logo

Genes within 1Mb (chr6:133648013:A:G):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000028839 TBPL1 -304157 sc-eQTL 3.88e-01 0.0866 0.1 0.214 B L1
ENSG00000112303 VNN2 884554 sc-eQTL 2.00e-01 0.0962 0.0748 0.214 B L1
ENSG00000112306 RPS12 833444 sc-eQTL 9.77e-01 0.0013 0.0454 0.214 B L1
ENSG00000118515 SGK1 -670099 sc-eQTL 1.62e-01 0.0978 0.0697 0.214 B L1
ENSG00000146409 SLC18B1 834674 sc-eQTL 6.07e-01 0.0493 0.0955 0.214 B L1
ENSG00000028839 TBPL1 -304157 sc-eQTL 7.38e-01 0.0247 0.0737 0.214 CD4T L1
ENSG00000112303 VNN2 884554 sc-eQTL 5.76e-01 -0.0372 0.0663 0.214 CD4T L1
ENSG00000112306 RPS12 833444 sc-eQTL 7.88e-01 0.0122 0.0451 0.214 CD4T L1
ENSG00000118515 SGK1 -670099 sc-eQTL 5.31e-01 -0.0381 0.0606 0.214 CD4T L1
ENSG00000146409 SLC18B1 834674 sc-eQTL 4.55e-01 0.0682 0.0912 0.214 CD4T L1
ENSG00000028839 TBPL1 -304157 sc-eQTL 1.92e-01 -0.096 0.0733 0.214 CD8T L1
ENSG00000112303 VNN2 884554 sc-eQTL 7.86e-01 -0.0244 0.0896 0.214 CD8T L1
ENSG00000112306 RPS12 833444 sc-eQTL 9.16e-01 0.00323 0.0306 0.214 CD8T L1
ENSG00000118515 SGK1 -670099 sc-eQTL 8.57e-01 0.00853 0.0472 0.214 CD8T L1
ENSG00000146409 SLC18B1 834674 sc-eQTL 9.26e-01 -0.00863 0.0926 0.214 CD8T L1
ENSG00000028839 TBPL1 -304157 sc-eQTL 1.06e-01 -0.185 0.114 0.216 DC L1
ENSG00000093134 VNN3 913248 sc-eQTL 6.86e-01 0.0357 0.0882 0.216 DC L1
ENSG00000112299 VNN1 933958 sc-eQTL 4.99e-01 0.0645 0.0952 0.216 DC L1
ENSG00000112303 VNN2 884554 sc-eQTL 6.91e-01 -0.0406 0.102 0.216 DC L1
ENSG00000112306 RPS12 833444 sc-eQTL 7.18e-03 0.152 0.0561 0.216 DC L1
ENSG00000118515 SGK1 -670099 sc-eQTL 7.80e-01 0.0186 0.0663 0.216 DC L1
ENSG00000146409 SLC18B1 834674 sc-eQTL 6.94e-01 0.0357 0.0904 0.216 DC L1
ENSG00000286438 AL591115.1 544885 sc-eQTL 1.04e-01 0.133 0.0818 0.216 DC L1
ENSG00000286887 AL355881.1 -648288 sc-eQTL 7.53e-01 0.0323 0.103 0.216 DC L1
ENSG00000028839 TBPL1 -304157 sc-eQTL 8.49e-01 0.0148 0.0777 0.214 Mono L1
ENSG00000093134 VNN3 913248 sc-eQTL 3.55e-01 0.0826 0.0891 0.214 Mono L1
ENSG00000112299 VNN1 933958 sc-eQTL 8.95e-01 -0.0126 0.0961 0.214 Mono L1
ENSG00000112303 VNN2 884554 sc-eQTL 3.13e-01 0.0683 0.0676 0.214 Mono L1
ENSG00000112306 RPS12 833444 sc-eQTL 2.81e-01 0.0438 0.0405 0.214 Mono L1
ENSG00000118515 SGK1 -670099 sc-eQTL 3.07e-01 0.0586 0.0572 0.214 Mono L1
ENSG00000146409 SLC18B1 834674 sc-eQTL 2.78e-02 -0.176 0.0795 0.214 Mono L1
ENSG00000286887 AL355881.1 -648288 sc-eQTL 6.33e-01 0.0378 0.0789 0.214 Mono L1
ENSG00000028839 TBPL1 -304157 sc-eQTL 3.86e-01 -0.0741 0.0853 0.212 NK L1
ENSG00000112303 VNN2 884554 sc-eQTL 1.62e-02 -0.235 0.097 0.212 NK L1
ENSG00000112306 RPS12 833444 sc-eQTL 3.08e-01 -0.0415 0.0406 0.212 NK L1
ENSG00000118515 SGK1 -670099 sc-eQTL 6.07e-01 -0.0387 0.0752 0.212 NK L1
ENSG00000028839 TBPL1 -304157 sc-eQTL 7.04e-01 0.0391 0.103 0.214 Other_T L1
ENSG00000112303 VNN2 884554 sc-eQTL 6.69e-01 0.0417 0.0976 0.214 Other_T L1
ENSG00000112306 RPS12 833444 sc-eQTL 8.88e-01 -0.00546 0.0387 0.214 Other_T L1
ENSG00000118515 SGK1 -670099 sc-eQTL 7.90e-01 0.0189 0.0712 0.214 Other_T L1
ENSG00000146409 SLC18B1 834674 sc-eQTL 7.05e-02 0.191 0.105 0.214 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000028839 TBPL1 -304157 sc-eQTL 2.47e-01 -0.144 0.124 0.202 B_Activated L2
ENSG00000112303 VNN2 884554 sc-eQTL 7.28e-01 0.0394 0.113 0.202 B_Activated L2
ENSG00000112306 RPS12 833444 sc-eQTL 3.30e-01 0.059 0.0604 0.202 B_Activated L2
ENSG00000118515 SGK1 -670099 sc-eQTL 9.28e-01 0.00974 0.108 0.202 B_Activated L2
ENSG00000146409 SLC18B1 834674 sc-eQTL 7.23e-01 0.0377 0.106 0.202 B_Activated L2
ENSG00000028839 TBPL1 -304157 sc-eQTL 3.47e-01 -0.107 0.113 0.215 B_Intermediate L2
ENSG00000112303 VNN2 884554 sc-eQTL 5.97e-01 0.0518 0.098 0.215 B_Intermediate L2
ENSG00000112306 RPS12 833444 sc-eQTL 8.34e-01 -0.0126 0.0601 0.215 B_Intermediate L2
ENSG00000118515 SGK1 -670099 sc-eQTL 1.37e-01 0.154 0.103 0.215 B_Intermediate L2
ENSG00000146409 SLC18B1 834674 sc-eQTL 9.95e-01 0.000648 0.108 0.215 B_Intermediate L2
ENSG00000028839 TBPL1 -304157 sc-eQTL 7.58e-01 0.0332 0.108 0.216 B_Memory L2
ENSG00000112303 VNN2 884554 sc-eQTL 3.67e-02 0.212 0.101 0.216 B_Memory L2
ENSG00000112306 RPS12 833444 sc-eQTL 5.26e-01 -0.0312 0.0491 0.216 B_Memory L2
ENSG00000118515 SGK1 -670099 sc-eQTL 1.19e-03 0.289 0.0879 0.216 B_Memory L2
ENSG00000146409 SLC18B1 834674 sc-eQTL 7.05e-01 0.0389 0.103 0.216 B_Memory L2
ENSG00000028839 TBPL1 -304157 sc-eQTL 5.24e-01 0.0639 0.1 0.214 B_Naive1 L2
ENSG00000112303 VNN2 884554 sc-eQTL 9.46e-02 0.156 0.093 0.214 B_Naive1 L2
ENSG00000112306 RPS12 833444 sc-eQTL 3.83e-01 -0.0465 0.0532 0.214 B_Naive1 L2
ENSG00000118515 SGK1 -670099 sc-eQTL 7.09e-01 0.0312 0.0834 0.214 B_Naive1 L2
ENSG00000146409 SLC18B1 834674 sc-eQTL 8.07e-01 0.0252 0.103 0.214 B_Naive1 L2
ENSG00000028839 TBPL1 -304157 sc-eQTL 3.84e-01 0.0936 0.107 0.215 B_Naive2 L2
ENSG00000112303 VNN2 884554 sc-eQTL 9.13e-01 -0.0115 0.105 0.215 B_Naive2 L2
ENSG00000112306 RPS12 833444 sc-eQTL 1.20e-01 -0.0862 0.0552 0.215 B_Naive2 L2
ENSG00000118515 SGK1 -670099 sc-eQTL 9.58e-01 0.00513 0.098 0.215 B_Naive2 L2
ENSG00000146409 SLC18B1 834674 sc-eQTL 3.96e-01 0.0899 0.106 0.215 B_Naive2 L2
ENSG00000028839 TBPL1 -304157 sc-eQTL 9.68e-01 0.00424 0.106 0.209 CD4_CTL L2
ENSG00000112303 VNN2 884554 sc-eQTL 3.31e-01 0.103 0.106 0.209 CD4_CTL L2
ENSG00000112306 RPS12 833444 sc-eQTL 8.27e-01 -0.0107 0.049 0.209 CD4_CTL L2
ENSG00000118515 SGK1 -670099 sc-eQTL 6.91e-01 -0.0339 0.085 0.209 CD4_CTL L2
ENSG00000146409 SLC18B1 834674 sc-eQTL 9.74e-01 0.00328 0.0989 0.209 CD4_CTL L2
ENSG00000028839 TBPL1 -304157 sc-eQTL 6.68e-01 0.0363 0.0847 0.214 CD4_Naive L2
ENSG00000112303 VNN2 884554 sc-eQTL 3.36e-01 -0.074 0.0768 0.214 CD4_Naive L2
ENSG00000112306 RPS12 833444 sc-eQTL 3.64e-01 0.0453 0.0498 0.214 CD4_Naive L2
ENSG00000118515 SGK1 -670099 sc-eQTL 6.40e-01 -0.0286 0.0611 0.214 CD4_Naive L2
ENSG00000146409 SLC18B1 834674 sc-eQTL 5.03e-01 0.0643 0.096 0.214 CD4_Naive L2
ENSG00000028839 TBPL1 -304157 sc-eQTL 1.43e-01 0.132 0.0898 0.214 CD4_TCM L2
ENSG00000112303 VNN2 884554 sc-eQTL 8.56e-01 0.0163 0.0896 0.214 CD4_TCM L2
ENSG00000112306 RPS12 833444 sc-eQTL 7.09e-01 0.0173 0.0464 0.214 CD4_TCM L2
ENSG00000118515 SGK1 -670099 sc-eQTL 5.27e-01 0.0412 0.0649 0.214 CD4_TCM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 834674 sc-eQTL 8.34e-01 0.0226 0.108 0.214 CD4_TCM L2
ENSG00000028839 TBPL1 -304157 sc-eQTL 8.63e-02 -0.179 0.104 0.214 CD4_TEM L2
ENSG00000112303 VNN2 884554 sc-eQTL 1.90e-01 0.132 0.1 0.214 CD4_TEM L2
ENSG00000112306 RPS12 833444 sc-eQTL 8.53e-01 0.00767 0.0413 0.214 CD4_TEM L2
ENSG00000118515 SGK1 -670099 sc-eQTL 3.74e-01 0.0631 0.0708 0.214 CD4_TEM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 834674 sc-eQTL 8.75e-01 -0.0162 0.103 0.214 CD4_TEM L2
ENSG00000028839 TBPL1 -304157 sc-eQTL 8.29e-01 -0.0204 0.094 0.214 CD8_CTL L2
ENSG00000112303 VNN2 884554 sc-eQTL 3.90e-01 0.0859 0.0997 0.214 CD8_CTL L2
ENSG00000112306 RPS12 833444 sc-eQTL 3.05e-01 -0.0549 0.0533 0.214 CD8_CTL L2
ENSG00000118515 SGK1 -670099 sc-eQTL 3.36e-01 -0.0868 0.0901 0.214 CD8_CTL L2
ENSG00000146409 SLC18B1 834674 sc-eQTL 6.92e-01 -0.0411 0.104 0.214 CD8_CTL L2
ENSG00000028839 TBPL1 -304157 sc-eQTL 4.45e-01 -0.0758 0.0992 0.214 CD8_Naive L2
ENSG00000112303 VNN2 884554 sc-eQTL 3.92e-01 -0.0782 0.0911 0.214 CD8_Naive L2
ENSG00000112306 RPS12 833444 sc-eQTL 7.91e-02 0.0915 0.0519 0.214 CD8_Naive L2
ENSG00000118515 SGK1 -670099 sc-eQTL 8.78e-01 -0.0101 0.0656 0.214 CD8_Naive L2
ENSG00000146409 SLC18B1 834674 sc-eQTL 8.21e-01 -0.0238 0.105 0.214 CD8_Naive L2
ENSG00000028839 TBPL1 -304157 sc-eQTL 4.09e-01 0.0935 0.113 0.213 CD8_TCM L2
ENSG00000112303 VNN2 884554 sc-eQTL 5.46e-01 -0.0628 0.104 0.213 CD8_TCM L2
ENSG00000112306 RPS12 833444 sc-eQTL 8.35e-01 0.0106 0.0507 0.213 CD8_TCM L2
ENSG00000118515 SGK1 -670099 sc-eQTL 6.60e-02 -0.154 0.0832 0.213 CD8_TCM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 834674 sc-eQTL 8.29e-01 0.024 0.111 0.213 CD8_TCM L2
ENSG00000028839 TBPL1 -304157 sc-eQTL 1.73e-01 -0.14 0.102 0.217 CD8_TEM L2
ENSG00000112303 VNN2 884554 sc-eQTL 2.75e-01 -0.122 0.111 0.217 CD8_TEM L2
ENSG00000112306 RPS12 833444 sc-eQTL 5.11e-01 -0.0395 0.06 0.217 CD8_TEM L2
ENSG00000118515 SGK1 -670099 sc-eQTL 9.13e-01 0.0107 0.0983 0.217 CD8_TEM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 834674 sc-eQTL 6.36e-02 0.21 0.112 0.217 CD8_TEM L2
ENSG00000028839 TBPL1 -304157 sc-eQTL 3.14e-01 0.107 0.106 0.212 MAIT L2
ENSG00000112303 VNN2 884554 sc-eQTL 2.60e-01 0.116 0.103 0.212 MAIT L2
ENSG00000112306 RPS12 833444 sc-eQTL 4.41e-01 -0.0391 0.0506 0.212 MAIT L2
ENSG00000118515 SGK1 -670099 sc-eQTL 3.27e-01 0.07 0.0711 0.212 MAIT L2
ENSG00000146409 SLC18B1 834674 sc-eQTL 1.02e-01 0.173 0.106 0.212 MAIT L2
ENSG00000028839 TBPL1 -304157 sc-eQTL 1.33e-01 -0.173 0.115 0.207 NK_CD56bright L2
ENSG00000112303 VNN2 884554 sc-eQTL 5.96e-02 -0.204 0.108 0.207 NK_CD56bright L2
ENSG00000112306 RPS12 833444 sc-eQTL 8.49e-01 0.0115 0.0604 0.207 NK_CD56bright L2
ENSG00000118515 SGK1 -670099 sc-eQTL 2.12e-01 0.113 0.09 0.207 NK_CD56bright L2
ENSG00000028839 TBPL1 -304157 sc-eQTL 3.47e-01 0.0865 0.0919 0.211 NK_CD56dim L2
ENSG00000112303 VNN2 884554 sc-eQTL 9.39e-02 -0.176 0.105 0.211 NK_CD56dim L2
ENSG00000112306 RPS12 833444 sc-eQTL 4.75e-01 -0.0299 0.0418 0.211 NK_CD56dim L2
ENSG00000118515 SGK1 -670099 sc-eQTL 8.70e-01 -0.0151 0.0927 0.211 NK_CD56dim L2
ENSG00000028839 TBPL1 -304157 sc-eQTL 9.44e-01 -0.00846 0.12 0.205 NK_HLA L2
ENSG00000112303 VNN2 884554 sc-eQTL 5.60e-01 -0.0646 0.111 0.205 NK_HLA L2
ENSG00000112306 RPS12 833444 sc-eQTL 7.12e-01 -0.019 0.0515 0.205 NK_HLA L2
ENSG00000118515 SGK1 -670099 sc-eQTL 4.96e-01 -0.0695 0.102 0.205 NK_HLA L2
ENSG00000028839 TBPL1 -304157 sc-eQTL 1.91e-01 -0.124 0.0946 0.211 NK_cytokine L2
ENSG00000112303 VNN2 884554 sc-eQTL 1.88e-01 -0.136 0.103 0.211 NK_cytokine L2
ENSG00000112306 RPS12 833444 sc-eQTL 3.77e-01 -0.0496 0.056 0.211 NK_cytokine L2
ENSG00000118515 SGK1 -670099 sc-eQTL 3.01e-01 -0.0966 0.0931 0.211 NK_cytokine L2
ENSG00000028839 TBPL1 -304157 sc-eQTL 7.06e-01 0.0485 0.128 0.23 PB L2
ENSG00000112303 VNN2 884554 sc-eQTL 1.19e-02 -0.278 0.109 0.23 PB L2
ENSG00000112306 RPS12 833444 sc-eQTL 6.58e-01 0.0282 0.0634 0.23 PB L2
ENSG00000118515 SGK1 -670099 sc-eQTL 3.25e-02 0.217 0.1 0.23 PB L2
ENSG00000146409 SLC18B1 834674 sc-eQTL 3.14e-01 0.12 0.118 0.23 PB L2
ENSG00000028839 TBPL1 -304157 sc-eQTL 2.23e-01 0.129 0.106 0.215 Pro_T L2
ENSG00000112303 VNN2 884554 sc-eQTL 3.60e-01 -0.0931 0.101 0.215 Pro_T L2
ENSG00000112306 RPS12 833444 sc-eQTL 8.91e-01 0.00526 0.0384 0.215 Pro_T L2
ENSG00000118515 SGK1 -670099 sc-eQTL 6.22e-01 0.0381 0.077 0.215 Pro_T L2
ENSG00000146409 SLC18B1 834674 sc-eQTL 7.47e-02 0.177 0.0987 0.215 Pro_T L2
ENSG00000028839 TBPL1 -304157 sc-eQTL 8.62e-01 0.0186 0.107 0.214 Treg L2
ENSG00000112303 VNN2 884554 sc-eQTL 2.42e-01 -0.0992 0.0846 0.214 Treg L2
ENSG00000112306 RPS12 833444 sc-eQTL 9.38e-01 0.00292 0.0376 0.214 Treg L2
ENSG00000118515 SGK1 -670099 sc-eQTL 4.32e-01 -0.0622 0.079 0.214 Treg L2
ENSG00000146409 SLC18B1 834674 sc-eQTL 1.86e-01 0.14 0.106 0.214 Treg L2
ENSG00000028839 TBPL1 -304157 sc-eQTL 9.11e-01 -0.0134 0.12 0.198 cDC L2
ENSG00000093134 VNN3 913248 sc-eQTL 4.51e-01 0.0705 0.0934 0.198 cDC L2
ENSG00000112299 VNN1 933958 sc-eQTL 2.75e-01 0.12 0.11 0.198 cDC L2
ENSG00000112303 VNN2 884554 sc-eQTL 1.27e-01 -0.163 0.106 0.198 cDC L2
ENSG00000112306 RPS12 833444 sc-eQTL 1.40e-01 0.078 0.0526 0.198 cDC L2
ENSG00000118515 SGK1 -670099 sc-eQTL 5.03e-01 0.0598 0.089 0.198 cDC L2
ENSG00000146409 SLC18B1 834674 sc-eQTL 5.22e-01 0.0671 0.105 0.198 cDC L2
ENSG00000286438 AL591115.1 544885 sc-eQTL 2.14e-01 0.104 0.0834 0.198 cDC L2
ENSG00000286887 AL355881.1 -648288 sc-eQTL 9.51e-01 -0.0063 0.103 0.198 cDC L2
ENSG00000028839 TBPL1 -304157 sc-eQTL 4.58e-01 0.0653 0.0879 0.214 cMono_IL1B L2
ENSG00000093134 VNN3 913248 sc-eQTL 2.74e-01 0.103 0.0941 0.214 cMono_IL1B L2
ENSG00000112299 VNN1 933958 sc-eQTL 9.00e-01 0.012 0.0952 0.214 cMono_IL1B L2
ENSG00000112303 VNN2 884554 sc-eQTL 2.87e-01 0.0811 0.0759 0.214 cMono_IL1B L2
ENSG00000112306 RPS12 833444 sc-eQTL 5.38e-02 0.0813 0.0419 0.214 cMono_IL1B L2
ENSG00000118515 SGK1 -670099 sc-eQTL 5.19e-01 0.0407 0.063 0.214 cMono_IL1B L2
ENSG00000146409 SLC18B1 834674 sc-eQTL 5.56e-02 -0.156 0.0809 0.214 cMono_IL1B L2
ENSG00000286887 AL355881.1 -648288 sc-eQTL 6.77e-01 0.0355 0.0849 0.214 cMono_IL1B L2
ENSG00000028839 TBPL1 -304157 sc-eQTL 4.03e-01 0.0838 0.0999 0.214 cMono_S100A L2
ENSG00000093134 VNN3 913248 sc-eQTL 8.80e-01 0.0136 0.0903 0.214 cMono_S100A L2
ENSG00000112299 VNN1 933958 sc-eQTL 5.02e-01 -0.0659 0.0979 0.214 cMono_S100A L2
ENSG00000112303 VNN2 884554 sc-eQTL 8.12e-01 -0.0153 0.0642 0.214 cMono_S100A L2
ENSG00000112306 RPS12 833444 sc-eQTL 4.17e-01 0.0375 0.0462 0.214 cMono_S100A L2
ENSG00000118515 SGK1 -670099 sc-eQTL 3.21e-01 0.0525 0.0528 0.214 cMono_S100A L2
ENSG00000146409 SLC18B1 834674 sc-eQTL 2.05e-01 -0.108 0.0852 0.214 cMono_S100A L2
ENSG00000286887 AL355881.1 -648288 sc-eQTL 1.86e-01 0.111 0.0833 0.214 cMono_S100A L2
ENSG00000028839 TBPL1 -304157 sc-eQTL 9.47e-02 -0.234 0.139 0.194 gdT L2
ENSG00000112303 VNN2 884554 sc-eQTL 1.59e-02 0.319 0.131 0.194 gdT L2
ENSG00000112306 RPS12 833444 sc-eQTL 9.13e-01 0.00559 0.0508 0.194 gdT L2
ENSG00000118515 SGK1 -670099 sc-eQTL 2.68e-01 -0.106 0.0955 0.194 gdT L2
ENSG00000146409 SLC18B1 834674 sc-eQTL 8.07e-01 -0.0322 0.131 0.194 gdT L2
ENSG00000028839 TBPL1 -304157 sc-eQTL 8.29e-01 -0.0222 0.103 0.216 intMono L2
ENSG00000093134 VNN3 913248 sc-eQTL 8.17e-01 0.023 0.0993 0.216 intMono L2
ENSG00000112299 VNN1 933958 sc-eQTL 4.90e-02 0.193 0.0972 0.216 intMono L2
ENSG00000112303 VNN2 884554 sc-eQTL 3.18e-01 -0.0996 0.0995 0.216 intMono L2
ENSG00000112306 RPS12 833444 sc-eQTL 1.05e-01 0.0703 0.0431 0.216 intMono L2
ENSG00000118515 SGK1 -670099 sc-eQTL 7.81e-01 0.0203 0.0729 0.216 intMono L2
ENSG00000146409 SLC18B1 834674 sc-eQTL 5.66e-01 0.0608 0.106 0.216 intMono L2
ENSG00000286887 AL355881.1 -648288 sc-eQTL 5.37e-01 -0.0625 0.101 0.216 intMono L2
ENSG00000028839 TBPL1 -304157 sc-eQTL 6.72e-01 0.0465 0.11 0.204 ncMono L2
ENSG00000093134 VNN3 913248 sc-eQTL 7.64e-01 -0.0315 0.105 0.204 ncMono L2
ENSG00000112299 VNN1 933958 sc-eQTL 9.07e-01 0.0121 0.104 0.204 ncMono L2
ENSG00000112303 VNN2 884554 sc-eQTL 3.94e-01 -0.0851 0.0997 0.204 ncMono L2
ENSG00000112306 RPS12 833444 sc-eQTL 9.29e-01 -0.00447 0.0501 0.204 ncMono L2
ENSG00000118515 SGK1 -670099 sc-eQTL 1.01e-01 0.116 0.0704 0.204 ncMono L2
ENSG00000146409 SLC18B1 834674 sc-eQTL 4.24e-01 -0.0707 0.0884 0.204 ncMono L2
ENSG00000286887 AL355881.1 -648288 sc-eQTL 1.77e-01 -0.126 0.0931 0.204 ncMono L2
ENSG00000028839 TBPL1 -304157 sc-eQTL 1.13e-01 -0.208 0.13 0.201 pDC L2
ENSG00000093134 VNN3 913248 sc-eQTL 4.85e-01 -0.0615 0.0878 0.201 pDC L2
ENSG00000112299 VNN1 933958 sc-eQTL 3.05e-01 -0.0918 0.0892 0.201 pDC L2
ENSG00000112303 VNN2 884554 sc-eQTL 7.31e-01 0.0366 0.107 0.201 pDC L2
ENSG00000112306 RPS12 833444 sc-eQTL 4.09e-03 0.208 0.0714 0.201 pDC L2
ENSG00000118515 SGK1 -670099 sc-eQTL 7.09e-01 0.0278 0.0745 0.201 pDC L2
ENSG00000146409 SLC18B1 834674 sc-eQTL 4.69e-01 -0.0787 0.108 0.201 pDC L2
ENSG00000286438 AL591115.1 544885 sc-eQTL 1.02e-01 0.169 0.103 0.201 pDC L2
ENSG00000286887 AL355881.1 -648288 sc-eQTL 5.87e-01 -0.0501 0.0921 0.201 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000028839 TBPL1 -304157 sc-eQTL 3.61e-01 -0.099 0.108 0.214 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 884554 sc-eQTL 3.52e-02 0.198 0.0934 0.214 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 833444 sc-eQTL 7.94e-01 -0.014 0.0538 0.214 B_Memory LOneK1K
ENSG00000118515 SGK1 -670099 sc-eQTL 1.29e-02 0.208 0.0828 0.214 B_Memory LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 834674 sc-eQTL 9.08e-01 0.0114 0.0987 0.214 B_Memory LOneK1K
ENSG00000028839 TBPL1 -304157 sc-eQTL 1.45e-01 0.146 0.0997 0.214 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 884554 sc-eQTL 4.28e-01 0.0695 0.0875 0.214 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 833444 sc-eQTL 2.42e-01 -0.062 0.0529 0.214 B_Naive LOneK1K
ENSG00000118515 SGK1 -670099 sc-eQTL 5.29e-01 0.0517 0.082 0.214 B_Naive LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 834674 sc-eQTL 4.46e-01 0.0763 0.0999 0.214 B_Naive LOneK1K
ENSG00000028839 TBPL1 -304157 sc-eQTL 5.77e-01 0.0447 0.0801 0.214 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000093134 VNN3 913248 sc-eQTL 3.27e-01 0.0891 0.0907 0.214 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112299 VNN1 933958 sc-eQTL 9.06e-01 -0.0112 0.0948 0.214 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 884554 sc-eQTL 5.70e-01 0.0356 0.0626 0.214 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 833444 sc-eQTL 6.51e-02 0.0791 0.0426 0.214 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000118515 SGK1 -670099 sc-eQTL 3.43e-01 0.0556 0.0585 0.214 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 834674 sc-eQTL 1.66e-02 -0.182 0.0755 0.214 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000286887 AL355881.1 -648288 sc-eQTL 3.30e-01 0.0781 0.08 0.214 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000028839 TBPL1 -304157 sc-eQTL 9.34e-01 0.0086 0.104 0.213 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000093134 VNN3 913248 sc-eQTL 7.08e-01 -0.0378 0.101 0.213 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112299 VNN1 933958 sc-eQTL 5.86e-01 0.0546 0.0999 0.213 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 884554 sc-eQTL 4.85e-01 -0.0659 0.0942 0.213 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 833444 sc-eQTL 1.00e+00 8.73e-06 0.04 0.213 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000118515 SGK1 -670099 sc-eQTL 3.44e-01 0.0573 0.0604 0.213 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 834674 sc-eQTL 8.47e-01 0.0187 0.0971 0.213 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000286887 AL355881.1 -648288 sc-eQTL 3.03e-01 -0.0904 0.0876 0.213 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000028839 TBPL1 -304157 sc-eQTL 3.87e-01 -0.0731 0.0843 0.211 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 884554 sc-eQTL 4.39e-02 -0.202 0.0995 0.211 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 833444 sc-eQTL 3.49e-01 -0.0384 0.0409 0.211 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000118515 SGK1 -670099 sc-eQTL 3.81e-01 -0.0743 0.0846 0.211 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000146409 SLC18B1 834674 eQTL 0.0427 0.0554 0.0273 0.0 0.0 0.192

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina