logo

Genes within 1Mb (chr6:133498705:T:A):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000028839 TBPL1 -453465 sc-eQTL 1.65e-01 0.128 0.0921 0.25 B L1
ENSG00000079950 STX7 985507 sc-eQTL 2.38e-01 0.0434 0.0367 0.25 B L1
ENSG00000112303 VNN2 735246 sc-eQTL 7.15e-01 -0.0254 0.0693 0.25 B L1
ENSG00000112306 RPS12 684136 sc-eQTL 5.13e-01 0.0274 0.0418 0.25 B L1
ENSG00000118515 SGK1 -819407 sc-eQTL 1.48e-01 0.0934 0.0643 0.25 B L1
ENSG00000146409 SLC18B1 685366 sc-eQTL 3.29e-01 0.0861 0.088 0.25 B L1
ENSG00000028839 TBPL1 -453465 sc-eQTL 4.38e-01 0.0535 0.0688 0.25 CD4T L1
ENSG00000079950 STX7 985507 sc-eQTL 2.57e-02 0.159 0.0708 0.25 CD4T L1
ENSG00000112303 VNN2 735246 sc-eQTL 8.21e-01 -0.0141 0.0621 0.25 CD4T L1
ENSG00000112306 RPS12 684136 sc-eQTL 7.30e-01 -0.0146 0.0422 0.25 CD4T L1
ENSG00000118515 SGK1 -819407 sc-eQTL 7.34e-01 -0.0193 0.0567 0.25 CD4T L1
ENSG00000146409 SLC18B1 685366 sc-eQTL 2.56e-02 0.19 0.0844 0.25 CD4T L1
ENSG00000028839 TBPL1 -453465 sc-eQTL 5.53e-01 0.0404 0.0679 0.25 CD8T L1
ENSG00000079950 STX7 985507 sc-eQTL 9.08e-01 0.00826 0.071 0.25 CD8T L1
ENSG00000112303 VNN2 735246 sc-eQTL 5.00e-01 -0.0559 0.0828 0.25 CD8T L1
ENSG00000112306 RPS12 684136 sc-eQTL 2.43e-01 -0.0331 0.0282 0.25 CD8T L1
ENSG00000118515 SGK1 -819407 sc-eQTL 2.51e-01 -0.05 0.0435 0.25 CD8T L1
ENSG00000146409 SLC18B1 685366 sc-eQTL 3.59e-01 0.0786 0.0855 0.25 CD8T L1
ENSG00000028839 TBPL1 -453465 sc-eQTL 9.81e-01 -0.00259 0.106 0.259 DC L1
ENSG00000079950 STX7 985507 sc-eQTL 6.85e-01 -0.0268 0.066 0.259 DC L1
ENSG00000093134 VNN3 763940 sc-eQTL 5.60e-01 -0.0478 0.0818 0.259 DC L1
ENSG00000112299 VNN1 784650 sc-eQTL 1.27e-01 0.135 0.0879 0.259 DC L1
ENSG00000112303 VNN2 735246 sc-eQTL 8.19e-01 -0.0217 0.0946 0.259 DC L1
ENSG00000112306 RPS12 684136 sc-eQTL 3.24e-01 -0.0523 0.0529 0.259 DC L1
ENSG00000118515 SGK1 -819407 sc-eQTL 3.85e-01 0.0535 0.0614 0.259 DC L1
ENSG00000146409 SLC18B1 685366 sc-eQTL 6.22e-01 0.0414 0.0839 0.259 DC L1
ENSG00000286438 AL591115.1 395577 sc-eQTL 1.10e-01 0.122 0.0759 0.259 DC L1
ENSG00000286887 AL355881.1 -797596 sc-eQTL 2.40e-01 0.112 0.0949 0.259 DC L1
ENSG00000028839 TBPL1 -453465 sc-eQTL 2.23e-01 0.0896 0.0733 0.25 Mono L1
ENSG00000079950 STX7 985507 sc-eQTL 5.19e-01 0.0317 0.0492 0.25 Mono L1
ENSG00000093134 VNN3 763940 sc-eQTL 6.80e-01 0.0349 0.0844 0.25 Mono L1
ENSG00000112299 VNN1 784650 sc-eQTL 3.30e-01 0.0885 0.0907 0.25 Mono L1
ENSG00000112303 VNN2 735246 sc-eQTL 1.92e-01 -0.0837 0.0639 0.25 Mono L1
ENSG00000112306 RPS12 684136 sc-eQTL 8.15e-01 0.00901 0.0384 0.25 Mono L1
ENSG00000118515 SGK1 -819407 sc-eQTL 9.43e-01 -0.00388 0.0543 0.25 Mono L1
ENSG00000146409 SLC18B1 685366 sc-eQTL 5.44e-01 -0.0461 0.076 0.25 Mono L1
ENSG00000286887 AL355881.1 -797596 sc-eQTL 3.61e-01 0.0683 0.0746 0.25 Mono L1
ENSG00000028839 TBPL1 -453465 sc-eQTL 4.25e-01 0.0637 0.0797 0.251 NK L1
ENSG00000079950 STX7 985507 sc-eQTL 7.61e-01 0.0225 0.0738 0.251 NK L1
ENSG00000112303 VNN2 735246 sc-eQTL 3.93e-01 -0.0785 0.0917 0.251 NK L1
ENSG00000112306 RPS12 684136 sc-eQTL 5.27e-01 -0.0241 0.038 0.251 NK L1
ENSG00000118515 SGK1 -819407 sc-eQTL 3.13e-01 -0.0709 0.0702 0.251 NK L1
ENSG00000028839 TBPL1 -453465 sc-eQTL 3.93e-01 -0.0785 0.0917 0.25 Other_T L1
ENSG00000079950 STX7 985507 sc-eQTL 1.71e-01 0.0988 0.072 0.25 Other_T L1
ENSG00000112303 VNN2 735246 sc-eQTL 2.48e-01 -0.101 0.0872 0.25 Other_T L1
ENSG00000112306 RPS12 684136 sc-eQTL 9.70e-02 -0.0574 0.0344 0.25 Other_T L1
ENSG00000118515 SGK1 -819407 sc-eQTL 6.33e-01 0.0305 0.0638 0.25 Other_T L1
ENSG00000146409 SLC18B1 685366 sc-eQTL 6.31e-01 0.0456 0.0949 0.25 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000028839 TBPL1 -453465 sc-eQTL 6.31e-01 -0.0525 0.109 0.245 B_Activated L2
ENSG00000079950 STX7 985507 sc-eQTL 8.12e-01 -0.0222 0.0934 0.245 B_Activated L2
ENSG00000112303 VNN2 735246 sc-eQTL 6.50e-01 0.0451 0.0994 0.245 B_Activated L2
ENSG00000112306 RPS12 684136 sc-eQTL 8.42e-01 0.0107 0.0533 0.245 B_Activated L2
ENSG00000118515 SGK1 -819407 sc-eQTL 3.62e-01 0.0866 0.0948 0.245 B_Activated L2
ENSG00000146409 SLC18B1 685366 sc-eQTL 2.65e-01 -0.104 0.093 0.245 B_Activated L2
ENSG00000028839 TBPL1 -453465 sc-eQTL 1.59e-01 0.146 0.103 0.249 B_Intermediate L2
ENSG00000079950 STX7 985507 sc-eQTL 2.39e-02 0.134 0.0587 0.249 B_Intermediate L2
ENSG00000112303 VNN2 735246 sc-eQTL 8.47e-01 -0.0172 0.0895 0.249 B_Intermediate L2
ENSG00000112306 RPS12 684136 sc-eQTL 8.51e-01 -0.0103 0.0548 0.249 B_Intermediate L2
ENSG00000118515 SGK1 -819407 sc-eQTL 6.76e-01 0.0396 0.0947 0.249 B_Intermediate L2
ENSG00000146409 SLC18B1 685366 sc-eQTL 9.86e-01 0.00174 0.0987 0.249 B_Intermediate L2
ENSG00000028839 TBPL1 -453465 sc-eQTL 7.12e-01 -0.0363 0.0983 0.25 B_Memory L2
ENSG00000079950 STX7 985507 sc-eQTL 1.89e-02 0.166 0.0702 0.25 B_Memory L2
ENSG00000112303 VNN2 735246 sc-eQTL 1.16e-01 0.146 0.0925 0.25 B_Memory L2
ENSG00000112306 RPS12 684136 sc-eQTL 6.48e-01 0.0205 0.0448 0.25 B_Memory L2
ENSG00000118515 SGK1 -819407 sc-eQTL 6.65e-04 0.276 0.08 0.25 B_Memory L2
ENSG00000146409 SLC18B1 685366 sc-eQTL 7.58e-01 0.0289 0.0935 0.25 B_Memory L2
ENSG00000028839 TBPL1 -453465 sc-eQTL 4.07e-01 0.0776 0.0934 0.25 B_Naive1 L2
ENSG00000079950 STX7 985507 sc-eQTL 2.89e-01 0.0476 0.0449 0.25 B_Naive1 L2
ENSG00000112303 VNN2 735246 sc-eQTL 1.69e-01 -0.12 0.0869 0.25 B_Naive1 L2
ENSG00000112306 RPS12 684136 sc-eQTL 6.42e-01 0.0231 0.0497 0.25 B_Naive1 L2
ENSG00000118515 SGK1 -819407 sc-eQTL 1.29e-01 0.118 0.0774 0.25 B_Naive1 L2
ENSG00000146409 SLC18B1 685366 sc-eQTL 8.64e-01 0.0165 0.096 0.25 B_Naive1 L2
ENSG00000028839 TBPL1 -453465 sc-eQTL 2.44e-01 0.116 0.0993 0.249 B_Naive2 L2
ENSG00000079950 STX7 985507 sc-eQTL 8.07e-01 0.0129 0.0529 0.249 B_Naive2 L2
ENSG00000112303 VNN2 735246 sc-eQTL 7.60e-01 0.0297 0.0971 0.249 B_Naive2 L2
ENSG00000112306 RPS12 684136 sc-eQTL 5.43e-01 0.0313 0.0514 0.249 B_Naive2 L2
ENSG00000118515 SGK1 -819407 sc-eQTL 8.85e-01 0.0131 0.0909 0.249 B_Naive2 L2
ENSG00000146409 SLC18B1 685366 sc-eQTL 1.56e-01 0.139 0.0976 0.249 B_Naive2 L2
ENSG00000028839 TBPL1 -453465 sc-eQTL 2.58e-01 0.113 0.0993 0.252 CD4_CTL L2
ENSG00000079950 STX7 985507 sc-eQTL 1.88e-01 0.13 0.0985 0.252 CD4_CTL L2
ENSG00000112303 VNN2 735246 sc-eQTL 5.63e-01 -0.0578 0.0997 0.252 CD4_CTL L2
ENSG00000112306 RPS12 684136 sc-eQTL 5.08e-01 -0.0306 0.0461 0.252 CD4_CTL L2
ENSG00000118515 SGK1 -819407 sc-eQTL 2.16e-01 0.0989 0.0797 0.252 CD4_CTL L2
ENSG00000146409 SLC18B1 685366 sc-eQTL 6.55e-01 0.0416 0.0929 0.252 CD4_CTL L2
ENSG00000028839 TBPL1 -453465 sc-eQTL 8.71e-01 -0.013 0.0794 0.25 CD4_Naive L2
ENSG00000079950 STX7 985507 sc-eQTL 1.12e-01 0.124 0.0774 0.25 CD4_Naive L2
ENSG00000112303 VNN2 735246 sc-eQTL 6.98e-01 0.0281 0.0721 0.25 CD4_Naive L2
ENSG00000112306 RPS12 684136 sc-eQTL 8.80e-01 -0.00707 0.0468 0.25 CD4_Naive L2
ENSG00000118515 SGK1 -819407 sc-eQTL 5.61e-01 0.0333 0.0573 0.25 CD4_Naive L2
ENSG00000146409 SLC18B1 685366 sc-eQTL 1.21e-02 0.225 0.0888 0.25 CD4_Naive L2
ENSG00000028839 TBPL1 -453465 sc-eQTL 4.28e-01 -0.0682 0.0859 0.25 CD4_TCM L2
ENSG00000079950 STX7 985507 sc-eQTL 2.35e-01 0.103 0.0863 0.25 CD4_TCM L2
ENSG00000112303 VNN2 735246 sc-eQTL 2.29e-01 -0.103 0.0851 0.25 CD4_TCM L2
ENSG00000112306 RPS12 684136 sc-eQTL 8.35e-02 -0.0764 0.0439 0.25 CD4_TCM L2
ENSG00000118515 SGK1 -819407 sc-eQTL 7.50e-01 -0.0198 0.0619 0.25 CD4_TCM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 685366 sc-eQTL 3.61e-01 0.0937 0.102 0.25 CD4_TCM L2
ENSG00000028839 TBPL1 -453465 sc-eQTL 1.11e-01 0.158 0.0984 0.25 CD4_TEM L2
ENSG00000079950 STX7 985507 sc-eQTL 1.42e-01 0.145 0.0986 0.25 CD4_TEM L2
ENSG00000112303 VNN2 735246 sc-eQTL 2.93e-01 0.0999 0.0949 0.25 CD4_TEM L2
ENSG00000112306 RPS12 684136 sc-eQTL 1.94e-01 -0.0507 0.0389 0.25 CD4_TEM L2
ENSG00000118515 SGK1 -819407 sc-eQTL 7.26e-01 0.0235 0.067 0.25 CD4_TEM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 685366 sc-eQTL 5.56e-01 0.0572 0.0969 0.25 CD4_TEM L2
ENSG00000028839 TBPL1 -453465 sc-eQTL 2.70e-01 0.0967 0.0875 0.25 CD8_CTL L2
ENSG00000079950 STX7 985507 sc-eQTL 7.81e-01 -0.0228 0.082 0.25 CD8_CTL L2
ENSG00000112303 VNN2 735246 sc-eQTL 8.30e-01 -0.02 0.0932 0.25 CD8_CTL L2
ENSG00000112306 RPS12 684136 sc-eQTL 1.73e-01 -0.0679 0.0497 0.25 CD8_CTL L2
ENSG00000118515 SGK1 -819407 sc-eQTL 7.07e-01 0.0317 0.0842 0.25 CD8_CTL L2
ENSG00000146409 SLC18B1 685366 sc-eQTL 8.05e-01 0.0239 0.0966 0.25 CD8_CTL L2
ENSG00000028839 TBPL1 -453465 sc-eQTL 4.54e-01 0.0699 0.0931 0.25 CD8_Naive L2
ENSG00000079950 STX7 985507 sc-eQTL 6.53e-01 0.0446 0.0993 0.25 CD8_Naive L2
ENSG00000112303 VNN2 735246 sc-eQTL 2.66e-01 -0.0954 0.0855 0.25 CD8_Naive L2
ENSG00000112306 RPS12 684136 sc-eQTL 5.45e-01 -0.0298 0.049 0.25 CD8_Naive L2
ENSG00000118515 SGK1 -819407 sc-eQTL 1.28e-01 -0.0937 0.0613 0.25 CD8_Naive L2
ENSG00000146409 SLC18B1 685366 sc-eQTL 8.68e-01 0.0164 0.0985 0.25 CD8_Naive L2
ENSG00000028839 TBPL1 -453465 sc-eQTL 7.32e-01 -0.0357 0.104 0.255 CD8_TCM L2
ENSG00000079950 STX7 985507 sc-eQTL 3.14e-01 0.0974 0.0964 0.255 CD8_TCM L2
ENSG00000112303 VNN2 735246 sc-eQTL 6.06e-01 0.0496 0.0959 0.255 CD8_TCM L2
ENSG00000112306 RPS12 684136 sc-eQTL 2.40e-01 -0.0549 0.0466 0.255 CD8_TCM L2
ENSG00000118515 SGK1 -819407 sc-eQTL 6.05e-02 0.145 0.0767 0.255 CD8_TCM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 685366 sc-eQTL 2.35e-01 0.122 0.102 0.255 CD8_TCM L2
ENSG00000028839 TBPL1 -453465 sc-eQTL 1.77e-01 -0.131 0.0966 0.251 CD8_TEM L2
ENSG00000079950 STX7 985507 sc-eQTL 1.97e-01 -0.136 0.105 0.251 CD8_TEM L2
ENSG00000112303 VNN2 735246 sc-eQTL 2.09e-01 0.132 0.105 0.251 CD8_TEM L2
ENSG00000112306 RPS12 684136 sc-eQTL 8.06e-01 0.0139 0.0566 0.251 CD8_TEM L2
ENSG00000118515 SGK1 -819407 sc-eQTL 8.74e-01 -0.0148 0.0928 0.251 CD8_TEM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 685366 sc-eQTL 5.17e-01 0.0695 0.107 0.251 CD8_TEM L2
ENSG00000028839 TBPL1 -453465 sc-eQTL 4.00e-01 -0.0832 0.0987 0.253 MAIT L2
ENSG00000079950 STX7 985507 sc-eQTL 6.08e-02 0.176 0.0932 0.253 MAIT L2
ENSG00000112303 VNN2 735246 sc-eQTL 7.31e-01 0.0329 0.0955 0.253 MAIT L2
ENSG00000112306 RPS12 684136 sc-eQTL 8.37e-03 -0.123 0.0462 0.253 MAIT L2
ENSG00000118515 SGK1 -819407 sc-eQTL 7.19e-01 -0.0239 0.0661 0.253 MAIT L2
ENSG00000146409 SLC18B1 685366 sc-eQTL 4.40e-01 0.0761 0.0984 0.253 MAIT L2
ENSG00000028839 TBPL1 -453465 sc-eQTL 9.96e-01 0.000571 0.109 0.247 NK_CD56bright L2
ENSG00000079950 STX7 985507 sc-eQTL 8.15e-01 0.0236 0.101 0.247 NK_CD56bright L2
ENSG00000112303 VNN2 735246 sc-eQTL 8.91e-01 -0.014 0.102 0.247 NK_CD56bright L2
ENSG00000112306 RPS12 684136 sc-eQTL 1.01e-01 -0.0934 0.0566 0.247 NK_CD56bright L2
ENSG00000118515 SGK1 -819407 sc-eQTL 8.71e-01 0.0139 0.0852 0.247 NK_CD56bright L2
ENSG00000028839 TBPL1 -453465 sc-eQTL 5.06e-01 0.0569 0.0855 0.252 NK_CD56dim L2
ENSG00000079950 STX7 985507 sc-eQTL 8.82e-01 -0.0117 0.0783 0.252 NK_CD56dim L2
ENSG00000112303 VNN2 735246 sc-eQTL 3.53e-02 -0.205 0.0969 0.252 NK_CD56dim L2
ENSG00000112306 RPS12 684136 sc-eQTL 3.56e-01 -0.0359 0.0388 0.252 NK_CD56dim L2
ENSG00000118515 SGK1 -819407 sc-eQTL 6.66e-01 0.0372 0.0861 0.252 NK_CD56dim L2
ENSG00000028839 TBPL1 -453465 sc-eQTL 7.49e-01 0.0351 0.109 0.249 NK_HLA L2
ENSG00000079950 STX7 985507 sc-eQTL 9.11e-01 0.0111 0.0996 0.249 NK_HLA L2
ENSG00000112303 VNN2 735246 sc-eQTL 2.40e-01 -0.118 0.1 0.249 NK_HLA L2
ENSG00000112306 RPS12 684136 sc-eQTL 6.62e-01 0.0205 0.0469 0.249 NK_HLA L2
ENSG00000118515 SGK1 -819407 sc-eQTL 6.10e-01 -0.0474 0.0928 0.249 NK_HLA L2
ENSG00000028839 TBPL1 -453465 sc-eQTL 5.93e-01 0.0477 0.0891 0.252 NK_cytokine L2
ENSG00000079950 STX7 985507 sc-eQTL 2.20e-01 0.106 0.086 0.252 NK_cytokine L2
ENSG00000112303 VNN2 735246 sc-eQTL 2.59e-01 0.11 0.0968 0.252 NK_cytokine L2
ENSG00000112306 RPS12 684136 sc-eQTL 8.93e-01 -0.0071 0.0527 0.252 NK_cytokine L2
ENSG00000118515 SGK1 -819407 sc-eQTL 6.72e-02 -0.16 0.087 0.252 NK_cytokine L2
ENSG00000028839 TBPL1 -453465 sc-eQTL 6.50e-01 0.0541 0.119 0.248 PB L2
ENSG00000079950 STX7 985507 sc-eQTL 6.05e-01 -0.0439 0.0846 0.248 PB L2
ENSG00000112303 VNN2 735246 sc-eQTL 7.44e-01 -0.0338 0.103 0.248 PB L2
ENSG00000112306 RPS12 684136 sc-eQTL 1.51e-01 -0.0841 0.0582 0.248 PB L2
ENSG00000118515 SGK1 -819407 sc-eQTL 3.76e-01 0.0841 0.0945 0.248 PB L2
ENSG00000146409 SLC18B1 685366 sc-eQTL 3.69e-01 0.099 0.11 0.248 PB L2
ENSG00000028839 TBPL1 -453465 sc-eQTL 4.49e-01 -0.0762 0.101 0.248 Pro_T L2
ENSG00000079950 STX7 985507 sc-eQTL 9.85e-02 0.148 0.0893 0.248 Pro_T L2
ENSG00000112303 VNN2 735246 sc-eQTL 4.91e-01 -0.0664 0.0963 0.248 Pro_T L2
ENSG00000112306 RPS12 684136 sc-eQTL 2.50e-01 -0.0419 0.0364 0.248 Pro_T L2
ENSG00000118515 SGK1 -819407 sc-eQTL 4.89e-01 0.0506 0.073 0.248 Pro_T L2
ENSG00000146409 SLC18B1 685366 sc-eQTL 8.54e-01 0.0174 0.0944 0.248 Pro_T L2
ENSG00000028839 TBPL1 -453465 sc-eQTL 6.43e-01 0.0474 0.102 0.25 Treg L2
ENSG00000079950 STX7 985507 sc-eQTL 4.90e-02 0.189 0.0954 0.25 Treg L2
ENSG00000112303 VNN2 735246 sc-eQTL 8.37e-01 0.0167 0.081 0.25 Treg L2
ENSG00000112306 RPS12 684136 sc-eQTL 9.31e-01 -0.00312 0.0358 0.25 Treg L2
ENSG00000118515 SGK1 -819407 sc-eQTL 2.98e-01 -0.0785 0.0753 0.25 Treg L2
ENSG00000146409 SLC18B1 685366 sc-eQTL 9.79e-01 0.00269 0.101 0.25 Treg L2
ENSG00000028839 TBPL1 -453465 sc-eQTL 8.41e-01 0.021 0.104 0.271 cDC L2
ENSG00000079950 STX7 985507 sc-eQTL 9.95e-01 0.000555 0.0818 0.271 cDC L2
ENSG00000093134 VNN3 763940 sc-eQTL 7.52e-01 -0.0257 0.0812 0.271 cDC L2
ENSG00000112299 VNN1 784650 sc-eQTL 2.47e-01 0.111 0.0952 0.271 cDC L2
ENSG00000112303 VNN2 735246 sc-eQTL 5.76e-01 -0.0521 0.093 0.271 cDC L2
ENSG00000112306 RPS12 684136 sc-eQTL 4.22e-01 -0.037 0.0459 0.271 cDC L2
ENSG00000118515 SGK1 -819407 sc-eQTL 1.31e-01 0.117 0.0769 0.271 cDC L2
ENSG00000146409 SLC18B1 685366 sc-eQTL 2.25e-01 0.11 0.0906 0.271 cDC L2
ENSG00000286438 AL591115.1 395577 sc-eQTL 5.11e-01 0.0479 0.0727 0.271 cDC L2
ENSG00000286887 AL355881.1 -797596 sc-eQTL 3.57e-02 0.187 0.0884 0.271 cDC L2
ENSG00000028839 TBPL1 -453465 sc-eQTL 4.72e-01 0.0598 0.0831 0.25 cMono_IL1B L2
ENSG00000079950 STX7 985507 sc-eQTL 5.45e-01 -0.0383 0.0631 0.25 cMono_IL1B L2
ENSG00000093134 VNN3 763940 sc-eQTL 3.48e-01 0.0838 0.089 0.25 cMono_IL1B L2
ENSG00000112299 VNN1 784650 sc-eQTL 2.23e-01 0.11 0.0897 0.25 cMono_IL1B L2
ENSG00000112303 VNN2 735246 sc-eQTL 1.93e-01 -0.0937 0.0717 0.25 cMono_IL1B L2
ENSG00000112306 RPS12 684136 sc-eQTL 6.38e-01 0.0188 0.0399 0.25 cMono_IL1B L2
ENSG00000118515 SGK1 -819407 sc-eQTL 8.80e-01 0.00903 0.0596 0.25 cMono_IL1B L2
ENSG00000146409 SLC18B1 685366 sc-eQTL 7.26e-01 0.027 0.0771 0.25 cMono_IL1B L2
ENSG00000286887 AL355881.1 -797596 sc-eQTL 8.13e-02 0.14 0.0797 0.25 cMono_IL1B L2
ENSG00000028839 TBPL1 -453465 sc-eQTL 5.07e-01 0.0623 0.0937 0.25 cMono_S100A L2
ENSG00000079950 STX7 985507 sc-eQTL 1.61e-01 0.0948 0.0674 0.25 cMono_S100A L2
ENSG00000093134 VNN3 763940 sc-eQTL 7.47e-01 0.0273 0.0846 0.25 cMono_S100A L2
ENSG00000112299 VNN1 784650 sc-eQTL 2.51e-01 0.105 0.0916 0.25 cMono_S100A L2
ENSG00000112303 VNN2 735246 sc-eQTL 3.71e-01 -0.0539 0.0601 0.25 cMono_S100A L2
ENSG00000112306 RPS12 684136 sc-eQTL 5.39e-01 0.0266 0.0433 0.25 cMono_S100A L2
ENSG00000118515 SGK1 -819407 sc-eQTL 6.41e-01 0.0231 0.0495 0.25 cMono_S100A L2
ENSG00000146409 SLC18B1 685366 sc-eQTL 8.66e-02 -0.137 0.0796 0.25 cMono_S100A L2
ENSG00000286887 AL355881.1 -797596 sc-eQTL 9.76e-01 -0.00238 0.0784 0.25 cMono_S100A L2
ENSG00000028839 TBPL1 -453465 sc-eQTL 3.14e-01 0.126 0.125 0.258 gdT L2
ENSG00000079950 STX7 985507 sc-eQTL 4.04e-01 -0.0902 0.108 0.258 gdT L2
ENSG00000112303 VNN2 735246 sc-eQTL 2.72e-02 -0.262 0.118 0.258 gdT L2
ENSG00000112306 RPS12 684136 sc-eQTL 3.17e-01 -0.0456 0.0454 0.258 gdT L2
ENSG00000118515 SGK1 -819407 sc-eQTL 5.33e-01 0.0537 0.0858 0.258 gdT L2
ENSG00000146409 SLC18B1 685366 sc-eQTL 2.61e-01 -0.132 0.117 0.258 gdT L2
ENSG00000028839 TBPL1 -453465 sc-eQTL 3.44e-02 0.202 0.0949 0.256 intMono L2
ENSG00000079950 STX7 985507 sc-eQTL 8.95e-01 0.0121 0.0916 0.256 intMono L2
ENSG00000093134 VNN3 763940 sc-eQTL 9.54e-01 0.00529 0.0925 0.256 intMono L2
ENSG00000112299 VNN1 784650 sc-eQTL 5.77e-01 0.0511 0.0914 0.256 intMono L2
ENSG00000112303 VNN2 735246 sc-eQTL 3.03e-01 0.0957 0.0927 0.256 intMono L2
ENSG00000112306 RPS12 684136 sc-eQTL 3.54e-01 -0.0375 0.0404 0.256 intMono L2
ENSG00000118515 SGK1 -819407 sc-eQTL 8.14e-01 0.016 0.0679 0.256 intMono L2
ENSG00000146409 SLC18B1 685366 sc-eQTL 5.15e-01 0.0641 0.0984 0.256 intMono L2
ENSG00000286887 AL355881.1 -797596 sc-eQTL 2.09e-01 0.118 0.0938 0.256 intMono L2
ENSG00000028839 TBPL1 -453465 sc-eQTL 5.84e-01 0.0552 0.101 0.249 ncMono L2
ENSG00000079950 STX7 985507 sc-eQTL 9.39e-01 0.00521 0.0682 0.249 ncMono L2
ENSG00000093134 VNN3 763940 sc-eQTL 7.86e-01 0.0262 0.0962 0.249 ncMono L2
ENSG00000112299 VNN1 784650 sc-eQTL 7.61e-01 0.0291 0.0955 0.249 ncMono L2
ENSG00000112303 VNN2 735246 sc-eQTL 7.45e-01 0.0299 0.0918 0.249 ncMono L2
ENSG00000112306 RPS12 684136 sc-eQTL 8.86e-01 0.00661 0.0461 0.249 ncMono L2
ENSG00000118515 SGK1 -819407 sc-eQTL 7.74e-02 0.115 0.0647 0.249 ncMono L2
ENSG00000146409 SLC18B1 685366 sc-eQTL 2.64e-01 0.0909 0.0811 0.249 ncMono L2
ENSG00000286887 AL355881.1 -797596 sc-eQTL 4.05e-01 0.0717 0.0859 0.249 ncMono L2
ENSG00000028839 TBPL1 -453465 sc-eQTL 9.04e-01 0.0142 0.117 0.257 pDC L2
ENSG00000079950 STX7 985507 sc-eQTL 5.51e-01 -0.0466 0.078 0.257 pDC L2
ENSG00000093134 VNN3 763940 sc-eQTL 2.01e-01 -0.1 0.0782 0.257 pDC L2
ENSG00000112299 VNN1 784650 sc-eQTL 6.26e-01 0.039 0.0799 0.257 pDC L2
ENSG00000112303 VNN2 735246 sc-eQTL 5.29e-01 -0.06 0.0951 0.257 pDC L2
ENSG00000112306 RPS12 684136 sc-eQTL 5.99e-01 0.0345 0.0655 0.257 pDC L2
ENSG00000118515 SGK1 -819407 sc-eQTL 8.23e-01 0.0149 0.0666 0.257 pDC L2
ENSG00000146409 SLC18B1 685366 sc-eQTL 3.19e-01 -0.0968 0.0968 0.257 pDC L2
ENSG00000286438 AL591115.1 395577 sc-eQTL 1.12e-01 0.147 0.0921 0.257 pDC L2
ENSG00000286887 AL355881.1 -797596 sc-eQTL 8.81e-01 0.0123 0.0824 0.257 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000028839 TBPL1 -453465 sc-eQTL 1.24e-01 0.153 0.0991 0.25 B_Memory LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 985507 sc-eQTL 4.17e-02 0.111 0.0543 0.25 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 735246 sc-eQTL 1.85e-01 0.115 0.0864 0.25 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 684136 sc-eQTL 8.91e-01 0.0068 0.0494 0.25 B_Memory LOneK1K
ENSG00000118515 SGK1 -819407 sc-eQTL 1.51e-01 0.111 0.0769 0.25 B_Memory LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 685366 sc-eQTL 9.11e-01 -0.0101 0.0907 0.25 B_Memory LOneK1K
ENSG00000028839 TBPL1 -453465 sc-eQTL 9.41e-02 0.156 0.0927 0.25 B_Naive LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 985507 sc-eQTL 3.11e-01 0.0426 0.042 0.25 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 735246 sc-eQTL 3.82e-01 -0.0714 0.0815 0.25 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 684136 sc-eQTL 4.28e-01 0.0392 0.0493 0.25 B_Naive LOneK1K
ENSG00000118515 SGK1 -819407 sc-eQTL 1.97e-01 0.0986 0.0762 0.25 B_Naive LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 685366 sc-eQTL 4.65e-01 0.0682 0.0931 0.25 B_Naive LOneK1K
ENSG00000028839 TBPL1 -453465 sc-eQTL 4.21e-01 0.0612 0.0758 0.25 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 985507 sc-eQTL 7.61e-01 0.0161 0.0528 0.25 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000093134 VNN3 763940 sc-eQTL 5.01e-01 0.0579 0.086 0.25 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112299 VNN1 784650 sc-eQTL 1.50e-01 0.129 0.0893 0.25 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 735246 sc-eQTL 2.05e-01 -0.0753 0.0591 0.25 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 684136 sc-eQTL 5.77e-01 0.0227 0.0407 0.25 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000118515 SGK1 -819407 sc-eQTL 9.58e-01 0.00292 0.0555 0.25 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 685366 sc-eQTL 5.37e-01 -0.0448 0.0724 0.25 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000286887 AL355881.1 -797596 sc-eQTL 2.50e-01 0.0873 0.0757 0.25 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000028839 TBPL1 -453465 sc-eQTL 1.37e-01 0.146 0.0978 0.252 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 985507 sc-eQTL 8.51e-01 0.0122 0.0649 0.252 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000093134 VNN3 763940 sc-eQTL 8.89e-01 0.0133 0.0954 0.252 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112299 VNN1 784650 sc-eQTL 3.15e-01 0.0951 0.0943 0.252 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 735246 sc-eQTL 5.02e-01 0.0599 0.0891 0.252 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 684136 sc-eQTL 8.81e-01 -0.00569 0.0378 0.252 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000118515 SGK1 -819407 sc-eQTL 3.30e-01 0.0558 0.0571 0.252 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 685366 sc-eQTL 6.36e-01 0.0435 0.0918 0.252 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000286887 AL355881.1 -797596 sc-eQTL 3.02e-01 0.0857 0.0828 0.252 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000028839 TBPL1 -453465 sc-eQTL 4.00e-01 0.0662 0.0785 0.252 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 985507 sc-eQTL 6.61e-01 0.0324 0.0739 0.252 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 735246 sc-eQTL 3.26e-01 -0.092 0.0933 0.252 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 684136 sc-eQTL 4.95e-01 -0.0261 0.0381 0.252 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000118515 SGK1 -819407 sc-eQTL 5.57e-01 -0.0463 0.0788 0.252 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000079950 STX7 985507 pQTL 0.0831 -0.045 0.026 0.00162 0.0 0.247
ENSG00000079950 STX7 985507 eQTL 0.00534 0.052 0.0186 0.0 0.0 0.236
ENSG00000112299 VNN1 784650 pQTL 0.00603 0.11 0.0401 0.0 0.0 0.247

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina