logo

Genes within 1Mb (chr6:133496803:T:C):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000028839 TBPL1 -455367 sc-eQTL 2.11e-01 0.115 0.0912 0.252 B L1
ENSG00000079950 STX7 983605 sc-eQTL 2.15e-01 0.0453 0.0363 0.252 B L1
ENSG00000112303 VNN2 733344 sc-eQTL 7.78e-01 -0.0194 0.0686 0.252 B L1
ENSG00000112306 RPS12 682234 sc-eQTL 5.31e-01 0.026 0.0414 0.252 B L1
ENSG00000118515 SGK1 -821309 sc-eQTL 1.89e-01 0.0839 0.0637 0.252 B L1
ENSG00000146409 SLC18B1 683464 sc-eQTL 3.37e-01 0.0837 0.0871 0.252 B L1
ENSG00000028839 TBPL1 -455367 sc-eQTL 4.44e-01 0.0524 0.0682 0.252 CD4T L1
ENSG00000079950 STX7 983605 sc-eQTL 2.84e-02 0.155 0.0702 0.252 CD4T L1
ENSG00000112303 VNN2 733344 sc-eQTL 7.51e-01 -0.0195 0.0615 0.252 CD4T L1
ENSG00000112306 RPS12 682234 sc-eQTL 6.54e-01 -0.0188 0.0418 0.252 CD4T L1
ENSG00000118515 SGK1 -821309 sc-eQTL 8.40e-01 -0.0114 0.0562 0.252 CD4T L1
ENSG00000146409 SLC18B1 683464 sc-eQTL 2.45e-02 0.189 0.0836 0.252 CD4T L1
ENSG00000028839 TBPL1 -455367 sc-eQTL 5.77e-01 0.0376 0.0673 0.252 CD8T L1
ENSG00000079950 STX7 983605 sc-eQTL 8.43e-01 0.014 0.0703 0.252 CD8T L1
ENSG00000112303 VNN2 733344 sc-eQTL 4.95e-01 -0.0561 0.082 0.252 CD8T L1
ENSG00000112306 RPS12 682234 sc-eQTL 2.32e-01 -0.0335 0.028 0.252 CD8T L1
ENSG00000118515 SGK1 -821309 sc-eQTL 3.14e-01 -0.0435 0.0431 0.252 CD8T L1
ENSG00000146409 SLC18B1 683464 sc-eQTL 3.40e-01 0.081 0.0846 0.252 CD8T L1
ENSG00000028839 TBPL1 -455367 sc-eQTL 9.26e-01 0.00974 0.105 0.261 DC L1
ENSG00000079950 STX7 983605 sc-eQTL 7.03e-01 -0.025 0.0655 0.261 DC L1
ENSG00000093134 VNN3 762038 sc-eQTL 6.83e-01 -0.0332 0.0812 0.261 DC L1
ENSG00000112299 VNN1 782748 sc-eQTL 9.75e-02 0.145 0.0871 0.261 DC L1
ENSG00000112303 VNN2 733344 sc-eQTL 8.51e-01 -0.0176 0.0938 0.261 DC L1
ENSG00000112306 RPS12 682234 sc-eQTL 3.16e-01 -0.0528 0.0525 0.261 DC L1
ENSG00000118515 SGK1 -821309 sc-eQTL 4.07e-01 0.0506 0.0609 0.261 DC L1
ENSG00000146409 SLC18B1 683464 sc-eQTL 6.32e-01 0.0399 0.0832 0.261 DC L1
ENSG00000286438 AL591115.1 393675 sc-eQTL 1.02e-01 0.124 0.0752 0.261 DC L1
ENSG00000286887 AL355881.1 -799498 sc-eQTL 2.51e-01 0.108 0.0941 0.261 DC L1
ENSG00000028839 TBPL1 -455367 sc-eQTL 1.27e-01 0.111 0.0724 0.252 Mono L1
ENSG00000079950 STX7 983605 sc-eQTL 5.01e-01 0.0328 0.0487 0.252 Mono L1
ENSG00000093134 VNN3 762038 sc-eQTL 6.06e-01 0.0432 0.0836 0.252 Mono L1
ENSG00000112299 VNN1 782748 sc-eQTL 3.85e-01 0.0782 0.0898 0.252 Mono L1
ENSG00000112303 VNN2 733344 sc-eQTL 1.90e-01 -0.0832 0.0632 0.252 Mono L1
ENSG00000112306 RPS12 682234 sc-eQTL 8.20e-01 0.00869 0.038 0.252 Mono L1
ENSG00000118515 SGK1 -821309 sc-eQTL 8.42e-01 -0.0107 0.0537 0.252 Mono L1
ENSG00000146409 SLC18B1 683464 sc-eQTL 5.87e-01 -0.0409 0.0752 0.252 Mono L1
ENSG00000286887 AL355881.1 -799498 sc-eQTL 4.31e-01 0.0582 0.0739 0.252 Mono L1
ENSG00000028839 TBPL1 -455367 sc-eQTL 3.56e-01 0.0731 0.079 0.253 NK L1
ENSG00000079950 STX7 983605 sc-eQTL 7.33e-01 0.025 0.0732 0.253 NK L1
ENSG00000112303 VNN2 733344 sc-eQTL 3.28e-01 -0.089 0.0909 0.253 NK L1
ENSG00000112306 RPS12 682234 sc-eQTL 5.47e-01 -0.0227 0.0377 0.253 NK L1
ENSG00000118515 SGK1 -821309 sc-eQTL 3.06e-01 -0.0713 0.0695 0.253 NK L1
ENSG00000028839 TBPL1 -455367 sc-eQTL 4.12e-01 -0.0747 0.0909 0.252 Other_T L1
ENSG00000079950 STX7 983605 sc-eQTL 2.06e-01 0.0905 0.0714 0.252 Other_T L1
ENSG00000112303 VNN2 733344 sc-eQTL 1.89e-01 -0.114 0.0863 0.252 Other_T L1
ENSG00000112306 RPS12 682234 sc-eQTL 9.86e-02 -0.0566 0.0341 0.252 Other_T L1
ENSG00000118515 SGK1 -821309 sc-eQTL 6.10e-01 0.0323 0.0632 0.252 Other_T L1
ENSG00000146409 SLC18B1 683464 sc-eQTL 6.29e-01 0.0455 0.094 0.252 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000028839 TBPL1 -455367 sc-eQTL 7.58e-01 -0.0332 0.108 0.247 B_Activated L2
ENSG00000079950 STX7 983605 sc-eQTL 7.55e-01 -0.0288 0.0921 0.247 B_Activated L2
ENSG00000112303 VNN2 733344 sc-eQTL 6.25e-01 0.048 0.098 0.247 B_Activated L2
ENSG00000112306 RPS12 682234 sc-eQTL 8.70e-01 0.00859 0.0526 0.247 B_Activated L2
ENSG00000118515 SGK1 -821309 sc-eQTL 5.40e-01 0.0575 0.0936 0.247 B_Activated L2
ENSG00000146409 SLC18B1 683464 sc-eQTL 2.51e-01 -0.106 0.0917 0.247 B_Activated L2
ENSG00000028839 TBPL1 -455367 sc-eQTL 1.95e-01 0.133 0.102 0.251 B_Intermediate L2
ENSG00000079950 STX7 983605 sc-eQTL 1.97e-02 0.137 0.0581 0.251 B_Intermediate L2
ENSG00000112303 VNN2 733344 sc-eQTL 9.73e-01 -0.00304 0.0886 0.251 B_Intermediate L2
ENSG00000112306 RPS12 682234 sc-eQTL 8.85e-01 -0.00787 0.0543 0.251 B_Intermediate L2
ENSG00000118515 SGK1 -821309 sc-eQTL 7.47e-01 0.0303 0.0938 0.251 B_Intermediate L2
ENSG00000146409 SLC18B1 683464 sc-eQTL 8.83e-01 0.0144 0.0978 0.251 B_Intermediate L2
ENSG00000028839 TBPL1 -455367 sc-eQTL 6.43e-01 -0.0451 0.0972 0.252 B_Memory L2
ENSG00000079950 STX7 983605 sc-eQTL 1.67e-02 0.167 0.0694 0.252 B_Memory L2
ENSG00000112303 VNN2 733344 sc-eQTL 1.38e-01 0.136 0.0916 0.252 B_Memory L2
ENSG00000112306 RPS12 682234 sc-eQTL 6.04e-01 0.023 0.0443 0.252 B_Memory L2
ENSG00000118515 SGK1 -821309 sc-eQTL 8.32e-04 0.269 0.0792 0.252 B_Memory L2
ENSG00000146409 SLC18B1 683464 sc-eQTL 7.36e-01 0.0313 0.0926 0.252 B_Memory L2
ENSG00000028839 TBPL1 -455367 sc-eQTL 4.27e-01 0.0737 0.0926 0.252 B_Naive1 L2
ENSG00000079950 STX7 983605 sc-eQTL 3.07e-01 0.0455 0.0444 0.252 B_Naive1 L2
ENSG00000112303 VNN2 733344 sc-eQTL 1.96e-01 -0.112 0.0862 0.252 B_Naive1 L2
ENSG00000112306 RPS12 682234 sc-eQTL 7.01e-01 0.0189 0.0492 0.252 B_Naive1 L2
ENSG00000118515 SGK1 -821309 sc-eQTL 1.57e-01 0.109 0.0767 0.252 B_Naive1 L2
ENSG00000146409 SLC18B1 683464 sc-eQTL 9.42e-01 0.00695 0.0951 0.252 B_Naive1 L2
ENSG00000028839 TBPL1 -455367 sc-eQTL 2.59e-01 0.111 0.0984 0.251 B_Naive2 L2
ENSG00000079950 STX7 983605 sc-eQTL 7.14e-01 0.0193 0.0524 0.251 B_Naive2 L2
ENSG00000112303 VNN2 733344 sc-eQTL 8.21e-01 0.0218 0.0963 0.251 B_Naive2 L2
ENSG00000112306 RPS12 682234 sc-eQTL 5.09e-01 0.0337 0.0509 0.251 B_Naive2 L2
ENSG00000118515 SGK1 -821309 sc-eQTL 9.51e-01 -0.00557 0.0901 0.251 B_Naive2 L2
ENSG00000146409 SLC18B1 683464 sc-eQTL 1.71e-01 0.133 0.0968 0.251 B_Naive2 L2
ENSG00000028839 TBPL1 -455367 sc-eQTL 2.42e-01 0.115 0.0981 0.255 CD4_CTL L2
ENSG00000079950 STX7 983605 sc-eQTL 2.18e-01 0.12 0.0974 0.255 CD4_CTL L2
ENSG00000112303 VNN2 733344 sc-eQTL 5.24e-01 -0.0628 0.0985 0.255 CD4_CTL L2
ENSG00000112306 RPS12 682234 sc-eQTL 5.71e-01 -0.0258 0.0455 0.255 CD4_CTL L2
ENSG00000118515 SGK1 -821309 sc-eQTL 2.32e-01 0.0944 0.0787 0.255 CD4_CTL L2
ENSG00000146409 SLC18B1 683464 sc-eQTL 5.75e-01 0.0515 0.0918 0.255 CD4_CTL L2
ENSG00000028839 TBPL1 -455367 sc-eQTL 8.51e-01 -0.0148 0.0788 0.252 CD4_Naive L2
ENSG00000079950 STX7 983605 sc-eQTL 1.01e-01 0.126 0.0767 0.252 CD4_Naive L2
ENSG00000112303 VNN2 733344 sc-eQTL 7.48e-01 0.0231 0.0715 0.252 CD4_Naive L2
ENSG00000112306 RPS12 682234 sc-eQTL 8.44e-01 -0.00915 0.0464 0.252 CD4_Naive L2
ENSG00000118515 SGK1 -821309 sc-eQTL 4.71e-01 0.041 0.0568 0.252 CD4_Naive L2
ENSG00000146409 SLC18B1 683464 sc-eQTL 1.40e-02 0.218 0.0881 0.252 CD4_Naive L2
ENSG00000028839 TBPL1 -455367 sc-eQTL 5.15e-01 -0.0555 0.0851 0.252 CD4_TCM L2
ENSG00000079950 STX7 983605 sc-eQTL 1.99e-01 0.11 0.0854 0.252 CD4_TCM L2
ENSG00000112303 VNN2 733344 sc-eQTL 2.02e-01 -0.108 0.0842 0.252 CD4_TCM L2
ENSG00000112306 RPS12 682234 sc-eQTL 7.01e-02 -0.0792 0.0435 0.252 CD4_TCM L2
ENSG00000118515 SGK1 -821309 sc-eQTL 8.15e-01 -0.0143 0.0613 0.252 CD4_TCM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 683464 sc-eQTL 4.02e-01 0.0852 0.101 0.252 CD4_TCM L2
ENSG00000028839 TBPL1 -455367 sc-eQTL 1.19e-01 0.152 0.0975 0.252 CD4_TEM L2
ENSG00000079950 STX7 983605 sc-eQTL 1.83e-01 0.131 0.0977 0.252 CD4_TEM L2
ENSG00000112303 VNN2 733344 sc-eQTL 2.97e-01 0.0983 0.0939 0.252 CD4_TEM L2
ENSG00000112306 RPS12 682234 sc-eQTL 1.87e-01 -0.0509 0.0385 0.252 CD4_TEM L2
ENSG00000118515 SGK1 -821309 sc-eQTL 6.97e-01 0.0259 0.0663 0.252 CD4_TEM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 683464 sc-eQTL 5.00e-01 0.0648 0.0959 0.252 CD4_TEM L2
ENSG00000028839 TBPL1 -455367 sc-eQTL 2.90e-01 0.0919 0.0867 0.252 CD8_CTL L2
ENSG00000079950 STX7 983605 sc-eQTL 7.90e-01 -0.0216 0.0812 0.252 CD8_CTL L2
ENSG00000112303 VNN2 733344 sc-eQTL 8.17e-01 -0.0213 0.0923 0.252 CD8_CTL L2
ENSG00000112306 RPS12 682234 sc-eQTL 2.10e-01 -0.0619 0.0492 0.252 CD8_CTL L2
ENSG00000118515 SGK1 -821309 sc-eQTL 7.93e-01 0.0219 0.0834 0.252 CD8_CTL L2
ENSG00000146409 SLC18B1 683464 sc-eQTL 7.59e-01 0.0294 0.0957 0.252 CD8_CTL L2
ENSG00000028839 TBPL1 -455367 sc-eQTL 4.84e-01 0.0646 0.0921 0.252 CD8_Naive L2
ENSG00000079950 STX7 983605 sc-eQTL 5.59e-01 0.0575 0.0982 0.252 CD8_Naive L2
ENSG00000112303 VNN2 733344 sc-eQTL 2.75e-01 -0.0925 0.0846 0.252 CD8_Naive L2
ENSG00000112306 RPS12 682234 sc-eQTL 5.03e-01 -0.0326 0.0485 0.252 CD8_Naive L2
ENSG00000118515 SGK1 -821309 sc-eQTL 1.78e-01 -0.082 0.0607 0.252 CD8_Naive L2
ENSG00000146409 SLC18B1 683464 sc-eQTL 8.63e-01 0.0168 0.0974 0.252 CD8_Naive L2
ENSG00000028839 TBPL1 -455367 sc-eQTL 8.64e-01 -0.0177 0.103 0.257 CD8_TCM L2
ENSG00000079950 STX7 983605 sc-eQTL 2.92e-01 0.101 0.0953 0.257 CD8_TCM L2
ENSG00000112303 VNN2 733344 sc-eQTL 5.84e-01 0.0519 0.0948 0.257 CD8_TCM L2
ENSG00000112306 RPS12 682234 sc-eQTL 2.28e-01 -0.0557 0.0461 0.257 CD8_TCM L2
ENSG00000118515 SGK1 -821309 sc-eQTL 5.87e-02 0.144 0.0759 0.257 CD8_TCM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 683464 sc-eQTL 2.76e-01 0.11 0.101 0.257 CD8_TCM L2
ENSG00000028839 TBPL1 -455367 sc-eQTL 1.93e-01 -0.125 0.0956 0.253 CD8_TEM L2
ENSG00000079950 STX7 983605 sc-eQTL 1.71e-01 -0.143 0.104 0.253 CD8_TEM L2
ENSG00000112303 VNN2 733344 sc-eQTL 1.92e-01 0.136 0.104 0.253 CD8_TEM L2
ENSG00000112306 RPS12 682234 sc-eQTL 7.37e-01 0.0189 0.056 0.253 CD8_TEM L2
ENSG00000118515 SGK1 -821309 sc-eQTL 9.07e-01 -0.0108 0.0918 0.253 CD8_TEM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 683464 sc-eQTL 4.69e-01 0.0768 0.106 0.253 CD8_TEM L2
ENSG00000028839 TBPL1 -455367 sc-eQTL 3.50e-01 -0.0915 0.0977 0.255 MAIT L2
ENSG00000079950 STX7 983605 sc-eQTL 5.96e-02 0.175 0.0922 0.255 MAIT L2
ENSG00000112303 VNN2 733344 sc-eQTL 7.94e-01 0.0247 0.0946 0.255 MAIT L2
ENSG00000112306 RPS12 682234 sc-eQTL 7.65e-03 -0.123 0.0457 0.255 MAIT L2
ENSG00000118515 SGK1 -821309 sc-eQTL 6.53e-01 -0.0295 0.0654 0.255 MAIT L2
ENSG00000146409 SLC18B1 683464 sc-eQTL 3.86e-01 0.0845 0.0973 0.255 MAIT L2
ENSG00000028839 TBPL1 -455367 sc-eQTL 9.09e-01 0.0123 0.107 0.249 NK_CD56bright L2
ENSG00000079950 STX7 983605 sc-eQTL 7.47e-01 0.0322 0.0995 0.249 NK_CD56bright L2
ENSG00000112303 VNN2 733344 sc-eQTL 8.70e-01 -0.0166 0.101 0.249 NK_CD56bright L2
ENSG00000112306 RPS12 682234 sc-eQTL 8.93e-02 -0.0955 0.0559 0.249 NK_CD56bright L2
ENSG00000118515 SGK1 -821309 sc-eQTL 9.75e-01 0.00267 0.0842 0.249 NK_CD56bright L2
ENSG00000028839 TBPL1 -455367 sc-eQTL 4.75e-01 0.0606 0.0847 0.254 NK_CD56dim L2
ENSG00000079950 STX7 983605 sc-eQTL 8.80e-01 -0.0118 0.0777 0.254 NK_CD56dim L2
ENSG00000112303 VNN2 733344 sc-eQTL 2.97e-02 -0.21 0.096 0.254 NK_CD56dim L2
ENSG00000112306 RPS12 682234 sc-eQTL 3.81e-01 -0.0338 0.0385 0.254 NK_CD56dim L2
ENSG00000118515 SGK1 -821309 sc-eQTL 7.33e-01 0.0291 0.0854 0.254 NK_CD56dim L2
ENSG00000028839 TBPL1 -455367 sc-eQTL 7.18e-01 0.0391 0.108 0.251 NK_HLA L2
ENSG00000079950 STX7 983605 sc-eQTL 8.62e-01 0.0172 0.0985 0.251 NK_HLA L2
ENSG00000112303 VNN2 733344 sc-eQTL 2.13e-01 -0.124 0.0993 0.251 NK_HLA L2
ENSG00000112306 RPS12 682234 sc-eQTL 7.35e-01 0.0158 0.0464 0.251 NK_HLA L2
ENSG00000118515 SGK1 -821309 sc-eQTL 6.60e-01 -0.0405 0.0917 0.251 NK_HLA L2
ENSG00000028839 TBPL1 -455367 sc-eQTL 4.71e-01 0.0638 0.0882 0.254 NK_cytokine L2
ENSG00000079950 STX7 983605 sc-eQTL 1.98e-01 0.11 0.0852 0.254 NK_cytokine L2
ENSG00000112303 VNN2 733344 sc-eQTL 3.05e-01 0.0986 0.0959 0.254 NK_cytokine L2
ENSG00000112306 RPS12 682234 sc-eQTL 8.47e-01 -0.0101 0.0522 0.254 NK_cytokine L2
ENSG00000118515 SGK1 -821309 sc-eQTL 6.37e-02 -0.161 0.0862 0.254 NK_cytokine L2
ENSG00000028839 TBPL1 -455367 sc-eQTL 6.50e-01 0.0541 0.119 0.248 PB L2
ENSG00000079950 STX7 983605 sc-eQTL 6.05e-01 -0.0439 0.0846 0.248 PB L2
ENSG00000112303 VNN2 733344 sc-eQTL 7.44e-01 -0.0338 0.103 0.248 PB L2
ENSG00000112306 RPS12 682234 sc-eQTL 1.51e-01 -0.0841 0.0582 0.248 PB L2
ENSG00000118515 SGK1 -821309 sc-eQTL 3.76e-01 0.0841 0.0945 0.248 PB L2
ENSG00000146409 SLC18B1 683464 sc-eQTL 3.69e-01 0.099 0.11 0.248 PB L2
ENSG00000028839 TBPL1 -455367 sc-eQTL 5.05e-01 -0.0663 0.0993 0.25 Pro_T L2
ENSG00000079950 STX7 983605 sc-eQTL 1.17e-01 0.139 0.0882 0.25 Pro_T L2
ENSG00000112303 VNN2 733344 sc-eQTL 4.75e-01 -0.0681 0.0951 0.25 Pro_T L2
ENSG00000112306 RPS12 682234 sc-eQTL 3.06e-01 -0.0368 0.0359 0.25 Pro_T L2
ENSG00000118515 SGK1 -821309 sc-eQTL 4.16e-01 0.0587 0.0721 0.25 Pro_T L2
ENSG00000146409 SLC18B1 683464 sc-eQTL 8.27e-01 0.0204 0.0932 0.25 Pro_T L2
ENSG00000028839 TBPL1 -455367 sc-eQTL 6.54e-01 0.0454 0.101 0.252 Treg L2
ENSG00000079950 STX7 983605 sc-eQTL 5.61e-02 0.181 0.0944 0.252 Treg L2
ENSG00000112303 VNN2 733344 sc-eQTL 5.49e-01 0.048 0.0801 0.252 Treg L2
ENSG00000112306 RPS12 682234 sc-eQTL 8.23e-01 -0.00793 0.0355 0.252 Treg L2
ENSG00000118515 SGK1 -821309 sc-eQTL 3.57e-01 -0.0689 0.0746 0.252 Treg L2
ENSG00000146409 SLC18B1 683464 sc-eQTL 9.03e-01 0.0122 0.1 0.252 Treg L2
ENSG00000028839 TBPL1 -455367 sc-eQTL 7.15e-01 0.0377 0.103 0.273 cDC L2
ENSG00000079950 STX7 983605 sc-eQTL 9.54e-01 0.00471 0.0809 0.273 cDC L2
ENSG00000093134 VNN3 762038 sc-eQTL 8.34e-01 -0.0169 0.0804 0.273 cDC L2
ENSG00000112299 VNN1 782748 sc-eQTL 1.95e-01 0.122 0.0941 0.273 cDC L2
ENSG00000112303 VNN2 733344 sc-eQTL 6.17e-01 -0.0461 0.092 0.273 cDC L2
ENSG00000112306 RPS12 682234 sc-eQTL 4.50e-01 -0.0344 0.0454 0.273 cDC L2
ENSG00000118515 SGK1 -821309 sc-eQTL 1.22e-01 0.118 0.0761 0.273 cDC L2
ENSG00000146409 SLC18B1 683464 sc-eQTL 2.18e-01 0.111 0.0897 0.273 cDC L2
ENSG00000286438 AL591115.1 393675 sc-eQTL 5.20e-01 0.0464 0.0719 0.273 cDC L2
ENSG00000286887 AL355881.1 -799498 sc-eQTL 3.88e-02 0.182 0.0875 0.273 cDC L2
ENSG00000028839 TBPL1 -455367 sc-eQTL 3.58e-01 0.0756 0.0821 0.252 cMono_IL1B L2
ENSG00000079950 STX7 983605 sc-eQTL 5.90e-01 -0.0337 0.0624 0.252 cMono_IL1B L2
ENSG00000093134 VNN3 762038 sc-eQTL 3.12e-01 0.0892 0.088 0.252 cMono_IL1B L2
ENSG00000112299 VNN1 782748 sc-eQTL 2.48e-01 0.103 0.0887 0.252 cMono_IL1B L2
ENSG00000112303 VNN2 733344 sc-eQTL 1.94e-01 -0.0924 0.0709 0.252 cMono_IL1B L2
ENSG00000112306 RPS12 682234 sc-eQTL 6.33e-01 0.0189 0.0395 0.252 cMono_IL1B L2
ENSG00000118515 SGK1 -821309 sc-eQTL 9.97e-01 0.000235 0.059 0.252 cMono_IL1B L2
ENSG00000146409 SLC18B1 683464 sc-eQTL 6.81e-01 0.0314 0.0762 0.252 cMono_IL1B L2
ENSG00000286887 AL355881.1 -799498 sc-eQTL 1.08e-01 0.128 0.0789 0.252 cMono_IL1B L2
ENSG00000028839 TBPL1 -455367 sc-eQTL 3.81e-01 0.0813 0.0927 0.252 cMono_S100A L2
ENSG00000079950 STX7 983605 sc-eQTL 1.40e-01 0.0988 0.0667 0.252 cMono_S100A L2
ENSG00000093134 VNN3 762038 sc-eQTL 6.29e-01 0.0405 0.0837 0.252 cMono_S100A L2
ENSG00000112299 VNN1 782748 sc-eQTL 3.61e-01 0.083 0.0907 0.252 cMono_S100A L2
ENSG00000112303 VNN2 733344 sc-eQTL 3.70e-01 -0.0534 0.0594 0.252 cMono_S100A L2
ENSG00000112306 RPS12 682234 sc-eQTL 5.73e-01 0.0242 0.0429 0.252 cMono_S100A L2
ENSG00000118515 SGK1 -821309 sc-eQTL 7.18e-01 0.0177 0.049 0.252 cMono_S100A L2
ENSG00000146409 SLC18B1 683464 sc-eQTL 9.71e-02 -0.131 0.0789 0.252 cMono_S100A L2
ENSG00000286887 AL355881.1 -799498 sc-eQTL 9.70e-01 -0.0029 0.0776 0.252 cMono_S100A L2
ENSG00000028839 TBPL1 -455367 sc-eQTL 2.89e-01 0.131 0.123 0.261 gdT L2
ENSG00000079950 STX7 983605 sc-eQTL 3.46e-01 -0.1 0.106 0.261 gdT L2
ENSG00000112303 VNN2 733344 sc-eQTL 1.82e-02 -0.276 0.115 0.261 gdT L2
ENSG00000112306 RPS12 682234 sc-eQTL 3.17e-01 -0.0449 0.0447 0.261 gdT L2
ENSG00000118515 SGK1 -821309 sc-eQTL 5.02e-01 0.0569 0.0845 0.261 gdT L2
ENSG00000146409 SLC18B1 683464 sc-eQTL 2.25e-01 -0.141 0.115 0.261 gdT L2
ENSG00000028839 TBPL1 -455367 sc-eQTL 2.39e-02 0.213 0.0937 0.258 intMono L2
ENSG00000079950 STX7 983605 sc-eQTL 9.83e-01 0.00189 0.0906 0.258 intMono L2
ENSG00000093134 VNN3 762038 sc-eQTL 8.29e-01 0.0198 0.0915 0.258 intMono L2
ENSG00000112299 VNN1 782748 sc-eQTL 6.20e-01 0.0449 0.0904 0.258 intMono L2
ENSG00000112303 VNN2 733344 sc-eQTL 2.69e-01 0.102 0.0917 0.258 intMono L2
ENSG00000112306 RPS12 682234 sc-eQTL 3.15e-01 -0.0402 0.0399 0.258 intMono L2
ENSG00000118515 SGK1 -821309 sc-eQTL 8.27e-01 0.0147 0.0672 0.258 intMono L2
ENSG00000146409 SLC18B1 683464 sc-eQTL 4.91e-01 0.0671 0.0973 0.258 intMono L2
ENSG00000286887 AL355881.1 -799498 sc-eQTL 1.63e-01 0.13 0.0927 0.258 intMono L2
ENSG00000028839 TBPL1 -455367 sc-eQTL 4.81e-01 0.0704 0.0996 0.251 ncMono L2
ENSG00000079950 STX7 983605 sc-eQTL 9.80e-01 0.00168 0.0675 0.251 ncMono L2
ENSG00000093134 VNN3 762038 sc-eQTL 9.00e-01 0.012 0.0952 0.251 ncMono L2
ENSG00000112299 VNN1 782748 sc-eQTL 7.67e-01 0.0281 0.0945 0.251 ncMono L2
ENSG00000112303 VNN2 733344 sc-eQTL 7.31e-01 0.0313 0.0908 0.251 ncMono L2
ENSG00000112306 RPS12 682234 sc-eQTL 8.44e-01 0.00895 0.0456 0.251 ncMono L2
ENSG00000118515 SGK1 -821309 sc-eQTL 8.85e-02 0.11 0.064 0.251 ncMono L2
ENSG00000146409 SLC18B1 683464 sc-eQTL 2.97e-01 0.0839 0.0803 0.251 ncMono L2
ENSG00000286887 AL355881.1 -799498 sc-eQTL 4.90e-01 0.0587 0.085 0.251 ncMono L2
ENSG00000028839 TBPL1 -455367 sc-eQTL 8.63e-01 0.02 0.116 0.26 pDC L2
ENSG00000079950 STX7 983605 sc-eQTL 5.80e-01 -0.0428 0.0773 0.26 pDC L2
ENSG00000093134 VNN3 762038 sc-eQTL 3.25e-01 -0.0767 0.0776 0.26 pDC L2
ENSG00000112299 VNN1 782748 sc-eQTL 6.65e-01 0.0344 0.0792 0.26 pDC L2
ENSG00000112303 VNN2 733344 sc-eQTL 4.97e-01 -0.0641 0.0942 0.26 pDC L2
ENSG00000112306 RPS12 682234 sc-eQTL 6.45e-01 0.03 0.0649 0.26 pDC L2
ENSG00000118515 SGK1 -821309 sc-eQTL 7.96e-01 0.0171 0.066 0.26 pDC L2
ENSG00000146409 SLC18B1 683464 sc-eQTL 3.37e-01 -0.0924 0.0959 0.26 pDC L2
ENSG00000286438 AL591115.1 393675 sc-eQTL 7.81e-02 0.162 0.0911 0.26 pDC L2
ENSG00000286887 AL355881.1 -799498 sc-eQTL 9.28e-01 0.00737 0.0816 0.26 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000028839 TBPL1 -455367 sc-eQTL 1.56e-01 0.14 0.0981 0.252 B_Memory LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 983605 sc-eQTL 3.43e-02 0.114 0.0537 0.252 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 733344 sc-eQTL 1.69e-01 0.118 0.0855 0.252 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 682234 sc-eQTL 8.39e-01 0.00996 0.0489 0.252 B_Memory LOneK1K
ENSG00000118515 SGK1 -821309 sc-eQTL 1.80e-01 0.102 0.0762 0.252 B_Memory LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 683464 sc-eQTL 9.97e-01 0.000296 0.0898 0.252 B_Memory LOneK1K
ENSG00000028839 TBPL1 -455367 sc-eQTL 1.04e-01 0.15 0.0919 0.252 B_Naive LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 983605 sc-eQTL 3.09e-01 0.0424 0.0416 0.252 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 733344 sc-eQTL 3.98e-01 -0.0685 0.0808 0.252 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 682234 sc-eQTL 4.57e-01 0.0364 0.0489 0.252 B_Naive LOneK1K
ENSG00000118515 SGK1 -821309 sc-eQTL 2.42e-01 0.0887 0.0755 0.252 B_Naive LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 683464 sc-eQTL 5.13e-01 0.0605 0.0923 0.252 B_Naive LOneK1K
ENSG00000028839 TBPL1 -455367 sc-eQTL 2.76e-01 0.0818 0.0749 0.252 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 983605 sc-eQTL 7.04e-01 0.0199 0.0523 0.252 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000093134 VNN3 762038 sc-eQTL 4.38e-01 0.0661 0.0851 0.252 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112299 VNN1 782748 sc-eQTL 1.94e-01 0.115 0.0885 0.252 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 733344 sc-eQTL 1.99e-01 -0.0753 0.0585 0.252 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 682234 sc-eQTL 5.97e-01 0.0213 0.0403 0.252 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000118515 SGK1 -821309 sc-eQTL 9.36e-01 -0.00443 0.0549 0.252 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 683464 sc-eQTL 5.67e-01 -0.0411 0.0716 0.252 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000286887 AL355881.1 -799498 sc-eQTL 3.07e-01 0.0768 0.075 0.252 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000028839 TBPL1 -455367 sc-eQTL 9.63e-02 0.161 0.0967 0.254 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 983605 sc-eQTL 9.47e-01 0.00425 0.0642 0.254 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000093134 VNN3 762038 sc-eQTL 9.07e-01 0.0111 0.0944 0.254 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112299 VNN1 782748 sc-eQTL 3.28e-01 0.0915 0.0934 0.254 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 733344 sc-eQTL 4.90e-01 0.0609 0.0881 0.254 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 682234 sc-eQTL 9.50e-01 -0.00234 0.0374 0.254 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000118515 SGK1 -821309 sc-eQTL 3.50e-01 0.053 0.0566 0.254 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 683464 sc-eQTL 6.48e-01 0.0416 0.0909 0.254 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000286887 AL355881.1 -799498 sc-eQTL 3.00e-01 0.0852 0.082 0.254 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000028839 TBPL1 -455367 sc-eQTL 3.20e-01 0.0775 0.0778 0.254 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 983605 sc-eQTL 6.39e-01 0.0344 0.0732 0.254 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 733344 sc-eQTL 2.74e-01 -0.101 0.0924 0.254 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 682234 sc-eQTL 5.20e-01 -0.0244 0.0378 0.254 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000118515 SGK1 -821309 sc-eQTL 5.58e-01 -0.0458 0.0781 0.254 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000079950 STX7 983605 pQTL 0.0817 -0.0453 0.026 0.00158 0.0 0.249
ENSG00000079950 STX7 983605 eQTL 0.00658 0.0509 0.0187 0.0 0.0 0.238
ENSG00000112299 VNN1 782748 pQTL 0.00419 0.115 0.0402 0.0 0.0 0.249

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina