logo

Genes within 1Mb (chr6:133628342:C:T):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000028839 TBPL1 -323828 sc-eQTL 5.83e-02 0.228 0.12 0.16 B L1
ENSG00000112303 VNN2 864883 sc-eQTL 4.54e-01 0.0679 0.0905 0.16 B L1
ENSG00000112306 RPS12 813773 sc-eQTL 7.28e-01 0.0191 0.0548 0.16 B L1
ENSG00000118515 SGK1 -689770 sc-eQTL 4.17e-01 0.0686 0.0843 0.16 B L1
ENSG00000146409 SLC18B1 815003 sc-eQTL 6.83e-01 0.0471 0.115 0.16 B L1
ENSG00000028839 TBPL1 -323828 sc-eQTL 6.86e-02 0.163 0.0892 0.16 CD4T L1
ENSG00000112303 VNN2 864883 sc-eQTL 8.03e-01 0.0202 0.081 0.16 CD4T L1
ENSG00000112306 RPS12 813773 sc-eQTL 8.40e-01 0.0111 0.0551 0.16 CD4T L1
ENSG00000118515 SGK1 -689770 sc-eQTL 1.13e-01 -0.117 0.0736 0.16 CD4T L1
ENSG00000146409 SLC18B1 815003 sc-eQTL 3.79e-01 0.098 0.111 0.16 CD4T L1
ENSG00000028839 TBPL1 -323828 sc-eQTL 5.30e-01 -0.0541 0.0861 0.16 CD8T L1
ENSG00000112303 VNN2 864883 sc-eQTL 6.07e-02 0.196 0.104 0.16 CD8T L1
ENSG00000112306 RPS12 813773 sc-eQTL 8.69e-01 -0.00592 0.0359 0.16 CD8T L1
ENSG00000118515 SGK1 -689770 sc-eQTL 9.41e-01 -0.0041 0.0553 0.16 CD8T L1
ENSG00000146409 SLC18B1 815003 sc-eQTL 4.33e-01 0.0852 0.108 0.16 CD8T L1
ENSG00000028839 TBPL1 -323828 sc-eQTL 4.57e-01 -0.0994 0.133 0.162 DC L1
ENSG00000093134 VNN3 893577 sc-eQTL 1.45e-01 0.15 0.102 0.162 DC L1
ENSG00000112299 VNN1 914287 sc-eQTL 7.49e-01 -0.0356 0.111 0.162 DC L1
ENSG00000112303 VNN2 864883 sc-eQTL 8.67e-01 0.0199 0.119 0.162 DC L1
ENSG00000112306 RPS12 813773 sc-eQTL 6.06e-01 0.0344 0.0666 0.162 DC L1
ENSG00000118515 SGK1 -689770 sc-eQTL 7.07e-01 0.0291 0.0773 0.162 DC L1
ENSG00000146409 SLC18B1 815003 sc-eQTL 3.94e-01 0.0899 0.105 0.162 DC L1
ENSG00000286438 AL591115.1 525214 sc-eQTL 7.28e-01 -0.0334 0.096 0.162 DC L1
ENSG00000286887 AL355881.1 -667959 sc-eQTL 5.35e-01 0.0742 0.12 0.162 DC L1
ENSG00000028839 TBPL1 -323828 sc-eQTL 4.01e-01 0.0784 0.0932 0.16 Mono L1
ENSG00000093134 VNN3 893577 sc-eQTL 7.68e-01 0.0316 0.107 0.16 Mono L1
ENSG00000112299 VNN1 914287 sc-eQTL 9.05e-01 -0.0137 0.115 0.16 Mono L1
ENSG00000112303 VNN2 864883 sc-eQTL 1.81e-01 0.109 0.081 0.16 Mono L1
ENSG00000112306 RPS12 813773 sc-eQTL 3.56e-01 -0.045 0.0487 0.16 Mono L1
ENSG00000118515 SGK1 -689770 sc-eQTL 5.12e-01 0.0452 0.0688 0.16 Mono L1
ENSG00000146409 SLC18B1 815003 sc-eQTL 3.73e-02 -0.2 0.0955 0.16 Mono L1
ENSG00000286887 AL355881.1 -667959 sc-eQTL 6.22e-01 0.0468 0.0947 0.16 Mono L1
ENSG00000028839 TBPL1 -323828 sc-eQTL 5.44e-01 -0.0607 0.1 0.161 NK L1
ENSG00000112303 VNN2 864883 sc-eQTL 5.55e-01 -0.0681 0.115 0.161 NK L1
ENSG00000112306 RPS12 813773 sc-eQTL 7.60e-01 -0.0146 0.0477 0.161 NK L1
ENSG00000118515 SGK1 -689770 sc-eQTL 5.45e-02 0.169 0.0874 0.161 NK L1
ENSG00000028839 TBPL1 -323828 sc-eQTL 1.76e-01 0.162 0.119 0.16 Other_T L1
ENSG00000112303 VNN2 864883 sc-eQTL 1.15e-01 0.179 0.113 0.16 Other_T L1
ENSG00000112306 RPS12 813773 sc-eQTL 2.29e-01 0.0544 0.045 0.16 Other_T L1
ENSG00000118515 SGK1 -689770 sc-eQTL 3.47e-01 0.0783 0.083 0.16 Other_T L1
ENSG00000146409 SLC18B1 815003 sc-eQTL 5.56e-02 0.236 0.123 0.16 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000028839 TBPL1 -323828 sc-eQTL 5.77e-01 -0.0811 0.145 0.148 B_Activated L2
ENSG00000112303 VNN2 864883 sc-eQTL 4.56e-01 0.0987 0.132 0.148 B_Activated L2
ENSG00000112306 RPS12 813773 sc-eQTL 9.91e-01 -0.000816 0.0709 0.148 B_Activated L2
ENSG00000118515 SGK1 -689770 sc-eQTL 2.06e-01 0.16 0.126 0.148 B_Activated L2
ENSG00000146409 SLC18B1 815003 sc-eQTL 5.17e-01 -0.0806 0.124 0.148 B_Activated L2
ENSG00000028839 TBPL1 -323828 sc-eQTL 9.35e-01 0.0108 0.132 0.161 B_Intermediate L2
ENSG00000112303 VNN2 864883 sc-eQTL 8.67e-01 -0.0192 0.114 0.161 B_Intermediate L2
ENSG00000112306 RPS12 813773 sc-eQTL 8.14e-01 0.0164 0.0699 0.161 B_Intermediate L2
ENSG00000118515 SGK1 -689770 sc-eQTL 1.01e-01 0.198 0.12 0.161 B_Intermediate L2
ENSG00000146409 SLC18B1 815003 sc-eQTL 5.84e-01 0.069 0.126 0.161 B_Intermediate L2
ENSG00000028839 TBPL1 -323828 sc-eQTL 8.37e-02 0.217 0.125 0.162 B_Memory L2
ENSG00000112303 VNN2 864883 sc-eQTL 8.30e-01 0.0255 0.119 0.162 B_Memory L2
ENSG00000112306 RPS12 813773 sc-eQTL 7.76e-01 0.0163 0.0573 0.162 B_Memory L2
ENSG00000118515 SGK1 -689770 sc-eQTL 4.76e-02 0.207 0.104 0.162 B_Memory L2
ENSG00000146409 SLC18B1 815003 sc-eQTL 7.59e-01 0.0366 0.119 0.162 B_Memory L2
ENSG00000028839 TBPL1 -323828 sc-eQTL 7.53e-01 0.0372 0.118 0.16 B_Naive1 L2
ENSG00000112303 VNN2 864883 sc-eQTL 2.15e-01 0.137 0.11 0.16 B_Naive1 L2
ENSG00000112306 RPS12 813773 sc-eQTL 9.15e-01 -0.00675 0.063 0.16 B_Naive1 L2
ENSG00000118515 SGK1 -689770 sc-eQTL 6.89e-01 -0.0395 0.0985 0.16 B_Naive1 L2
ENSG00000146409 SLC18B1 815003 sc-eQTL 7.33e-01 0.0415 0.121 0.16 B_Naive1 L2
ENSG00000028839 TBPL1 -323828 sc-eQTL 5.96e-02 0.238 0.126 0.161 B_Naive2 L2
ENSG00000112303 VNN2 864883 sc-eQTL 8.49e-01 -0.0236 0.123 0.161 B_Naive2 L2
ENSG00000112306 RPS12 813773 sc-eQTL 7.19e-01 -0.0236 0.0654 0.161 B_Naive2 L2
ENSG00000118515 SGK1 -689770 sc-eQTL 8.80e-01 -0.0174 0.116 0.161 B_Naive2 L2
ENSG00000146409 SLC18B1 815003 sc-eQTL 9.58e-01 -0.00663 0.125 0.161 B_Naive2 L2
ENSG00000028839 TBPL1 -323828 sc-eQTL 5.09e-01 0.0821 0.124 0.161 CD4_CTL L2
ENSG00000112303 VNN2 864883 sc-eQTL 8.43e-01 0.0247 0.124 0.161 CD4_CTL L2
ENSG00000112306 RPS12 813773 sc-eQTL 2.82e-01 -0.0618 0.0573 0.161 CD4_CTL L2
ENSG00000118515 SGK1 -689770 sc-eQTL 6.15e-01 0.0502 0.0996 0.161 CD4_CTL L2
ENSG00000146409 SLC18B1 815003 sc-eQTL 6.10e-01 0.0592 0.116 0.161 CD4_CTL L2
ENSG00000028839 TBPL1 -323828 sc-eQTL 1.30e-01 0.152 0.1 0.16 CD4_Naive L2
ENSG00000112303 VNN2 864883 sc-eQTL 8.27e-01 0.02 0.0915 0.16 CD4_Naive L2
ENSG00000112306 RPS12 813773 sc-eQTL 5.27e-01 0.0376 0.0593 0.16 CD4_Naive L2
ENSG00000118515 SGK1 -689770 sc-eQTL 2.46e-01 -0.0843 0.0725 0.16 CD4_Naive L2
ENSG00000146409 SLC18B1 815003 sc-eQTL 7.54e-01 0.0358 0.114 0.16 CD4_Naive L2
ENSG00000028839 TBPL1 -323828 sc-eQTL 8.26e-01 0.0236 0.107 0.16 CD4_TCM L2
ENSG00000112303 VNN2 864883 sc-eQTL 7.62e-01 0.0323 0.107 0.16 CD4_TCM L2
ENSG00000112306 RPS12 813773 sc-eQTL 3.19e-01 0.0551 0.0551 0.16 CD4_TCM L2
ENSG00000118515 SGK1 -689770 sc-eQTL 3.89e-01 -0.0666 0.0772 0.16 CD4_TCM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 815003 sc-eQTL 8.89e-01 0.0179 0.128 0.16 CD4_TCM L2
ENSG00000028839 TBPL1 -323828 sc-eQTL 3.71e-01 -0.112 0.125 0.16 CD4_TEM L2
ENSG00000112303 VNN2 864883 sc-eQTL 6.58e-01 -0.0535 0.121 0.16 CD4_TEM L2
ENSG00000112306 RPS12 813773 sc-eQTL 3.03e-01 0.051 0.0494 0.16 CD4_TEM L2
ENSG00000118515 SGK1 -689770 sc-eQTL 3.22e-01 0.0842 0.0849 0.16 CD4_TEM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 815003 sc-eQTL 1.28e-01 0.187 0.122 0.16 CD4_TEM L2
ENSG00000028839 TBPL1 -323828 sc-eQTL 1.91e-01 -0.145 0.111 0.16 CD8_CTL L2
ENSG00000112303 VNN2 864883 sc-eQTL 7.23e-01 0.0419 0.118 0.16 CD8_CTL L2
ENSG00000112306 RPS12 813773 sc-eQTL 4.32e-01 -0.0496 0.0631 0.16 CD8_CTL L2
ENSG00000118515 SGK1 -689770 sc-eQTL 1.27e-01 0.162 0.106 0.16 CD8_CTL L2
ENSG00000146409 SLC18B1 815003 sc-eQTL 4.44e-01 -0.0937 0.122 0.16 CD8_CTL L2
ENSG00000028839 TBPL1 -323828 sc-eQTL 4.47e-01 0.089 0.117 0.16 CD8_Naive L2
ENSG00000112303 VNN2 864883 sc-eQTL 3.03e-01 0.111 0.107 0.16 CD8_Naive L2
ENSG00000112306 RPS12 813773 sc-eQTL 2.27e-01 0.0744 0.0614 0.16 CD8_Naive L2
ENSG00000118515 SGK1 -689770 sc-eQTL 6.66e-01 -0.0335 0.0773 0.16 CD8_Naive L2
ENSG00000146409 SLC18B1 815003 sc-eQTL 7.85e-01 0.0338 0.124 0.16 CD8_Naive L2
ENSG00000028839 TBPL1 -323828 sc-eQTL 3.09e-01 -0.137 0.134 0.16 CD8_TCM L2
ENSG00000112303 VNN2 864883 sc-eQTL 9.75e-01 -0.00383 0.124 0.16 CD8_TCM L2
ENSG00000112306 RPS12 813773 sc-eQTL 9.03e-01 0.00735 0.0603 0.16 CD8_TCM L2
ENSG00000118515 SGK1 -689770 sc-eQTL 3.67e-01 -0.0901 0.0996 0.16 CD8_TCM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 815003 sc-eQTL 4.45e-01 0.101 0.132 0.16 CD8_TCM L2
ENSG00000028839 TBPL1 -323828 sc-eQTL 3.99e-01 -0.102 0.121 0.164 CD8_TEM L2
ENSG00000112303 VNN2 864883 sc-eQTL 1.03e-01 0.214 0.131 0.164 CD8_TEM L2
ENSG00000112306 RPS12 813773 sc-eQTL 6.03e-01 0.0368 0.0707 0.164 CD8_TEM L2
ENSG00000118515 SGK1 -689770 sc-eQTL 9.76e-01 0.00351 0.116 0.164 CD8_TEM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 815003 sc-eQTL 2.92e-01 0.141 0.133 0.164 CD8_TEM L2
ENSG00000028839 TBPL1 -323828 sc-eQTL 5.71e-02 0.238 0.124 0.158 MAIT L2
ENSG00000112303 VNN2 864883 sc-eQTL 3.11e-01 0.123 0.121 0.158 MAIT L2
ENSG00000112306 RPS12 813773 sc-eQTL 7.70e-01 0.0175 0.0597 0.158 MAIT L2
ENSG00000118515 SGK1 -689770 sc-eQTL 2.87e-03 0.248 0.0822 0.158 MAIT L2
ENSG00000146409 SLC18B1 815003 sc-eQTL 6.76e-02 0.228 0.124 0.158 MAIT L2
ENSG00000028839 TBPL1 -323828 sc-eQTL 7.40e-01 -0.0453 0.136 0.162 NK_CD56bright L2
ENSG00000112303 VNN2 864883 sc-eQTL 5.59e-01 0.0752 0.128 0.162 NK_CD56bright L2
ENSG00000112306 RPS12 813773 sc-eQTL 9.14e-01 -0.00774 0.0716 0.162 NK_CD56bright L2
ENSG00000118515 SGK1 -689770 sc-eQTL 2.11e-02 0.245 0.106 0.162 NK_CD56bright L2
ENSG00000028839 TBPL1 -323828 sc-eQTL 6.88e-01 -0.0432 0.107 0.162 NK_CD56dim L2
ENSG00000112303 VNN2 864883 sc-eQTL 8.15e-01 -0.0288 0.123 0.162 NK_CD56dim L2
ENSG00000112306 RPS12 813773 sc-eQTL 9.86e-01 0.000859 0.0488 0.162 NK_CD56dim L2
ENSG00000118515 SGK1 -689770 sc-eQTL 2.55e-01 0.123 0.108 0.162 NK_CD56dim L2
ENSG00000028839 TBPL1 -323828 sc-eQTL 6.59e-01 0.0596 0.135 0.162 NK_HLA L2
ENSG00000112303 VNN2 864883 sc-eQTL 7.64e-01 0.0373 0.124 0.162 NK_HLA L2
ENSG00000112306 RPS12 813773 sc-eQTL 4.35e-01 0.0452 0.0578 0.162 NK_HLA L2
ENSG00000118515 SGK1 -689770 sc-eQTL 6.05e-01 0.0593 0.114 0.162 NK_HLA L2
ENSG00000028839 TBPL1 -323828 sc-eQTL 3.69e-01 -0.101 0.112 0.162 NK_cytokine L2
ENSG00000112303 VNN2 864883 sc-eQTL 5.31e-01 -0.0767 0.122 0.162 NK_cytokine L2
ENSG00000112306 RPS12 813773 sc-eQTL 7.62e-01 0.0201 0.0664 0.162 NK_cytokine L2
ENSG00000118515 SGK1 -689770 sc-eQTL 3.40e-01 0.105 0.11 0.162 NK_cytokine L2
ENSG00000028839 TBPL1 -323828 sc-eQTL 1.46e-01 0.225 0.154 0.159 PB L2
ENSG00000112303 VNN2 864883 sc-eQTL 8.58e-01 0.0243 0.135 0.159 PB L2
ENSG00000112306 RPS12 813773 sc-eQTL 3.23e-01 0.0758 0.0765 0.159 PB L2
ENSG00000118515 SGK1 -689770 sc-eQTL 6.60e-01 0.0547 0.124 0.159 PB L2
ENSG00000146409 SLC18B1 815003 sc-eQTL 3.53e-01 -0.134 0.143 0.159 PB L2
ENSG00000028839 TBPL1 -323828 sc-eQTL 5.28e-01 -0.0812 0.129 0.161 Pro_T L2
ENSG00000112303 VNN2 864883 sc-eQTL 7.90e-02 -0.216 0.122 0.161 Pro_T L2
ENSG00000112306 RPS12 813773 sc-eQTL 2.40e-01 0.0548 0.0465 0.161 Pro_T L2
ENSG00000118515 SGK1 -689770 sc-eQTL 3.12e-01 -0.0945 0.0933 0.161 Pro_T L2
ENSG00000146409 SLC18B1 815003 sc-eQTL 4.04e-01 -0.101 0.12 0.161 Pro_T L2
ENSG00000028839 TBPL1 -323828 sc-eQTL 1.35e-01 0.189 0.126 0.16 Treg L2
ENSG00000112303 VNN2 864883 sc-eQTL 1.45e-01 -0.146 0.0999 0.16 Treg L2
ENSG00000112306 RPS12 813773 sc-eQTL 2.46e-01 0.0515 0.0443 0.16 Treg L2
ENSG00000118515 SGK1 -689770 sc-eQTL 8.90e-01 0.013 0.0935 0.16 Treg L2
ENSG00000146409 SLC18B1 815003 sc-eQTL 3.48e-01 0.118 0.125 0.16 Treg L2
ENSG00000028839 TBPL1 -323828 sc-eQTL 3.77e-01 0.119 0.134 0.154 cDC L2
ENSG00000093134 VNN3 893577 sc-eQTL 5.15e-01 0.0681 0.105 0.154 cDC L2
ENSG00000112299 VNN1 914287 sc-eQTL 3.65e-01 -0.111 0.123 0.154 cDC L2
ENSG00000112303 VNN2 864883 sc-eQTL 7.35e-01 -0.0407 0.12 0.154 cDC L2
ENSG00000112306 RPS12 813773 sc-eQTL 5.12e-01 -0.0388 0.0591 0.154 cDC L2
ENSG00000118515 SGK1 -689770 sc-eQTL 3.53e-01 0.0927 0.0995 0.154 cDC L2
ENSG00000146409 SLC18B1 815003 sc-eQTL 3.97e-01 0.0992 0.117 0.154 cDC L2
ENSG00000286438 AL591115.1 525214 sc-eQTL 5.75e-01 0.0526 0.0936 0.154 cDC L2
ENSG00000286887 AL355881.1 -667959 sc-eQTL 5.54e-01 0.0683 0.115 0.154 cDC L2
ENSG00000028839 TBPL1 -323828 sc-eQTL 2.18e-01 0.129 0.105 0.16 cMono_IL1B L2
ENSG00000093134 VNN3 893577 sc-eQTL 3.65e-01 0.102 0.112 0.16 cMono_IL1B L2
ENSG00000112299 VNN1 914287 sc-eQTL 9.80e-01 0.00292 0.114 0.16 cMono_IL1B L2
ENSG00000112303 VNN2 864883 sc-eQTL 7.50e-02 0.161 0.0902 0.16 cMono_IL1B L2
ENSG00000112306 RPS12 813773 sc-eQTL 9.23e-01 -0.00486 0.0504 0.16 cMono_IL1B L2
ENSG00000118515 SGK1 -689770 sc-eQTL 6.33e-01 0.0359 0.0752 0.16 cMono_IL1B L2
ENSG00000146409 SLC18B1 815003 sc-eQTL 9.25e-02 -0.163 0.0967 0.16 cMono_IL1B L2
ENSG00000286887 AL355881.1 -667959 sc-eQTL 8.92e-01 0.0137 0.101 0.16 cMono_IL1B L2
ENSG00000028839 TBPL1 -323828 sc-eQTL 8.15e-01 0.0277 0.119 0.16 cMono_S100A L2
ENSG00000093134 VNN3 893577 sc-eQTL 6.22e-01 -0.0528 0.107 0.16 cMono_S100A L2
ENSG00000112299 VNN1 914287 sc-eQTL 8.66e-01 -0.0196 0.116 0.16 cMono_S100A L2
ENSG00000112303 VNN2 864883 sc-eQTL 9.60e-01 0.0038 0.0761 0.16 cMono_S100A L2
ENSG00000112306 RPS12 813773 sc-eQTL 1.87e-01 -0.0722 0.0546 0.16 cMono_S100A L2
ENSG00000118515 SGK1 -689770 sc-eQTL 2.21e-01 0.0766 0.0625 0.16 cMono_S100A L2
ENSG00000146409 SLC18B1 815003 sc-eQTL 2.90e-01 -0.107 0.101 0.16 cMono_S100A L2
ENSG00000286887 AL355881.1 -667959 sc-eQTL 1.85e-01 0.131 0.0988 0.16 cMono_S100A L2
ENSG00000028839 TBPL1 -323828 sc-eQTL 1.54e-01 -0.238 0.166 0.161 gdT L2
ENSG00000112303 VNN2 864883 sc-eQTL 9.15e-03 0.411 0.155 0.161 gdT L2
ENSG00000112306 RPS12 813773 sc-eQTL 7.63e-01 0.0183 0.0606 0.161 gdT L2
ENSG00000118515 SGK1 -689770 sc-eQTL 5.86e-01 0.0624 0.114 0.161 gdT L2
ENSG00000146409 SLC18B1 815003 sc-eQTL 6.47e-01 -0.072 0.157 0.161 gdT L2
ENSG00000028839 TBPL1 -323828 sc-eQTL 3.12e-01 0.123 0.121 0.164 intMono L2
ENSG00000093134 VNN3 893577 sc-eQTL 9.70e-01 -0.00439 0.117 0.164 intMono L2
ENSG00000112299 VNN1 914287 sc-eQTL 8.95e-01 -0.0152 0.116 0.164 intMono L2
ENSG00000112303 VNN2 864883 sc-eQTL 8.74e-01 -0.0187 0.118 0.164 intMono L2
ENSG00000112306 RPS12 813773 sc-eQTL 2.77e-01 0.0557 0.051 0.164 intMono L2
ENSG00000118515 SGK1 -689770 sc-eQTL 8.76e-01 -0.0134 0.086 0.164 intMono L2
ENSG00000146409 SLC18B1 815003 sc-eQTL 5.38e-01 0.0768 0.124 0.164 intMono L2
ENSG00000286887 AL355881.1 -667959 sc-eQTL 5.49e-01 0.0715 0.119 0.164 intMono L2
ENSG00000028839 TBPL1 -323828 sc-eQTL 5.04e-01 -0.0853 0.127 0.158 ncMono L2
ENSG00000093134 VNN3 893577 sc-eQTL 8.34e-01 -0.0255 0.122 0.158 ncMono L2
ENSG00000112299 VNN1 914287 sc-eQTL 7.90e-01 -0.0323 0.121 0.158 ncMono L2
ENSG00000112303 VNN2 864883 sc-eQTL 8.65e-01 0.0198 0.116 0.158 ncMono L2
ENSG00000112306 RPS12 813773 sc-eQTL 6.53e-01 -0.0262 0.0582 0.158 ncMono L2
ENSG00000118515 SGK1 -689770 sc-eQTL 2.51e-01 0.0946 0.0822 0.158 ncMono L2
ENSG00000146409 SLC18B1 815003 sc-eQTL 9.58e-02 -0.171 0.102 0.158 ncMono L2
ENSG00000286887 AL355881.1 -667959 sc-eQTL 4.27e-01 0.0865 0.109 0.158 ncMono L2
ENSG00000028839 TBPL1 -323828 sc-eQTL 4.20e-01 -0.119 0.147 0.164 pDC L2
ENSG00000093134 VNN3 893577 sc-eQTL 2.65e-01 0.11 0.098 0.164 pDC L2
ENSG00000112299 VNN1 914287 sc-eQTL 3.91e-02 -0.206 0.0988 0.164 pDC L2
ENSG00000112303 VNN2 864883 sc-eQTL 6.85e-01 0.0485 0.119 0.164 pDC L2
ENSG00000112306 RPS12 813773 sc-eQTL 2.52e-01 0.0939 0.0818 0.164 pDC L2
ENSG00000118515 SGK1 -689770 sc-eQTL 6.41e-01 0.039 0.0834 0.164 pDC L2
ENSG00000146409 SLC18B1 815003 sc-eQTL 7.64e-01 -0.0366 0.122 0.164 pDC L2
ENSG00000286438 AL591115.1 525214 sc-eQTL 9.81e-01 0.00278 0.116 0.164 pDC L2
ENSG00000286887 AL355881.1 -667959 sc-eQTL 4.44e-01 -0.0791 0.103 0.164 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000028839 TBPL1 -323828 sc-eQTL 5.39e-01 0.0775 0.126 0.16 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 864883 sc-eQTL 3.89e-01 0.0946 0.11 0.16 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 813773 sc-eQTL 6.72e-01 0.0265 0.0625 0.16 B_Memory LOneK1K
ENSG00000118515 SGK1 -689770 sc-eQTL 3.19e-03 0.286 0.0957 0.16 B_Memory LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 815003 sc-eQTL 7.43e-01 0.0376 0.115 0.16 B_Memory LOneK1K
ENSG00000028839 TBPL1 -323828 sc-eQTL 8.44e-02 0.205 0.118 0.16 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 864883 sc-eQTL 4.86e-01 0.0726 0.104 0.16 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 813773 sc-eQTL 9.51e-01 -0.00389 0.063 0.16 B_Naive LOneK1K
ENSG00000118515 SGK1 -689770 sc-eQTL 7.20e-01 -0.035 0.0975 0.16 B_Naive LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 815003 sc-eQTL 6.15e-01 0.0599 0.119 0.16 B_Naive LOneK1K
ENSG00000028839 TBPL1 -323828 sc-eQTL 3.25e-01 0.0942 0.0955 0.16 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000093134 VNN3 893577 sc-eQTL 5.54e-01 0.0643 0.108 0.16 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112299 VNN1 914287 sc-eQTL 8.46e-01 -0.0221 0.113 0.16 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 864883 sc-eQTL 2.22e-01 0.0913 0.0745 0.16 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 813773 sc-eQTL 7.17e-01 -0.0186 0.0513 0.16 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000118515 SGK1 -689770 sc-eQTL 3.32e-01 0.0679 0.0697 0.16 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 815003 sc-eQTL 6.30e-02 -0.169 0.0905 0.16 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000286887 AL355881.1 -667959 sc-eQTL 5.76e-01 0.0535 0.0957 0.16 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000028839 TBPL1 -323828 sc-eQTL 9.11e-01 -0.0137 0.122 0.162 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000093134 VNN3 893577 sc-eQTL 8.40e-01 -0.0239 0.119 0.162 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112299 VNN1 914287 sc-eQTL 9.87e-01 0.00185 0.118 0.162 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 864883 sc-eQTL 8.39e-01 0.0225 0.111 0.162 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 813773 sc-eQTL 9.65e-01 -0.00206 0.047 0.162 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000118515 SGK1 -689770 sc-eQTL 6.49e-01 0.0324 0.0712 0.162 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 815003 sc-eQTL 8.88e-01 -0.0161 0.114 0.162 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000286887 AL355881.1 -667959 sc-eQTL 6.12e-01 0.0524 0.103 0.162 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000028839 TBPL1 -323828 sc-eQTL 3.48e-01 -0.0927 0.0987 0.162 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 864883 sc-eQTL 6.02e-01 -0.0613 0.117 0.162 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 813773 sc-eQTL 8.42e-01 -0.00958 0.048 0.162 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000118515 SGK1 -689770 sc-eQTL 2.41e-01 0.116 0.0988 0.162 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000112299 VNN1 914287 pQTL 0.00122 -0.154 0.0476 0.0 0.0 0.153
ENSG00000112299 VNN1 914287 eQTL 0.0326 -0.0612 0.0286 0.0 0.0 0.16
ENSG00000112303 VNN2 864883 pQTL 0.0163 0.0826 0.0344 0.0 0.0 0.153
ENSG00000220378 KRT8P42 -670353 eQTL 0.016 0.0982 0.0407 0.00204 0.0 0.16

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina