logo

Genes within 1Mb (chr6:133603744:C:G):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000028839 TBPL1 -348426 sc-eQTL 2.84e-02 0.284 0.129 0.13 B L1
ENSG00000112303 VNN2 840285 sc-eQTL 7.34e-01 0.0332 0.0974 0.13 B L1
ENSG00000112306 RPS12 789175 sc-eQTL 4.85e-01 -0.0411 0.0588 0.13 B L1
ENSG00000118515 SGK1 -714368 sc-eQTL 6.07e-01 0.0467 0.0908 0.13 B L1
ENSG00000146409 SLC18B1 790405 sc-eQTL 3.71e-01 0.111 0.124 0.13 B L1
ENSG00000028839 TBPL1 -348426 sc-eQTL 2.07e-01 0.121 0.0953 0.13 CD4T L1
ENSG00000112303 VNN2 840285 sc-eQTL 8.44e-01 0.017 0.0861 0.13 CD4T L1
ENSG00000112306 RPS12 789175 sc-eQTL 4.75e-01 -0.0418 0.0585 0.13 CD4T L1
ENSG00000118515 SGK1 -714368 sc-eQTL 1.92e-01 -0.103 0.0784 0.13 CD4T L1
ENSG00000146409 SLC18B1 790405 sc-eQTL 3.72e-01 0.106 0.118 0.13 CD4T L1
ENSG00000028839 TBPL1 -348426 sc-eQTL 3.99e-01 -0.0787 0.0931 0.13 CD8T L1
ENSG00000112303 VNN2 840285 sc-eQTL 2.28e-01 0.137 0.113 0.13 CD8T L1
ENSG00000112306 RPS12 789175 sc-eQTL 3.32e-01 -0.0377 0.0388 0.13 CD8T L1
ENSG00000118515 SGK1 -714368 sc-eQTL 8.86e-01 0.00863 0.0599 0.13 CD8T L1
ENSG00000146409 SLC18B1 790405 sc-eQTL 3.80e-01 0.103 0.117 0.13 CD8T L1
ENSG00000028839 TBPL1 -348426 sc-eQTL 2.48e-01 -0.167 0.144 0.133 DC L1
ENSG00000093134 VNN3 868979 sc-eQTL 3.21e-01 0.11 0.111 0.133 DC L1
ENSG00000112299 VNN1 889689 sc-eQTL 4.49e-01 -0.091 0.12 0.133 DC L1
ENSG00000112303 VNN2 840285 sc-eQTL 7.70e-01 0.0377 0.129 0.133 DC L1
ENSG00000112306 RPS12 789175 sc-eQTL 7.40e-01 -0.024 0.0721 0.133 DC L1
ENSG00000118515 SGK1 -714368 sc-eQTL 5.23e-01 0.0535 0.0836 0.133 DC L1
ENSG00000146409 SLC18B1 790405 sc-eQTL 3.58e-01 0.105 0.114 0.133 DC L1
ENSG00000286438 AL591115.1 500616 sc-eQTL 9.30e-01 -0.00907 0.104 0.133 DC L1
ENSG00000286887 AL355881.1 -692557 sc-eQTL 8.79e-01 -0.0197 0.129 0.133 DC L1
ENSG00000028839 TBPL1 -348426 sc-eQTL 8.87e-01 0.0143 0.101 0.13 Mono L1
ENSG00000093134 VNN3 868979 sc-eQTL 9.47e-01 0.00763 0.116 0.13 Mono L1
ENSG00000112299 VNN1 889689 sc-eQTL 7.88e-01 -0.0335 0.124 0.13 Mono L1
ENSG00000112303 VNN2 840285 sc-eQTL 2.70e-01 0.0967 0.0875 0.13 Mono L1
ENSG00000112306 RPS12 789175 sc-eQTL 4.62e-01 -0.0387 0.0525 0.13 Mono L1
ENSG00000118515 SGK1 -714368 sc-eQTL 6.65e-01 0.0321 0.0742 0.13 Mono L1
ENSG00000146409 SLC18B1 790405 sc-eQTL 6.49e-02 -0.191 0.103 0.13 Mono L1
ENSG00000286887 AL355881.1 -692557 sc-eQTL 8.48e-01 0.0197 0.102 0.13 Mono L1
ENSG00000028839 TBPL1 -348426 sc-eQTL 8.13e-01 -0.0257 0.109 0.131 NK L1
ENSG00000112303 VNN2 840285 sc-eQTL 5.62e-01 -0.0727 0.125 0.131 NK L1
ENSG00000112306 RPS12 789175 sc-eQTL 6.82e-01 -0.0212 0.0518 0.131 NK L1
ENSG00000118515 SGK1 -714368 sc-eQTL 3.73e-01 0.0853 0.0956 0.131 NK L1
ENSG00000028839 TBPL1 -348426 sc-eQTL 3.10e-01 0.134 0.131 0.13 Other_T L1
ENSG00000112303 VNN2 840285 sc-eQTL 3.73e-01 0.112 0.125 0.13 Other_T L1
ENSG00000112306 RPS12 789175 sc-eQTL 4.80e-01 0.0351 0.0496 0.13 Other_T L1
ENSG00000118515 SGK1 -714368 sc-eQTL 7.24e-01 0.0323 0.0914 0.13 Other_T L1
ENSG00000146409 SLC18B1 790405 sc-eQTL 1.71e-02 0.322 0.134 0.13 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000028839 TBPL1 -348426 sc-eQTL 4.55e-01 -0.117 0.156 0.125 B_Activated L2
ENSG00000112303 VNN2 840285 sc-eQTL 4.14e-01 -0.116 0.142 0.125 B_Activated L2
ENSG00000112306 RPS12 789175 sc-eQTL 1.88e-01 -0.1 0.0759 0.125 B_Activated L2
ENSG00000118515 SGK1 -714368 sc-eQTL 2.92e-01 0.143 0.136 0.125 B_Activated L2
ENSG00000146409 SLC18B1 790405 sc-eQTL 4.69e-01 -0.0968 0.133 0.125 B_Activated L2
ENSG00000028839 TBPL1 -348426 sc-eQTL 9.65e-01 -0.00632 0.143 0.131 B_Intermediate L2
ENSG00000112303 VNN2 840285 sc-eQTL 9.21e-01 -0.0123 0.124 0.131 B_Intermediate L2
ENSG00000112306 RPS12 789175 sc-eQTL 7.39e-01 -0.0252 0.0756 0.131 B_Intermediate L2
ENSG00000118515 SGK1 -714368 sc-eQTL 1.25e-01 0.201 0.13 0.131 B_Intermediate L2
ENSG00000146409 SLC18B1 790405 sc-eQTL 4.19e-01 0.11 0.136 0.131 B_Intermediate L2
ENSG00000028839 TBPL1 -348426 sc-eQTL 8.48e-02 0.233 0.134 0.131 B_Memory L2
ENSG00000112303 VNN2 840285 sc-eQTL 8.35e-01 -0.0267 0.128 0.131 B_Memory L2
ENSG00000112306 RPS12 789175 sc-eQTL 5.51e-01 -0.0369 0.0617 0.131 B_Memory L2
ENSG00000118515 SGK1 -714368 sc-eQTL 7.26e-02 0.203 0.112 0.131 B_Memory L2
ENSG00000146409 SLC18B1 790405 sc-eQTL 5.44e-01 0.0782 0.129 0.131 B_Memory L2
ENSG00000028839 TBPL1 -348426 sc-eQTL 8.03e-01 0.0317 0.127 0.13 B_Naive1 L2
ENSG00000112303 VNN2 840285 sc-eQTL 2.45e-01 0.138 0.118 0.13 B_Naive1 L2
ENSG00000112306 RPS12 789175 sc-eQTL 4.50e-01 -0.0512 0.0676 0.13 B_Naive1 L2
ENSG00000118515 SGK1 -714368 sc-eQTL 6.09e-01 -0.0542 0.106 0.13 B_Naive1 L2
ENSG00000146409 SLC18B1 790405 sc-eQTL 5.89e-01 0.0706 0.13 0.13 B_Naive1 L2
ENSG00000028839 TBPL1 -348426 sc-eQTL 5.58e-03 0.378 0.135 0.131 B_Naive2 L2
ENSG00000112303 VNN2 840285 sc-eQTL 5.54e-01 -0.0794 0.134 0.131 B_Naive2 L2
ENSG00000112306 RPS12 789175 sc-eQTL 1.41e-01 -0.104 0.0705 0.131 B_Naive2 L2
ENSG00000118515 SGK1 -714368 sc-eQTL 5.00e-01 -0.0846 0.125 0.131 B_Naive2 L2
ENSG00000146409 SLC18B1 790405 sc-eQTL 9.89e-01 -0.00184 0.135 0.131 B_Naive2 L2
ENSG00000028839 TBPL1 -348426 sc-eQTL 6.90e-01 0.0531 0.133 0.132 CD4_CTL L2
ENSG00000112303 VNN2 840285 sc-eQTL 7.31e-01 -0.0459 0.133 0.132 CD4_CTL L2
ENSG00000112306 RPS12 789175 sc-eQTL 2.01e-02 -0.143 0.0608 0.132 CD4_CTL L2
ENSG00000118515 SGK1 -714368 sc-eQTL 1.41e-01 0.157 0.106 0.132 CD4_CTL L2
ENSG00000146409 SLC18B1 790405 sc-eQTL 8.03e-01 0.0311 0.124 0.132 CD4_CTL L2
ENSG00000028839 TBPL1 -348426 sc-eQTL 1.80e-01 0.145 0.108 0.13 CD4_Naive L2
ENSG00000112303 VNN2 840285 sc-eQTL 5.09e-01 0.0652 0.0985 0.13 CD4_Naive L2
ENSG00000112306 RPS12 789175 sc-eQTL 9.67e-01 0.00262 0.064 0.13 CD4_Naive L2
ENSG00000118515 SGK1 -714368 sc-eQTL 3.18e-01 -0.0783 0.0781 0.13 CD4_Naive L2
ENSG00000146409 SLC18B1 790405 sc-eQTL 7.09e-01 0.046 0.123 0.13 CD4_Naive L2
ENSG00000028839 TBPL1 -348426 sc-eQTL 5.05e-01 -0.0773 0.116 0.13 CD4_TCM L2
ENSG00000112303 VNN2 840285 sc-eQTL 4.47e-01 0.0876 0.115 0.13 CD4_TCM L2
ENSG00000112306 RPS12 789175 sc-eQTL 9.36e-01 -0.00479 0.0597 0.13 CD4_TCM L2
ENSG00000118515 SGK1 -714368 sc-eQTL 2.52e-01 -0.0956 0.0832 0.13 CD4_TCM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 790405 sc-eQTL 9.03e-01 -0.0168 0.138 0.13 CD4_TCM L2
ENSG00000028839 TBPL1 -348426 sc-eQTL 3.53e-01 -0.126 0.135 0.13 CD4_TEM L2
ENSG00000112303 VNN2 840285 sc-eQTL 7.92e-02 -0.228 0.129 0.13 CD4_TEM L2
ENSG00000112306 RPS12 789175 sc-eQTL 5.47e-01 0.0322 0.0534 0.13 CD4_TEM L2
ENSG00000118515 SGK1 -714368 sc-eQTL 3.97e-01 0.0777 0.0916 0.13 CD4_TEM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 790405 sc-eQTL 3.20e-01 0.132 0.132 0.13 CD4_TEM L2
ENSG00000028839 TBPL1 -348426 sc-eQTL 7.06e-02 -0.217 0.12 0.13 CD8_CTL L2
ENSG00000112303 VNN2 840285 sc-eQTL 8.62e-01 -0.0224 0.128 0.13 CD8_CTL L2
ENSG00000112306 RPS12 789175 sc-eQTL 1.43e-01 -0.1 0.0682 0.13 CD8_CTL L2
ENSG00000118515 SGK1 -714368 sc-eQTL 1.62e-01 0.162 0.115 0.13 CD8_CTL L2
ENSG00000146409 SLC18B1 790405 sc-eQTL 9.61e-01 -0.00645 0.133 0.13 CD8_CTL L2
ENSG00000028839 TBPL1 -348426 sc-eQTL 9.39e-01 0.00963 0.126 0.13 CD8_Naive L2
ENSG00000112303 VNN2 840285 sc-eQTL 3.27e-01 0.114 0.116 0.13 CD8_Naive L2
ENSG00000112306 RPS12 789175 sc-eQTL 3.66e-01 0.06 0.0663 0.13 CD8_Naive L2
ENSG00000118515 SGK1 -714368 sc-eQTL 6.75e-01 -0.0349 0.0833 0.13 CD8_Naive L2
ENSG00000146409 SLC18B1 790405 sc-eQTL 9.67e-01 0.0056 0.133 0.13 CD8_Naive L2
ENSG00000028839 TBPL1 -348426 sc-eQTL 9.79e-01 -0.00371 0.142 0.134 CD8_TCM L2
ENSG00000112303 VNN2 840285 sc-eQTL 9.29e-01 0.0116 0.13 0.134 CD8_TCM L2
ENSG00000112306 RPS12 789175 sc-eQTL 8.54e-01 0.0117 0.0635 0.134 CD8_TCM L2
ENSG00000118515 SGK1 -714368 sc-eQTL 5.25e-01 -0.0669 0.105 0.134 CD8_TCM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 790405 sc-eQTL 4.60e-01 0.103 0.139 0.134 CD8_TCM L2
ENSG00000028839 TBPL1 -348426 sc-eQTL 5.70e-01 -0.0752 0.132 0.132 CD8_TEM L2
ENSG00000112303 VNN2 840285 sc-eQTL 3.55e-01 0.133 0.143 0.132 CD8_TEM L2
ENSG00000112306 RPS12 789175 sc-eQTL 9.35e-01 -0.00627 0.0772 0.132 CD8_TEM L2
ENSG00000118515 SGK1 -714368 sc-eQTL 4.82e-01 -0.0891 0.126 0.132 CD8_TEM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 790405 sc-eQTL 8.77e-01 0.0226 0.146 0.132 CD8_TEM L2
ENSG00000028839 TBPL1 -348426 sc-eQTL 9.30e-02 0.228 0.135 0.13 MAIT L2
ENSG00000112303 VNN2 840285 sc-eQTL 4.39e-01 0.102 0.131 0.13 MAIT L2
ENSG00000112306 RPS12 789175 sc-eQTL 8.25e-01 -0.0143 0.0647 0.13 MAIT L2
ENSG00000118515 SGK1 -714368 sc-eQTL 1.50e-02 0.22 0.0898 0.13 MAIT L2
ENSG00000146409 SLC18B1 790405 sc-eQTL 1.96e-02 0.315 0.134 0.13 MAIT L2
ENSG00000028839 TBPL1 -348426 sc-eQTL 4.96e-01 0.098 0.144 0.133 NK_CD56bright L2
ENSG00000112303 VNN2 840285 sc-eQTL 2.82e-01 0.146 0.135 0.133 NK_CD56bright L2
ENSG00000112306 RPS12 789175 sc-eQTL 5.22e-01 -0.0483 0.0754 0.133 NK_CD56bright L2
ENSG00000118515 SGK1 -714368 sc-eQTL 3.59e-02 0.236 0.112 0.133 NK_CD56bright L2
ENSG00000028839 TBPL1 -348426 sc-eQTL 5.22e-01 -0.0746 0.116 0.131 NK_CD56dim L2
ENSG00000112303 VNN2 840285 sc-eQTL 6.15e-01 -0.0672 0.133 0.131 NK_CD56dim L2
ENSG00000112306 RPS12 789175 sc-eQTL 6.72e-01 0.0224 0.0529 0.131 NK_CD56dim L2
ENSG00000118515 SGK1 -714368 sc-eQTL 4.08e-01 0.0971 0.117 0.131 NK_CD56dim L2
ENSG00000028839 TBPL1 -348426 sc-eQTL 8.73e-01 -0.0233 0.146 0.132 NK_HLA L2
ENSG00000112303 VNN2 840285 sc-eQTL 7.26e-01 0.0472 0.134 0.132 NK_HLA L2
ENSG00000112306 RPS12 789175 sc-eQTL 7.34e-01 0.0213 0.0626 0.132 NK_HLA L2
ENSG00000118515 SGK1 -714368 sc-eQTL 8.92e-01 0.0169 0.124 0.132 NK_HLA L2
ENSG00000028839 TBPL1 -348426 sc-eQTL 8.11e-01 -0.0292 0.122 0.131 NK_cytokine L2
ENSG00000112303 VNN2 840285 sc-eQTL 4.84e-01 -0.0927 0.132 0.131 NK_cytokine L2
ENSG00000112306 RPS12 789175 sc-eQTL 8.43e-01 0.0142 0.0718 0.131 NK_cytokine L2
ENSG00000118515 SGK1 -714368 sc-eQTL 7.29e-01 0.0415 0.119 0.131 NK_cytokine L2
ENSG00000028839 TBPL1 -348426 sc-eQTL 1.47e-01 0.252 0.172 0.133 PB L2
ENSG00000112303 VNN2 840285 sc-eQTL 6.02e-01 -0.079 0.151 0.133 PB L2
ENSG00000112306 RPS12 789175 sc-eQTL 2.83e-01 0.0923 0.0855 0.133 PB L2
ENSG00000118515 SGK1 -714368 sc-eQTL 3.76e-01 0.123 0.138 0.133 PB L2
ENSG00000146409 SLC18B1 790405 sc-eQTL 5.02e-01 -0.108 0.161 0.133 PB L2
ENSG00000028839 TBPL1 -348426 sc-eQTL 3.99e-01 -0.117 0.138 0.13 Pro_T L2
ENSG00000112303 VNN2 840285 sc-eQTL 7.37e-02 -0.237 0.132 0.13 Pro_T L2
ENSG00000112306 RPS12 789175 sc-eQTL 6.77e-01 0.021 0.0502 0.13 Pro_T L2
ENSG00000118515 SGK1 -714368 sc-eQTL 5.43e-01 -0.0612 0.101 0.13 Pro_T L2
ENSG00000146409 SLC18B1 790405 sc-eQTL 2.55e-01 -0.148 0.129 0.13 Pro_T L2
ENSG00000028839 TBPL1 -348426 sc-eQTL 9.80e-02 0.227 0.136 0.13 Treg L2
ENSG00000112303 VNN2 840285 sc-eQTL 2.69e-01 -0.12 0.109 0.13 Treg L2
ENSG00000112306 RPS12 789175 sc-eQTL 9.09e-01 -0.00551 0.0481 0.13 Treg L2
ENSG00000118515 SGK1 -714368 sc-eQTL 8.51e-01 -0.0191 0.101 0.13 Treg L2
ENSG00000146409 SLC18B1 790405 sc-eQTL 2.21e-01 0.166 0.136 0.13 Treg L2
ENSG00000028839 TBPL1 -348426 sc-eQTL 4.99e-01 0.0986 0.145 0.124 cDC L2
ENSG00000093134 VNN3 868979 sc-eQTL 8.52e-01 0.0212 0.114 0.124 cDC L2
ENSG00000112299 VNN1 889689 sc-eQTL 2.24e-01 -0.162 0.133 0.124 cDC L2
ENSG00000112303 VNN2 840285 sc-eQTL 8.74e-01 0.0206 0.13 0.124 cDC L2
ENSG00000112306 RPS12 789175 sc-eQTL 1.84e-01 -0.0852 0.0639 0.124 cDC L2
ENSG00000118515 SGK1 -714368 sc-eQTL 6.33e-01 0.0517 0.108 0.124 cDC L2
ENSG00000146409 SLC18B1 790405 sc-eQTL 8.35e-01 0.0265 0.127 0.124 cDC L2
ENSG00000286438 AL591115.1 500616 sc-eQTL 4.65e-01 0.0743 0.102 0.124 cDC L2
ENSG00000286887 AL355881.1 -692557 sc-eQTL 8.82e-01 0.0186 0.125 0.124 cDC L2
ENSG00000028839 TBPL1 -348426 sc-eQTL 2.91e-01 0.12 0.113 0.13 cMono_IL1B L2
ENSG00000093134 VNN3 868979 sc-eQTL 4.86e-01 0.0846 0.121 0.13 cMono_IL1B L2
ENSG00000112299 VNN1 889689 sc-eQTL 7.90e-01 -0.0327 0.123 0.13 cMono_IL1B L2
ENSG00000112303 VNN2 840285 sc-eQTL 1.40e-01 0.144 0.0975 0.13 cMono_IL1B L2
ENSG00000112306 RPS12 789175 sc-eQTL 8.84e-01 -0.00797 0.0544 0.13 cMono_IL1B L2
ENSG00000118515 SGK1 -714368 sc-eQTL 6.43e-01 0.0376 0.0811 0.13 cMono_IL1B L2
ENSG00000146409 SLC18B1 790405 sc-eQTL 1.22e-01 -0.162 0.104 0.13 cMono_IL1B L2
ENSG00000286887 AL355881.1 -692557 sc-eQTL 9.44e-01 0.00763 0.109 0.13 cMono_IL1B L2
ENSG00000028839 TBPL1 -348426 sc-eQTL 7.27e-01 -0.0448 0.128 0.13 cMono_S100A L2
ENSG00000093134 VNN3 868979 sc-eQTL 3.58e-01 -0.106 0.115 0.13 cMono_S100A L2
ENSG00000112299 VNN1 889689 sc-eQTL 8.11e-01 -0.03 0.126 0.13 cMono_S100A L2
ENSG00000112303 VNN2 840285 sc-eQTL 8.14e-01 0.0194 0.0822 0.13 cMono_S100A L2
ENSG00000112306 RPS12 789175 sc-eQTL 3.72e-01 -0.0529 0.0591 0.13 cMono_S100A L2
ENSG00000118515 SGK1 -714368 sc-eQTL 4.52e-01 0.0509 0.0676 0.13 cMono_S100A L2
ENSG00000146409 SLC18B1 790405 sc-eQTL 3.48e-01 -0.103 0.109 0.13 cMono_S100A L2
ENSG00000286887 AL355881.1 -692557 sc-eQTL 4.15e-01 0.0874 0.107 0.13 cMono_S100A L2
ENSG00000028839 TBPL1 -348426 sc-eQTL 1.44e-01 -0.257 0.175 0.136 gdT L2
ENSG00000112303 VNN2 840285 sc-eQTL 1.10e-02 0.421 0.164 0.136 gdT L2
ENSG00000112306 RPS12 789175 sc-eQTL 8.24e-01 0.0142 0.0637 0.136 gdT L2
ENSG00000118515 SGK1 -714368 sc-eQTL 6.25e-01 -0.0589 0.12 0.136 gdT L2
ENSG00000146409 SLC18B1 790405 sc-eQTL 9.77e-01 0.0048 0.165 0.136 gdT L2
ENSG00000028839 TBPL1 -348426 sc-eQTL 9.79e-01 0.00346 0.131 0.133 intMono L2
ENSG00000093134 VNN3 868979 sc-eQTL 8.43e-01 -0.0251 0.127 0.133 intMono L2
ENSG00000112299 VNN1 889689 sc-eQTL 7.25e-01 -0.044 0.125 0.133 intMono L2
ENSG00000112303 VNN2 840285 sc-eQTL 9.68e-01 -0.00516 0.127 0.133 intMono L2
ENSG00000112306 RPS12 789175 sc-eQTL 1.84e-01 0.0736 0.0551 0.133 intMono L2
ENSG00000118515 SGK1 -714368 sc-eQTL 9.15e-01 -0.00997 0.093 0.133 intMono L2
ENSG00000146409 SLC18B1 790405 sc-eQTL 6.18e-01 0.0672 0.135 0.133 intMono L2
ENSG00000286887 AL355881.1 -692557 sc-eQTL 8.22e-01 0.029 0.129 0.133 intMono L2
ENSG00000028839 TBPL1 -348426 sc-eQTL 3.39e-01 -0.133 0.139 0.127 ncMono L2
ENSG00000093134 VNN3 868979 sc-eQTL 8.75e-01 0.0209 0.133 0.127 ncMono L2
ENSG00000112299 VNN1 889689 sc-eQTL 7.06e-01 0.0499 0.132 0.127 ncMono L2
ENSG00000112303 VNN2 840285 sc-eQTL 7.28e-01 0.0441 0.127 0.127 ncMono L2
ENSG00000112306 RPS12 789175 sc-eQTL 5.63e-01 -0.0369 0.0636 0.127 ncMono L2
ENSG00000118515 SGK1 -714368 sc-eQTL 5.75e-01 0.0506 0.09 0.127 ncMono L2
ENSG00000146409 SLC18B1 790405 sc-eQTL 1.21e-01 -0.174 0.112 0.127 ncMono L2
ENSG00000286887 AL355881.1 -692557 sc-eQTL 6.84e-01 0.0485 0.119 0.127 ncMono L2
ENSG00000028839 TBPL1 -348426 sc-eQTL 4.67e-01 -0.116 0.158 0.136 pDC L2
ENSG00000093134 VNN3 868979 sc-eQTL 3.32e-01 0.103 0.106 0.136 pDC L2
ENSG00000112299 VNN1 889689 sc-eQTL 4.50e-02 -0.216 0.107 0.136 pDC L2
ENSG00000112303 VNN2 840285 sc-eQTL 8.95e-01 0.0171 0.129 0.136 pDC L2
ENSG00000112306 RPS12 789175 sc-eQTL 6.41e-01 0.0414 0.0886 0.136 pDC L2
ENSG00000118515 SGK1 -714368 sc-eQTL 5.63e-01 0.0522 0.09 0.136 pDC L2
ENSG00000146409 SLC18B1 790405 sc-eQTL 9.55e-01 -0.00738 0.131 0.136 pDC L2
ENSG00000286438 AL591115.1 500616 sc-eQTL 8.50e-01 -0.0238 0.126 0.136 pDC L2
ENSG00000286887 AL355881.1 -692557 sc-eQTL 1.19e-01 -0.173 0.111 0.136 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000028839 TBPL1 -348426 sc-eQTL 7.67e-01 0.0406 0.137 0.13 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 840285 sc-eQTL 7.59e-01 0.0367 0.119 0.13 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 789175 sc-eQTL 7.50e-01 -0.0216 0.0678 0.13 B_Memory LOneK1K
ENSG00000118515 SGK1 -714368 sc-eQTL 2.17e-02 0.242 0.105 0.13 B_Memory LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 790405 sc-eQTL 6.08e-01 0.0639 0.124 0.13 B_Memory LOneK1K
ENSG00000028839 TBPL1 -348426 sc-eQTL 2.79e-02 0.281 0.127 0.13 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 840285 sc-eQTL 7.30e-01 0.0388 0.112 0.13 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 789175 sc-eQTL 3.55e-01 -0.0628 0.0677 0.13 B_Naive LOneK1K
ENSG00000118515 SGK1 -714368 sc-eQTL 6.52e-01 -0.0474 0.105 0.13 B_Naive LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 790405 sc-eQTL 5.02e-01 0.0861 0.128 0.13 B_Naive LOneK1K
ENSG00000028839 TBPL1 -348426 sc-eQTL 5.47e-01 0.0623 0.103 0.13 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000093134 VNN3 868979 sc-eQTL 7.49e-01 0.0376 0.117 0.13 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112299 VNN1 889689 sc-eQTL 6.88e-01 -0.0491 0.122 0.13 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 840285 sc-eQTL 2.74e-01 0.0882 0.0805 0.13 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 789175 sc-eQTL 8.66e-01 -0.00936 0.0554 0.13 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000118515 SGK1 -714368 sc-eQTL 4.29e-01 0.0596 0.0753 0.13 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 790405 sc-eQTL 1.13e-01 -0.156 0.0979 0.13 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000286887 AL355881.1 -692557 sc-eQTL 7.46e-01 0.0335 0.103 0.13 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000028839 TBPL1 -348426 sc-eQTL 4.50e-01 -0.0999 0.132 0.131 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000093134 VNN3 868979 sc-eQTL 9.67e-01 0.00526 0.128 0.131 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112299 VNN1 889689 sc-eQTL 8.77e-01 0.0196 0.127 0.131 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 840285 sc-eQTL 9.43e-01 0.00862 0.12 0.131 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 789175 sc-eQTL 9.41e-01 0.00377 0.0508 0.131 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000118515 SGK1 -714368 sc-eQTL 9.97e-01 -0.000267 0.0769 0.131 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 790405 sc-eQTL 8.41e-01 -0.0247 0.123 0.131 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000286887 AL355881.1 -692557 sc-eQTL 7.70e-01 0.0326 0.112 0.131 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000028839 TBPL1 -348426 sc-eQTL 4.89e-01 -0.0744 0.107 0.131 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 840285 sc-eQTL 4.49e-01 -0.0967 0.128 0.131 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 789175 sc-eQTL 8.57e-01 -0.00941 0.0522 0.131 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000118515 SGK1 -714368 sc-eQTL 4.60e-01 0.0797 0.108 0.131 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000112299 VNN1 889689 pQTL 0.000864 -0.173 0.0517 0.0 0.0 0.124

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000118515 \N -714368 3.21e-07 1.51e-07 7e-08 2.2e-07 1.05e-07 8.75e-08 2.24e-07 5.84e-08 1.85e-07 1.03e-07 1.69e-07 1.48e-07 2.29e-07 8.07e-08 6.12e-08 9.6e-08 5.27e-08 1.91e-07 7.42e-08 6.03e-08 1.24e-07 1.7e-07 1.68e-07 4.07e-08 2.09e-07 1.51e-07 1.29e-07 1.12e-07 1.37e-07 1.29e-07 1.21e-07 4.47e-08 3.56e-08 9.5e-08 4.41e-08 3.3e-08 3.91e-08 7.49e-08 6.21e-08 6.07e-08 4.92e-08 1.59e-07 3.4e-08 1.34e-08 3.4e-08 8.31e-09 7e-08 2.13e-09 4.67e-08