logo

Genes within 1Mb (chr6:133580019:T:G):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000028839 TBPL1 -372151 sc-eQTL 2.36e-02 0.268 0.117 0.16 B L1
ENSG00000112303 VNN2 816560 sc-eQTL 8.93e-01 0.012 0.089 0.16 B L1
ENSG00000112306 RPS12 765450 sc-eQTL 7.09e-01 -0.0201 0.0538 0.16 B L1
ENSG00000118515 SGK1 -738093 sc-eQTL 2.80e-01 0.0897 0.0828 0.16 B L1
ENSG00000146409 SLC18B1 766680 sc-eQTL 3.14e-01 0.114 0.113 0.16 B L1
ENSG00000028839 TBPL1 -372151 sc-eQTL 4.22e-01 0.0709 0.0881 0.16 CD4T L1
ENSG00000112303 VNN2 816560 sc-eQTL 7.19e-01 0.0286 0.0795 0.16 CD4T L1
ENSG00000112306 RPS12 765450 sc-eQTL 4.30e-01 -0.0427 0.054 0.16 CD4T L1
ENSG00000118515 SGK1 -738093 sc-eQTL 2.53e-01 -0.083 0.0724 0.16 CD4T L1
ENSG00000146409 SLC18B1 766680 sc-eQTL 1.80e-01 0.146 0.109 0.16 CD4T L1
ENSG00000028839 TBPL1 -372151 sc-eQTL 2.97e-01 -0.089 0.085 0.16 CD8T L1
ENSG00000112303 VNN2 816560 sc-eQTL 2.89e-01 0.11 0.104 0.16 CD8T L1
ENSG00000112306 RPS12 765450 sc-eQTL 3.77e-01 -0.0314 0.0354 0.16 CD8T L1
ENSG00000118515 SGK1 -738093 sc-eQTL 6.11e-01 0.0279 0.0547 0.16 CD8T L1
ENSG00000146409 SLC18B1 766680 sc-eQTL 2.61e-01 0.12 0.107 0.16 CD8T L1
ENSG00000028839 TBPL1 -372151 sc-eQTL 3.20e-01 -0.13 0.131 0.167 DC L1
ENSG00000093134 VNN3 845254 sc-eQTL 2.48e-01 0.117 0.101 0.167 DC L1
ENSG00000112299 VNN1 865964 sc-eQTL 8.51e-01 0.0205 0.109 0.167 DC L1
ENSG00000112303 VNN2 816560 sc-eQTL 8.54e-01 0.0215 0.117 0.167 DC L1
ENSG00000112306 RPS12 765450 sc-eQTL 3.29e-01 0.0639 0.0653 0.167 DC L1
ENSG00000118515 SGK1 -738093 sc-eQTL 5.29e-01 0.0478 0.0759 0.167 DC L1
ENSG00000146409 SLC18B1 766680 sc-eQTL 4.22e-01 0.0833 0.103 0.167 DC L1
ENSG00000286438 AL591115.1 476891 sc-eQTL 8.14e-01 0.0222 0.0943 0.167 DC L1
ENSG00000286887 AL355881.1 -716282 sc-eQTL 9.69e-01 0.00462 0.118 0.167 DC L1
ENSG00000028839 TBPL1 -372151 sc-eQTL 7.59e-01 0.0286 0.093 0.16 Mono L1
ENSG00000093134 VNN3 845254 sc-eQTL 9.72e-01 0.00379 0.107 0.16 Mono L1
ENSG00000112299 VNN1 865964 sc-eQTL 3.99e-01 -0.097 0.115 0.16 Mono L1
ENSG00000112303 VNN2 816560 sc-eQTL 3.16e-01 0.0814 0.0809 0.16 Mono L1
ENSG00000112306 RPS12 765450 sc-eQTL 4.19e-01 -0.0393 0.0485 0.16 Mono L1
ENSG00000118515 SGK1 -738093 sc-eQTL 4.66e-01 0.05 0.0686 0.16 Mono L1
ENSG00000146409 SLC18B1 766680 sc-eQTL 5.90e-02 -0.181 0.0954 0.16 Mono L1
ENSG00000286887 AL355881.1 -716282 sc-eQTL 3.08e-01 0.0963 0.0943 0.16 Mono L1
ENSG00000028839 TBPL1 -372151 sc-eQTL 2.81e-01 -0.107 0.0986 0.161 NK L1
ENSG00000112303 VNN2 816560 sc-eQTL 6.41e-02 -0.21 0.113 0.161 NK L1
ENSG00000112306 RPS12 765450 sc-eQTL 7.50e-01 -0.015 0.0471 0.161 NK L1
ENSG00000118515 SGK1 -738093 sc-eQTL 1.33e-01 0.131 0.0866 0.161 NK L1
ENSG00000028839 TBPL1 -372151 sc-eQTL 6.18e-02 0.225 0.12 0.16 Other_T L1
ENSG00000112303 VNN2 816560 sc-eQTL 4.31e-02 0.232 0.114 0.16 Other_T L1
ENSG00000112306 RPS12 765450 sc-eQTL 3.63e-01 0.0415 0.0455 0.16 Other_T L1
ENSG00000118515 SGK1 -738093 sc-eQTL 3.51e-01 0.0783 0.0837 0.16 Other_T L1
ENSG00000146409 SLC18B1 766680 sc-eQTL 9.97e-02 0.205 0.124 0.16 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000028839 TBPL1 -372151 sc-eQTL 5.28e-01 -0.0907 0.144 0.158 B_Activated L2
ENSG00000112303 VNN2 816560 sc-eQTL 7.98e-01 0.0335 0.131 0.158 B_Activated L2
ENSG00000112306 RPS12 765450 sc-eQTL 4.72e-01 -0.0505 0.0701 0.158 B_Activated L2
ENSG00000118515 SGK1 -738093 sc-eQTL 1.48e-01 0.181 0.124 0.158 B_Activated L2
ENSG00000146409 SLC18B1 766680 sc-eQTL 6.46e-01 -0.0566 0.123 0.158 B_Activated L2
ENSG00000028839 TBPL1 -372151 sc-eQTL 7.27e-01 -0.0461 0.132 0.161 B_Intermediate L2
ENSG00000112303 VNN2 816560 sc-eQTL 9.69e-01 0.00443 0.114 0.161 B_Intermediate L2
ENSG00000112306 RPS12 765450 sc-eQTL 9.32e-01 -0.00594 0.0699 0.161 B_Intermediate L2
ENSG00000118515 SGK1 -738093 sc-eQTL 4.99e-02 0.236 0.12 0.161 B_Intermediate L2
ENSG00000146409 SLC18B1 766680 sc-eQTL 6.27e-01 0.0613 0.126 0.161 B_Intermediate L2
ENSG00000028839 TBPL1 -372151 sc-eQTL 1.14e-01 0.196 0.124 0.162 B_Memory L2
ENSG00000112303 VNN2 816560 sc-eQTL 6.98e-01 0.0457 0.118 0.162 B_Memory L2
ENSG00000112306 RPS12 765450 sc-eQTL 8.93e-01 0.00764 0.0568 0.162 B_Memory L2
ENSG00000118515 SGK1 -738093 sc-eQTL 6.00e-02 0.196 0.103 0.162 B_Memory L2
ENSG00000146409 SLC18B1 766680 sc-eQTL 2.64e-01 0.132 0.118 0.162 B_Memory L2
ENSG00000028839 TBPL1 -372151 sc-eQTL 5.14e-01 0.0765 0.117 0.16 B_Naive1 L2
ENSG00000112303 VNN2 816560 sc-eQTL 3.37e-01 0.105 0.109 0.16 B_Naive1 L2
ENSG00000112306 RPS12 765450 sc-eQTL 9.29e-01 -0.00559 0.0623 0.16 B_Naive1 L2
ENSG00000118515 SGK1 -738093 sc-eQTL 8.71e-01 0.0158 0.0975 0.16 B_Naive1 L2
ENSG00000146409 SLC18B1 766680 sc-eQTL 6.61e-01 0.0528 0.12 0.16 B_Naive1 L2
ENSG00000028839 TBPL1 -372151 sc-eQTL 4.19e-03 0.359 0.124 0.161 B_Naive2 L2
ENSG00000112303 VNN2 816560 sc-eQTL 1.14e-01 -0.195 0.123 0.161 B_Naive2 L2
ENSG00000112306 RPS12 765450 sc-eQTL 8.38e-02 -0.113 0.0649 0.161 B_Naive2 L2
ENSG00000118515 SGK1 -738093 sc-eQTL 5.90e-01 -0.0622 0.115 0.161 B_Naive2 L2
ENSG00000146409 SLC18B1 766680 sc-eQTL 5.34e-01 0.0776 0.125 0.161 B_Naive2 L2
ENSG00000028839 TBPL1 -372151 sc-eQTL 7.46e-01 0.0398 0.123 0.161 CD4_CTL L2
ENSG00000112303 VNN2 816560 sc-eQTL 1.95e-01 -0.16 0.123 0.161 CD4_CTL L2
ENSG00000112306 RPS12 765450 sc-eQTL 5.82e-02 -0.108 0.0564 0.161 CD4_CTL L2
ENSG00000118515 SGK1 -738093 sc-eQTL 9.50e-01 0.00618 0.0987 0.161 CD4_CTL L2
ENSG00000146409 SLC18B1 766680 sc-eQTL 2.37e-01 0.136 0.114 0.161 CD4_CTL L2
ENSG00000028839 TBPL1 -372151 sc-eQTL 2.25e-01 0.122 0.1 0.16 CD4_Naive L2
ENSG00000112303 VNN2 816560 sc-eQTL 2.62e-01 0.102 0.0909 0.16 CD4_Naive L2
ENSG00000112306 RPS12 765450 sc-eQTL 9.42e-01 0.0043 0.0591 0.16 CD4_Naive L2
ENSG00000118515 SGK1 -738093 sc-eQTL 4.29e-01 -0.0573 0.0723 0.16 CD4_Naive L2
ENSG00000146409 SLC18B1 766680 sc-eQTL 2.85e-01 0.122 0.114 0.16 CD4_Naive L2
ENSG00000028839 TBPL1 -372151 sc-eQTL 7.00e-01 -0.0407 0.106 0.16 CD4_TCM L2
ENSG00000112303 VNN2 816560 sc-eQTL 4.28e-01 0.0831 0.105 0.16 CD4_TCM L2
ENSG00000112306 RPS12 765450 sc-eQTL 9.14e-01 0.00587 0.0543 0.16 CD4_TCM L2
ENSG00000118515 SGK1 -738093 sc-eQTL 7.34e-01 -0.0259 0.076 0.16 CD4_TCM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 766680 sc-eQTL 9.52e-01 0.00761 0.126 0.16 CD4_TCM L2
ENSG00000028839 TBPL1 -372151 sc-eQTL 1.66e-01 -0.17 0.122 0.16 CD4_TEM L2
ENSG00000112303 VNN2 816560 sc-eQTL 8.09e-02 -0.206 0.117 0.16 CD4_TEM L2
ENSG00000112306 RPS12 765450 sc-eQTL 3.33e-01 0.0469 0.0483 0.16 CD4_TEM L2
ENSG00000118515 SGK1 -738093 sc-eQTL 2.50e-01 0.0956 0.0829 0.16 CD4_TEM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 766680 sc-eQTL 4.19e-01 0.0972 0.12 0.16 CD4_TEM L2
ENSG00000028839 TBPL1 -372151 sc-eQTL 4.29e-01 -0.0866 0.109 0.16 CD8_CTL L2
ENSG00000112303 VNN2 816560 sc-eQTL 6.97e-01 0.0454 0.116 0.16 CD8_CTL L2
ENSG00000112306 RPS12 765450 sc-eQTL 3.76e-01 -0.0551 0.0621 0.16 CD8_CTL L2
ENSG00000118515 SGK1 -738093 sc-eQTL 6.81e-03 0.282 0.103 0.16 CD8_CTL L2
ENSG00000146409 SLC18B1 766680 sc-eQTL 9.72e-01 -0.00425 0.121 0.16 CD8_CTL L2
ENSG00000028839 TBPL1 -372151 sc-eQTL 7.32e-01 0.0398 0.116 0.16 CD8_Naive L2
ENSG00000112303 VNN2 816560 sc-eQTL 8.25e-01 0.0237 0.107 0.16 CD8_Naive L2
ENSG00000112306 RPS12 765450 sc-eQTL 2.64e-01 0.0682 0.061 0.16 CD8_Naive L2
ENSG00000118515 SGK1 -738093 sc-eQTL 5.77e-01 -0.0429 0.0767 0.16 CD8_Naive L2
ENSG00000146409 SLC18B1 766680 sc-eQTL 8.70e-01 0.0201 0.123 0.16 CD8_Naive L2
ENSG00000028839 TBPL1 -372151 sc-eQTL 1.44e-01 -0.19 0.129 0.164 CD8_TCM L2
ENSG00000112303 VNN2 816560 sc-eQTL 6.61e-01 -0.0524 0.119 0.164 CD8_TCM L2
ENSG00000112306 RPS12 765450 sc-eQTL 6.34e-01 -0.0277 0.0581 0.164 CD8_TCM L2
ENSG00000118515 SGK1 -738093 sc-eQTL 5.39e-01 -0.0593 0.0962 0.164 CD8_TCM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 766680 sc-eQTL 6.88e-02 0.231 0.126 0.164 CD8_TCM L2
ENSG00000028839 TBPL1 -372151 sc-eQTL 3.31e-01 -0.121 0.124 0.162 CD8_TEM L2
ENSG00000112303 VNN2 816560 sc-eQTL 9.59e-02 0.225 0.134 0.162 CD8_TEM L2
ENSG00000112306 RPS12 765450 sc-eQTL 9.62e-01 -0.00349 0.0727 0.162 CD8_TEM L2
ENSG00000118515 SGK1 -738093 sc-eQTL 8.11e-01 -0.0285 0.119 0.162 CD8_TEM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 766680 sc-eQTL 5.46e-01 0.0831 0.137 0.162 CD8_TEM L2
ENSG00000028839 TBPL1 -372151 sc-eQTL 1.46e-02 0.301 0.122 0.16 MAIT L2
ENSG00000112303 VNN2 816560 sc-eQTL 8.12e-02 0.208 0.119 0.16 MAIT L2
ENSG00000112306 RPS12 765450 sc-eQTL 4.67e-01 0.0428 0.0588 0.16 MAIT L2
ENSG00000118515 SGK1 -738093 sc-eQTL 4.89e-03 0.231 0.0813 0.16 MAIT L2
ENSG00000146409 SLC18B1 766680 sc-eQTL 1.37e-01 0.183 0.123 0.16 MAIT L2
ENSG00000028839 TBPL1 -372151 sc-eQTL 3.51e-01 -0.124 0.132 0.158 NK_CD56bright L2
ENSG00000112303 VNN2 816560 sc-eQTL 8.13e-01 -0.0295 0.125 0.158 NK_CD56bright L2
ENSG00000112306 RPS12 765450 sc-eQTL 5.85e-01 -0.038 0.0694 0.158 NK_CD56bright L2
ENSG00000118515 SGK1 -738093 sc-eQTL 1.66e-03 0.323 0.101 0.158 NK_CD56bright L2
ENSG00000028839 TBPL1 -372151 sc-eQTL 5.71e-01 -0.0602 0.106 0.162 NK_CD56dim L2
ENSG00000112303 VNN2 816560 sc-eQTL 4.24e-02 -0.246 0.12 0.162 NK_CD56dim L2
ENSG00000112306 RPS12 765450 sc-eQTL 7.63e-01 0.0146 0.0482 0.162 NK_CD56dim L2
ENSG00000118515 SGK1 -738093 sc-eQTL 5.50e-01 0.0639 0.107 0.162 NK_CD56dim L2
ENSG00000028839 TBPL1 -372151 sc-eQTL 7.12e-01 -0.0503 0.136 0.16 NK_HLA L2
ENSG00000112303 VNN2 816560 sc-eQTL 9.25e-01 -0.0118 0.125 0.16 NK_HLA L2
ENSG00000112306 RPS12 765450 sc-eQTL 9.64e-01 -0.00267 0.0583 0.16 NK_HLA L2
ENSG00000118515 SGK1 -738093 sc-eQTL 7.49e-01 0.037 0.115 0.16 NK_HLA L2
ENSG00000028839 TBPL1 -372151 sc-eQTL 6.09e-01 -0.0573 0.112 0.162 NK_cytokine L2
ENSG00000112303 VNN2 816560 sc-eQTL 3.08e-01 -0.124 0.122 0.162 NK_cytokine L2
ENSG00000112306 RPS12 765450 sc-eQTL 9.12e-01 0.00734 0.0661 0.162 NK_cytokine L2
ENSG00000118515 SGK1 -738093 sc-eQTL 8.84e-01 -0.0161 0.11 0.162 NK_cytokine L2
ENSG00000028839 TBPL1 -372151 sc-eQTL 1.79e-01 0.208 0.154 0.17 PB L2
ENSG00000112303 VNN2 816560 sc-eQTL 7.81e-01 -0.0376 0.135 0.17 PB L2
ENSG00000112306 RPS12 765450 sc-eQTL 6.61e-01 0.0336 0.0765 0.17 PB L2
ENSG00000118515 SGK1 -738093 sc-eQTL 3.08e-01 0.126 0.123 0.17 PB L2
ENSG00000146409 SLC18B1 766680 sc-eQTL 4.73e-01 -0.103 0.143 0.17 PB L2
ENSG00000028839 TBPL1 -372151 sc-eQTL 7.09e-01 0.0473 0.127 0.159 Pro_T L2
ENSG00000112303 VNN2 816560 sc-eQTL 9.33e-02 -0.203 0.121 0.159 Pro_T L2
ENSG00000112306 RPS12 765450 sc-eQTL 9.00e-01 0.00578 0.0459 0.159 Pro_T L2
ENSG00000118515 SGK1 -738093 sc-eQTL 9.79e-01 -0.00239 0.0921 0.159 Pro_T L2
ENSG00000146409 SLC18B1 766680 sc-eQTL 7.67e-01 -0.0352 0.119 0.159 Pro_T L2
ENSG00000028839 TBPL1 -372151 sc-eQTL 3.84e-01 0.11 0.126 0.16 Treg L2
ENSG00000112303 VNN2 816560 sc-eQTL 1.99e-01 -0.128 0.0995 0.16 Treg L2
ENSG00000112306 RPS12 765450 sc-eQTL 6.15e-01 0.0223 0.0442 0.16 Treg L2
ENSG00000118515 SGK1 -738093 sc-eQTL 9.08e-01 -0.0108 0.0931 0.16 Treg L2
ENSG00000146409 SLC18B1 766680 sc-eQTL 9.23e-01 0.012 0.125 0.16 Treg L2
ENSG00000028839 TBPL1 -372151 sc-eQTL 6.53e-01 0.0594 0.132 0.161 cDC L2
ENSG00000093134 VNN3 845254 sc-eQTL 5.66e-01 0.059 0.103 0.161 cDC L2
ENSG00000112299 VNN1 865964 sc-eQTL 5.96e-01 -0.0641 0.121 0.161 cDC L2
ENSG00000112303 VNN2 816560 sc-eQTL 7.21e-01 -0.0422 0.118 0.161 cDC L2
ENSG00000112306 RPS12 765450 sc-eQTL 8.19e-01 -0.0133 0.0582 0.161 cDC L2
ENSG00000118515 SGK1 -738093 sc-eQTL 5.60e-01 0.0572 0.0979 0.161 cDC L2
ENSG00000146409 SLC18B1 766680 sc-eQTL 4.23e-01 0.0923 0.115 0.161 cDC L2
ENSG00000286438 AL591115.1 476891 sc-eQTL 9.98e-01 0.000268 0.0921 0.161 cDC L2
ENSG00000286887 AL355881.1 -716282 sc-eQTL 3.91e-01 0.0973 0.113 0.161 cDC L2
ENSG00000028839 TBPL1 -372151 sc-eQTL 1.92e-01 0.135 0.103 0.16 cMono_IL1B L2
ENSG00000093134 VNN3 845254 sc-eQTL 6.81e-01 0.0458 0.111 0.16 cMono_IL1B L2
ENSG00000112299 VNN1 865964 sc-eQTL 6.69e-01 -0.0481 0.112 0.16 cMono_IL1B L2
ENSG00000112303 VNN2 816560 sc-eQTL 2.28e-01 0.108 0.0895 0.16 cMono_IL1B L2
ENSG00000112306 RPS12 765450 sc-eQTL 8.96e-01 0.0065 0.0499 0.16 cMono_IL1B L2
ENSG00000118515 SGK1 -738093 sc-eQTL 3.29e-01 0.0726 0.0742 0.16 cMono_IL1B L2
ENSG00000146409 SLC18B1 766680 sc-eQTL 1.12e-01 -0.153 0.0956 0.16 cMono_IL1B L2
ENSG00000286887 AL355881.1 -716282 sc-eQTL 2.58e-01 0.113 0.0998 0.16 cMono_IL1B L2
ENSG00000028839 TBPL1 -372151 sc-eQTL 5.53e-01 -0.07 0.118 0.16 cMono_S100A L2
ENSG00000093134 VNN3 845254 sc-eQTL 6.41e-01 -0.0497 0.106 0.16 cMono_S100A L2
ENSG00000112299 VNN1 865964 sc-eQTL 5.09e-01 -0.0763 0.115 0.16 cMono_S100A L2
ENSG00000112303 VNN2 816560 sc-eQTL 7.69e-01 0.0222 0.0756 0.16 cMono_S100A L2
ENSG00000112306 RPS12 765450 sc-eQTL 7.31e-01 -0.0187 0.0544 0.16 cMono_S100A L2
ENSG00000118515 SGK1 -738093 sc-eQTL 3.81e-01 0.0545 0.0621 0.16 cMono_S100A L2
ENSG00000146409 SLC18B1 766680 sc-eQTL 3.41e-01 -0.096 0.101 0.16 cMono_S100A L2
ENSG00000286887 AL355881.1 -716282 sc-eQTL 3.00e-01 0.102 0.0983 0.16 cMono_S100A L2
ENSG00000028839 TBPL1 -372151 sc-eQTL 7.26e-02 -0.299 0.165 0.161 gdT L2
ENSG00000112303 VNN2 816560 sc-eQTL 4.11e-03 0.451 0.155 0.161 gdT L2
ENSG00000112306 RPS12 765450 sc-eQTL 9.86e-01 0.00105 0.0606 0.161 gdT L2
ENSG00000118515 SGK1 -738093 sc-eQTL 4.86e-01 -0.0798 0.114 0.161 gdT L2
ENSG00000146409 SLC18B1 766680 sc-eQTL 8.64e-01 -0.0269 0.157 0.161 gdT L2
ENSG00000028839 TBPL1 -372151 sc-eQTL 2.85e-01 0.129 0.12 0.164 intMono L2
ENSG00000093134 VNN3 845254 sc-eQTL 8.60e-01 0.0205 0.116 0.164 intMono L2
ENSG00000112299 VNN1 865964 sc-eQTL 7.70e-01 0.0337 0.115 0.164 intMono L2
ENSG00000112303 VNN2 816560 sc-eQTL 2.36e-01 -0.138 0.116 0.164 intMono L2
ENSG00000112306 RPS12 765450 sc-eQTL 2.74e-01 0.0556 0.0507 0.164 intMono L2
ENSG00000118515 SGK1 -738093 sc-eQTL 4.81e-01 0.0601 0.0853 0.164 intMono L2
ENSG00000146409 SLC18B1 766680 sc-eQTL 3.98e-01 0.105 0.124 0.164 intMono L2
ENSG00000286887 AL355881.1 -716282 sc-eQTL 9.42e-01 -0.00855 0.118 0.164 intMono L2
ENSG00000028839 TBPL1 -372151 sc-eQTL 5.11e-01 -0.0835 0.127 0.161 ncMono L2
ENSG00000093134 VNN3 845254 sc-eQTL 5.53e-01 0.0721 0.121 0.161 ncMono L2
ENSG00000112299 VNN1 865964 sc-eQTL 9.90e-01 -0.00146 0.12 0.161 ncMono L2
ENSG00000112303 VNN2 816560 sc-eQTL 7.53e-01 0.0364 0.116 0.161 ncMono L2
ENSG00000112306 RPS12 765450 sc-eQTL 9.77e-01 -0.00165 0.058 0.161 ncMono L2
ENSG00000118515 SGK1 -738093 sc-eQTL 3.69e-01 0.0737 0.0819 0.161 ncMono L2
ENSG00000146409 SLC18B1 766680 sc-eQTL 1.08e-01 -0.164 0.102 0.161 ncMono L2
ENSG00000286887 AL355881.1 -716282 sc-eQTL 1.72e-01 0.148 0.108 0.161 ncMono L2
ENSG00000028839 TBPL1 -372151 sc-eQTL 9.85e-01 -0.00278 0.143 0.175 pDC L2
ENSG00000093134 VNN3 845254 sc-eQTL 3.53e-01 0.0891 0.0956 0.175 pDC L2
ENSG00000112299 VNN1 865964 sc-eQTL 1.37e-01 -0.145 0.0969 0.175 pDC L2
ENSG00000112303 VNN2 816560 sc-eQTL 6.75e-01 0.0488 0.116 0.175 pDC L2
ENSG00000112306 RPS12 765450 sc-eQTL 1.79e-01 0.107 0.0796 0.175 pDC L2
ENSG00000118515 SGK1 -738093 sc-eQTL 5.68e-01 0.0465 0.0812 0.175 pDC L2
ENSG00000146409 SLC18B1 766680 sc-eQTL 5.18e-01 -0.0766 0.118 0.175 pDC L2
ENSG00000286438 AL591115.1 476891 sc-eQTL 4.35e-01 0.0886 0.113 0.175 pDC L2
ENSG00000286887 AL355881.1 -716282 sc-eQTL 9.61e-02 -0.167 0.0996 0.175 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000028839 TBPL1 -372151 sc-eQTL 8.00e-01 0.0319 0.126 0.16 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 816560 sc-eQTL 4.03e-01 0.0915 0.109 0.16 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 765450 sc-eQTL 9.29e-01 0.00553 0.0623 0.16 B_Memory LOneK1K
ENSG00000118515 SGK1 -738093 sc-eQTL 5.76e-03 0.267 0.0957 0.16 B_Memory LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 766680 sc-eQTL 6.46e-01 0.0527 0.114 0.16 B_Memory LOneK1K
ENSG00000028839 TBPL1 -372151 sc-eQTL 1.31e-02 0.291 0.116 0.16 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 816560 sc-eQTL 6.45e-01 -0.0475 0.103 0.16 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 765450 sc-eQTL 5.84e-01 -0.0342 0.0623 0.16 B_Naive LOneK1K
ENSG00000118515 SGK1 -738093 sc-eQTL 8.38e-01 0.0198 0.0966 0.16 B_Naive LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 766680 sc-eQTL 3.62e-01 0.107 0.117 0.16 B_Naive LOneK1K
ENSG00000028839 TBPL1 -372151 sc-eQTL 5.64e-01 0.0545 0.0945 0.16 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000093134 VNN3 845254 sc-eQTL 7.98e-01 0.0275 0.107 0.16 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112299 VNN1 865964 sc-eQTL 4.96e-01 -0.0762 0.112 0.16 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 816560 sc-eQTL 3.85e-01 0.0642 0.0738 0.16 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 765450 sc-eQTL 8.21e-01 0.0114 0.0507 0.16 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000118515 SGK1 -738093 sc-eQTL 2.89e-01 0.0732 0.0689 0.16 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 766680 sc-eQTL 8.37e-02 -0.156 0.0895 0.16 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000286887 AL355881.1 -716282 sc-eQTL 2.16e-01 0.117 0.0942 0.16 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000028839 TBPL1 -372151 sc-eQTL 8.29e-01 0.0262 0.121 0.162 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000093134 VNN3 845254 sc-eQTL 5.51e-01 0.0703 0.118 0.162 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112299 VNN1 865964 sc-eQTL 9.89e-01 0.00165 0.117 0.162 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 816560 sc-eQTL 7.24e-01 -0.0388 0.11 0.162 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 765450 sc-eQTL 9.93e-01 0.000398 0.0467 0.162 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000118515 SGK1 -738093 sc-eQTL 6.77e-01 0.0294 0.0707 0.162 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 766680 sc-eQTL 8.01e-01 -0.0286 0.113 0.162 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000286887 AL355881.1 -716282 sc-eQTL 6.87e-01 0.0414 0.103 0.162 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000028839 TBPL1 -372151 sc-eQTL 3.80e-01 -0.0858 0.0975 0.162 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 816560 sc-eQTL 5.70e-02 -0.22 0.115 0.162 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 765450 sc-eQTL 8.93e-01 -0.00638 0.0474 0.162 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000118515 SGK1 -738093 sc-eQTL 6.67e-01 0.0422 0.0979 0.162 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000112299 VNN1 865964 pQTL 0.0116 -0.115 0.0454 0.0 0.0 0.172
ENSG00000112299 VNN1 865964 eQTL 0.0454 -0.0545 0.0272 0.0 0.0 0.18
ENSG00000146409 SLC18B1 766680 eQTL 0.035 0.0589 0.0279 0.0 0.0 0.18

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina