logo

Genes within 1Mb (chr6:133571254:GAA:G):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000028839 TBPL1 -380916 sc-eQTL 8.73e-01 -0.0264 0.166 0.068 B L1
ENSG00000112303 VNN2 807795 sc-eQTL 1.85e-01 0.164 0.123 0.068 B L1
ENSG00000112306 RPS12 756685 sc-eQTL 6.37e-01 -0.0355 0.0749 0.068 B L1
ENSG00000118515 SGK1 -746858 sc-eQTL 6.69e-01 -0.0494 0.116 0.068 B L1
ENSG00000146409 SLC18B1 757915 sc-eQTL 2.25e-01 0.191 0.157 0.068 B L1
ENSG00000028839 TBPL1 -380916 sc-eQTL 3.44e-01 0.118 0.124 0.068 CD4T L1
ENSG00000112303 VNN2 807795 sc-eQTL 7.78e-01 0.0317 0.112 0.068 CD4T L1
ENSG00000112306 RPS12 756685 sc-eQTL 7.53e-01 -0.024 0.0763 0.068 CD4T L1
ENSG00000118515 SGK1 -746858 sc-eQTL 7.15e-01 -0.0375 0.103 0.068 CD4T L1
ENSG00000146409 SLC18B1 757915 sc-eQTL 3.00e-01 0.16 0.154 0.068 CD4T L1
ENSG00000028839 TBPL1 -380916 sc-eQTL 6.94e-02 -0.221 0.121 0.068 CD8T L1
ENSG00000112303 VNN2 807795 sc-eQTL 6.33e-02 0.275 0.147 0.068 CD8T L1
ENSG00000112306 RPS12 756685 sc-eQTL 2.11e-01 0.0633 0.0505 0.068 CD8T L1
ENSG00000118515 SGK1 -746858 sc-eQTL 6.61e-01 -0.0343 0.0781 0.068 CD8T L1
ENSG00000146409 SLC18B1 757915 sc-eQTL 4.49e-01 -0.116 0.153 0.068 CD8T L1
ENSG00000028839 TBPL1 -380916 sc-eQTL 7.43e-01 -0.0641 0.195 0.068 DC L1
ENSG00000093134 VNN3 836489 sc-eQTL 7.73e-01 -0.0434 0.15 0.068 DC L1
ENSG00000112299 VNN1 857199 sc-eQTL 4.40e-03 -0.458 0.159 0.068 DC L1
ENSG00000112303 VNN2 807795 sc-eQTL 3.90e-02 -0.357 0.172 0.068 DC L1
ENSG00000112306 RPS12 756685 sc-eQTL 1.21e-01 0.151 0.0967 0.068 DC L1
ENSG00000118515 SGK1 -746858 sc-eQTL 5.44e-01 -0.0686 0.113 0.068 DC L1
ENSG00000146409 SLC18B1 757915 sc-eQTL 5.09e-01 0.102 0.154 0.068 DC L1
ENSG00000286438 AL591115.1 468126 sc-eQTL 4.01e-01 -0.118 0.14 0.068 DC L1
ENSG00000286887 AL355881.1 -725047 sc-eQTL 9.33e-01 -0.0148 0.175 0.068 DC L1
ENSG00000028839 TBPL1 -380916 sc-eQTL 1.95e-01 -0.171 0.131 0.068 Mono L1
ENSG00000093134 VNN3 836489 sc-eQTL 7.15e-01 -0.0554 0.151 0.068 Mono L1
ENSG00000112299 VNN1 857199 sc-eQTL 6.27e-01 -0.0792 0.163 0.068 Mono L1
ENSG00000112303 VNN2 807795 sc-eQTL 3.36e-02 0.243 0.114 0.068 Mono L1
ENSG00000112306 RPS12 756685 sc-eQTL 9.83e-01 -0.00148 0.0689 0.068 Mono L1
ENSG00000118515 SGK1 -746858 sc-eQTL 3.30e-01 -0.0948 0.0971 0.068 Mono L1
ENSG00000146409 SLC18B1 757915 sc-eQTL 9.06e-01 0.0161 0.136 0.068 Mono L1
ENSG00000286887 AL355881.1 -725047 sc-eQTL 3.46e-01 -0.126 0.134 0.068 Mono L1
ENSG00000028839 TBPL1 -380916 sc-eQTL 1.03e-01 -0.233 0.142 0.067 NK L1
ENSG00000112303 VNN2 807795 sc-eQTL 7.86e-02 -0.289 0.163 0.067 NK L1
ENSG00000112306 RPS12 756685 sc-eQTL 2.06e-01 -0.0862 0.0679 0.067 NK L1
ENSG00000118515 SGK1 -746858 sc-eQTL 2.83e-01 -0.135 0.126 0.067 NK L1
ENSG00000028839 TBPL1 -380916 sc-eQTL 1.71e-03 -0.514 0.162 0.068 Other_T L1
ENSG00000112303 VNN2 807795 sc-eQTL 4.74e-01 0.113 0.157 0.068 Other_T L1
ENSG00000112306 RPS12 756685 sc-eQTL 5.97e-01 -0.0331 0.0624 0.068 Other_T L1
ENSG00000118515 SGK1 -746858 sc-eQTL 1.82e-01 -0.153 0.114 0.068 Other_T L1
ENSG00000146409 SLC18B1 757915 sc-eQTL 2.52e-01 0.196 0.17 0.068 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000028839 TBPL1 -380916 sc-eQTL 3.70e-01 0.174 0.193 0.069 B_Activated L2
ENSG00000112303 VNN2 807795 sc-eQTL 7.07e-01 -0.0665 0.177 0.069 B_Activated L2
ENSG00000112306 RPS12 756685 sc-eQTL 1.65e-01 0.131 0.0942 0.069 B_Activated L2
ENSG00000118515 SGK1 -746858 sc-eQTL 2.84e-01 -0.181 0.168 0.069 B_Activated L2
ENSG00000146409 SLC18B1 757915 sc-eQTL 3.91e-01 0.142 0.166 0.069 B_Activated L2
ENSG00000028839 TBPL1 -380916 sc-eQTL 7.10e-01 -0.0685 0.184 0.069 B_Intermediate L2
ENSG00000112303 VNN2 807795 sc-eQTL 6.79e-03 0.427 0.156 0.069 B_Intermediate L2
ENSG00000112306 RPS12 756685 sc-eQTL 5.60e-01 0.0567 0.0972 0.069 B_Intermediate L2
ENSG00000118515 SGK1 -746858 sc-eQTL 7.94e-01 -0.044 0.168 0.069 B_Intermediate L2
ENSG00000146409 SLC18B1 757915 sc-eQTL 4.42e-01 0.135 0.175 0.069 B_Intermediate L2
ENSG00000028839 TBPL1 -380916 sc-eQTL 6.21e-01 -0.0862 0.174 0.069 B_Memory L2
ENSG00000112303 VNN2 807795 sc-eQTL 2.35e-01 0.196 0.164 0.069 B_Memory L2
ENSG00000112306 RPS12 756685 sc-eQTL 9.47e-01 0.00524 0.0795 0.069 B_Memory L2
ENSG00000118515 SGK1 -746858 sc-eQTL 5.08e-01 -0.0965 0.146 0.069 B_Memory L2
ENSG00000146409 SLC18B1 757915 sc-eQTL 7.97e-01 0.0427 0.166 0.069 B_Memory L2
ENSG00000028839 TBPL1 -380916 sc-eQTL 7.03e-01 0.0631 0.165 0.068 B_Naive1 L2
ENSG00000112303 VNN2 807795 sc-eQTL 9.49e-01 0.00987 0.154 0.068 B_Naive1 L2
ENSG00000112306 RPS12 756685 sc-eQTL 2.22e-01 -0.107 0.0875 0.068 B_Naive1 L2
ENSG00000118515 SGK1 -746858 sc-eQTL 3.01e-01 -0.142 0.137 0.068 B_Naive1 L2
ENSG00000146409 SLC18B1 757915 sc-eQTL 7.78e-01 0.0477 0.169 0.068 B_Naive1 L2
ENSG00000028839 TBPL1 -380916 sc-eQTL 4.01e-01 -0.147 0.175 0.069 B_Naive2 L2
ENSG00000112303 VNN2 807795 sc-eQTL 8.43e-01 0.0338 0.171 0.069 B_Naive2 L2
ENSG00000112306 RPS12 756685 sc-eQTL 1.19e-01 -0.141 0.09 0.069 B_Naive2 L2
ENSG00000118515 SGK1 -746858 sc-eQTL 4.76e-01 -0.114 0.16 0.069 B_Naive2 L2
ENSG00000146409 SLC18B1 757915 sc-eQTL 2.19e-01 0.212 0.172 0.069 B_Naive2 L2
ENSG00000028839 TBPL1 -380916 sc-eQTL 6.76e-01 -0.0718 0.172 0.07 CD4_CTL L2
ENSG00000112303 VNN2 807795 sc-eQTL 2.75e-01 0.188 0.171 0.07 CD4_CTL L2
ENSG00000112306 RPS12 756685 sc-eQTL 6.93e-01 -0.0314 0.0794 0.07 CD4_CTL L2
ENSG00000118515 SGK1 -746858 sc-eQTL 5.51e-01 0.0823 0.138 0.07 CD4_CTL L2
ENSG00000146409 SLC18B1 757915 sc-eQTL 7.85e-01 0.0438 0.16 0.07 CD4_CTL L2
ENSG00000028839 TBPL1 -380916 sc-eQTL 1.17e-01 0.223 0.142 0.068 CD4_Naive L2
ENSG00000112303 VNN2 807795 sc-eQTL 5.32e-01 -0.0809 0.129 0.068 CD4_Naive L2
ENSG00000112306 RPS12 756685 sc-eQTL 6.19e-01 -0.0418 0.0839 0.068 CD4_Naive L2
ENSG00000118515 SGK1 -746858 sc-eQTL 5.38e-01 -0.0633 0.103 0.068 CD4_Naive L2
ENSG00000146409 SLC18B1 757915 sc-eQTL 3.69e-01 0.145 0.161 0.068 CD4_Naive L2
ENSG00000028839 TBPL1 -380916 sc-eQTL 1.89e-01 0.202 0.153 0.068 CD4_TCM L2
ENSG00000112303 VNN2 807795 sc-eQTL 7.67e-01 -0.0452 0.153 0.068 CD4_TCM L2
ENSG00000112306 RPS12 756685 sc-eQTL 6.56e-01 0.0353 0.0791 0.068 CD4_TCM L2
ENSG00000118515 SGK1 -746858 sc-eQTL 8.35e-01 -0.0231 0.111 0.068 CD4_TCM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 757915 sc-eQTL 2.88e-01 0.195 0.183 0.068 CD4_TCM L2
ENSG00000028839 TBPL1 -380916 sc-eQTL 7.96e-01 0.0455 0.176 0.068 CD4_TEM L2
ENSG00000112303 VNN2 807795 sc-eQTL 5.40e-01 0.104 0.168 0.068 CD4_TEM L2
ENSG00000112306 RPS12 756685 sc-eQTL 7.28e-01 -0.0241 0.0691 0.068 CD4_TEM L2
ENSG00000118515 SGK1 -746858 sc-eQTL 6.83e-01 -0.0486 0.119 0.068 CD4_TEM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 757915 sc-eQTL 7.03e-01 -0.0657 0.172 0.068 CD4_TEM L2
ENSG00000028839 TBPL1 -380916 sc-eQTL 6.85e-01 -0.0645 0.159 0.068 CD8_CTL L2
ENSG00000112303 VNN2 807795 sc-eQTL 2.93e-01 0.178 0.168 0.068 CD8_CTL L2
ENSG00000112306 RPS12 756685 sc-eQTL 8.09e-01 0.0218 0.0904 0.068 CD8_CTL L2
ENSG00000118515 SGK1 -746858 sc-eQTL 1.26e-02 -0.379 0.15 0.068 CD8_CTL L2
ENSG00000146409 SLC18B1 757915 sc-eQTL 8.66e-02 -0.299 0.174 0.068 CD8_CTL L2
ENSG00000028839 TBPL1 -380916 sc-eQTL 2.44e-01 -0.192 0.165 0.068 CD8_Naive L2
ENSG00000112303 VNN2 807795 sc-eQTL 1.95e-02 0.353 0.15 0.068 CD8_Naive L2
ENSG00000112306 RPS12 756685 sc-eQTL 7.85e-01 0.0238 0.087 0.068 CD8_Naive L2
ENSG00000118515 SGK1 -746858 sc-eQTL 8.80e-01 -0.0165 0.109 0.068 CD8_Naive L2
ENSG00000146409 SLC18B1 757915 sc-eQTL 3.35e-02 0.37 0.173 0.068 CD8_Naive L2
ENSG00000028839 TBPL1 -380916 sc-eQTL 3.25e-01 0.181 0.183 0.072 CD8_TCM L2
ENSG00000112303 VNN2 807795 sc-eQTL 2.76e-01 -0.184 0.168 0.072 CD8_TCM L2
ENSG00000112306 RPS12 756685 sc-eQTL 7.16e-01 -0.03 0.0822 0.072 CD8_TCM L2
ENSG00000118515 SGK1 -746858 sc-eQTL 9.59e-01 0.00696 0.136 0.072 CD8_TCM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 757915 sc-eQTL 7.05e-01 -0.0683 0.18 0.072 CD8_TCM L2
ENSG00000028839 TBPL1 -380916 sc-eQTL 4.38e-01 -0.129 0.166 0.066 CD8_TEM L2
ENSG00000112303 VNN2 807795 sc-eQTL 2.69e-01 -0.199 0.18 0.066 CD8_TEM L2
ENSG00000112306 RPS12 756685 sc-eQTL 3.03e-01 -0.1 0.0969 0.066 CD8_TEM L2
ENSG00000118515 SGK1 -746858 sc-eQTL 3.20e-01 -0.158 0.159 0.066 CD8_TEM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 757915 sc-eQTL 3.88e-01 0.159 0.183 0.066 CD8_TEM L2
ENSG00000028839 TBPL1 -380916 sc-eQTL 3.24e-01 -0.173 0.175 0.067 MAIT L2
ENSG00000112303 VNN2 807795 sc-eQTL 9.78e-01 -0.00464 0.169 0.067 MAIT L2
ENSG00000112306 RPS12 756685 sc-eQTL 7.18e-01 -0.0301 0.0832 0.067 MAIT L2
ENSG00000118515 SGK1 -746858 sc-eQTL 5.51e-01 -0.0698 0.117 0.067 MAIT L2
ENSG00000146409 SLC18B1 757915 sc-eQTL 6.78e-01 0.0726 0.174 0.067 MAIT L2
ENSG00000028839 TBPL1 -380916 sc-eQTL 2.28e-01 0.226 0.187 0.069 NK_CD56bright L2
ENSG00000112303 VNN2 807795 sc-eQTL 3.69e-01 -0.159 0.177 0.069 NK_CD56bright L2
ENSG00000112306 RPS12 756685 sc-eQTL 8.30e-01 -0.0212 0.0985 0.069 NK_CD56bright L2
ENSG00000118515 SGK1 -746858 sc-eQTL 6.41e-01 -0.0688 0.147 0.069 NK_CD56bright L2
ENSG00000028839 TBPL1 -380916 sc-eQTL 5.47e-01 -0.0925 0.153 0.067 NK_CD56dim L2
ENSG00000112303 VNN2 807795 sc-eQTL 1.16e-01 -0.276 0.175 0.067 NK_CD56dim L2
ENSG00000112306 RPS12 756685 sc-eQTL 6.17e-01 -0.0349 0.0697 0.067 NK_CD56dim L2
ENSG00000118515 SGK1 -746858 sc-eQTL 5.21e-01 -0.0992 0.154 0.067 NK_CD56dim L2
ENSG00000028839 TBPL1 -380916 sc-eQTL 1.06e-01 -0.318 0.195 0.071 NK_HLA L2
ENSG00000112303 VNN2 807795 sc-eQTL 7.83e-01 0.0501 0.181 0.071 NK_HLA L2
ENSG00000112306 RPS12 756685 sc-eQTL 3.80e-01 -0.0741 0.0842 0.071 NK_HLA L2
ENSG00000118515 SGK1 -746858 sc-eQTL 3.17e-01 -0.167 0.166 0.071 NK_HLA L2
ENSG00000028839 TBPL1 -380916 sc-eQTL 7.52e-02 -0.279 0.156 0.067 NK_cytokine L2
ENSG00000112303 VNN2 807795 sc-eQTL 9.31e-02 -0.286 0.17 0.067 NK_cytokine L2
ENSG00000112306 RPS12 756685 sc-eQTL 8.99e-02 -0.157 0.0921 0.067 NK_cytokine L2
ENSG00000118515 SGK1 -746858 sc-eQTL 3.33e-01 -0.149 0.154 0.067 NK_cytokine L2
ENSG00000028839 TBPL1 -380916 sc-eQTL 5.24e-01 -0.144 0.225 0.059 PB L2
ENSG00000112303 VNN2 807795 sc-eQTL 9.54e-01 -0.0113 0.196 0.059 PB L2
ENSG00000112306 RPS12 756685 sc-eQTL 9.85e-01 -0.00205 0.111 0.059 PB L2
ENSG00000118515 SGK1 -746858 sc-eQTL 1.09e-01 0.288 0.178 0.059 PB L2
ENSG00000146409 SLC18B1 757915 sc-eQTL 9.59e-01 0.0109 0.209 0.059 PB L2
ENSG00000028839 TBPL1 -380916 sc-eQTL 4.11e-01 -0.146 0.177 0.07 Pro_T L2
ENSG00000112303 VNN2 807795 sc-eQTL 9.91e-01 0.00201 0.17 0.07 Pro_T L2
ENSG00000112306 RPS12 756685 sc-eQTL 6.81e-01 0.0264 0.0642 0.07 Pro_T L2
ENSG00000118515 SGK1 -746858 sc-eQTL 8.74e-02 -0.219 0.128 0.07 Pro_T L2
ENSG00000146409 SLC18B1 757915 sc-eQTL 1.22e-01 0.256 0.165 0.07 Pro_T L2
ENSG00000028839 TBPL1 -380916 sc-eQTL 5.52e-01 -0.107 0.18 0.068 Treg L2
ENSG00000112303 VNN2 807795 sc-eQTL 2.05e-01 0.181 0.142 0.068 Treg L2
ENSG00000112306 RPS12 756685 sc-eQTL 7.98e-01 -0.0162 0.0631 0.068 Treg L2
ENSG00000118515 SGK1 -746858 sc-eQTL 7.46e-03 -0.353 0.131 0.068 Treg L2
ENSG00000146409 SLC18B1 757915 sc-eQTL 7.36e-02 0.318 0.177 0.068 Treg L2
ENSG00000028839 TBPL1 -380916 sc-eQTL 6.23e-01 0.0974 0.198 0.063 cDC L2
ENSG00000093134 VNN3 836489 sc-eQTL 8.56e-01 -0.028 0.154 0.063 cDC L2
ENSG00000112299 VNN1 857199 sc-eQTL 4.52e-03 -0.51 0.177 0.063 cDC L2
ENSG00000112303 VNN2 807795 sc-eQTL 7.06e-02 -0.318 0.175 0.063 cDC L2
ENSG00000112306 RPS12 756685 sc-eQTL 8.72e-02 0.149 0.0865 0.063 cDC L2
ENSG00000118515 SGK1 -746858 sc-eQTL 2.63e-01 -0.164 0.146 0.063 cDC L2
ENSG00000146409 SLC18B1 757915 sc-eQTL 9.79e-01 0.00464 0.173 0.063 cDC L2
ENSG00000286438 AL591115.1 468126 sc-eQTL 3.23e-01 -0.137 0.138 0.063 cDC L2
ENSG00000286887 AL355881.1 -725047 sc-eQTL 3.14e-01 -0.171 0.169 0.063 cDC L2
ENSG00000028839 TBPL1 -380916 sc-eQTL 6.39e-01 -0.0706 0.15 0.068 cMono_IL1B L2
ENSG00000093134 VNN3 836489 sc-eQTL 4.03e-01 -0.135 0.161 0.068 cMono_IL1B L2
ENSG00000112299 VNN1 857199 sc-eQTL 9.99e-01 0.000227 0.163 0.068 cMono_IL1B L2
ENSG00000112303 VNN2 807795 sc-eQTL 5.74e-02 0.247 0.129 0.068 cMono_IL1B L2
ENSG00000112306 RPS12 756685 sc-eQTL 8.42e-01 0.0144 0.0723 0.068 cMono_IL1B L2
ENSG00000118515 SGK1 -746858 sc-eQTL 2.33e-01 -0.129 0.107 0.068 cMono_IL1B L2
ENSG00000146409 SLC18B1 757915 sc-eQTL 8.06e-01 0.0343 0.139 0.068 cMono_IL1B L2
ENSG00000286887 AL355881.1 -725047 sc-eQTL 2.93e-01 -0.153 0.145 0.068 cMono_IL1B L2
ENSG00000028839 TBPL1 -380916 sc-eQTL 1.03e-01 -0.274 0.167 0.068 cMono_S100A L2
ENSG00000093134 VNN3 836489 sc-eQTL 7.64e-01 0.0456 0.152 0.068 cMono_S100A L2
ENSG00000112299 VNN1 857199 sc-eQTL 4.08e-01 -0.136 0.165 0.068 cMono_S100A L2
ENSG00000112303 VNN2 807795 sc-eQTL 5.87e-02 0.204 0.107 0.068 cMono_S100A L2
ENSG00000112306 RPS12 756685 sc-eQTL 8.05e-01 0.0192 0.0778 0.068 cMono_S100A L2
ENSG00000118515 SGK1 -746858 sc-eQTL 6.22e-01 -0.0439 0.0889 0.068 cMono_S100A L2
ENSG00000146409 SLC18B1 757915 sc-eQTL 8.19e-01 0.033 0.144 0.068 cMono_S100A L2
ENSG00000286887 AL355881.1 -725047 sc-eQTL 5.38e-01 0.0869 0.141 0.068 cMono_S100A L2
ENSG00000028839 TBPL1 -380916 sc-eQTL 3.37e-02 -0.526 0.245 0.061 gdT L2
ENSG00000112303 VNN2 807795 sc-eQTL 5.64e-03 0.648 0.231 0.061 gdT L2
ENSG00000112306 RPS12 756685 sc-eQTL 7.53e-01 0.0284 0.0902 0.061 gdT L2
ENSG00000118515 SGK1 -746858 sc-eQTL 7.56e-01 0.0529 0.17 0.061 gdT L2
ENSG00000146409 SLC18B1 757915 sc-eQTL 8.49e-01 0.0446 0.233 0.061 gdT L2
ENSG00000028839 TBPL1 -380916 sc-eQTL 2.59e-01 -0.197 0.174 0.067 intMono L2
ENSG00000093134 VNN3 836489 sc-eQTL 4.12e-01 0.138 0.168 0.067 intMono L2
ENSG00000112299 VNN1 857199 sc-eQTL 9.37e-01 -0.0131 0.166 0.067 intMono L2
ENSG00000112303 VNN2 807795 sc-eQTL 8.67e-01 0.0283 0.169 0.067 intMono L2
ENSG00000112306 RPS12 756685 sc-eQTL 8.01e-01 -0.0186 0.0735 0.067 intMono L2
ENSG00000118515 SGK1 -746858 sc-eQTL 3.52e-01 -0.115 0.123 0.067 intMono L2
ENSG00000146409 SLC18B1 757915 sc-eQTL 9.89e-01 -0.0024 0.179 0.067 intMono L2
ENSG00000286887 AL355881.1 -725047 sc-eQTL 3.97e-02 -0.351 0.169 0.067 intMono L2
ENSG00000028839 TBPL1 -380916 sc-eQTL 3.05e-01 -0.186 0.181 0.066 ncMono L2
ENSG00000093134 VNN3 836489 sc-eQTL 9.15e-01 0.0185 0.173 0.066 ncMono L2
ENSG00000112299 VNN1 857199 sc-eQTL 1.39e-01 -0.254 0.171 0.066 ncMono L2
ENSG00000112303 VNN2 807795 sc-eQTL 5.89e-01 -0.0892 0.165 0.066 ncMono L2
ENSG00000112306 RPS12 756685 sc-eQTL 6.37e-02 -0.153 0.0821 0.066 ncMono L2
ENSG00000118515 SGK1 -746858 sc-eQTL 6.64e-01 0.051 0.117 0.066 ncMono L2
ENSG00000146409 SLC18B1 757915 sc-eQTL 9.32e-01 -0.0126 0.146 0.066 ncMono L2
ENSG00000286887 AL355881.1 -725047 sc-eQTL 2.63e-01 -0.173 0.154 0.066 ncMono L2
ENSG00000028839 TBPL1 -380916 sc-eQTL 2.47e-01 -0.254 0.218 0.059 pDC L2
ENSG00000093134 VNN3 836489 sc-eQTL 3.77e-01 -0.13 0.147 0.059 pDC L2
ENSG00000112299 VNN1 857199 sc-eQTL 8.12e-01 -0.0357 0.149 0.059 pDC L2
ENSG00000112303 VNN2 807795 sc-eQTL 6.27e-01 -0.0866 0.178 0.059 pDC L2
ENSG00000112306 RPS12 756685 sc-eQTL 4.25e-01 0.0978 0.122 0.059 pDC L2
ENSG00000118515 SGK1 -746858 sc-eQTL 3.49e-01 0.117 0.124 0.059 pDC L2
ENSG00000146409 SLC18B1 757915 sc-eQTL 3.52e-01 0.169 0.181 0.059 pDC L2
ENSG00000286438 AL591115.1 468126 sc-eQTL 8.89e-01 0.0242 0.174 0.059 pDC L2
ENSG00000286887 AL355881.1 -725047 sc-eQTL 1.65e-01 0.213 0.153 0.059 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000028839 TBPL1 -380916 sc-eQTL 6.40e-01 -0.0839 0.179 0.068 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 807795 sc-eQTL 1.35e-01 0.233 0.155 0.068 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 756685 sc-eQTL 7.43e-01 0.0292 0.089 0.068 B_Memory LOneK1K
ENSG00000118515 SGK1 -746858 sc-eQTL 1.68e-01 -0.192 0.139 0.068 B_Memory LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 757915 sc-eQTL 4.52e-01 0.123 0.163 0.068 B_Memory LOneK1K
ENSG00000028839 TBPL1 -380916 sc-eQTL 8.68e-01 -0.0275 0.165 0.068 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 807795 sc-eQTL 9.71e-01 0.00531 0.145 0.068 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 756685 sc-eQTL 1.84e-01 -0.116 0.0871 0.068 B_Naive LOneK1K
ENSG00000118515 SGK1 -746858 sc-eQTL 3.12e-01 -0.137 0.135 0.068 B_Naive LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 757915 sc-eQTL 5.37e-01 0.102 0.165 0.068 B_Naive LOneK1K
ENSG00000028839 TBPL1 -380916 sc-eQTL 1.93e-01 -0.178 0.137 0.068 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000093134 VNN3 836489 sc-eQTL 6.09e-01 -0.0796 0.155 0.068 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112299 VNN1 857199 sc-eQTL 7.51e-01 -0.0514 0.162 0.068 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 807795 sc-eQTL 4.54e-02 0.214 0.106 0.068 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 756685 sc-eQTL 8.62e-01 0.0128 0.0735 0.068 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000118515 SGK1 -746858 sc-eQTL 2.96e-01 -0.105 0.0999 0.068 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 757915 sc-eQTL 9.87e-01 -0.0021 0.131 0.068 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000286887 AL355881.1 -725047 sc-eQTL 6.18e-01 -0.0685 0.137 0.068 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000028839 TBPL1 -380916 sc-eQTL 3.84e-01 -0.154 0.177 0.067 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000093134 VNN3 836489 sc-eQTL 5.78e-01 0.0956 0.172 0.067 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112299 VNN1 857199 sc-eQTL 3.68e-01 -0.153 0.17 0.067 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 807795 sc-eQTL 5.92e-01 0.086 0.16 0.067 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 756685 sc-eQTL 6.97e-01 -0.0265 0.0681 0.067 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000118515 SGK1 -746858 sc-eQTL 2.38e-01 -0.122 0.103 0.067 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 757915 sc-eQTL 1.95e-01 0.214 0.165 0.067 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000286887 AL355881.1 -725047 sc-eQTL 5.09e-02 -0.291 0.148 0.067 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000028839 TBPL1 -380916 sc-eQTL 2.31e-02 -0.32 0.14 0.067 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 807795 sc-eQTL 1.13e-01 -0.266 0.167 0.067 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 756685 sc-eQTL 2.94e-01 -0.072 0.0685 0.067 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000118515 SGK1 -746858 sc-eQTL 3.06e-01 -0.145 0.141 0.067 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000220378 KRT8P42 -727441 eQTL 0.0134 -0.217 0.0877 0.00215 0.0 0.0304
ENSG00000234484 AL032821.1 818579 eQTL 0.0093 -0.23 0.0881 0.0 0.0 0.0304

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000220378 KRT8P42 -727441 1.4e-06 9.79e-07 3.08e-07 3.4e-07 1.08e-07 3.2e-07 1.32e-06 5.68e-08 5.3e-07 1.21e-07 1.35e-06 3.84e-07 2.62e-06 2.79e-07 4.31e-07 4.14e-07 1.35e-07 8.55e-07 2.13e-07 8.69e-08 3.91e-07 1.17e-06 3.09e-06 4.15e-08 1.95e-06 2.34e-07 2.23e-07 1.61e-07 1.75e-06 3.52e-07 6.63e-07 3.82e-08 3.21e-08 2.84e-07 3.69e-07 1.61e-07 1e-07 9.61e-08 6.76e-08 3.54e-08 4.27e-08 1.45e-05 2.92e-08 1.32e-08 5.43e-08 1.32e-08 8.81e-08 4.41e-09 4.85e-08
ENSG00000234484 AL032821.1 818579 1.34e-06 9.33e-07 2.62e-07 3.81e-07 1.05e-07 3.22e-07 1.25e-06 5.85e-08 4.3e-07 1.11e-07 1.33e-06 3.48e-07 2.53e-06 2.67e-07 4.53e-07 3.4e-07 9.3e-08 7.19e-07 1.77e-07 6.58e-08 3.07e-07 9.58e-07 2.69e-06 3.68e-08 1.86e-06 2.36e-07 1.85e-07 1.48e-07 1.63e-06 2.75e-07 6.14e-07 3.88e-08 3.59e-08 2.19e-07 3.44e-07 1.18e-07 7.86e-08 9.68e-08 6.57e-08 3.18e-08 4.18e-08 1.3e-05 1.7e-08 1.71e-08 5.59e-08 8.94e-09 1.11e-07 4.5e-09 4.85e-08