logo

Genes within 1Mb (chr6:133642549:GT:G):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000028839 TBPL1 -309621 sc-eQTL 7.62e-01 0.0429 0.142 0.113 B L1
ENSG00000112303 VNN2 879090 sc-eQTL 5.94e-02 0.199 0.105 0.113 B L1
ENSG00000112306 RPS12 827980 sc-eQTL 7.71e-01 -0.0186 0.0641 0.113 B L1
ENSG00000118515 SGK1 -675563 sc-eQTL 4.45e-01 0.0756 0.0987 0.113 B L1
ENSG00000146409 SLC18B1 829210 sc-eQTL 6.46e-01 -0.0621 0.135 0.113 B L1
ENSG00000028839 TBPL1 -309621 sc-eQTL 2.88e-01 0.112 0.105 0.113 CD4T L1
ENSG00000112303 VNN2 879090 sc-eQTL 9.51e-01 -0.00584 0.0947 0.113 CD4T L1
ENSG00000112306 RPS12 827980 sc-eQTL 8.47e-01 0.0125 0.0644 0.113 CD4T L1
ENSG00000118515 SGK1 -675563 sc-eQTL 5.39e-02 -0.166 0.0858 0.113 CD4T L1
ENSG00000146409 SLC18B1 829210 sc-eQTL 6.20e-01 -0.0646 0.13 0.113 CD4T L1
ENSG00000028839 TBPL1 -309621 sc-eQTL 9.73e-01 0.00344 0.102 0.113 CD8T L1
ENSG00000112303 VNN2 879090 sc-eQTL 1.75e-01 0.168 0.124 0.113 CD8T L1
ENSG00000112306 RPS12 827980 sc-eQTL 8.90e-01 -0.00588 0.0425 0.113 CD8T L1
ENSG00000118515 SGK1 -675563 sc-eQTL 4.01e-01 -0.055 0.0654 0.113 CD8T L1
ENSG00000146409 SLC18B1 829210 sc-eQTL 8.46e-01 0.0249 0.129 0.113 CD8T L1
ENSG00000028839 TBPL1 -309621 sc-eQTL 3.34e-01 -0.155 0.16 0.113 DC L1
ENSG00000093134 VNN3 907784 sc-eQTL 6.06e-01 0.0637 0.123 0.113 DC L1
ENSG00000112299 VNN1 928494 sc-eQTL 9.46e-01 -0.00899 0.133 0.113 DC L1
ENSG00000112303 VNN2 879090 sc-eQTL 8.85e-01 0.0207 0.143 0.113 DC L1
ENSG00000112306 RPS12 827980 sc-eQTL 3.28e-01 0.0783 0.0798 0.113 DC L1
ENSG00000118515 SGK1 -675563 sc-eQTL 5.06e-01 0.0619 0.0927 0.113 DC L1
ENSG00000146409 SLC18B1 829210 sc-eQTL 6.53e-01 0.057 0.127 0.113 DC L1
ENSG00000286438 AL591115.1 539421 sc-eQTL 9.05e-01 0.0138 0.115 0.113 DC L1
ENSG00000286887 AL355881.1 -653752 sc-eQTL 1.63e-01 0.2 0.143 0.113 DC L1
ENSG00000028839 TBPL1 -309621 sc-eQTL 2.49e-01 0.126 0.109 0.113 Mono L1
ENSG00000093134 VNN3 907784 sc-eQTL 7.01e-01 0.0484 0.126 0.113 Mono L1
ENSG00000112299 VNN1 928494 sc-eQTL 4.65e-01 -0.0989 0.135 0.113 Mono L1
ENSG00000112303 VNN2 879090 sc-eQTL 5.64e-02 0.182 0.0947 0.113 Mono L1
ENSG00000112306 RPS12 827980 sc-eQTL 8.10e-01 0.0138 0.0572 0.113 Mono L1
ENSG00000118515 SGK1 -675563 sc-eQTL 2.21e-01 0.0989 0.0806 0.113 Mono L1
ENSG00000146409 SLC18B1 829210 sc-eQTL 7.00e-02 -0.205 0.112 0.113 Mono L1
ENSG00000286887 AL355881.1 -653752 sc-eQTL 3.67e-01 0.101 0.111 0.113 Mono L1
ENSG00000028839 TBPL1 -309621 sc-eQTL 9.11e-01 0.0133 0.119 0.114 NK L1
ENSG00000112303 VNN2 879090 sc-eQTL 4.00e-01 -0.116 0.137 0.114 NK L1
ENSG00000112306 RPS12 827980 sc-eQTL 6.47e-01 -0.0261 0.0569 0.114 NK L1
ENSG00000118515 SGK1 -675563 sc-eQTL 5.51e-01 0.0628 0.105 0.114 NK L1
ENSG00000028839 TBPL1 -309621 sc-eQTL 4.76e-01 0.101 0.141 0.113 Other_T L1
ENSG00000112303 VNN2 879090 sc-eQTL 1.11e-01 0.214 0.134 0.113 Other_T L1
ENSG00000112306 RPS12 827980 sc-eQTL 5.03e-01 0.0357 0.0533 0.113 Other_T L1
ENSG00000118515 SGK1 -675563 sc-eQTL 8.53e-01 -0.0182 0.0981 0.113 Other_T L1
ENSG00000146409 SLC18B1 829210 sc-eQTL 6.68e-02 0.267 0.145 0.113 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000028839 TBPL1 -309621 sc-eQTL 3.63e-01 -0.159 0.174 0.099 B_Activated L2
ENSG00000112303 VNN2 879090 sc-eQTL 3.54e-01 0.148 0.159 0.099 B_Activated L2
ENSG00000112306 RPS12 827980 sc-eQTL 9.57e-01 -0.00456 0.0853 0.099 B_Activated L2
ENSG00000118515 SGK1 -675563 sc-eQTL 2.27e-01 0.184 0.151 0.099 B_Activated L2
ENSG00000146409 SLC18B1 829210 sc-eQTL 7.17e-01 0.0543 0.149 0.099 B_Activated L2
ENSG00000028839 TBPL1 -309621 sc-eQTL 4.14e-01 -0.129 0.158 0.114 B_Intermediate L2
ENSG00000112303 VNN2 879090 sc-eQTL 6.28e-01 0.0662 0.137 0.114 B_Intermediate L2
ENSG00000112306 RPS12 827980 sc-eQTL 4.80e-01 -0.0592 0.0835 0.114 B_Intermediate L2
ENSG00000118515 SGK1 -675563 sc-eQTL 5.65e-02 0.275 0.143 0.114 B_Intermediate L2
ENSG00000146409 SLC18B1 829210 sc-eQTL 5.05e-01 0.101 0.151 0.114 B_Intermediate L2
ENSG00000028839 TBPL1 -309621 sc-eQTL 3.03e-01 0.155 0.15 0.114 B_Memory L2
ENSG00000112303 VNN2 879090 sc-eQTL 2.14e-01 0.176 0.141 0.114 B_Memory L2
ENSG00000112306 RPS12 827980 sc-eQTL 5.21e-01 -0.0439 0.0684 0.114 B_Memory L2
ENSG00000118515 SGK1 -675563 sc-eQTL 1.10e-02 0.317 0.124 0.114 B_Memory L2
ENSG00000146409 SLC18B1 829210 sc-eQTL 3.30e-01 -0.139 0.142 0.114 B_Memory L2
ENSG00000028839 TBPL1 -309621 sc-eQTL 7.69e-01 -0.0411 0.14 0.113 B_Naive1 L2
ENSG00000112303 VNN2 879090 sc-eQTL 2.54e-02 0.291 0.129 0.113 B_Naive1 L2
ENSG00000112306 RPS12 827980 sc-eQTL 3.49e-01 -0.0696 0.0742 0.113 B_Naive1 L2
ENSG00000118515 SGK1 -675563 sc-eQTL 2.57e-01 -0.132 0.116 0.113 B_Naive1 L2
ENSG00000146409 SLC18B1 829210 sc-eQTL 5.88e-01 -0.0779 0.143 0.113 B_Naive1 L2
ENSG00000028839 TBPL1 -309621 sc-eQTL 2.96e-01 0.157 0.15 0.114 B_Naive2 L2
ENSG00000112303 VNN2 879090 sc-eQTL 7.11e-01 0.0543 0.146 0.114 B_Naive2 L2
ENSG00000112306 RPS12 827980 sc-eQTL 1.63e-01 -0.108 0.0771 0.114 B_Naive2 L2
ENSG00000118515 SGK1 -675563 sc-eQTL 6.36e-01 -0.0649 0.137 0.114 B_Naive2 L2
ENSG00000146409 SLC18B1 829210 sc-eQTL 5.94e-01 -0.0789 0.148 0.114 B_Naive2 L2
ENSG00000028839 TBPL1 -309621 sc-eQTL 4.10e-01 0.123 0.149 0.111 CD4_CTL L2
ENSG00000112303 VNN2 879090 sc-eQTL 1.55e-01 0.213 0.149 0.111 CD4_CTL L2
ENSG00000112306 RPS12 827980 sc-eQTL 1.91e-01 -0.0902 0.0688 0.111 CD4_CTL L2
ENSG00000118515 SGK1 -675563 sc-eQTL 4.53e-01 0.0899 0.12 0.111 CD4_CTL L2
ENSG00000146409 SLC18B1 829210 sc-eQTL 9.52e-01 0.00833 0.139 0.111 CD4_CTL L2
ENSG00000028839 TBPL1 -309621 sc-eQTL 2.49e-01 0.137 0.119 0.113 CD4_Naive L2
ENSG00000112303 VNN2 879090 sc-eQTL 8.77e-01 -0.0167 0.108 0.113 CD4_Naive L2
ENSG00000112306 RPS12 827980 sc-eQTL 6.43e-01 0.0325 0.0702 0.113 CD4_Naive L2
ENSG00000118515 SGK1 -675563 sc-eQTL 1.23e-01 -0.132 0.0855 0.113 CD4_Naive L2
ENSG00000146409 SLC18B1 829210 sc-eQTL 6.36e-01 -0.0639 0.135 0.113 CD4_Naive L2
ENSG00000028839 TBPL1 -309621 sc-eQTL 6.62e-01 0.056 0.128 0.113 CD4_TCM L2
ENSG00000112303 VNN2 879090 sc-eQTL 9.11e-01 0.0143 0.127 0.113 CD4_TCM L2
ENSG00000112306 RPS12 827980 sc-eQTL 7.84e-01 0.018 0.0658 0.113 CD4_TCM L2
ENSG00000118515 SGK1 -675563 sc-eQTL 4.61e-01 -0.068 0.0919 0.113 CD4_TCM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 829210 sc-eQTL 6.06e-01 -0.0786 0.152 0.113 CD4_TCM L2
ENSG00000028839 TBPL1 -309621 sc-eQTL 6.20e-02 -0.279 0.149 0.113 CD4_TEM L2
ENSG00000112303 VNN2 879090 sc-eQTL 5.06e-01 0.0958 0.144 0.113 CD4_TEM L2
ENSG00000112306 RPS12 827980 sc-eQTL 6.65e-01 0.0256 0.059 0.113 CD4_TEM L2
ENSG00000118515 SGK1 -675563 sc-eQTL 6.03e-01 0.0529 0.101 0.113 CD4_TEM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 829210 sc-eQTL 3.96e-01 0.125 0.147 0.113 CD4_TEM L2
ENSG00000028839 TBPL1 -309621 sc-eQTL 4.76e-01 -0.0946 0.133 0.113 CD8_CTL L2
ENSG00000112303 VNN2 879090 sc-eQTL 2.55e-01 0.16 0.141 0.113 CD8_CTL L2
ENSG00000112306 RPS12 827980 sc-eQTL 4.29e-01 -0.0597 0.0753 0.113 CD8_CTL L2
ENSG00000118515 SGK1 -675563 sc-eQTL 4.02e-01 0.107 0.127 0.113 CD8_CTL L2
ENSG00000146409 SLC18B1 829210 sc-eQTL 9.37e-01 -0.0116 0.146 0.113 CD8_CTL L2
ENSG00000028839 TBPL1 -309621 sc-eQTL 6.25e-01 0.0677 0.138 0.113 CD8_Naive L2
ENSG00000112303 VNN2 879090 sc-eQTL 7.81e-01 0.0353 0.127 0.113 CD8_Naive L2
ENSG00000112306 RPS12 827980 sc-eQTL 1.81e-01 0.0972 0.0725 0.113 CD8_Naive L2
ENSG00000118515 SGK1 -675563 sc-eQTL 3.86e-01 -0.0792 0.0912 0.113 CD8_Naive L2
ENSG00000146409 SLC18B1 829210 sc-eQTL 5.86e-01 -0.0795 0.146 0.113 CD8_Naive L2
ENSG00000028839 TBPL1 -309621 sc-eQTL 9.02e-01 0.0199 0.162 0.111 CD8_TCM L2
ENSG00000112303 VNN2 879090 sc-eQTL 9.17e-01 0.0154 0.148 0.111 CD8_TCM L2
ENSG00000112306 RPS12 827980 sc-eQTL 5.65e-01 0.0417 0.0723 0.111 CD8_TCM L2
ENSG00000118515 SGK1 -675563 sc-eQTL 8.98e-02 -0.203 0.119 0.111 CD8_TCM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 829210 sc-eQTL 3.73e-01 -0.141 0.158 0.111 CD8_TCM L2
ENSG00000028839 TBPL1 -309621 sc-eQTL 6.10e-01 -0.0724 0.142 0.116 CD8_TEM L2
ENSG00000112303 VNN2 879090 sc-eQTL 8.66e-01 0.026 0.154 0.116 CD8_TEM L2
ENSG00000112306 RPS12 827980 sc-eQTL 9.43e-01 -0.00596 0.0829 0.116 CD8_TEM L2
ENSG00000118515 SGK1 -675563 sc-eQTL 9.86e-01 -0.00238 0.136 0.116 CD8_TEM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 829210 sc-eQTL 2.19e-01 0.192 0.156 0.116 CD8_TEM L2
ENSG00000028839 TBPL1 -309621 sc-eQTL 4.84e-01 0.105 0.15 0.11 MAIT L2
ENSG00000112303 VNN2 879090 sc-eQTL 2.74e-01 0.158 0.145 0.11 MAIT L2
ENSG00000112306 RPS12 827980 sc-eQTL 4.29e-01 -0.0564 0.0712 0.11 MAIT L2
ENSG00000118515 SGK1 -675563 sc-eQTL 9.45e-02 0.168 0.0997 0.11 MAIT L2
ENSG00000146409 SLC18B1 829210 sc-eQTL 6.00e-02 0.28 0.148 0.11 MAIT L2
ENSG00000028839 TBPL1 -309621 sc-eQTL 7.98e-01 -0.0407 0.159 0.116 NK_CD56bright L2
ENSG00000112303 VNN2 879090 sc-eQTL 9.42e-01 0.011 0.15 0.116 NK_CD56bright L2
ENSG00000112306 RPS12 827980 sc-eQTL 9.75e-01 0.00265 0.0833 0.116 NK_CD56bright L2
ENSG00000118515 SGK1 -675563 sc-eQTL 2.13e-01 0.155 0.124 0.116 NK_CD56bright L2
ENSG00000028839 TBPL1 -309621 sc-eQTL 7.58e-01 0.0395 0.128 0.114 NK_CD56dim L2
ENSG00000112303 VNN2 879090 sc-eQTL 9.61e-01 -0.00714 0.146 0.114 NK_CD56dim L2
ENSG00000112306 RPS12 827980 sc-eQTL 7.98e-01 -0.0149 0.0581 0.114 NK_CD56dim L2
ENSG00000118515 SGK1 -675563 sc-eQTL 7.33e-01 0.044 0.129 0.114 NK_CD56dim L2
ENSG00000028839 TBPL1 -309621 sc-eQTL 6.70e-01 0.0678 0.159 0.114 NK_HLA L2
ENSG00000112303 VNN2 879090 sc-eQTL 6.13e-01 -0.0741 0.146 0.114 NK_HLA L2
ENSG00000112306 RPS12 827980 sc-eQTL 5.43e-01 0.0415 0.0682 0.114 NK_HLA L2
ENSG00000118515 SGK1 -675563 sc-eQTL 9.05e-01 -0.0161 0.135 0.114 NK_HLA L2
ENSG00000028839 TBPL1 -309621 sc-eQTL 4.88e-01 -0.0924 0.133 0.114 NK_cytokine L2
ENSG00000112303 VNN2 879090 sc-eQTL 3.22e-01 -0.143 0.145 0.114 NK_cytokine L2
ENSG00000112306 RPS12 827980 sc-eQTL 9.52e-01 0.00471 0.0786 0.114 NK_cytokine L2
ENSG00000118515 SGK1 -675563 sc-eQTL 3.01e-01 0.135 0.13 0.114 NK_cytokine L2
ENSG00000028839 TBPL1 -309621 sc-eQTL 3.50e-01 0.172 0.183 0.119 PB L2
ENSG00000112303 VNN2 879090 sc-eQTL 1.33e-01 -0.239 0.158 0.119 PB L2
ENSG00000112306 RPS12 827980 sc-eQTL 2.87e-01 0.0967 0.0903 0.119 PB L2
ENSG00000118515 SGK1 -675563 sc-eQTL 3.99e-01 0.124 0.146 0.119 PB L2
ENSG00000146409 SLC18B1 829210 sc-eQTL 9.58e-01 -0.00896 0.17 0.119 PB L2
ENSG00000028839 TBPL1 -309621 sc-eQTL 9.39e-01 0.0114 0.149 0.115 Pro_T L2
ENSG00000112303 VNN2 879090 sc-eQTL 4.06e-01 -0.119 0.143 0.115 Pro_T L2
ENSG00000112306 RPS12 827980 sc-eQTL 6.40e-01 0.0254 0.0541 0.115 Pro_T L2
ENSG00000118515 SGK1 -675563 sc-eQTL 8.16e-01 -0.0252 0.109 0.115 Pro_T L2
ENSG00000146409 SLC18B1 829210 sc-eQTL 9.16e-01 -0.0148 0.14 0.115 Pro_T L2
ENSG00000028839 TBPL1 -309621 sc-eQTL 2.33e-01 0.18 0.15 0.113 Treg L2
ENSG00000112303 VNN2 879090 sc-eQTL 7.04e-02 -0.216 0.119 0.113 Treg L2
ENSG00000112306 RPS12 827980 sc-eQTL 8.13e-01 0.0125 0.053 0.113 Treg L2
ENSG00000118515 SGK1 -675563 sc-eQTL 9.16e-01 -0.0118 0.112 0.113 Treg L2
ENSG00000146409 SLC18B1 829210 sc-eQTL 5.99e-01 0.0788 0.15 0.113 Treg L2
ENSG00000028839 TBPL1 -309621 sc-eQTL 6.41e-01 0.0782 0.167 0.1 cDC L2
ENSG00000093134 VNN3 907784 sc-eQTL 9.76e-01 -0.00392 0.131 0.1 cDC L2
ENSG00000112299 VNN1 928494 sc-eQTL 6.17e-01 -0.077 0.153 0.1 cDC L2
ENSG00000112303 VNN2 879090 sc-eQTL 8.51e-01 -0.0281 0.15 0.1 cDC L2
ENSG00000112306 RPS12 827980 sc-eQTL 9.97e-01 -0.000258 0.0739 0.1 cDC L2
ENSG00000118515 SGK1 -675563 sc-eQTL 2.82e-01 0.134 0.124 0.1 cDC L2
ENSG00000146409 SLC18B1 829210 sc-eQTL 7.52e-01 0.0463 0.146 0.1 cDC L2
ENSG00000286438 AL591115.1 539421 sc-eQTL 4.11e-01 0.0962 0.117 0.1 cDC L2
ENSG00000286887 AL355881.1 -653752 sc-eQTL 4.68e-01 0.104 0.144 0.1 cDC L2
ENSG00000028839 TBPL1 -309621 sc-eQTL 1.46e-01 0.18 0.123 0.113 cMono_IL1B L2
ENSG00000093134 VNN3 907784 sc-eQTL 4.04e-01 0.111 0.132 0.113 cMono_IL1B L2
ENSG00000112299 VNN1 928494 sc-eQTL 4.84e-01 -0.0937 0.134 0.113 cMono_IL1B L2
ENSG00000112303 VNN2 879090 sc-eQTL 2.44e-02 0.24 0.106 0.113 cMono_IL1B L2
ENSG00000112306 RPS12 827980 sc-eQTL 3.44e-01 0.0561 0.0592 0.113 cMono_IL1B L2
ENSG00000118515 SGK1 -675563 sc-eQTL 3.86e-01 0.0768 0.0884 0.113 cMono_IL1B L2
ENSG00000146409 SLC18B1 829210 sc-eQTL 2.08e-01 -0.144 0.114 0.113 cMono_IL1B L2
ENSG00000286887 AL355881.1 -653752 sc-eQTL 7.53e-01 0.0375 0.119 0.113 cMono_IL1B L2
ENSG00000028839 TBPL1 -309621 sc-eQTL 5.00e-01 0.0953 0.141 0.113 cMono_S100A L2
ENSG00000093134 VNN3 907784 sc-eQTL 7.20e-01 -0.0456 0.127 0.113 cMono_S100A L2
ENSG00000112299 VNN1 928494 sc-eQTL 2.39e-01 -0.163 0.138 0.113 cMono_S100A L2
ENSG00000112303 VNN2 879090 sc-eQTL 5.77e-01 0.0506 0.0904 0.113 cMono_S100A L2
ENSG00000112306 RPS12 827980 sc-eQTL 7.25e-01 -0.023 0.0652 0.113 cMono_S100A L2
ENSG00000118515 SGK1 -675563 sc-eQTL 1.11e-01 0.119 0.0741 0.113 cMono_S100A L2
ENSG00000146409 SLC18B1 829210 sc-eQTL 3.24e-01 -0.119 0.12 0.113 cMono_S100A L2
ENSG00000286887 AL355881.1 -653752 sc-eQTL 3.03e-02 0.254 0.117 0.113 cMono_S100A L2
ENSG00000028839 TBPL1 -309621 sc-eQTL 2.27e-01 -0.239 0.197 0.109 gdT L2
ENSG00000112303 VNN2 879090 sc-eQTL 6.96e-03 0.502 0.183 0.109 gdT L2
ENSG00000112306 RPS12 827980 sc-eQTL 8.30e-01 -0.0155 0.0717 0.109 gdT L2
ENSG00000118515 SGK1 -675563 sc-eQTL 5.98e-01 -0.0713 0.135 0.109 gdT L2
ENSG00000146409 SLC18B1 829210 sc-eQTL 8.79e-01 0.0283 0.185 0.109 gdT L2
ENSG00000028839 TBPL1 -309621 sc-eQTL 6.72e-01 0.0609 0.143 0.116 intMono L2
ENSG00000093134 VNN3 907784 sc-eQTL 7.87e-01 -0.0375 0.138 0.116 intMono L2
ENSG00000112299 VNN1 928494 sc-eQTL 8.44e-01 0.0269 0.137 0.116 intMono L2
ENSG00000112303 VNN2 879090 sc-eQTL 9.21e-01 -0.0138 0.139 0.116 intMono L2
ENSG00000112306 RPS12 827980 sc-eQTL 1.04e-01 0.0983 0.0601 0.116 intMono L2
ENSG00000118515 SGK1 -675563 sc-eQTL 5.61e-01 0.0591 0.102 0.116 intMono L2
ENSG00000146409 SLC18B1 829210 sc-eQTL 7.24e-01 0.052 0.147 0.116 intMono L2
ENSG00000286887 AL355881.1 -653752 sc-eQTL 8.27e-01 0.0308 0.141 0.116 intMono L2
ENSG00000028839 TBPL1 -309621 sc-eQTL 9.20e-01 -0.0154 0.153 0.109 ncMono L2
ENSG00000093134 VNN3 907784 sc-eQTL 9.27e-01 0.0133 0.146 0.109 ncMono L2
ENSG00000112299 VNN1 928494 sc-eQTL 6.43e-01 0.0672 0.145 0.109 ncMono L2
ENSG00000112303 VNN2 879090 sc-eQTL 7.23e-01 -0.0494 0.139 0.109 ncMono L2
ENSG00000112306 RPS12 827980 sc-eQTL 8.97e-01 -0.00908 0.0699 0.109 ncMono L2
ENSG00000118515 SGK1 -675563 sc-eQTL 8.25e-02 0.171 0.0981 0.109 ncMono L2
ENSG00000146409 SLC18B1 829210 sc-eQTL 6.25e-01 -0.0603 0.123 0.109 ncMono L2
ENSG00000286887 AL355881.1 -653752 sc-eQTL 9.70e-01 -0.0049 0.131 0.109 ncMono L2
ENSG00000028839 TBPL1 -309621 sc-eQTL 2.64e-01 -0.205 0.183 0.107 pDC L2
ENSG00000093134 VNN3 907784 sc-eQTL 9.97e-01 -0.000412 0.123 0.107 pDC L2
ENSG00000112299 VNN1 928494 sc-eQTL 2.13e-01 -0.156 0.125 0.107 pDC L2
ENSG00000112303 VNN2 879090 sc-eQTL 8.80e-01 -0.0225 0.149 0.107 pDC L2
ENSG00000112306 RPS12 827980 sc-eQTL 7.49e-02 0.182 0.102 0.107 pDC L2
ENSG00000118515 SGK1 -675563 sc-eQTL 5.44e-01 0.0634 0.104 0.107 pDC L2
ENSG00000146409 SLC18B1 829210 sc-eQTL 8.37e-01 -0.0314 0.152 0.107 pDC L2
ENSG00000286438 AL591115.1 539421 sc-eQTL 8.37e-01 0.03 0.146 0.107 pDC L2
ENSG00000286887 AL355881.1 -653752 sc-eQTL 4.70e-01 -0.0933 0.129 0.107 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000028839 TBPL1 -309621 sc-eQTL 6.39e-01 -0.0706 0.15 0.113 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 879090 sc-eQTL 5.90e-02 0.247 0.13 0.113 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 827980 sc-eQTL 6.90e-01 -0.0298 0.0747 0.113 B_Memory LOneK1K
ENSG00000118515 SGK1 -675563 sc-eQTL 8.03e-04 0.387 0.114 0.113 B_Memory LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 829210 sc-eQTL 9.64e-01 -0.00617 0.137 0.113 B_Memory LOneK1K
ENSG00000028839 TBPL1 -309621 sc-eQTL 4.92e-01 0.0967 0.141 0.113 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 879090 sc-eQTL 1.01e-01 0.202 0.122 0.113 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 827980 sc-eQTL 2.47e-01 -0.0863 0.0743 0.113 B_Naive LOneK1K
ENSG00000118515 SGK1 -675563 sc-eQTL 3.40e-01 -0.11 0.115 0.113 B_Naive LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 829210 sc-eQTL 7.10e-01 -0.0524 0.141 0.113 B_Naive LOneK1K
ENSG00000028839 TBPL1 -309621 sc-eQTL 1.52e-01 0.162 0.112 0.113 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000093134 VNN3 907784 sc-eQTL 5.66e-01 0.0734 0.128 0.113 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112299 VNN1 928494 sc-eQTL 3.07e-01 -0.136 0.133 0.113 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 879090 sc-eQTL 8.69e-02 0.151 0.0876 0.113 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 827980 sc-eQTL 5.29e-01 0.0381 0.0605 0.113 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000118515 SGK1 -675563 sc-eQTL 1.35e-01 0.123 0.082 0.113 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 829210 sc-eQTL 1.31e-01 -0.162 0.107 0.113 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000286887 AL355881.1 -653752 sc-eQTL 2.36e-01 0.134 0.113 0.113 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000028839 TBPL1 -309621 sc-eQTL 9.87e-01 -0.00246 0.145 0.114 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000093134 VNN3 907784 sc-eQTL 9.63e-01 -0.00649 0.141 0.114 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112299 VNN1 928494 sc-eQTL 6.61e-01 0.0613 0.14 0.114 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 879090 sc-eQTL 9.32e-01 0.0112 0.132 0.114 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 827980 sc-eQTL 8.86e-01 0.00799 0.0559 0.114 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000118515 SGK1 -675563 sc-eQTL 2.20e-01 0.104 0.0843 0.114 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 829210 sc-eQTL 9.46e-01 0.00919 0.136 0.114 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000286887 AL355881.1 -653752 sc-eQTL 9.65e-01 -0.00542 0.123 0.114 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000028839 TBPL1 -309621 sc-eQTL 5.49e-01 -0.0708 0.118 0.114 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 879090 sc-eQTL 4.84e-01 -0.0983 0.14 0.114 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 827980 sc-eQTL 6.46e-01 -0.0264 0.0573 0.114 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000118515 SGK1 -675563 sc-eQTL 5.96e-01 0.0627 0.118 0.114 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000112299 VNN1 928494 pQTL 0.00976 -0.15 0.0581 0.0 0.0 0.0965

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000146409 \N 829210 2.91e-07 1.33e-07 5.82e-08 1.8e-07 9.02e-08 8.33e-08 2.74e-07 5.19e-08 1.45e-07 4.4e-08 2.18e-07 8.59e-08 5.39e-07 8e-08 6.18e-08 7.5e-08 3.88e-08 1.8e-07 5.36e-08 3.89e-08 1.21e-07 2.3e-07 1.58e-07 4.05e-08 1.65e-07 1.16e-07 1.13e-07 8.7e-08 1.16e-07 1.07e-07 1.26e-07 3.41e-08 2.92e-08 8.82e-08 2.97e-08 3.65e-08 4.96e-08 9.2e-08 8.42e-08 3.74e-08 3.66e-08 1.43e-06 4.01e-08 0.0 1.09e-07 1.83e-08 1.35e-07 4.7e-09 4.72e-08
ENSG00000234484 \N 889874 2.67e-07 1.27e-07 5.14e-08 1.82e-07 9.65e-08 9.91e-08 2.16e-07 5.33e-08 1.45e-07 4.38e-08 1.76e-07 8.14e-08 3.77e-07 7.64e-08 6.17e-08 7.53e-08 4.63e-08 1.51e-07 5.19e-08 3.59e-08 1.08e-07 1.98e-07 1.5e-07 4.26e-08 1.5e-07 1.14e-07 1.07e-07 8.71e-08 1.08e-07 1.12e-07 1.09e-07 3.41e-08 2.74e-08 8.25e-08 5.64e-08 3.93e-08 5.09e-08 9.06e-08 8.22e-08 3.8e-08 4.02e-08 1.01e-06 4.01e-08 0.0 1.12e-07 1.69e-08 1.44e-07 4.82e-09 4.72e-08