logo

Genes within 1Mb (chr6:133565002:C:T):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000028839 TBPL1 -387168 sc-eQTL 5.52e-01 0.085 0.143 0.088 B L1
ENSG00000112303 VNN2 801543 sc-eQTL 1.74e-01 0.145 0.106 0.088 B L1
ENSG00000112306 RPS12 750433 sc-eQTL 8.16e-01 0.015 0.0646 0.088 B L1
ENSG00000118515 SGK1 -753110 sc-eQTL 8.35e-01 0.0208 0.0997 0.088 B L1
ENSG00000146409 SLC18B1 751663 sc-eQTL 4.97e-01 0.0924 0.136 0.088 B L1
ENSG00000028839 TBPL1 -387168 sc-eQTL 8.34e-01 0.0223 0.106 0.088 CD4T L1
ENSG00000112303 VNN2 801543 sc-eQTL 3.01e-01 0.0988 0.0953 0.088 CD4T L1
ENSG00000112306 RPS12 750433 sc-eQTL 8.88e-01 0.00916 0.065 0.088 CD4T L1
ENSG00000118515 SGK1 -753110 sc-eQTL 9.25e-01 -0.00822 0.0874 0.088 CD4T L1
ENSG00000146409 SLC18B1 751663 sc-eQTL 4.14e-01 0.107 0.131 0.088 CD4T L1
ENSG00000028839 TBPL1 -387168 sc-eQTL 4.69e-02 -0.207 0.104 0.088 CD8T L1
ENSG00000112303 VNN2 801543 sc-eQTL 8.38e-02 0.22 0.126 0.088 CD8T L1
ENSG00000112306 RPS12 750433 sc-eQTL 3.65e-01 0.0394 0.0434 0.088 CD8T L1
ENSG00000118515 SGK1 -753110 sc-eQTL 6.08e-01 -0.0344 0.0671 0.088 CD8T L1
ENSG00000146409 SLC18B1 751663 sc-eQTL 2.82e-01 -0.142 0.131 0.088 CD8T L1
ENSG00000028839 TBPL1 -387168 sc-eQTL 5.75e-01 -0.0934 0.166 0.088 DC L1
ENSG00000093134 VNN3 830237 sc-eQTL 6.54e-01 0.0575 0.128 0.088 DC L1
ENSG00000112299 VNN1 850947 sc-eQTL 1.16e-01 -0.217 0.137 0.088 DC L1
ENSG00000112303 VNN2 801543 sc-eQTL 3.01e-01 -0.153 0.148 0.088 DC L1
ENSG00000112306 RPS12 750433 sc-eQTL 1.07e-01 0.133 0.0824 0.088 DC L1
ENSG00000118515 SGK1 -753110 sc-eQTL 8.57e-01 0.0173 0.0962 0.088 DC L1
ENSG00000146409 SLC18B1 751663 sc-eQTL 6.02e-01 0.0685 0.131 0.088 DC L1
ENSG00000286438 AL591115.1 461874 sc-eQTL 5.16e-01 -0.0776 0.119 0.088 DC L1
ENSG00000286887 AL355881.1 -731299 sc-eQTL 6.62e-01 -0.0652 0.149 0.088 DC L1
ENSG00000028839 TBPL1 -387168 sc-eQTL 1.47e-01 -0.161 0.111 0.088 Mono L1
ENSG00000093134 VNN3 830237 sc-eQTL 8.56e-01 0.0233 0.128 0.088 Mono L1
ENSG00000112299 VNN1 850947 sc-eQTL 3.57e-01 -0.127 0.137 0.088 Mono L1
ENSG00000112303 VNN2 801543 sc-eQTL 1.26e-01 0.148 0.0965 0.088 Mono L1
ENSG00000112306 RPS12 750433 sc-eQTL 8.71e-01 0.00942 0.0581 0.088 Mono L1
ENSG00000118515 SGK1 -753110 sc-eQTL 4.46e-01 0.0626 0.082 0.088 Mono L1
ENSG00000146409 SLC18B1 751663 sc-eQTL 4.63e-01 -0.0844 0.115 0.088 Mono L1
ENSG00000286887 AL355881.1 -731299 sc-eQTL 5.82e-01 -0.0623 0.113 0.088 Mono L1
ENSG00000028839 TBPL1 -387168 sc-eQTL 1.03e-01 -0.2 0.122 0.086 NK L1
ENSG00000112303 VNN2 801543 sc-eQTL 7.17e-02 -0.254 0.14 0.086 NK L1
ENSG00000112306 RPS12 750433 sc-eQTL 2.15e-01 -0.0725 0.0583 0.086 NK L1
ENSG00000118515 SGK1 -753110 sc-eQTL 8.69e-01 0.0178 0.108 0.086 NK L1
ENSG00000028839 TBPL1 -387168 sc-eQTL 2.45e-01 -0.164 0.141 0.088 Other_T L1
ENSG00000112303 VNN2 801543 sc-eQTL 3.34e-01 0.13 0.134 0.088 Other_T L1
ENSG00000112306 RPS12 750433 sc-eQTL 8.86e-01 -0.00761 0.0532 0.088 Other_T L1
ENSG00000118515 SGK1 -753110 sc-eQTL 2.83e-01 -0.105 0.0977 0.088 Other_T L1
ENSG00000146409 SLC18B1 751663 sc-eQTL 5.09e-01 0.0964 0.146 0.088 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000028839 TBPL1 -387168 sc-eQTL 8.20e-01 0.038 0.166 0.089 B_Activated L2
ENSG00000112303 VNN2 801543 sc-eQTL 9.19e-01 0.0155 0.152 0.089 B_Activated L2
ENSG00000112306 RPS12 750433 sc-eQTL 2.43e-01 0.0948 0.0809 0.089 B_Activated L2
ENSG00000118515 SGK1 -753110 sc-eQTL 9.01e-01 0.018 0.145 0.089 B_Activated L2
ENSG00000146409 SLC18B1 751663 sc-eQTL 5.98e-01 0.0751 0.142 0.089 B_Activated L2
ENSG00000028839 TBPL1 -387168 sc-eQTL 8.04e-01 0.0389 0.157 0.088 B_Intermediate L2
ENSG00000112303 VNN2 801543 sc-eQTL 1.41e-02 0.331 0.134 0.088 B_Intermediate L2
ENSG00000112306 RPS12 750433 sc-eQTL 9.17e-02 0.14 0.0825 0.088 B_Intermediate L2
ENSG00000118515 SGK1 -753110 sc-eQTL 8.31e-01 0.0307 0.144 0.088 B_Intermediate L2
ENSG00000146409 SLC18B1 751663 sc-eQTL 8.11e-01 0.0359 0.15 0.088 B_Intermediate L2
ENSG00000028839 TBPL1 -387168 sc-eQTL 5.08e-01 -0.0988 0.149 0.088 B_Memory L2
ENSG00000112303 VNN2 801543 sc-eQTL 2.12e-01 0.176 0.141 0.088 B_Memory L2
ENSG00000112306 RPS12 750433 sc-eQTL 8.29e-01 0.0147 0.068 0.088 B_Memory L2
ENSG00000118515 SGK1 -753110 sc-eQTL 7.03e-01 -0.0475 0.125 0.088 B_Memory L2
ENSG00000146409 SLC18B1 751663 sc-eQTL 8.93e-01 0.0191 0.142 0.088 B_Memory L2
ENSG00000028839 TBPL1 -387168 sc-eQTL 5.48e-01 0.0858 0.143 0.088 B_Naive1 L2
ENSG00000112303 VNN2 801543 sc-eQTL 9.79e-01 0.00357 0.133 0.088 B_Naive1 L2
ENSG00000112306 RPS12 750433 sc-eQTL 8.01e-01 -0.0191 0.0758 0.088 B_Naive1 L2
ENSG00000118515 SGK1 -753110 sc-eQTL 9.69e-01 -0.00464 0.119 0.088 B_Naive1 L2
ENSG00000146409 SLC18B1 751663 sc-eQTL 9.61e-01 -0.00722 0.146 0.088 B_Naive1 L2
ENSG00000028839 TBPL1 -387168 sc-eQTL 9.98e-01 0.000312 0.152 0.088 B_Naive2 L2
ENSG00000112303 VNN2 801543 sc-eQTL 7.23e-01 -0.0526 0.148 0.088 B_Naive2 L2
ENSG00000112306 RPS12 750433 sc-eQTL 2.69e-01 -0.0867 0.0781 0.088 B_Naive2 L2
ENSG00000118515 SGK1 -753110 sc-eQTL 8.01e-01 -0.035 0.138 0.088 B_Naive2 L2
ENSG00000146409 SLC18B1 751663 sc-eQTL 5.80e-01 0.0827 0.149 0.088 B_Naive2 L2
ENSG00000028839 TBPL1 -387168 sc-eQTL 6.19e-01 -0.0732 0.147 0.091 CD4_CTL L2
ENSG00000112303 VNN2 801543 sc-eQTL 8.47e-01 -0.0285 0.147 0.091 CD4_CTL L2
ENSG00000112306 RPS12 750433 sc-eQTL 6.36e-01 -0.0322 0.068 0.091 CD4_CTL L2
ENSG00000118515 SGK1 -753110 sc-eQTL 5.66e-01 -0.0677 0.118 0.091 CD4_CTL L2
ENSG00000146409 SLC18B1 751663 sc-eQTL 7.63e-01 0.0415 0.137 0.091 CD4_CTL L2
ENSG00000028839 TBPL1 -387168 sc-eQTL 2.57e-01 0.137 0.121 0.088 CD4_Naive L2
ENSG00000112303 VNN2 801543 sc-eQTL 9.77e-01 0.00318 0.11 0.088 CD4_Naive L2
ENSG00000112306 RPS12 750433 sc-eQTL 6.80e-01 0.0295 0.0715 0.088 CD4_Naive L2
ENSG00000118515 SGK1 -753110 sc-eQTL 6.92e-01 -0.0348 0.0876 0.088 CD4_Naive L2
ENSG00000146409 SLC18B1 751663 sc-eQTL 3.31e-01 0.134 0.137 0.088 CD4_Naive L2
ENSG00000028839 TBPL1 -387168 sc-eQTL 5.08e-01 0.0866 0.131 0.088 CD4_TCM L2
ENSG00000112303 VNN2 801543 sc-eQTL 9.32e-01 -0.0112 0.13 0.088 CD4_TCM L2
ENSG00000112306 RPS12 750433 sc-eQTL 3.38e-01 0.0645 0.0672 0.088 CD4_TCM L2
ENSG00000118515 SGK1 -753110 sc-eQTL 9.02e-01 0.0116 0.0942 0.088 CD4_TCM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 751663 sc-eQTL 6.99e-01 0.0603 0.156 0.088 CD4_TCM L2
ENSG00000028839 TBPL1 -387168 sc-eQTL 4.83e-01 -0.104 0.148 0.088 CD4_TEM L2
ENSG00000112303 VNN2 801543 sc-eQTL 6.15e-01 0.0719 0.142 0.088 CD4_TEM L2
ENSG00000112306 RPS12 750433 sc-eQTL 7.87e-01 0.0158 0.0585 0.088 CD4_TEM L2
ENSG00000118515 SGK1 -753110 sc-eQTL 4.64e-01 -0.0736 0.1 0.088 CD4_TEM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 751663 sc-eQTL 4.54e-01 -0.109 0.145 0.088 CD4_TEM L2
ENSG00000028839 TBPL1 -387168 sc-eQTL 7.95e-01 -0.0354 0.136 0.088 CD8_CTL L2
ENSG00000112303 VNN2 801543 sc-eQTL 2.73e-01 0.158 0.144 0.088 CD8_CTL L2
ENSG00000112306 RPS12 750433 sc-eQTL 7.78e-01 0.0218 0.0772 0.088 CD8_CTL L2
ENSG00000118515 SGK1 -753110 sc-eQTL 9.51e-02 -0.217 0.13 0.088 CD8_CTL L2
ENSG00000146409 SLC18B1 751663 sc-eQTL 1.21e-01 -0.231 0.149 0.088 CD8_CTL L2
ENSG00000028839 TBPL1 -387168 sc-eQTL 4.23e-01 -0.113 0.141 0.088 CD8_Naive L2
ENSG00000112303 VNN2 801543 sc-eQTL 1.27e-01 0.197 0.129 0.088 CD8_Naive L2
ENSG00000112306 RPS12 750433 sc-eQTL 1.78e-01 0.0997 0.0738 0.088 CD8_Naive L2
ENSG00000118515 SGK1 -753110 sc-eQTL 5.64e-01 -0.0537 0.0929 0.088 CD8_Naive L2
ENSG00000146409 SLC18B1 751663 sc-eQTL 1.35e-01 0.222 0.148 0.088 CD8_Naive L2
ENSG00000028839 TBPL1 -387168 sc-eQTL 8.03e-01 0.039 0.156 0.093 CD8_TCM L2
ENSG00000112303 VNN2 801543 sc-eQTL 2.42e-01 -0.168 0.143 0.093 CD8_TCM L2
ENSG00000112306 RPS12 750433 sc-eQTL 5.20e-01 -0.045 0.0699 0.093 CD8_TCM L2
ENSG00000118515 SGK1 -753110 sc-eQTL 9.50e-01 -0.00733 0.116 0.093 CD8_TCM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 751663 sc-eQTL 9.05e-01 -0.0183 0.153 0.093 CD8_TCM L2
ENSG00000028839 TBPL1 -387168 sc-eQTL 1.45e-01 -0.207 0.141 0.087 CD8_TEM L2
ENSG00000112303 VNN2 801543 sc-eQTL 5.66e-01 -0.0885 0.154 0.087 CD8_TEM L2
ENSG00000112306 RPS12 750433 sc-eQTL 2.31e-01 -0.0991 0.0825 0.087 CD8_TEM L2
ENSG00000118515 SGK1 -753110 sc-eQTL 7.38e-01 -0.0454 0.136 0.087 CD8_TEM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 751663 sc-eQTL 4.98e-01 0.106 0.156 0.087 CD8_TEM L2
ENSG00000028839 TBPL1 -387168 sc-eQTL 3.76e-01 0.132 0.148 0.087 MAIT L2
ENSG00000112303 VNN2 801543 sc-eQTL 7.90e-01 0.0384 0.144 0.087 MAIT L2
ENSG00000112306 RPS12 750433 sc-eQTL 6.46e-01 0.0325 0.0707 0.087 MAIT L2
ENSG00000118515 SGK1 -753110 sc-eQTL 9.30e-01 -0.00873 0.0995 0.087 MAIT L2
ENSG00000146409 SLC18B1 751663 sc-eQTL 9.87e-01 0.00242 0.148 0.087 MAIT L2
ENSG00000028839 TBPL1 -387168 sc-eQTL 7.93e-01 0.0421 0.16 0.087 NK_CD56bright L2
ENSG00000112303 VNN2 801543 sc-eQTL 9.41e-02 -0.252 0.15 0.087 NK_CD56bright L2
ENSG00000112306 RPS12 750433 sc-eQTL 9.98e-01 -0.000181 0.0839 0.087 NK_CD56bright L2
ENSG00000118515 SGK1 -753110 sc-eQTL 9.28e-01 0.0113 0.125 0.087 NK_CD56bright L2
ENSG00000028839 TBPL1 -387168 sc-eQTL 7.34e-01 -0.0446 0.131 0.086 NK_CD56dim L2
ENSG00000112303 VNN2 801543 sc-eQTL 1.13e-01 -0.237 0.149 0.086 NK_CD56dim L2
ENSG00000112306 RPS12 750433 sc-eQTL 6.68e-01 -0.0256 0.0596 0.086 NK_CD56dim L2
ENSG00000118515 SGK1 -753110 sc-eQTL 6.62e-01 -0.0578 0.132 0.086 NK_CD56dim L2
ENSG00000028839 TBPL1 -387168 sc-eQTL 9.24e-02 -0.28 0.166 0.089 NK_HLA L2
ENSG00000112303 VNN2 801543 sc-eQTL 9.05e-01 0.0184 0.154 0.089 NK_HLA L2
ENSG00000112306 RPS12 750433 sc-eQTL 4.84e-02 -0.141 0.071 0.089 NK_HLA L2
ENSG00000118515 SGK1 -753110 sc-eQTL 5.49e-01 -0.0849 0.142 0.089 NK_HLA L2
ENSG00000028839 TBPL1 -387168 sc-eQTL 1.98e-01 -0.174 0.134 0.086 NK_cytokine L2
ENSG00000112303 VNN2 801543 sc-eQTL 2.07e-01 -0.185 0.146 0.086 NK_cytokine L2
ENSG00000112306 RPS12 750433 sc-eQTL 5.38e-02 -0.153 0.0789 0.086 NK_cytokine L2
ENSG00000118515 SGK1 -753110 sc-eQTL 9.42e-01 0.00961 0.133 0.086 NK_cytokine L2
ENSG00000028839 TBPL1 -387168 sc-eQTL 7.13e-01 -0.069 0.187 0.085 PB L2
ENSG00000112303 VNN2 801543 sc-eQTL 2.74e-01 -0.178 0.162 0.085 PB L2
ENSG00000112306 RPS12 750433 sc-eQTL 7.19e-01 0.0333 0.0923 0.085 PB L2
ENSG00000118515 SGK1 -753110 sc-eQTL 6.29e-02 0.276 0.147 0.085 PB L2
ENSG00000146409 SLC18B1 751663 sc-eQTL 6.28e-01 0.084 0.173 0.085 PB L2
ENSG00000028839 TBPL1 -387168 sc-eQTL 8.39e-01 0.0305 0.15 0.089 Pro_T L2
ENSG00000112303 VNN2 801543 sc-eQTL 9.98e-01 -0.000393 0.143 0.089 Pro_T L2
ENSG00000112306 RPS12 750433 sc-eQTL 9.39e-01 0.00416 0.0542 0.089 Pro_T L2
ENSG00000118515 SGK1 -753110 sc-eQTL 2.25e-01 -0.132 0.108 0.089 Pro_T L2
ENSG00000146409 SLC18B1 751663 sc-eQTL 1.55e-01 0.199 0.14 0.089 Pro_T L2
ENSG00000028839 TBPL1 -387168 sc-eQTL 5.72e-01 -0.0867 0.153 0.088 Treg L2
ENSG00000112303 VNN2 801543 sc-eQTL 9.90e-02 0.2 0.121 0.088 Treg L2
ENSG00000112306 RPS12 750433 sc-eQTL 4.12e-01 -0.0442 0.0537 0.088 Treg L2
ENSG00000118515 SGK1 -753110 sc-eQTL 2.86e-02 -0.247 0.112 0.088 Treg L2
ENSG00000146409 SLC18B1 751663 sc-eQTL 2.86e-01 0.162 0.152 0.088 Treg L2
ENSG00000028839 TBPL1 -387168 sc-eQTL 9.40e-01 -0.0126 0.168 0.083 cDC L2
ENSG00000093134 VNN3 830237 sc-eQTL 5.68e-01 0.0751 0.131 0.083 cDC L2
ENSG00000112299 VNN1 850947 sc-eQTL 2.11e-01 -0.193 0.154 0.083 cDC L2
ENSG00000112303 VNN2 801543 sc-eQTL 2.03e-01 -0.191 0.15 0.083 cDC L2
ENSG00000112306 RPS12 750433 sc-eQTL 4.87e-02 0.146 0.0735 0.083 cDC L2
ENSG00000118515 SGK1 -753110 sc-eQTL 6.05e-01 -0.0648 0.125 0.083 cDC L2
ENSG00000146409 SLC18B1 751663 sc-eQTL 9.72e-01 -0.00514 0.147 0.083 cDC L2
ENSG00000286438 AL591115.1 461874 sc-eQTL 2.25e-01 -0.143 0.117 0.083 cDC L2
ENSG00000286887 AL355881.1 -731299 sc-eQTL 4.45e-01 -0.111 0.144 0.083 cDC L2
ENSG00000028839 TBPL1 -387168 sc-eQTL 3.64e-01 -0.115 0.127 0.088 cMono_IL1B L2
ENSG00000093134 VNN3 830237 sc-eQTL 6.91e-01 -0.0542 0.136 0.088 cMono_IL1B L2
ENSG00000112299 VNN1 850947 sc-eQTL 7.69e-01 -0.0405 0.137 0.088 cMono_IL1B L2
ENSG00000112303 VNN2 801543 sc-eQTL 2.15e-01 0.136 0.109 0.088 cMono_IL1B L2
ENSG00000112306 RPS12 750433 sc-eQTL 4.51e-01 0.046 0.0609 0.088 cMono_IL1B L2
ENSG00000118515 SGK1 -753110 sc-eQTL 6.10e-01 0.0465 0.091 0.088 cMono_IL1B L2
ENSG00000146409 SLC18B1 751663 sc-eQTL 8.66e-01 -0.0199 0.118 0.088 cMono_IL1B L2
ENSG00000286887 AL355881.1 -731299 sc-eQTL 7.27e-01 -0.0428 0.123 0.088 cMono_IL1B L2
ENSG00000028839 TBPL1 -387168 sc-eQTL 2.07e-01 -0.181 0.143 0.088 cMono_S100A L2
ENSG00000093134 VNN3 830237 sc-eQTL 8.11e-01 0.031 0.129 0.088 cMono_S100A L2
ENSG00000112299 VNN1 850947 sc-eQTL 2.77e-01 -0.153 0.14 0.088 cMono_S100A L2
ENSG00000112303 VNN2 801543 sc-eQTL 1.33e-01 0.138 0.0915 0.088 cMono_S100A L2
ENSG00000112306 RPS12 750433 sc-eQTL 4.43e-01 0.0508 0.0662 0.088 cMono_S100A L2
ENSG00000118515 SGK1 -753110 sc-eQTL 3.67e-01 0.0684 0.0756 0.088 cMono_S100A L2
ENSG00000146409 SLC18B1 751663 sc-eQTL 3.69e-01 -0.11 0.122 0.088 cMono_S100A L2
ENSG00000286887 AL355881.1 -731299 sc-eQTL 7.11e-01 0.0444 0.12 0.088 cMono_S100A L2
ENSG00000028839 TBPL1 -387168 sc-eQTL 9.92e-02 -0.321 0.193 0.079 gdT L2
ENSG00000112303 VNN2 801543 sc-eQTL 2.91e-02 0.403 0.183 0.079 gdT L2
ENSG00000112306 RPS12 750433 sc-eQTL 6.23e-01 0.0349 0.0707 0.079 gdT L2
ENSG00000118515 SGK1 -753110 sc-eQTL 8.87e-01 0.019 0.134 0.079 gdT L2
ENSG00000146409 SLC18B1 751663 sc-eQTL 7.98e-01 -0.0468 0.183 0.079 gdT L2
ENSG00000028839 TBPL1 -387168 sc-eQTL 2.58e-01 -0.167 0.147 0.087 intMono L2
ENSG00000093134 VNN3 830237 sc-eQTL 4.67e-01 0.103 0.142 0.087 intMono L2
ENSG00000112299 VNN1 850947 sc-eQTL 9.57e-01 0.00764 0.141 0.087 intMono L2
ENSG00000112303 VNN2 801543 sc-eQTL 4.16e-01 -0.116 0.143 0.087 intMono L2
ENSG00000112306 RPS12 750433 sc-eQTL 4.45e-01 -0.0475 0.0621 0.087 intMono L2
ENSG00000118515 SGK1 -753110 sc-eQTL 6.86e-01 0.0423 0.104 0.087 intMono L2
ENSG00000146409 SLC18B1 751663 sc-eQTL 9.06e-01 0.0178 0.151 0.087 intMono L2
ENSG00000286887 AL355881.1 -731299 sc-eQTL 4.40e-03 -0.409 0.142 0.087 intMono L2
ENSG00000028839 TBPL1 -387168 sc-eQTL 4.31e-01 -0.121 0.153 0.084 ncMono L2
ENSG00000093134 VNN3 830237 sc-eQTL 6.31e-01 0.0703 0.146 0.084 ncMono L2
ENSG00000112299 VNN1 850947 sc-eQTL 1.20e-01 -0.225 0.144 0.084 ncMono L2
ENSG00000112303 VNN2 801543 sc-eQTL 4.79e-01 -0.0988 0.139 0.084 ncMono L2
ENSG00000112306 RPS12 750433 sc-eQTL 2.20e-01 -0.0858 0.0697 0.084 ncMono L2
ENSG00000118515 SGK1 -753110 sc-eQTL 2.50e-01 0.114 0.0986 0.084 ncMono L2
ENSG00000146409 SLC18B1 751663 sc-eQTL 4.77e-01 -0.0878 0.123 0.084 ncMono L2
ENSG00000286887 AL355881.1 -731299 sc-eQTL 8.12e-01 -0.0311 0.131 0.084 ncMono L2
ENSG00000028839 TBPL1 -387168 sc-eQTL 6.80e-01 -0.0736 0.178 0.079 pDC L2
ENSG00000093134 VNN3 830237 sc-eQTL 4.15e-01 -0.0976 0.119 0.079 pDC L2
ENSG00000112299 VNN1 850947 sc-eQTL 9.81e-01 0.00285 0.122 0.079 pDC L2
ENSG00000112303 VNN2 801543 sc-eQTL 9.78e-01 -0.00395 0.145 0.079 pDC L2
ENSG00000112306 RPS12 750433 sc-eQTL 9.43e-01 -0.00714 0.0998 0.079 pDC L2
ENSG00000118515 SGK1 -753110 sc-eQTL 9.53e-02 0.169 0.101 0.079 pDC L2
ENSG00000146409 SLC18B1 751663 sc-eQTL 7.12e-01 0.0546 0.148 0.079 pDC L2
ENSG00000286438 AL591115.1 461874 sc-eQTL 9.01e-01 0.0177 0.141 0.079 pDC L2
ENSG00000286887 AL355881.1 -731299 sc-eQTL 8.40e-01 0.0254 0.125 0.079 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000028839 TBPL1 -387168 sc-eQTL 8.74e-01 -0.0243 0.152 0.088 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 801543 sc-eQTL 1.27e-01 0.202 0.132 0.088 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 750433 sc-eQTL 2.96e-01 0.0789 0.0753 0.088 B_Memory LOneK1K
ENSG00000118515 SGK1 -753110 sc-eQTL 7.56e-01 -0.0367 0.118 0.088 B_Memory LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 751663 sc-eQTL 8.63e-01 0.0238 0.139 0.088 B_Memory LOneK1K
ENSG00000028839 TBPL1 -387168 sc-eQTL 6.67e-01 0.0614 0.142 0.088 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 801543 sc-eQTL 6.83e-01 -0.051 0.125 0.088 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 750433 sc-eQTL 6.47e-01 -0.0346 0.0754 0.088 B_Naive LOneK1K
ENSG00000118515 SGK1 -753110 sc-eQTL 9.55e-01 -0.00656 0.117 0.088 B_Naive LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 751663 sc-eQTL 9.38e-01 0.0111 0.142 0.088 B_Naive LOneK1K
ENSG00000028839 TBPL1 -387168 sc-eQTL 1.47e-01 -0.168 0.115 0.088 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000093134 VNN3 830237 sc-eQTL 9.19e-01 -0.0134 0.131 0.088 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112299 VNN1 850947 sc-eQTL 5.51e-01 -0.0817 0.137 0.088 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 801543 sc-eQTL 1.87e-01 0.119 0.0901 0.088 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 750433 sc-eQTL 4.08e-01 0.0514 0.0619 0.088 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000118515 SGK1 -753110 sc-eQTL 5.19e-01 0.0545 0.0845 0.088 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 751663 sc-eQTL 3.46e-01 -0.104 0.11 0.088 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000286887 AL355881.1 -731299 sc-eQTL 9.71e-01 -0.00419 0.116 0.088 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000028839 TBPL1 -387168 sc-eQTL 3.97e-01 -0.127 0.15 0.086 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000093134 VNN3 830237 sc-eQTL 2.27e-01 0.176 0.145 0.086 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112299 VNN1 850947 sc-eQTL 2.86e-01 -0.154 0.144 0.086 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 801543 sc-eQTL 9.92e-01 0.0014 0.136 0.086 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 750433 sc-eQTL 3.63e-01 -0.0525 0.0576 0.086 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000118515 SGK1 -753110 sc-eQTL 8.42e-01 0.0175 0.0873 0.086 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 751663 sc-eQTL 4.32e-01 0.11 0.14 0.086 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000286887 AL355881.1 -731299 sc-eQTL 3.60e-02 -0.264 0.125 0.086 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000028839 TBPL1 -387168 sc-eQTL 1.12e-01 -0.192 0.12 0.086 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 801543 sc-eQTL 1.19e-01 -0.224 0.143 0.086 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 750433 sc-eQTL 3.22e-01 -0.0581 0.0585 0.086 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000118515 SGK1 -753110 sc-eQTL 9.40e-01 0.00907 0.121 0.086 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000220378 KRT8P42 -733693 eQTL 0.00786 -0.201 0.0756 0.00279 0.00115 0.0412

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000220378 KRT8P42 -733693 3.07e-07 1.33e-07 4.48e-08 2.01e-07 9.79e-08 9.05e-08 1.73e-07 5.53e-08 1.47e-07 6.08e-08 1.67e-07 1.08e-07 1.71e-07 7.64e-08 6.25e-08 7.23e-08 4.01e-08 1.44e-07 5.97e-08 4.31e-08 1.21e-07 1.26e-07 1.5e-07 2.79e-08 1.68e-07 1.25e-07 1.1e-07 9.92e-08 1.22e-07 9.49e-08 1.07e-07 3.26e-08 3.89e-08 8.89e-08 4.84e-08 3.2e-08 5.37e-08 9.25e-08 6.63e-08 4.47e-08 5.34e-08 1.5e-07 5.2e-08 1.35e-08 3.84e-08 1.86e-08 1.21e-07 3.81e-09 4.9e-08