logo

Genes within 1Mb (chr6:133578921:C:A):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000028839 TBPL1 -373249 sc-eQTL 2.36e-02 0.268 0.117 0.16 B L1
ENSG00000112303 VNN2 815462 sc-eQTL 8.93e-01 0.012 0.089 0.16 B L1
ENSG00000112306 RPS12 764352 sc-eQTL 7.09e-01 -0.0201 0.0538 0.16 B L1
ENSG00000118515 SGK1 -739191 sc-eQTL 2.80e-01 0.0897 0.0828 0.16 B L1
ENSG00000146409 SLC18B1 765582 sc-eQTL 3.14e-01 0.114 0.113 0.16 B L1
ENSG00000028839 TBPL1 -373249 sc-eQTL 4.22e-01 0.0709 0.0881 0.16 CD4T L1
ENSG00000112303 VNN2 815462 sc-eQTL 7.19e-01 0.0286 0.0795 0.16 CD4T L1
ENSG00000112306 RPS12 764352 sc-eQTL 4.30e-01 -0.0427 0.054 0.16 CD4T L1
ENSG00000118515 SGK1 -739191 sc-eQTL 2.53e-01 -0.083 0.0724 0.16 CD4T L1
ENSG00000146409 SLC18B1 765582 sc-eQTL 1.80e-01 0.146 0.109 0.16 CD4T L1
ENSG00000028839 TBPL1 -373249 sc-eQTL 2.97e-01 -0.089 0.085 0.16 CD8T L1
ENSG00000112303 VNN2 815462 sc-eQTL 2.89e-01 0.11 0.104 0.16 CD8T L1
ENSG00000112306 RPS12 764352 sc-eQTL 3.77e-01 -0.0314 0.0354 0.16 CD8T L1
ENSG00000118515 SGK1 -739191 sc-eQTL 6.11e-01 0.0279 0.0547 0.16 CD8T L1
ENSG00000146409 SLC18B1 765582 sc-eQTL 2.61e-01 0.12 0.107 0.16 CD8T L1
ENSG00000028839 TBPL1 -373249 sc-eQTL 3.20e-01 -0.13 0.131 0.167 DC L1
ENSG00000093134 VNN3 844156 sc-eQTL 2.48e-01 0.117 0.101 0.167 DC L1
ENSG00000112299 VNN1 864866 sc-eQTL 8.51e-01 0.0205 0.109 0.167 DC L1
ENSG00000112303 VNN2 815462 sc-eQTL 8.54e-01 0.0215 0.117 0.167 DC L1
ENSG00000112306 RPS12 764352 sc-eQTL 3.29e-01 0.0639 0.0653 0.167 DC L1
ENSG00000118515 SGK1 -739191 sc-eQTL 5.29e-01 0.0478 0.0759 0.167 DC L1
ENSG00000146409 SLC18B1 765582 sc-eQTL 4.22e-01 0.0833 0.103 0.167 DC L1
ENSG00000286438 AL591115.1 475793 sc-eQTL 8.14e-01 0.0222 0.0943 0.167 DC L1
ENSG00000286887 AL355881.1 -717380 sc-eQTL 9.69e-01 0.00462 0.118 0.167 DC L1
ENSG00000028839 TBPL1 -373249 sc-eQTL 7.59e-01 0.0286 0.093 0.16 Mono L1
ENSG00000093134 VNN3 844156 sc-eQTL 9.72e-01 0.00379 0.107 0.16 Mono L1
ENSG00000112299 VNN1 864866 sc-eQTL 3.99e-01 -0.097 0.115 0.16 Mono L1
ENSG00000112303 VNN2 815462 sc-eQTL 3.16e-01 0.0814 0.0809 0.16 Mono L1
ENSG00000112306 RPS12 764352 sc-eQTL 4.19e-01 -0.0393 0.0485 0.16 Mono L1
ENSG00000118515 SGK1 -739191 sc-eQTL 4.66e-01 0.05 0.0686 0.16 Mono L1
ENSG00000146409 SLC18B1 765582 sc-eQTL 5.90e-02 -0.181 0.0954 0.16 Mono L1
ENSG00000286887 AL355881.1 -717380 sc-eQTL 3.08e-01 0.0963 0.0943 0.16 Mono L1
ENSG00000028839 TBPL1 -373249 sc-eQTL 2.81e-01 -0.107 0.0986 0.161 NK L1
ENSG00000112303 VNN2 815462 sc-eQTL 6.41e-02 -0.21 0.113 0.161 NK L1
ENSG00000112306 RPS12 764352 sc-eQTL 7.50e-01 -0.015 0.0471 0.161 NK L1
ENSG00000118515 SGK1 -739191 sc-eQTL 1.33e-01 0.131 0.0866 0.161 NK L1
ENSG00000028839 TBPL1 -373249 sc-eQTL 6.18e-02 0.225 0.12 0.16 Other_T L1
ENSG00000112303 VNN2 815462 sc-eQTL 4.31e-02 0.232 0.114 0.16 Other_T L1
ENSG00000112306 RPS12 764352 sc-eQTL 3.63e-01 0.0415 0.0455 0.16 Other_T L1
ENSG00000118515 SGK1 -739191 sc-eQTL 3.51e-01 0.0783 0.0837 0.16 Other_T L1
ENSG00000146409 SLC18B1 765582 sc-eQTL 9.97e-02 0.205 0.124 0.16 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000028839 TBPL1 -373249 sc-eQTL 5.28e-01 -0.0907 0.144 0.158 B_Activated L2
ENSG00000112303 VNN2 815462 sc-eQTL 7.98e-01 0.0335 0.131 0.158 B_Activated L2
ENSG00000112306 RPS12 764352 sc-eQTL 4.72e-01 -0.0505 0.0701 0.158 B_Activated L2
ENSG00000118515 SGK1 -739191 sc-eQTL 1.48e-01 0.181 0.124 0.158 B_Activated L2
ENSG00000146409 SLC18B1 765582 sc-eQTL 6.46e-01 -0.0566 0.123 0.158 B_Activated L2
ENSG00000028839 TBPL1 -373249 sc-eQTL 7.27e-01 -0.0461 0.132 0.161 B_Intermediate L2
ENSG00000112303 VNN2 815462 sc-eQTL 9.69e-01 0.00443 0.114 0.161 B_Intermediate L2
ENSG00000112306 RPS12 764352 sc-eQTL 9.32e-01 -0.00594 0.0699 0.161 B_Intermediate L2
ENSG00000118515 SGK1 -739191 sc-eQTL 4.99e-02 0.236 0.12 0.161 B_Intermediate L2
ENSG00000146409 SLC18B1 765582 sc-eQTL 6.27e-01 0.0613 0.126 0.161 B_Intermediate L2
ENSG00000028839 TBPL1 -373249 sc-eQTL 1.14e-01 0.196 0.124 0.162 B_Memory L2
ENSG00000112303 VNN2 815462 sc-eQTL 6.98e-01 0.0457 0.118 0.162 B_Memory L2
ENSG00000112306 RPS12 764352 sc-eQTL 8.93e-01 0.00764 0.0568 0.162 B_Memory L2
ENSG00000118515 SGK1 -739191 sc-eQTL 6.00e-02 0.196 0.103 0.162 B_Memory L2
ENSG00000146409 SLC18B1 765582 sc-eQTL 2.64e-01 0.132 0.118 0.162 B_Memory L2
ENSG00000028839 TBPL1 -373249 sc-eQTL 5.14e-01 0.0765 0.117 0.16 B_Naive1 L2
ENSG00000112303 VNN2 815462 sc-eQTL 3.37e-01 0.105 0.109 0.16 B_Naive1 L2
ENSG00000112306 RPS12 764352 sc-eQTL 9.29e-01 -0.00559 0.0623 0.16 B_Naive1 L2
ENSG00000118515 SGK1 -739191 sc-eQTL 8.71e-01 0.0158 0.0975 0.16 B_Naive1 L2
ENSG00000146409 SLC18B1 765582 sc-eQTL 6.61e-01 0.0528 0.12 0.16 B_Naive1 L2
ENSG00000028839 TBPL1 -373249 sc-eQTL 4.19e-03 0.359 0.124 0.161 B_Naive2 L2
ENSG00000112303 VNN2 815462 sc-eQTL 1.14e-01 -0.195 0.123 0.161 B_Naive2 L2
ENSG00000112306 RPS12 764352 sc-eQTL 8.38e-02 -0.113 0.0649 0.161 B_Naive2 L2
ENSG00000118515 SGK1 -739191 sc-eQTL 5.90e-01 -0.0622 0.115 0.161 B_Naive2 L2
ENSG00000146409 SLC18B1 765582 sc-eQTL 5.34e-01 0.0776 0.125 0.161 B_Naive2 L2
ENSG00000028839 TBPL1 -373249 sc-eQTL 7.46e-01 0.0398 0.123 0.161 CD4_CTL L2
ENSG00000112303 VNN2 815462 sc-eQTL 1.95e-01 -0.16 0.123 0.161 CD4_CTL L2
ENSG00000112306 RPS12 764352 sc-eQTL 5.82e-02 -0.108 0.0564 0.161 CD4_CTL L2
ENSG00000118515 SGK1 -739191 sc-eQTL 9.50e-01 0.00618 0.0987 0.161 CD4_CTL L2
ENSG00000146409 SLC18B1 765582 sc-eQTL 2.37e-01 0.136 0.114 0.161 CD4_CTL L2
ENSG00000028839 TBPL1 -373249 sc-eQTL 2.25e-01 0.122 0.1 0.16 CD4_Naive L2
ENSG00000112303 VNN2 815462 sc-eQTL 2.62e-01 0.102 0.0909 0.16 CD4_Naive L2
ENSG00000112306 RPS12 764352 sc-eQTL 9.42e-01 0.0043 0.0591 0.16 CD4_Naive L2
ENSG00000118515 SGK1 -739191 sc-eQTL 4.29e-01 -0.0573 0.0723 0.16 CD4_Naive L2
ENSG00000146409 SLC18B1 765582 sc-eQTL 2.85e-01 0.122 0.114 0.16 CD4_Naive L2
ENSG00000028839 TBPL1 -373249 sc-eQTL 7.00e-01 -0.0407 0.106 0.16 CD4_TCM L2
ENSG00000112303 VNN2 815462 sc-eQTL 4.28e-01 0.0831 0.105 0.16 CD4_TCM L2
ENSG00000112306 RPS12 764352 sc-eQTL 9.14e-01 0.00587 0.0543 0.16 CD4_TCM L2
ENSG00000118515 SGK1 -739191 sc-eQTL 7.34e-01 -0.0259 0.076 0.16 CD4_TCM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 765582 sc-eQTL 9.52e-01 0.00761 0.126 0.16 CD4_TCM L2
ENSG00000028839 TBPL1 -373249 sc-eQTL 1.66e-01 -0.17 0.122 0.16 CD4_TEM L2
ENSG00000112303 VNN2 815462 sc-eQTL 8.09e-02 -0.206 0.117 0.16 CD4_TEM L2
ENSG00000112306 RPS12 764352 sc-eQTL 3.33e-01 0.0469 0.0483 0.16 CD4_TEM L2
ENSG00000118515 SGK1 -739191 sc-eQTL 2.50e-01 0.0956 0.0829 0.16 CD4_TEM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 765582 sc-eQTL 4.19e-01 0.0972 0.12 0.16 CD4_TEM L2
ENSG00000028839 TBPL1 -373249 sc-eQTL 4.29e-01 -0.0866 0.109 0.16 CD8_CTL L2
ENSG00000112303 VNN2 815462 sc-eQTL 6.97e-01 0.0454 0.116 0.16 CD8_CTL L2
ENSG00000112306 RPS12 764352 sc-eQTL 3.76e-01 -0.0551 0.0621 0.16 CD8_CTL L2
ENSG00000118515 SGK1 -739191 sc-eQTL 6.81e-03 0.282 0.103 0.16 CD8_CTL L2
ENSG00000146409 SLC18B1 765582 sc-eQTL 9.72e-01 -0.00425 0.121 0.16 CD8_CTL L2
ENSG00000028839 TBPL1 -373249 sc-eQTL 7.32e-01 0.0398 0.116 0.16 CD8_Naive L2
ENSG00000112303 VNN2 815462 sc-eQTL 8.25e-01 0.0237 0.107 0.16 CD8_Naive L2
ENSG00000112306 RPS12 764352 sc-eQTL 2.64e-01 0.0682 0.061 0.16 CD8_Naive L2
ENSG00000118515 SGK1 -739191 sc-eQTL 5.77e-01 -0.0429 0.0767 0.16 CD8_Naive L2
ENSG00000146409 SLC18B1 765582 sc-eQTL 8.70e-01 0.0201 0.123 0.16 CD8_Naive L2
ENSG00000028839 TBPL1 -373249 sc-eQTL 1.44e-01 -0.19 0.129 0.164 CD8_TCM L2
ENSG00000112303 VNN2 815462 sc-eQTL 6.61e-01 -0.0524 0.119 0.164 CD8_TCM L2
ENSG00000112306 RPS12 764352 sc-eQTL 6.34e-01 -0.0277 0.0581 0.164 CD8_TCM L2
ENSG00000118515 SGK1 -739191 sc-eQTL 5.39e-01 -0.0593 0.0962 0.164 CD8_TCM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 765582 sc-eQTL 6.88e-02 0.231 0.126 0.164 CD8_TCM L2
ENSG00000028839 TBPL1 -373249 sc-eQTL 3.31e-01 -0.121 0.124 0.162 CD8_TEM L2
ENSG00000112303 VNN2 815462 sc-eQTL 9.59e-02 0.225 0.134 0.162 CD8_TEM L2
ENSG00000112306 RPS12 764352 sc-eQTL 9.62e-01 -0.00349 0.0727 0.162 CD8_TEM L2
ENSG00000118515 SGK1 -739191 sc-eQTL 8.11e-01 -0.0285 0.119 0.162 CD8_TEM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 765582 sc-eQTL 5.46e-01 0.0831 0.137 0.162 CD8_TEM L2
ENSG00000028839 TBPL1 -373249 sc-eQTL 1.46e-02 0.301 0.122 0.16 MAIT L2
ENSG00000112303 VNN2 815462 sc-eQTL 8.12e-02 0.208 0.119 0.16 MAIT L2
ENSG00000112306 RPS12 764352 sc-eQTL 4.67e-01 0.0428 0.0588 0.16 MAIT L2
ENSG00000118515 SGK1 -739191 sc-eQTL 4.89e-03 0.231 0.0813 0.16 MAIT L2
ENSG00000146409 SLC18B1 765582 sc-eQTL 1.37e-01 0.183 0.123 0.16 MAIT L2
ENSG00000028839 TBPL1 -373249 sc-eQTL 3.51e-01 -0.124 0.132 0.158 NK_CD56bright L2
ENSG00000112303 VNN2 815462 sc-eQTL 8.13e-01 -0.0295 0.125 0.158 NK_CD56bright L2
ENSG00000112306 RPS12 764352 sc-eQTL 5.85e-01 -0.038 0.0694 0.158 NK_CD56bright L2
ENSG00000118515 SGK1 -739191 sc-eQTL 1.66e-03 0.323 0.101 0.158 NK_CD56bright L2
ENSG00000028839 TBPL1 -373249 sc-eQTL 5.71e-01 -0.0602 0.106 0.162 NK_CD56dim L2
ENSG00000112303 VNN2 815462 sc-eQTL 4.24e-02 -0.246 0.12 0.162 NK_CD56dim L2
ENSG00000112306 RPS12 764352 sc-eQTL 7.63e-01 0.0146 0.0482 0.162 NK_CD56dim L2
ENSG00000118515 SGK1 -739191 sc-eQTL 5.50e-01 0.0639 0.107 0.162 NK_CD56dim L2
ENSG00000028839 TBPL1 -373249 sc-eQTL 7.12e-01 -0.0503 0.136 0.16 NK_HLA L2
ENSG00000112303 VNN2 815462 sc-eQTL 9.25e-01 -0.0118 0.125 0.16 NK_HLA L2
ENSG00000112306 RPS12 764352 sc-eQTL 9.64e-01 -0.00267 0.0583 0.16 NK_HLA L2
ENSG00000118515 SGK1 -739191 sc-eQTL 7.49e-01 0.037 0.115 0.16 NK_HLA L2
ENSG00000028839 TBPL1 -373249 sc-eQTL 6.09e-01 -0.0573 0.112 0.162 NK_cytokine L2
ENSG00000112303 VNN2 815462 sc-eQTL 3.08e-01 -0.124 0.122 0.162 NK_cytokine L2
ENSG00000112306 RPS12 764352 sc-eQTL 9.12e-01 0.00734 0.0661 0.162 NK_cytokine L2
ENSG00000118515 SGK1 -739191 sc-eQTL 8.84e-01 -0.0161 0.11 0.162 NK_cytokine L2
ENSG00000028839 TBPL1 -373249 sc-eQTL 1.79e-01 0.208 0.154 0.17 PB L2
ENSG00000112303 VNN2 815462 sc-eQTL 7.81e-01 -0.0376 0.135 0.17 PB L2
ENSG00000112306 RPS12 764352 sc-eQTL 6.61e-01 0.0336 0.0765 0.17 PB L2
ENSG00000118515 SGK1 -739191 sc-eQTL 3.08e-01 0.126 0.123 0.17 PB L2
ENSG00000146409 SLC18B1 765582 sc-eQTL 4.73e-01 -0.103 0.143 0.17 PB L2
ENSG00000028839 TBPL1 -373249 sc-eQTL 7.09e-01 0.0473 0.127 0.159 Pro_T L2
ENSG00000112303 VNN2 815462 sc-eQTL 9.33e-02 -0.203 0.121 0.159 Pro_T L2
ENSG00000112306 RPS12 764352 sc-eQTL 9.00e-01 0.00578 0.0459 0.159 Pro_T L2
ENSG00000118515 SGK1 -739191 sc-eQTL 9.79e-01 -0.00239 0.0921 0.159 Pro_T L2
ENSG00000146409 SLC18B1 765582 sc-eQTL 7.67e-01 -0.0352 0.119 0.159 Pro_T L2
ENSG00000028839 TBPL1 -373249 sc-eQTL 3.84e-01 0.11 0.126 0.16 Treg L2
ENSG00000112303 VNN2 815462 sc-eQTL 1.99e-01 -0.128 0.0995 0.16 Treg L2
ENSG00000112306 RPS12 764352 sc-eQTL 6.15e-01 0.0223 0.0442 0.16 Treg L2
ENSG00000118515 SGK1 -739191 sc-eQTL 9.08e-01 -0.0108 0.0931 0.16 Treg L2
ENSG00000146409 SLC18B1 765582 sc-eQTL 9.23e-01 0.012 0.125 0.16 Treg L2
ENSG00000028839 TBPL1 -373249 sc-eQTL 6.53e-01 0.0594 0.132 0.161 cDC L2
ENSG00000093134 VNN3 844156 sc-eQTL 5.66e-01 0.059 0.103 0.161 cDC L2
ENSG00000112299 VNN1 864866 sc-eQTL 5.96e-01 -0.0641 0.121 0.161 cDC L2
ENSG00000112303 VNN2 815462 sc-eQTL 7.21e-01 -0.0422 0.118 0.161 cDC L2
ENSG00000112306 RPS12 764352 sc-eQTL 8.19e-01 -0.0133 0.0582 0.161 cDC L2
ENSG00000118515 SGK1 -739191 sc-eQTL 5.60e-01 0.0572 0.0979 0.161 cDC L2
ENSG00000146409 SLC18B1 765582 sc-eQTL 4.23e-01 0.0923 0.115 0.161 cDC L2
ENSG00000286438 AL591115.1 475793 sc-eQTL 9.98e-01 0.000268 0.0921 0.161 cDC L2
ENSG00000286887 AL355881.1 -717380 sc-eQTL 3.91e-01 0.0973 0.113 0.161 cDC L2
ENSG00000028839 TBPL1 -373249 sc-eQTL 1.92e-01 0.135 0.103 0.16 cMono_IL1B L2
ENSG00000093134 VNN3 844156 sc-eQTL 6.81e-01 0.0458 0.111 0.16 cMono_IL1B L2
ENSG00000112299 VNN1 864866 sc-eQTL 6.69e-01 -0.0481 0.112 0.16 cMono_IL1B L2
ENSG00000112303 VNN2 815462 sc-eQTL 2.28e-01 0.108 0.0895 0.16 cMono_IL1B L2
ENSG00000112306 RPS12 764352 sc-eQTL 8.96e-01 0.0065 0.0499 0.16 cMono_IL1B L2
ENSG00000118515 SGK1 -739191 sc-eQTL 3.29e-01 0.0726 0.0742 0.16 cMono_IL1B L2
ENSG00000146409 SLC18B1 765582 sc-eQTL 1.12e-01 -0.153 0.0956 0.16 cMono_IL1B L2
ENSG00000286887 AL355881.1 -717380 sc-eQTL 2.58e-01 0.113 0.0998 0.16 cMono_IL1B L2
ENSG00000028839 TBPL1 -373249 sc-eQTL 5.53e-01 -0.07 0.118 0.16 cMono_S100A L2
ENSG00000093134 VNN3 844156 sc-eQTL 6.41e-01 -0.0497 0.106 0.16 cMono_S100A L2
ENSG00000112299 VNN1 864866 sc-eQTL 5.09e-01 -0.0763 0.115 0.16 cMono_S100A L2
ENSG00000112303 VNN2 815462 sc-eQTL 7.69e-01 0.0222 0.0756 0.16 cMono_S100A L2
ENSG00000112306 RPS12 764352 sc-eQTL 7.31e-01 -0.0187 0.0544 0.16 cMono_S100A L2
ENSG00000118515 SGK1 -739191 sc-eQTL 3.81e-01 0.0545 0.0621 0.16 cMono_S100A L2
ENSG00000146409 SLC18B1 765582 sc-eQTL 3.41e-01 -0.096 0.101 0.16 cMono_S100A L2
ENSG00000286887 AL355881.1 -717380 sc-eQTL 3.00e-01 0.102 0.0983 0.16 cMono_S100A L2
ENSG00000028839 TBPL1 -373249 sc-eQTL 7.26e-02 -0.299 0.165 0.161 gdT L2
ENSG00000112303 VNN2 815462 sc-eQTL 4.11e-03 0.451 0.155 0.161 gdT L2
ENSG00000112306 RPS12 764352 sc-eQTL 9.86e-01 0.00105 0.0606 0.161 gdT L2
ENSG00000118515 SGK1 -739191 sc-eQTL 4.86e-01 -0.0798 0.114 0.161 gdT L2
ENSG00000146409 SLC18B1 765582 sc-eQTL 8.64e-01 -0.0269 0.157 0.161 gdT L2
ENSG00000028839 TBPL1 -373249 sc-eQTL 2.85e-01 0.129 0.12 0.164 intMono L2
ENSG00000093134 VNN3 844156 sc-eQTL 8.60e-01 0.0205 0.116 0.164 intMono L2
ENSG00000112299 VNN1 864866 sc-eQTL 7.70e-01 0.0337 0.115 0.164 intMono L2
ENSG00000112303 VNN2 815462 sc-eQTL 2.36e-01 -0.138 0.116 0.164 intMono L2
ENSG00000112306 RPS12 764352 sc-eQTL 2.74e-01 0.0556 0.0507 0.164 intMono L2
ENSG00000118515 SGK1 -739191 sc-eQTL 4.81e-01 0.0601 0.0853 0.164 intMono L2
ENSG00000146409 SLC18B1 765582 sc-eQTL 3.98e-01 0.105 0.124 0.164 intMono L2
ENSG00000286887 AL355881.1 -717380 sc-eQTL 9.42e-01 -0.00855 0.118 0.164 intMono L2
ENSG00000028839 TBPL1 -373249 sc-eQTL 5.11e-01 -0.0835 0.127 0.161 ncMono L2
ENSG00000093134 VNN3 844156 sc-eQTL 5.53e-01 0.0721 0.121 0.161 ncMono L2
ENSG00000112299 VNN1 864866 sc-eQTL 9.90e-01 -0.00146 0.12 0.161 ncMono L2
ENSG00000112303 VNN2 815462 sc-eQTL 7.53e-01 0.0364 0.116 0.161 ncMono L2
ENSG00000112306 RPS12 764352 sc-eQTL 9.77e-01 -0.00165 0.058 0.161 ncMono L2
ENSG00000118515 SGK1 -739191 sc-eQTL 3.69e-01 0.0737 0.0819 0.161 ncMono L2
ENSG00000146409 SLC18B1 765582 sc-eQTL 1.08e-01 -0.164 0.102 0.161 ncMono L2
ENSG00000286887 AL355881.1 -717380 sc-eQTL 1.72e-01 0.148 0.108 0.161 ncMono L2
ENSG00000028839 TBPL1 -373249 sc-eQTL 9.85e-01 -0.00278 0.143 0.175 pDC L2
ENSG00000093134 VNN3 844156 sc-eQTL 3.53e-01 0.0891 0.0956 0.175 pDC L2
ENSG00000112299 VNN1 864866 sc-eQTL 1.37e-01 -0.145 0.0969 0.175 pDC L2
ENSG00000112303 VNN2 815462 sc-eQTL 6.75e-01 0.0488 0.116 0.175 pDC L2
ENSG00000112306 RPS12 764352 sc-eQTL 1.79e-01 0.107 0.0796 0.175 pDC L2
ENSG00000118515 SGK1 -739191 sc-eQTL 5.68e-01 0.0465 0.0812 0.175 pDC L2
ENSG00000146409 SLC18B1 765582 sc-eQTL 5.18e-01 -0.0766 0.118 0.175 pDC L2
ENSG00000286438 AL591115.1 475793 sc-eQTL 4.35e-01 0.0886 0.113 0.175 pDC L2
ENSG00000286887 AL355881.1 -717380 sc-eQTL 9.61e-02 -0.167 0.0996 0.175 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000028839 TBPL1 -373249 sc-eQTL 8.00e-01 0.0319 0.126 0.16 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 815462 sc-eQTL 4.03e-01 0.0915 0.109 0.16 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 764352 sc-eQTL 9.29e-01 0.00553 0.0623 0.16 B_Memory LOneK1K
ENSG00000118515 SGK1 -739191 sc-eQTL 5.76e-03 0.267 0.0957 0.16 B_Memory LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 765582 sc-eQTL 6.46e-01 0.0527 0.114 0.16 B_Memory LOneK1K
ENSG00000028839 TBPL1 -373249 sc-eQTL 1.31e-02 0.291 0.116 0.16 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 815462 sc-eQTL 6.45e-01 -0.0475 0.103 0.16 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 764352 sc-eQTL 5.84e-01 -0.0342 0.0623 0.16 B_Naive LOneK1K
ENSG00000118515 SGK1 -739191 sc-eQTL 8.38e-01 0.0198 0.0966 0.16 B_Naive LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 765582 sc-eQTL 3.62e-01 0.107 0.117 0.16 B_Naive LOneK1K
ENSG00000028839 TBPL1 -373249 sc-eQTL 5.64e-01 0.0545 0.0945 0.16 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000093134 VNN3 844156 sc-eQTL 7.98e-01 0.0275 0.107 0.16 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112299 VNN1 864866 sc-eQTL 4.96e-01 -0.0762 0.112 0.16 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 815462 sc-eQTL 3.85e-01 0.0642 0.0738 0.16 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 764352 sc-eQTL 8.21e-01 0.0114 0.0507 0.16 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000118515 SGK1 -739191 sc-eQTL 2.89e-01 0.0732 0.0689 0.16 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 765582 sc-eQTL 8.37e-02 -0.156 0.0895 0.16 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000286887 AL355881.1 -717380 sc-eQTL 2.16e-01 0.117 0.0942 0.16 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000028839 TBPL1 -373249 sc-eQTL 8.29e-01 0.0262 0.121 0.162 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000093134 VNN3 844156 sc-eQTL 5.51e-01 0.0703 0.118 0.162 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112299 VNN1 864866 sc-eQTL 9.89e-01 0.00165 0.117 0.162 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 815462 sc-eQTL 7.24e-01 -0.0388 0.11 0.162 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 764352 sc-eQTL 9.93e-01 0.000398 0.0467 0.162 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000118515 SGK1 -739191 sc-eQTL 6.77e-01 0.0294 0.0707 0.162 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 765582 sc-eQTL 8.01e-01 -0.0286 0.113 0.162 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000286887 AL355881.1 -717380 sc-eQTL 6.87e-01 0.0414 0.103 0.162 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000028839 TBPL1 -373249 sc-eQTL 3.80e-01 -0.0858 0.0975 0.162 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 815462 sc-eQTL 5.70e-02 -0.22 0.115 0.162 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 764352 sc-eQTL 8.93e-01 -0.00638 0.0474 0.162 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000118515 SGK1 -739191 sc-eQTL 6.67e-01 0.0422 0.0979 0.162 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000112299 VNN1 864866 pQTL 0.0111 -0.115 0.0454 0.0 0.0 0.172
ENSG00000112299 VNN1 864866 eQTL 0.0431 -0.0551 0.0272 0.0 0.0 0.18
ENSG00000146409 SLC18B1 765582 eQTL 0.0392 0.0576 0.0279 0.0 0.0 0.18

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina