logo

Genes within 1Mb (chr6:133537162:G:A):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000028839 TBPL1 -415008 sc-eQTL 2.86e-02 -0.285 0.129 0.098 B L1
ENSG00000112303 VNN2 773703 sc-eQTL 6.68e-01 -0.042 0.0979 0.098 B L1
ENSG00000112306 RPS12 722593 sc-eQTL 5.74e-01 -0.0333 0.0592 0.098 B L1
ENSG00000118515 SGK1 -780950 sc-eQTL 1.16e-01 -0.143 0.0908 0.098 B L1
ENSG00000146409 SLC18B1 723823 sc-eQTL 5.00e-01 0.0842 0.125 0.098 B L1
ENSG00000028839 TBPL1 -415008 sc-eQTL 1.38e-02 -0.239 0.0963 0.098 CD4T L1
ENSG00000112303 VNN2 773703 sc-eQTL 3.91e-01 0.0755 0.0878 0.098 CD4T L1
ENSG00000112306 RPS12 722593 sc-eQTL 2.68e-01 0.0663 0.0596 0.098 CD4T L1
ENSG00000118515 SGK1 -780950 sc-eQTL 8.34e-01 -0.0169 0.0804 0.098 CD4T L1
ENSG00000146409 SLC18B1 723823 sc-eQTL 8.93e-01 -0.0164 0.121 0.098 CD4T L1
ENSG00000028839 TBPL1 -415008 sc-eQTL 5.66e-01 -0.0558 0.097 0.098 CD8T L1
ENSG00000112303 VNN2 773703 sc-eQTL 1.31e-01 0.178 0.118 0.098 CD8T L1
ENSG00000112306 RPS12 722593 sc-eQTL 4.57e-01 0.0301 0.0404 0.098 CD8T L1
ENSG00000118515 SGK1 -780950 sc-eQTL 4.37e-01 0.0484 0.0622 0.098 CD8T L1
ENSG00000146409 SLC18B1 723823 sc-eQTL 6.06e-01 0.0632 0.122 0.098 CD8T L1
ENSG00000028839 TBPL1 -415008 sc-eQTL 6.93e-01 -0.0582 0.147 0.101 DC L1
ENSG00000093134 VNN3 802397 sc-eQTL 3.27e-01 0.111 0.113 0.101 DC L1
ENSG00000112299 VNN1 823107 sc-eQTL 3.25e-01 0.121 0.122 0.101 DC L1
ENSG00000112303 VNN2 773703 sc-eQTL 2.64e-01 0.146 0.131 0.101 DC L1
ENSG00000112306 RPS12 722593 sc-eQTL 2.37e-01 0.087 0.0733 0.101 DC L1
ENSG00000118515 SGK1 -780950 sc-eQTL 1.27e-02 -0.211 0.084 0.101 DC L1
ENSG00000146409 SLC18B1 723823 sc-eQTL 3.42e-01 -0.111 0.116 0.101 DC L1
ENSG00000286438 AL591115.1 434034 sc-eQTL 5.21e-02 0.205 0.105 0.101 DC L1
ENSG00000286887 AL355881.1 -759139 sc-eQTL 5.56e-01 -0.0779 0.132 0.101 DC L1
ENSG00000028839 TBPL1 -415008 sc-eQTL 5.01e-01 -0.0688 0.102 0.098 Mono L1
ENSG00000093134 VNN3 802397 sc-eQTL 5.60e-02 -0.224 0.116 0.098 Mono L1
ENSG00000112299 VNN1 823107 sc-eQTL 6.20e-01 0.0626 0.126 0.098 Mono L1
ENSG00000112303 VNN2 773703 sc-eQTL 3.51e-02 0.187 0.0882 0.098 Mono L1
ENSG00000112306 RPS12 722593 sc-eQTL 7.38e-01 0.0179 0.0534 0.098 Mono L1
ENSG00000118515 SGK1 -780950 sc-eQTL 2.31e-01 -0.0903 0.0752 0.098 Mono L1
ENSG00000146409 SLC18B1 723823 sc-eQTL 6.68e-01 0.0454 0.106 0.098 Mono L1
ENSG00000286887 AL355881.1 -759139 sc-eQTL 2.97e-02 -0.225 0.103 0.098 Mono L1
ENSG00000028839 TBPL1 -415008 sc-eQTL 6.76e-01 0.0471 0.113 0.099 NK L1
ENSG00000112303 VNN2 773703 sc-eQTL 6.88e-01 0.0521 0.13 0.099 NK L1
ENSG00000112306 RPS12 722593 sc-eQTL 7.20e-01 -0.0192 0.0536 0.099 NK L1
ENSG00000118515 SGK1 -780950 sc-eQTL 4.37e-01 -0.0771 0.099 0.099 NK L1
ENSG00000028839 TBPL1 -415008 sc-eQTL 9.07e-01 -0.0155 0.133 0.098 Other_T L1
ENSG00000112303 VNN2 773703 sc-eQTL 6.46e-01 0.0582 0.127 0.098 Other_T L1
ENSG00000112306 RPS12 722593 sc-eQTL 7.28e-01 0.0175 0.0502 0.098 Other_T L1
ENSG00000118515 SGK1 -780950 sc-eQTL 9.30e-01 0.00809 0.0924 0.098 Other_T L1
ENSG00000146409 SLC18B1 723823 sc-eQTL 3.83e-01 -0.12 0.137 0.098 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000028839 TBPL1 -415008 sc-eQTL 8.42e-01 0.0297 0.149 0.11 B_Activated L2
ENSG00000112303 VNN2 773703 sc-eQTL 3.56e-01 0.125 0.136 0.11 B_Activated L2
ENSG00000112306 RPS12 722593 sc-eQTL 6.03e-01 0.0379 0.0727 0.11 B_Activated L2
ENSG00000118515 SGK1 -780950 sc-eQTL 7.13e-01 -0.0478 0.13 0.11 B_Activated L2
ENSG00000146409 SLC18B1 723823 sc-eQTL 2.45e-01 0.148 0.127 0.11 B_Activated L2
ENSG00000028839 TBPL1 -415008 sc-eQTL 2.06e-01 -0.183 0.145 0.099 B_Intermediate L2
ENSG00000112303 VNN2 773703 sc-eQTL 8.55e-01 -0.023 0.126 0.099 B_Intermediate L2
ENSG00000112306 RPS12 722593 sc-eQTL 7.34e-01 -0.0261 0.0769 0.099 B_Intermediate L2
ENSG00000118515 SGK1 -780950 sc-eQTL 9.97e-02 -0.219 0.132 0.099 B_Intermediate L2
ENSG00000146409 SLC18B1 723823 sc-eQTL 5.86e-01 0.0756 0.138 0.099 B_Intermediate L2
ENSG00000028839 TBPL1 -415008 sc-eQTL 9.39e-01 0.0106 0.139 0.099 B_Memory L2
ENSG00000112303 VNN2 773703 sc-eQTL 1.21e-01 -0.204 0.131 0.099 B_Memory L2
ENSG00000112306 RPS12 722593 sc-eQTL 6.34e-01 -0.0302 0.0633 0.099 B_Memory L2
ENSG00000118515 SGK1 -780950 sc-eQTL 2.84e-02 -0.254 0.115 0.099 B_Memory L2
ENSG00000146409 SLC18B1 723823 sc-eQTL 7.20e-01 -0.0475 0.132 0.099 B_Memory L2
ENSG00000028839 TBPL1 -415008 sc-eQTL 1.11e-01 -0.212 0.133 0.098 B_Naive1 L2
ENSG00000112303 VNN2 773703 sc-eQTL 9.03e-01 -0.0152 0.125 0.098 B_Naive1 L2
ENSG00000112306 RPS12 722593 sc-eQTL 8.81e-01 0.0106 0.071 0.098 B_Naive1 L2
ENSG00000118515 SGK1 -780950 sc-eQTL 1.60e-01 -0.156 0.111 0.098 B_Naive1 L2
ENSG00000146409 SLC18B1 723823 sc-eQTL 1.73e-02 0.325 0.135 0.098 B_Naive1 L2
ENSG00000028839 TBPL1 -415008 sc-eQTL 6.14e-01 -0.0713 0.141 0.099 B_Naive2 L2
ENSG00000112303 VNN2 773703 sc-eQTL 2.09e-01 -0.173 0.137 0.099 B_Naive2 L2
ENSG00000112306 RPS12 722593 sc-eQTL 9.83e-01 0.00151 0.0729 0.099 B_Naive2 L2
ENSG00000118515 SGK1 -780950 sc-eQTL 3.91e-01 0.11 0.129 0.099 B_Naive2 L2
ENSG00000146409 SLC18B1 723823 sc-eQTL 1.16e-01 -0.218 0.138 0.099 B_Naive2 L2
ENSG00000028839 TBPL1 -415008 sc-eQTL 1.41e-01 0.209 0.141 0.098 CD4_CTL L2
ENSG00000112303 VNN2 773703 sc-eQTL 8.17e-01 0.0331 0.142 0.098 CD4_CTL L2
ENSG00000112306 RPS12 722593 sc-eQTL 2.09e-01 0.0827 0.0656 0.098 CD4_CTL L2
ENSG00000118515 SGK1 -780950 sc-eQTL 9.27e-01 -0.0105 0.114 0.098 CD4_CTL L2
ENSG00000146409 SLC18B1 723823 sc-eQTL 8.31e-02 0.229 0.132 0.098 CD4_CTL L2
ENSG00000028839 TBPL1 -415008 sc-eQTL 6.85e-02 -0.203 0.111 0.098 CD4_Naive L2
ENSG00000112303 VNN2 773703 sc-eQTL 9.85e-01 -0.00197 0.102 0.098 CD4_Naive L2
ENSG00000112306 RPS12 722593 sc-eQTL 3.75e-01 0.0585 0.0658 0.098 CD4_Naive L2
ENSG00000118515 SGK1 -780950 sc-eQTL 9.42e-01 0.00585 0.0807 0.098 CD4_Naive L2
ENSG00000146409 SLC18B1 723823 sc-eQTL 4.65e-01 -0.0927 0.127 0.098 CD4_Naive L2
ENSG00000028839 TBPL1 -415008 sc-eQTL 7.22e-02 -0.215 0.119 0.098 CD4_TCM L2
ENSG00000112303 VNN2 773703 sc-eQTL 1.65e-02 0.284 0.118 0.098 CD4_TCM L2
ENSG00000112306 RPS12 722593 sc-eQTL 4.96e-01 0.0421 0.0617 0.098 CD4_TCM L2
ENSG00000118515 SGK1 -780950 sc-eQTL 1.46e-01 -0.125 0.086 0.098 CD4_TCM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 723823 sc-eQTL 1.20e-01 0.222 0.142 0.098 CD4_TCM L2
ENSG00000028839 TBPL1 -415008 sc-eQTL 5.96e-01 0.0736 0.139 0.098 CD4_TEM L2
ENSG00000112303 VNN2 773703 sc-eQTL 2.20e-01 -0.163 0.133 0.098 CD4_TEM L2
ENSG00000112306 RPS12 722593 sc-eQTL 1.62e-01 0.0764 0.0544 0.098 CD4_TEM L2
ENSG00000118515 SGK1 -780950 sc-eQTL 7.77e-02 -0.165 0.0932 0.098 CD4_TEM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 723823 sc-eQTL 4.33e-01 -0.106 0.136 0.098 CD4_TEM L2
ENSG00000028839 TBPL1 -415008 sc-eQTL 8.72e-01 -0.02 0.124 0.098 CD8_CTL L2
ENSG00000112303 VNN2 773703 sc-eQTL 2.93e-01 0.139 0.132 0.098 CD8_CTL L2
ENSG00000112306 RPS12 722593 sc-eQTL 1.17e-01 0.111 0.0703 0.098 CD8_CTL L2
ENSG00000118515 SGK1 -780950 sc-eQTL 1.88e-01 -0.157 0.119 0.098 CD8_CTL L2
ENSG00000146409 SLC18B1 723823 sc-eQTL 5.23e-01 0.0875 0.137 0.098 CD8_CTL L2
ENSG00000028839 TBPL1 -415008 sc-eQTL 7.08e-01 0.0491 0.131 0.098 CD8_Naive L2
ENSG00000112303 VNN2 773703 sc-eQTL 9.00e-01 0.0151 0.12 0.098 CD8_Naive L2
ENSG00000112306 RPS12 722593 sc-eQTL 7.10e-02 0.124 0.0683 0.098 CD8_Naive L2
ENSG00000118515 SGK1 -780950 sc-eQTL 5.20e-01 0.0556 0.0863 0.098 CD8_Naive L2
ENSG00000146409 SLC18B1 723823 sc-eQTL 8.55e-01 0.0252 0.138 0.098 CD8_Naive L2
ENSG00000028839 TBPL1 -415008 sc-eQTL 1.63e-01 -0.21 0.15 0.1 CD8_TCM L2
ENSG00000112303 VNN2 773703 sc-eQTL 5.93e-01 -0.0742 0.139 0.1 CD8_TCM L2
ENSG00000112306 RPS12 722593 sc-eQTL 6.97e-01 0.0263 0.0675 0.1 CD8_TCM L2
ENSG00000118515 SGK1 -780950 sc-eQTL 9.55e-01 -0.00626 0.112 0.1 CD8_TCM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 723823 sc-eQTL 9.57e-01 0.00797 0.148 0.1 CD8_TCM L2
ENSG00000028839 TBPL1 -415008 sc-eQTL 6.04e-01 0.0712 0.137 0.098 CD8_TEM L2
ENSG00000112303 VNN2 773703 sc-eQTL 2.87e-01 0.158 0.148 0.098 CD8_TEM L2
ENSG00000112306 RPS12 722593 sc-eQTL 2.09e-01 0.1 0.0796 0.098 CD8_TEM L2
ENSG00000118515 SGK1 -780950 sc-eQTL 5.47e-01 -0.0789 0.131 0.098 CD8_TEM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 723823 sc-eQTL 5.90e-01 0.0816 0.151 0.098 CD8_TEM L2
ENSG00000028839 TBPL1 -415008 sc-eQTL 3.34e-01 -0.136 0.141 0.097 MAIT L2
ENSG00000112303 VNN2 773703 sc-eQTL 5.41e-01 -0.0834 0.136 0.097 MAIT L2
ENSG00000112306 RPS12 722593 sc-eQTL 2.81e-01 0.0724 0.0669 0.097 MAIT L2
ENSG00000118515 SGK1 -780950 sc-eQTL 6.45e-01 -0.0435 0.0944 0.097 MAIT L2
ENSG00000146409 SLC18B1 723823 sc-eQTL 5.89e-01 -0.076 0.141 0.097 MAIT L2
ENSG00000028839 TBPL1 -415008 sc-eQTL 1.50e-01 -0.211 0.146 0.1 NK_CD56bright L2
ENSG00000112303 VNN2 773703 sc-eQTL 8.81e-01 0.0207 0.138 0.1 NK_CD56bright L2
ENSG00000112306 RPS12 722593 sc-eQTL 6.69e-01 0.0329 0.077 0.1 NK_CD56bright L2
ENSG00000118515 SGK1 -780950 sc-eQTL 9.43e-02 -0.192 0.114 0.1 NK_CD56bright L2
ENSG00000028839 TBPL1 -415008 sc-eQTL 1.89e-01 0.159 0.12 0.099 NK_CD56dim L2
ENSG00000112303 VNN2 773703 sc-eQTL 8.98e-01 0.0178 0.138 0.099 NK_CD56dim L2
ENSG00000112306 RPS12 722593 sc-eQTL 9.53e-01 -0.00324 0.0548 0.099 NK_CD56dim L2
ENSG00000118515 SGK1 -780950 sc-eQTL 1.36e-01 -0.181 0.121 0.099 NK_CD56dim L2
ENSG00000028839 TBPL1 -415008 sc-eQTL 7.37e-01 -0.0519 0.154 0.096 NK_HLA L2
ENSG00000112303 VNN2 773703 sc-eQTL 1.05e-01 0.231 0.141 0.096 NK_HLA L2
ENSG00000112306 RPS12 722593 sc-eQTL 1.61e-01 -0.0928 0.066 0.096 NK_HLA L2
ENSG00000118515 SGK1 -780950 sc-eQTL 7.76e-02 0.231 0.13 0.096 NK_HLA L2
ENSG00000028839 TBPL1 -415008 sc-eQTL 5.94e-01 -0.0667 0.125 0.099 NK_cytokine L2
ENSG00000112303 VNN2 773703 sc-eQTL 7.11e-01 -0.0504 0.136 0.099 NK_cytokine L2
ENSG00000112306 RPS12 722593 sc-eQTL 9.92e-01 0.000707 0.0737 0.099 NK_cytokine L2
ENSG00000118515 SGK1 -780950 sc-eQTL 2.44e-01 0.143 0.122 0.099 NK_cytokine L2
ENSG00000028839 TBPL1 -415008 sc-eQTL 6.15e-02 -0.32 0.17 0.093 PB L2
ENSG00000112303 VNN2 773703 sc-eQTL 7.16e-01 0.0547 0.15 0.093 PB L2
ENSG00000112306 RPS12 722593 sc-eQTL 8.75e-01 0.0134 0.0851 0.093 PB L2
ENSG00000118515 SGK1 -780950 sc-eQTL 3.22e-01 -0.136 0.137 0.093 PB L2
ENSG00000146409 SLC18B1 723823 sc-eQTL 8.06e-01 -0.0393 0.16 0.093 PB L2
ENSG00000028839 TBPL1 -415008 sc-eQTL 6.08e-01 0.0709 0.138 0.1 Pro_T L2
ENSG00000112303 VNN2 773703 sc-eQTL 2.18e-01 0.163 0.132 0.1 Pro_T L2
ENSG00000112306 RPS12 722593 sc-eQTL 5.89e-01 -0.0271 0.05 0.1 Pro_T L2
ENSG00000118515 SGK1 -780950 sc-eQTL 9.25e-01 -0.0095 0.1 0.1 Pro_T L2
ENSG00000146409 SLC18B1 723823 sc-eQTL 2.35e-01 -0.154 0.129 0.1 Pro_T L2
ENSG00000028839 TBPL1 -415008 sc-eQTL 1.01e-01 -0.232 0.141 0.098 Treg L2
ENSG00000112303 VNN2 773703 sc-eQTL 4.72e-03 0.315 0.11 0.098 Treg L2
ENSG00000112306 RPS12 722593 sc-eQTL 7.67e-01 0.0148 0.0498 0.098 Treg L2
ENSG00000118515 SGK1 -780950 sc-eQTL 3.25e-01 -0.103 0.105 0.098 Treg L2
ENSG00000146409 SLC18B1 723823 sc-eQTL 5.90e-01 -0.0759 0.141 0.098 Treg L2
ENSG00000028839 TBPL1 -415008 sc-eQTL 8.81e-01 -0.0224 0.149 0.1 cDC L2
ENSG00000093134 VNN3 802397 sc-eQTL 6.52e-01 0.0524 0.116 0.1 cDC L2
ENSG00000112299 VNN1 823107 sc-eQTL 3.81e-01 0.12 0.136 0.1 cDC L2
ENSG00000112303 VNN2 773703 sc-eQTL 4.29e-02 0.268 0.132 0.1 cDC L2
ENSG00000112306 RPS12 722593 sc-eQTL 8.45e-02 0.113 0.0651 0.1 cDC L2
ENSG00000118515 SGK1 -780950 sc-eQTL 3.53e-02 -0.232 0.109 0.1 cDC L2
ENSG00000146409 SLC18B1 723823 sc-eQTL 3.21e-01 -0.129 0.13 0.1 cDC L2
ENSG00000286438 AL591115.1 434034 sc-eQTL 1.76e-01 0.14 0.103 0.1 cDC L2
ENSG00000286887 AL355881.1 -759139 sc-eQTL 1.81e-01 -0.171 0.127 0.1 cDC L2
ENSG00000028839 TBPL1 -415008 sc-eQTL 8.81e-01 -0.0176 0.117 0.098 cMono_IL1B L2
ENSG00000093134 VNN3 802397 sc-eQTL 1.23e-01 -0.193 0.125 0.098 cMono_IL1B L2
ENSG00000112299 VNN1 823107 sc-eQTL 8.37e-01 -0.026 0.127 0.098 cMono_IL1B L2
ENSG00000112303 VNN2 773703 sc-eQTL 1.70e-02 0.24 0.0999 0.098 cMono_IL1B L2
ENSG00000112306 RPS12 722593 sc-eQTL 6.93e-01 0.0222 0.0562 0.098 cMono_IL1B L2
ENSG00000118515 SGK1 -780950 sc-eQTL 2.82e-01 -0.0902 0.0836 0.098 cMono_IL1B L2
ENSG00000146409 SLC18B1 723823 sc-eQTL 6.84e-01 0.0441 0.108 0.098 cMono_IL1B L2
ENSG00000286887 AL355881.1 -759139 sc-eQTL 2.99e-02 -0.244 0.112 0.098 cMono_IL1B L2
ENSG00000028839 TBPL1 -415008 sc-eQTL 4.80e-01 -0.0939 0.133 0.098 cMono_S100A L2
ENSG00000093134 VNN3 802397 sc-eQTL 8.08e-02 -0.209 0.119 0.098 cMono_S100A L2
ENSG00000112299 VNN1 823107 sc-eQTL 1.89e-01 0.171 0.13 0.098 cMono_S100A L2
ENSG00000112303 VNN2 773703 sc-eQTL 2.13e-01 0.106 0.0849 0.098 cMono_S100A L2
ENSG00000112306 RPS12 722593 sc-eQTL 9.20e-01 -0.00614 0.0613 0.098 cMono_S100A L2
ENSG00000118515 SGK1 -780950 sc-eQTL 4.25e-01 -0.0559 0.07 0.098 cMono_S100A L2
ENSG00000146409 SLC18B1 723823 sc-eQTL 2.79e-01 0.123 0.113 0.098 cMono_S100A L2
ENSG00000286887 AL355881.1 -759139 sc-eQTL 2.86e-01 -0.118 0.111 0.098 cMono_S100A L2
ENSG00000028839 TBPL1 -415008 sc-eQTL 4.56e-01 0.144 0.192 0.085 gdT L2
ENSG00000112303 VNN2 773703 sc-eQTL 2.15e-01 -0.227 0.182 0.085 gdT L2
ENSG00000112306 RPS12 722593 sc-eQTL 2.75e-01 0.0763 0.0696 0.085 gdT L2
ENSG00000118515 SGK1 -780950 sc-eQTL 8.13e-01 -0.0312 0.132 0.085 gdT L2
ENSG00000146409 SLC18B1 723823 sc-eQTL 2.55e-01 0.206 0.18 0.085 gdT L2
ENSG00000028839 TBPL1 -415008 sc-eQTL 6.17e-01 -0.069 0.138 0.1 intMono L2
ENSG00000093134 VNN3 802397 sc-eQTL 1.49e-01 -0.192 0.132 0.1 intMono L2
ENSG00000112299 VNN1 823107 sc-eQTL 3.16e-01 0.132 0.131 0.1 intMono L2
ENSG00000112303 VNN2 773703 sc-eQTL 2.82e-02 0.292 0.132 0.1 intMono L2
ENSG00000112306 RPS12 722593 sc-eQTL 7.83e-01 0.016 0.0581 0.1 intMono L2
ENSG00000118515 SGK1 -780950 sc-eQTL 1.17e-01 -0.153 0.0971 0.1 intMono L2
ENSG00000146409 SLC18B1 723823 sc-eQTL 7.77e-02 0.249 0.14 0.1 intMono L2
ENSG00000286887 AL355881.1 -759139 sc-eQTL 1.87e-01 -0.178 0.135 0.1 intMono L2
ENSG00000028839 TBPL1 -415008 sc-eQTL 4.47e-01 -0.108 0.141 0.1 ncMono L2
ENSG00000093134 VNN3 802397 sc-eQTL 5.31e-01 -0.0847 0.135 0.1 ncMono L2
ENSG00000112299 VNN1 823107 sc-eQTL 3.07e-02 0.289 0.133 0.1 ncMono L2
ENSG00000112303 VNN2 773703 sc-eQTL 6.34e-02 0.239 0.128 0.1 ncMono L2
ENSG00000112306 RPS12 722593 sc-eQTL 5.01e-01 0.0436 0.0646 0.1 ncMono L2
ENSG00000118515 SGK1 -780950 sc-eQTL 4.76e-01 -0.0652 0.0914 0.1 ncMono L2
ENSG00000146409 SLC18B1 723823 sc-eQTL 6.53e-02 -0.21 0.113 0.1 ncMono L2
ENSG00000286887 AL355881.1 -759139 sc-eQTL 7.85e-01 -0.033 0.121 0.1 ncMono L2
ENSG00000028839 TBPL1 -415008 sc-eQTL 2.85e-01 -0.179 0.167 0.09 pDC L2
ENSG00000093134 VNN3 802397 sc-eQTL 1.08e-01 0.18 0.111 0.09 pDC L2
ENSG00000112299 VNN1 823107 sc-eQTL 2.81e-02 0.249 0.112 0.09 pDC L2
ENSG00000112303 VNN2 773703 sc-eQTL 4.28e-01 0.108 0.136 0.09 pDC L2
ENSG00000112306 RPS12 722593 sc-eQTL 9.16e-01 -0.00994 0.0936 0.09 pDC L2
ENSG00000118515 SGK1 -780950 sc-eQTL 2.92e-01 -0.1 0.0947 0.09 pDC L2
ENSG00000146409 SLC18B1 723823 sc-eQTL 7.46e-01 -0.0449 0.138 0.09 pDC L2
ENSG00000286438 AL591115.1 434034 sc-eQTL 1.35e-01 0.198 0.132 0.09 pDC L2
ENSG00000286887 AL355881.1 -759139 sc-eQTL 4.20e-01 0.0949 0.117 0.09 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000028839 TBPL1 -415008 sc-eQTL 4.42e-01 -0.108 0.14 0.098 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 773703 sc-eQTL 3.22e-01 -0.121 0.122 0.098 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 722593 sc-eQTL 9.72e-01 0.00246 0.0695 0.098 B_Memory LOneK1K
ENSG00000118515 SGK1 -780950 sc-eQTL 1.32e-01 -0.163 0.108 0.098 B_Memory LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 723823 sc-eQTL 3.54e-01 0.118 0.127 0.098 B_Memory LOneK1K
ENSG00000028839 TBPL1 -415008 sc-eQTL 1.47e-01 -0.191 0.131 0.098 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 773703 sc-eQTL 5.75e-01 -0.0647 0.115 0.098 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 722593 sc-eQTL 7.80e-01 -0.0195 0.0698 0.098 B_Naive LOneK1K
ENSG00000118515 SGK1 -780950 sc-eQTL 3.31e-01 -0.105 0.108 0.098 B_Naive LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 723823 sc-eQTL 3.68e-01 0.119 0.131 0.098 B_Naive LOneK1K
ENSG00000028839 TBPL1 -415008 sc-eQTL 6.82e-01 -0.0435 0.106 0.098 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000093134 VNN3 802397 sc-eQTL 7.59e-02 -0.213 0.119 0.098 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112299 VNN1 823107 sc-eQTL 7.92e-01 0.0331 0.125 0.098 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 773703 sc-eQTL 4.10e-02 0.169 0.0822 0.098 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 722593 sc-eQTL 8.13e-01 0.0135 0.0569 0.098 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000118515 SGK1 -780950 sc-eQTL 3.17e-01 -0.0775 0.0774 0.098 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 723823 sc-eQTL 5.78e-01 0.0564 0.101 0.098 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000286887 AL355881.1 -759139 sc-eQTL 3.11e-02 -0.228 0.105 0.098 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000028839 TBPL1 -415008 sc-eQTL 3.82e-01 -0.122 0.139 0.099 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000093134 VNN3 802397 sc-eQTL 2.26e-01 -0.164 0.135 0.099 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112299 VNN1 823107 sc-eQTL 1.56e-01 0.19 0.134 0.099 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 773703 sc-eQTL 4.01e-03 0.361 0.124 0.099 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 722593 sc-eQTL 7.21e-01 -0.0192 0.0537 0.099 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000118515 SGK1 -780950 sc-eQTL 1.68e-01 -0.112 0.081 0.099 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 723823 sc-eQTL 9.97e-01 0.000508 0.13 0.099 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000286887 AL355881.1 -759139 sc-eQTL 9.57e-02 -0.196 0.117 0.099 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000028839 TBPL1 -415008 sc-eQTL 3.45e-01 0.105 0.111 0.099 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 773703 sc-eQTL 8.06e-01 0.0325 0.132 0.099 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 722593 sc-eQTL 8.56e-01 -0.00979 0.0539 0.099 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000118515 SGK1 -780950 sc-eQTL 8.31e-01 -0.0238 0.111 0.099 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000112299 VNN1 823107 pQTL 0.731 0.0204 0.0592 0.00723 0.0 0.095
ENSG00000112303 VNN2 773703 eQTL 0.0107 0.0543 0.0212 0.00106 0.0 0.0976

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000118515 \N -780950 2.91e-07 1.53e-07 5.82e-08 2.07e-07 9.8e-08 8.21e-08 1.99e-07 5.75e-08 1.54e-07 7.6e-08 1.63e-07 1.19e-07 2.24e-07 8e-08 5.94e-08 7.89e-08 4.45e-08 1.64e-07 7.18e-08 4.8e-08 1.27e-07 1.39e-07 1.62e-07 2.68e-08 2.02e-07 1.22e-07 1.12e-07 1.06e-07 1.34e-07 1.33e-07 1.14e-07 3.1e-08 3.59e-08 9.52e-08 3.02e-08 3.22e-08 5.35e-08 8.68e-08 6.71e-08 3.82e-08 5.45e-08 1.6e-07 4.83e-08 7.39e-09 2.82e-08 1.68e-08 1.11e-07 1.91e-09 4.83e-08