logo

Genes within 1Mb (chr6:133506457:A:G):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000028839 TBPL1 -445713 sc-eQTL 8.98e-01 0.0155 0.12 0.158 B L1
ENSG00000079950 STX7 993259 sc-eQTL 7.18e-01 -0.0172 0.0478 0.158 B L1
ENSG00000112303 VNN2 742998 sc-eQTL 8.20e-01 -0.0204 0.0898 0.158 B L1
ENSG00000112306 RPS12 691888 sc-eQTL 6.37e-01 -0.0257 0.0543 0.158 B L1
ENSG00000118515 SGK1 -811655 sc-eQTL 8.22e-01 0.0189 0.0837 0.158 B L1
ENSG00000146409 SLC18B1 693118 sc-eQTL 8.00e-01 0.029 0.114 0.158 B L1
ENSG00000028839 TBPL1 -445713 sc-eQTL 8.10e-02 0.153 0.0875 0.158 CD4T L1
ENSG00000079950 STX7 993259 sc-eQTL 1.58e-01 -0.129 0.0912 0.158 CD4T L1
ENSG00000112303 VNN2 742998 sc-eQTL 1.07e-01 -0.128 0.0788 0.158 CD4T L1
ENSG00000112306 RPS12 691888 sc-eQTL 5.61e-01 -0.0314 0.0539 0.158 CD4T L1
ENSG00000118515 SGK1 -811655 sc-eQTL 8.85e-01 -0.0105 0.0725 0.158 CD4T L1
ENSG00000146409 SLC18B1 693118 sc-eQTL 7.00e-01 0.0422 0.109 0.158 CD4T L1
ENSG00000028839 TBPL1 -445713 sc-eQTL 4.40e-01 -0.0666 0.086 0.158 CD8T L1
ENSG00000079950 STX7 993259 sc-eQTL 4.09e-01 0.0743 0.0897 0.158 CD8T L1
ENSG00000112303 VNN2 742998 sc-eQTL 7.11e-01 -0.0389 0.105 0.158 CD8T L1
ENSG00000112306 RPS12 691888 sc-eQTL 7.27e-01 0.0125 0.0359 0.158 CD8T L1
ENSG00000118515 SGK1 -811655 sc-eQTL 7.83e-01 -0.0153 0.0553 0.158 CD8T L1
ENSG00000146409 SLC18B1 693118 sc-eQTL 1.16e-01 0.17 0.108 0.158 CD8T L1
ENSG00000028839 TBPL1 -445713 sc-eQTL 6.50e-01 -0.0615 0.135 0.16 DC L1
ENSG00000079950 STX7 993259 sc-eQTL 5.01e-01 0.0566 0.0841 0.16 DC L1
ENSG00000093134 VNN3 771692 sc-eQTL 7.15e-01 0.0382 0.104 0.16 DC L1
ENSG00000112299 VNN1 792402 sc-eQTL 9.45e-02 0.188 0.112 0.16 DC L1
ENSG00000112303 VNN2 742998 sc-eQTL 9.06e-01 0.0143 0.121 0.16 DC L1
ENSG00000112306 RPS12 691888 sc-eQTL 2.28e-01 0.0813 0.0673 0.16 DC L1
ENSG00000118515 SGK1 -811655 sc-eQTL 7.56e-01 0.0244 0.0784 0.16 DC L1
ENSG00000146409 SLC18B1 693118 sc-eQTL 2.73e-01 0.117 0.107 0.16 DC L1
ENSG00000286438 AL591115.1 403329 sc-eQTL 6.34e-01 -0.0464 0.0973 0.16 DC L1
ENSG00000286887 AL355881.1 -789844 sc-eQTL 5.57e-01 -0.0713 0.121 0.16 DC L1
ENSG00000028839 TBPL1 -445713 sc-eQTL 2.60e-01 0.104 0.0924 0.158 Mono L1
ENSG00000079950 STX7 993259 sc-eQTL 6.10e-01 0.0317 0.062 0.158 Mono L1
ENSG00000093134 VNN3 771692 sc-eQTL 5.14e-04 0.365 0.103 0.158 Mono L1
ENSG00000112299 VNN1 792402 sc-eQTL 6.17e-01 0.0574 0.114 0.158 Mono L1
ENSG00000112303 VNN2 742998 sc-eQTL 4.18e-01 0.0655 0.0807 0.158 Mono L1
ENSG00000112306 RPS12 691888 sc-eQTL 9.11e-01 -0.00542 0.0484 0.158 Mono L1
ENSG00000118515 SGK1 -811655 sc-eQTL 2.00e-01 -0.0876 0.0681 0.158 Mono L1
ENSG00000146409 SLC18B1 693118 sc-eQTL 1.19e-01 0.149 0.0953 0.158 Mono L1
ENSG00000286887 AL355881.1 -789844 sc-eQTL 6.70e-01 -0.0402 0.0941 0.158 Mono L1
ENSG00000028839 TBPL1 -445713 sc-eQTL 6.91e-01 -0.0395 0.0991 0.159 NK L1
ENSG00000079950 STX7 993259 sc-eQTL 4.68e-01 0.0665 0.0915 0.159 NK L1
ENSG00000112303 VNN2 742998 sc-eQTL 2.94e-01 -0.12 0.114 0.159 NK L1
ENSG00000112306 RPS12 691888 sc-eQTL 6.75e-01 -0.0198 0.0472 0.159 NK L1
ENSG00000118515 SGK1 -811655 sc-eQTL 3.08e-01 -0.0891 0.0871 0.159 NK L1
ENSG00000028839 TBPL1 -445713 sc-eQTL 9.84e-01 -0.00236 0.116 0.158 Other_T L1
ENSG00000079950 STX7 993259 sc-eQTL 2.80e-01 0.0983 0.0908 0.158 Other_T L1
ENSG00000112303 VNN2 742998 sc-eQTL 3.00e-02 0.238 0.109 0.158 Other_T L1
ENSG00000112306 RPS12 691888 sc-eQTL 5.18e-01 -0.0282 0.0436 0.158 Other_T L1
ENSG00000118515 SGK1 -811655 sc-eQTL 1.19e-01 -0.125 0.0799 0.158 Other_T L1
ENSG00000146409 SLC18B1 693118 sc-eQTL 2.37e-01 0.141 0.119 0.158 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000028839 TBPL1 -445713 sc-eQTL 3.06e-01 -0.137 0.133 0.161 B_Activated L2
ENSG00000079950 STX7 993259 sc-eQTL 5.43e-01 0.0694 0.114 0.161 B_Activated L2
ENSG00000112303 VNN2 742998 sc-eQTL 5.34e-01 0.0756 0.121 0.161 B_Activated L2
ENSG00000112306 RPS12 691888 sc-eQTL 9.39e-01 0.005 0.0651 0.161 B_Activated L2
ENSG00000118515 SGK1 -811655 sc-eQTL 7.71e-01 -0.0338 0.116 0.161 B_Activated L2
ENSG00000146409 SLC18B1 693118 sc-eQTL 6.30e-01 0.055 0.114 0.161 B_Activated L2
ENSG00000028839 TBPL1 -445713 sc-eQTL 4.89e-01 -0.0895 0.129 0.157 B_Intermediate L2
ENSG00000079950 STX7 993259 sc-eQTL 9.40e-01 0.00559 0.0743 0.157 B_Intermediate L2
ENSG00000112303 VNN2 742998 sc-eQTL 7.04e-01 0.0426 0.112 0.157 B_Intermediate L2
ENSG00000112306 RPS12 691888 sc-eQTL 6.37e-01 -0.0324 0.0685 0.157 B_Intermediate L2
ENSG00000118515 SGK1 -811655 sc-eQTL 9.10e-01 -0.0134 0.119 0.157 B_Intermediate L2
ENSG00000146409 SLC18B1 693118 sc-eQTL 9.29e-01 -0.011 0.123 0.157 B_Intermediate L2
ENSG00000028839 TBPL1 -445713 sc-eQTL 8.68e-02 0.211 0.123 0.159 B_Memory L2
ENSG00000079950 STX7 993259 sc-eQTL 1.39e-01 -0.132 0.0889 0.159 B_Memory L2
ENSG00000112303 VNN2 742998 sc-eQTL 1.55e-01 0.166 0.116 0.159 B_Memory L2
ENSG00000112306 RPS12 691888 sc-eQTL 3.69e-01 0.0506 0.0562 0.159 B_Memory L2
ENSG00000118515 SGK1 -811655 sc-eQTL 4.34e-01 0.0808 0.103 0.159 B_Memory L2
ENSG00000146409 SLC18B1 693118 sc-eQTL 3.21e-01 -0.117 0.117 0.159 B_Memory L2
ENSG00000028839 TBPL1 -445713 sc-eQTL 2.15e-01 0.144 0.116 0.158 B_Naive1 L2
ENSG00000079950 STX7 993259 sc-eQTL 3.73e-01 -0.0499 0.0559 0.158 B_Naive1 L2
ENSG00000112303 VNN2 742998 sc-eQTL 1.93e-01 -0.141 0.108 0.158 B_Naive1 L2
ENSG00000112306 RPS12 691888 sc-eQTL 1.52e-01 -0.0885 0.0616 0.158 B_Naive1 L2
ENSG00000118515 SGK1 -811655 sc-eQTL 8.84e-01 -0.0142 0.0968 0.158 B_Naive1 L2
ENSG00000146409 SLC18B1 693118 sc-eQTL 3.63e-01 0.109 0.119 0.158 B_Naive1 L2
ENSG00000028839 TBPL1 -445713 sc-eQTL 9.81e-01 -0.00299 0.124 0.159 B_Naive2 L2
ENSG00000079950 STX7 993259 sc-eQTL 8.75e-01 -0.0104 0.0659 0.159 B_Naive2 L2
ENSG00000112303 VNN2 742998 sc-eQTL 3.72e-01 0.108 0.121 0.159 B_Naive2 L2
ENSG00000112306 RPS12 691888 sc-eQTL 4.78e-01 -0.0455 0.064 0.159 B_Naive2 L2
ENSG00000118515 SGK1 -811655 sc-eQTL 6.21e-02 -0.21 0.112 0.159 B_Naive2 L2
ENSG00000146409 SLC18B1 693118 sc-eQTL 3.82e-01 0.107 0.122 0.159 B_Naive2 L2
ENSG00000028839 TBPL1 -445713 sc-eQTL 9.06e-01 0.0144 0.121 0.159 CD4_CTL L2
ENSG00000079950 STX7 993259 sc-eQTL 6.15e-01 -0.0605 0.12 0.159 CD4_CTL L2
ENSG00000112303 VNN2 742998 sc-eQTL 2.53e-01 0.138 0.121 0.159 CD4_CTL L2
ENSG00000112306 RPS12 691888 sc-eQTL 3.32e-01 -0.0542 0.0558 0.159 CD4_CTL L2
ENSG00000118515 SGK1 -811655 sc-eQTL 1.17e-01 -0.152 0.0963 0.159 CD4_CTL L2
ENSG00000146409 SLC18B1 693118 sc-eQTL 6.78e-01 -0.0469 0.113 0.159 CD4_CTL L2
ENSG00000028839 TBPL1 -445713 sc-eQTL 3.15e-02 0.215 0.0993 0.158 CD4_Naive L2
ENSG00000079950 STX7 993259 sc-eQTL 1.86e-01 -0.13 0.098 0.158 CD4_Naive L2
ENSG00000112303 VNN2 742998 sc-eQTL 2.34e-01 -0.108 0.0909 0.158 CD4_Naive L2
ENSG00000112306 RPS12 691888 sc-eQTL 4.80e-01 -0.0419 0.0591 0.158 CD4_Naive L2
ENSG00000118515 SGK1 -811655 sc-eQTL 4.79e-01 -0.0513 0.0724 0.158 CD4_Naive L2
ENSG00000146409 SLC18B1 693118 sc-eQTL 9.67e-01 0.00465 0.114 0.158 CD4_Naive L2
ENSG00000028839 TBPL1 -445713 sc-eQTL 2.28e-01 0.13 0.108 0.158 CD4_TCM L2
ENSG00000079950 STX7 993259 sc-eQTL 9.92e-01 0.00106 0.109 0.158 CD4_TCM L2
ENSG00000112303 VNN2 742998 sc-eQTL 3.87e-01 -0.0928 0.107 0.158 CD4_TCM L2
ENSG00000112306 RPS12 691888 sc-eQTL 5.00e-01 -0.0375 0.0555 0.158 CD4_TCM L2
ENSG00000118515 SGK1 -811655 sc-eQTL 7.12e-01 0.0287 0.0777 0.158 CD4_TCM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 693118 sc-eQTL 6.34e-01 -0.0612 0.129 0.158 CD4_TCM L2
ENSG00000028839 TBPL1 -445713 sc-eQTL 7.91e-02 -0.213 0.121 0.158 CD4_TEM L2
ENSG00000079950 STX7 993259 sc-eQTL 1.32e-01 -0.183 0.121 0.158 CD4_TEM L2
ENSG00000112303 VNN2 742998 sc-eQTL 6.96e-01 0.0457 0.117 0.158 CD4_TEM L2
ENSG00000112306 RPS12 691888 sc-eQTL 4.03e-01 -0.0401 0.0479 0.158 CD4_TEM L2
ENSG00000118515 SGK1 -811655 sc-eQTL 4.17e-01 -0.0669 0.0823 0.158 CD4_TEM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 693118 sc-eQTL 3.06e-01 0.122 0.119 0.158 CD4_TEM L2
ENSG00000028839 TBPL1 -445713 sc-eQTL 8.42e-01 0.0213 0.107 0.158 CD8_CTL L2
ENSG00000079950 STX7 993259 sc-eQTL 5.79e-01 0.0556 0.1 0.158 CD8_CTL L2
ENSG00000112303 VNN2 742998 sc-eQTL 7.38e-01 0.0381 0.114 0.158 CD8_CTL L2
ENSG00000112306 RPS12 691888 sc-eQTL 2.52e-01 -0.0697 0.0607 0.158 CD8_CTL L2
ENSG00000118515 SGK1 -811655 sc-eQTL 3.33e-01 -0.0995 0.103 0.158 CD8_CTL L2
ENSG00000146409 SLC18B1 693118 sc-eQTL 3.20e-01 0.117 0.118 0.158 CD8_CTL L2
ENSG00000028839 TBPL1 -445713 sc-eQTL 1.39e-01 -0.167 0.113 0.158 CD8_Naive L2
ENSG00000079950 STX7 993259 sc-eQTL 8.92e-01 0.0164 0.121 0.158 CD8_Naive L2
ENSG00000112303 VNN2 742998 sc-eQTL 5.83e-01 -0.0572 0.104 0.158 CD8_Naive L2
ENSG00000112306 RPS12 691888 sc-eQTL 6.49e-01 -0.0271 0.0596 0.158 CD8_Naive L2
ENSG00000118515 SGK1 -811655 sc-eQTL 7.18e-01 -0.0271 0.0748 0.158 CD8_Naive L2
ENSG00000146409 SLC18B1 693118 sc-eQTL 3.06e-01 0.123 0.119 0.158 CD8_Naive L2
ENSG00000028839 TBPL1 -445713 sc-eQTL 4.26e-01 -0.102 0.128 0.16 CD8_TCM L2
ENSG00000079950 STX7 993259 sc-eQTL 8.18e-01 0.0273 0.118 0.16 CD8_TCM L2
ENSG00000112303 VNN2 742998 sc-eQTL 4.20e-02 -0.238 0.116 0.16 CD8_TCM L2
ENSG00000112306 RPS12 691888 sc-eQTL 6.57e-01 0.0255 0.0573 0.16 CD8_TCM L2
ENSG00000118515 SGK1 -811655 sc-eQTL 9.05e-03 -0.246 0.0932 0.16 CD8_TCM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 693118 sc-eQTL 5.68e-01 0.0717 0.125 0.16 CD8_TCM L2
ENSG00000028839 TBPL1 -445713 sc-eQTL 9.86e-01 -0.00209 0.119 0.146 CD8_TEM L2
ENSG00000079950 STX7 993259 sc-eQTL 8.02e-01 0.0328 0.13 0.146 CD8_TEM L2
ENSG00000112303 VNN2 742998 sc-eQTL 3.66e-01 -0.117 0.129 0.146 CD8_TEM L2
ENSG00000112306 RPS12 691888 sc-eQTL 8.92e-02 -0.118 0.0692 0.146 CD8_TEM L2
ENSG00000118515 SGK1 -811655 sc-eQTL 4.00e-01 -0.0961 0.114 0.146 CD8_TEM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 693118 sc-eQTL 5.68e-01 0.0754 0.132 0.146 CD8_TEM L2
ENSG00000028839 TBPL1 -445713 sc-eQTL 6.50e-01 -0.0545 0.12 0.158 MAIT L2
ENSG00000079950 STX7 993259 sc-eQTL 9.73e-01 -0.00392 0.114 0.158 MAIT L2
ENSG00000112303 VNN2 742998 sc-eQTL 9.44e-03 0.299 0.114 0.158 MAIT L2
ENSG00000112306 RPS12 691888 sc-eQTL 7.02e-01 -0.0218 0.057 0.158 MAIT L2
ENSG00000118515 SGK1 -811655 sc-eQTL 5.09e-01 -0.053 0.0801 0.158 MAIT L2
ENSG00000146409 SLC18B1 693118 sc-eQTL 5.95e-01 0.0636 0.119 0.158 MAIT L2
ENSG00000028839 TBPL1 -445713 sc-eQTL 8.26e-01 0.0286 0.13 0.158 NK_CD56bright L2
ENSG00000079950 STX7 993259 sc-eQTL 3.73e-02 -0.25 0.119 0.158 NK_CD56bright L2
ENSG00000112303 VNN2 742998 sc-eQTL 1.81e-01 -0.163 0.122 0.158 NK_CD56bright L2
ENSG00000112306 RPS12 691888 sc-eQTL 5.00e-01 0.0459 0.068 0.158 NK_CD56bright L2
ENSG00000118515 SGK1 -811655 sc-eQTL 2.60e-01 0.115 0.101 0.158 NK_CD56bright L2
ENSG00000028839 TBPL1 -445713 sc-eQTL 1.14e-01 -0.168 0.106 0.159 NK_CD56dim L2
ENSG00000079950 STX7 993259 sc-eQTL 1.68e-01 0.134 0.0972 0.159 NK_CD56dim L2
ENSG00000112303 VNN2 742998 sc-eQTL 6.22e-01 -0.0602 0.122 0.159 NK_CD56dim L2
ENSG00000112306 RPS12 691888 sc-eQTL 7.65e-01 -0.0145 0.0485 0.159 NK_CD56dim L2
ENSG00000118515 SGK1 -811655 sc-eQTL 1.48e-01 -0.155 0.107 0.159 NK_CD56dim L2
ENSG00000028839 TBPL1 -445713 sc-eQTL 7.23e-01 0.0478 0.134 0.155 NK_HLA L2
ENSG00000079950 STX7 993259 sc-eQTL 5.41e-01 -0.0749 0.122 0.155 NK_HLA L2
ENSG00000112303 VNN2 742998 sc-eQTL 4.15e-01 -0.101 0.124 0.155 NK_HLA L2
ENSG00000112306 RPS12 691888 sc-eQTL 9.00e-01 -0.00728 0.0577 0.155 NK_HLA L2
ENSG00000118515 SGK1 -811655 sc-eQTL 5.76e-01 0.0638 0.114 0.155 NK_HLA L2
ENSG00000028839 TBPL1 -445713 sc-eQTL 5.62e-01 -0.0629 0.108 0.159 NK_cytokine L2
ENSG00000079950 STX7 993259 sc-eQTL 6.50e-01 -0.0476 0.105 0.159 NK_cytokine L2
ENSG00000112303 VNN2 742998 sc-eQTL 2.79e-01 -0.128 0.118 0.159 NK_cytokine L2
ENSG00000112306 RPS12 691888 sc-eQTL 9.42e-01 -0.00469 0.064 0.159 NK_cytokine L2
ENSG00000118515 SGK1 -811655 sc-eQTL 3.45e-01 -0.101 0.106 0.159 NK_cytokine L2
ENSG00000028839 TBPL1 -445713 sc-eQTL 8.62e-01 0.0233 0.134 0.189 PB L2
ENSG00000079950 STX7 993259 sc-eQTL 2.90e-01 -0.101 0.0951 0.189 PB L2
ENSG00000112303 VNN2 742998 sc-eQTL 2.49e-01 0.134 0.116 0.189 PB L2
ENSG00000112306 RPS12 691888 sc-eQTL 8.69e-01 0.011 0.0663 0.189 PB L2
ENSG00000118515 SGK1 -811655 sc-eQTL 2.79e-01 -0.116 0.107 0.189 PB L2
ENSG00000146409 SLC18B1 693118 sc-eQTL 5.51e-02 -0.237 0.122 0.189 PB L2
ENSG00000028839 TBPL1 -445713 sc-eQTL 1.37e-01 0.178 0.119 0.157 Pro_T L2
ENSG00000079950 STX7 993259 sc-eQTL 9.08e-01 0.0124 0.107 0.157 Pro_T L2
ENSG00000112303 VNN2 742998 sc-eQTL 3.78e-01 0.101 0.115 0.157 Pro_T L2
ENSG00000112306 RPS12 691888 sc-eQTL 3.11e-01 -0.0441 0.0434 0.157 Pro_T L2
ENSG00000118515 SGK1 -811655 sc-eQTL 9.87e-01 -0.00137 0.0871 0.157 Pro_T L2
ENSG00000146409 SLC18B1 693118 sc-eQTL 9.07e-01 -0.0132 0.112 0.157 Pro_T L2
ENSG00000028839 TBPL1 -445713 sc-eQTL 4.15e-01 0.101 0.124 0.158 Treg L2
ENSG00000079950 STX7 993259 sc-eQTL 1.02e-03 -0.38 0.114 0.158 Treg L2
ENSG00000112303 VNN2 742998 sc-eQTL 4.92e-01 -0.0677 0.0984 0.158 Treg L2
ENSG00000112306 RPS12 691888 sc-eQTL 2.20e-01 -0.0534 0.0434 0.158 Treg L2
ENSG00000118515 SGK1 -811655 sc-eQTL 4.60e-01 0.0679 0.0917 0.158 Treg L2
ENSG00000146409 SLC18B1 693118 sc-eQTL 6.55e-02 0.226 0.122 0.158 Treg L2
ENSG00000028839 TBPL1 -445713 sc-eQTL 4.21e-01 -0.113 0.14 0.144 cDC L2
ENSG00000079950 STX7 993259 sc-eQTL 1.61e-01 -0.154 0.11 0.144 cDC L2
ENSG00000093134 VNN3 771692 sc-eQTL 9.84e-01 -0.00219 0.11 0.144 cDC L2
ENSG00000112299 VNN1 792402 sc-eQTL 1.53e-01 0.184 0.128 0.144 cDC L2
ENSG00000112303 VNN2 742998 sc-eQTL 7.05e-01 -0.0475 0.126 0.144 cDC L2
ENSG00000112306 RPS12 691888 sc-eQTL 3.20e-01 0.0617 0.0618 0.144 cDC L2
ENSG00000118515 SGK1 -811655 sc-eQTL 5.01e-01 -0.0703 0.104 0.144 cDC L2
ENSG00000146409 SLC18B1 693118 sc-eQTL 3.04e-01 0.126 0.122 0.144 cDC L2
ENSG00000286438 AL591115.1 403329 sc-eQTL 5.75e-01 0.0551 0.0981 0.144 cDC L2
ENSG00000286887 AL355881.1 -789844 sc-eQTL 3.86e-01 -0.105 0.121 0.144 cDC L2
ENSG00000028839 TBPL1 -445713 sc-eQTL 2.91e-01 0.11 0.104 0.158 cMono_IL1B L2
ENSG00000079950 STX7 993259 sc-eQTL 5.48e-01 0.0476 0.0792 0.158 cMono_IL1B L2
ENSG00000093134 VNN3 771692 sc-eQTL 9.73e-04 0.365 0.109 0.158 cMono_IL1B L2
ENSG00000112299 VNN1 792402 sc-eQTL 9.27e-01 -0.0103 0.113 0.158 cMono_IL1B L2
ENSG00000112303 VNN2 742998 sc-eQTL 2.19e-01 0.111 0.0901 0.158 cMono_IL1B L2
ENSG00000112306 RPS12 691888 sc-eQTL 9.21e-01 -0.00495 0.0502 0.158 cMono_IL1B L2
ENSG00000118515 SGK1 -811655 sc-eQTL 3.81e-01 -0.0656 0.0747 0.158 cMono_IL1B L2
ENSG00000146409 SLC18B1 693118 sc-eQTL 2.01e-01 0.124 0.0965 0.158 cMono_IL1B L2
ENSG00000286887 AL355881.1 -789844 sc-eQTL 5.61e-01 -0.0587 0.101 0.158 cMono_IL1B L2
ENSG00000028839 TBPL1 -445713 sc-eQTL 3.36e-01 0.114 0.118 0.158 cMono_S100A L2
ENSG00000079950 STX7 993259 sc-eQTL 7.70e-01 0.0251 0.0854 0.158 cMono_S100A L2
ENSG00000093134 VNN3 771692 sc-eQTL 1.81e-03 0.329 0.104 0.158 cMono_S100A L2
ENSG00000112299 VNN1 792402 sc-eQTL 2.38e-01 0.137 0.115 0.158 cMono_S100A L2
ENSG00000112303 VNN2 742998 sc-eQTL 2.69e-01 0.0839 0.0757 0.158 cMono_S100A L2
ENSG00000112306 RPS12 691888 sc-eQTL 7.11e-01 -0.0202 0.0546 0.158 cMono_S100A L2
ENSG00000118515 SGK1 -811655 sc-eQTL 8.77e-02 -0.106 0.0621 0.158 cMono_S100A L2
ENSG00000146409 SLC18B1 693118 sc-eQTL 9.94e-02 0.166 0.1 0.158 cMono_S100A L2
ENSG00000286887 AL355881.1 -789844 sc-eQTL 6.20e-01 0.0491 0.0988 0.158 cMono_S100A L2
ENSG00000028839 TBPL1 -445713 sc-eQTL 3.84e-01 -0.141 0.162 0.148 gdT L2
ENSG00000079950 STX7 993259 sc-eQTL 4.90e-01 0.0965 0.139 0.148 gdT L2
ENSG00000112303 VNN2 742998 sc-eQTL 6.38e-01 0.0727 0.154 0.148 gdT L2
ENSG00000112306 RPS12 691888 sc-eQTL 9.59e-01 0.00301 0.0588 0.148 gdT L2
ENSG00000118515 SGK1 -811655 sc-eQTL 1.01e-02 -0.283 0.108 0.148 gdT L2
ENSG00000146409 SLC18B1 693118 sc-eQTL 2.23e-01 0.185 0.151 0.148 gdT L2
ENSG00000028839 TBPL1 -445713 sc-eQTL 7.80e-01 -0.0339 0.121 0.162 intMono L2
ENSG00000079950 STX7 993259 sc-eQTL 2.49e-01 0.133 0.115 0.162 intMono L2
ENSG00000093134 VNN3 771692 sc-eQTL 4.21e-01 0.0939 0.117 0.162 intMono L2
ENSG00000112299 VNN1 792402 sc-eQTL 6.29e-01 0.0559 0.115 0.162 intMono L2
ENSG00000112303 VNN2 742998 sc-eQTL 1.28e-02 -0.29 0.115 0.162 intMono L2
ENSG00000112306 RPS12 691888 sc-eQTL 9.11e-01 -0.0057 0.051 0.162 intMono L2
ENSG00000118515 SGK1 -811655 sc-eQTL 5.89e-01 -0.0463 0.0857 0.162 intMono L2
ENSG00000146409 SLC18B1 693118 sc-eQTL 1.18e-01 -0.194 0.123 0.162 intMono L2
ENSG00000286887 AL355881.1 -789844 sc-eQTL 9.70e-01 -0.00448 0.119 0.162 intMono L2
ENSG00000028839 TBPL1 -445713 sc-eQTL 7.56e-01 -0.0391 0.126 0.152 ncMono L2
ENSG00000079950 STX7 993259 sc-eQTL 9.29e-01 -0.00755 0.0851 0.152 ncMono L2
ENSG00000093134 VNN3 771692 sc-eQTL 3.31e-02 0.255 0.119 0.152 ncMono L2
ENSG00000112299 VNN1 792402 sc-eQTL 7.16e-01 -0.0435 0.119 0.152 ncMono L2
ENSG00000112303 VNN2 742998 sc-eQTL 4.16e-01 -0.0933 0.114 0.152 ncMono L2
ENSG00000112306 RPS12 691888 sc-eQTL 7.24e-01 -0.0203 0.0575 0.152 ncMono L2
ENSG00000118515 SGK1 -811655 sc-eQTL 3.07e-01 -0.0831 0.0811 0.152 ncMono L2
ENSG00000146409 SLC18B1 693118 sc-eQTL 2.71e-01 0.112 0.101 0.152 ncMono L2
ENSG00000286887 AL355881.1 -789844 sc-eQTL 9.31e-01 -0.00936 0.107 0.152 ncMono L2
ENSG00000028839 TBPL1 -445713 sc-eQTL 7.23e-01 0.0529 0.149 0.158 pDC L2
ENSG00000079950 STX7 993259 sc-eQTL 8.17e-02 0.172 0.0984 0.158 pDC L2
ENSG00000093134 VNN3 771692 sc-eQTL 7.61e-01 0.0304 0.1 0.158 pDC L2
ENSG00000112299 VNN1 792402 sc-eQTL 2.00e-01 0.13 0.101 0.158 pDC L2
ENSG00000112303 VNN2 742998 sc-eQTL 4.31e-01 0.0954 0.121 0.158 pDC L2
ENSG00000112306 RPS12 691888 sc-eQTL 2.32e-01 0.0996 0.0831 0.158 pDC L2
ENSG00000118515 SGK1 -811655 sc-eQTL 3.07e-01 0.0867 0.0845 0.158 pDC L2
ENSG00000146409 SLC18B1 693118 sc-eQTL 9.95e-01 -0.000751 0.124 0.158 pDC L2
ENSG00000286438 AL591115.1 403329 sc-eQTL 3.77e-01 -0.105 0.118 0.158 pDC L2
ENSG00000286887 AL355881.1 -789844 sc-eQTL 8.19e-01 -0.024 0.105 0.158 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000028839 TBPL1 -445713 sc-eQTL 2.66e-01 -0.138 0.124 0.158 B_Memory LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 993259 sc-eQTL 7.64e-01 -0.0205 0.0682 0.158 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 742998 sc-eQTL 3.32e-01 0.105 0.108 0.158 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 691888 sc-eQTL 7.30e-01 -0.0212 0.0615 0.158 B_Memory LOneK1K
ENSG00000118515 SGK1 -811655 sc-eQTL 9.38e-01 0.00755 0.0961 0.158 B_Memory LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 693118 sc-eQTL 5.22e-01 -0.0723 0.113 0.158 B_Memory LOneK1K
ENSG00000028839 TBPL1 -445713 sc-eQTL 5.29e-01 0.0733 0.116 0.158 B_Naive LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 993259 sc-eQTL 2.63e-01 -0.0587 0.0523 0.158 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 742998 sc-eQTL 7.52e-01 -0.0322 0.102 0.158 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 691888 sc-eQTL 1.69e-01 -0.0846 0.0613 0.158 B_Naive LOneK1K
ENSG00000118515 SGK1 -811655 sc-eQTL 2.63e-01 -0.107 0.0951 0.158 B_Naive LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 693118 sc-eQTL 3.33e-01 0.113 0.116 0.158 B_Naive LOneK1K
ENSG00000028839 TBPL1 -445713 sc-eQTL 3.91e-01 0.0824 0.0959 0.158 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 993259 sc-eQTL 6.79e-01 0.0277 0.0668 0.158 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000093134 VNN3 771692 sc-eQTL 1.25e-03 0.348 0.106 0.158 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112299 VNN1 792402 sc-eQTL 7.49e-01 0.0364 0.114 0.158 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 742998 sc-eQTL 5.03e-01 0.0504 0.075 0.158 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 691888 sc-eQTL 9.98e-01 0.000133 0.0515 0.158 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000118515 SGK1 -811655 sc-eQTL 2.56e-01 -0.0797 0.0699 0.158 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 693118 sc-eQTL 3.99e-02 0.188 0.0907 0.158 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000286887 AL355881.1 -789844 sc-eQTL 9.07e-01 -0.0112 0.0961 0.158 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000028839 TBPL1 -445713 sc-eQTL 9.20e-01 0.0123 0.123 0.159 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 993259 sc-eQTL 2.05e-01 0.103 0.081 0.159 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000093134 VNN3 771692 sc-eQTL 4.27e-03 0.339 0.117 0.159 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112299 VNN1 792402 sc-eQTL 8.56e-01 -0.0216 0.118 0.159 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 742998 sc-eQTL 7.97e-02 -0.195 0.111 0.159 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 691888 sc-eQTL 8.11e-01 0.0113 0.0474 0.159 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000118515 SGK1 -811655 sc-eQTL 4.56e-01 -0.0536 0.0717 0.159 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 693118 sc-eQTL 2.51e-01 -0.132 0.115 0.159 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000286887 AL355881.1 -789844 sc-eQTL 6.57e-01 -0.0463 0.104 0.159 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000028839 TBPL1 -445713 sc-eQTL 1.09e-01 -0.157 0.0978 0.159 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 993259 sc-eQTL 3.67e-01 0.0833 0.0922 0.159 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 742998 sc-eQTL 5.46e-01 -0.0707 0.117 0.159 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 691888 sc-eQTL 6.91e-01 -0.019 0.0477 0.159 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000118515 SGK1 -811655 sc-eQTL 1.43e-02 -0.24 0.0972 0.159 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000079950 STX7 993259 eQTL 0.0433 -0.0453 0.0224 0.0 0.0 0.139
ENSG00000093134 VNN3 771692 eQTL 0.0211 0.0475 0.0206 0.0 0.0 0.139
ENSG00000112299 VNN1 792402 pQTL 0.0263 -0.112 0.0504 0.0 0.0 0.135

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000093134 VNN3 771692 2.74e-07 1.27e-07 4.48e-08 1.81e-07 9.25e-08 9.9e-08 1.61e-07 5.48e-08 1.45e-07 5.42e-08 1.52e-07 9e-08 1.52e-07 7.13e-08 6.04e-08 7.36e-08 4.17e-08 1.27e-07 5.97e-08 4.1e-08 1.21e-07 1.24e-07 1.45e-07 2.91e-08 1.5e-07 1.14e-07 1.07e-07 9.61e-08 1.12e-07 1e-07 1.02e-07 3.26e-08 3.73e-08 8.25e-08 6.67e-08 3.28e-08 5.37e-08 8.63e-08 6.59e-08 3.8e-08 5.13e-08 1.46e-07 5.2e-08 1.17e-08 4.25e-08 1.84e-08 1.22e-07 1.89e-09 4.99e-08