logo

Genes within 1Mb (chr6:133540983:TAAAAC:T):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000028839 TBPL1 -411187 sc-eQTL 5.33e-01 -0.0718 0.115 0.152 B L1
ENSG00000112303 VNN2 777524 sc-eQTL 3.37e-01 -0.0828 0.0861 0.152 B L1
ENSG00000112306 RPS12 726414 sc-eQTL 5.16e-01 -0.0339 0.0521 0.152 B L1
ENSG00000118515 SGK1 -777129 sc-eQTL 4.92e-01 0.0552 0.0803 0.152 B L1
ENSG00000146409 SLC18B1 727644 sc-eQTL 2.97e-01 -0.115 0.109 0.152 B L1
ENSG00000028839 TBPL1 -411187 sc-eQTL 9.04e-01 -0.0102 0.0837 0.152 CD4T L1
ENSG00000112303 VNN2 777524 sc-eQTL 6.52e-01 -0.034 0.0754 0.152 CD4T L1
ENSG00000112306 RPS12 726414 sc-eQTL 8.62e-01 -0.0089 0.0513 0.152 CD4T L1
ENSG00000118515 SGK1 -777129 sc-eQTL 2.63e-01 0.0771 0.0687 0.152 CD4T L1
ENSG00000146409 SLC18B1 727644 sc-eQTL 1.01e-02 -0.265 0.102 0.152 CD4T L1
ENSG00000028839 TBPL1 -411187 sc-eQTL 5.33e-01 -0.0527 0.0845 0.152 CD8T L1
ENSG00000112303 VNN2 777524 sc-eQTL 3.35e-01 -0.0992 0.103 0.152 CD8T L1
ENSG00000112306 RPS12 726414 sc-eQTL 8.60e-01 0.0062 0.0352 0.152 CD8T L1
ENSG00000118515 SGK1 -777129 sc-eQTL 9.45e-01 0.00373 0.0543 0.152 CD8T L1
ENSG00000146409 SLC18B1 727644 sc-eQTL 1.64e-01 -0.148 0.106 0.152 CD8T L1
ENSG00000028839 TBPL1 -411187 sc-eQTL 7.42e-01 -0.043 0.13 0.144 DC L1
ENSG00000093134 VNN3 806218 sc-eQTL 5.32e-01 0.0629 0.1 0.144 DC L1
ENSG00000112299 VNN1 826928 sc-eQTL 6.55e-01 -0.0486 0.109 0.144 DC L1
ENSG00000112303 VNN2 777524 sc-eQTL 2.36e-01 -0.138 0.116 0.144 DC L1
ENSG00000112306 RPS12 726414 sc-eQTL 9.32e-01 0.00557 0.0651 0.144 DC L1
ENSG00000118515 SGK1 -777129 sc-eQTL 4.59e-01 -0.056 0.0755 0.144 DC L1
ENSG00000146409 SLC18B1 727644 sc-eQTL 6.77e-01 0.0429 0.103 0.144 DC L1
ENSG00000286438 AL591115.1 437855 sc-eQTL 4.89e-02 -0.184 0.0929 0.144 DC L1
ENSG00000286887 AL355881.1 -755318 sc-eQTL 6.83e-01 -0.0478 0.117 0.144 DC L1
ENSG00000028839 TBPL1 -411187 sc-eQTL 7.14e-01 -0.0324 0.0884 0.152 Mono L1
ENSG00000093134 VNN3 806218 sc-eQTL 5.04e-01 -0.0679 0.101 0.152 Mono L1
ENSG00000112299 VNN1 826928 sc-eQTL 8.25e-01 -0.0243 0.109 0.152 Mono L1
ENSG00000112303 VNN2 777524 sc-eQTL 5.75e-02 -0.146 0.0765 0.152 Mono L1
ENSG00000112306 RPS12 726414 sc-eQTL 4.44e-01 0.0354 0.0462 0.152 Mono L1
ENSG00000118515 SGK1 -777129 sc-eQTL 7.53e-01 0.0206 0.0652 0.152 Mono L1
ENSG00000146409 SLC18B1 727644 sc-eQTL 2.86e-01 -0.0975 0.0912 0.152 Mono L1
ENSG00000286887 AL355881.1 -755318 sc-eQTL 1.42e-01 0.132 0.0894 0.152 Mono L1
ENSG00000028839 TBPL1 -411187 sc-eQTL 4.68e-01 -0.0704 0.0969 0.15 NK L1
ENSG00000112303 VNN2 777524 sc-eQTL 9.67e-01 -0.00464 0.112 0.15 NK L1
ENSG00000112306 RPS12 726414 sc-eQTL 7.66e-01 -0.0138 0.0462 0.15 NK L1
ENSG00000118515 SGK1 -777129 sc-eQTL 2.49e-02 0.191 0.0844 0.15 NK L1
ENSG00000028839 TBPL1 -411187 sc-eQTL 3.36e-01 0.11 0.115 0.152 Other_T L1
ENSG00000112303 VNN2 777524 sc-eQTL 9.90e-01 -0.00133 0.109 0.152 Other_T L1
ENSG00000112306 RPS12 726414 sc-eQTL 6.02e-01 0.0226 0.0433 0.152 Other_T L1
ENSG00000118515 SGK1 -777129 sc-eQTL 3.17e-02 0.171 0.0789 0.152 Other_T L1
ENSG00000146409 SLC18B1 727644 sc-eQTL 3.90e-01 -0.102 0.118 0.152 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000028839 TBPL1 -411187 sc-eQTL 6.74e-01 -0.0563 0.134 0.156 B_Activated L2
ENSG00000112303 VNN2 777524 sc-eQTL 3.97e-01 -0.103 0.122 0.156 B_Activated L2
ENSG00000112306 RPS12 726414 sc-eQTL 3.74e-01 -0.0581 0.0652 0.156 B_Activated L2
ENSG00000118515 SGK1 -777129 sc-eQTL 6.32e-01 0.0559 0.116 0.156 B_Activated L2
ENSG00000146409 SLC18B1 727644 sc-eQTL 4.17e-01 -0.0929 0.114 0.156 B_Activated L2
ENSG00000028839 TBPL1 -411187 sc-eQTL 9.87e-01 -0.00198 0.126 0.152 B_Intermediate L2
ENSG00000112303 VNN2 777524 sc-eQTL 4.59e-01 -0.0807 0.109 0.152 B_Intermediate L2
ENSG00000112306 RPS12 726414 sc-eQTL 5.78e-01 -0.0372 0.0667 0.152 B_Intermediate L2
ENSG00000118515 SGK1 -777129 sc-eQTL 5.08e-01 0.0765 0.115 0.152 B_Intermediate L2
ENSG00000146409 SLC18B1 727644 sc-eQTL 3.96e-01 -0.102 0.12 0.152 B_Intermediate L2
ENSG00000028839 TBPL1 -411187 sc-eQTL 7.71e-01 0.035 0.12 0.151 B_Memory L2
ENSG00000112303 VNN2 777524 sc-eQTL 2.61e-02 -0.251 0.112 0.151 B_Memory L2
ENSG00000112306 RPS12 726414 sc-eQTL 6.92e-01 -0.0217 0.0547 0.151 B_Memory L2
ENSG00000118515 SGK1 -777129 sc-eQTL 6.40e-01 -0.0469 0.1 0.151 B_Memory L2
ENSG00000146409 SLC18B1 727644 sc-eQTL 8.72e-01 -0.0184 0.114 0.151 B_Memory L2
ENSG00000028839 TBPL1 -411187 sc-eQTL 3.45e-01 -0.109 0.115 0.152 B_Naive1 L2
ENSG00000112303 VNN2 777524 sc-eQTL 3.34e-01 0.104 0.107 0.152 B_Naive1 L2
ENSG00000112306 RPS12 726414 sc-eQTL 3.22e-01 -0.0606 0.061 0.152 B_Naive1 L2
ENSG00000118515 SGK1 -777129 sc-eQTL 9.04e-01 -0.0116 0.0956 0.152 B_Naive1 L2
ENSG00000146409 SLC18B1 727644 sc-eQTL 7.39e-01 -0.0393 0.118 0.152 B_Naive1 L2
ENSG00000028839 TBPL1 -411187 sc-eQTL 2.21e-01 -0.149 0.122 0.15 B_Naive2 L2
ENSG00000112303 VNN2 777524 sc-eQTL 4.51e-01 -0.0899 0.119 0.15 B_Naive2 L2
ENSG00000112306 RPS12 726414 sc-eQTL 4.48e-01 -0.0479 0.063 0.15 B_Naive2 L2
ENSG00000118515 SGK1 -777129 sc-eQTL 9.51e-01 -0.00688 0.111 0.15 B_Naive2 L2
ENSG00000146409 SLC18B1 727644 sc-eQTL 1.09e-01 -0.193 0.12 0.15 B_Naive2 L2
ENSG00000028839 TBPL1 -411187 sc-eQTL 7.08e-01 -0.0456 0.121 0.145 CD4_CTL L2
ENSG00000112303 VNN2 777524 sc-eQTL 9.26e-02 -0.204 0.121 0.145 CD4_CTL L2
ENSG00000112306 RPS12 726414 sc-eQTL 4.00e-01 0.0473 0.0561 0.145 CD4_CTL L2
ENSG00000118515 SGK1 -777129 sc-eQTL 3.35e-01 0.0939 0.0972 0.145 CD4_CTL L2
ENSG00000146409 SLC18B1 727644 sc-eQTL 5.69e-01 0.0645 0.113 0.145 CD4_CTL L2
ENSG00000028839 TBPL1 -411187 sc-eQTL 5.74e-01 -0.0539 0.0957 0.152 CD4_Naive L2
ENSG00000112303 VNN2 777524 sc-eQTL 7.69e-01 -0.0255 0.087 0.152 CD4_Naive L2
ENSG00000112306 RPS12 726414 sc-eQTL 7.51e-01 0.0179 0.0564 0.152 CD4_Naive L2
ENSG00000118515 SGK1 -777129 sc-eQTL 4.24e-01 0.0553 0.069 0.152 CD4_Naive L2
ENSG00000146409 SLC18B1 727644 sc-eQTL 2.45e-02 -0.243 0.107 0.152 CD4_Naive L2
ENSG00000028839 TBPL1 -411187 sc-eQTL 3.79e-01 0.0905 0.103 0.152 CD4_TCM L2
ENSG00000112303 VNN2 777524 sc-eQTL 2.74e-01 -0.112 0.102 0.152 CD4_TCM L2
ENSG00000112306 RPS12 726414 sc-eQTL 8.46e-01 0.0103 0.0529 0.152 CD4_TCM L2
ENSG00000118515 SGK1 -777129 sc-eQTL 9.06e-01 -0.00877 0.0741 0.152 CD4_TCM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 727644 sc-eQTL 2.44e-02 -0.275 0.121 0.152 CD4_TCM L2
ENSG00000028839 TBPL1 -411187 sc-eQTL 8.69e-01 0.0197 0.119 0.152 CD4_TEM L2
ENSG00000112303 VNN2 777524 sc-eQTL 9.63e-01 0.00528 0.115 0.152 CD4_TEM L2
ENSG00000112306 RPS12 726414 sc-eQTL 6.98e-01 -0.0183 0.047 0.152 CD4_TEM L2
ENSG00000118515 SGK1 -777129 sc-eQTL 6.67e-01 0.0349 0.0808 0.152 CD4_TEM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 727644 sc-eQTL 2.36e-01 -0.138 0.117 0.152 CD4_TEM L2
ENSG00000028839 TBPL1 -411187 sc-eQTL 6.71e-01 -0.0456 0.107 0.152 CD8_CTL L2
ENSG00000112303 VNN2 777524 sc-eQTL 4.22e-01 -0.0915 0.114 0.152 CD8_CTL L2
ENSG00000112306 RPS12 726414 sc-eQTL 6.44e-01 -0.0282 0.061 0.152 CD8_CTL L2
ENSG00000118515 SGK1 -777129 sc-eQTL 3.92e-01 0.0882 0.103 0.152 CD8_CTL L2
ENSG00000146409 SLC18B1 727644 sc-eQTL 1.09e-01 -0.189 0.118 0.152 CD8_CTL L2
ENSG00000028839 TBPL1 -411187 sc-eQTL 8.65e-01 -0.0193 0.113 0.152 CD8_Naive L2
ENSG00000112303 VNN2 777524 sc-eQTL 9.78e-01 0.00285 0.104 0.152 CD8_Naive L2
ENSG00000112306 RPS12 726414 sc-eQTL 5.46e-01 -0.0359 0.0594 0.152 CD8_Naive L2
ENSG00000118515 SGK1 -777129 sc-eQTL 9.16e-02 0.126 0.0741 0.152 CD8_Naive L2
ENSG00000146409 SLC18B1 727644 sc-eQTL 1.26e-01 -0.182 0.119 0.152 CD8_Naive L2
ENSG00000028839 TBPL1 -411187 sc-eQTL 4.55e-01 -0.0971 0.13 0.146 CD8_TCM L2
ENSG00000112303 VNN2 777524 sc-eQTL 7.76e-01 0.0339 0.119 0.146 CD8_TCM L2
ENSG00000112306 RPS12 726414 sc-eQTL 1.07e-01 0.0934 0.0577 0.146 CD8_TCM L2
ENSG00000118515 SGK1 -777129 sc-eQTL 9.80e-01 -0.00236 0.0962 0.146 CD8_TCM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 727644 sc-eQTL 2.02e-01 -0.162 0.127 0.146 CD8_TCM L2
ENSG00000028839 TBPL1 -411187 sc-eQTL 7.42e-01 0.0375 0.114 0.155 CD8_TEM L2
ENSG00000112303 VNN2 777524 sc-eQTL 1.20e-01 -0.191 0.123 0.155 CD8_TEM L2
ENSG00000112306 RPS12 726414 sc-eQTL 9.48e-01 0.00436 0.0664 0.155 CD8_TEM L2
ENSG00000118515 SGK1 -777129 sc-eQTL 3.90e-01 -0.0935 0.109 0.155 CD8_TEM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 727644 sc-eQTL 9.85e-01 -0.00239 0.126 0.155 CD8_TEM L2
ENSG00000028839 TBPL1 -411187 sc-eQTL 9.37e-02 0.201 0.119 0.152 MAIT L2
ENSG00000112303 VNN2 777524 sc-eQTL 5.24e-01 -0.074 0.116 0.152 MAIT L2
ENSG00000112306 RPS12 726414 sc-eQTL 4.20e-01 0.0461 0.057 0.152 MAIT L2
ENSG00000118515 SGK1 -777129 sc-eQTL 1.13e-01 0.127 0.0799 0.152 MAIT L2
ENSG00000146409 SLC18B1 727644 sc-eQTL 9.80e-01 -0.00304 0.12 0.152 MAIT L2
ENSG00000028839 TBPL1 -411187 sc-eQTL 2.10e-01 0.159 0.126 0.149 NK_CD56bright L2
ENSG00000112303 VNN2 777524 sc-eQTL 7.68e-01 -0.0353 0.12 0.149 NK_CD56bright L2
ENSG00000112306 RPS12 726414 sc-eQTL 7.94e-02 -0.117 0.0661 0.149 NK_CD56bright L2
ENSG00000118515 SGK1 -777129 sc-eQTL 1.89e-01 0.131 0.0991 0.149 NK_CD56bright L2
ENSG00000028839 TBPL1 -411187 sc-eQTL 7.81e-01 0.0291 0.105 0.149 NK_CD56dim L2
ENSG00000112303 VNN2 777524 sc-eQTL 5.56e-01 0.0706 0.12 0.149 NK_CD56dim L2
ENSG00000112306 RPS12 726414 sc-eQTL 7.40e-01 -0.0158 0.0476 0.149 NK_CD56dim L2
ENSG00000118515 SGK1 -777129 sc-eQTL 7.08e-01 0.0395 0.105 0.149 NK_CD56dim L2
ENSG00000028839 TBPL1 -411187 sc-eQTL 9.91e-01 0.00151 0.136 0.151 NK_HLA L2
ENSG00000112303 VNN2 777524 sc-eQTL 3.07e-01 -0.128 0.125 0.151 NK_HLA L2
ENSG00000112306 RPS12 726414 sc-eQTL 7.27e-01 -0.0205 0.0585 0.151 NK_HLA L2
ENSG00000118515 SGK1 -777129 sc-eQTL 3.49e-01 -0.108 0.115 0.151 NK_HLA L2
ENSG00000028839 TBPL1 -411187 sc-eQTL 3.53e-01 -0.101 0.108 0.149 NK_cytokine L2
ENSG00000112303 VNN2 777524 sc-eQTL 8.21e-01 -0.0267 0.118 0.149 NK_cytokine L2
ENSG00000112306 RPS12 726414 sc-eQTL 6.18e-01 -0.0319 0.064 0.149 NK_cytokine L2
ENSG00000118515 SGK1 -777129 sc-eQTL 1.59e-02 0.256 0.105 0.149 NK_cytokine L2
ENSG00000028839 TBPL1 -411187 sc-eQTL 8.21e-02 0.262 0.149 0.163 PB L2
ENSG00000112303 VNN2 777524 sc-eQTL 3.30e-01 -0.128 0.131 0.163 PB L2
ENSG00000112306 RPS12 726414 sc-eQTL 6.63e-01 0.0326 0.0747 0.163 PB L2
ENSG00000118515 SGK1 -777129 sc-eQTL 1.88e-01 0.159 0.12 0.163 PB L2
ENSG00000146409 SLC18B1 727644 sc-eQTL 3.47e-01 -0.132 0.14 0.163 PB L2
ENSG00000028839 TBPL1 -411187 sc-eQTL 7.22e-01 0.0435 0.122 0.152 Pro_T L2
ENSG00000112303 VNN2 777524 sc-eQTL 9.40e-01 0.00887 0.117 0.152 Pro_T L2
ENSG00000112306 RPS12 726414 sc-eQTL 9.90e-01 0.000562 0.0442 0.152 Pro_T L2
ENSG00000118515 SGK1 -777129 sc-eQTL 4.07e-01 0.0735 0.0884 0.152 Pro_T L2
ENSG00000146409 SLC18B1 727644 sc-eQTL 5.86e-01 -0.0623 0.114 0.152 Pro_T L2
ENSG00000028839 TBPL1 -411187 sc-eQTL 4.08e-01 -0.102 0.123 0.152 Treg L2
ENSG00000112303 VNN2 777524 sc-eQTL 5.62e-01 -0.0565 0.0974 0.152 Treg L2
ENSG00000112306 RPS12 726414 sc-eQTL 7.86e-01 -0.0117 0.0431 0.152 Treg L2
ENSG00000118515 SGK1 -777129 sc-eQTL 2.76e-01 0.0989 0.0906 0.152 Treg L2
ENSG00000146409 SLC18B1 727644 sc-eQTL 6.02e-01 0.0637 0.122 0.152 Treg L2
ENSG00000028839 TBPL1 -411187 sc-eQTL 7.06e-01 -0.0499 0.132 0.149 cDC L2
ENSG00000093134 VNN3 806218 sc-eQTL 5.92e-01 -0.0555 0.103 0.149 cDC L2
ENSG00000112299 VNN1 826928 sc-eQTL 5.14e-01 -0.0793 0.121 0.149 cDC L2
ENSG00000112303 VNN2 777524 sc-eQTL 8.62e-02 -0.202 0.117 0.149 cDC L2
ENSG00000112306 RPS12 726414 sc-eQTL 3.62e-01 -0.0532 0.0583 0.149 cDC L2
ENSG00000118515 SGK1 -777129 sc-eQTL 9.92e-01 0.00101 0.0984 0.149 cDC L2
ENSG00000146409 SLC18B1 727644 sc-eQTL 5.78e-01 -0.0644 0.116 0.149 cDC L2
ENSG00000286438 AL591115.1 437855 sc-eQTL 3.63e-01 -0.084 0.0922 0.149 cDC L2
ENSG00000286887 AL355881.1 -755318 sc-eQTL 8.92e-01 0.0155 0.114 0.149 cDC L2
ENSG00000028839 TBPL1 -411187 sc-eQTL 1.13e-01 -0.163 0.102 0.152 cMono_IL1B L2
ENSG00000093134 VNN3 806218 sc-eQTL 9.34e-01 0.00912 0.111 0.152 cMono_IL1B L2
ENSG00000112299 VNN1 826928 sc-eQTL 9.25e-01 0.0104 0.112 0.152 cMono_IL1B L2
ENSG00000112303 VNN2 777524 sc-eQTL 1.06e-01 -0.144 0.0887 0.152 cMono_IL1B L2
ENSG00000112306 RPS12 726414 sc-eQTL 3.50e-01 0.0463 0.0494 0.152 cMono_IL1B L2
ENSG00000118515 SGK1 -777129 sc-eQTL 9.93e-01 0.000622 0.0739 0.152 cMono_IL1B L2
ENSG00000146409 SLC18B1 727644 sc-eQTL 8.26e-01 -0.0211 0.0956 0.152 cMono_IL1B L2
ENSG00000286887 AL355881.1 -755318 sc-eQTL 3.12e-01 0.101 0.0993 0.152 cMono_IL1B L2
ENSG00000028839 TBPL1 -411187 sc-eQTL 6.34e-01 0.0559 0.117 0.152 cMono_S100A L2
ENSG00000093134 VNN3 806218 sc-eQTL 2.03e-01 -0.135 0.106 0.152 cMono_S100A L2
ENSG00000112299 VNN1 826928 sc-eQTL 4.06e-01 -0.0958 0.115 0.152 cMono_S100A L2
ENSG00000112303 VNN2 777524 sc-eQTL 1.02e-02 -0.192 0.0742 0.152 cMono_S100A L2
ENSG00000112306 RPS12 726414 sc-eQTL 4.49e-01 0.0411 0.0542 0.152 cMono_S100A L2
ENSG00000118515 SGK1 -777129 sc-eQTL 3.91e-01 0.0532 0.062 0.152 cMono_S100A L2
ENSG00000146409 SLC18B1 727644 sc-eQTL 8.11e-03 -0.264 0.0988 0.152 cMono_S100A L2
ENSG00000286887 AL355881.1 -755318 sc-eQTL 6.27e-01 0.0479 0.0982 0.152 cMono_S100A L2
ENSG00000028839 TBPL1 -411187 sc-eQTL 4.10e-01 0.121 0.146 0.158 gdT L2
ENSG00000112303 VNN2 777524 sc-eQTL 1.19e-01 0.217 0.138 0.158 gdT L2
ENSG00000112306 RPS12 726414 sc-eQTL 9.91e-01 0.000623 0.0531 0.158 gdT L2
ENSG00000118515 SGK1 -777129 sc-eQTL 4.12e-01 0.0823 0.1 0.158 gdT L2
ENSG00000146409 SLC18B1 727644 sc-eQTL 1.97e-01 -0.177 0.137 0.158 gdT L2
ENSG00000028839 TBPL1 -411187 sc-eQTL 9.81e-01 -0.00281 0.12 0.144 intMono L2
ENSG00000093134 VNN3 806218 sc-eQTL 1.22e-01 -0.179 0.115 0.144 intMono L2
ENSG00000112299 VNN1 826928 sc-eQTL 2.82e-01 -0.123 0.114 0.144 intMono L2
ENSG00000112303 VNN2 777524 sc-eQTL 3.86e-01 -0.101 0.116 0.144 intMono L2
ENSG00000112306 RPS12 726414 sc-eQTL 4.03e-01 -0.0423 0.0505 0.144 intMono L2
ENSG00000118515 SGK1 -777129 sc-eQTL 4.92e-01 0.0584 0.0849 0.144 intMono L2
ENSG00000146409 SLC18B1 727644 sc-eQTL 7.83e-01 -0.034 0.123 0.144 intMono L2
ENSG00000286887 AL355881.1 -755318 sc-eQTL 9.63e-01 0.00554 0.118 0.144 intMono L2
ENSG00000028839 TBPL1 -411187 sc-eQTL 4.99e-01 0.0825 0.122 0.156 ncMono L2
ENSG00000093134 VNN3 806218 sc-eQTL 2.26e-01 -0.141 0.116 0.156 ncMono L2
ENSG00000112299 VNN1 826928 sc-eQTL 7.12e-01 -0.0426 0.115 0.156 ncMono L2
ENSG00000112303 VNN2 777524 sc-eQTL 3.70e-01 -0.0995 0.111 0.156 ncMono L2
ENSG00000112306 RPS12 726414 sc-eQTL 4.19e-01 0.045 0.0556 0.156 ncMono L2
ENSG00000118515 SGK1 -777129 sc-eQTL 9.37e-01 -0.00623 0.0788 0.156 ncMono L2
ENSG00000146409 SLC18B1 727644 sc-eQTL 9.34e-01 0.00815 0.0983 0.156 ncMono L2
ENSG00000286887 AL355881.1 -755318 sc-eQTL 2.03e-01 0.132 0.104 0.156 ncMono L2
ENSG00000028839 TBPL1 -411187 sc-eQTL 3.91e-01 0.118 0.137 0.15 pDC L2
ENSG00000093134 VNN3 806218 sc-eQTL 2.50e-01 0.106 0.0919 0.15 pDC L2
ENSG00000112299 VNN1 826928 sc-eQTL 2.20e-01 -0.115 0.0934 0.15 pDC L2
ENSG00000112303 VNN2 777524 sc-eQTL 2.97e-01 -0.116 0.111 0.15 pDC L2
ENSG00000112306 RPS12 726414 sc-eQTL 9.65e-01 0.00337 0.077 0.15 pDC L2
ENSG00000118515 SGK1 -777129 sc-eQTL 6.24e-01 -0.0384 0.0782 0.15 pDC L2
ENSG00000146409 SLC18B1 727644 sc-eQTL 5.29e-02 0.22 0.113 0.15 pDC L2
ENSG00000286438 AL591115.1 437855 sc-eQTL 1.24e-01 -0.167 0.108 0.15 pDC L2
ENSG00000286887 AL355881.1 -755318 sc-eQTL 6.20e-01 0.0481 0.0966 0.15 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000028839 TBPL1 -411187 sc-eQTL 5.24e-01 -0.0774 0.121 0.152 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 777524 sc-eQTL 6.05e-02 -0.198 0.105 0.152 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 726414 sc-eQTL 4.71e-01 -0.0434 0.0601 0.152 B_Memory LOneK1K
ENSG00000118515 SGK1 -777129 sc-eQTL 6.84e-01 0.0384 0.0941 0.152 B_Memory LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 727644 sc-eQTL 4.42e-01 -0.085 0.11 0.152 B_Memory LOneK1K
ENSG00000028839 TBPL1 -411187 sc-eQTL 1.34e-01 -0.172 0.114 0.152 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 777524 sc-eQTL 7.51e-01 0.0319 0.1 0.152 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 726414 sc-eQTL 3.20e-01 -0.0604 0.0606 0.152 B_Naive LOneK1K
ENSG00000118515 SGK1 -777129 sc-eQTL 9.26e-01 -0.00876 0.0941 0.152 B_Naive LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 727644 sc-eQTL 3.08e-01 -0.117 0.114 0.152 B_Naive LOneK1K
ENSG00000028839 TBPL1 -411187 sc-eQTL 4.13e-01 -0.0768 0.0938 0.152 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000093134 VNN3 806218 sc-eQTL 8.02e-01 -0.0268 0.106 0.152 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112299 VNN1 826928 sc-eQTL 9.28e-01 -0.0101 0.111 0.152 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 777524 sc-eQTL 1.08e-01 -0.118 0.0729 0.152 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 726414 sc-eQTL 5.40e-01 0.0309 0.0503 0.152 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000118515 SGK1 -777129 sc-eQTL 9.73e-01 0.00229 0.0686 0.152 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 727644 sc-eQTL 2.91e-01 -0.0946 0.0893 0.152 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000286887 AL355881.1 -755318 sc-eQTL 5.14e-01 0.0613 0.0938 0.152 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000028839 TBPL1 -411187 sc-eQTL 5.60e-01 0.0689 0.118 0.151 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000093134 VNN3 806218 sc-eQTL 6.33e-02 -0.212 0.114 0.151 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112299 VNN1 826928 sc-eQTL 3.75e-01 -0.101 0.113 0.151 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 777524 sc-eQTL 2.58e-01 -0.121 0.107 0.151 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 726414 sc-eQTL 4.42e-01 0.035 0.0454 0.151 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000118515 SGK1 -777129 sc-eQTL 5.80e-01 0.0381 0.0688 0.151 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 727644 sc-eQTL 7.42e-01 0.0364 0.11 0.151 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000286887 AL355881.1 -755318 sc-eQTL 2.49e-01 0.115 0.0995 0.151 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000028839 TBPL1 -411187 sc-eQTL 8.47e-01 -0.0188 0.0973 0.149 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 777524 sc-eQTL 9.88e-01 -0.0017 0.116 0.149 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 726414 sc-eQTL 9.34e-01 -0.00389 0.0472 0.149 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000118515 SGK1 -777129 sc-eQTL 6.87e-02 0.177 0.0968 0.149 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000112299 VNN1 826928 pQTL 0.000417 -0.174 0.0492 0.0 0.0 0.154
ENSG00000112306 RPS12 726414 eQTL 0.0481 0.0166 0.00841 0.0 0.0 0.156

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina