logo

Genes within 1Mb (chr6:133565546:A:G):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000028839 TBPL1 -386624 sc-eQTL 4.70e-01 0.101 0.14 0.09 B L1
ENSG00000112303 VNN2 802087 sc-eQTL 1.79e-01 0.141 0.105 0.09 B L1
ENSG00000112306 RPS12 750977 sc-eQTL 6.78e-01 0.0264 0.0635 0.09 B L1
ENSG00000118515 SGK1 -752566 sc-eQTL 9.41e-01 -0.00729 0.098 0.09 B L1
ENSG00000146409 SLC18B1 752207 sc-eQTL 3.67e-01 0.121 0.133 0.09 B L1
ENSG00000028839 TBPL1 -386624 sc-eQTL 6.06e-01 0.0542 0.105 0.09 CD4T L1
ENSG00000112303 VNN2 802087 sc-eQTL 2.92e-01 0.0995 0.0943 0.09 CD4T L1
ENSG00000112306 RPS12 750977 sc-eQTL 7.12e-01 0.0237 0.0642 0.09 CD4T L1
ENSG00000118515 SGK1 -752566 sc-eQTL 8.46e-01 -0.0168 0.0864 0.09 CD4T L1
ENSG00000146409 SLC18B1 752207 sc-eQTL 2.85e-01 0.139 0.13 0.09 CD4T L1
ENSG00000028839 TBPL1 -386624 sc-eQTL 8.15e-02 -0.179 0.102 0.09 CD8T L1
ENSG00000112303 VNN2 802087 sc-eQTL 7.68e-02 0.222 0.125 0.09 CD8T L1
ENSG00000112306 RPS12 750977 sc-eQTL 2.89e-01 0.0456 0.0428 0.09 CD8T L1
ENSG00000118515 SGK1 -752566 sc-eQTL 5.64e-01 -0.0383 0.0661 0.09 CD8T L1
ENSG00000146409 SLC18B1 752207 sc-eQTL 3.64e-01 -0.118 0.13 0.09 CD8T L1
ENSG00000028839 TBPL1 -386624 sc-eQTL 7.05e-01 -0.0618 0.163 0.09 DC L1
ENSG00000093134 VNN3 830781 sc-eQTL 6.88e-01 0.0505 0.126 0.09 DC L1
ENSG00000112299 VNN1 851491 sc-eQTL 1.11e-01 -0.216 0.135 0.09 DC L1
ENSG00000112303 VNN2 802087 sc-eQTL 2.82e-01 -0.156 0.145 0.09 DC L1
ENSG00000112306 RPS12 750977 sc-eQTL 8.93e-02 0.138 0.0809 0.09 DC L1
ENSG00000118515 SGK1 -752566 sc-eQTL 8.93e-01 -0.0128 0.0945 0.09 DC L1
ENSG00000146409 SLC18B1 752207 sc-eQTL 4.38e-01 0.1 0.129 0.09 DC L1
ENSG00000286438 AL591115.1 462418 sc-eQTL 5.96e-01 -0.0623 0.117 0.09 DC L1
ENSG00000286887 AL355881.1 -730755 sc-eQTL 6.91e-01 -0.0582 0.146 0.09 DC L1
ENSG00000028839 TBPL1 -386624 sc-eQTL 2.05e-01 -0.139 0.11 0.09 Mono L1
ENSG00000093134 VNN3 830781 sc-eQTL 9.72e-01 0.00441 0.126 0.09 Mono L1
ENSG00000112299 VNN1 851491 sc-eQTL 3.51e-01 -0.127 0.136 0.09 Mono L1
ENSG00000112303 VNN2 802087 sc-eQTL 4.48e-02 0.192 0.095 0.09 Mono L1
ENSG00000112306 RPS12 750977 sc-eQTL 7.95e-01 0.0149 0.0575 0.09 Mono L1
ENSG00000118515 SGK1 -752566 sc-eQTL 6.38e-01 0.0382 0.0811 0.09 Mono L1
ENSG00000146409 SLC18B1 752207 sc-eQTL 5.44e-01 -0.069 0.114 0.09 Mono L1
ENSG00000286887 AL355881.1 -730755 sc-eQTL 5.65e-01 -0.0644 0.112 0.09 Mono L1
ENSG00000028839 TBPL1 -386624 sc-eQTL 9.08e-02 -0.203 0.12 0.088 NK L1
ENSG00000112303 VNN2 802087 sc-eQTL 5.31e-02 -0.267 0.137 0.088 NK L1
ENSG00000112306 RPS12 750977 sc-eQTL 2.61e-01 -0.0644 0.0572 0.088 NK L1
ENSG00000118515 SGK1 -752566 sc-eQTL 8.41e-01 0.0213 0.106 0.088 NK L1
ENSG00000028839 TBPL1 -386624 sc-eQTL 2.80e-01 -0.15 0.139 0.09 Other_T L1
ENSG00000112303 VNN2 802087 sc-eQTL 3.28e-01 0.13 0.132 0.09 Other_T L1
ENSG00000112306 RPS12 750977 sc-eQTL 9.07e-01 -0.00617 0.0525 0.09 Other_T L1
ENSG00000118515 SGK1 -752566 sc-eQTL 2.77e-01 -0.105 0.0964 0.09 Other_T L1
ENSG00000146409 SLC18B1 752207 sc-eQTL 5.18e-01 0.0931 0.144 0.09 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000028839 TBPL1 -386624 sc-eQTL 7.09e-01 0.061 0.163 0.092 B_Activated L2
ENSG00000112303 VNN2 802087 sc-eQTL 8.83e-01 0.022 0.149 0.092 B_Activated L2
ENSG00000112306 RPS12 750977 sc-eQTL 2.26e-01 0.0966 0.0794 0.092 B_Activated L2
ENSG00000118515 SGK1 -752566 sc-eQTL 9.94e-01 -0.00103 0.142 0.092 B_Activated L2
ENSG00000146409 SLC18B1 752207 sc-eQTL 4.59e-01 0.104 0.139 0.092 B_Activated L2
ENSG00000028839 TBPL1 -386624 sc-eQTL 9.20e-01 -0.0155 0.155 0.09 B_Intermediate L2
ENSG00000112303 VNN2 802087 sc-eQTL 1.29e-02 0.331 0.132 0.09 B_Intermediate L2
ENSG00000112306 RPS12 750977 sc-eQTL 9.50e-02 0.136 0.0813 0.09 B_Intermediate L2
ENSG00000118515 SGK1 -752566 sc-eQTL 9.99e-01 0.000165 0.142 0.09 B_Intermediate L2
ENSG00000146409 SLC18B1 752207 sc-eQTL 6.01e-01 0.0772 0.147 0.09 B_Intermediate L2
ENSG00000028839 TBPL1 -386624 sc-eQTL 4.96e-01 -0.0998 0.146 0.091 B_Memory L2
ENSG00000112303 VNN2 802087 sc-eQTL 1.94e-01 0.18 0.138 0.091 B_Memory L2
ENSG00000112306 RPS12 750977 sc-eQTL 6.78e-01 0.0278 0.0669 0.091 B_Memory L2
ENSG00000118515 SGK1 -752566 sc-eQTL 6.96e-01 -0.048 0.123 0.091 B_Memory L2
ENSG00000146409 SLC18B1 752207 sc-eQTL 9.66e-01 -0.00592 0.14 0.091 B_Memory L2
ENSG00000028839 TBPL1 -386624 sc-eQTL 3.95e-01 0.119 0.14 0.09 B_Naive1 L2
ENSG00000112303 VNN2 802087 sc-eQTL 9.93e-01 0.00116 0.131 0.09 B_Naive1 L2
ENSG00000112306 RPS12 750977 sc-eQTL 8.92e-01 -0.0102 0.0745 0.09 B_Naive1 L2
ENSG00000118515 SGK1 -752566 sc-eQTL 6.57e-01 -0.0518 0.117 0.09 B_Naive1 L2
ENSG00000146409 SLC18B1 752207 sc-eQTL 9.29e-01 0.0129 0.144 0.09 B_Naive1 L2
ENSG00000028839 TBPL1 -386624 sc-eQTL 9.85e-01 -0.00276 0.149 0.09 B_Naive2 L2
ENSG00000112303 VNN2 802087 sc-eQTL 7.53e-01 -0.0457 0.145 0.09 B_Naive2 L2
ENSG00000112306 RPS12 750977 sc-eQTL 3.17e-01 -0.077 0.0767 0.09 B_Naive2 L2
ENSG00000118515 SGK1 -752566 sc-eQTL 5.42e-01 -0.083 0.136 0.09 B_Naive2 L2
ENSG00000146409 SLC18B1 752207 sc-eQTL 4.85e-01 0.102 0.147 0.09 B_Naive2 L2
ENSG00000028839 TBPL1 -386624 sc-eQTL 6.04e-01 -0.0748 0.144 0.093 CD4_CTL L2
ENSG00000112303 VNN2 802087 sc-eQTL 9.25e-01 -0.0136 0.145 0.093 CD4_CTL L2
ENSG00000112306 RPS12 750977 sc-eQTL 7.35e-01 -0.0227 0.0668 0.093 CD4_CTL L2
ENSG00000118515 SGK1 -752566 sc-eQTL 5.34e-01 -0.0721 0.116 0.093 CD4_CTL L2
ENSG00000146409 SLC18B1 752207 sc-eQTL 6.48e-01 0.0615 0.135 0.093 CD4_CTL L2
ENSG00000028839 TBPL1 -386624 sc-eQTL 1.41e-01 0.176 0.119 0.09 CD4_Naive L2
ENSG00000112303 VNN2 802087 sc-eQTL 9.36e-01 0.0088 0.109 0.09 CD4_Naive L2
ENSG00000112306 RPS12 750977 sc-eQTL 5.24e-01 0.0451 0.0706 0.09 CD4_Naive L2
ENSG00000118515 SGK1 -752566 sc-eQTL 6.57e-01 -0.0385 0.0865 0.09 CD4_Naive L2
ENSG00000146409 SLC18B1 752207 sc-eQTL 2.13e-01 0.169 0.136 0.09 CD4_Naive L2
ENSG00000028839 TBPL1 -386624 sc-eQTL 5.16e-01 0.0839 0.129 0.09 CD4_TCM L2
ENSG00000112303 VNN2 802087 sc-eQTL 9.90e-01 0.00166 0.128 0.09 CD4_TCM L2
ENSG00000112306 RPS12 750977 sc-eQTL 2.94e-01 0.0697 0.0662 0.09 CD4_TCM L2
ENSG00000118515 SGK1 -752566 sc-eQTL 9.42e-01 -0.00676 0.0928 0.09 CD4_TCM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 752207 sc-eQTL 6.45e-01 0.0708 0.154 0.09 CD4_TCM L2
ENSG00000028839 TBPL1 -386624 sc-eQTL 4.45e-01 -0.112 0.147 0.09 CD4_TEM L2
ENSG00000112303 VNN2 802087 sc-eQTL 6.57e-01 0.0629 0.141 0.09 CD4_TEM L2
ENSG00000112306 RPS12 750977 sc-eQTL 6.60e-01 0.0255 0.0579 0.09 CD4_TEM L2
ENSG00000118515 SGK1 -752566 sc-eQTL 4.33e-01 -0.0782 0.0995 0.09 CD4_TEM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 752207 sc-eQTL 5.23e-01 -0.0922 0.144 0.09 CD4_TEM L2
ENSG00000028839 TBPL1 -386624 sc-eQTL 9.12e-01 -0.0148 0.134 0.09 CD8_CTL L2
ENSG00000112303 VNN2 802087 sc-eQTL 2.59e-01 0.16 0.142 0.09 CD8_CTL L2
ENSG00000112306 RPS12 750977 sc-eQTL 8.93e-01 0.0102 0.076 0.09 CD8_CTL L2
ENSG00000118515 SGK1 -752566 sc-eQTL 1.00e-01 -0.211 0.128 0.09 CD8_CTL L2
ENSG00000146409 SLC18B1 752207 sc-eQTL 1.22e-01 -0.227 0.146 0.09 CD8_CTL L2
ENSG00000028839 TBPL1 -386624 sc-eQTL 5.36e-01 -0.0861 0.139 0.09 CD8_Naive L2
ENSG00000112303 VNN2 802087 sc-eQTL 8.80e-02 0.218 0.127 0.09 CD8_Naive L2
ENSG00000112306 RPS12 750977 sc-eQTL 1.91e-01 0.0957 0.0729 0.09 CD8_Naive L2
ENSG00000118515 SGK1 -752566 sc-eQTL 6.59e-01 -0.0406 0.0918 0.09 CD8_Naive L2
ENSG00000146409 SLC18B1 752207 sc-eQTL 8.09e-02 0.256 0.146 0.09 CD8_Naive L2
ENSG00000028839 TBPL1 -386624 sc-eQTL 8.33e-01 0.0324 0.153 0.095 CD8_TCM L2
ENSG00000112303 VNN2 802087 sc-eQTL 2.08e-01 -0.178 0.14 0.095 CD8_TCM L2
ENSG00000112306 RPS12 750977 sc-eQTL 4.60e-01 -0.0508 0.0686 0.095 CD8_TCM L2
ENSG00000118515 SGK1 -752566 sc-eQTL 8.75e-01 -0.0179 0.114 0.095 CD8_TCM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 752207 sc-eQTL 8.65e-01 -0.0257 0.151 0.095 CD8_TCM L2
ENSG00000028839 TBPL1 -386624 sc-eQTL 2.31e-01 -0.167 0.139 0.089 CD8_TEM L2
ENSG00000112303 VNN2 802087 sc-eQTL 5.52e-01 -0.0901 0.151 0.089 CD8_TEM L2
ENSG00000112306 RPS12 750977 sc-eQTL 2.05e-01 -0.103 0.0812 0.089 CD8_TEM L2
ENSG00000118515 SGK1 -752566 sc-eQTL 7.47e-01 -0.0431 0.133 0.089 CD8_TEM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 752207 sc-eQTL 3.45e-01 0.145 0.154 0.089 CD8_TEM L2
ENSG00000028839 TBPL1 -386624 sc-eQTL 5.09e-01 0.0967 0.146 0.089 MAIT L2
ENSG00000112303 VNN2 802087 sc-eQTL 6.53e-01 0.0636 0.141 0.089 MAIT L2
ENSG00000112306 RPS12 750977 sc-eQTL 7.25e-01 0.0245 0.0695 0.089 MAIT L2
ENSG00000118515 SGK1 -752566 sc-eQTL 9.99e-01 0.000183 0.0978 0.089 MAIT L2
ENSG00000146409 SLC18B1 752207 sc-eQTL 9.45e-01 0.0101 0.146 0.089 MAIT L2
ENSG00000028839 TBPL1 -386624 sc-eQTL 8.02e-01 0.0395 0.157 0.089 NK_CD56bright L2
ENSG00000112303 VNN2 802087 sc-eQTL 1.05e-01 -0.239 0.147 0.089 NK_CD56bright L2
ENSG00000112306 RPS12 750977 sc-eQTL 8.85e-01 0.0119 0.0825 0.089 NK_CD56bright L2
ENSG00000118515 SGK1 -752566 sc-eQTL 6.07e-01 0.0634 0.123 0.089 NK_CD56bright L2
ENSG00000028839 TBPL1 -386624 sc-eQTL 6.57e-01 -0.0573 0.129 0.088 NK_CD56dim L2
ENSG00000112303 VNN2 802087 sc-eQTL 8.92e-02 -0.25 0.146 0.088 NK_CD56dim L2
ENSG00000112306 RPS12 750977 sc-eQTL 6.62e-01 -0.0256 0.0585 0.088 NK_CD56dim L2
ENSG00000118515 SGK1 -752566 sc-eQTL 6.34e-01 -0.0618 0.13 0.088 NK_CD56dim L2
ENSG00000028839 TBPL1 -386624 sc-eQTL 8.05e-02 -0.285 0.162 0.091 NK_HLA L2
ENSG00000112303 VNN2 802087 sc-eQTL 6.40e-01 0.0704 0.15 0.091 NK_HLA L2
ENSG00000112306 RPS12 750977 sc-eQTL 8.91e-02 -0.119 0.0696 0.091 NK_HLA L2
ENSG00000118515 SGK1 -752566 sc-eQTL 4.79e-01 -0.0982 0.138 0.091 NK_HLA L2
ENSG00000028839 TBPL1 -386624 sc-eQTL 1.54e-01 -0.188 0.132 0.088 NK_cytokine L2
ENSG00000112303 VNN2 802087 sc-eQTL 1.51e-01 -0.207 0.143 0.088 NK_cytokine L2
ENSG00000112306 RPS12 750977 sc-eQTL 6.79e-02 -0.142 0.0775 0.088 NK_cytokine L2
ENSG00000118515 SGK1 -752566 sc-eQTL 8.39e-01 0.0265 0.13 0.088 NK_cytokine L2
ENSG00000028839 TBPL1 -386624 sc-eQTL 8.95e-01 -0.0242 0.184 0.089 PB L2
ENSG00000112303 VNN2 802087 sc-eQTL 3.46e-01 -0.151 0.159 0.089 PB L2
ENSG00000112306 RPS12 750977 sc-eQTL 8.21e-01 0.0206 0.0907 0.089 PB L2
ENSG00000118515 SGK1 -752566 sc-eQTL 7.90e-02 0.256 0.145 0.089 PB L2
ENSG00000146409 SLC18B1 752207 sc-eQTL 5.61e-01 0.099 0.17 0.089 PB L2
ENSG00000028839 TBPL1 -386624 sc-eQTL 7.48e-01 0.0475 0.148 0.091 Pro_T L2
ENSG00000112303 VNN2 802087 sc-eQTL 9.94e-01 -0.000986 0.141 0.091 Pro_T L2
ENSG00000112306 RPS12 750977 sc-eQTL 9.53e-01 0.00313 0.0535 0.091 Pro_T L2
ENSG00000118515 SGK1 -752566 sc-eQTL 1.74e-01 -0.146 0.107 0.091 Pro_T L2
ENSG00000146409 SLC18B1 752207 sc-eQTL 1.52e-01 0.198 0.138 0.091 Pro_T L2
ENSG00000028839 TBPL1 -386624 sc-eQTL 8.18e-01 -0.0349 0.151 0.09 Treg L2
ENSG00000112303 VNN2 802087 sc-eQTL 1.07e-01 0.192 0.119 0.09 Treg L2
ENSG00000112306 RPS12 750977 sc-eQTL 5.87e-01 -0.0288 0.0529 0.09 Treg L2
ENSG00000118515 SGK1 -752566 sc-eQTL 2.31e-02 -0.252 0.11 0.09 Treg L2
ENSG00000146409 SLC18B1 752207 sc-eQTL 2.44e-01 0.174 0.149 0.09 Treg L2
ENSG00000028839 TBPL1 -386624 sc-eQTL 9.08e-01 0.0191 0.165 0.085 cDC L2
ENSG00000093134 VNN3 830781 sc-eQTL 5.95e-01 0.0685 0.129 0.085 cDC L2
ENSG00000112299 VNN1 851491 sc-eQTL 2.04e-01 -0.192 0.151 0.085 cDC L2
ENSG00000112303 VNN2 802087 sc-eQTL 1.59e-01 -0.207 0.147 0.085 cDC L2
ENSG00000112306 RPS12 750977 sc-eQTL 5.17e-02 0.141 0.0721 0.085 cDC L2
ENSG00000118515 SGK1 -752566 sc-eQTL 4.96e-01 -0.0837 0.123 0.085 cDC L2
ENSG00000146409 SLC18B1 752207 sc-eQTL 9.04e-01 0.0174 0.144 0.085 cDC L2
ENSG00000286438 AL591115.1 462418 sc-eQTL 2.31e-01 -0.138 0.115 0.085 cDC L2
ENSG00000286887 AL355881.1 -730755 sc-eQTL 5.45e-01 -0.0859 0.142 0.085 cDC L2
ENSG00000028839 TBPL1 -386624 sc-eQTL 3.75e-01 -0.111 0.125 0.09 cMono_IL1B L2
ENSG00000093134 VNN3 830781 sc-eQTL 5.81e-01 -0.0742 0.134 0.09 cMono_IL1B L2
ENSG00000112299 VNN1 851491 sc-eQTL 7.18e-01 -0.049 0.136 0.09 cMono_IL1B L2
ENSG00000112303 VNN2 802087 sc-eQTL 9.86e-02 0.179 0.108 0.09 cMono_IL1B L2
ENSG00000112306 RPS12 750977 sc-eQTL 4.63e-01 0.0442 0.0601 0.09 cMono_IL1B L2
ENSG00000118515 SGK1 -752566 sc-eQTL 8.20e-01 0.0205 0.0898 0.09 cMono_IL1B L2
ENSG00000146409 SLC18B1 752207 sc-eQTL 9.07e-01 -0.0136 0.116 0.09 cMono_IL1B L2
ENSG00000286887 AL355881.1 -730755 sc-eQTL 7.51e-01 -0.0384 0.121 0.09 cMono_IL1B L2
ENSG00000028839 TBPL1 -386624 sc-eQTL 2.84e-01 -0.152 0.141 0.09 cMono_S100A L2
ENSG00000093134 VNN3 830781 sc-eQTL 8.59e-01 0.0228 0.128 0.09 cMono_S100A L2
ENSG00000112299 VNN1 851491 sc-eQTL 2.47e-01 -0.16 0.138 0.09 cMono_S100A L2
ENSG00000112303 VNN2 802087 sc-eQTL 9.26e-02 0.152 0.0901 0.09 cMono_S100A L2
ENSG00000112306 RPS12 750977 sc-eQTL 4.53e-01 0.0491 0.0652 0.09 cMono_S100A L2
ENSG00000118515 SGK1 -752566 sc-eQTL 4.79e-01 0.0529 0.0746 0.09 cMono_S100A L2
ENSG00000146409 SLC18B1 752207 sc-eQTL 4.63e-01 -0.0888 0.121 0.09 cMono_S100A L2
ENSG00000286887 AL355881.1 -730755 sc-eQTL 7.43e-01 0.0389 0.118 0.09 cMono_S100A L2
ENSG00000028839 TBPL1 -386624 sc-eQTL 9.92e-02 -0.321 0.193 0.079 gdT L2
ENSG00000112303 VNN2 802087 sc-eQTL 2.91e-02 0.403 0.183 0.079 gdT L2
ENSG00000112306 RPS12 750977 sc-eQTL 6.23e-01 0.0349 0.0707 0.079 gdT L2
ENSG00000118515 SGK1 -752566 sc-eQTL 8.87e-01 0.019 0.134 0.079 gdT L2
ENSG00000146409 SLC18B1 752207 sc-eQTL 7.98e-01 -0.0468 0.183 0.079 gdT L2
ENSG00000028839 TBPL1 -386624 sc-eQTL 2.43e-01 -0.169 0.145 0.089 intMono L2
ENSG00000093134 VNN3 830781 sc-eQTL 5.43e-01 0.0853 0.14 0.089 intMono L2
ENSG00000112299 VNN1 851491 sc-eQTL 9.83e-01 0.00288 0.138 0.089 intMono L2
ENSG00000112303 VNN2 802087 sc-eQTL 5.41e-01 -0.086 0.141 0.089 intMono L2
ENSG00000112306 RPS12 750977 sc-eQTL 4.60e-01 -0.0452 0.0611 0.089 intMono L2
ENSG00000118515 SGK1 -752566 sc-eQTL 9.13e-01 0.0113 0.103 0.089 intMono L2
ENSG00000146409 SLC18B1 752207 sc-eQTL 8.34e-01 0.0313 0.149 0.089 intMono L2
ENSG00000286887 AL355881.1 -730755 sc-eQTL 4.39e-03 -0.402 0.14 0.089 intMono L2
ENSG00000028839 TBPL1 -386624 sc-eQTL 4.25e-01 -0.12 0.151 0.086 ncMono L2
ENSG00000093134 VNN3 830781 sc-eQTL 6.41e-01 0.067 0.144 0.086 ncMono L2
ENSG00000112299 VNN1 851491 sc-eQTL 1.42e-01 -0.209 0.142 0.086 ncMono L2
ENSG00000112303 VNN2 802087 sc-eQTL 6.36e-01 -0.065 0.137 0.086 ncMono L2
ENSG00000112306 RPS12 750977 sc-eQTL 1.89e-01 -0.0903 0.0686 0.086 ncMono L2
ENSG00000118515 SGK1 -752566 sc-eQTL 3.14e-01 0.098 0.0972 0.086 ncMono L2
ENSG00000146409 SLC18B1 752207 sc-eQTL 4.31e-01 -0.0959 0.121 0.086 ncMono L2
ENSG00000286887 AL355881.1 -730755 sc-eQTL 8.48e-01 -0.0246 0.129 0.086 ncMono L2
ENSG00000028839 TBPL1 -386624 sc-eQTL 5.98e-01 -0.0927 0.175 0.082 pDC L2
ENSG00000093134 VNN3 830781 sc-eQTL 3.45e-01 -0.111 0.117 0.082 pDC L2
ENSG00000112299 VNN1 851491 sc-eQTL 9.98e-01 -0.000233 0.12 0.082 pDC L2
ENSG00000112303 VNN2 802087 sc-eQTL 9.43e-01 0.0102 0.143 0.082 pDC L2
ENSG00000112306 RPS12 750977 sc-eQTL 7.39e-01 0.0328 0.0981 0.082 pDC L2
ENSG00000118515 SGK1 -752566 sc-eQTL 1.07e-01 0.16 0.0989 0.082 pDC L2
ENSG00000146409 SLC18B1 752207 sc-eQTL 5.85e-01 0.0795 0.145 0.082 pDC L2
ENSG00000286438 AL591115.1 462418 sc-eQTL 6.96e-01 0.0543 0.139 0.082 pDC L2
ENSG00000286887 AL355881.1 -730755 sc-eQTL 8.73e-01 0.0197 0.123 0.082 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000028839 TBPL1 -386624 sc-eQTL 6.47e-01 -0.0688 0.15 0.09 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 802087 sc-eQTL 1.33e-01 0.196 0.13 0.09 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 750977 sc-eQTL 2.96e-01 0.0779 0.0743 0.09 B_Memory LOneK1K
ENSG00000118515 SGK1 -752566 sc-eQTL 5.78e-01 -0.0649 0.116 0.09 B_Memory LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 752207 sc-eQTL 6.69e-01 0.0585 0.137 0.09 B_Memory LOneK1K
ENSG00000028839 TBPL1 -386624 sc-eQTL 5.36e-01 0.0868 0.14 0.09 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 802087 sc-eQTL 7.16e-01 -0.0446 0.122 0.09 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 750977 sc-eQTL 7.47e-01 -0.0239 0.0741 0.09 B_Naive LOneK1K
ENSG00000118515 SGK1 -752566 sc-eQTL 5.50e-01 -0.0687 0.115 0.09 B_Naive LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 752207 sc-eQTL 8.05e-01 0.0345 0.14 0.09 B_Naive LOneK1K
ENSG00000028839 TBPL1 -386624 sc-eQTL 2.01e-01 -0.146 0.114 0.09 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000093134 VNN3 830781 sc-eQTL 8.10e-01 -0.0312 0.13 0.09 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112299 VNN1 851491 sc-eQTL 5.06e-01 -0.09 0.135 0.09 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 802087 sc-eQTL 7.69e-02 0.158 0.0887 0.09 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 750977 sc-eQTL 4.05e-01 0.051 0.0612 0.09 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000118515 SGK1 -752566 sc-eQTL 6.97e-01 0.0325 0.0835 0.09 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 752207 sc-eQTL 4.31e-01 -0.0859 0.109 0.09 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000286887 AL355881.1 -730755 sc-eQTL 9.53e-01 -0.00672 0.114 0.09 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000028839 TBPL1 -386624 sc-eQTL 4.00e-01 -0.125 0.148 0.088 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000093134 VNN3 830781 sc-eQTL 2.74e-01 0.157 0.143 0.088 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112299 VNN1 851491 sc-eQTL 3.19e-01 -0.142 0.142 0.088 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 802087 sc-eQTL 7.71e-01 0.0391 0.134 0.088 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 750977 sc-eQTL 3.30e-01 -0.0555 0.0568 0.088 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000118515 SGK1 -752566 sc-eQTL 9.83e-01 -0.00182 0.0861 0.088 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 752207 sc-eQTL 3.95e-01 0.118 0.138 0.088 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000286887 AL355881.1 -730755 sc-eQTL 3.18e-02 -0.267 0.124 0.088 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000028839 TBPL1 -386624 sc-eQTL 7.94e-02 -0.208 0.118 0.088 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 802087 sc-eQTL 9.25e-02 -0.237 0.14 0.088 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 750977 sc-eQTL 3.58e-01 -0.0529 0.0575 0.088 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000118515 SGK1 -752566 sc-eQTL 9.90e-01 0.00152 0.119 0.088 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000220378 KRT8P42 -733149 eQTL 0.00778 -0.202 0.0756 0.0028 0.00116 0.0412

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000220378 KRT8P42 -733149 2.95e-07 1.51e-07 5.64e-08 2.09e-07 9.79e-08 9.48e-08 1.73e-07 5.43e-08 1.47e-07 6.08e-08 1.59e-07 1.15e-07 1.71e-07 7.95e-08 5.43e-08 7.74e-08 4.31e-08 1.51e-07 6.75e-08 4.8e-08 1.22e-07 1.26e-07 1.58e-07 2.87e-08 1.98e-07 1.22e-07 1.13e-07 1.12e-07 1.24e-07 1e-07 1.06e-07 3.03e-08 3.89e-08 8.72e-08 3.07e-08 2.99e-08 5.8e-08 9.36e-08 6.37e-08 5.13e-08 5.3e-08 1.52e-07 5.24e-08 1.3e-08 3.83e-08 1.92e-08 1.2e-07 1.89e-09 5.02e-08