logo

Genes within 1Mb (chr6:133489442:T:C):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000028839 TBPL1 -462728 sc-eQTL 2.60e-01 0.104 0.0921 0.252 B L1
ENSG00000079950 STX7 976244 sc-eQTL 2.42e-01 0.0431 0.0367 0.252 B L1
ENSG00000112303 VNN2 725983 sc-eQTL 8.93e-01 -0.00935 0.0692 0.252 B L1
ENSG00000112306 RPS12 674873 sc-eQTL 5.09e-01 0.0276 0.0418 0.252 B L1
ENSG00000118515 SGK1 -828670 sc-eQTL 1.28e-01 0.098 0.0642 0.252 B L1
ENSG00000146409 SLC18B1 676103 sc-eQTL 3.81e-01 0.0771 0.0879 0.252 B L1
ENSG00000028839 TBPL1 -462728 sc-eQTL 3.63e-01 0.0625 0.0686 0.252 CD4T L1
ENSG00000079950 STX7 976244 sc-eQTL 4.92e-02 0.14 0.0708 0.252 CD4T L1
ENSG00000112303 VNN2 725983 sc-eQTL 8.42e-01 -0.0123 0.0618 0.252 CD4T L1
ENSG00000112306 RPS12 674873 sc-eQTL 8.46e-01 -0.00816 0.042 0.252 CD4T L1
ENSG00000118515 SGK1 -828670 sc-eQTL 6.47e-01 -0.0259 0.0565 0.252 CD4T L1
ENSG00000146409 SLC18B1 676103 sc-eQTL 2.99e-02 0.184 0.0841 0.252 CD4T L1
ENSG00000028839 TBPL1 -462728 sc-eQTL 4.10e-01 0.0559 0.0677 0.252 CD8T L1
ENSG00000079950 STX7 976244 sc-eQTL 9.52e-01 0.00424 0.0708 0.252 CD8T L1
ENSG00000112303 VNN2 725983 sc-eQTL 5.22e-01 -0.053 0.0826 0.252 CD8T L1
ENSG00000112306 RPS12 674873 sc-eQTL 2.63e-01 -0.0316 0.0282 0.252 CD8T L1
ENSG00000118515 SGK1 -828670 sc-eQTL 1.94e-01 -0.0565 0.0434 0.252 CD8T L1
ENSG00000146409 SLC18B1 676103 sc-eQTL 3.07e-01 0.0873 0.0852 0.252 CD8T L1
ENSG00000028839 TBPL1 -462728 sc-eQTL 9.81e-01 -0.00259 0.106 0.259 DC L1
ENSG00000079950 STX7 976244 sc-eQTL 6.85e-01 -0.0268 0.066 0.259 DC L1
ENSG00000093134 VNN3 754677 sc-eQTL 5.60e-01 -0.0478 0.0818 0.259 DC L1
ENSG00000112299 VNN1 775387 sc-eQTL 1.27e-01 0.135 0.0879 0.259 DC L1
ENSG00000112303 VNN2 725983 sc-eQTL 8.19e-01 -0.0217 0.0946 0.259 DC L1
ENSG00000112306 RPS12 674873 sc-eQTL 3.24e-01 -0.0523 0.0529 0.259 DC L1
ENSG00000118515 SGK1 -828670 sc-eQTL 3.85e-01 0.0535 0.0614 0.259 DC L1
ENSG00000146409 SLC18B1 676103 sc-eQTL 6.22e-01 0.0414 0.0839 0.259 DC L1
ENSG00000286438 AL591115.1 386314 sc-eQTL 1.10e-01 0.122 0.0759 0.259 DC L1
ENSG00000286887 AL355881.1 -806859 sc-eQTL 2.40e-01 0.112 0.0949 0.259 DC L1
ENSG00000028839 TBPL1 -462728 sc-eQTL 2.10e-01 0.0918 0.0731 0.252 Mono L1
ENSG00000079950 STX7 976244 sc-eQTL 4.61e-01 0.0362 0.049 0.252 Mono L1
ENSG00000093134 VNN3 754677 sc-eQTL 7.08e-01 0.0316 0.0842 0.252 Mono L1
ENSG00000112299 VNN1 775387 sc-eQTL 2.93e-01 0.0954 0.0904 0.252 Mono L1
ENSG00000112303 VNN2 725983 sc-eQTL 1.87e-01 -0.0843 0.0637 0.252 Mono L1
ENSG00000112306 RPS12 674873 sc-eQTL 8.33e-01 0.00807 0.0383 0.252 Mono L1
ENSG00000118515 SGK1 -828670 sc-eQTL 9.90e-01 -0.000708 0.0541 0.252 Mono L1
ENSG00000146409 SLC18B1 676103 sc-eQTL 4.97e-01 -0.0516 0.0757 0.252 Mono L1
ENSG00000286887 AL355881.1 -806859 sc-eQTL 3.83e-01 0.065 0.0744 0.252 Mono L1
ENSG00000028839 TBPL1 -462728 sc-eQTL 4.06e-01 0.0664 0.0797 0.253 NK L1
ENSG00000079950 STX7 976244 sc-eQTL 7.36e-01 0.0249 0.0738 0.253 NK L1
ENSG00000112303 VNN2 725983 sc-eQTL 4.79e-01 -0.065 0.0917 0.253 NK L1
ENSG00000112306 RPS12 674873 sc-eQTL 7.40e-01 -0.0126 0.038 0.253 NK L1
ENSG00000118515 SGK1 -828670 sc-eQTL 3.09e-01 -0.0716 0.0701 0.253 NK L1
ENSG00000028839 TBPL1 -462728 sc-eQTL 5.57e-01 -0.0541 0.0918 0.252 Other_T L1
ENSG00000079950 STX7 976244 sc-eQTL 2.28e-01 0.0872 0.0721 0.252 Other_T L1
ENSG00000112303 VNN2 725983 sc-eQTL 2.11e-01 -0.109 0.0871 0.252 Other_T L1
ENSG00000112306 RPS12 674873 sc-eQTL 1.25e-01 -0.0531 0.0345 0.252 Other_T L1
ENSG00000118515 SGK1 -828670 sc-eQTL 5.93e-01 0.0342 0.0638 0.252 Other_T L1
ENSG00000146409 SLC18B1 676103 sc-eQTL 5.97e-01 0.0502 0.0949 0.252 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000028839 TBPL1 -462728 sc-eQTL 6.31e-01 -0.0525 0.109 0.245 B_Activated L2
ENSG00000079950 STX7 976244 sc-eQTL 8.12e-01 -0.0222 0.0934 0.245 B_Activated L2
ENSG00000112303 VNN2 725983 sc-eQTL 6.50e-01 0.0451 0.0994 0.245 B_Activated L2
ENSG00000112306 RPS12 674873 sc-eQTL 8.42e-01 0.0107 0.0533 0.245 B_Activated L2
ENSG00000118515 SGK1 -828670 sc-eQTL 3.62e-01 0.0866 0.0948 0.245 B_Activated L2
ENSG00000146409 SLC18B1 676103 sc-eQTL 2.65e-01 -0.104 0.093 0.245 B_Activated L2
ENSG00000028839 TBPL1 -462728 sc-eQTL 1.37e-01 0.154 0.103 0.251 B_Intermediate L2
ENSG00000079950 STX7 976244 sc-eQTL 2.21e-02 0.135 0.0587 0.251 B_Intermediate L2
ENSG00000112303 VNN2 725983 sc-eQTL 8.96e-01 -0.0117 0.0895 0.251 B_Intermediate L2
ENSG00000112306 RPS12 674873 sc-eQTL 9.13e-01 -0.00601 0.0548 0.251 B_Intermediate L2
ENSG00000118515 SGK1 -828670 sc-eQTL 6.37e-01 0.0447 0.0947 0.251 B_Intermediate L2
ENSG00000146409 SLC18B1 676103 sc-eQTL 9.57e-01 0.00532 0.0987 0.251 B_Intermediate L2
ENSG00000028839 TBPL1 -462728 sc-eQTL 6.04e-01 -0.051 0.0982 0.252 B_Memory L2
ENSG00000079950 STX7 976244 sc-eQTL 2.48e-02 0.159 0.0702 0.252 B_Memory L2
ENSG00000112303 VNN2 725983 sc-eQTL 7.50e-02 0.165 0.0923 0.252 B_Memory L2
ENSG00000112306 RPS12 674873 sc-eQTL 5.10e-01 0.0295 0.0448 0.252 B_Memory L2
ENSG00000118515 SGK1 -828670 sc-eQTL 5.17e-04 0.282 0.0799 0.252 B_Memory L2
ENSG00000146409 SLC18B1 676103 sc-eQTL 8.26e-01 0.0206 0.0935 0.252 B_Memory L2
ENSG00000028839 TBPL1 -462728 sc-eQTL 5.59e-01 0.0545 0.0931 0.252 B_Naive1 L2
ENSG00000079950 STX7 976244 sc-eQTL 2.79e-01 0.0485 0.0447 0.252 B_Naive1 L2
ENSG00000112303 VNN2 725983 sc-eQTL 1.88e-01 -0.115 0.0866 0.252 B_Naive1 L2
ENSG00000112306 RPS12 674873 sc-eQTL 5.34e-01 0.0308 0.0495 0.252 B_Naive1 L2
ENSG00000118515 SGK1 -828670 sc-eQTL 1.08e-01 0.124 0.077 0.252 B_Naive1 L2
ENSG00000146409 SLC18B1 676103 sc-eQTL 9.53e-01 0.00564 0.0956 0.252 B_Naive1 L2
ENSG00000028839 TBPL1 -462728 sc-eQTL 3.30e-01 0.0967 0.0991 0.251 B_Naive2 L2
ENSG00000079950 STX7 976244 sc-eQTL 8.61e-01 0.00922 0.0527 0.251 B_Naive2 L2
ENSG00000112303 VNN2 725983 sc-eQTL 6.23e-01 0.0476 0.0968 0.251 B_Naive2 L2
ENSG00000112306 RPS12 674873 sc-eQTL 4.83e-01 0.036 0.0512 0.251 B_Naive2 L2
ENSG00000118515 SGK1 -828670 sc-eQTL 9.54e-01 0.00528 0.0906 0.251 B_Naive2 L2
ENSG00000146409 SLC18B1 676103 sc-eQTL 1.65e-01 0.136 0.0974 0.251 B_Naive2 L2
ENSG00000028839 TBPL1 -462728 sc-eQTL 2.52e-01 0.114 0.0992 0.255 CD4_CTL L2
ENSG00000079950 STX7 976244 sc-eQTL 2.08e-01 0.124 0.0984 0.255 CD4_CTL L2
ENSG00000112303 VNN2 725983 sc-eQTL 5.73e-01 -0.0563 0.0996 0.255 CD4_CTL L2
ENSG00000112306 RPS12 674873 sc-eQTL 5.59e-01 -0.0269 0.046 0.255 CD4_CTL L2
ENSG00000118515 SGK1 -828670 sc-eQTL 2.52e-01 0.0914 0.0796 0.255 CD4_CTL L2
ENSG00000146409 SLC18B1 676103 sc-eQTL 6.35e-01 0.0442 0.0928 0.255 CD4_CTL L2
ENSG00000028839 TBPL1 -462728 sc-eQTL 9.70e-01 -0.00296 0.0791 0.252 CD4_Naive L2
ENSG00000079950 STX7 976244 sc-eQTL 1.69e-01 0.107 0.0772 0.252 CD4_Naive L2
ENSG00000112303 VNN2 725983 sc-eQTL 6.92e-01 0.0285 0.0718 0.252 CD4_Naive L2
ENSG00000112306 RPS12 674873 sc-eQTL 8.90e-01 -0.00645 0.0466 0.252 CD4_Naive L2
ENSG00000118515 SGK1 -828670 sc-eQTL 6.23e-01 0.0281 0.057 0.252 CD4_Naive L2
ENSG00000146409 SLC18B1 676103 sc-eQTL 1.66e-02 0.214 0.0885 0.252 CD4_Naive L2
ENSG00000028839 TBPL1 -462728 sc-eQTL 4.74e-01 -0.0614 0.0856 0.252 CD4_TCM L2
ENSG00000079950 STX7 976244 sc-eQTL 2.77e-01 0.0938 0.0861 0.252 CD4_TCM L2
ENSG00000112303 VNN2 725983 sc-eQTL 2.86e-01 -0.0908 0.0848 0.252 CD4_TCM L2
ENSG00000112306 RPS12 674873 sc-eQTL 9.22e-02 -0.0741 0.0438 0.252 CD4_TCM L2
ENSG00000118515 SGK1 -828670 sc-eQTL 6.95e-01 -0.0242 0.0617 0.252 CD4_TCM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 676103 sc-eQTL 3.00e-01 0.106 0.102 0.252 CD4_TCM L2
ENSG00000028839 TBPL1 -462728 sc-eQTL 1.32e-01 0.148 0.098 0.252 CD4_TEM L2
ENSG00000079950 STX7 976244 sc-eQTL 1.26e-01 0.151 0.0981 0.252 CD4_TEM L2
ENSG00000112303 VNN2 725983 sc-eQTL 3.24e-01 0.0935 0.0945 0.252 CD4_TEM L2
ENSG00000112306 RPS12 674873 sc-eQTL 2.41e-01 -0.0455 0.0387 0.252 CD4_TEM L2
ENSG00000118515 SGK1 -828670 sc-eQTL 8.25e-01 0.0148 0.0667 0.252 CD4_TEM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 676103 sc-eQTL 6.05e-01 0.0499 0.0965 0.252 CD4_TEM L2
ENSG00000028839 TBPL1 -462728 sc-eQTL 1.72e-01 0.119 0.0872 0.252 CD8_CTL L2
ENSG00000079950 STX7 976244 sc-eQTL 7.12e-01 -0.0303 0.0819 0.252 CD8_CTL L2
ENSG00000112303 VNN2 725983 sc-eQTL 9.28e-01 -0.00841 0.0931 0.252 CD8_CTL L2
ENSG00000112306 RPS12 674873 sc-eQTL 1.75e-01 -0.0674 0.0496 0.252 CD8_CTL L2
ENSG00000118515 SGK1 -828670 sc-eQTL 6.39e-01 0.0395 0.0841 0.252 CD8_CTL L2
ENSG00000146409 SLC18B1 676103 sc-eQTL 6.97e-01 0.0376 0.0965 0.252 CD8_CTL L2
ENSG00000028839 TBPL1 -462728 sc-eQTL 5.08e-01 0.0617 0.0931 0.252 CD8_Naive L2
ENSG00000079950 STX7 976244 sc-eQTL 6.52e-01 0.0448 0.0992 0.252 CD8_Naive L2
ENSG00000112303 VNN2 725983 sc-eQTL 2.34e-01 -0.102 0.0854 0.252 CD8_Naive L2
ENSG00000112306 RPS12 674873 sc-eQTL 5.43e-01 -0.0299 0.049 0.252 CD8_Naive L2
ENSG00000118515 SGK1 -828670 sc-eQTL 8.98e-02 -0.104 0.0611 0.252 CD8_Naive L2
ENSG00000146409 SLC18B1 676103 sc-eQTL 9.10e-01 0.0112 0.0984 0.252 CD8_Naive L2
ENSG00000028839 TBPL1 -462728 sc-eQTL 7.32e-01 -0.0357 0.104 0.255 CD8_TCM L2
ENSG00000079950 STX7 976244 sc-eQTL 3.14e-01 0.0974 0.0964 0.255 CD8_TCM L2
ENSG00000112303 VNN2 725983 sc-eQTL 6.06e-01 0.0496 0.0959 0.255 CD8_TCM L2
ENSG00000112306 RPS12 674873 sc-eQTL 2.40e-01 -0.0549 0.0466 0.255 CD8_TCM L2
ENSG00000118515 SGK1 -828670 sc-eQTL 6.05e-02 0.145 0.0767 0.255 CD8_TCM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 676103 sc-eQTL 2.35e-01 0.122 0.102 0.255 CD8_TCM L2
ENSG00000028839 TBPL1 -462728 sc-eQTL 2.02e-01 -0.124 0.0968 0.253 CD8_TEM L2
ENSG00000079950 STX7 976244 sc-eQTL 2.10e-01 -0.133 0.106 0.253 CD8_TEM L2
ENSG00000112303 VNN2 725983 sc-eQTL 2.16e-01 0.13 0.105 0.253 CD8_TEM L2
ENSG00000112306 RPS12 674873 sc-eQTL 7.93e-01 0.0149 0.0567 0.253 CD8_TEM L2
ENSG00000118515 SGK1 -828670 sc-eQTL 8.23e-01 -0.0208 0.0929 0.253 CD8_TEM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 676103 sc-eQTL 5.25e-01 0.0682 0.107 0.253 CD8_TEM L2
ENSG00000028839 TBPL1 -462728 sc-eQTL 5.14e-01 -0.0647 0.0989 0.255 MAIT L2
ENSG00000079950 STX7 976244 sc-eQTL 8.74e-02 0.16 0.0934 0.255 MAIT L2
ENSG00000112303 VNN2 725983 sc-eQTL 9.35e-01 0.00784 0.0957 0.255 MAIT L2
ENSG00000112306 RPS12 674873 sc-eQTL 2.18e-02 -0.107 0.0465 0.255 MAIT L2
ENSG00000118515 SGK1 -828670 sc-eQTL 8.30e-01 -0.0143 0.0663 0.255 MAIT L2
ENSG00000146409 SLC18B1 676103 sc-eQTL 4.95e-01 0.0674 0.0986 0.255 MAIT L2
ENSG00000028839 TBPL1 -462728 sc-eQTL 9.62e-01 0.00522 0.108 0.249 NK_CD56bright L2
ENSG00000079950 STX7 976244 sc-eQTL 7.98e-01 0.0258 0.101 0.249 NK_CD56bright L2
ENSG00000112303 VNN2 725983 sc-eQTL 9.12e-01 0.0113 0.102 0.249 NK_CD56bright L2
ENSG00000112306 RPS12 674873 sc-eQTL 1.41e-01 -0.0836 0.0566 0.249 NK_CD56bright L2
ENSG00000118515 SGK1 -828670 sc-eQTL 7.68e-01 0.0251 0.0851 0.249 NK_CD56bright L2
ENSG00000028839 TBPL1 -462728 sc-eQTL 4.59e-01 0.0634 0.0854 0.254 NK_CD56dim L2
ENSG00000079950 STX7 976244 sc-eQTL 9.31e-01 -0.00676 0.0783 0.254 NK_CD56dim L2
ENSG00000112303 VNN2 725983 sc-eQTL 4.17e-02 -0.199 0.097 0.254 NK_CD56dim L2
ENSG00000112306 RPS12 674873 sc-eQTL 5.06e-01 -0.0258 0.0388 0.254 NK_CD56dim L2
ENSG00000118515 SGK1 -828670 sc-eQTL 6.76e-01 0.036 0.0861 0.254 NK_CD56dim L2
ENSG00000028839 TBPL1 -462728 sc-eQTL 7.94e-01 0.0286 0.109 0.251 NK_HLA L2
ENSG00000079950 STX7 976244 sc-eQTL 8.32e-01 0.0212 0.0996 0.251 NK_HLA L2
ENSG00000112303 VNN2 725983 sc-eQTL 2.63e-01 -0.113 0.101 0.251 NK_HLA L2
ENSG00000112306 RPS12 674873 sc-eQTL 5.16e-01 0.0306 0.0469 0.251 NK_HLA L2
ENSG00000118515 SGK1 -828670 sc-eQTL 5.49e-01 -0.0556 0.0928 0.251 NK_HLA L2
ENSG00000028839 TBPL1 -462728 sc-eQTL 6.06e-01 0.0459 0.089 0.254 NK_cytokine L2
ENSG00000079950 STX7 976244 sc-eQTL 2.33e-01 0.103 0.086 0.254 NK_cytokine L2
ENSG00000112303 VNN2 725983 sc-eQTL 2.05e-01 0.123 0.0966 0.254 NK_cytokine L2
ENSG00000112306 RPS12 674873 sc-eQTL 9.34e-01 0.00439 0.0526 0.254 NK_cytokine L2
ENSG00000118515 SGK1 -828670 sc-eQTL 8.08e-02 -0.153 0.0869 0.254 NK_cytokine L2
ENSG00000028839 TBPL1 -462728 sc-eQTL 8.04e-01 0.0297 0.119 0.252 PB L2
ENSG00000079950 STX7 976244 sc-eQTL 6.01e-01 -0.0445 0.0848 0.252 PB L2
ENSG00000112303 VNN2 725983 sc-eQTL 7.58e-01 -0.0321 0.104 0.252 PB L2
ENSG00000112306 RPS12 674873 sc-eQTL 1.70e-01 -0.0807 0.0584 0.252 PB L2
ENSG00000118515 SGK1 -828670 sc-eQTL 3.88e-01 0.0822 0.0949 0.252 PB L2
ENSG00000146409 SLC18B1 676103 sc-eQTL 3.42e-01 0.105 0.11 0.252 PB L2
ENSG00000028839 TBPL1 -462728 sc-eQTL 4.73e-01 -0.0722 0.1 0.25 Pro_T L2
ENSG00000079950 STX7 976244 sc-eQTL 1.04e-01 0.146 0.0892 0.25 Pro_T L2
ENSG00000112303 VNN2 725983 sc-eQTL 5.14e-01 -0.0628 0.0962 0.25 Pro_T L2
ENSG00000112306 RPS12 674873 sc-eQTL 2.33e-01 -0.0434 0.0363 0.25 Pro_T L2
ENSG00000118515 SGK1 -828670 sc-eQTL 4.72e-01 0.0526 0.073 0.25 Pro_T L2
ENSG00000146409 SLC18B1 676103 sc-eQTL 7.96e-01 0.0245 0.0943 0.25 Pro_T L2
ENSG00000028839 TBPL1 -462728 sc-eQTL 6.22e-01 0.0503 0.102 0.252 Treg L2
ENSG00000079950 STX7 976244 sc-eQTL 5.15e-02 0.186 0.0951 0.252 Treg L2
ENSG00000112303 VNN2 725983 sc-eQTL 8.41e-01 0.0163 0.0808 0.252 Treg L2
ENSG00000112306 RPS12 674873 sc-eQTL 9.11e-01 -0.00399 0.0357 0.252 Treg L2
ENSG00000118515 SGK1 -828670 sc-eQTL 2.94e-01 -0.079 0.0751 0.252 Treg L2
ENSG00000146409 SLC18B1 676103 sc-eQTL 9.78e-01 0.00275 0.101 0.252 Treg L2
ENSG00000028839 TBPL1 -462728 sc-eQTL 8.41e-01 0.021 0.104 0.271 cDC L2
ENSG00000079950 STX7 976244 sc-eQTL 9.95e-01 0.000555 0.0818 0.271 cDC L2
ENSG00000093134 VNN3 754677 sc-eQTL 7.52e-01 -0.0257 0.0812 0.271 cDC L2
ENSG00000112299 VNN1 775387 sc-eQTL 2.47e-01 0.111 0.0952 0.271 cDC L2
ENSG00000112303 VNN2 725983 sc-eQTL 5.76e-01 -0.0521 0.093 0.271 cDC L2
ENSG00000112306 RPS12 674873 sc-eQTL 4.22e-01 -0.037 0.0459 0.271 cDC L2
ENSG00000118515 SGK1 -828670 sc-eQTL 1.31e-01 0.117 0.0769 0.271 cDC L2
ENSG00000146409 SLC18B1 676103 sc-eQTL 2.25e-01 0.11 0.0906 0.271 cDC L2
ENSG00000286438 AL591115.1 386314 sc-eQTL 5.11e-01 0.0479 0.0727 0.271 cDC L2
ENSG00000286887 AL355881.1 -806859 sc-eQTL 3.57e-02 0.187 0.0884 0.271 cDC L2
ENSG00000028839 TBPL1 -462728 sc-eQTL 5.28e-01 0.0524 0.0829 0.252 cMono_IL1B L2
ENSG00000079950 STX7 976244 sc-eQTL 5.70e-01 -0.0358 0.0629 0.252 cMono_IL1B L2
ENSG00000093134 VNN3 754677 sc-eQTL 3.93e-01 0.0761 0.0889 0.252 cMono_IL1B L2
ENSG00000112299 VNN1 775387 sc-eQTL 2.42e-01 0.105 0.0895 0.252 cMono_IL1B L2
ENSG00000112303 VNN2 725983 sc-eQTL 1.82e-01 -0.0957 0.0715 0.252 cMono_IL1B L2
ENSG00000112306 RPS12 674873 sc-eQTL 7.13e-01 0.0147 0.0399 0.252 cMono_IL1B L2
ENSG00000118515 SGK1 -828670 sc-eQTL 8.35e-01 0.0124 0.0595 0.252 cMono_IL1B L2
ENSG00000146409 SLC18B1 676103 sc-eQTL 7.21e-01 0.0275 0.0769 0.252 cMono_IL1B L2
ENSG00000286887 AL355881.1 -806859 sc-eQTL 8.19e-02 0.139 0.0796 0.252 cMono_IL1B L2
ENSG00000028839 TBPL1 -462728 sc-eQTL 4.75e-01 0.067 0.0936 0.252 cMono_S100A L2
ENSG00000079950 STX7 976244 sc-eQTL 1.25e-01 0.104 0.0673 0.252 cMono_S100A L2
ENSG00000093134 VNN3 754677 sc-eQTL 7.26e-01 0.0296 0.0845 0.252 cMono_S100A L2
ENSG00000112299 VNN1 775387 sc-eQTL 1.97e-01 0.118 0.0915 0.252 cMono_S100A L2
ENSG00000112303 VNN2 725983 sc-eQTL 3.89e-01 -0.0518 0.06 0.252 cMono_S100A L2
ENSG00000112306 RPS12 674873 sc-eQTL 5.69e-01 0.0247 0.0433 0.252 cMono_S100A L2
ENSG00000118515 SGK1 -828670 sc-eQTL 6.46e-01 0.0228 0.0495 0.252 cMono_S100A L2
ENSG00000146409 SLC18B1 676103 sc-eQTL 6.33e-02 -0.148 0.0795 0.252 cMono_S100A L2
ENSG00000286887 AL355881.1 -806859 sc-eQTL 9.02e-01 -0.00966 0.0784 0.252 cMono_S100A L2
ENSG00000028839 TBPL1 -462728 sc-eQTL 3.14e-01 0.126 0.125 0.258 gdT L2
ENSG00000079950 STX7 976244 sc-eQTL 4.04e-01 -0.0902 0.108 0.258 gdT L2
ENSG00000112303 VNN2 725983 sc-eQTL 2.72e-02 -0.262 0.118 0.258 gdT L2
ENSG00000112306 RPS12 674873 sc-eQTL 3.17e-01 -0.0456 0.0454 0.258 gdT L2
ENSG00000118515 SGK1 -828670 sc-eQTL 5.33e-01 0.0537 0.0858 0.258 gdT L2
ENSG00000146409 SLC18B1 676103 sc-eQTL 2.61e-01 -0.132 0.117 0.258 gdT L2
ENSG00000028839 TBPL1 -462728 sc-eQTL 2.86e-02 0.208 0.0943 0.258 intMono L2
ENSG00000079950 STX7 976244 sc-eQTL 7.63e-01 0.0275 0.0911 0.258 intMono L2
ENSG00000093134 VNN3 754677 sc-eQTL 9.31e-01 0.008 0.092 0.258 intMono L2
ENSG00000112299 VNN1 775387 sc-eQTL 4.45e-01 0.0695 0.0908 0.258 intMono L2
ENSG00000112303 VNN2 725983 sc-eQTL 2.47e-01 0.107 0.0921 0.258 intMono L2
ENSG00000112306 RPS12 674873 sc-eQTL 3.58e-01 -0.037 0.0401 0.258 intMono L2
ENSG00000118515 SGK1 -828670 sc-eQTL 7.18e-01 0.0244 0.0675 0.258 intMono L2
ENSG00000146409 SLC18B1 676103 sc-eQTL 6.21e-01 0.0485 0.0979 0.258 intMono L2
ENSG00000286887 AL355881.1 -806859 sc-eQTL 1.84e-01 0.124 0.0932 0.258 intMono L2
ENSG00000028839 TBPL1 -462728 sc-eQTL 6.20e-01 0.0498 0.1 0.251 ncMono L2
ENSG00000079950 STX7 976244 sc-eQTL 9.74e-01 -0.00221 0.0678 0.251 ncMono L2
ENSG00000093134 VNN3 754677 sc-eQTL 8.72e-01 0.0154 0.0957 0.251 ncMono L2
ENSG00000112299 VNN1 775387 sc-eQTL 5.96e-01 0.0503 0.0949 0.251 ncMono L2
ENSG00000112303 VNN2 725983 sc-eQTL 6.91e-01 0.0363 0.0913 0.251 ncMono L2
ENSG00000112306 RPS12 674873 sc-eQTL 7.21e-01 0.0164 0.0458 0.251 ncMono L2
ENSG00000118515 SGK1 -828670 sc-eQTL 7.89e-02 0.114 0.0643 0.251 ncMono L2
ENSG00000146409 SLC18B1 676103 sc-eQTL 3.20e-01 0.0805 0.0807 0.251 ncMono L2
ENSG00000286887 AL355881.1 -806859 sc-eQTL 4.19e-01 0.0692 0.0854 0.251 ncMono L2
ENSG00000028839 TBPL1 -462728 sc-eQTL 9.04e-01 0.0142 0.117 0.257 pDC L2
ENSG00000079950 STX7 976244 sc-eQTL 5.51e-01 -0.0466 0.078 0.257 pDC L2
ENSG00000093134 VNN3 754677 sc-eQTL 2.01e-01 -0.1 0.0782 0.257 pDC L2
ENSG00000112299 VNN1 775387 sc-eQTL 6.26e-01 0.039 0.0799 0.257 pDC L2
ENSG00000112303 VNN2 725983 sc-eQTL 5.29e-01 -0.06 0.0951 0.257 pDC L2
ENSG00000112306 RPS12 674873 sc-eQTL 5.99e-01 0.0345 0.0655 0.257 pDC L2
ENSG00000118515 SGK1 -828670 sc-eQTL 8.23e-01 0.0149 0.0666 0.257 pDC L2
ENSG00000146409 SLC18B1 676103 sc-eQTL 3.19e-01 -0.0968 0.0968 0.257 pDC L2
ENSG00000286438 AL591115.1 386314 sc-eQTL 1.12e-01 0.147 0.0921 0.257 pDC L2
ENSG00000286887 AL355881.1 -806859 sc-eQTL 8.81e-01 0.0123 0.0824 0.257 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000028839 TBPL1 -462728 sc-eQTL 7.67e-02 0.175 0.0986 0.252 B_Memory LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 976244 sc-eQTL 5.26e-02 0.106 0.0542 0.252 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 725983 sc-eQTL 1.35e-01 0.129 0.0861 0.252 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 674873 sc-eQTL 7.78e-01 0.0139 0.0493 0.252 B_Memory LOneK1K
ENSG00000118515 SGK1 -828670 sc-eQTL 1.39e-01 0.114 0.0767 0.252 B_Memory LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 676103 sc-eQTL 8.80e-01 -0.0137 0.0905 0.252 B_Memory LOneK1K
ENSG00000028839 TBPL1 -462728 sc-eQTL 1.64e-01 0.129 0.0926 0.252 B_Naive LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 976244 sc-eQTL 3.15e-01 0.0422 0.0418 0.252 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 725983 sc-eQTL 4.96e-01 -0.0555 0.0813 0.252 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 674873 sc-eQTL 3.53e-01 0.0458 0.0492 0.252 B_Naive LOneK1K
ENSG00000118515 SGK1 -828670 sc-eQTL 1.85e-01 0.101 0.0759 0.252 B_Naive LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 676103 sc-eQTL 5.21e-01 0.0597 0.0928 0.252 B_Naive LOneK1K
ENSG00000028839 TBPL1 -462728 sc-eQTL 4.34e-01 0.0594 0.0757 0.252 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 976244 sc-eQTL 6.75e-01 0.0221 0.0527 0.252 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000093134 VNN3 754677 sc-eQTL 5.33e-01 0.0537 0.0858 0.252 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112299 VNN1 775387 sc-eQTL 1.40e-01 0.132 0.0892 0.252 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 725983 sc-eQTL 1.99e-01 -0.076 0.059 0.252 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 674873 sc-eQTL 6.30e-01 0.0196 0.0406 0.252 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000118515 SGK1 -828670 sc-eQTL 9.30e-01 0.00484 0.0554 0.252 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 676103 sc-eQTL 5.16e-01 -0.047 0.0722 0.252 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000286887 AL355881.1 -806859 sc-eQTL 2.70e-01 0.0836 0.0756 0.252 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000028839 TBPL1 -462728 sc-eQTL 1.30e-01 0.148 0.0973 0.254 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 976244 sc-eQTL 8.09e-01 0.0156 0.0645 0.254 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000093134 VNN3 754677 sc-eQTL 9.42e-01 0.00692 0.0949 0.254 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112299 VNN1 775387 sc-eQTL 2.37e-01 0.111 0.0938 0.254 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 725983 sc-eQTL 4.70e-01 0.0642 0.0886 0.254 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 674873 sc-eQTL 9.46e-01 -0.00257 0.0376 0.254 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000118515 SGK1 -828670 sc-eQTL 2.97e-01 0.0594 0.0568 0.254 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 676103 sc-eQTL 7.56e-01 0.0285 0.0914 0.254 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000286887 AL355881.1 -806859 sc-eQTL 2.88e-01 0.0878 0.0824 0.254 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000028839 TBPL1 -462728 sc-eQTL 3.83e-01 0.0686 0.0785 0.254 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 976244 sc-eQTL 6.32e-01 0.0354 0.0738 0.254 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 725983 sc-eQTL 3.88e-01 -0.0807 0.0933 0.254 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 674873 sc-eQTL 6.88e-01 -0.0153 0.0381 0.254 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000118515 SGK1 -828670 sc-eQTL 5.59e-01 -0.0461 0.0788 0.254 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000079950 STX7 976244 pQTL 0.067 -0.0475 0.0259 0.0014 0.0 0.255
ENSG00000079950 STX7 976244 eQTL 0.0096 0.0482 0.0186 0.0 0.0 0.245
ENSG00000112299 VNN1 775387 pQTL 0.00352 0.117 0.04 0.0 0.0 0.255

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina