logo

Genes within 1Mb (chr6:133640236:T:C):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000028839 TBPL1 -311934 sc-eQTL 7.50e-01 0.0449 0.141 0.115 B L1
ENSG00000112303 VNN2 876777 sc-eQTL 4.96e-02 0.206 0.105 0.115 B L1
ENSG00000112306 RPS12 825667 sc-eQTL 8.18e-01 -0.0147 0.0638 0.115 B L1
ENSG00000118515 SGK1 -677876 sc-eQTL 3.76e-01 0.087 0.0982 0.115 B L1
ENSG00000146409 SLC18B1 826897 sc-eQTL 7.51e-01 -0.0427 0.134 0.115 B L1
ENSG00000028839 TBPL1 -311934 sc-eQTL 2.56e-01 0.119 0.104 0.115 CD4T L1
ENSG00000112303 VNN2 876777 sc-eQTL 9.35e-01 -0.00774 0.0942 0.115 CD4T L1
ENSG00000112306 RPS12 825667 sc-eQTL 8.80e-01 0.0097 0.0641 0.115 CD4T L1
ENSG00000118515 SGK1 -677876 sc-eQTL 5.23e-02 -0.167 0.0853 0.115 CD4T L1
ENSG00000146409 SLC18B1 826897 sc-eQTL 7.24e-01 -0.0459 0.13 0.115 CD4T L1
ENSG00000028839 TBPL1 -311934 sc-eQTL 9.74e-01 0.0033 0.101 0.115 CD8T L1
ENSG00000112303 VNN2 876777 sc-eQTL 2.11e-01 0.154 0.123 0.115 CD8T L1
ENSG00000112306 RPS12 825667 sc-eQTL 8.82e-01 -0.0063 0.0422 0.115 CD8T L1
ENSG00000118515 SGK1 -677876 sc-eQTL 3.69e-01 -0.0584 0.0649 0.115 CD8T L1
ENSG00000146409 SLC18B1 826897 sc-eQTL 7.51e-01 0.0406 0.128 0.115 CD8T L1
ENSG00000028839 TBPL1 -311934 sc-eQTL 2.79e-01 -0.172 0.158 0.115 DC L1
ENSG00000093134 VNN3 905471 sc-eQTL 4.75e-01 0.0875 0.122 0.115 DC L1
ENSG00000112299 VNN1 926181 sc-eQTL 8.89e-01 0.0185 0.132 0.115 DC L1
ENSG00000112303 VNN2 876777 sc-eQTL 7.91e-01 0.0375 0.141 0.115 DC L1
ENSG00000112306 RPS12 825667 sc-eQTL 2.67e-01 0.0879 0.079 0.115 DC L1
ENSG00000118515 SGK1 -677876 sc-eQTL 4.05e-01 0.0767 0.0918 0.115 DC L1
ENSG00000146409 SLC18B1 826897 sc-eQTL 6.57e-01 0.0557 0.125 0.115 DC L1
ENSG00000286438 AL591115.1 537108 sc-eQTL 6.85e-01 0.0463 0.114 0.115 DC L1
ENSG00000286887 AL355881.1 -656065 sc-eQTL 1.13e-01 0.225 0.141 0.115 DC L1
ENSG00000028839 TBPL1 -311934 sc-eQTL 2.52e-01 0.125 0.108 0.115 Mono L1
ENSG00000093134 VNN3 905471 sc-eQTL 7.16e-01 0.0455 0.125 0.115 Mono L1
ENSG00000112299 VNN1 926181 sc-eQTL 6.08e-01 -0.069 0.134 0.115 Mono L1
ENSG00000112303 VNN2 876777 sc-eQTL 9.34e-02 0.159 0.0943 0.115 Mono L1
ENSG00000112306 RPS12 825667 sc-eQTL 9.62e-01 0.00274 0.0569 0.115 Mono L1
ENSG00000118515 SGK1 -677876 sc-eQTL 2.37e-01 0.0949 0.08 0.115 Mono L1
ENSG00000146409 SLC18B1 826897 sc-eQTL 7.04e-02 -0.203 0.112 0.115 Mono L1
ENSG00000286887 AL355881.1 -656065 sc-eQTL 4.12e-01 0.0907 0.11 0.115 Mono L1
ENSG00000028839 TBPL1 -311934 sc-eQTL 9.93e-01 -0.001 0.119 0.116 NK L1
ENSG00000112303 VNN2 876777 sc-eQTL 3.87e-01 -0.118 0.136 0.116 NK L1
ENSG00000112306 RPS12 825667 sc-eQTL 6.27e-01 -0.0275 0.0565 0.116 NK L1
ENSG00000118515 SGK1 -677876 sc-eQTL 6.30e-01 0.0504 0.105 0.116 NK L1
ENSG00000028839 TBPL1 -311934 sc-eQTL 6.29e-01 0.0679 0.14 0.115 Other_T L1
ENSG00000112303 VNN2 876777 sc-eQTL 1.56e-01 0.189 0.133 0.115 Other_T L1
ENSG00000112306 RPS12 825667 sc-eQTL 6.52e-01 0.0239 0.0529 0.115 Other_T L1
ENSG00000118515 SGK1 -677876 sc-eQTL 6.80e-01 -0.0403 0.0974 0.115 Other_T L1
ENSG00000146409 SLC18B1 826897 sc-eQTL 7.05e-02 0.262 0.144 0.115 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000028839 TBPL1 -311934 sc-eQTL 3.48e-01 -0.163 0.173 0.102 B_Activated L2
ENSG00000112303 VNN2 876777 sc-eQTL 3.23e-01 0.156 0.157 0.102 B_Activated L2
ENSG00000112306 RPS12 825667 sc-eQTL 8.13e-01 0.02 0.0845 0.102 B_Activated L2
ENSG00000118515 SGK1 -677876 sc-eQTL 3.55e-01 0.14 0.15 0.102 B_Activated L2
ENSG00000146409 SLC18B1 826897 sc-eQTL 8.24e-01 0.033 0.148 0.102 B_Activated L2
ENSG00000028839 TBPL1 -311934 sc-eQTL 4.53e-01 -0.118 0.157 0.116 B_Intermediate L2
ENSG00000112303 VNN2 876777 sc-eQTL 6.32e-01 0.065 0.136 0.116 B_Intermediate L2
ENSG00000112306 RPS12 825667 sc-eQTL 5.19e-01 -0.0536 0.083 0.116 B_Intermediate L2
ENSG00000118515 SGK1 -677876 sc-eQTL 5.15e-02 0.279 0.142 0.116 B_Intermediate L2
ENSG00000146409 SLC18B1 826897 sc-eQTL 4.44e-01 0.115 0.149 0.116 B_Intermediate L2
ENSG00000028839 TBPL1 -311934 sc-eQTL 4.17e-01 0.121 0.149 0.116 B_Memory L2
ENSG00000112303 VNN2 876777 sc-eQTL 2.54e-01 0.161 0.141 0.116 B_Memory L2
ENSG00000112306 RPS12 825667 sc-eQTL 5.41e-01 -0.0415 0.0679 0.116 B_Memory L2
ENSG00000118515 SGK1 -677876 sc-eQTL 1.16e-02 0.312 0.123 0.116 B_Memory L2
ENSG00000146409 SLC18B1 826897 sc-eQTL 3.83e-01 -0.124 0.141 0.116 B_Memory L2
ENSG00000028839 TBPL1 -311934 sc-eQTL 9.31e-01 -0.012 0.139 0.115 B_Naive1 L2
ENSG00000112303 VNN2 876777 sc-eQTL 3.14e-02 0.279 0.129 0.115 B_Naive1 L2
ENSG00000112306 RPS12 825667 sc-eQTL 3.36e-01 -0.0713 0.0739 0.115 B_Naive1 L2
ENSG00000118515 SGK1 -677876 sc-eQTL 3.87e-01 -0.1 0.116 0.115 B_Naive1 L2
ENSG00000146409 SLC18B1 826897 sc-eQTL 6.89e-01 -0.0573 0.143 0.115 B_Naive1 L2
ENSG00000028839 TBPL1 -311934 sc-eQTL 2.72e-01 0.164 0.149 0.116 B_Naive2 L2
ENSG00000112303 VNN2 876777 sc-eQTL 4.83e-01 0.102 0.145 0.116 B_Naive2 L2
ENSG00000112306 RPS12 825667 sc-eQTL 1.88e-01 -0.101 0.0766 0.116 B_Naive2 L2
ENSG00000118515 SGK1 -677876 sc-eQTL 8.38e-01 -0.0278 0.136 0.116 B_Naive2 L2
ENSG00000146409 SLC18B1 826897 sc-eQTL 6.73e-01 -0.0619 0.147 0.116 B_Naive2 L2
ENSG00000028839 TBPL1 -311934 sc-eQTL 3.53e-01 0.138 0.148 0.114 CD4_CTL L2
ENSG00000112303 VNN2 876777 sc-eQTL 1.88e-01 0.195 0.148 0.114 CD4_CTL L2
ENSG00000112306 RPS12 825667 sc-eQTL 1.74e-01 -0.0931 0.0682 0.114 CD4_CTL L2
ENSG00000118515 SGK1 -677876 sc-eQTL 5.03e-01 0.0795 0.119 0.114 CD4_CTL L2
ENSG00000146409 SLC18B1 826897 sc-eQTL 9.28e-01 0.0125 0.138 0.114 CD4_CTL L2
ENSG00000028839 TBPL1 -311934 sc-eQTL 2.45e-01 0.138 0.118 0.115 CD4_Naive L2
ENSG00000112303 VNN2 876777 sc-eQTL 8.89e-01 -0.015 0.108 0.115 CD4_Naive L2
ENSG00000112306 RPS12 825667 sc-eQTL 6.77e-01 0.0292 0.0698 0.115 CD4_Naive L2
ENSG00000118515 SGK1 -677876 sc-eQTL 1.36e-01 -0.127 0.0851 0.115 CD4_Naive L2
ENSG00000146409 SLC18B1 826897 sc-eQTL 7.11e-01 -0.0499 0.134 0.115 CD4_Naive L2
ENSG00000028839 TBPL1 -311934 sc-eQTL 7.45e-01 0.0413 0.127 0.115 CD4_TCM L2
ENSG00000112303 VNN2 876777 sc-eQTL 9.04e-01 -0.0152 0.126 0.115 CD4_TCM L2
ENSG00000112306 RPS12 825667 sc-eQTL 8.51e-01 0.0123 0.0652 0.115 CD4_TCM L2
ENSG00000118515 SGK1 -677876 sc-eQTL 4.21e-01 -0.0736 0.0912 0.115 CD4_TCM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 826897 sc-eQTL 5.67e-01 -0.0867 0.151 0.115 CD4_TCM L2
ENSG00000028839 TBPL1 -311934 sc-eQTL 8.34e-02 -0.257 0.148 0.115 CD4_TEM L2
ENSG00000112303 VNN2 876777 sc-eQTL 3.20e-01 0.142 0.143 0.115 CD4_TEM L2
ENSG00000112306 RPS12 825667 sc-eQTL 7.52e-01 0.0185 0.0586 0.115 CD4_TEM L2
ENSG00000118515 SGK1 -677876 sc-eQTL 6.70e-01 0.043 0.101 0.115 CD4_TEM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 826897 sc-eQTL 2.55e-01 0.166 0.145 0.115 CD4_TEM L2
ENSG00000028839 TBPL1 -311934 sc-eQTL 5.00e-01 -0.0889 0.132 0.115 CD8_CTL L2
ENSG00000112303 VNN2 876777 sc-eQTL 3.56e-01 0.129 0.14 0.115 CD8_CTL L2
ENSG00000112306 RPS12 825667 sc-eQTL 3.91e-01 -0.0643 0.0748 0.115 CD8_CTL L2
ENSG00000118515 SGK1 -677876 sc-eQTL 4.87e-01 0.0879 0.126 0.115 CD8_CTL L2
ENSG00000146409 SLC18B1 826897 sc-eQTL 9.68e-01 0.00579 0.145 0.115 CD8_CTL L2
ENSG00000028839 TBPL1 -311934 sc-eQTL 4.74e-01 0.0983 0.137 0.115 CD8_Naive L2
ENSG00000112303 VNN2 876777 sc-eQTL 8.66e-01 0.0213 0.126 0.115 CD8_Naive L2
ENSG00000112306 RPS12 825667 sc-eQTL 2.45e-01 0.0841 0.0721 0.115 CD8_Naive L2
ENSG00000118515 SGK1 -677876 sc-eQTL 3.48e-01 -0.0852 0.0906 0.115 CD8_Naive L2
ENSG00000146409 SLC18B1 826897 sc-eQTL 7.25e-01 -0.051 0.145 0.115 CD8_Naive L2
ENSG00000028839 TBPL1 -311934 sc-eQTL 8.66e-01 -0.0271 0.16 0.113 CD8_TCM L2
ENSG00000112303 VNN2 876777 sc-eQTL 8.87e-01 0.021 0.147 0.113 CD8_TCM L2
ENSG00000112306 RPS12 825667 sc-eQTL 6.63e-01 0.0312 0.0716 0.113 CD8_TCM L2
ENSG00000118515 SGK1 -677876 sc-eQTL 8.76e-02 -0.202 0.118 0.113 CD8_TCM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 826897 sc-eQTL 3.57e-01 -0.145 0.157 0.113 CD8_TCM L2
ENSG00000028839 TBPL1 -311934 sc-eQTL 4.95e-01 -0.0963 0.141 0.119 CD8_TEM L2
ENSG00000112303 VNN2 876777 sc-eQTL 8.41e-01 0.0307 0.153 0.119 CD8_TEM L2
ENSG00000112306 RPS12 825667 sc-eQTL 8.42e-01 -0.0164 0.0824 0.119 CD8_TEM L2
ENSG00000118515 SGK1 -677876 sc-eQTL 9.06e-01 -0.0159 0.135 0.119 CD8_TEM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 826897 sc-eQTL 2.14e-01 0.194 0.155 0.119 CD8_TEM L2
ENSG00000028839 TBPL1 -311934 sc-eQTL 4.78e-01 0.106 0.149 0.113 MAIT L2
ENSG00000112303 VNN2 876777 sc-eQTL 2.67e-01 0.159 0.143 0.113 MAIT L2
ENSG00000112306 RPS12 825667 sc-eQTL 3.75e-01 -0.0628 0.0706 0.113 MAIT L2
ENSG00000118515 SGK1 -677876 sc-eQTL 1.42e-01 0.146 0.099 0.113 MAIT L2
ENSG00000146409 SLC18B1 826897 sc-eQTL 8.02e-02 0.259 0.147 0.113 MAIT L2
ENSG00000028839 TBPL1 -311934 sc-eQTL 6.81e-01 -0.065 0.158 0.118 NK_CD56bright L2
ENSG00000112303 VNN2 876777 sc-eQTL 7.30e-01 0.0512 0.148 0.118 NK_CD56bright L2
ENSG00000112306 RPS12 825667 sc-eQTL 9.10e-01 0.00941 0.0827 0.118 NK_CD56bright L2
ENSG00000118515 SGK1 -677876 sc-eQTL 3.05e-01 0.127 0.123 0.118 NK_CD56bright L2
ENSG00000028839 TBPL1 -311934 sc-eQTL 9.50e-01 0.00802 0.127 0.116 NK_CD56dim L2
ENSG00000112303 VNN2 876777 sc-eQTL 8.06e-01 -0.0358 0.145 0.116 NK_CD56dim L2
ENSG00000112306 RPS12 825667 sc-eQTL 7.81e-01 -0.0161 0.0577 0.116 NK_CD56dim L2
ENSG00000118515 SGK1 -677876 sc-eQTL 6.45e-01 0.059 0.128 0.116 NK_CD56dim L2
ENSG00000028839 TBPL1 -311934 sc-eQTL 5.95e-01 0.0839 0.158 0.116 NK_HLA L2
ENSG00000112303 VNN2 876777 sc-eQTL 6.30e-01 -0.0701 0.145 0.116 NK_HLA L2
ENSG00000112306 RPS12 825667 sc-eQTL 4.83e-01 0.0475 0.0676 0.116 NK_HLA L2
ENSG00000118515 SGK1 -677876 sc-eQTL 8.82e-01 -0.0198 0.134 0.116 NK_HLA L2
ENSG00000028839 TBPL1 -311934 sc-eQTL 4.57e-01 -0.0983 0.132 0.116 NK_cytokine L2
ENSG00000112303 VNN2 876777 sc-eQTL 3.93e-01 -0.123 0.144 0.116 NK_cytokine L2
ENSG00000112306 RPS12 825667 sc-eQTL 8.08e-01 0.019 0.0781 0.116 NK_cytokine L2
ENSG00000118515 SGK1 -677876 sc-eQTL 3.83e-01 0.113 0.13 0.116 NK_cytokine L2
ENSG00000028839 TBPL1 -311934 sc-eQTL 3.50e-01 0.172 0.183 0.119 PB L2
ENSG00000112303 VNN2 876777 sc-eQTL 1.33e-01 -0.239 0.158 0.119 PB L2
ENSG00000112306 RPS12 825667 sc-eQTL 2.87e-01 0.0967 0.0903 0.119 PB L2
ENSG00000118515 SGK1 -677876 sc-eQTL 3.99e-01 0.124 0.146 0.119 PB L2
ENSG00000146409 SLC18B1 826897 sc-eQTL 9.58e-01 -0.00896 0.17 0.119 PB L2
ENSG00000028839 TBPL1 -311934 sc-eQTL 9.35e-01 -0.0123 0.15 0.117 Pro_T L2
ENSG00000112303 VNN2 876777 sc-eQTL 2.79e-01 -0.155 0.143 0.117 Pro_T L2
ENSG00000112306 RPS12 825667 sc-eQTL 6.01e-01 0.0284 0.0542 0.117 Pro_T L2
ENSG00000118515 SGK1 -677876 sc-eQTL 6.75e-01 -0.0456 0.109 0.117 Pro_T L2
ENSG00000146409 SLC18B1 826897 sc-eQTL 8.28e-01 -0.0306 0.14 0.117 Pro_T L2
ENSG00000028839 TBPL1 -311934 sc-eQTL 2.58e-01 0.17 0.149 0.115 Treg L2
ENSG00000112303 VNN2 876777 sc-eQTL 7.50e-02 -0.211 0.118 0.115 Treg L2
ENSG00000112306 RPS12 825667 sc-eQTL 7.71e-01 0.0153 0.0526 0.115 Treg L2
ENSG00000118515 SGK1 -677876 sc-eQTL 8.84e-01 -0.0161 0.111 0.115 Treg L2
ENSG00000146409 SLC18B1 826897 sc-eQTL 4.99e-01 0.1 0.148 0.115 Treg L2
ENSG00000028839 TBPL1 -311934 sc-eQTL 7.22e-01 0.059 0.166 0.102 cDC L2
ENSG00000093134 VNN3 905471 sc-eQTL 7.80e-01 0.0361 0.129 0.102 cDC L2
ENSG00000112299 VNN1 926181 sc-eQTL 8.29e-01 -0.0329 0.152 0.102 cDC L2
ENSG00000112303 VNN2 876777 sc-eQTL 9.94e-01 0.00104 0.148 0.102 cDC L2
ENSG00000112306 RPS12 825667 sc-eQTL 9.22e-01 0.00712 0.0731 0.102 cDC L2
ENSG00000118515 SGK1 -677876 sc-eQTL 1.71e-01 0.168 0.123 0.102 cDC L2
ENSG00000146409 SLC18B1 826897 sc-eQTL 7.00e-01 0.0559 0.145 0.102 cDC L2
ENSG00000286438 AL591115.1 537108 sc-eQTL 2.29e-01 0.139 0.115 0.102 cDC L2
ENSG00000286887 AL355881.1 -656065 sc-eQTL 3.36e-01 0.137 0.142 0.102 cDC L2
ENSG00000028839 TBPL1 -311934 sc-eQTL 1.74e-01 0.167 0.122 0.115 cMono_IL1B L2
ENSG00000093134 VNN3 905471 sc-eQTL 4.11e-01 0.109 0.132 0.115 cMono_IL1B L2
ENSG00000112299 VNN1 926181 sc-eQTL 6.26e-01 -0.065 0.133 0.115 cMono_IL1B L2
ENSG00000112303 VNN2 876777 sc-eQTL 4.09e-02 0.217 0.105 0.115 cMono_IL1B L2
ENSG00000112306 RPS12 825667 sc-eQTL 5.17e-01 0.0383 0.059 0.115 cMono_IL1B L2
ENSG00000118515 SGK1 -677876 sc-eQTL 3.76e-01 0.078 0.0879 0.115 cMono_IL1B L2
ENSG00000146409 SLC18B1 826897 sc-eQTL 1.90e-01 -0.149 0.113 0.115 cMono_IL1B L2
ENSG00000286887 AL355881.1 -656065 sc-eQTL 7.87e-01 0.0321 0.119 0.115 cMono_IL1B L2
ENSG00000028839 TBPL1 -311934 sc-eQTL 4.70e-01 0.101 0.14 0.115 cMono_S100A L2
ENSG00000093134 VNN3 905471 sc-eQTL 5.94e-01 -0.0674 0.126 0.115 cMono_S100A L2
ENSG00000112299 VNN1 926181 sc-eQTL 3.13e-01 -0.138 0.137 0.115 cMono_S100A L2
ENSG00000112303 VNN2 876777 sc-eQTL 6.70e-01 0.0384 0.0899 0.115 cMono_S100A L2
ENSG00000112306 RPS12 825667 sc-eQTL 5.19e-01 -0.0418 0.0647 0.115 cMono_S100A L2
ENSG00000118515 SGK1 -677876 sc-eQTL 8.48e-02 0.127 0.0735 0.115 cMono_S100A L2
ENSG00000146409 SLC18B1 826897 sc-eQTL 3.33e-01 -0.116 0.12 0.115 cMono_S100A L2
ENSG00000286887 AL355881.1 -656065 sc-eQTL 5.41e-02 0.225 0.116 0.115 cMono_S100A L2
ENSG00000028839 TBPL1 -311934 sc-eQTL 2.27e-01 -0.239 0.197 0.109 gdT L2
ENSG00000112303 VNN2 876777 sc-eQTL 6.96e-03 0.502 0.183 0.109 gdT L2
ENSG00000112306 RPS12 825667 sc-eQTL 8.30e-01 -0.0155 0.0717 0.109 gdT L2
ENSG00000118515 SGK1 -677876 sc-eQTL 5.98e-01 -0.0713 0.135 0.109 gdT L2
ENSG00000146409 SLC18B1 826897 sc-eQTL 8.79e-01 0.0283 0.185 0.109 gdT L2
ENSG00000028839 TBPL1 -311934 sc-eQTL 8.19e-01 0.0326 0.142 0.118 intMono L2
ENSG00000093134 VNN3 905471 sc-eQTL 6.93e-01 -0.0542 0.137 0.118 intMono L2
ENSG00000112299 VNN1 926181 sc-eQTL 9.19e-01 0.0138 0.136 0.118 intMono L2
ENSG00000112303 VNN2 876777 sc-eQTL 9.05e-01 -0.0164 0.138 0.118 intMono L2
ENSG00000112306 RPS12 825667 sc-eQTL 1.42e-01 0.0879 0.0597 0.118 intMono L2
ENSG00000118515 SGK1 -677876 sc-eQTL 8.35e-01 0.021 0.101 0.118 intMono L2
ENSG00000146409 SLC18B1 826897 sc-eQTL 6.79e-01 0.0606 0.146 0.118 intMono L2
ENSG00000286887 AL355881.1 -656065 sc-eQTL 5.73e-01 0.0788 0.14 0.118 intMono L2
ENSG00000028839 TBPL1 -311934 sc-eQTL 9.89e-01 -0.00219 0.152 0.111 ncMono L2
ENSG00000093134 VNN3 905471 sc-eQTL 7.23e-01 0.0515 0.145 0.111 ncMono L2
ENSG00000112299 VNN1 926181 sc-eQTL 6.23e-01 0.071 0.144 0.111 ncMono L2
ENSG00000112303 VNN2 876777 sc-eQTL 4.76e-01 -0.0988 0.138 0.111 ncMono L2
ENSG00000112306 RPS12 825667 sc-eQTL 9.74e-01 -0.00228 0.0695 0.111 ncMono L2
ENSG00000118515 SGK1 -677876 sc-eQTL 6.32e-02 0.182 0.0974 0.111 ncMono L2
ENSG00000146409 SLC18B1 826897 sc-eQTL 6.11e-01 -0.0625 0.123 0.111 ncMono L2
ENSG00000286887 AL355881.1 -656065 sc-eQTL 9.81e-01 -0.00303 0.13 0.111 ncMono L2
ENSG00000028839 TBPL1 -311934 sc-eQTL 2.39e-01 -0.214 0.181 0.11 pDC L2
ENSG00000093134 VNN3 905471 sc-eQTL 8.32e-01 -0.0259 0.122 0.11 pDC L2
ENSG00000112299 VNN1 926181 sc-eQTL 1.85e-01 -0.164 0.123 0.11 pDC L2
ENSG00000112303 VNN2 876777 sc-eQTL 8.02e-01 -0.0371 0.148 0.11 pDC L2
ENSG00000112306 RPS12 825667 sc-eQTL 6.00e-02 0.19 0.101 0.11 pDC L2
ENSG00000118515 SGK1 -677876 sc-eQTL 5.79e-01 0.0574 0.103 0.11 pDC L2
ENSG00000146409 SLC18B1 826897 sc-eQTL 7.11e-01 -0.0559 0.15 0.11 pDC L2
ENSG00000286438 AL591115.1 537108 sc-eQTL 6.84e-01 0.0587 0.144 0.11 pDC L2
ENSG00000286887 AL355881.1 -656065 sc-eQTL 6.42e-01 -0.0594 0.128 0.11 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000028839 TBPL1 -311934 sc-eQTL 6.00e-01 -0.0784 0.149 0.115 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 876777 sc-eQTL 5.87e-02 0.245 0.129 0.115 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 825667 sc-eQTL 7.18e-01 -0.0268 0.0742 0.115 B_Memory LOneK1K
ENSG00000118515 SGK1 -677876 sc-eQTL 9.49e-04 0.379 0.113 0.115 B_Memory LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 826897 sc-eQTL 9.55e-01 0.00774 0.136 0.115 B_Memory LOneK1K
ENSG00000028839 TBPL1 -311934 sc-eQTL 3.75e-01 0.124 0.14 0.115 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 876777 sc-eQTL 7.02e-02 0.221 0.122 0.115 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 825667 sc-eQTL 2.53e-01 -0.0848 0.074 0.115 B_Naive LOneK1K
ENSG00000118515 SGK1 -677876 sc-eQTL 4.71e-01 -0.0828 0.115 0.115 B_Naive LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 826897 sc-eQTL 8.47e-01 -0.0271 0.14 0.115 B_Naive LOneK1K
ENSG00000028839 TBPL1 -311934 sc-eQTL 1.72e-01 0.153 0.112 0.115 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000093134 VNN3 905471 sc-eQTL 6.33e-01 0.0608 0.127 0.115 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112299 VNN1 926181 sc-eQTL 4.33e-01 -0.104 0.132 0.115 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 876777 sc-eQTL 1.34e-01 0.131 0.0873 0.115 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 825667 sc-eQTL 7.21e-01 0.0215 0.0601 0.115 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000118515 SGK1 -677876 sc-eQTL 1.30e-01 0.124 0.0815 0.115 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 826897 sc-eQTL 1.26e-01 -0.163 0.106 0.115 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000286887 AL355881.1 -656065 sc-eQTL 2.83e-01 0.121 0.112 0.115 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000028839 TBPL1 -311934 sc-eQTL 9.72e-01 -0.00514 0.144 0.116 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000093134 VNN3 905471 sc-eQTL 8.83e-01 0.0207 0.14 0.116 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112299 VNN1 926181 sc-eQTL 6.48e-01 0.0632 0.139 0.116 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 876777 sc-eQTL 8.29e-01 -0.0282 0.131 0.116 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 825667 sc-eQTL 9.17e-01 0.00576 0.0554 0.116 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000118515 SGK1 -677876 sc-eQTL 2.24e-01 0.102 0.0836 0.116 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 826897 sc-eQTL 8.92e-01 0.0183 0.135 0.116 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000286887 AL355881.1 -656065 sc-eQTL 8.90e-01 0.0169 0.122 0.116 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000028839 TBPL1 -311934 sc-eQTL 4.85e-01 -0.082 0.117 0.116 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 876777 sc-eQTL 4.39e-01 -0.108 0.139 0.116 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 825667 sc-eQTL 6.41e-01 -0.0266 0.0569 0.116 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000118515 SGK1 -677876 sc-eQTL 6.07e-01 0.0605 0.118 0.116 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000112299 VNN1 926181 pQTL 0.00806 -0.154 0.058 0.0 0.0 0.0965
ENSG00000112299 VNN1 926181 eQTL 0.0476 -0.0702 0.0354 0.0 0.0 0.0981
ENSG00000234484 AL032821.1 887561 eQTL 0.0445 -0.102 0.0507 0.0 0.0 0.0981

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000146409 \N 826897 3.02e-07 1.5e-07 5.64e-08 2.09e-07 1.03e-07 8.45e-08 1.9e-07 5.62e-08 1.44e-07 6.75e-08 1.62e-07 1.19e-07 2.13e-07 8e-08 5.69e-08 7.89e-08 4.45e-08 1.64e-07 6.75e-08 4.92e-08 1.27e-07 1.39e-07 1.58e-07 2.87e-08 1.72e-07 1.23e-07 1.17e-07 1.06e-07 1.26e-07 1.03e-07 1.09e-07 3.93e-08 3.59e-08 8.89e-08 3.51e-08 3.22e-08 5.65e-08 8.68e-08 6.71e-08 3.67e-08 5.43e-08 1.5e-07 4.87e-08 1.09e-08 3.81e-08 1.71e-08 1.2e-07 1.92e-09 4.99e-08
ENSG00000234484 AL032821.1 887561 2.91e-07 1.36e-07 4.98e-08 2.01e-07 1.01e-07 8.45e-08 1.67e-07 5.66e-08 1.47e-07 6.08e-08 1.73e-07 1.08e-07 1.87e-07 7.95e-08 5.72e-08 7.23e-08 4.24e-08 1.51e-07 6.07e-08 4.3e-08 1.25e-07 1.25e-07 1.44e-07 2.64e-08 1.65e-07 1.26e-07 1.13e-07 9.92e-08 1.23e-07 1e-07 1.07e-07 2.96e-08 4.02e-08 8.56e-08 3.4e-08 2.99e-08 5.59e-08 8.61e-08 6.86e-08 4.47e-08 5.13e-08 1.46e-07 5.08e-08 1.35e-08 3.84e-08 1.8e-08 1.18e-07 1.89e-09 5.02e-08