logo

Genes within 1Mb (chr6:133494327:T:A):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000028839 TBPL1 -457843 sc-eQTL 3.55e-01 0.0902 0.0973 0.244 B L1
ENSG00000079950 STX7 981129 sc-eQTL 7.72e-02 -0.0685 0.0385 0.244 B L1
ENSG00000112303 VNN2 730868 sc-eQTL 1.21e-01 0.113 0.0726 0.244 B L1
ENSG00000112306 RPS12 679758 sc-eQTL 4.11e-01 0.0363 0.0441 0.244 B L1
ENSG00000118515 SGK1 -823785 sc-eQTL 4.82e-01 -0.0478 0.068 0.244 B L1
ENSG00000146409 SLC18B1 680988 sc-eQTL 2.63e-01 -0.104 0.0926 0.244 B L1
ENSG00000028839 TBPL1 -457843 sc-eQTL 9.58e-01 -0.00377 0.0722 0.244 CD4T L1
ENSG00000079950 STX7 981129 sc-eQTL 9.83e-01 0.0016 0.0751 0.244 CD4T L1
ENSG00000112303 VNN2 730868 sc-eQTL 5.19e-01 0.0419 0.0649 0.244 CD4T L1
ENSG00000112306 RPS12 679758 sc-eQTL 7.18e-01 0.016 0.0442 0.244 CD4T L1
ENSG00000118515 SGK1 -823785 sc-eQTL 5.70e-01 0.0338 0.0594 0.244 CD4T L1
ENSG00000146409 SLC18B1 680988 sc-eQTL 6.10e-01 -0.0456 0.0894 0.244 CD4T L1
ENSG00000028839 TBPL1 -457843 sc-eQTL 1.44e-01 0.105 0.0715 0.244 CD8T L1
ENSG00000079950 STX7 981129 sc-eQTL 7.91e-01 0.0199 0.075 0.244 CD8T L1
ENSG00000112303 VNN2 730868 sc-eQTL 3.89e-01 0.0755 0.0874 0.244 CD8T L1
ENSG00000112306 RPS12 679758 sc-eQTL 8.99e-01 0.0038 0.0299 0.244 CD8T L1
ENSG00000118515 SGK1 -823785 sc-eQTL 2.52e-01 0.0528 0.046 0.244 CD8T L1
ENSG00000146409 SLC18B1 680988 sc-eQTL 2.26e-01 -0.109 0.0901 0.244 CD8T L1
ENSG00000028839 TBPL1 -457843 sc-eQTL 5.95e-01 0.0593 0.111 0.243 DC L1
ENSG00000079950 STX7 981129 sc-eQTL 4.46e-01 0.0528 0.0691 0.243 DC L1
ENSG00000093134 VNN3 759562 sc-eQTL 4.10e-01 -0.0707 0.0857 0.243 DC L1
ENSG00000112299 VNN1 780272 sc-eQTL 1.38e-01 -0.137 0.0922 0.243 DC L1
ENSG00000112303 VNN2 730868 sc-eQTL 8.21e-01 -0.0224 0.0991 0.243 DC L1
ENSG00000112306 RPS12 679758 sc-eQTL 9.56e-01 -0.00309 0.0556 0.243 DC L1
ENSG00000118515 SGK1 -823785 sc-eQTL 3.55e-01 0.0597 0.0644 0.243 DC L1
ENSG00000146409 SLC18B1 680988 sc-eQTL 4.20e-01 -0.071 0.0878 0.243 DC L1
ENSG00000286438 AL591115.1 391199 sc-eQTL 1.70e-01 -0.11 0.0797 0.243 DC L1
ENSG00000286887 AL355881.1 -801974 sc-eQTL 4.71e-01 -0.072 0.0997 0.243 DC L1
ENSG00000028839 TBPL1 -457843 sc-eQTL 5.66e-01 -0.0434 0.0755 0.244 Mono L1
ENSG00000079950 STX7 981129 sc-eQTL 1.86e-01 -0.0668 0.0503 0.244 Mono L1
ENSG00000093134 VNN3 759562 sc-eQTL 2.24e-01 -0.105 0.0865 0.244 Mono L1
ENSG00000112299 VNN1 780272 sc-eQTL 7.43e-02 -0.166 0.0927 0.244 Mono L1
ENSG00000112303 VNN2 730868 sc-eQTL 6.38e-01 0.031 0.0659 0.244 Mono L1
ENSG00000112306 RPS12 679758 sc-eQTL 3.75e-01 -0.035 0.0394 0.244 Mono L1
ENSG00000118515 SGK1 -823785 sc-eQTL 1.89e-01 0.0731 0.0555 0.244 Mono L1
ENSG00000146409 SLC18B1 680988 sc-eQTL 2.82e-01 0.0841 0.0779 0.244 Mono L1
ENSG00000286887 AL355881.1 -801974 sc-eQTL 3.87e-01 -0.0665 0.0766 0.244 Mono L1
ENSG00000028839 TBPL1 -457843 sc-eQTL 8.97e-01 -0.0107 0.0824 0.242 NK L1
ENSG00000079950 STX7 981129 sc-eQTL 9.66e-01 -0.00328 0.0762 0.242 NK L1
ENSG00000112303 VNN2 730868 sc-eQTL 5.35e-01 0.0588 0.0947 0.242 NK L1
ENSG00000112306 RPS12 679758 sc-eQTL 2.38e-01 0.0463 0.0391 0.242 NK L1
ENSG00000118515 SGK1 -823785 sc-eQTL 9.55e-01 0.00407 0.0725 0.242 NK L1
ENSG00000028839 TBPL1 -457843 sc-eQTL 4.06e-01 -0.0819 0.0983 0.244 Other_T L1
ENSG00000079950 STX7 981129 sc-eQTL 1.28e-01 -0.118 0.0771 0.244 Other_T L1
ENSG00000112303 VNN2 730868 sc-eQTL 1.57e-01 -0.132 0.0933 0.244 Other_T L1
ENSG00000112306 RPS12 679758 sc-eQTL 5.04e-01 0.0249 0.0371 0.244 Other_T L1
ENSG00000118515 SGK1 -823785 sc-eQTL 3.07e-01 -0.0699 0.0682 0.244 Other_T L1
ENSG00000146409 SLC18B1 680988 sc-eQTL 9.31e-01 -0.00878 0.102 0.244 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000028839 TBPL1 -457843 sc-eQTL 7.61e-01 0.036 0.118 0.23 B_Activated L2
ENSG00000079950 STX7 981129 sc-eQTL 5.66e-01 -0.0583 0.101 0.23 B_Activated L2
ENSG00000112303 VNN2 730868 sc-eQTL 8.71e-02 -0.184 0.107 0.23 B_Activated L2
ENSG00000112306 RPS12 679758 sc-eQTL 4.74e-01 0.0415 0.0577 0.23 B_Activated L2
ENSG00000118515 SGK1 -823785 sc-eQTL 2.87e-01 -0.11 0.103 0.23 B_Activated L2
ENSG00000146409 SLC18B1 680988 sc-eQTL 5.00e-01 -0.0683 0.101 0.23 B_Activated L2
ENSG00000028839 TBPL1 -457843 sc-eQTL 7.08e-01 0.041 0.109 0.245 B_Intermediate L2
ENSG00000079950 STX7 981129 sc-eQTL 1.54e-01 -0.0893 0.0624 0.245 B_Intermediate L2
ENSG00000112303 VNN2 730868 sc-eQTL 1.78e-01 0.127 0.094 0.245 B_Intermediate L2
ENSG00000112306 RPS12 679758 sc-eQTL 1.85e-01 0.0765 0.0576 0.245 B_Intermediate L2
ENSG00000118515 SGK1 -823785 sc-eQTL 8.05e-01 -0.0247 0.1 0.245 B_Intermediate L2
ENSG00000146409 SLC18B1 680988 sc-eQTL 9.77e-01 -0.00304 0.104 0.245 B_Intermediate L2
ENSG00000028839 TBPL1 -457843 sc-eQTL 3.87e-02 -0.224 0.107 0.241 B_Memory L2
ENSG00000079950 STX7 981129 sc-eQTL 6.55e-01 -0.0351 0.0785 0.241 B_Memory L2
ENSG00000112303 VNN2 730868 sc-eQTL 4.57e-01 0.0764 0.103 0.241 B_Memory L2
ENSG00000112306 RPS12 679758 sc-eQTL 7.04e-01 -0.0188 0.0495 0.241 B_Memory L2
ENSG00000118515 SGK1 -823785 sc-eQTL 1.29e-02 -0.224 0.0895 0.241 B_Memory L2
ENSG00000146409 SLC18B1 680988 sc-eQTL 8.96e-01 -0.0135 0.103 0.241 B_Memory L2
ENSG00000028839 TBPL1 -457843 sc-eQTL 5.45e-01 0.0592 0.0976 0.244 B_Naive1 L2
ENSG00000079950 STX7 981129 sc-eQTL 8.53e-02 -0.0806 0.0466 0.244 B_Naive1 L2
ENSG00000112303 VNN2 730868 sc-eQTL 5.13e-01 0.0597 0.0911 0.244 B_Naive1 L2
ENSG00000112306 RPS12 679758 sc-eQTL 1.48e-01 0.075 0.0517 0.244 B_Naive1 L2
ENSG00000118515 SGK1 -823785 sc-eQTL 8.00e-01 0.0206 0.0812 0.244 B_Naive1 L2
ENSG00000146409 SLC18B1 680988 sc-eQTL 6.71e-02 -0.183 0.0994 0.244 B_Naive1 L2
ENSG00000028839 TBPL1 -457843 sc-eQTL 6.32e-01 0.0504 0.105 0.245 B_Naive2 L2
ENSG00000079950 STX7 981129 sc-eQTL 1.44e-01 -0.0815 0.0555 0.245 B_Naive2 L2
ENSG00000112303 VNN2 730868 sc-eQTL 2.95e-01 0.107 0.102 0.245 B_Naive2 L2
ENSG00000112306 RPS12 679758 sc-eQTL 1.83e-01 0.0722 0.054 0.245 B_Naive2 L2
ENSG00000118515 SGK1 -823785 sc-eQTL 2.13e-01 0.119 0.0955 0.245 B_Naive2 L2
ENSG00000146409 SLC18B1 680988 sc-eQTL 6.48e-01 0.0474 0.103 0.245 B_Naive2 L2
ENSG00000028839 TBPL1 -457843 sc-eQTL 1.77e-02 -0.239 0.0997 0.248 CD4_CTL L2
ENSG00000079950 STX7 981129 sc-eQTL 9.20e-01 -0.0101 0.1 0.248 CD4_CTL L2
ENSG00000112303 VNN2 730868 sc-eQTL 3.41e-01 0.0964 0.101 0.248 CD4_CTL L2
ENSG00000112306 RPS12 679758 sc-eQTL 9.09e-01 0.00536 0.0468 0.248 CD4_CTL L2
ENSG00000118515 SGK1 -823785 sc-eQTL 3.03e-01 0.0836 0.081 0.248 CD4_CTL L2
ENSG00000146409 SLC18B1 680988 sc-eQTL 2.85e-01 -0.101 0.0942 0.248 CD4_CTL L2
ENSG00000028839 TBPL1 -457843 sc-eQTL 7.66e-01 0.0249 0.0834 0.244 CD4_Naive L2
ENSG00000079950 STX7 981129 sc-eQTL 9.41e-01 0.00604 0.0818 0.244 CD4_Naive L2
ENSG00000112303 VNN2 730868 sc-eQTL 5.26e-01 0.0481 0.0757 0.244 CD4_Naive L2
ENSG00000112306 RPS12 679758 sc-eQTL 8.11e-01 0.0117 0.0491 0.244 CD4_Naive L2
ENSG00000118515 SGK1 -823785 sc-eQTL 8.43e-01 0.0119 0.0602 0.244 CD4_Naive L2
ENSG00000146409 SLC18B1 680988 sc-eQTL 6.27e-01 -0.0461 0.0945 0.244 CD4_Naive L2
ENSG00000028839 TBPL1 -457843 sc-eQTL 4.47e-01 0.0677 0.0888 0.244 CD4_TCM L2
ENSG00000079950 STX7 981129 sc-eQTL 6.55e-01 -0.0401 0.0895 0.244 CD4_TCM L2
ENSG00000112303 VNN2 730868 sc-eQTL 4.44e-01 -0.0675 0.0881 0.244 CD4_TCM L2
ENSG00000112306 RPS12 679758 sc-eQTL 2.35e-01 0.0543 0.0456 0.244 CD4_TCM L2
ENSG00000118515 SGK1 -823785 sc-eQTL 1.46e-01 0.0929 0.0637 0.244 CD4_TCM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 680988 sc-eQTL 7.52e-01 0.0335 0.106 0.244 CD4_TCM L2
ENSG00000028839 TBPL1 -457843 sc-eQTL 6.95e-01 -0.0407 0.103 0.244 CD4_TEM L2
ENSG00000079950 STX7 981129 sc-eQTL 6.47e-01 -0.0474 0.104 0.244 CD4_TEM L2
ENSG00000112303 VNN2 730868 sc-eQTL 7.75e-01 -0.0285 0.0994 0.244 CD4_TEM L2
ENSG00000112306 RPS12 679758 sc-eQTL 2.30e-01 0.049 0.0406 0.244 CD4_TEM L2
ENSG00000118515 SGK1 -823785 sc-eQTL 2.91e-01 0.074 0.0699 0.244 CD4_TEM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 680988 sc-eQTL 1.00e+00 5.83e-05 0.101 0.244 CD4_TEM L2
ENSG00000028839 TBPL1 -457843 sc-eQTL 9.33e-01 -0.00756 0.0901 0.244 CD8_CTL L2
ENSG00000079950 STX7 981129 sc-eQTL 4.04e-01 0.0703 0.0841 0.244 CD8_CTL L2
ENSG00000112303 VNN2 730868 sc-eQTL 4.65e-01 0.07 0.0956 0.244 CD8_CTL L2
ENSG00000112306 RPS12 679758 sc-eQTL 8.05e-01 0.0127 0.0512 0.244 CD8_CTL L2
ENSG00000118515 SGK1 -823785 sc-eQTL 2.83e-01 0.093 0.0863 0.244 CD8_CTL L2
ENSG00000146409 SLC18B1 680988 sc-eQTL 6.13e-01 -0.0503 0.0992 0.244 CD8_CTL L2
ENSG00000028839 TBPL1 -457843 sc-eQTL 6.43e-01 -0.0448 0.0964 0.244 CD8_Naive L2
ENSG00000079950 STX7 981129 sc-eQTL 2.74e-01 0.113 0.103 0.244 CD8_Naive L2
ENSG00000112303 VNN2 730868 sc-eQTL 2.92e-01 0.0935 0.0885 0.244 CD8_Naive L2
ENSG00000112306 RPS12 679758 sc-eQTL 9.11e-01 0.00569 0.0508 0.244 CD8_Naive L2
ENSG00000118515 SGK1 -823785 sc-eQTL 6.41e-01 0.0297 0.0637 0.244 CD8_Naive L2
ENSG00000146409 SLC18B1 680988 sc-eQTL 4.71e-01 0.0735 0.102 0.244 CD8_Naive L2
ENSG00000028839 TBPL1 -457843 sc-eQTL 7.36e-02 0.195 0.108 0.245 CD8_TCM L2
ENSG00000079950 STX7 981129 sc-eQTL 6.89e-01 -0.0405 0.101 0.245 CD8_TCM L2
ENSG00000112303 VNN2 730868 sc-eQTL 3.02e-01 0.104 0.1 0.245 CD8_TCM L2
ENSG00000112306 RPS12 679758 sc-eQTL 7.81e-01 0.0136 0.0489 0.245 CD8_TCM L2
ENSG00000118515 SGK1 -823785 sc-eQTL 7.00e-01 0.0312 0.081 0.245 CD8_TCM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 680988 sc-eQTL 8.40e-01 -0.0216 0.107 0.245 CD8_TCM L2
ENSG00000028839 TBPL1 -457843 sc-eQTL 9.79e-02 0.161 0.097 0.244 CD8_TEM L2
ENSG00000079950 STX7 981129 sc-eQTL 1.76e-01 -0.144 0.106 0.244 CD8_TEM L2
ENSG00000112303 VNN2 730868 sc-eQTL 5.75e-01 -0.0595 0.106 0.244 CD8_TEM L2
ENSG00000112306 RPS12 679758 sc-eQTL 8.69e-01 -0.00941 0.057 0.244 CD8_TEM L2
ENSG00000118515 SGK1 -823785 sc-eQTL 6.17e-03 0.254 0.0917 0.244 CD8_TEM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 680988 sc-eQTL 3.72e-01 -0.0963 0.108 0.244 CD8_TEM L2
ENSG00000028839 TBPL1 -457843 sc-eQTL 1.62e-01 -0.144 0.103 0.24 MAIT L2
ENSG00000079950 STX7 981129 sc-eQTL 6.98e-01 -0.0381 0.098 0.24 MAIT L2
ENSG00000112303 VNN2 730868 sc-eQTL 1.78e-01 -0.134 0.0993 0.24 MAIT L2
ENSG00000112306 RPS12 679758 sc-eQTL 2.51e-01 0.0563 0.0489 0.24 MAIT L2
ENSG00000118515 SGK1 -823785 sc-eQTL 7.67e-01 -0.0205 0.069 0.24 MAIT L2
ENSG00000146409 SLC18B1 680988 sc-eQTL 6.90e-01 -0.041 0.103 0.24 MAIT L2
ENSG00000028839 TBPL1 -457843 sc-eQTL 9.88e-01 0.00164 0.106 0.251 NK_CD56bright L2
ENSG00000079950 STX7 981129 sc-eQTL 1.38e-01 0.146 0.0982 0.251 NK_CD56bright L2
ENSG00000112303 VNN2 730868 sc-eQTL 2.86e-01 0.107 0.0999 0.251 NK_CD56bright L2
ENSG00000112306 RPS12 679758 sc-eQTL 4.48e-02 0.112 0.0553 0.251 NK_CD56bright L2
ENSG00000118515 SGK1 -823785 sc-eQTL 1.49e-01 -0.12 0.083 0.251 NK_CD56bright L2
ENSG00000028839 TBPL1 -457843 sc-eQTL 6.85e-01 -0.0358 0.0883 0.244 NK_CD56dim L2
ENSG00000079950 STX7 981129 sc-eQTL 8.48e-01 -0.0155 0.0808 0.244 NK_CD56dim L2
ENSG00000112303 VNN2 730868 sc-eQTL 4.22e-01 0.0812 0.101 0.244 NK_CD56dim L2
ENSG00000112306 RPS12 679758 sc-eQTL 2.48e-01 0.0464 0.04 0.244 NK_CD56dim L2
ENSG00000118515 SGK1 -823785 sc-eQTL 3.12e-01 0.0899 0.0887 0.244 NK_CD56dim L2
ENSG00000028839 TBPL1 -457843 sc-eQTL 3.97e-01 -0.0907 0.107 0.256 NK_HLA L2
ENSG00000079950 STX7 981129 sc-eQTL 8.15e-01 0.0229 0.0974 0.256 NK_HLA L2
ENSG00000112303 VNN2 730868 sc-eQTL 4.74e-01 0.0706 0.0984 0.256 NK_HLA L2
ENSG00000112306 RPS12 679758 sc-eQTL 4.96e-01 0.0313 0.0459 0.256 NK_HLA L2
ENSG00000118515 SGK1 -823785 sc-eQTL 7.08e-01 -0.034 0.0907 0.256 NK_HLA L2
ENSG00000028839 TBPL1 -457843 sc-eQTL 7.61e-01 0.0278 0.0912 0.244 NK_cytokine L2
ENSG00000079950 STX7 981129 sc-eQTL 2.03e-01 -0.112 0.088 0.244 NK_cytokine L2
ENSG00000112303 VNN2 730868 sc-eQTL 7.02e-01 -0.038 0.0992 0.244 NK_cytokine L2
ENSG00000112306 RPS12 679758 sc-eQTL 6.68e-01 0.0231 0.0538 0.244 NK_cytokine L2
ENSG00000118515 SGK1 -823785 sc-eQTL 8.45e-01 0.0176 0.0897 0.244 NK_cytokine L2
ENSG00000028839 TBPL1 -457843 sc-eQTL 9.95e-01 -0.000925 0.134 0.207 PB L2
ENSG00000079950 STX7 981129 sc-eQTL 1.37e-02 0.233 0.093 0.207 PB L2
ENSG00000112303 VNN2 730868 sc-eQTL 7.67e-01 -0.0346 0.117 0.207 PB L2
ENSG00000112306 RPS12 679758 sc-eQTL 3.99e-01 0.0559 0.066 0.207 PB L2
ENSG00000118515 SGK1 -823785 sc-eQTL 6.36e-01 -0.0508 0.107 0.207 PB L2
ENSG00000146409 SLC18B1 680988 sc-eQTL 2.55e-01 0.141 0.123 0.207 PB L2
ENSG00000028839 TBPL1 -457843 sc-eQTL 7.37e-01 -0.0353 0.105 0.243 Pro_T L2
ENSG00000079950 STX7 981129 sc-eQTL 3.84e-01 -0.0817 0.0936 0.243 Pro_T L2
ENSG00000112303 VNN2 730868 sc-eQTL 7.52e-01 -0.0318 0.101 0.243 Pro_T L2
ENSG00000112306 RPS12 679758 sc-eQTL 1.26e-02 0.0944 0.0375 0.243 Pro_T L2
ENSG00000118515 SGK1 -823785 sc-eQTL 4.92e-01 -0.0525 0.0762 0.243 Pro_T L2
ENSG00000146409 SLC18B1 680988 sc-eQTL 4.07e-01 0.0817 0.0983 0.243 Pro_T L2
ENSG00000028839 TBPL1 -457843 sc-eQTL 3.70e-01 0.0943 0.105 0.244 Treg L2
ENSG00000079950 STX7 981129 sc-eQTL 5.67e-01 0.0568 0.0991 0.244 Treg L2
ENSG00000112303 VNN2 730868 sc-eQTL 9.87e-01 -0.00137 0.0835 0.244 Treg L2
ENSG00000112306 RPS12 679758 sc-eQTL 3.91e-01 0.0317 0.0369 0.244 Treg L2
ENSG00000118515 SGK1 -823785 sc-eQTL 9.23e-01 0.00755 0.0778 0.244 Treg L2
ENSG00000146409 SLC18B1 680988 sc-eQTL 1.13e-01 -0.165 0.104 0.244 Treg L2
ENSG00000028839 TBPL1 -457843 sc-eQTL 6.29e-01 0.0545 0.113 0.249 cDC L2
ENSG00000079950 STX7 981129 sc-eQTL 9.96e-01 -0.000459 0.0887 0.249 cDC L2
ENSG00000093134 VNN3 759562 sc-eQTL 8.47e-01 0.017 0.088 0.249 cDC L2
ENSG00000112299 VNN1 780272 sc-eQTL 4.16e-01 -0.0842 0.103 0.249 cDC L2
ENSG00000112303 VNN2 730868 sc-eQTL 5.42e-01 0.0615 0.101 0.249 cDC L2
ENSG00000112306 RPS12 679758 sc-eQTL 9.56e-01 0.00278 0.0498 0.249 cDC L2
ENSG00000118515 SGK1 -823785 sc-eQTL 7.45e-01 0.0273 0.0839 0.249 cDC L2
ENSG00000146409 SLC18B1 680988 sc-eQTL 7.21e-01 -0.0353 0.0986 0.249 cDC L2
ENSG00000286438 AL591115.1 391199 sc-eQTL 6.34e-02 -0.146 0.0781 0.249 cDC L2
ENSG00000286887 AL355881.1 -801974 sc-eQTL 5.09e-01 -0.0641 0.0969 0.249 cDC L2
ENSG00000028839 TBPL1 -457843 sc-eQTL 5.57e-01 0.0502 0.0855 0.244 cMono_IL1B L2
ENSG00000079950 STX7 981129 sc-eQTL 8.91e-01 -0.00887 0.0649 0.244 cMono_IL1B L2
ENSG00000093134 VNN3 759562 sc-eQTL 3.33e-02 -0.195 0.0908 0.244 cMono_IL1B L2
ENSG00000112299 VNN1 780272 sc-eQTL 3.70e-01 -0.0831 0.0924 0.244 cMono_IL1B L2
ENSG00000112303 VNN2 730868 sc-eQTL 9.71e-01 -0.00268 0.074 0.244 cMono_IL1B L2
ENSG00000112306 RPS12 679758 sc-eQTL 3.72e-01 -0.0367 0.041 0.244 cMono_IL1B L2
ENSG00000118515 SGK1 -823785 sc-eQTL 2.49e-01 0.0706 0.0611 0.244 cMono_IL1B L2
ENSG00000146409 SLC18B1 680988 sc-eQTL 8.89e-01 0.0111 0.0793 0.244 cMono_IL1B L2
ENSG00000286887 AL355881.1 -801974 sc-eQTL 2.32e-01 -0.0986 0.0823 0.244 cMono_IL1B L2
ENSG00000028839 TBPL1 -457843 sc-eQTL 5.45e-02 -0.187 0.0967 0.244 cMono_S100A L2
ENSG00000079950 STX7 981129 sc-eQTL 2.78e-01 -0.0765 0.0703 0.244 cMono_S100A L2
ENSG00000093134 VNN3 759562 sc-eQTL 9.10e-01 0.01 0.088 0.244 cMono_S100A L2
ENSG00000112299 VNN1 780272 sc-eQTL 4.68e-02 -0.189 0.0946 0.244 cMono_S100A L2
ENSG00000112303 VNN2 730868 sc-eQTL 1.86e-01 0.0827 0.0623 0.244 cMono_S100A L2
ENSG00000112306 RPS12 679758 sc-eQTL 1.27e-01 -0.0686 0.0448 0.244 cMono_S100A L2
ENSG00000118515 SGK1 -823785 sc-eQTL 6.08e-01 0.0264 0.0515 0.244 cMono_S100A L2
ENSG00000146409 SLC18B1 680988 sc-eQTL 4.32e-01 0.0655 0.0833 0.244 cMono_S100A L2
ENSG00000286887 AL355881.1 -801974 sc-eQTL 8.38e-01 0.0167 0.0816 0.244 cMono_S100A L2
ENSG00000028839 TBPL1 -457843 sc-eQTL 7.66e-01 -0.0392 0.131 0.255 gdT L2
ENSG00000079950 STX7 981129 sc-eQTL 5.68e-01 -0.0645 0.113 0.255 gdT L2
ENSG00000112303 VNN2 730868 sc-eQTL 8.71e-01 -0.0203 0.125 0.255 gdT L2
ENSG00000112306 RPS12 679758 sc-eQTL 8.85e-01 -0.00686 0.0476 0.255 gdT L2
ENSG00000118515 SGK1 -823785 sc-eQTL 8.64e-01 0.0154 0.0898 0.255 gdT L2
ENSG00000146409 SLC18B1 680988 sc-eQTL 8.90e-01 -0.0171 0.123 0.255 gdT L2
ENSG00000028839 TBPL1 -457843 sc-eQTL 3.17e-01 -0.0987 0.0984 0.242 intMono L2
ENSG00000079950 STX7 981129 sc-eQTL 6.56e-01 -0.0421 0.0942 0.242 intMono L2
ENSG00000093134 VNN3 759562 sc-eQTL 4.56e-01 0.0709 0.095 0.242 intMono L2
ENSG00000112299 VNN1 780272 sc-eQTL 3.25e-01 -0.0925 0.0938 0.242 intMono L2
ENSG00000112303 VNN2 730868 sc-eQTL 4.65e-01 0.0699 0.0954 0.242 intMono L2
ENSG00000112306 RPS12 679758 sc-eQTL 7.43e-01 0.0137 0.0416 0.242 intMono L2
ENSG00000118515 SGK1 -823785 sc-eQTL 4.99e-01 0.0473 0.0698 0.242 intMono L2
ENSG00000146409 SLC18B1 680988 sc-eQTL 8.18e-01 -0.0233 0.101 0.242 intMono L2
ENSG00000286887 AL355881.1 -801974 sc-eQTL 2.33e-01 -0.115 0.0965 0.242 intMono L2
ENSG00000028839 TBPL1 -457843 sc-eQTL 9.62e-01 -0.00503 0.104 0.244 ncMono L2
ENSG00000079950 STX7 981129 sc-eQTL 6.89e-01 -0.0282 0.0704 0.244 ncMono L2
ENSG00000093134 VNN3 759562 sc-eQTL 6.88e-01 -0.04 0.0994 0.244 ncMono L2
ENSG00000112299 VNN1 780272 sc-eQTL 1.49e-01 -0.142 0.0982 0.244 ncMono L2
ENSG00000112303 VNN2 730868 sc-eQTL 8.33e-01 -0.02 0.0949 0.244 ncMono L2
ENSG00000112306 RPS12 679758 sc-eQTL 7.27e-01 -0.0167 0.0476 0.244 ncMono L2
ENSG00000118515 SGK1 -823785 sc-eQTL 3.47e-01 -0.0633 0.0672 0.244 ncMono L2
ENSG00000146409 SLC18B1 680988 sc-eQTL 4.76e-01 -0.06 0.0839 0.244 ncMono L2
ENSG00000286887 AL355881.1 -801974 sc-eQTL 1.76e-02 -0.21 0.0876 0.244 ncMono L2
ENSG00000028839 TBPL1 -457843 sc-eQTL 9.43e-01 -0.00906 0.126 0.257 pDC L2
ENSG00000079950 STX7 981129 sc-eQTL 8.95e-02 0.142 0.0829 0.257 pDC L2
ENSG00000093134 VNN3 759562 sc-eQTL 5.36e-01 -0.0521 0.0841 0.257 pDC L2
ENSG00000112299 VNN1 780272 sc-eQTL 9.99e-01 0.000156 0.0857 0.257 pDC L2
ENSG00000112303 VNN2 730868 sc-eQTL 6.95e-01 -0.0401 0.102 0.257 pDC L2
ENSG00000112306 RPS12 679758 sc-eQTL 8.39e-01 -0.0143 0.0703 0.257 pDC L2
ENSG00000118515 SGK1 -823785 sc-eQTL 8.48e-01 -0.0137 0.0714 0.257 pDC L2
ENSG00000146409 SLC18B1 680988 sc-eQTL 3.13e-01 -0.105 0.104 0.257 pDC L2
ENSG00000286438 AL591115.1 391199 sc-eQTL 6.04e-01 -0.0517 0.0995 0.257 pDC L2
ENSG00000286887 AL355881.1 -801974 sc-eQTL 5.75e-01 -0.0496 0.0882 0.257 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000028839 TBPL1 -457843 sc-eQTL 9.45e-01 -0.00716 0.104 0.244 B_Memory LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 981129 sc-eQTL 1.35e-01 -0.0855 0.057 0.244 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 730868 sc-eQTL 5.99e-01 0.0477 0.0906 0.244 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 679758 sc-eQTL 3.48e-01 0.0485 0.0515 0.244 B_Memory LOneK1K
ENSG00000118515 SGK1 -823785 sc-eQTL 2.05e-01 -0.102 0.0804 0.244 B_Memory LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 680988 sc-eQTL 8.39e-01 -0.0192 0.0948 0.244 B_Memory LOneK1K
ENSG00000028839 TBPL1 -457843 sc-eQTL 5.29e-01 0.0621 0.0984 0.244 B_Naive LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 981129 sc-eQTL 9.84e-02 -0.0732 0.0441 0.244 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 730868 sc-eQTL 2.23e-01 0.105 0.0858 0.244 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 679758 sc-eQTL 8.76e-02 0.0888 0.0518 0.244 B_Naive LOneK1K
ENSG00000118515 SGK1 -823785 sc-eQTL 3.57e-01 0.0743 0.0805 0.244 B_Naive LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 680988 sc-eQTL 2.30e-01 -0.118 0.098 0.244 B_Naive LOneK1K
ENSG00000028839 TBPL1 -457843 sc-eQTL 5.98e-01 -0.0413 0.0783 0.244 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 981129 sc-eQTL 3.97e-01 -0.0461 0.0544 0.244 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000093134 VNN3 759562 sc-eQTL 1.24e-01 -0.136 0.0883 0.244 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112299 VNN1 780272 sc-eQTL 9.73e-02 -0.153 0.092 0.244 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 730868 sc-eQTL 6.32e-01 0.0294 0.0612 0.244 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 679758 sc-eQTL 1.65e-01 -0.0582 0.0418 0.244 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000118515 SGK1 -823785 sc-eQTL 2.01e-01 0.0731 0.057 0.244 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 680988 sc-eQTL 5.62e-01 0.0433 0.0747 0.244 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000286887 AL355881.1 -801974 sc-eQTL 4.96e-01 -0.0534 0.0783 0.244 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000028839 TBPL1 -457843 sc-eQTL 4.36e-01 -0.0794 0.102 0.244 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 981129 sc-eQTL 2.26e-01 -0.0814 0.067 0.244 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000093134 VNN3 759562 sc-eQTL 5.79e-01 -0.0549 0.0988 0.244 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112299 VNN1 780272 sc-eQTL 1.38e-01 -0.145 0.0975 0.244 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 730868 sc-eQTL 9.50e-01 -0.00576 0.0924 0.244 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 679758 sc-eQTL 8.87e-01 -0.00558 0.0392 0.244 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000118515 SGK1 -823785 sc-eQTL 9.81e-01 -0.00145 0.0593 0.244 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 680988 sc-eQTL 7.45e-01 0.0309 0.0952 0.244 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000286887 AL355881.1 -801974 sc-eQTL 6.59e-02 -0.158 0.0854 0.244 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000028839 TBPL1 -457843 sc-eQTL 5.74e-01 -0.0459 0.0814 0.244 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 981129 sc-eQTL 6.48e-01 -0.035 0.0765 0.244 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 730868 sc-eQTL 6.66e-01 0.0418 0.0968 0.244 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 679758 sc-eQTL 2.90e-01 0.0418 0.0394 0.244 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000118515 SGK1 -823785 sc-eQTL 2.34e-01 0.0972 0.0814 0.244 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina
ENSG00000146409 \N 680988 3.62e-07 1.67e-07 6.41e-08 2.26e-07 1.1e-07 8.85e-08 2.5e-07 6.75e-08 1.96e-07 1.11e-07 1.96e-07 1.57e-07 2.55e-07 8.44e-08 6.6e-08 1.06e-07 6.63e-08 2.21e-07 7.42e-08 6.02e-08 1.27e-07 1.9e-07 1.73e-07 4.27e-08 2.36e-07 1.82e-07 1.29e-07 1.28e-07 1.36e-07 1.38e-07 1.26e-07 4.61e-08 4.23e-08 1.02e-07 5.65e-08 3.5e-08 4.54e-08 7.25e-08 6.33e-08 5.96e-08 6.28e-08 1.59e-07 3.08e-08 1.11e-08 3.87e-08 6.53e-09 8.93e-08 2.16e-09 4.97e-08