logo

Genes within 1Mb (chr6:133489964:CAT:C):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000028839 TBPL1 -462206 sc-eQTL 1.50e-01 0.133 0.0923 0.248 B L1
ENSG00000079950 STX7 976766 sc-eQTL 2.69e-01 0.0408 0.0368 0.248 B L1
ENSG00000112303 VNN2 726505 sc-eQTL 7.22e-01 -0.0247 0.0694 0.248 B L1
ENSG00000112306 RPS12 675395 sc-eQTL 5.59e-01 0.0245 0.0419 0.248 B L1
ENSG00000118515 SGK1 -828148 sc-eQTL 1.06e-01 0.104 0.0643 0.248 B L1
ENSG00000146409 SLC18B1 676625 sc-eQTL 3.32e-01 0.0857 0.0881 0.248 B L1
ENSG00000028839 TBPL1 -462206 sc-eQTL 4.86e-01 0.0481 0.069 0.248 CD4T L1
ENSG00000079950 STX7 976766 sc-eQTL 1.62e-02 0.172 0.0709 0.248 CD4T L1
ENSG00000112303 VNN2 726505 sc-eQTL 7.94e-01 -0.0163 0.0622 0.248 CD4T L1
ENSG00000112306 RPS12 675395 sc-eQTL 6.39e-01 -0.0199 0.0423 0.248 CD4T L1
ENSG00000118515 SGK1 -828148 sc-eQTL 6.51e-01 -0.0258 0.0568 0.248 CD4T L1
ENSG00000146409 SLC18B1 676625 sc-eQTL 2.65e-02 0.189 0.0846 0.248 CD4T L1
ENSG00000028839 TBPL1 -462206 sc-eQTL 5.73e-01 0.0385 0.0681 0.248 CD8T L1
ENSG00000079950 STX7 976766 sc-eQTL 9.59e-01 0.00367 0.0712 0.248 CD8T L1
ENSG00000112303 VNN2 726505 sc-eQTL 6.01e-01 -0.0436 0.0831 0.248 CD8T L1
ENSG00000112306 RPS12 675395 sc-eQTL 1.89e-01 -0.0373 0.0283 0.248 CD8T L1
ENSG00000118515 SGK1 -828148 sc-eQTL 2.04e-01 -0.0555 0.0436 0.248 CD8T L1
ENSG00000146409 SLC18B1 676625 sc-eQTL 2.86e-01 0.0915 0.0856 0.248 CD8T L1
ENSG00000028839 TBPL1 -462206 sc-eQTL 9.51e-01 -0.00651 0.106 0.257 DC L1
ENSG00000079950 STX7 976766 sc-eQTL 7.09e-01 -0.0246 0.0658 0.257 DC L1
ENSG00000093134 VNN3 755199 sc-eQTL 5.30e-01 -0.0513 0.0816 0.257 DC L1
ENSG00000112299 VNN1 775909 sc-eQTL 8.98e-02 0.149 0.0875 0.257 DC L1
ENSG00000112303 VNN2 726505 sc-eQTL 8.38e-01 -0.0193 0.0943 0.257 DC L1
ENSG00000112306 RPS12 675395 sc-eQTL 3.18e-01 -0.0528 0.0527 0.257 DC L1
ENSG00000118515 SGK1 -828148 sc-eQTL 4.15e-01 0.05 0.0613 0.257 DC L1
ENSG00000146409 SLC18B1 676625 sc-eQTL 5.71e-01 0.0474 0.0836 0.257 DC L1
ENSG00000286438 AL591115.1 386836 sc-eQTL 1.16e-01 0.119 0.0757 0.257 DC L1
ENSG00000286887 AL355881.1 -806337 sc-eQTL 2.01e-01 0.121 0.0946 0.257 DC L1
ENSG00000028839 TBPL1 -462206 sc-eQTL 2.68e-01 0.0813 0.0733 0.248 Mono L1
ENSG00000079950 STX7 976766 sc-eQTL 5.58e-01 0.0288 0.0491 0.248 Mono L1
ENSG00000093134 VNN3 755199 sc-eQTL 8.26e-01 0.0186 0.0844 0.248 Mono L1
ENSG00000112299 VNN1 775909 sc-eQTL 4.12e-01 0.0746 0.0907 0.248 Mono L1
ENSG00000112303 VNN2 726505 sc-eQTL 2.23e-01 -0.0781 0.0639 0.248 Mono L1
ENSG00000112306 RPS12 675395 sc-eQTL 7.65e-01 0.0115 0.0384 0.248 Mono L1
ENSG00000118515 SGK1 -828148 sc-eQTL 9.66e-01 -0.00232 0.0542 0.248 Mono L1
ENSG00000146409 SLC18B1 676625 sc-eQTL 5.18e-01 -0.0492 0.0759 0.248 Mono L1
ENSG00000286887 AL355881.1 -806337 sc-eQTL 3.99e-01 0.063 0.0745 0.248 Mono L1
ENSG00000028839 TBPL1 -462206 sc-eQTL 3.70e-01 0.0719 0.0801 0.249 NK L1
ENSG00000079950 STX7 976766 sc-eQTL 7.51e-01 0.0236 0.0742 0.249 NK L1
ENSG00000112303 VNN2 726505 sc-eQTL 3.36e-01 -0.0888 0.0921 0.249 NK L1
ENSG00000112306 RPS12 675395 sc-eQTL 3.88e-01 -0.033 0.0381 0.249 NK L1
ENSG00000118515 SGK1 -828148 sc-eQTL 3.23e-01 -0.0698 0.0705 0.249 NK L1
ENSG00000028839 TBPL1 -462206 sc-eQTL 4.14e-01 -0.0752 0.0918 0.248 Other_T L1
ENSG00000079950 STX7 976766 sc-eQTL 1.68e-01 0.0996 0.072 0.248 Other_T L1
ENSG00000112303 VNN2 726505 sc-eQTL 2.96e-01 -0.0915 0.0873 0.248 Other_T L1
ENSG00000112306 RPS12 675395 sc-eQTL 6.67e-02 -0.0634 0.0344 0.248 Other_T L1
ENSG00000118515 SGK1 -828148 sc-eQTL 6.26e-01 0.0311 0.0638 0.248 Other_T L1
ENSG00000146409 SLC18B1 676625 sc-eQTL 6.60e-01 0.0419 0.0949 0.248 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000028839 TBPL1 -462206 sc-eQTL 6.33e-01 -0.0521 0.109 0.242 B_Activated L2
ENSG00000079950 STX7 976766 sc-eQTL 7.40e-01 -0.031 0.0933 0.242 B_Activated L2
ENSG00000112303 VNN2 726505 sc-eQTL 6.12e-01 0.0504 0.0992 0.242 B_Activated L2
ENSG00000112306 RPS12 675395 sc-eQTL 8.55e-01 0.00975 0.0532 0.242 B_Activated L2
ENSG00000118515 SGK1 -828148 sc-eQTL 3.31e-01 0.0923 0.0946 0.242 B_Activated L2
ENSG00000146409 SLC18B1 676625 sc-eQTL 2.40e-01 -0.109 0.0928 0.242 B_Activated L2
ENSG00000028839 TBPL1 -462206 sc-eQTL 1.57e-01 0.146 0.103 0.247 B_Intermediate L2
ENSG00000079950 STX7 976766 sc-eQTL 2.63e-02 0.131 0.0587 0.247 B_Intermediate L2
ENSG00000112303 VNN2 726505 sc-eQTL 8.08e-01 -0.0217 0.0895 0.247 B_Intermediate L2
ENSG00000112306 RPS12 675395 sc-eQTL 8.17e-01 -0.0127 0.0548 0.247 B_Intermediate L2
ENSG00000118515 SGK1 -828148 sc-eQTL 6.19e-01 0.0472 0.0947 0.247 B_Intermediate L2
ENSG00000146409 SLC18B1 676625 sc-eQTL 9.33e-01 0.00833 0.0987 0.247 B_Intermediate L2
ENSG00000028839 TBPL1 -462206 sc-eQTL 7.36e-01 -0.0331 0.0983 0.248 B_Memory L2
ENSG00000079950 STX7 976766 sc-eQTL 2.02e-02 0.164 0.0702 0.248 B_Memory L2
ENSG00000112303 VNN2 726505 sc-eQTL 1.42e-01 0.137 0.0926 0.248 B_Memory L2
ENSG00000112306 RPS12 675395 sc-eQTL 6.91e-01 0.0179 0.0448 0.248 B_Memory L2
ENSG00000118515 SGK1 -828148 sc-eQTL 5.33e-04 0.281 0.0799 0.248 B_Memory L2
ENSG00000146409 SLC18B1 676625 sc-eQTL 6.94e-01 0.0369 0.0935 0.248 B_Memory L2
ENSG00000028839 TBPL1 -462206 sc-eQTL 3.99e-01 0.079 0.0936 0.248 B_Naive1 L2
ENSG00000079950 STX7 976766 sc-eQTL 3.18e-01 0.045 0.0449 0.248 B_Naive1 L2
ENSG00000112303 VNN2 726505 sc-eQTL 2.24e-01 -0.106 0.0872 0.248 B_Naive1 L2
ENSG00000112306 RPS12 675395 sc-eQTL 6.82e-01 0.0204 0.0498 0.248 B_Naive1 L2
ENSG00000118515 SGK1 -828148 sc-eQTL 1.19e-01 0.121 0.0775 0.248 B_Naive1 L2
ENSG00000146409 SLC18B1 676625 sc-eQTL 8.46e-01 0.0187 0.0961 0.248 B_Naive1 L2
ENSG00000028839 TBPL1 -462206 sc-eQTL 2.38e-01 0.117 0.0991 0.247 B_Naive2 L2
ENSG00000079950 STX7 976766 sc-eQTL 8.53e-01 0.00979 0.0528 0.247 B_Naive2 L2
ENSG00000112303 VNN2 726505 sc-eQTL 7.24e-01 0.0343 0.097 0.247 B_Naive2 L2
ENSG00000112306 RPS12 675395 sc-eQTL 5.96e-01 0.0272 0.0513 0.247 B_Naive2 L2
ENSG00000118515 SGK1 -828148 sc-eQTL 7.97e-01 0.0233 0.0908 0.247 B_Naive2 L2
ENSG00000146409 SLC18B1 676625 sc-eQTL 1.64e-01 0.136 0.0975 0.247 B_Naive2 L2
ENSG00000028839 TBPL1 -462206 sc-eQTL 2.71e-01 0.11 0.0993 0.25 CD4_CTL L2
ENSG00000079950 STX7 976766 sc-eQTL 2.31e-01 0.118 0.0986 0.25 CD4_CTL L2
ENSG00000112303 VNN2 726505 sc-eQTL 5.77e-01 -0.0557 0.0998 0.25 CD4_CTL L2
ENSG00000112306 RPS12 675395 sc-eQTL 3.85e-01 -0.0401 0.046 0.25 CD4_CTL L2
ENSG00000118515 SGK1 -828148 sc-eQTL 1.75e-01 0.108 0.0796 0.25 CD4_CTL L2
ENSG00000146409 SLC18B1 676625 sc-eQTL 5.91e-01 0.0501 0.0929 0.25 CD4_CTL L2
ENSG00000028839 TBPL1 -462206 sc-eQTL 7.98e-01 -0.0204 0.0796 0.248 CD4_Naive L2
ENSG00000079950 STX7 976766 sc-eQTL 7.97e-02 0.136 0.0775 0.248 CD4_Naive L2
ENSG00000112303 VNN2 726505 sc-eQTL 7.08e-01 0.0271 0.0723 0.248 CD4_Naive L2
ENSG00000112306 RPS12 675395 sc-eQTL 7.86e-01 -0.0127 0.0469 0.248 CD4_Naive L2
ENSG00000118515 SGK1 -828148 sc-eQTL 6.53e-01 0.0259 0.0574 0.248 CD4_Naive L2
ENSG00000146409 SLC18B1 676625 sc-eQTL 1.07e-02 0.229 0.0889 0.248 CD4_Naive L2
ENSG00000028839 TBPL1 -462206 sc-eQTL 4.30e-01 -0.0678 0.0858 0.248 CD4_TCM L2
ENSG00000079950 STX7 976766 sc-eQTL 2.07e-01 0.109 0.0862 0.248 CD4_TCM L2
ENSG00000112303 VNN2 726505 sc-eQTL 1.79e-01 -0.115 0.085 0.248 CD4_TCM L2
ENSG00000112306 RPS12 675395 sc-eQTL 7.79e-02 -0.0778 0.0439 0.248 CD4_TCM L2
ENSG00000118515 SGK1 -828148 sc-eQTL 7.01e-01 -0.0238 0.0619 0.248 CD4_TCM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 676625 sc-eQTL 3.94e-01 0.0873 0.102 0.248 CD4_TCM L2
ENSG00000028839 TBPL1 -462206 sc-eQTL 1.05e-01 0.16 0.0984 0.248 CD4_TEM L2
ENSG00000079950 STX7 976766 sc-eQTL 1.15e-01 0.156 0.0985 0.248 CD4_TEM L2
ENSG00000112303 VNN2 726505 sc-eQTL 2.66e-01 0.106 0.0948 0.248 CD4_TEM L2
ENSG00000112306 RPS12 675395 sc-eQTL 1.51e-01 -0.0559 0.0388 0.248 CD4_TEM L2
ENSG00000118515 SGK1 -828148 sc-eQTL 7.51e-01 0.0213 0.067 0.248 CD4_TEM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 676625 sc-eQTL 4.66e-01 0.0707 0.0968 0.248 CD4_TEM L2
ENSG00000028839 TBPL1 -462206 sc-eQTL 2.72e-01 0.0965 0.0876 0.248 CD8_CTL L2
ENSG00000079950 STX7 976766 sc-eQTL 7.15e-01 -0.03 0.0821 0.248 CD8_CTL L2
ENSG00000112303 VNN2 726505 sc-eQTL 9.22e-01 -0.00917 0.0933 0.248 CD8_CTL L2
ENSG00000112306 RPS12 675395 sc-eQTL 1.39e-01 -0.0738 0.0497 0.248 CD8_CTL L2
ENSG00000118515 SGK1 -828148 sc-eQTL 6.45e-01 0.0389 0.0843 0.248 CD8_CTL L2
ENSG00000146409 SLC18B1 676625 sc-eQTL 8.29e-01 0.0209 0.0968 0.248 CD8_CTL L2
ENSG00000028839 TBPL1 -462206 sc-eQTL 5.35e-01 0.058 0.0933 0.248 CD8_Naive L2
ENSG00000079950 STX7 976766 sc-eQTL 6.14e-01 0.0502 0.0994 0.248 CD8_Naive L2
ENSG00000112303 VNN2 726505 sc-eQTL 3.11e-01 -0.087 0.0856 0.248 CD8_Naive L2
ENSG00000112306 RPS12 675395 sc-eQTL 4.55e-01 -0.0367 0.0491 0.248 CD8_Naive L2
ENSG00000118515 SGK1 -828148 sc-eQTL 8.65e-02 -0.105 0.0612 0.248 CD8_Naive L2
ENSG00000146409 SLC18B1 676625 sc-eQTL 7.70e-01 0.0289 0.0986 0.248 CD8_Naive L2
ENSG00000028839 TBPL1 -462206 sc-eQTL 6.20e-01 -0.0517 0.104 0.252 CD8_TCM L2
ENSG00000079950 STX7 976766 sc-eQTL 2.43e-01 0.112 0.096 0.252 CD8_TCM L2
ENSG00000112303 VNN2 726505 sc-eQTL 7.18e-01 0.0345 0.0955 0.252 CD8_TCM L2
ENSG00000112306 RPS12 675395 sc-eQTL 2.07e-01 -0.0587 0.0464 0.252 CD8_TCM L2
ENSG00000118515 SGK1 -828148 sc-eQTL 6.60e-02 0.141 0.0765 0.252 CD8_TCM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 676625 sc-eQTL 2.17e-01 0.126 0.102 0.252 CD8_TCM L2
ENSG00000028839 TBPL1 -462206 sc-eQTL 1.65e-01 -0.135 0.0967 0.249 CD8_TEM L2
ENSG00000079950 STX7 976766 sc-eQTL 1.93e-01 -0.138 0.106 0.249 CD8_TEM L2
ENSG00000112303 VNN2 726505 sc-eQTL 2.31e-01 0.126 0.105 0.249 CD8_TEM L2
ENSG00000112306 RPS12 675395 sc-eQTL 8.49e-01 0.0108 0.0567 0.249 CD8_TEM L2
ENSG00000118515 SGK1 -828148 sc-eQTL 8.90e-01 -0.0128 0.0929 0.249 CD8_TEM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 676625 sc-eQTL 4.05e-01 0.0893 0.107 0.249 CD8_TEM L2
ENSG00000028839 TBPL1 -462206 sc-eQTL 4.20e-01 -0.0798 0.0987 0.251 MAIT L2
ENSG00000079950 STX7 976766 sc-eQTL 6.82e-02 0.171 0.0932 0.251 MAIT L2
ENSG00000112303 VNN2 726505 sc-eQTL 6.82e-01 0.0392 0.0955 0.251 MAIT L2
ENSG00000112306 RPS12 675395 sc-eQTL 5.62e-03 -0.129 0.0461 0.251 MAIT L2
ENSG00000118515 SGK1 -828148 sc-eQTL 7.30e-01 -0.0229 0.0661 0.251 MAIT L2
ENSG00000146409 SLC18B1 676625 sc-eQTL 4.60e-01 0.0728 0.0984 0.251 MAIT L2
ENSG00000028839 TBPL1 -462206 sc-eQTL 9.91e-01 0.00119 0.109 0.244 NK_CD56bright L2
ENSG00000079950 STX7 976766 sc-eQTL 7.75e-01 0.0289 0.101 0.244 NK_CD56bright L2
ENSG00000112303 VNN2 726505 sc-eQTL 9.56e-01 0.00573 0.103 0.244 NK_CD56bright L2
ENSG00000112306 RPS12 675395 sc-eQTL 6.17e-02 -0.106 0.0567 0.244 NK_CD56bright L2
ENSG00000118515 SGK1 -828148 sc-eQTL 7.35e-01 0.029 0.0854 0.244 NK_CD56bright L2
ENSG00000028839 TBPL1 -462206 sc-eQTL 5.10e-01 0.0566 0.0858 0.25 NK_CD56dim L2
ENSG00000079950 STX7 976766 sc-eQTL 8.88e-01 -0.0111 0.0786 0.25 NK_CD56dim L2
ENSG00000112303 VNN2 726505 sc-eQTL 3.11e-02 -0.211 0.0972 0.25 NK_CD56dim L2
ENSG00000112306 RPS12 675395 sc-eQTL 2.71e-01 -0.0429 0.0389 0.25 NK_CD56dim L2
ENSG00000118515 SGK1 -828148 sc-eQTL 6.56e-01 0.0386 0.0864 0.25 NK_CD56dim L2
ENSG00000028839 TBPL1 -462206 sc-eQTL 7.16e-01 0.0401 0.11 0.247 NK_HLA L2
ENSG00000079950 STX7 976766 sc-eQTL 9.17e-01 0.0105 0.1 0.247 NK_HLA L2
ENSG00000112303 VNN2 726505 sc-eQTL 1.95e-01 -0.131 0.101 0.247 NK_HLA L2
ENSG00000112306 RPS12 675395 sc-eQTL 8.01e-01 0.0119 0.0472 0.247 NK_HLA L2
ENSG00000118515 SGK1 -828148 sc-eQTL 5.86e-01 -0.0508 0.0932 0.247 NK_HLA L2
ENSG00000028839 TBPL1 -462206 sc-eQTL 4.97e-01 0.0608 0.0893 0.25 NK_cytokine L2
ENSG00000079950 STX7 976766 sc-eQTL 2.38e-01 0.102 0.0863 0.25 NK_cytokine L2
ENSG00000112303 VNN2 726505 sc-eQTL 3.64e-01 0.0884 0.0972 0.25 NK_cytokine L2
ENSG00000112306 RPS12 675395 sc-eQTL 8.66e-01 -0.00891 0.0528 0.25 NK_cytokine L2
ENSG00000118515 SGK1 -828148 sc-eQTL 5.13e-02 -0.171 0.0871 0.25 NK_cytokine L2
ENSG00000028839 TBPL1 -462206 sc-eQTL 6.61e-01 0.0517 0.118 0.244 PB L2
ENSG00000079950 STX7 976766 sc-eQTL 7.28e-01 -0.0291 0.0838 0.244 PB L2
ENSG00000112303 VNN2 726505 sc-eQTL 7.30e-01 -0.0354 0.102 0.244 PB L2
ENSG00000112306 RPS12 675395 sc-eQTL 1.27e-01 -0.0885 0.0575 0.244 PB L2
ENSG00000118515 SGK1 -828148 sc-eQTL 3.41e-01 0.0894 0.0935 0.244 PB L2
ENSG00000146409 SLC18B1 676625 sc-eQTL 4.46e-01 0.083 0.109 0.244 PB L2
ENSG00000028839 TBPL1 -462206 sc-eQTL 4.80e-01 -0.0709 0.1 0.246 Pro_T L2
ENSG00000079950 STX7 976766 sc-eQTL 7.10e-02 0.161 0.0889 0.246 Pro_T L2
ENSG00000112303 VNN2 726505 sc-eQTL 3.99e-01 -0.0812 0.096 0.246 Pro_T L2
ENSG00000112306 RPS12 675395 sc-eQTL 1.94e-01 -0.0472 0.0362 0.246 Pro_T L2
ENSG00000118515 SGK1 -828148 sc-eQTL 4.78e-01 0.0518 0.0728 0.246 Pro_T L2
ENSG00000146409 SLC18B1 676625 sc-eQTL 9.64e-01 0.00424 0.0941 0.246 Pro_T L2
ENSG00000028839 TBPL1 -462206 sc-eQTL 7.41e-01 0.0338 0.102 0.248 Treg L2
ENSG00000079950 STX7 976766 sc-eQTL 3.07e-02 0.207 0.0952 0.248 Treg L2
ENSG00000112303 VNN2 726505 sc-eQTL 9.75e-01 0.00257 0.081 0.248 Treg L2
ENSG00000112306 RPS12 675395 sc-eQTL 9.36e-01 -0.00286 0.0358 0.248 Treg L2
ENSG00000118515 SGK1 -828148 sc-eQTL 3.27e-01 -0.074 0.0753 0.248 Treg L2
ENSG00000146409 SLC18B1 676625 sc-eQTL 8.70e-01 0.0166 0.101 0.248 Treg L2
ENSG00000028839 TBPL1 -462206 sc-eQTL 8.66e-01 0.0176 0.104 0.268 cDC L2
ENSG00000079950 STX7 976766 sc-eQTL 9.86e-01 0.00139 0.0818 0.268 cDC L2
ENSG00000093134 VNN3 755199 sc-eQTL 6.94e-01 -0.032 0.0812 0.268 cDC L2
ENSG00000112299 VNN1 775909 sc-eQTL 1.96e-01 0.123 0.095 0.268 cDC L2
ENSG00000112303 VNN2 726505 sc-eQTL 5.78e-01 -0.0518 0.0929 0.268 cDC L2
ENSG00000112306 RPS12 675395 sc-eQTL 4.05e-01 -0.0382 0.0458 0.268 cDC L2
ENSG00000118515 SGK1 -828148 sc-eQTL 1.30e-01 0.117 0.0769 0.268 cDC L2
ENSG00000146409 SLC18B1 676625 sc-eQTL 2.06e-01 0.115 0.0905 0.268 cDC L2
ENSG00000286438 AL591115.1 386836 sc-eQTL 5.34e-01 0.0452 0.0726 0.268 cDC L2
ENSG00000286887 AL355881.1 -806337 sc-eQTL 2.82e-02 0.195 0.0883 0.268 cDC L2
ENSG00000028839 TBPL1 -462206 sc-eQTL 4.90e-01 0.0574 0.083 0.248 cMono_IL1B L2
ENSG00000079950 STX7 976766 sc-eQTL 5.78e-01 -0.0351 0.063 0.248 cMono_IL1B L2
ENSG00000093134 VNN3 755199 sc-eQTL 4.41e-01 0.0688 0.089 0.248 cMono_IL1B L2
ENSG00000112299 VNN1 775909 sc-eQTL 2.80e-01 0.0971 0.0897 0.248 cMono_IL1B L2
ENSG00000112303 VNN2 726505 sc-eQTL 2.46e-01 -0.0833 0.0717 0.248 cMono_IL1B L2
ENSG00000112306 RPS12 675395 sc-eQTL 5.71e-01 0.0226 0.0399 0.248 cMono_IL1B L2
ENSG00000118515 SGK1 -828148 sc-eQTL 8.86e-01 0.00854 0.0595 0.248 cMono_IL1B L2
ENSG00000146409 SLC18B1 676625 sc-eQTL 8.02e-01 0.0194 0.077 0.248 cMono_IL1B L2
ENSG00000286887 AL355881.1 -806337 sc-eQTL 9.65e-02 0.133 0.0797 0.248 cMono_IL1B L2
ENSG00000028839 TBPL1 -462206 sc-eQTL 6.00e-01 0.0492 0.0936 0.248 cMono_S100A L2
ENSG00000079950 STX7 976766 sc-eQTL 2.51e-01 0.0776 0.0675 0.248 cMono_S100A L2
ENSG00000093134 VNN3 755199 sc-eQTL 8.89e-01 0.0119 0.0845 0.248 cMono_S100A L2
ENSG00000112299 VNN1 775909 sc-eQTL 3.13e-01 0.0926 0.0915 0.248 cMono_S100A L2
ENSG00000112303 VNN2 726505 sc-eQTL 4.07e-01 -0.0498 0.06 0.248 cMono_S100A L2
ENSG00000112306 RPS12 675395 sc-eQTL 4.92e-01 0.0297 0.0432 0.248 cMono_S100A L2
ENSG00000118515 SGK1 -828148 sc-eQTL 6.43e-01 0.0229 0.0495 0.248 cMono_S100A L2
ENSG00000146409 SLC18B1 676625 sc-eQTL 9.06e-02 -0.135 0.0796 0.248 cMono_S100A L2
ENSG00000286887 AL355881.1 -806337 sc-eQTL 8.66e-01 -0.0132 0.0783 0.248 cMono_S100A L2
ENSG00000028839 TBPL1 -462206 sc-eQTL 2.95e-01 0.132 0.125 0.255 gdT L2
ENSG00000079950 STX7 976766 sc-eQTL 4.24e-01 -0.0867 0.108 0.255 gdT L2
ENSG00000112303 VNN2 726505 sc-eQTL 3.88e-02 -0.246 0.118 0.255 gdT L2
ENSG00000112306 RPS12 675395 sc-eQTL 3.28e-01 -0.0446 0.0455 0.255 gdT L2
ENSG00000118515 SGK1 -828148 sc-eQTL 4.91e-01 0.0594 0.086 0.255 gdT L2
ENSG00000146409 SLC18B1 676625 sc-eQTL 2.64e-01 -0.132 0.117 0.255 gdT L2
ENSG00000028839 TBPL1 -462206 sc-eQTL 4.31e-02 0.193 0.0948 0.253 intMono L2
ENSG00000079950 STX7 976766 sc-eQTL 9.33e-01 0.00771 0.0915 0.253 intMono L2
ENSG00000093134 VNN3 755199 sc-eQTL 9.88e-01 0.00134 0.0923 0.253 intMono L2
ENSG00000112299 VNN1 775909 sc-eQTL 5.82e-01 0.0502 0.0912 0.253 intMono L2
ENSG00000112303 VNN2 726505 sc-eQTL 2.71e-01 0.102 0.0925 0.253 intMono L2
ENSG00000112306 RPS12 675395 sc-eQTL 3.23e-01 -0.0399 0.0403 0.253 intMono L2
ENSG00000118515 SGK1 -828148 sc-eQTL 8.13e-01 0.0161 0.0678 0.253 intMono L2
ENSG00000146409 SLC18B1 676625 sc-eQTL 4.73e-01 0.0706 0.0981 0.253 intMono L2
ENSG00000286887 AL355881.1 -806337 sc-eQTL 2.07e-01 0.118 0.0936 0.253 intMono L2
ENSG00000028839 TBPL1 -462206 sc-eQTL 6.00e-01 0.0529 0.101 0.247 ncMono L2
ENSG00000079950 STX7 976766 sc-eQTL 9.40e-01 0.00517 0.0682 0.247 ncMono L2
ENSG00000093134 VNN3 755199 sc-eQTL 7.41e-01 0.0319 0.0962 0.247 ncMono L2
ENSG00000112299 VNN1 775909 sc-eQTL 7.60e-01 0.0292 0.0955 0.247 ncMono L2
ENSG00000112303 VNN2 726505 sc-eQTL 6.30e-01 0.0442 0.0918 0.247 ncMono L2
ENSG00000112306 RPS12 675395 sc-eQTL 9.24e-01 0.00439 0.0461 0.247 ncMono L2
ENSG00000118515 SGK1 -828148 sc-eQTL 7.43e-02 0.116 0.0646 0.247 ncMono L2
ENSG00000146409 SLC18B1 676625 sc-eQTL 3.15e-01 0.0817 0.0812 0.247 ncMono L2
ENSG00000286887 AL355881.1 -806337 sc-eQTL 3.75e-01 0.0763 0.0859 0.247 ncMono L2
ENSG00000028839 TBPL1 -462206 sc-eQTL 9.12e-01 0.0129 0.117 0.254 pDC L2
ENSG00000079950 STX7 976766 sc-eQTL 5.55e-01 -0.046 0.0777 0.254 pDC L2
ENSG00000093134 VNN3 755199 sc-eQTL 2.20e-01 -0.0959 0.0779 0.254 pDC L2
ENSG00000112299 VNN1 775909 sc-eQTL 6.07e-01 0.041 0.0796 0.254 pDC L2
ENSG00000112303 VNN2 726505 sc-eQTL 5.87e-01 -0.0516 0.0947 0.254 pDC L2
ENSG00000112306 RPS12 675395 sc-eQTL 8.33e-01 0.0138 0.0653 0.254 pDC L2
ENSG00000118515 SGK1 -828148 sc-eQTL 7.66e-01 0.0198 0.0664 0.254 pDC L2
ENSG00000146409 SLC18B1 676625 sc-eQTL 3.67e-01 -0.0873 0.0964 0.254 pDC L2
ENSG00000286438 AL591115.1 386836 sc-eQTL 1.36e-01 0.138 0.0918 0.254 pDC L2
ENSG00000286887 AL355881.1 -806337 sc-eQTL 8.96e-01 0.0108 0.082 0.254 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000028839 TBPL1 -462206 sc-eQTL 1.12e-01 0.158 0.0991 0.248 B_Memory LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 976766 sc-eQTL 4.64e-02 0.109 0.0544 0.248 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 726505 sc-eQTL 2.10e-01 0.109 0.0865 0.248 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 675395 sc-eQTL 9.23e-01 0.00482 0.0495 0.248 B_Memory LOneK1K
ENSG00000118515 SGK1 -828148 sc-eQTL 1.19e-01 0.12 0.0769 0.248 B_Memory LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 676625 sc-eQTL 9.74e-01 0.00295 0.0908 0.248 B_Memory LOneK1K
ENSG00000028839 TBPL1 -462206 sc-eQTL 8.63e-02 0.16 0.0928 0.248 B_Naive LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 976766 sc-eQTL 3.77e-01 0.0372 0.042 0.248 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 726505 sc-eQTL 4.63e-01 -0.06 0.0816 0.248 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 675395 sc-eQTL 4.76e-01 0.0353 0.0494 0.248 B_Naive LOneK1K
ENSG00000118515 SGK1 -828148 sc-eQTL 1.53e-01 0.109 0.0762 0.248 B_Naive LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 676625 sc-eQTL 4.88e-01 0.0648 0.0932 0.248 B_Naive LOneK1K
ENSG00000028839 TBPL1 -462206 sc-eQTL 4.89e-01 0.0525 0.0758 0.248 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 976766 sc-eQTL 8.13e-01 0.0125 0.0527 0.248 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000093134 VNN3 755199 sc-eQTL 6.38e-01 0.0405 0.0859 0.248 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112299 VNN1 775909 sc-eQTL 2.02e-01 0.114 0.0893 0.248 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 726505 sc-eQTL 2.44e-01 -0.069 0.0591 0.248 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 675395 sc-eQTL 5.25e-01 0.0258 0.0406 0.248 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000118515 SGK1 -828148 sc-eQTL 9.53e-01 0.00328 0.0554 0.248 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 676625 sc-eQTL 4.95e-01 -0.0494 0.0723 0.248 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000286887 AL355881.1 -806337 sc-eQTL 3.04e-01 0.078 0.0757 0.248 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000028839 TBPL1 -462206 sc-eQTL 1.48e-01 0.142 0.0977 0.25 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 976766 sc-eQTL 8.76e-01 0.0101 0.0648 0.25 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000093134 VNN3 755199 sc-eQTL 8.63e-01 0.0164 0.0953 0.25 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112299 VNN1 775909 sc-eQTL 3.12e-01 0.0954 0.0942 0.25 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 726505 sc-eQTL 4.03e-01 0.0745 0.0889 0.25 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 675395 sc-eQTL 8.24e-01 -0.00844 0.0378 0.25 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000118515 SGK1 -828148 sc-eQTL 3.11e-01 0.058 0.0571 0.25 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 676625 sc-eQTL 6.27e-01 0.0447 0.0917 0.25 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000286887 AL355881.1 -806337 sc-eQTL 2.88e-01 0.0881 0.0827 0.25 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000028839 TBPL1 -462206 sc-eQTL 3.56e-01 0.0729 0.0788 0.25 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 976766 sc-eQTL 6.57e-01 0.033 0.0742 0.25 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 726505 sc-eQTL 2.66e-01 -0.105 0.0937 0.25 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 675395 sc-eQTL 3.63e-01 -0.0349 0.0383 0.25 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000118515 SGK1 -828148 sc-eQTL 5.15e-01 -0.0516 0.0791 0.25 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000079950 STX7 976766 pQTL 0.0797 -0.0456 0.026 0.00159 0.0 0.249
ENSG00000079950 STX7 976766 eQTL 0.00622 0.0513 0.0187 0.0 0.0 0.238
ENSG00000112299 VNN1 775909 pQTL 0.0048 0.113 0.0402 0.0 0.0 0.249

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina