logo

Genes within 1Mb (chr6:133604471:T:C):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000028839 TBPL1 -347699 sc-eQTL 6.09e-02 0.223 0.119 0.16 B L1
ENSG00000112303 VNN2 841012 sc-eQTL 4.17e-01 0.0726 0.0894 0.16 B L1
ENSG00000112306 RPS12 789902 sc-eQTL 8.51e-01 -0.0101 0.0541 0.16 B L1
ENSG00000118515 SGK1 -713641 sc-eQTL 4.19e-01 0.0675 0.0833 0.16 B L1
ENSG00000146409 SLC18B1 791132 sc-eQTL 8.86e-01 0.0163 0.114 0.16 B L1
ENSG00000028839 TBPL1 -347699 sc-eQTL 1.50e-01 0.129 0.089 0.16 CD4T L1
ENSG00000112303 VNN2 841012 sc-eQTL 9.70e-01 -0.00307 0.0806 0.16 CD4T L1
ENSG00000112306 RPS12 789902 sc-eQTL 8.00e-01 -0.0139 0.0548 0.16 CD4T L1
ENSG00000118515 SGK1 -713641 sc-eQTL 8.98e-02 -0.125 0.0731 0.16 CD4T L1
ENSG00000146409 SLC18B1 791132 sc-eQTL 2.73e-01 0.122 0.11 0.16 CD4T L1
ENSG00000028839 TBPL1 -347699 sc-eQTL 4.22e-01 -0.0688 0.0856 0.16 CD8T L1
ENSG00000112303 VNN2 841012 sc-eQTL 8.49e-02 0.18 0.104 0.16 CD8T L1
ENSG00000112306 RPS12 789902 sc-eQTL 6.24e-01 -0.0175 0.0357 0.16 CD8T L1
ENSG00000118515 SGK1 -713641 sc-eQTL 8.68e-01 -0.00916 0.055 0.16 CD8T L1
ENSG00000146409 SLC18B1 791132 sc-eQTL 4.05e-01 0.09 0.108 0.16 CD8T L1
ENSG00000028839 TBPL1 -347699 sc-eQTL 2.88e-01 -0.142 0.133 0.162 DC L1
ENSG00000093134 VNN3 869706 sc-eQTL 1.57e-01 0.146 0.103 0.162 DC L1
ENSG00000112299 VNN1 890416 sc-eQTL 5.92e-01 -0.0596 0.111 0.162 DC L1
ENSG00000112303 VNN2 841012 sc-eQTL 8.85e-01 0.0172 0.119 0.162 DC L1
ENSG00000112306 RPS12 789902 sc-eQTL 7.19e-01 0.024 0.0667 0.162 DC L1
ENSG00000118515 SGK1 -713641 sc-eQTL 5.30e-01 0.0487 0.0773 0.162 DC L1
ENSG00000146409 SLC18B1 791132 sc-eQTL 6.37e-01 0.0499 0.106 0.162 DC L1
ENSG00000286438 AL591115.1 501343 sc-eQTL 6.35e-01 -0.0457 0.096 0.162 DC L1
ENSG00000286887 AL355881.1 -691830 sc-eQTL 5.60e-01 0.0698 0.12 0.162 DC L1
ENSG00000028839 TBPL1 -347699 sc-eQTL 4.15e-01 0.0759 0.093 0.16 Mono L1
ENSG00000093134 VNN3 869706 sc-eQTL 8.29e-01 0.0232 0.107 0.16 Mono L1
ENSG00000112299 VNN1 890416 sc-eQTL 7.35e-01 -0.039 0.115 0.16 Mono L1
ENSG00000112303 VNN2 841012 sc-eQTL 5.60e-01 0.0474 0.0811 0.16 Mono L1
ENSG00000112306 RPS12 789902 sc-eQTL 2.18e-01 -0.0599 0.0485 0.16 Mono L1
ENSG00000118515 SGK1 -713641 sc-eQTL 2.57e-01 0.0779 0.0685 0.16 Mono L1
ENSG00000146409 SLC18B1 791132 sc-eQTL 3.03e-02 -0.208 0.0952 0.16 Mono L1
ENSG00000286887 AL355881.1 -691830 sc-eQTL 3.43e-01 0.0897 0.0944 0.16 Mono L1
ENSG00000028839 TBPL1 -347699 sc-eQTL 4.64e-01 -0.0733 0.1 0.161 NK L1
ENSG00000112303 VNN2 841012 sc-eQTL 5.50e-01 -0.0689 0.115 0.161 NK L1
ENSG00000112306 RPS12 789902 sc-eQTL 6.12e-01 -0.0242 0.0476 0.161 NK L1
ENSG00000118515 SGK1 -713641 sc-eQTL 1.05e-01 0.143 0.0876 0.161 NK L1
ENSG00000028839 TBPL1 -347699 sc-eQTL 1.06e-01 0.192 0.118 0.16 Other_T L1
ENSG00000112303 VNN2 841012 sc-eQTL 3.10e-01 0.115 0.113 0.16 Other_T L1
ENSG00000112306 RPS12 789902 sc-eQTL 3.44e-01 0.0425 0.0448 0.16 Other_T L1
ENSG00000118515 SGK1 -713641 sc-eQTL 4.95e-01 0.0564 0.0825 0.16 Other_T L1
ENSG00000146409 SLC18B1 791132 sc-eQTL 1.73e-02 0.291 0.121 0.16 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000028839 TBPL1 -347699 sc-eQTL 4.71e-01 -0.104 0.144 0.151 B_Activated L2
ENSG00000112303 VNN2 841012 sc-eQTL 5.33e-01 0.0818 0.131 0.151 B_Activated L2
ENSG00000112306 RPS12 789902 sc-eQTL 9.84e-01 -0.00139 0.0703 0.151 B_Activated L2
ENSG00000118515 SGK1 -713641 sc-eQTL 1.96e-01 0.162 0.125 0.151 B_Activated L2
ENSG00000146409 SLC18B1 791132 sc-eQTL 5.32e-01 -0.0771 0.123 0.151 B_Activated L2
ENSG00000028839 TBPL1 -347699 sc-eQTL 9.00e-01 0.0165 0.131 0.161 B_Intermediate L2
ENSG00000112303 VNN2 841012 sc-eQTL 9.79e-01 -0.00294 0.114 0.161 B_Intermediate L2
ENSG00000112306 RPS12 789902 sc-eQTL 8.53e-01 -0.0129 0.0696 0.161 B_Intermediate L2
ENSG00000118515 SGK1 -713641 sc-eQTL 6.97e-02 0.218 0.119 0.161 B_Intermediate L2
ENSG00000146409 SLC18B1 791132 sc-eQTL 8.87e-01 0.0179 0.125 0.161 B_Intermediate L2
ENSG00000028839 TBPL1 -347699 sc-eQTL 8.38e-02 0.216 0.124 0.162 B_Memory L2
ENSG00000112303 VNN2 841012 sc-eQTL 7.36e-01 0.0399 0.118 0.162 B_Memory L2
ENSG00000112306 RPS12 789902 sc-eQTL 6.88e-01 -0.0229 0.057 0.162 B_Memory L2
ENSG00000118515 SGK1 -713641 sc-eQTL 4.87e-02 0.205 0.104 0.162 B_Memory L2
ENSG00000146409 SLC18B1 791132 sc-eQTL 7.46e-01 0.0386 0.119 0.162 B_Memory L2
ENSG00000028839 TBPL1 -347699 sc-eQTL 7.68e-01 0.0349 0.118 0.16 B_Naive1 L2
ENSG00000112303 VNN2 841012 sc-eQTL 2.05e-01 0.14 0.11 0.16 B_Naive1 L2
ENSG00000112306 RPS12 789902 sc-eQTL 4.56e-01 -0.0468 0.0627 0.16 B_Naive1 L2
ENSG00000118515 SGK1 -713641 sc-eQTL 8.66e-01 -0.0166 0.0981 0.16 B_Naive1 L2
ENSG00000146409 SLC18B1 791132 sc-eQTL 9.88e-01 0.00185 0.121 0.16 B_Naive1 L2
ENSG00000028839 TBPL1 -347699 sc-eQTL 4.83e-02 0.248 0.125 0.161 B_Naive2 L2
ENSG00000112303 VNN2 841012 sc-eQTL 7.79e-01 -0.0345 0.123 0.161 B_Naive2 L2
ENSG00000112306 RPS12 789902 sc-eQTL 4.11e-01 -0.0535 0.065 0.161 B_Naive2 L2
ENSG00000118515 SGK1 -713641 sc-eQTL 9.37e-01 0.00909 0.115 0.161 B_Naive2 L2
ENSG00000146409 SLC18B1 791132 sc-eQTL 8.30e-01 -0.0266 0.124 0.161 B_Naive2 L2
ENSG00000028839 TBPL1 -347699 sc-eQTL 7.47e-01 0.0401 0.124 0.161 CD4_CTL L2
ENSG00000112303 VNN2 841012 sc-eQTL 8.32e-01 0.0264 0.124 0.161 CD4_CTL L2
ENSG00000112306 RPS12 789902 sc-eQTL 1.72e-01 -0.0784 0.0571 0.161 CD4_CTL L2
ENSG00000118515 SGK1 -713641 sc-eQTL 5.51e-01 0.0594 0.0994 0.161 CD4_CTL L2
ENSG00000146409 SLC18B1 791132 sc-eQTL 5.08e-01 0.0767 0.116 0.161 CD4_CTL L2
ENSG00000028839 TBPL1 -347699 sc-eQTL 4.02e-01 0.0844 0.1 0.16 CD4_Naive L2
ENSG00000112303 VNN2 841012 sc-eQTL 9.85e-01 0.0017 0.0914 0.16 CD4_Naive L2
ENSG00000112306 RPS12 789902 sc-eQTL 6.61e-01 0.0261 0.0593 0.16 CD4_Naive L2
ENSG00000118515 SGK1 -713641 sc-eQTL 1.18e-01 -0.113 0.0722 0.16 CD4_Naive L2
ENSG00000146409 SLC18B1 791132 sc-eQTL 5.25e-01 0.0725 0.114 0.16 CD4_Naive L2
ENSG00000028839 TBPL1 -347699 sc-eQTL 7.08e-01 0.0402 0.107 0.16 CD4_TCM L2
ENSG00000112303 VNN2 841012 sc-eQTL 8.64e-01 -0.0182 0.106 0.16 CD4_TCM L2
ENSG00000112306 RPS12 789902 sc-eQTL 4.94e-01 0.0377 0.055 0.16 CD4_TCM L2
ENSG00000118515 SGK1 -713641 sc-eQTL 5.26e-01 -0.0489 0.0769 0.16 CD4_TCM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 791132 sc-eQTL 7.00e-01 0.0492 0.127 0.16 CD4_TCM L2
ENSG00000028839 TBPL1 -347699 sc-eQTL 3.18e-01 -0.125 0.125 0.16 CD4_TEM L2
ENSG00000112303 VNN2 841012 sc-eQTL 5.69e-01 -0.0686 0.12 0.16 CD4_TEM L2
ENSG00000112306 RPS12 789902 sc-eQTL 5.54e-01 0.0292 0.0493 0.16 CD4_TEM L2
ENSG00000118515 SGK1 -713641 sc-eQTL 3.54e-01 0.0786 0.0846 0.16 CD4_TEM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 791132 sc-eQTL 2.27e-01 0.148 0.122 0.16 CD4_TEM L2
ENSG00000028839 TBPL1 -347699 sc-eQTL 1.81e-01 -0.148 0.11 0.16 CD8_CTL L2
ENSG00000112303 VNN2 841012 sc-eQTL 7.79e-01 0.033 0.118 0.16 CD8_CTL L2
ENSG00000112306 RPS12 789902 sc-eQTL 4.11e-01 -0.0517 0.0629 0.16 CD8_CTL L2
ENSG00000118515 SGK1 -713641 sc-eQTL 1.38e-01 0.158 0.106 0.16 CD8_CTL L2
ENSG00000146409 SLC18B1 791132 sc-eQTL 5.27e-01 -0.0773 0.122 0.16 CD8_CTL L2
ENSG00000028839 TBPL1 -347699 sc-eQTL 6.22e-01 0.0576 0.117 0.16 CD8_Naive L2
ENSG00000112303 VNN2 841012 sc-eQTL 3.27e-01 0.105 0.107 0.16 CD8_Naive L2
ENSG00000112306 RPS12 789902 sc-eQTL 4.15e-01 0.0501 0.0614 0.16 CD8_Naive L2
ENSG00000118515 SGK1 -713641 sc-eQTL 4.44e-01 -0.0592 0.0771 0.16 CD8_Naive L2
ENSG00000146409 SLC18B1 791132 sc-eQTL 7.82e-01 0.0342 0.123 0.16 CD8_Naive L2
ENSG00000028839 TBPL1 -347699 sc-eQTL 2.88e-01 -0.143 0.134 0.16 CD8_TCM L2
ENSG00000112303 VNN2 841012 sc-eQTL 9.59e-01 -0.00638 0.124 0.16 CD8_TCM L2
ENSG00000112306 RPS12 789902 sc-eQTL 9.99e-01 0.000102 0.0604 0.16 CD8_TCM L2
ENSG00000118515 SGK1 -713641 sc-eQTL 4.12e-01 -0.082 0.0998 0.16 CD8_TCM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 791132 sc-eQTL 4.53e-01 0.0994 0.132 0.16 CD8_TCM L2
ENSG00000028839 TBPL1 -347699 sc-eQTL 2.92e-01 -0.127 0.12 0.164 CD8_TEM L2
ENSG00000112303 VNN2 841012 sc-eQTL 1.51e-01 0.188 0.13 0.164 CD8_TEM L2
ENSG00000112306 RPS12 789902 sc-eQTL 9.17e-01 0.00732 0.0704 0.164 CD8_TEM L2
ENSG00000118515 SGK1 -713641 sc-eQTL 8.16e-01 -0.0269 0.115 0.164 CD8_TEM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 791132 sc-eQTL 4.19e-01 0.108 0.133 0.164 CD8_TEM L2
ENSG00000028839 TBPL1 -347699 sc-eQTL 1.27e-02 0.309 0.123 0.158 MAIT L2
ENSG00000112303 VNN2 841012 sc-eQTL 2.64e-01 0.135 0.12 0.158 MAIT L2
ENSG00000112306 RPS12 789902 sc-eQTL 8.22e-01 0.0133 0.0593 0.158 MAIT L2
ENSG00000118515 SGK1 -713641 sc-eQTL 8.22e-03 0.219 0.0821 0.158 MAIT L2
ENSG00000146409 SLC18B1 791132 sc-eQTL 9.96e-03 0.318 0.122 0.158 MAIT L2
ENSG00000028839 TBPL1 -347699 sc-eQTL 8.45e-01 -0.0267 0.136 0.162 NK_CD56bright L2
ENSG00000112303 VNN2 841012 sc-eQTL 6.93e-01 0.0507 0.128 0.162 NK_CD56bright L2
ENSG00000112306 RPS12 789902 sc-eQTL 4.43e-01 -0.0549 0.0715 0.162 NK_CD56bright L2
ENSG00000118515 SGK1 -713641 sc-eQTL 7.40e-02 0.191 0.106 0.162 NK_CD56bright L2
ENSG00000028839 TBPL1 -347699 sc-eQTL 5.51e-01 -0.064 0.107 0.162 NK_CD56dim L2
ENSG00000112303 VNN2 841012 sc-eQTL 9.06e-01 -0.0146 0.123 0.162 NK_CD56dim L2
ENSG00000112306 RPS12 789902 sc-eQTL 9.28e-01 0.0044 0.0488 0.162 NK_CD56dim L2
ENSG00000118515 SGK1 -713641 sc-eQTL 2.74e-01 0.118 0.108 0.162 NK_CD56dim L2
ENSG00000028839 TBPL1 -347699 sc-eQTL 5.35e-01 0.0836 0.134 0.162 NK_HLA L2
ENSG00000112303 VNN2 841012 sc-eQTL 9.56e-01 0.00688 0.124 0.162 NK_HLA L2
ENSG00000112306 RPS12 789902 sc-eQTL 7.07e-01 0.0217 0.0577 0.162 NK_HLA L2
ENSG00000118515 SGK1 -713641 sc-eQTL 7.04e-01 0.0435 0.114 0.162 NK_HLA L2
ENSG00000028839 TBPL1 -347699 sc-eQTL 3.08e-01 -0.115 0.112 0.162 NK_cytokine L2
ENSG00000112303 VNN2 841012 sc-eQTL 5.28e-01 -0.0773 0.122 0.162 NK_cytokine L2
ENSG00000112306 RPS12 789902 sc-eQTL 9.38e-01 0.00515 0.0664 0.162 NK_cytokine L2
ENSG00000118515 SGK1 -713641 sc-eQTL 4.12e-01 0.0908 0.11 0.162 NK_cytokine L2
ENSG00000028839 TBPL1 -347699 sc-eQTL 2.00e-01 0.199 0.155 0.159 PB L2
ENSG00000112303 VNN2 841012 sc-eQTL 8.06e-01 0.0335 0.136 0.159 PB L2
ENSG00000112306 RPS12 789902 sc-eQTL 2.22e-01 0.094 0.0765 0.159 PB L2
ENSG00000118515 SGK1 -713641 sc-eQTL 8.31e-01 0.0266 0.124 0.159 PB L2
ENSG00000146409 SLC18B1 791132 sc-eQTL 6.91e-01 -0.0575 0.144 0.159 PB L2
ENSG00000028839 TBPL1 -347699 sc-eQTL 4.15e-01 -0.105 0.128 0.161 Pro_T L2
ENSG00000112303 VNN2 841012 sc-eQTL 3.36e-02 -0.26 0.122 0.161 Pro_T L2
ENSG00000112306 RPS12 789902 sc-eQTL 1.30e-01 0.0704 0.0463 0.161 Pro_T L2
ENSG00000118515 SGK1 -713641 sc-eQTL 2.57e-01 -0.106 0.093 0.161 Pro_T L2
ENSG00000146409 SLC18B1 791132 sc-eQTL 2.85e-01 -0.129 0.12 0.161 Pro_T L2
ENSG00000028839 TBPL1 -347699 sc-eQTL 1.05e-01 0.205 0.126 0.16 Treg L2
ENSG00000112303 VNN2 841012 sc-eQTL 8.80e-02 -0.171 0.0996 0.16 Treg L2
ENSG00000112306 RPS12 789902 sc-eQTL 6.28e-01 0.0215 0.0443 0.16 Treg L2
ENSG00000118515 SGK1 -713641 sc-eQTL 8.07e-01 0.0228 0.0934 0.16 Treg L2
ENSG00000146409 SLC18B1 791132 sc-eQTL 3.65e-01 0.113 0.125 0.16 Treg L2
ENSG00000028839 TBPL1 -347699 sc-eQTL 6.48e-01 0.0613 0.134 0.154 cDC L2
ENSG00000093134 VNN3 869706 sc-eQTL 4.59e-01 0.0774 0.104 0.154 cDC L2
ENSG00000112299 VNN1 890416 sc-eQTL 3.16e-01 -0.123 0.123 0.154 cDC L2
ENSG00000112303 VNN2 841012 sc-eQTL 8.04e-01 -0.0297 0.12 0.154 cDC L2
ENSG00000112306 RPS12 789902 sc-eQTL 2.51e-01 -0.0678 0.0589 0.154 cDC L2
ENSG00000118515 SGK1 -713641 sc-eQTL 2.93e-01 0.105 0.0993 0.154 cDC L2
ENSG00000146409 SLC18B1 791132 sc-eQTL 7.01e-01 0.045 0.117 0.154 cDC L2
ENSG00000286438 AL591115.1 501343 sc-eQTL 3.48e-01 0.0878 0.0933 0.154 cDC L2
ENSG00000286887 AL355881.1 -691830 sc-eQTL 4.24e-01 0.0921 0.115 0.154 cDC L2
ENSG00000028839 TBPL1 -347699 sc-eQTL 1.53e-01 0.149 0.104 0.16 cMono_IL1B L2
ENSG00000093134 VNN3 869706 sc-eQTL 3.54e-01 0.104 0.112 0.16 cMono_IL1B L2
ENSG00000112299 VNN1 890416 sc-eQTL 9.78e-01 -0.00317 0.113 0.16 cMono_IL1B L2
ENSG00000112303 VNN2 841012 sc-eQTL 1.93e-01 0.118 0.09 0.16 cMono_IL1B L2
ENSG00000112306 RPS12 789902 sc-eQTL 7.32e-01 -0.0172 0.0502 0.16 cMono_IL1B L2
ENSG00000118515 SGK1 -713641 sc-eQTL 2.66e-01 0.0832 0.0746 0.16 cMono_IL1B L2
ENSG00000146409 SLC18B1 791132 sc-eQTL 8.78e-02 -0.165 0.0961 0.16 cMono_IL1B L2
ENSG00000286887 AL355881.1 -691830 sc-eQTL 6.43e-01 0.0468 0.101 0.16 cMono_IL1B L2
ENSG00000028839 TBPL1 -347699 sc-eQTL 9.90e-01 0.00147 0.118 0.16 cMono_S100A L2
ENSG00000093134 VNN3 869706 sc-eQTL 6.39e-01 -0.05 0.106 0.16 cMono_S100A L2
ENSG00000112299 VNN1 890416 sc-eQTL 8.51e-01 -0.0217 0.116 0.16 cMono_S100A L2
ENSG00000112303 VNN2 841012 sc-eQTL 8.13e-01 -0.0179 0.0757 0.16 cMono_S100A L2
ENSG00000112306 RPS12 789902 sc-eQTL 1.43e-01 -0.0796 0.0542 0.16 cMono_S100A L2
ENSG00000118515 SGK1 -713641 sc-eQTL 1.32e-01 0.0938 0.062 0.16 cMono_S100A L2
ENSG00000146409 SLC18B1 791132 sc-eQTL 1.64e-01 -0.14 0.1 0.16 cMono_S100A L2
ENSG00000286887 AL355881.1 -691830 sc-eQTL 1.41e-01 0.145 0.0982 0.16 cMono_S100A L2
ENSG00000028839 TBPL1 -347699 sc-eQTL 9.85e-02 -0.274 0.165 0.164 gdT L2
ENSG00000112303 VNN2 841012 sc-eQTL 1.77e-02 0.372 0.155 0.164 gdT L2
ENSG00000112306 RPS12 789902 sc-eQTL 8.79e-01 -0.00917 0.0602 0.164 gdT L2
ENSG00000118515 SGK1 -713641 sc-eQTL 6.56e-01 0.0508 0.114 0.164 gdT L2
ENSG00000146409 SLC18B1 791132 sc-eQTL 5.24e-01 -0.0994 0.155 0.164 gdT L2
ENSG00000028839 TBPL1 -347699 sc-eQTL 3.13e-01 0.123 0.121 0.162 intMono L2
ENSG00000093134 VNN3 869706 sc-eQTL 9.51e-01 0.00727 0.117 0.162 intMono L2
ENSG00000112299 VNN1 890416 sc-eQTL 8.73e-01 -0.0185 0.116 0.162 intMono L2
ENSG00000112303 VNN2 841012 sc-eQTL 7.61e-01 -0.0359 0.118 0.162 intMono L2
ENSG00000112306 RPS12 789902 sc-eQTL 5.52e-01 0.0305 0.0512 0.162 intMono L2
ENSG00000118515 SGK1 -713641 sc-eQTL 7.43e-01 0.0282 0.0861 0.162 intMono L2
ENSG00000146409 SLC18B1 791132 sc-eQTL 7.94e-01 0.0327 0.125 0.162 intMono L2
ENSG00000286887 AL355881.1 -691830 sc-eQTL 4.91e-01 0.0822 0.119 0.162 intMono L2
ENSG00000028839 TBPL1 -347699 sc-eQTL 6.72e-01 -0.0539 0.127 0.158 ncMono L2
ENSG00000093134 VNN3 869706 sc-eQTL 9.48e-01 -0.00788 0.121 0.158 ncMono L2
ENSG00000112299 VNN1 890416 sc-eQTL 5.50e-01 -0.0721 0.12 0.158 ncMono L2
ENSG00000112303 VNN2 841012 sc-eQTL 8.22e-01 -0.0261 0.116 0.158 ncMono L2
ENSG00000112306 RPS12 789902 sc-eQTL 8.06e-01 -0.0143 0.0581 0.158 ncMono L2
ENSG00000118515 SGK1 -713641 sc-eQTL 2.94e-01 0.0862 0.082 0.158 ncMono L2
ENSG00000146409 SLC18B1 791132 sc-eQTL 1.43e-01 -0.15 0.102 0.158 ncMono L2
ENSG00000286887 AL355881.1 -691830 sc-eQTL 2.13e-01 0.135 0.108 0.158 ncMono L2
ENSG00000028839 TBPL1 -347699 sc-eQTL 4.40e-01 -0.112 0.145 0.164 pDC L2
ENSG00000093134 VNN3 869706 sc-eQTL 2.75e-01 0.106 0.0973 0.164 pDC L2
ENSG00000112299 VNN1 890416 sc-eQTL 1.46e-02 -0.241 0.0975 0.164 pDC L2
ENSG00000112303 VNN2 841012 sc-eQTL 5.66e-01 0.0679 0.118 0.164 pDC L2
ENSG00000112306 RPS12 789902 sc-eQTL 3.86e-01 0.0707 0.0813 0.164 pDC L2
ENSG00000118515 SGK1 -713641 sc-eQTL 4.76e-01 0.0591 0.0827 0.164 pDC L2
ENSG00000146409 SLC18B1 791132 sc-eQTL 5.75e-01 -0.0677 0.121 0.164 pDC L2
ENSG00000286438 AL591115.1 501343 sc-eQTL 7.77e-01 -0.0328 0.115 0.164 pDC L2
ENSG00000286887 AL355881.1 -691830 sc-eQTL 5.55e-01 -0.0604 0.102 0.164 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000028839 TBPL1 -347699 sc-eQTL 5.31e-01 0.0785 0.125 0.16 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 841012 sc-eQTL 1.82e-01 0.146 0.109 0.16 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 789902 sc-eQTL 9.61e-01 -0.00305 0.0621 0.16 B_Memory LOneK1K
ENSG00000118515 SGK1 -713641 sc-eQTL 4.10e-03 0.276 0.0953 0.16 B_Memory LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 791132 sc-eQTL 9.04e-01 -0.0137 0.114 0.16 B_Memory LOneK1K
ENSG00000028839 TBPL1 -347699 sc-eQTL 8.45e-02 0.204 0.118 0.16 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 841012 sc-eQTL 5.34e-01 0.0645 0.104 0.16 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 789902 sc-eQTL 4.82e-01 -0.0441 0.0627 0.16 B_Naive LOneK1K
ENSG00000118515 SGK1 -713641 sc-eQTL 8.59e-01 -0.0173 0.0971 0.16 B_Naive LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 791132 sc-eQTL 8.35e-01 0.0247 0.118 0.16 B_Naive LOneK1K
ENSG00000028839 TBPL1 -347699 sc-eQTL 3.58e-01 0.0878 0.0952 0.16 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000093134 VNN3 869706 sc-eQTL 5.90e-01 0.0583 0.108 0.16 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112299 VNN1 890416 sc-eQTL 7.77e-01 -0.032 0.113 0.16 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 841012 sc-eQTL 5.83e-01 0.041 0.0745 0.16 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 789902 sc-eQTL 5.07e-01 -0.034 0.0511 0.16 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000118515 SGK1 -713641 sc-eQTL 1.38e-01 0.103 0.0693 0.16 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 791132 sc-eQTL 4.30e-02 -0.184 0.0901 0.16 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000286887 AL355881.1 -691830 sc-eQTL 3.73e-01 0.0851 0.0953 0.16 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000028839 TBPL1 -347699 sc-eQTL 8.84e-01 0.0177 0.121 0.162 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000093134 VNN3 869706 sc-eQTL 9.88e-01 -0.00171 0.118 0.162 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112299 VNN1 890416 sc-eQTL 7.41e-01 -0.0386 0.117 0.162 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 841012 sc-eQTL 9.06e-01 -0.013 0.11 0.162 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 789902 sc-eQTL 9.78e-01 0.00131 0.0467 0.162 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000118515 SGK1 -713641 sc-eQTL 5.45e-01 0.0428 0.0707 0.162 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 791132 sc-eQTL 8.38e-01 -0.0232 0.113 0.162 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000286887 AL355881.1 -691830 sc-eQTL 3.30e-01 0.0999 0.102 0.162 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000028839 TBPL1 -347699 sc-eQTL 2.86e-01 -0.106 0.0986 0.162 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 841012 sc-eQTL 6.19e-01 -0.0585 0.117 0.162 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 789902 sc-eQTL 7.82e-01 -0.0133 0.048 0.162 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000118515 SGK1 -713641 sc-eQTL 2.92e-01 0.104 0.0988 0.162 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000112299 VNN1 890416 pQTL 0.00313 -0.141 0.0475 0.0 0.0 0.151
ENSG00000112299 VNN1 890416 eQTL 0.048 -0.0562 0.0284 0.0 0.0 0.159
ENSG00000112303 VNN2 841012 pQTL 0.0176 0.0814 0.0343 0.0 0.0 0.151
ENSG00000220378 KRT8P42 -694224 eQTL 0.0328 0.0865 0.0404 0.00142 0.0 0.159

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina