L2
ENSG00000146409 SLC18B1 845250 sc-eQTL 2.11e-01 -0.195 0.156 0.06 cMono_S100A L2
ENSG00000286887 AL355881.1 -637712 sc-eQTL 4.47e-01 -0.116 0.153 0.06 cMono_S100A L2
ENSG00000028839 TBPL1 -293581 sc-eQTL 7.42e-01 -0.0877 0.266 0.055 gdT L2
ENSG00000112303 VNN2 895130 sc-eQTL 6.57e-01 0.113 0.253 0.055 gdT L2
ENSG00000112306 RPS12 844020 sc-eQTL 6.03e-01 0.0501 0.0962 0.055 gdT L2
ENSG00000118515 SGK1 -659523 sc-eQTL 1.66e-01 -0.251 0.18 0.055 gdT L2
ENSG00000146409 SLC18B1 845250 sc-eQTL 9.47e-01 -0.0164 0.249 0.055 gdT L2
ENSG00000028839 TBPL1 -293581 sc-eQTL 2.71e-01 -0.207 0.187 0.058 intMono L2
ENSG00000093134 VNN3 923824 sc-eQTL 9.90e-01 0.00236 0.181 0.058 intMono L2
ENSG00000112299 VNN1 944534 sc-eQTL 1.51e-01 0.256 0.178 0.058 intMono L2
ENSG00000112303 VNN2 895130 sc-eQTL 5.99e-01 -0.0956 0.182 0.058 intMono L2
ENSG00000112306 RPS12 844020 sc-eQTL 5.05e-01 0.0528 0.079 0.058 intMono L2
ENSG00000118515 SGK1 -659523 sc-eQTL 7.41e-01 0.044 0.133 0.058 intMono L2
ENSG00000146409 SLC18B1 845250 sc-eQTL 9.75e-01 -0.00595 0.193 0.058 intMono L2
ENSG00000286887 AL355881.1 -637712 sc-eQTL 7.97e-01 -0.0475 0.184 0.058 intMono L2
ENSG00000028839 TBPL1 -293581 sc-eQTL 9.55e-01 -0.0114 0.202 0.052 ncMono L2
ENSG00000093134 VNN3 923824 sc-eQTL 3.50e-02 -0.405 0.191 0.052 ncMono L2
ENSG00000112299 VNN1 944534 sc-eQTL 2.03e-01 -0.244 0.191 0.052 ncMono L2
ENSG00000112303 VNN2 895130 sc-eQTL 2.97e-01 -0.192 0.184 0.052 ncMono L2
ENSG00000112306 RPS12 844020 sc-eQTL 5.69e-01 -0.0526 0.0923 0.052 ncMono L2
ENSG00000118515 SGK1 -659523 sc-eQTL 8.68e-01 0.0217 0.131 0.052 ncMono L2
ENSG00000146409 SLC18B1 845250 sc-eQTL 8.39e-01 0.0331 0.163 0.052 ncMono L2
ENSG00000286887 AL355881.1 -637712 sc-eQTL 5.41e-02 -0.331 0.171 0.052 ncMono L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000028839 TBPL1 -293581 sc-eQTL 9.27e-01 -0.0174 0.189 0.06 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 895130 sc-eQTL 5.34e-01 0.102 0.164 0.06 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 844020 sc-eQTL 4.37e-01 0.0727 0.0934 0.06 B_Memory LOneK1K
ENSG00000118515 SGK1 -659523 sc-eQTL 2.48e-01 -0.169 0.146 0.06 B_Memory LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 845250 sc-eQTL 5.74e-01 -0.0965 0.172 0.06 B_Memory LOneK1K
ENSG00000028839 TBPL1 -293581 sc-eQTL 6.88e-01 0.0724 0.18 0.06 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 895130 sc-eQTL 3.54e-01 -0.146 0.157 0.06 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 844020 sc-eQTL 8.12e-01 -0.0226 0.0951 0.06 B_Naive LOneK1K
ENSG00000118515 SGK1 -659523 sc-eQTL 8.96e-01 0.0193 0.147 0.06 B_Naive LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 845250 sc-eQTL 2.38e-01 0.212 0.179 0.06 B_Naive LOneK1K
ENSG00000028839 TBPL1 -293581 sc-eQTL 4.86e-01 -0.103 0.147 0.06 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000093134 VNN3 923824 sc-eQTL 2.37e-01 0.198 0.167 0.06 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112299 VNN1 944534 sc-eQTL 3.85e-01 0.152 0.174 0.06 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 895130 sc-eQTL 6.66e-01 -0.0499 0.115 0.06 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 844020 sc-eQTL 6.64e-02 0.145 0.0784 0.06 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000118515 SGK1 -659523 sc-eQTL 7.43e-01 -0.0353 0.108 0.06 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 845250 sc-eQTL 6.18e-02 -0.262 0.14 0.06 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000286887 AL355881.1 -637712 sc-eQTL 9.20e-01 0.0148 0.148 0.06 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000028839 TBPL1 -293581 sc-eQTL 6.15e-01 -0.0971 0.193 0.058 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000093134 VNN3 923824 sc-eQTL 4.74e-02 -0.37 0.186 0.058 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112299 VNN1 944534 sc-eQTL 3.66e-01 -0.168 0.185 0.058 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 895130 sc-eQTL 4.50e-01 -0.132 0.175 0.058 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 844020 sc-eQTL 9.69e-01 -0.00291 0.0743 0.058 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000118515 SGK1 -659523 sc-eQTL 9.57e-01 -0.00605 0.112 0.058 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 845250 sc-eQTL 9.91e-01 -0.00201 0.18 0.058 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000286887 AL355881.1 -637712 sc-eQTL 3.90e-01 -0.14 0.163 0.058 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000028839 TBPL1 -293581 sc-eQTL 5.73e-01 0.0851 0.151 0.058 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 895130 sc-eQTL 8.52e-02 -0.308 0.178 0.058 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 844020 sc-eQTL 9.51e-01 0.00452 0.0732 0.058 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000118515 SGK1 -659523 sc-eQTL 7.09e-03 -0.404 0.149 0.058 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000028839 TBPL1 -293581 eQTL 0.0216 -0.0649 0.0282 0.00101 0.0 0.05

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina