logo

Genes within 1Mb (chr6:133586808:C:CT):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000028839 TBPL1 -365362 sc-eQTL 8.46e-01 -0.0207 0.106 0.175 B L1
ENSG00000112303 VNN2 823349 sc-eQTL 4.22e-01 -0.0639 0.0795 0.175 B L1
ENSG00000112306 RPS12 772239 sc-eQTL 2.81e-01 0.0519 0.048 0.175 B L1
ENSG00000118515 SGK1 -731304 sc-eQTL 3.34e-01 0.0717 0.074 0.175 B L1
ENSG00000146409 SLC18B1 773469 sc-eQTL 9.25e-01 0.00954 0.101 0.175 B L1
ENSG00000028839 TBPL1 -365362 sc-eQTL 8.34e-01 0.0164 0.0781 0.175 CD4T L1
ENSG00000112303 VNN2 823349 sc-eQTL 2.07e-01 -0.0886 0.0701 0.175 CD4T L1
ENSG00000112306 RPS12 772239 sc-eQTL 1.38e-03 0.151 0.0467 0.175 CD4T L1
ENSG00000118515 SGK1 -731304 sc-eQTL 6.99e-02 0.116 0.0638 0.175 CD4T L1
ENSG00000146409 SLC18B1 773469 sc-eQTL 3.12e-01 0.0977 0.0965 0.175 CD4T L1
ENSG00000028839 TBPL1 -365362 sc-eQTL 2.50e-01 -0.0881 0.0764 0.175 CD8T L1
ENSG00000112303 VNN2 823349 sc-eQTL 5.49e-01 -0.056 0.0933 0.175 CD8T L1
ENSG00000112306 RPS12 772239 sc-eQTL 6.39e-02 0.059 0.0317 0.175 CD8T L1
ENSG00000118515 SGK1 -731304 sc-eQTL 7.47e-01 0.0159 0.0492 0.175 CD8T L1
ENSG00000146409 SLC18B1 773469 sc-eQTL 2.30e-01 -0.116 0.0962 0.175 CD8T L1
ENSG00000028839 TBPL1 -365362 sc-eQTL 7.37e-01 0.0398 0.118 0.176 DC L1
ENSG00000093134 VNN3 852043 sc-eQTL 6.87e-01 -0.0367 0.091 0.176 DC L1
ENSG00000112299 VNN1 872753 sc-eQTL 5.31e-01 0.0617 0.0982 0.176 DC L1
ENSG00000112303 VNN2 823349 sc-eQTL 3.56e-01 -0.0971 0.105 0.176 DC L1
ENSG00000112306 RPS12 772239 sc-eQTL 1.02e-01 0.0962 0.0585 0.176 DC L1
ENSG00000118515 SGK1 -731304 sc-eQTL 4.00e-01 -0.0576 0.0683 0.176 DC L1
ENSG00000146409 SLC18B1 773469 sc-eQTL 4.24e-01 0.0745 0.0931 0.176 DC L1
ENSG00000286438 AL591115.1 483680 sc-eQTL 3.63e-01 0.0773 0.0847 0.176 DC L1
ENSG00000286887 AL355881.1 -709493 sc-eQTL 1.10e-01 -0.169 0.105 0.176 DC L1
ENSG00000028839 TBPL1 -365362 sc-eQTL 7.45e-01 0.0268 0.0823 0.175 Mono L1
ENSG00000093134 VNN3 852043 sc-eQTL 2.49e-02 0.211 0.0934 0.175 Mono L1
ENSG00000112299 VNN1 872753 sc-eQTL 7.66e-02 0.18 0.101 0.175 Mono L1
ENSG00000112303 VNN2 823349 sc-eQTL 4.43e-01 0.0551 0.0717 0.175 Mono L1
ENSG00000112306 RPS12 772239 sc-eQTL 8.95e-02 0.0729 0.0427 0.175 Mono L1
ENSG00000118515 SGK1 -731304 sc-eQTL 1.92e-01 -0.0792 0.0605 0.175 Mono L1
ENSG00000146409 SLC18B1 773469 sc-eQTL 5.55e-01 -0.0503 0.085 0.175 Mono L1
ENSG00000286887 AL355881.1 -709493 sc-eQTL 1.24e-01 -0.128 0.0831 0.175 Mono L1
ENSG00000028839 TBPL1 -365362 sc-eQTL 5.33e-01 0.0561 0.0898 0.174 NK L1
ENSG00000112303 VNN2 823349 sc-eQTL 7.15e-01 -0.0378 0.103 0.174 NK L1
ENSG00000112306 RPS12 772239 sc-eQTL 6.89e-01 0.0172 0.0428 0.174 NK L1
ENSG00000118515 SGK1 -731304 sc-eQTL 3.57e-02 -0.166 0.0784 0.174 NK L1
ENSG00000028839 TBPL1 -365362 sc-eQTL 2.62e-01 -0.123 0.109 0.175 Other_T L1
ENSG00000112303 VNN2 823349 sc-eQTL 4.51e-01 -0.0785 0.104 0.175 Other_T L1
ENSG00000112306 RPS12 772239 sc-eQTL 7.23e-01 0.0146 0.0412 0.175 Other_T L1
ENSG00000118515 SGK1 -731304 sc-eQTL 4.99e-01 0.0513 0.0758 0.175 Other_T L1
ENSG00000146409 SLC18B1 773469 sc-eQTL 4.38e-03 0.319 0.111 0.175 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000028839 TBPL1 -365362 sc-eQTL 8.31e-01 0.027 0.126 0.166 B_Activated L2
ENSG00000112303 VNN2 823349 sc-eQTL 7.92e-01 0.0305 0.115 0.166 B_Activated L2
ENSG00000112306 RPS12 772239 sc-eQTL 4.69e-02 0.122 0.061 0.166 B_Activated L2
ENSG00000118515 SGK1 -731304 sc-eQTL 8.77e-01 0.0171 0.11 0.166 B_Activated L2
ENSG00000146409 SLC18B1 773469 sc-eQTL 8.10e-01 -0.026 0.108 0.166 B_Activated L2
ENSG00000028839 TBPL1 -365362 sc-eQTL 6.37e-01 -0.0551 0.117 0.174 B_Intermediate L2
ENSG00000112303 VNN2 823349 sc-eQTL 6.47e-01 0.0463 0.101 0.174 B_Intermediate L2
ENSG00000112306 RPS12 772239 sc-eQTL 6.35e-02 0.114 0.0613 0.174 B_Intermediate L2
ENSG00000118515 SGK1 -731304 sc-eQTL 3.09e-01 -0.109 0.107 0.174 B_Intermediate L2
ENSG00000146409 SLC18B1 773469 sc-eQTL 7.69e-01 -0.0327 0.111 0.174 B_Intermediate L2
ENSG00000028839 TBPL1 -365362 sc-eQTL 8.66e-01 -0.0188 0.112 0.175 B_Memory L2
ENSG00000112303 VNN2 823349 sc-eQTL 8.08e-02 0.184 0.105 0.175 B_Memory L2
ENSG00000112306 RPS12 772239 sc-eQTL 6.54e-02 0.0936 0.0505 0.175 B_Memory L2
ENSG00000118515 SGK1 -731304 sc-eQTL 8.54e-02 0.16 0.0928 0.175 B_Memory L2
ENSG00000146409 SLC18B1 773469 sc-eQTL 4.51e-01 0.0802 0.106 0.175 B_Memory L2
ENSG00000028839 TBPL1 -365362 sc-eQTL 8.84e-01 -0.0155 0.106 0.175 B_Naive1 L2
ENSG00000112303 VNN2 823349 sc-eQTL 2.86e-01 -0.106 0.0988 0.175 B_Naive1 L2
ENSG00000112306 RPS12 772239 sc-eQTL 3.62e-01 0.0514 0.0563 0.175 B_Naive1 L2
ENSG00000118515 SGK1 -731304 sc-eQTL 2.20e-01 0.108 0.0879 0.175 B_Naive1 L2
ENSG00000146409 SLC18B1 773469 sc-eQTL 7.33e-01 0.0372 0.109 0.175 B_Naive1 L2
ENSG00000028839 TBPL1 -365362 sc-eQTL 6.31e-01 -0.0543 0.113 0.176 B_Naive2 L2
ENSG00000112303 VNN2 823349 sc-eQTL 6.85e-01 0.0447 0.11 0.176 B_Naive2 L2
ENSG00000112306 RPS12 772239 sc-eQTL 3.26e-01 0.0573 0.0582 0.176 B_Naive2 L2
ENSG00000118515 SGK1 -731304 sc-eQTL 8.71e-01 -0.0168 0.103 0.176 B_Naive2 L2
ENSG00000146409 SLC18B1 773469 sc-eQTL 6.04e-01 0.0579 0.111 0.176 B_Naive2 L2
ENSG00000028839 TBPL1 -365362 sc-eQTL 1.89e-01 0.144 0.109 0.177 CD4_CTL L2
ENSG00000112303 VNN2 823349 sc-eQTL 6.56e-01 -0.0491 0.11 0.177 CD4_CTL L2
ENSG00000112306 RPS12 772239 sc-eQTL 8.86e-02 0.0864 0.0505 0.177 CD4_CTL L2
ENSG00000118515 SGK1 -731304 sc-eQTL 2.00e-01 -0.113 0.0878 0.177 CD4_CTL L2
ENSG00000146409 SLC18B1 773469 sc-eQTL 9.90e-01 -0.00122 0.103 0.177 CD4_CTL L2
ENSG00000028839 TBPL1 -365362 sc-eQTL 9.79e-01 0.00236 0.089 0.175 CD4_Naive L2
ENSG00000112303 VNN2 823349 sc-eQTL 4.25e-02 -0.163 0.0801 0.175 CD4_Naive L2
ENSG00000112306 RPS12 772239 sc-eQTL 9.70e-03 0.135 0.0516 0.175 CD4_Naive L2
ENSG00000118515 SGK1 -731304 sc-eQTL 1.22e-01 0.0992 0.0639 0.175 CD4_Naive L2
ENSG00000146409 SLC18B1 773469 sc-eQTL 7.72e-01 0.0293 0.101 0.175 CD4_Naive L2
ENSG00000028839 TBPL1 -365362 sc-eQTL 4.24e-01 0.0762 0.0951 0.175 CD4_TCM L2
ENSG00000112303 VNN2 823349 sc-eQTL 7.50e-01 0.0302 0.0945 0.175 CD4_TCM L2
ENSG00000112306 RPS12 772239 sc-eQTL 2.16e-03 0.149 0.0479 0.175 CD4_TCM L2
ENSG00000118515 SGK1 -731304 sc-eQTL 1.00e-01 0.112 0.0681 0.175 CD4_TCM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 773469 sc-eQTL 7.03e-01 0.0433 0.113 0.175 CD4_TCM L2
ENSG00000028839 TBPL1 -365362 sc-eQTL 2.38e-01 -0.13 0.11 0.175 CD4_TEM L2
ENSG00000112303 VNN2 823349 sc-eQTL 1.62e-03 0.331 0.104 0.175 CD4_TEM L2
ENSG00000112306 RPS12 772239 sc-eQTL 1.21e-01 0.0674 0.0433 0.175 CD4_TEM L2
ENSG00000118515 SGK1 -731304 sc-eQTL 3.26e-01 0.0735 0.0747 0.175 CD4_TEM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 773469 sc-eQTL 6.65e-01 0.047 0.108 0.175 CD4_TEM L2
ENSG00000028839 TBPL1 -365362 sc-eQTL 9.08e-01 0.0116 0.1 0.175 CD8_CTL L2
ENSG00000112303 VNN2 823349 sc-eQTL 9.47e-01 0.00714 0.106 0.175 CD8_CTL L2
ENSG00000112306 RPS12 772239 sc-eQTL 9.61e-01 0.0028 0.0569 0.175 CD8_CTL L2
ENSG00000118515 SGK1 -731304 sc-eQTL 3.46e-04 -0.339 0.0933 0.175 CD8_CTL L2
ENSG00000146409 SLC18B1 773469 sc-eQTL 1.54e-01 -0.157 0.11 0.175 CD8_CTL L2
ENSG00000028839 TBPL1 -365362 sc-eQTL 2.70e-01 -0.115 0.104 0.175 CD8_Naive L2
ENSG00000112303 VNN2 823349 sc-eQTL 8.17e-01 -0.0222 0.096 0.175 CD8_Naive L2
ENSG00000112306 RPS12 772239 sc-eQTL 4.01e-03 0.157 0.0539 0.175 CD8_Naive L2
ENSG00000118515 SGK1 -731304 sc-eQTL 2.09e-01 0.0866 0.0687 0.175 CD8_Naive L2
ENSG00000146409 SLC18B1 773469 sc-eQTL 7.12e-01 0.0407 0.11 0.175 CD8_Naive L2
ENSG00000028839 TBPL1 -365362 sc-eQTL 1.58e-01 0.167 0.118 0.174 CD8_TCM L2
ENSG00000112303 VNN2 823349 sc-eQTL 4.85e-01 0.0758 0.109 0.174 CD8_TCM L2
ENSG00000112306 RPS12 772239 sc-eQTL 1.38e-01 0.0784 0.0527 0.174 CD8_TCM L2
ENSG00000118515 SGK1 -731304 sc-eQTL 3.88e-01 -0.0758 0.0875 0.174 CD8_TCM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 773469 sc-eQTL 9.02e-01 -0.0143 0.116 0.174 CD8_TCM L2
ENSG00000028839 TBPL1 -365362 sc-eQTL 5.92e-01 -0.0587 0.109 0.171 CD8_TEM L2
ENSG00000112303 VNN2 823349 sc-eQTL 2.32e-02 -0.268 0.117 0.171 CD8_TEM L2
ENSG00000112306 RPS12 772239 sc-eQTL 2.04e-01 0.0811 0.0636 0.171 CD8_TEM L2
ENSG00000118515 SGK1 -731304 sc-eQTL 9.92e-01 0.00109 0.105 0.171 CD8_TEM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 773469 sc-eQTL 8.43e-01 0.0239 0.121 0.171 CD8_TEM L2
ENSG00000028839 TBPL1 -365362 sc-eQTL 5.34e-01 -0.0691 0.111 0.175 MAIT L2
ENSG00000112303 VNN2 823349 sc-eQTL 5.64e-01 -0.0618 0.107 0.175 MAIT L2
ENSG00000112306 RPS12 772239 sc-eQTL 6.37e-01 0.0249 0.0527 0.175 MAIT L2
ENSG00000118515 SGK1 -731304 sc-eQTL 4.78e-01 -0.0527 0.0741 0.175 MAIT L2
ENSG00000146409 SLC18B1 773469 sc-eQTL 1.05e-02 0.281 0.109 0.175 MAIT L2
ENSG00000028839 TBPL1 -365362 sc-eQTL 2.83e-01 -0.128 0.119 0.173 NK_CD56bright L2
ENSG00000112303 VNN2 823349 sc-eQTL 1.04e-01 -0.182 0.111 0.173 NK_CD56bright L2
ENSG00000112306 RPS12 772239 sc-eQTL 1.46e-02 0.152 0.0616 0.173 NK_CD56bright L2
ENSG00000118515 SGK1 -731304 sc-eQTL 4.30e-01 -0.0739 0.0933 0.173 NK_CD56bright L2
ENSG00000028839 TBPL1 -365362 sc-eQTL 9.62e-02 0.16 0.0957 0.172 NK_CD56dim L2
ENSG00000112303 VNN2 823349 sc-eQTL 6.81e-01 -0.0454 0.11 0.172 NK_CD56dim L2
ENSG00000112306 RPS12 772239 sc-eQTL 9.49e-01 0.00279 0.0438 0.172 NK_CD56dim L2
ENSG00000118515 SGK1 -731304 sc-eQTL 1.58e-01 -0.137 0.0965 0.172 NK_CD56dim L2
ENSG00000028839 TBPL1 -365362 sc-eQTL 2.06e-01 0.155 0.122 0.169 NK_HLA L2
ENSG00000112303 VNN2 823349 sc-eQTL 4.57e-01 0.0842 0.113 0.169 NK_HLA L2
ENSG00000112306 RPS12 772239 sc-eQTL 2.91e-01 0.0556 0.0526 0.169 NK_HLA L2
ENSG00000118515 SGK1 -731304 sc-eQTL 5.24e-01 0.0665 0.104 0.169 NK_HLA L2
ENSG00000028839 TBPL1 -365362 sc-eQTL 6.57e-01 -0.0442 0.0996 0.172 NK_cytokine L2
ENSG00000112303 VNN2 823349 sc-eQTL 9.10e-01 -0.0123 0.108 0.172 NK_cytokine L2
ENSG00000112306 RPS12 772239 sc-eQTL 8.30e-01 -0.0127 0.0588 0.172 NK_cytokine L2
ENSG00000118515 SGK1 -731304 sc-eQTL 1.50e-01 -0.141 0.0975 0.172 NK_cytokine L2
ENSG00000028839 TBPL1 -365362 sc-eQTL 5.06e-01 -0.0957 0.143 0.167 PB L2
ENSG00000112303 VNN2 823349 sc-eQTL 2.66e-01 -0.139 0.124 0.167 PB L2
ENSG00000112306 RPS12 772239 sc-eQTL 7.05e-01 0.027 0.0709 0.167 PB L2
ENSG00000118515 SGK1 -731304 sc-eQTL 4.32e-01 0.0901 0.114 0.167 PB L2
ENSG00000146409 SLC18B1 773469 sc-eQTL 1.52e-01 0.19 0.132 0.167 PB L2
ENSG00000028839 TBPL1 -365362 sc-eQTL 1.29e-01 0.176 0.115 0.176 Pro_T L2
ENSG00000112303 VNN2 823349 sc-eQTL 1.46e-02 0.27 0.11 0.176 Pro_T L2
ENSG00000112306 RPS12 772239 sc-eQTL 2.27e-01 0.0507 0.0419 0.176 Pro_T L2
ENSG00000118515 SGK1 -731304 sc-eQTL 9.79e-01 -0.00219 0.0843 0.176 Pro_T L2
ENSG00000146409 SLC18B1 773469 sc-eQTL 3.78e-02 0.225 0.108 0.176 Pro_T L2
ENSG00000028839 TBPL1 -365362 sc-eQTL 6.85e-01 -0.0464 0.114 0.175 Treg L2
ENSG00000112303 VNN2 823349 sc-eQTL 4.57e-01 0.0675 0.0906 0.175 Treg L2
ENSG00000112306 RPS12 772239 sc-eQTL 7.81e-03 0.106 0.0394 0.175 Treg L2
ENSG00000118515 SGK1 -731304 sc-eQTL 8.23e-01 0.0189 0.0845 0.175 Treg L2
ENSG00000146409 SLC18B1 773469 sc-eQTL 1.92e-02 0.264 0.112 0.175 Treg L2
ENSG00000028839 TBPL1 -365362 sc-eQTL 6.70e-01 0.0521 0.122 0.163 cDC L2
ENSG00000093134 VNN3 852043 sc-eQTL 9.08e-01 0.011 0.0954 0.163 cDC L2
ENSG00000112299 VNN1 872753 sc-eQTL 1.29e-01 0.17 0.111 0.163 cDC L2
ENSG00000112303 VNN2 823349 sc-eQTL 3.42e-02 -0.23 0.108 0.163 cDC L2
ENSG00000112306 RPS12 772239 sc-eQTL 5.67e-02 0.102 0.0534 0.163 cDC L2
ENSG00000118515 SGK1 -731304 sc-eQTL 7.08e-01 -0.034 0.0909 0.163 cDC L2
ENSG00000146409 SLC18B1 773469 sc-eQTL 7.44e-01 0.0349 0.107 0.163 cDC L2
ENSG00000286438 AL591115.1 483680 sc-eQTL 8.69e-01 -0.0141 0.0854 0.163 cDC L2
ENSG00000286887 AL355881.1 -709493 sc-eQTL 5.77e-03 -0.288 0.103 0.163 cDC L2
ENSG00000028839 TBPL1 -365362 sc-eQTL 6.21e-01 0.0461 0.093 0.175 cMono_IL1B L2
ENSG00000093134 VNN3 852043 sc-eQTL 6.81e-02 0.182 0.099 0.175 cMono_IL1B L2
ENSG00000112299 VNN1 872753 sc-eQTL 2.22e-01 0.123 0.1 0.175 cMono_IL1B L2
ENSG00000112303 VNN2 823349 sc-eQTL 7.21e-01 0.0288 0.0805 0.175 cMono_IL1B L2
ENSG00000112306 RPS12 772239 sc-eQTL 1.55e-02 0.108 0.0441 0.175 cMono_IL1B L2
ENSG00000118515 SGK1 -731304 sc-eQTL 2.96e-01 -0.0697 0.0665 0.175 cMono_IL1B L2
ENSG00000146409 SLC18B1 773469 sc-eQTL 4.97e-01 -0.0586 0.0862 0.175 cMono_IL1B L2
ENSG00000286887 AL355881.1 -709493 sc-eQTL 5.40e-01 -0.0551 0.0897 0.175 cMono_IL1B L2
ENSG00000028839 TBPL1 -365362 sc-eQTL 1.24e-01 0.164 0.106 0.175 cMono_S100A L2
ENSG00000093134 VNN3 852043 sc-eQTL 8.43e-02 0.166 0.0955 0.175 cMono_S100A L2
ENSG00000112299 VNN1 872753 sc-eQTL 1.83e-01 0.139 0.104 0.175 cMono_S100A L2
ENSG00000112303 VNN2 823349 sc-eQTL 8.90e-01 0.00951 0.0684 0.175 cMono_S100A L2
ENSG00000112306 RPS12 772239 sc-eQTL 4.87e-01 0.0343 0.0492 0.175 cMono_S100A L2
ENSG00000118515 SGK1 -731304 sc-eQTL 2.13e-01 -0.0701 0.0561 0.175 cMono_S100A L2
ENSG00000146409 SLC18B1 773469 sc-eQTL 9.65e-01 0.00401 0.0911 0.175 cMono_S100A L2
ENSG00000286887 AL355881.1 -709493 sc-eQTL 4.34e-01 -0.0698 0.089 0.175 cMono_S100A L2
ENSG00000028839 TBPL1 -365362 sc-eQTL 3.51e-01 -0.133 0.142 0.167 gdT L2
ENSG00000112303 VNN2 823349 sc-eQTL 4.33e-01 -0.107 0.136 0.167 gdT L2
ENSG00000112306 RPS12 772239 sc-eQTL 2.47e-01 0.0599 0.0516 0.167 gdT L2
ENSG00000118515 SGK1 -731304 sc-eQTL 2.80e-01 -0.106 0.0974 0.167 gdT L2
ENSG00000146409 SLC18B1 773469 sc-eQTL 5.26e-01 0.0849 0.134 0.167 gdT L2
ENSG00000028839 TBPL1 -365362 sc-eQTL 7.08e-01 -0.0407 0.109 0.178 intMono L2
ENSG00000093134 VNN3 852043 sc-eQTL 4.37e-01 0.0813 0.105 0.178 intMono L2
ENSG00000112299 VNN1 872753 sc-eQTL 1.08e-01 0.166 0.103 0.178 intMono L2
ENSG00000112303 VNN2 823349 sc-eQTL 4.80e-01 -0.0744 0.105 0.178 intMono L2
ENSG00000112306 RPS12 772239 sc-eQTL 2.66e-01 0.0509 0.0456 0.178 intMono L2
ENSG00000118515 SGK1 -731304 sc-eQTL 2.40e-02 -0.173 0.0759 0.178 intMono L2
ENSG00000146409 SLC18B1 773469 sc-eQTL 5.33e-01 -0.0695 0.111 0.178 intMono L2
ENSG00000286887 AL355881.1 -709493 sc-eQTL 2.69e-01 -0.118 0.106 0.178 intMono L2
ENSG00000028839 TBPL1 -365362 sc-eQTL 7.28e-01 -0.0406 0.117 0.163 ncMono L2
ENSG00000093134 VNN3 852043 sc-eQTL 4.16e-01 -0.0907 0.111 0.163 ncMono L2
ENSG00000112299 VNN1 872753 sc-eQTL 8.82e-01 0.0165 0.111 0.163 ncMono L2
ENSG00000112303 VNN2 823349 sc-eQTL 6.55e-01 -0.0476 0.106 0.163 ncMono L2
ENSG00000112306 RPS12 772239 sc-eQTL 2.34e-01 -0.0635 0.0532 0.163 ncMono L2
ENSG00000118515 SGK1 -731304 sc-eQTL 9.82e-01 -0.00171 0.0755 0.163 ncMono L2
ENSG00000146409 SLC18B1 773469 sc-eQTL 8.93e-01 -0.0126 0.0942 0.163 ncMono L2
ENSG00000286887 AL355881.1 -709493 sc-eQTL 1.63e-02 -0.238 0.0982 0.163 ncMono L2
ENSG00000028839 TBPL1 -365362 sc-eQTL 4.75e-01 -0.0977 0.137 0.158 pDC L2
ENSG00000093134 VNN3 852043 sc-eQTL 7.09e-01 -0.0342 0.0916 0.158 pDC L2
ENSG00000112299 VNN1 872753 sc-eQTL 7.68e-01 0.0276 0.0932 0.158 pDC L2
ENSG00000112303 VNN2 823349 sc-eQTL 1.19e-01 0.173 0.11 0.158 pDC L2
ENSG00000112306 RPS12 772239 sc-eQTL 1.57e-01 0.108 0.076 0.158 pDC L2
ENSG00000118515 SGK1 -731304 sc-eQTL 4.49e-01 -0.0589 0.0776 0.158 pDC L2
ENSG00000146409 SLC18B1 773469 sc-eQTL 2.08e-01 0.143 0.113 0.158 pDC L2
ENSG00000286438 AL591115.1 483680 sc-eQTL 3.21e-01 0.107 0.108 0.158 pDC L2
ENSG00000286887 AL355881.1 -709493 sc-eQTL 6.21e-01 -0.0476 0.096 0.158 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000028839 TBPL1 -365362 sc-eQTL 6.80e-01 -0.0465 0.113 0.175 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 823349 sc-eQTL 6.70e-01 0.0418 0.0981 0.175 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 772239 sc-eQTL 1.05e-01 0.0905 0.0555 0.175 B_Memory LOneK1K
ENSG00000118515 SGK1 -731304 sc-eQTL 9.86e-01 0.00152 0.0874 0.175 B_Memory LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 773469 sc-eQTL 7.45e-01 -0.0334 0.103 0.175 B_Memory LOneK1K
ENSG00000028839 TBPL1 -365362 sc-eQTL 9.65e-01 -0.00468 0.106 0.175 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 823349 sc-eQTL 4.57e-01 -0.069 0.0927 0.175 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 772239 sc-eQTL 4.47e-01 0.0427 0.0561 0.175 B_Naive LOneK1K
ENSG00000118515 SGK1 -731304 sc-eQTL 2.21e-01 0.106 0.0866 0.175 B_Naive LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 773469 sc-eQTL 6.95e-01 0.0415 0.106 0.175 B_Naive LOneK1K
ENSG00000028839 TBPL1 -365362 sc-eQTL 4.15e-01 0.0694 0.085 0.175 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000093134 VNN3 852043 sc-eQTL 3.22e-02 0.206 0.0955 0.175 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112299 VNN1 872753 sc-eQTL 6.87e-02 0.183 0.0999 0.175 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 823349 sc-eQTL 6.14e-01 0.0336 0.0665 0.175 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 772239 sc-eQTL 4.31e-02 0.092 0.0452 0.175 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000118515 SGK1 -731304 sc-eQTL 2.13e-01 -0.0775 0.062 0.175 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 773469 sc-eQTL 5.36e-01 -0.0503 0.0812 0.175 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000286887 AL355881.1 -709493 sc-eQTL 3.41e-01 -0.0812 0.085 0.175 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000028839 TBPL1 -365362 sc-eQTL 4.31e-01 -0.0876 0.111 0.175 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000093134 VNN3 852043 sc-eQTL 7.54e-01 0.0338 0.108 0.175 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112299 VNN1 872753 sc-eQTL 6.80e-01 0.0441 0.107 0.175 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 823349 sc-eQTL 8.08e-01 -0.0245 0.101 0.175 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 772239 sc-eQTL 7.18e-01 -0.0155 0.0427 0.175 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000118515 SGK1 -731304 sc-eQTL 1.81e-01 -0.0865 0.0644 0.175 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 773469 sc-eQTL 7.15e-01 -0.0379 0.104 0.175 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000286887 AL355881.1 -709493 sc-eQTL 8.01e-02 -0.164 0.0931 0.175 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000028839 TBPL1 -365362 sc-eQTL 6.02e-01 0.0464 0.0889 0.172 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 823349 sc-eQTL 9.84e-01 -0.00214 0.106 0.172 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 772239 sc-eQTL 7.67e-01 0.0128 0.0431 0.172 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000118515 SGK1 -731304 sc-eQTL 2.24e-02 -0.203 0.088 0.172 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000093134 VNN3 852043 eQTL 0.00694 0.052 0.0192 0.0 0.0 0.173
ENSG00000112299 VNN1 872753 eQTL 0.0168 0.0686 0.0286 0.0 0.0 0.173

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina