logo

Genes within 1Mb (chr6:133506806:A:G):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000028839 TBPL1 -445364 sc-eQTL 1.94e-01 0.121 0.0925 0.25 B L1
ENSG00000079950 STX7 993608 sc-eQTL 2.23e-01 0.045 0.0369 0.25 B L1
ENSG00000112303 VNN2 743347 sc-eQTL 7.06e-01 -0.0263 0.0695 0.25 B L1
ENSG00000112306 RPS12 692237 sc-eQTL 4.50e-01 0.0318 0.042 0.25 B L1
ENSG00000118515 SGK1 -811306 sc-eQTL 2.93e-01 0.0682 0.0647 0.25 B L1
ENSG00000146409 SLC18B1 693467 sc-eQTL 2.92e-01 0.0933 0.0883 0.25 B L1
ENSG00000028839 TBPL1 -445364 sc-eQTL 3.74e-01 0.0617 0.0693 0.25 CD4T L1
ENSG00000079950 STX7 993608 sc-eQTL 5.14e-02 0.14 0.0715 0.25 CD4T L1
ENSG00000112303 VNN2 743347 sc-eQTL 7.82e-01 -0.0173 0.0625 0.25 CD4T L1
ENSG00000112306 RPS12 692237 sc-eQTL 7.63e-01 -0.0128 0.0425 0.25 CD4T L1
ENSG00000118515 SGK1 -811306 sc-eQTL 6.57e-01 -0.0254 0.0571 0.25 CD4T L1
ENSG00000146409 SLC18B1 693467 sc-eQTL 1.51e-02 0.208 0.0848 0.25 CD4T L1
ENSG00000028839 TBPL1 -445364 sc-eQTL 5.66e-01 0.0393 0.0683 0.25 CD8T L1
ENSG00000079950 STX7 993608 sc-eQTL 9.17e-01 0.0074 0.0714 0.25 CD8T L1
ENSG00000112303 VNN2 743347 sc-eQTL 4.99e-01 -0.0564 0.0832 0.25 CD8T L1
ENSG00000112306 RPS12 692237 sc-eQTL 2.75e-01 -0.0311 0.0284 0.25 CD8T L1
ENSG00000118515 SGK1 -811306 sc-eQTL 1.95e-01 -0.0568 0.0437 0.25 CD8T L1
ENSG00000146409 SLC18B1 693467 sc-eQTL 4.89e-01 0.0597 0.086 0.25 CD8T L1
ENSG00000028839 TBPL1 -445364 sc-eQTL 9.72e-01 -0.00377 0.107 0.259 DC L1
ENSG00000079950 STX7 993608 sc-eQTL 8.65e-01 -0.0113 0.0664 0.259 DC L1
ENSG00000093134 VNN3 772041 sc-eQTL 9.41e-01 0.00605 0.0823 0.259 DC L1
ENSG00000112299 VNN1 792751 sc-eQTL 1.14e-01 0.14 0.0883 0.259 DC L1
ENSG00000112303 VNN2 743347 sc-eQTL 7.22e-01 -0.0339 0.095 0.259 DC L1
ENSG00000112306 RPS12 692237 sc-eQTL 2.93e-01 -0.0561 0.0531 0.259 DC L1
ENSG00000118515 SGK1 -811306 sc-eQTL 5.70e-01 0.0351 0.0618 0.259 DC L1
ENSG00000146409 SLC18B1 693467 sc-eQTL 8.00e-01 0.0214 0.0843 0.259 DC L1
ENSG00000286438 AL591115.1 403678 sc-eQTL 1.06e-01 0.124 0.0762 0.259 DC L1
ENSG00000286887 AL355881.1 -789495 sc-eQTL 2.35e-01 0.113 0.0953 0.259 DC L1
ENSG00000028839 TBPL1 -445364 sc-eQTL 1.80e-01 0.0991 0.0737 0.25 Mono L1
ENSG00000079950 STX7 993608 sc-eQTL 4.33e-01 0.0389 0.0494 0.25 Mono L1
ENSG00000093134 VNN3 772041 sc-eQTL 7.45e-01 0.0277 0.085 0.25 Mono L1
ENSG00000112299 VNN1 792751 sc-eQTL 2.46e-01 0.106 0.0911 0.25 Mono L1
ENSG00000112303 VNN2 743347 sc-eQTL 9.74e-02 -0.107 0.0641 0.25 Mono L1
ENSG00000112306 RPS12 692237 sc-eQTL 7.04e-01 0.0147 0.0387 0.25 Mono L1
ENSG00000118515 SGK1 -811306 sc-eQTL 5.97e-01 -0.0289 0.0546 0.25 Mono L1
ENSG00000146409 SLC18B1 693467 sc-eQTL 4.56e-01 -0.057 0.0764 0.25 Mono L1
ENSG00000286887 AL355881.1 -789495 sc-eQTL 5.25e-01 0.0478 0.0751 0.25 Mono L1
ENSG00000028839 TBPL1 -445364 sc-eQTL 3.17e-01 0.0803 0.0801 0.251 NK L1
ENSG00000079950 STX7 993608 sc-eQTL 7.75e-01 0.0213 0.0743 0.251 NK L1
ENSG00000112303 VNN2 743347 sc-eQTL 2.95e-01 -0.0968 0.0922 0.251 NK L1
ENSG00000112306 RPS12 692237 sc-eQTL 5.44e-01 -0.0232 0.0382 0.251 NK L1
ENSG00000118515 SGK1 -811306 sc-eQTL 3.13e-01 -0.0714 0.0706 0.251 NK L1
ENSG00000028839 TBPL1 -445364 sc-eQTL 5.31e-01 -0.0577 0.092 0.25 Other_T L1
ENSG00000079950 STX7 993608 sc-eQTL 1.55e-01 0.103 0.0721 0.25 Other_T L1
ENSG00000112303 VNN2 743347 sc-eQTL 2.00e-01 -0.112 0.0873 0.25 Other_T L1
ENSG00000112306 RPS12 692237 sc-eQTL 8.92e-02 -0.0589 0.0345 0.25 Other_T L1
ENSG00000118515 SGK1 -811306 sc-eQTL 9.41e-01 0.00473 0.0639 0.25 Other_T L1
ENSG00000146409 SLC18B1 693467 sc-eQTL 5.28e-01 0.0601 0.095 0.25 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000028839 TBPL1 -445364 sc-eQTL 6.18e-01 -0.0545 0.109 0.247 B_Activated L2
ENSG00000079950 STX7 993608 sc-eQTL 8.88e-01 -0.0132 0.0933 0.247 B_Activated L2
ENSG00000112303 VNN2 743347 sc-eQTL 7.24e-01 0.0351 0.0993 0.247 B_Activated L2
ENSG00000112306 RPS12 692237 sc-eQTL 7.90e-01 0.0142 0.0532 0.247 B_Activated L2
ENSG00000118515 SGK1 -811306 sc-eQTL 6.66e-01 0.041 0.0949 0.247 B_Activated L2
ENSG00000146409 SLC18B1 693467 sc-eQTL 2.88e-01 -0.099 0.0929 0.247 B_Activated L2
ENSG00000028839 TBPL1 -445364 sc-eQTL 3.62e-01 0.0946 0.103 0.249 B_Intermediate L2
ENSG00000079950 STX7 993608 sc-eQTL 5.11e-02 0.116 0.059 0.249 B_Intermediate L2
ENSG00000112303 VNN2 743347 sc-eQTL 6.66e-01 -0.0388 0.0897 0.249 B_Intermediate L2
ENSG00000112306 RPS12 692237 sc-eQTL 9.77e-01 -0.00158 0.0549 0.249 B_Intermediate L2
ENSG00000118515 SGK1 -811306 sc-eQTL 9.13e-01 0.0104 0.095 0.249 B_Intermediate L2
ENSG00000146409 SLC18B1 693467 sc-eQTL 7.96e-01 0.0256 0.0989 0.249 B_Intermediate L2
ENSG00000028839 TBPL1 -445364 sc-eQTL 5.47e-01 -0.0593 0.0984 0.25 B_Memory L2
ENSG00000079950 STX7 993608 sc-eQTL 2.99e-02 0.154 0.0705 0.25 B_Memory L2
ENSG00000112303 VNN2 743347 sc-eQTL 1.19e-01 0.145 0.0927 0.25 B_Memory L2
ENSG00000112306 RPS12 692237 sc-eQTL 5.89e-01 0.0243 0.0449 0.25 B_Memory L2
ENSG00000118515 SGK1 -811306 sc-eQTL 6.96e-04 0.276 0.0802 0.25 B_Memory L2
ENSG00000146409 SLC18B1 693467 sc-eQTL 4.59e-01 0.0694 0.0936 0.25 B_Memory L2
ENSG00000028839 TBPL1 -445364 sc-eQTL 4.00e-01 0.0791 0.0937 0.25 B_Naive1 L2
ENSG00000079950 STX7 993608 sc-eQTL 2.77e-01 0.0491 0.045 0.25 B_Naive1 L2
ENSG00000112303 VNN2 743347 sc-eQTL 2.11e-01 -0.11 0.0873 0.25 B_Naive1 L2
ENSG00000112306 RPS12 692237 sc-eQTL 5.90e-01 0.0269 0.0499 0.25 B_Naive1 L2
ENSG00000118515 SGK1 -811306 sc-eQTL 2.53e-01 0.0892 0.0778 0.25 B_Naive1 L2
ENSG00000146409 SLC18B1 693467 sc-eQTL 9.31e-01 0.00832 0.0963 0.25 B_Naive1 L2
ENSG00000028839 TBPL1 -445364 sc-eQTL 1.23e-01 0.154 0.0993 0.249 B_Naive2 L2
ENSG00000079950 STX7 993608 sc-eQTL 7.20e-01 0.0191 0.0531 0.249 B_Naive2 L2
ENSG00000112303 VNN2 743347 sc-eQTL 9.50e-01 0.00613 0.0974 0.249 B_Naive2 L2
ENSG00000112306 RPS12 692237 sc-eQTL 5.02e-01 0.0347 0.0515 0.249 B_Naive2 L2
ENSG00000118515 SGK1 -811306 sc-eQTL 8.95e-01 -0.0121 0.0912 0.249 B_Naive2 L2
ENSG00000146409 SLC18B1 693467 sc-eQTL 1.29e-01 0.149 0.0979 0.249 B_Naive2 L2
ENSG00000028839 TBPL1 -445364 sc-eQTL 2.15e-01 0.123 0.0992 0.252 CD4_CTL L2
ENSG00000079950 STX7 993608 sc-eQTL 1.72e-01 0.135 0.0984 0.252 CD4_CTL L2
ENSG00000112303 VNN2 743347 sc-eQTL 5.04e-01 -0.0667 0.0997 0.252 CD4_CTL L2
ENSG00000112306 RPS12 692237 sc-eQTL 5.05e-01 -0.0308 0.0461 0.252 CD4_CTL L2
ENSG00000118515 SGK1 -811306 sc-eQTL 3.55e-01 0.074 0.0798 0.252 CD4_CTL L2
ENSG00000146409 SLC18B1 693467 sc-eQTL 4.95e-01 0.0634 0.0928 0.252 CD4_CTL L2
ENSG00000028839 TBPL1 -445364 sc-eQTL 9.05e-01 -0.00963 0.0801 0.25 CD4_Naive L2
ENSG00000079950 STX7 993608 sc-eQTL 1.55e-01 0.112 0.0782 0.25 CD4_Naive L2
ENSG00000112303 VNN2 743347 sc-eQTL 7.37e-01 0.0245 0.0728 0.25 CD4_Naive L2
ENSG00000112306 RPS12 692237 sc-eQTL 9.27e-01 -0.00431 0.0472 0.25 CD4_Naive L2
ENSG00000118515 SGK1 -811306 sc-eQTL 6.05e-01 0.0299 0.0578 0.25 CD4_Naive L2
ENSG00000146409 SLC18B1 693467 sc-eQTL 6.57e-03 0.245 0.0893 0.25 CD4_Naive L2
ENSG00000028839 TBPL1 -445364 sc-eQTL 7.16e-01 -0.0315 0.0863 0.25 CD4_TCM L2
ENSG00000079950 STX7 993608 sc-eQTL 2.04e-01 0.11 0.0866 0.25 CD4_TCM L2
ENSG00000112303 VNN2 743347 sc-eQTL 1.85e-01 -0.113 0.0853 0.25 CD4_TCM L2
ENSG00000112306 RPS12 692237 sc-eQTL 1.03e-01 -0.0723 0.0441 0.25 CD4_TCM L2
ENSG00000118515 SGK1 -811306 sc-eQTL 6.28e-01 -0.0301 0.0621 0.25 CD4_TCM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 693467 sc-eQTL 3.18e-01 0.103 0.103 0.25 CD4_TCM L2
ENSG00000028839 TBPL1 -445364 sc-eQTL 1.08e-01 0.159 0.0987 0.25 CD4_TEM L2
ENSG00000079950 STX7 993608 sc-eQTL 1.85e-01 0.132 0.099 0.25 CD4_TEM L2
ENSG00000112303 VNN2 743347 sc-eQTL 2.63e-01 0.107 0.0952 0.25 CD4_TEM L2
ENSG00000112306 RPS12 692237 sc-eQTL 1.74e-01 -0.0532 0.039 0.25 CD4_TEM L2
ENSG00000118515 SGK1 -811306 sc-eQTL 9.76e-01 0.00204 0.0673 0.25 CD4_TEM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 693467 sc-eQTL 8.47e-01 0.0188 0.0973 0.25 CD4_TEM L2
ENSG00000028839 TBPL1 -445364 sc-eQTL 3.20e-01 0.0874 0.0877 0.25 CD8_CTL L2
ENSG00000079950 STX7 993608 sc-eQTL 6.01e-01 -0.043 0.0821 0.25 CD8_CTL L2
ENSG00000112303 VNN2 743347 sc-eQTL 8.88e-01 -0.0132 0.0933 0.25 CD8_CTL L2
ENSG00000112306 RPS12 692237 sc-eQTL 1.69e-01 -0.0687 0.0497 0.25 CD8_CTL L2
ENSG00000118515 SGK1 -811306 sc-eQTL 7.88e-01 0.0227 0.0843 0.25 CD8_CTL L2
ENSG00000146409 SLC18B1 693467 sc-eQTL 6.78e-01 0.0402 0.0967 0.25 CD8_CTL L2
ENSG00000028839 TBPL1 -445364 sc-eQTL 5.47e-01 0.0566 0.0938 0.25 CD8_Naive L2
ENSG00000079950 STX7 993608 sc-eQTL 6.19e-01 0.0498 0.1 0.25 CD8_Naive L2
ENSG00000112303 VNN2 743347 sc-eQTL 2.47e-01 -0.0998 0.086 0.25 CD8_Naive L2
ENSG00000112306 RPS12 692237 sc-eQTL 5.61e-01 -0.0288 0.0494 0.25 CD8_Naive L2
ENSG00000118515 SGK1 -811306 sc-eQTL 1.46e-01 -0.0901 0.0617 0.25 CD8_Naive L2
ENSG00000146409 SLC18B1 693467 sc-eQTL 9.59e-01 -0.00506 0.0992 0.25 CD8_Naive L2
ENSG00000028839 TBPL1 -445364 sc-eQTL 8.80e-01 0.0158 0.105 0.255 CD8_TCM L2
ENSG00000079950 STX7 993608 sc-eQTL 3.23e-01 0.0959 0.0968 0.255 CD8_TCM L2
ENSG00000112303 VNN2 743347 sc-eQTL 4.19e-01 0.0779 0.0962 0.255 CD8_TCM L2
ENSG00000112306 RPS12 692237 sc-eQTL 1.53e-01 -0.0671 0.0467 0.255 CD8_TCM L2
ENSG00000118515 SGK1 -811306 sc-eQTL 9.97e-02 0.128 0.0772 0.255 CD8_TCM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 693467 sc-eQTL 2.33e-01 0.123 0.103 0.255 CD8_TCM L2
ENSG00000028839 TBPL1 -445364 sc-eQTL 2.02e-01 -0.124 0.0966 0.251 CD8_TEM L2
ENSG00000079950 STX7 993608 sc-eQTL 1.25e-01 -0.162 0.105 0.251 CD8_TEM L2
ENSG00000112303 VNN2 743347 sc-eQTL 2.26e-01 0.128 0.105 0.251 CD8_TEM L2
ENSG00000112306 RPS12 692237 sc-eQTL 7.12e-01 0.0209 0.0566 0.251 CD8_TEM L2
ENSG00000118515 SGK1 -811306 sc-eQTL 7.21e-01 -0.0332 0.0928 0.251 CD8_TEM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 693467 sc-eQTL 3.29e-01 0.105 0.107 0.251 CD8_TEM L2
ENSG00000028839 TBPL1 -445364 sc-eQTL 5.70e-01 -0.0565 0.0992 0.253 MAIT L2
ENSG00000079950 STX7 993608 sc-eQTL 3.56e-02 0.197 0.0934 0.253 MAIT L2
ENSG00000112303 VNN2 743347 sc-eQTL 7.91e-01 0.0254 0.0959 0.253 MAIT L2
ENSG00000112306 RPS12 692237 sc-eQTL 5.72e-03 -0.129 0.0463 0.253 MAIT L2
ENSG00000118515 SGK1 -811306 sc-eQTL 3.78e-01 -0.0585 0.0663 0.253 MAIT L2
ENSG00000146409 SLC18B1 693467 sc-eQTL 3.19e-01 0.0985 0.0987 0.253 MAIT L2
ENSG00000028839 TBPL1 -445364 sc-eQTL 8.56e-01 0.0195 0.107 0.247 NK_CD56bright L2
ENSG00000079950 STX7 993608 sc-eQTL 7.26e-01 0.0349 0.0996 0.247 NK_CD56bright L2
ENSG00000112303 VNN2 743347 sc-eQTL 9.58e-01 -0.0053 0.101 0.247 NK_CD56bright L2
ENSG00000112306 RPS12 692237 sc-eQTL 1.05e-01 -0.0912 0.056 0.247 NK_CD56bright L2
ENSG00000118515 SGK1 -811306 sc-eQTL 7.98e-01 -0.0216 0.0842 0.247 NK_CD56bright L2
ENSG00000028839 TBPL1 -445364 sc-eQTL 3.94e-01 0.0733 0.086 0.252 NK_CD56dim L2
ENSG00000079950 STX7 993608 sc-eQTL 7.92e-01 -0.0208 0.0788 0.252 NK_CD56dim L2
ENSG00000112303 VNN2 743347 sc-eQTL 1.92e-02 -0.23 0.0973 0.252 NK_CD56dim L2
ENSG00000112306 RPS12 692237 sc-eQTL 4.32e-01 -0.0308 0.0391 0.252 NK_CD56dim L2
ENSG00000118515 SGK1 -811306 sc-eQTL 5.88e-01 0.047 0.0866 0.252 NK_CD56dim L2
ENSG00000028839 TBPL1 -445364 sc-eQTL 5.58e-01 0.0644 0.11 0.249 NK_HLA L2
ENSG00000079950 STX7 993608 sc-eQTL 8.18e-01 0.023 0.1 0.249 NK_HLA L2
ENSG00000112303 VNN2 743347 sc-eQTL 2.74e-01 -0.111 0.101 0.249 NK_HLA L2
ENSG00000112306 RPS12 692237 sc-eQTL 8.35e-01 0.00984 0.0471 0.249 NK_HLA L2
ENSG00000118515 SGK1 -811306 sc-eQTL 6.39e-01 -0.0438 0.0931 0.249 NK_HLA L2
ENSG00000028839 TBPL1 -445364 sc-eQTL 4.63e-01 0.066 0.0897 0.252 NK_cytokine L2
ENSG00000079950 STX7 993608 sc-eQTL 2.10e-01 0.109 0.0866 0.252 NK_cytokine L2
ENSG00000112303 VNN2 743347 sc-eQTL 2.73e-01 0.107 0.0975 0.252 NK_cytokine L2
ENSG00000112306 RPS12 692237 sc-eQTL 8.21e-01 -0.012 0.053 0.252 NK_cytokine L2
ENSG00000118515 SGK1 -811306 sc-eQTL 5.61e-02 -0.168 0.0875 0.252 NK_cytokine L2
ENSG00000028839 TBPL1 -445364 sc-eQTL 5.60e-01 0.0709 0.121 0.244 PB L2
ENSG00000079950 STX7 993608 sc-eQTL 5.81e-01 -0.0478 0.0863 0.244 PB L2
ENSG00000112303 VNN2 743347 sc-eQTL 6.92e-01 -0.0419 0.106 0.244 PB L2
ENSG00000112306 RPS12 692237 sc-eQTL 1.44e-01 -0.0875 0.0594 0.244 PB L2
ENSG00000118515 SGK1 -811306 sc-eQTL 4.27e-01 0.077 0.0966 0.244 PB L2
ENSG00000146409 SLC18B1 693467 sc-eQTL 4.35e-01 0.0878 0.112 0.244 PB L2
ENSG00000028839 TBPL1 -445364 sc-eQTL 5.35e-01 -0.0623 0.1 0.248 Pro_T L2
ENSG00000079950 STX7 993608 sc-eQTL 1.14e-01 0.141 0.0891 0.248 Pro_T L2
ENSG00000112303 VNN2 743347 sc-eQTL 5.14e-01 -0.0628 0.096 0.248 Pro_T L2
ENSG00000112306 RPS12 692237 sc-eQTL 3.39e-01 -0.0348 0.0363 0.248 Pro_T L2
ENSG00000118515 SGK1 -811306 sc-eQTL 5.16e-01 0.0474 0.0728 0.248 Pro_T L2
ENSG00000146409 SLC18B1 693467 sc-eQTL 4.89e-01 0.0651 0.094 0.248 Pro_T L2
ENSG00000028839 TBPL1 -445364 sc-eQTL 5.25e-01 0.0652 0.102 0.25 Treg L2
ENSG00000079950 STX7 993608 sc-eQTL 9.12e-02 0.163 0.096 0.25 Treg L2
ENSG00000112303 VNN2 743347 sc-eQTL 4.96e-01 0.0554 0.0813 0.25 Treg L2
ENSG00000112306 RPS12 692237 sc-eQTL 8.08e-01 -0.00876 0.036 0.25 Treg L2
ENSG00000118515 SGK1 -811306 sc-eQTL 1.40e-01 -0.112 0.0754 0.25 Treg L2
ENSG00000146409 SLC18B1 693467 sc-eQTL 8.10e-01 -0.0245 0.102 0.25 Treg L2
ENSG00000028839 TBPL1 -445364 sc-eQTL 8.60e-01 0.0185 0.105 0.271 cDC L2
ENSG00000079950 STX7 993608 sc-eQTL 8.11e-01 0.0196 0.0821 0.271 cDC L2
ENSG00000093134 VNN3 772041 sc-eQTL 7.56e-01 0.0254 0.0815 0.271 cDC L2
ENSG00000112299 VNN1 792751 sc-eQTL 1.89e-01 0.126 0.0954 0.271 cDC L2
ENSG00000112303 VNN2 743347 sc-eQTL 4.87e-01 -0.065 0.0932 0.271 cDC L2
ENSG00000112306 RPS12 692237 sc-eQTL 4.91e-01 -0.0318 0.046 0.271 cDC L2
ENSG00000118515 SGK1 -811306 sc-eQTL 1.97e-01 0.1 0.0773 0.271 cDC L2
ENSG00000146409 SLC18B1 693467 sc-eQTL 3.13e-01 0.0921 0.091 0.271 cDC L2
ENSG00000286438 AL591115.1 403678 sc-eQTL 3.97e-01 0.0619 0.0728 0.271 cDC L2
ENSG00000286887 AL355881.1 -789495 sc-eQTL 3.46e-02 0.189 0.0887 0.271 cDC L2
ENSG00000028839 TBPL1 -445364 sc-eQTL 4.52e-01 0.0629 0.0834 0.25 cMono_IL1B L2
ENSG00000079950 STX7 993608 sc-eQTL 6.34e-01 -0.0301 0.0633 0.25 cMono_IL1B L2
ENSG00000093134 VNN3 772041 sc-eQTL 4.16e-01 0.0729 0.0894 0.25 cMono_IL1B L2
ENSG00000112299 VNN1 792751 sc-eQTL 1.42e-01 0.132 0.0899 0.25 cMono_IL1B L2
ENSG00000112303 VNN2 743347 sc-eQTL 1.19e-01 -0.113 0.0718 0.25 cMono_IL1B L2
ENSG00000112306 RPS12 692237 sc-eQTL 5.47e-01 0.0242 0.0401 0.25 cMono_IL1B L2
ENSG00000118515 SGK1 -811306 sc-eQTL 7.67e-01 -0.0177 0.0598 0.25 cMono_IL1B L2
ENSG00000146409 SLC18B1 693467 sc-eQTL 7.75e-01 0.0221 0.0774 0.25 cMono_IL1B L2
ENSG00000286887 AL355881.1 -789495 sc-eQTL 1.48e-01 0.116 0.0802 0.25 cMono_IL1B L2
ENSG00000028839 TBPL1 -445364 sc-eQTL 4.18e-01 0.0762 0.0938 0.25 cMono_S100A L2
ENSG00000079950 STX7 993608 sc-eQTL 1.50e-01 0.0976 0.0675 0.25 cMono_S100A L2
ENSG00000093134 VNN3 772041 sc-eQTL 7.65e-01 0.0254 0.0848 0.25 cMono_S100A L2
ENSG00000112299 VNN1 792751 sc-eQTL 2.60e-01 0.104 0.0918 0.25 cMono_S100A L2
ENSG00000112303 VNN2 743347 sc-eQTL 2.16e-01 -0.0745 0.0601 0.25 cMono_S100A L2
ENSG00000112306 RPS12 692237 sc-eQTL 5.01e-01 0.0292 0.0434 0.25 cMono_S100A L2
ENSG00000118515 SGK1 -811306 sc-eQTL 7.93e-01 0.013 0.0496 0.25 cMono_S100A L2
ENSG00000146409 SLC18B1 693467 sc-eQTL 8.24e-02 -0.139 0.0798 0.25 cMono_S100A L2
ENSG00000286887 AL355881.1 -789495 sc-eQTL 9.55e-01 0.00444 0.0786 0.25 cMono_S100A L2
ENSG00000028839 TBPL1 -445364 sc-eQTL 4.67e-01 0.0905 0.124 0.258 gdT L2
ENSG00000079950 STX7 993608 sc-eQTL 4.03e-01 -0.0895 0.107 0.258 gdT L2
ENSG00000112303 VNN2 743347 sc-eQTL 2.74e-02 -0.259 0.116 0.258 gdT L2
ENSG00000112306 RPS12 692237 sc-eQTL 2.62e-01 -0.0505 0.0449 0.258 gdT L2
ENSG00000118515 SGK1 -811306 sc-eQTL 4.51e-01 0.0641 0.0849 0.258 gdT L2
ENSG00000146409 SLC18B1 693467 sc-eQTL 1.29e-01 -0.177 0.116 0.258 gdT L2
ENSG00000028839 TBPL1 -445364 sc-eQTL 2.26e-02 0.218 0.0949 0.256 intMono L2
ENSG00000079950 STX7 993608 sc-eQTL 8.71e-01 0.0149 0.0918 0.256 intMono L2
ENSG00000093134 VNN3 772041 sc-eQTL 6.20e-01 0.0461 0.0926 0.256 intMono L2
ENSG00000112299 VNN1 792751 sc-eQTL 6.15e-01 0.0461 0.0916 0.256 intMono L2
ENSG00000112303 VNN2 743347 sc-eQTL 2.89e-01 0.0987 0.0929 0.256 intMono L2
ENSG00000112306 RPS12 692237 sc-eQTL 4.52e-01 -0.0305 0.0405 0.256 intMono L2
ENSG00000118515 SGK1 -811306 sc-eQTL 8.53e-01 -0.0126 0.0681 0.256 intMono L2
ENSG00000146409 SLC18B1 693467 sc-eQTL 5.87e-01 0.0537 0.0986 0.256 intMono L2
ENSG00000286887 AL355881.1 -789495 sc-eQTL 2.00e-01 0.121 0.094 0.256 intMono L2
ENSG00000028839 TBPL1 -445364 sc-eQTL 5.31e-01 0.0632 0.101 0.249 ncMono L2
ENSG00000079950 STX7 993608 sc-eQTL 6.73e-01 0.0288 0.0682 0.249 ncMono L2
ENSG00000093134 VNN3 772041 sc-eQTL 8.56e-01 0.0174 0.0962 0.249 ncMono L2
ENSG00000112299 VNN1 792751 sc-eQTL 7.08e-01 0.0358 0.0955 0.249 ncMono L2
ENSG00000112303 VNN2 743347 sc-eQTL 8.53e-01 0.017 0.0919 0.249 ncMono L2
ENSG00000112306 RPS12 692237 sc-eQTL 8.65e-01 0.00782 0.0461 0.249 ncMono L2
ENSG00000118515 SGK1 -811306 sc-eQTL 1.64e-01 0.0907 0.0649 0.249 ncMono L2
ENSG00000146409 SLC18B1 693467 sc-eQTL 3.92e-01 0.0696 0.0812 0.249 ncMono L2
ENSG00000286887 AL355881.1 -789495 sc-eQTL 4.19e-01 0.0696 0.0859 0.249 ncMono L2
ENSG00000028839 TBPL1 -445364 sc-eQTL 8.68e-01 0.0195 0.118 0.257 pDC L2
ENSG00000079950 STX7 993608 sc-eQTL 7.44e-01 -0.0257 0.0783 0.257 pDC L2
ENSG00000093134 VNN3 772041 sc-eQTL 5.24e-01 -0.0503 0.0788 0.257 pDC L2
ENSG00000112299 VNN1 792751 sc-eQTL 7.24e-01 0.0284 0.0803 0.257 pDC L2
ENSG00000112303 VNN2 743347 sc-eQTL 4.29e-01 -0.0757 0.0954 0.257 pDC L2
ENSG00000112306 RPS12 692237 sc-eQTL 6.46e-01 0.0303 0.0658 0.257 pDC L2
ENSG00000118515 SGK1 -811306 sc-eQTL 9.37e-01 0.00531 0.0669 0.257 pDC L2
ENSG00000146409 SLC18B1 693467 sc-eQTL 2.69e-01 -0.108 0.0971 0.257 pDC L2
ENSG00000286438 AL591115.1 403678 sc-eQTL 9.92e-02 0.153 0.0924 0.257 pDC L2
ENSG00000286887 AL355881.1 -789495 sc-eQTL 9.37e-01 -0.00651 0.0827 0.257 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000028839 TBPL1 -445364 sc-eQTL 3.14e-01 0.1 0.0997 0.25 B_Memory LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 993608 sc-eQTL 6.26e-02 0.102 0.0545 0.25 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 743347 sc-eQTL 2.48e-01 0.1 0.0867 0.25 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 692237 sc-eQTL 7.19e-01 0.0179 0.0495 0.25 B_Memory LOneK1K
ENSG00000118515 SGK1 -811306 sc-eQTL 2.71e-01 0.0853 0.0773 0.25 B_Memory LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 693467 sc-eQTL 7.48e-01 0.0292 0.0909 0.25 B_Memory LOneK1K
ENSG00000028839 TBPL1 -445364 sc-eQTL 5.84e-02 0.177 0.0929 0.25 B_Naive LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 993608 sc-eQTL 2.51e-01 0.0484 0.0421 0.25 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 743347 sc-eQTL 3.87e-01 -0.0708 0.0818 0.25 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 692237 sc-eQTL 3.90e-01 0.0426 0.0495 0.25 B_Naive LOneK1K
ENSG00000118515 SGK1 -811306 sc-eQTL 3.44e-01 0.0726 0.0766 0.25 B_Naive LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 693467 sc-eQTL 5.02e-01 0.0628 0.0934 0.25 B_Naive LOneK1K
ENSG00000028839 TBPL1 -445364 sc-eQTL 3.78e-01 0.0673 0.0761 0.25 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 993608 sc-eQTL 6.52e-01 0.0239 0.053 0.25 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000093134 VNN3 772041 sc-eQTL 5.72e-01 0.0489 0.0864 0.25 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112299 VNN1 792751 sc-eQTL 1.11e-01 0.143 0.0896 0.25 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 743347 sc-eQTL 1.02e-01 -0.0973 0.0592 0.25 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 692237 sc-eQTL 5.22e-01 0.0262 0.0408 0.25 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000118515 SGK1 -811306 sc-eQTL 7.35e-01 -0.0189 0.0557 0.25 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 693467 sc-eQTL 4.73e-01 -0.0522 0.0726 0.25 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000286887 AL355881.1 -789495 sc-eQTL 3.64e-01 0.0692 0.0761 0.25 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000028839 TBPL1 -445364 sc-eQTL 1.23e-01 0.152 0.098 0.252 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 993608 sc-eQTL 6.90e-01 0.026 0.065 0.252 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000093134 VNN3 772041 sc-eQTL 7.99e-01 0.0243 0.0956 0.252 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112299 VNN1 792751 sc-eQTL 2.98e-01 0.0986 0.0945 0.252 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 743347 sc-eQTL 6.21e-01 0.0443 0.0893 0.252 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 692237 sc-eQTL 9.35e-01 0.00311 0.0379 0.252 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000118515 SGK1 -811306 sc-eQTL 5.76e-01 0.0321 0.0573 0.252 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 693467 sc-eQTL 7.91e-01 0.0245 0.092 0.252 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000286887 AL355881.1 -789495 sc-eQTL 3.34e-01 0.0804 0.083 0.252 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000028839 TBPL1 -445364 sc-eQTL 2.88e-01 0.0841 0.0789 0.252 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 993608 sc-eQTL 6.83e-01 0.0304 0.0743 0.252 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 743347 sc-eQTL 2.34e-01 -0.112 0.0938 0.252 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 692237 sc-eQTL 5.44e-01 -0.0233 0.0384 0.252 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000118515 SGK1 -811306 sc-eQTL 6.19e-01 -0.0394 0.0793 0.252 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000079950 STX7 993608 pQTL 0.0714 -0.0468 0.0259 0.00209 0.0 0.249
ENSG00000079950 STX7 993608 eQTL 0.00684 0.0502 0.0185 0.0 0.0 0.237
ENSG00000112299 VNN1 792751 pQTL 0.00477 0.113 0.04 0.0 0.0 0.249

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina