logo

Genes within 1Mb (chr6:133488039:C:T):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000028839 TBPL1 -464131 sc-eQTL 2.23e-01 0.114 0.0933 0.25 B L1
ENSG00000079950 STX7 974841 sc-eQTL 2.44e-01 0.0434 0.0372 0.25 B L1
ENSG00000112303 VNN2 724580 sc-eQTL 8.75e-01 -0.011 0.0701 0.25 B L1
ENSG00000112306 RPS12 673470 sc-eQTL 4.48e-01 0.0322 0.0424 0.25 B L1
ENSG00000118515 SGK1 -830073 sc-eQTL 1.53e-01 0.0934 0.0651 0.25 B L1
ENSG00000146409 SLC18B1 674700 sc-eQTL 3.04e-01 0.0917 0.089 0.25 B L1
ENSG00000028839 TBPL1 -464131 sc-eQTL 3.87e-01 0.0601 0.0694 0.25 CD4T L1
ENSG00000079950 STX7 974841 sc-eQTL 4.22e-02 0.146 0.0716 0.25 CD4T L1
ENSG00000112303 VNN2 724580 sc-eQTL 8.26e-01 -0.0138 0.0626 0.25 CD4T L1
ENSG00000112306 RPS12 673470 sc-eQTL 9.15e-01 -0.00457 0.0426 0.25 CD4T L1
ENSG00000118515 SGK1 -830073 sc-eQTL 6.19e-01 -0.0284 0.0572 0.25 CD4T L1
ENSG00000146409 SLC18B1 674700 sc-eQTL 3.14e-02 0.184 0.0852 0.25 CD4T L1
ENSG00000028839 TBPL1 -464131 sc-eQTL 4.28e-01 0.0545 0.0686 0.25 CD8T L1
ENSG00000079950 STX7 974841 sc-eQTL 9.99e-01 0.0001 0.0717 0.25 CD8T L1
ENSG00000112303 VNN2 724580 sc-eQTL 4.57e-01 -0.0623 0.0836 0.25 CD8T L1
ENSG00000112306 RPS12 673470 sc-eQTL 3.10e-01 -0.029 0.0285 0.25 CD8T L1
ENSG00000118515 SGK1 -830073 sc-eQTL 1.65e-01 -0.0611 0.0439 0.25 CD8T L1
ENSG00000146409 SLC18B1 674700 sc-eQTL 3.18e-01 0.0864 0.0863 0.25 CD8T L1
ENSG00000028839 TBPL1 -464131 sc-eQTL 9.98e-01 -0.000312 0.108 0.257 DC L1
ENSG00000079950 STX7 974841 sc-eQTL 6.68e-01 -0.0287 0.0668 0.257 DC L1
ENSG00000093134 VNN3 753274 sc-eQTL 4.99e-01 -0.0562 0.0828 0.257 DC L1
ENSG00000112299 VNN1 773984 sc-eQTL 1.65e-01 0.124 0.0891 0.257 DC L1
ENSG00000112303 VNN2 724580 sc-eQTL 8.83e-01 -0.0141 0.0958 0.257 DC L1
ENSG00000112306 RPS12 673470 sc-eQTL 3.53e-01 -0.0498 0.0536 0.257 DC L1
ENSG00000118515 SGK1 -830073 sc-eQTL 3.63e-01 0.0567 0.0622 0.257 DC L1
ENSG00000146409 SLC18B1 674700 sc-eQTL 7.88e-01 0.0229 0.085 0.257 DC L1
ENSG00000286438 AL591115.1 384911 sc-eQTL 1.83e-01 0.103 0.077 0.257 DC L1
ENSG00000286887 AL355881.1 -808262 sc-eQTL 2.90e-01 0.102 0.0961 0.257 DC L1
ENSG00000028839 TBPL1 -464131 sc-eQTL 2.05e-01 0.0939 0.0739 0.25 Mono L1
ENSG00000079950 STX7 974841 sc-eQTL 3.75e-01 0.044 0.0496 0.25 Mono L1
ENSG00000093134 VNN3 753274 sc-eQTL 8.60e-01 0.0151 0.0852 0.25 Mono L1
ENSG00000112299 VNN1 773984 sc-eQTL 2.32e-01 0.11 0.0914 0.25 Mono L1
ENSG00000112303 VNN2 724580 sc-eQTL 1.88e-01 -0.0851 0.0644 0.25 Mono L1
ENSG00000112306 RPS12 673470 sc-eQTL 6.44e-01 0.0179 0.0388 0.25 Mono L1
ENSG00000118515 SGK1 -830073 sc-eQTL 9.85e-01 0.001 0.0548 0.25 Mono L1
ENSG00000146409 SLC18B1 674700 sc-eQTL 5.34e-01 -0.0478 0.0767 0.25 Mono L1
ENSG00000286887 AL355881.1 -808262 sc-eQTL 3.68e-01 0.0679 0.0752 0.25 Mono L1
ENSG00000028839 TBPL1 -464131 sc-eQTL 4.38e-01 0.0626 0.0806 0.251 NK L1
ENSG00000079950 STX7 974841 sc-eQTL 7.42e-01 0.0246 0.0746 0.251 NK L1
ENSG00000112303 VNN2 724580 sc-eQTL 4.40e-01 -0.0717 0.0927 0.251 NK L1
ENSG00000112306 RPS12 673470 sc-eQTL 7.99e-01 -0.00977 0.0384 0.251 NK L1
ENSG00000118515 SGK1 -830073 sc-eQTL 3.15e-01 -0.0714 0.0709 0.251 NK L1
ENSG00000028839 TBPL1 -464131 sc-eQTL 4.58e-01 -0.069 0.0928 0.25 Other_T L1
ENSG00000079950 STX7 974841 sc-eQTL 2.44e-01 0.0852 0.0729 0.25 Other_T L1
ENSG00000112303 VNN2 724580 sc-eQTL 2.18e-01 -0.109 0.0881 0.25 Other_T L1
ENSG00000112306 RPS12 673470 sc-eQTL 1.55e-01 -0.0498 0.0349 0.25 Other_T L1
ENSG00000118515 SGK1 -830073 sc-eQTL 5.67e-01 0.037 0.0645 0.25 Other_T L1
ENSG00000146409 SLC18B1 674700 sc-eQTL 6.35e-01 0.0456 0.096 0.25 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000028839 TBPL1 -464131 sc-eQTL 6.11e-01 -0.0563 0.111 0.242 B_Activated L2
ENSG00000079950 STX7 974841 sc-eQTL 7.55e-01 -0.0296 0.0947 0.242 B_Activated L2
ENSG00000112303 VNN2 724580 sc-eQTL 5.54e-01 0.0596 0.101 0.242 B_Activated L2
ENSG00000112306 RPS12 673470 sc-eQTL 6.97e-01 0.021 0.054 0.242 B_Activated L2
ENSG00000118515 SGK1 -830073 sc-eQTL 3.30e-01 0.0938 0.0961 0.242 B_Activated L2
ENSG00000146409 SLC18B1 674700 sc-eQTL 2.74e-01 -0.103 0.0943 0.242 B_Activated L2
ENSG00000028839 TBPL1 -464131 sc-eQTL 7.10e-02 0.189 0.104 0.249 B_Intermediate L2
ENSG00000079950 STX7 974841 sc-eQTL 1.70e-02 0.143 0.0594 0.249 B_Intermediate L2
ENSG00000112303 VNN2 724580 sc-eQTL 8.90e-01 -0.0125 0.0907 0.249 B_Intermediate L2
ENSG00000112306 RPS12 673470 sc-eQTL 9.97e-01 0.0002 0.0555 0.249 B_Intermediate L2
ENSG00000118515 SGK1 -830073 sc-eQTL 5.60e-01 0.0561 0.096 0.249 B_Intermediate L2
ENSG00000146409 SLC18B1 674700 sc-eQTL 8.29e-01 0.0216 0.1 0.249 B_Intermediate L2
ENSG00000028839 TBPL1 -464131 sc-eQTL 5.40e-01 -0.061 0.0994 0.25 B_Memory L2
ENSG00000079950 STX7 974841 sc-eQTL 1.49e-02 0.174 0.0709 0.25 B_Memory L2
ENSG00000112303 VNN2 724580 sc-eQTL 8.60e-02 0.161 0.0935 0.25 B_Memory L2
ENSG00000112306 RPS12 673470 sc-eQTL 4.69e-01 0.0329 0.0453 0.25 B_Memory L2
ENSG00000118515 SGK1 -830073 sc-eQTL 5.62e-04 0.283 0.0809 0.25 B_Memory L2
ENSG00000146409 SLC18B1 674700 sc-eQTL 7.24e-01 0.0335 0.0946 0.25 B_Memory L2
ENSG00000028839 TBPL1 -464131 sc-eQTL 5.19e-01 0.061 0.0944 0.25 B_Naive1 L2
ENSG00000079950 STX7 974841 sc-eQTL 2.88e-01 0.0482 0.0453 0.25 B_Naive1 L2
ENSG00000112303 VNN2 724580 sc-eQTL 1.67e-01 -0.122 0.0877 0.25 B_Naive1 L2
ENSG00000112306 RPS12 673470 sc-eQTL 4.61e-01 0.037 0.0501 0.25 B_Naive1 L2
ENSG00000118515 SGK1 -830073 sc-eQTL 1.38e-01 0.116 0.0781 0.25 B_Naive1 L2
ENSG00000146409 SLC18B1 674700 sc-eQTL 9.36e-01 0.00776 0.0969 0.25 B_Naive1 L2
ENSG00000028839 TBPL1 -464131 sc-eQTL 2.93e-01 0.106 0.1 0.249 B_Naive2 L2
ENSG00000079950 STX7 974841 sc-eQTL 8.46e-01 0.0104 0.0534 0.249 B_Naive2 L2
ENSG00000112303 VNN2 724580 sc-eQTL 5.97e-01 0.0519 0.098 0.249 B_Naive2 L2
ENSG00000112306 RPS12 673470 sc-eQTL 4.05e-01 0.0433 0.0518 0.249 B_Naive2 L2
ENSG00000118515 SGK1 -830073 sc-eQTL 9.13e-01 0.0101 0.0918 0.249 B_Naive2 L2
ENSG00000146409 SLC18B1 674700 sc-eQTL 1.34e-01 0.148 0.0985 0.249 B_Naive2 L2
ENSG00000028839 TBPL1 -464131 sc-eQTL 2.41e-01 0.118 0.1 0.252 CD4_CTL L2
ENSG00000079950 STX7 974841 sc-eQTL 1.52e-01 0.143 0.0995 0.252 CD4_CTL L2
ENSG00000112303 VNN2 724580 sc-eQTL 5.20e-01 -0.0649 0.101 0.252 CD4_CTL L2
ENSG00000112306 RPS12 673470 sc-eQTL 6.03e-01 -0.0243 0.0466 0.252 CD4_CTL L2
ENSG00000118515 SGK1 -830073 sc-eQTL 1.97e-01 0.104 0.0805 0.252 CD4_CTL L2
ENSG00000146409 SLC18B1 674700 sc-eQTL 6.39e-01 0.0442 0.0939 0.252 CD4_CTL L2
ENSG00000028839 TBPL1 -464131 sc-eQTL 8.95e-01 -0.0105 0.08 0.25 CD4_Naive L2
ENSG00000079950 STX7 974841 sc-eQTL 1.40e-01 0.115 0.078 0.25 CD4_Naive L2
ENSG00000112303 VNN2 724580 sc-eQTL 6.47e-01 0.0333 0.0726 0.25 CD4_Naive L2
ENSG00000112306 RPS12 673470 sc-eQTL 9.18e-01 -0.00485 0.0471 0.25 CD4_Naive L2
ENSG00000118515 SGK1 -830073 sc-eQTL 6.45e-01 0.0267 0.0577 0.25 CD4_Naive L2
ENSG00000146409 SLC18B1 674700 sc-eQTL 2.09e-02 0.208 0.0896 0.25 CD4_Naive L2
ENSG00000028839 TBPL1 -464131 sc-eQTL 4.99e-01 -0.059 0.0871 0.25 CD4_TCM L2
ENSG00000079950 STX7 974841 sc-eQTL 2.73e-01 0.0961 0.0875 0.25 CD4_TCM L2
ENSG00000112303 VNN2 724580 sc-eQTL 1.98e-01 -0.111 0.0862 0.25 CD4_TCM L2
ENSG00000112306 RPS12 673470 sc-eQTL 1.05e-01 -0.0725 0.0446 0.25 CD4_TCM L2
ENSG00000118515 SGK1 -830073 sc-eQTL 7.45e-01 -0.0204 0.0627 0.25 CD4_TCM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 674700 sc-eQTL 2.46e-01 0.12 0.104 0.25 CD4_TCM L2
ENSG00000028839 TBPL1 -464131 sc-eQTL 9.26e-02 0.167 0.0991 0.25 CD4_TEM L2
ENSG00000079950 STX7 974841 sc-eQTL 1.47e-01 0.145 0.0994 0.25 CD4_TEM L2
ENSG00000112303 VNN2 724580 sc-eQTL 2.88e-01 0.102 0.0956 0.25 CD4_TEM L2
ENSG00000112306 RPS12 673470 sc-eQTL 3.02e-01 -0.0406 0.0392 0.25 CD4_TEM L2
ENSG00000118515 SGK1 -830073 sc-eQTL 8.17e-01 0.0157 0.0676 0.25 CD4_TEM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 674700 sc-eQTL 6.40e-01 0.0458 0.0977 0.25 CD4_TEM L2
ENSG00000028839 TBPL1 -464131 sc-eQTL 1.97e-01 0.115 0.0885 0.25 CD8_CTL L2
ENSG00000079950 STX7 974841 sc-eQTL 6.51e-01 -0.0376 0.083 0.25 CD8_CTL L2
ENSG00000112303 VNN2 724580 sc-eQTL 8.40e-01 -0.019 0.0943 0.25 CD8_CTL L2
ENSG00000112306 RPS12 673470 sc-eQTL 1.99e-01 -0.0648 0.0503 0.25 CD8_CTL L2
ENSG00000118515 SGK1 -830073 sc-eQTL 5.85e-01 0.0466 0.0852 0.25 CD8_CTL L2
ENSG00000146409 SLC18B1 674700 sc-eQTL 7.10e-01 0.0364 0.0978 0.25 CD8_CTL L2
ENSG00000028839 TBPL1 -464131 sc-eQTL 5.41e-01 0.0577 0.0943 0.25 CD8_Naive L2
ENSG00000079950 STX7 974841 sc-eQTL 5.85e-01 0.0549 0.1 0.25 CD8_Naive L2
ENSG00000112303 VNN2 724580 sc-eQTL 2.11e-01 -0.108 0.0864 0.25 CD8_Naive L2
ENSG00000112306 RPS12 673470 sc-eQTL 5.63e-01 -0.0288 0.0496 0.25 CD8_Naive L2
ENSG00000118515 SGK1 -830073 sc-eQTL 8.06e-02 -0.109 0.0619 0.25 CD8_Naive L2
ENSG00000146409 SLC18B1 674700 sc-eQTL 8.96e-01 0.013 0.0996 0.25 CD8_Naive L2
ENSG00000028839 TBPL1 -464131 sc-eQTL 7.60e-01 -0.0324 0.106 0.252 CD8_TCM L2
ENSG00000079950 STX7 974841 sc-eQTL 2.77e-01 0.106 0.0975 0.252 CD8_TCM L2
ENSG00000112303 VNN2 724580 sc-eQTL 5.67e-01 0.0557 0.097 0.252 CD8_TCM L2
ENSG00000112306 RPS12 673470 sc-eQTL 2.72e-01 -0.052 0.0472 0.252 CD8_TCM L2
ENSG00000118515 SGK1 -830073 sc-eQTL 5.48e-02 0.15 0.0776 0.252 CD8_TCM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 674700 sc-eQTL 2.76e-01 0.113 0.103 0.252 CD8_TCM L2
ENSG00000028839 TBPL1 -464131 sc-eQTL 2.43e-01 -0.115 0.0984 0.251 CD8_TEM L2
ENSG00000079950 STX7 974841 sc-eQTL 2.26e-01 -0.13 0.107 0.251 CD8_TEM L2
ENSG00000112303 VNN2 724580 sc-eQTL 2.44e-01 0.125 0.107 0.251 CD8_TEM L2
ENSG00000112306 RPS12 673470 sc-eQTL 7.15e-01 0.0211 0.0576 0.251 CD8_TEM L2
ENSG00000118515 SGK1 -830073 sc-eQTL 8.41e-01 -0.019 0.0944 0.251 CD8_TEM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 674700 sc-eQTL 4.43e-01 0.0836 0.109 0.251 CD8_TEM L2
ENSG00000028839 TBPL1 -464131 sc-eQTL 4.41e-01 -0.0774 0.1 0.253 MAIT L2
ENSG00000079950 STX7 974841 sc-eQTL 9.39e-02 0.159 0.0947 0.253 MAIT L2
ENSG00000112303 VNN2 724580 sc-eQTL 9.16e-01 0.0103 0.097 0.253 MAIT L2
ENSG00000112306 RPS12 673470 sc-eQTL 2.37e-02 -0.107 0.0471 0.253 MAIT L2
ENSG00000118515 SGK1 -830073 sc-eQTL 8.85e-01 -0.00969 0.0671 0.253 MAIT L2
ENSG00000146409 SLC18B1 674700 sc-eQTL 6.44e-01 0.0462 0.1 0.253 MAIT L2
ENSG00000028839 TBPL1 -464131 sc-eQTL 8.27e-01 0.024 0.11 0.247 NK_CD56bright L2
ENSG00000079950 STX7 974841 sc-eQTL 9.43e-01 0.00733 0.102 0.247 NK_CD56bright L2
ENSG00000112303 VNN2 724580 sc-eQTL 9.52e-01 0.00622 0.103 0.247 NK_CD56bright L2
ENSG00000112306 RPS12 673470 sc-eQTL 1.91e-01 -0.0752 0.0573 0.247 NK_CD56bright L2
ENSG00000118515 SGK1 -830073 sc-eQTL 7.60e-01 0.0263 0.086 0.247 NK_CD56bright L2
ENSG00000028839 TBPL1 -464131 sc-eQTL 4.89e-01 0.06 0.0865 0.252 NK_CD56dim L2
ENSG00000079950 STX7 974841 sc-eQTL 9.07e-01 -0.00925 0.0793 0.252 NK_CD56dim L2
ENSG00000112303 VNN2 724580 sc-eQTL 3.84e-02 -0.204 0.0981 0.252 NK_CD56dim L2
ENSG00000112306 RPS12 673470 sc-eQTL 5.63e-01 -0.0228 0.0393 0.252 NK_CD56dim L2
ENSG00000118515 SGK1 -830073 sc-eQTL 7.31e-01 0.03 0.0871 0.252 NK_CD56dim L2
ENSG00000028839 TBPL1 -464131 sc-eQTL 9.11e-01 0.0125 0.111 0.249 NK_HLA L2
ENSG00000079950 STX7 974841 sc-eQTL 7.86e-01 0.0274 0.101 0.249 NK_HLA L2
ENSG00000112303 VNN2 724580 sc-eQTL 3.57e-01 -0.0942 0.102 0.249 NK_HLA L2
ENSG00000112306 RPS12 673470 sc-eQTL 4.70e-01 0.0344 0.0475 0.249 NK_HLA L2
ENSG00000118515 SGK1 -830073 sc-eQTL 6.24e-01 -0.0462 0.094 0.249 NK_HLA L2
ENSG00000028839 TBPL1 -464131 sc-eQTL 6.46e-01 0.0415 0.09 0.252 NK_cytokine L2
ENSG00000079950 STX7 974841 sc-eQTL 2.40e-01 0.103 0.087 0.252 NK_cytokine L2
ENSG00000112303 VNN2 724580 sc-eQTL 2.54e-01 0.112 0.0978 0.252 NK_cytokine L2
ENSG00000112306 RPS12 673470 sc-eQTL 8.52e-01 0.00991 0.0532 0.252 NK_cytokine L2
ENSG00000118515 SGK1 -830073 sc-eQTL 9.52e-02 -0.147 0.088 0.252 NK_cytokine L2
ENSG00000028839 TBPL1 -464131 sc-eQTL 8.04e-01 0.0297 0.119 0.252 PB L2
ENSG00000079950 STX7 974841 sc-eQTL 6.01e-01 -0.0445 0.0848 0.252 PB L2
ENSG00000112303 VNN2 724580 sc-eQTL 7.58e-01 -0.0321 0.104 0.252 PB L2
ENSG00000112306 RPS12 673470 sc-eQTL 1.70e-01 -0.0807 0.0584 0.252 PB L2
ENSG00000118515 SGK1 -830073 sc-eQTL 3.88e-01 0.0822 0.0949 0.252 PB L2
ENSG00000146409 SLC18B1 674700 sc-eQTL 3.42e-01 0.105 0.11 0.252 PB L2
ENSG00000028839 TBPL1 -464131 sc-eQTL 4.16e-01 -0.0828 0.102 0.248 Pro_T L2
ENSG00000079950 STX7 974841 sc-eQTL 1.59e-01 0.128 0.0904 0.248 Pro_T L2
ENSG00000112303 VNN2 724580 sc-eQTL 5.04e-01 -0.0652 0.0974 0.248 Pro_T L2
ENSG00000112306 RPS12 673470 sc-eQTL 2.37e-01 -0.0436 0.0367 0.248 Pro_T L2
ENSG00000118515 SGK1 -830073 sc-eQTL 3.83e-01 0.0644 0.0738 0.248 Pro_T L2
ENSG00000146409 SLC18B1 674700 sc-eQTL 6.75e-01 0.0401 0.0954 0.248 Pro_T L2
ENSG00000028839 TBPL1 -464131 sc-eQTL 7.31e-01 0.0355 0.103 0.25 Treg L2
ENSG00000079950 STX7 974841 sc-eQTL 6.77e-02 0.177 0.0965 0.25 Treg L2
ENSG00000112303 VNN2 724580 sc-eQTL 7.95e-01 0.0213 0.0818 0.25 Treg L2
ENSG00000112306 RPS12 673470 sc-eQTL 9.93e-01 0.000334 0.0362 0.25 Treg L2
ENSG00000118515 SGK1 -830073 sc-eQTL 3.71e-01 -0.0682 0.0761 0.25 Treg L2
ENSG00000146409 SLC18B1 674700 sc-eQTL 9.22e-01 0.0101 0.102 0.25 Treg L2
ENSG00000028839 TBPL1 -464131 sc-eQTL 8.44e-01 0.0208 0.106 0.268 cDC L2
ENSG00000079950 STX7 974841 sc-eQTL 9.85e-01 0.00154 0.0829 0.268 cDC L2
ENSG00000093134 VNN3 753274 sc-eQTL 6.47e-01 -0.0377 0.0822 0.268 cDC L2
ENSG00000112299 VNN1 773984 sc-eQTL 3.10e-01 0.0983 0.0965 0.268 cDC L2
ENSG00000112303 VNN2 724580 sc-eQTL 6.74e-01 -0.0397 0.0942 0.268 cDC L2
ENSG00000112306 RPS12 673470 sc-eQTL 4.57e-01 -0.0346 0.0465 0.268 cDC L2
ENSG00000118515 SGK1 -830073 sc-eQTL 1.15e-01 0.123 0.0779 0.268 cDC L2
ENSG00000146409 SLC18B1 674700 sc-eQTL 2.52e-01 0.105 0.0919 0.268 cDC L2
ENSG00000286438 AL591115.1 384911 sc-eQTL 5.97e-01 0.039 0.0736 0.268 cDC L2
ENSG00000286887 AL355881.1 -808262 sc-eQTL 4.55e-02 0.181 0.0897 0.268 cDC L2
ENSG00000028839 TBPL1 -464131 sc-eQTL 5.05e-01 0.0561 0.0839 0.25 cMono_IL1B L2
ENSG00000079950 STX7 974841 sc-eQTL 5.91e-01 -0.0343 0.0637 0.25 cMono_IL1B L2
ENSG00000093134 VNN3 753274 sc-eQTL 4.83e-01 0.0632 0.09 0.25 cMono_IL1B L2
ENSG00000112299 VNN1 773984 sc-eQTL 1.94e-01 0.118 0.0905 0.25 cMono_IL1B L2
ENSG00000112303 VNN2 724580 sc-eQTL 2.00e-01 -0.0931 0.0724 0.25 cMono_IL1B L2
ENSG00000112306 RPS12 673470 sc-eQTL 5.66e-01 0.0232 0.0403 0.25 cMono_IL1B L2
ENSG00000118515 SGK1 -830073 sc-eQTL 8.18e-01 0.0139 0.0602 0.25 cMono_IL1B L2
ENSG00000146409 SLC18B1 674700 sc-eQTL 6.70e-01 0.0332 0.0778 0.25 cMono_IL1B L2
ENSG00000286887 AL355881.1 -808262 sc-eQTL 8.50e-02 0.139 0.0805 0.25 cMono_IL1B L2
ENSG00000028839 TBPL1 -464131 sc-eQTL 5.05e-01 0.0633 0.0947 0.25 cMono_S100A L2
ENSG00000079950 STX7 974841 sc-eQTL 8.95e-02 0.116 0.068 0.25 cMono_S100A L2
ENSG00000093134 VNN3 753274 sc-eQTL 8.44e-01 0.0169 0.0855 0.25 cMono_S100A L2
ENSG00000112299 VNN1 773984 sc-eQTL 1.67e-01 0.128 0.0924 0.25 cMono_S100A L2
ENSG00000112303 VNN2 724580 sc-eQTL 3.66e-01 -0.0549 0.0607 0.25 cMono_S100A L2
ENSG00000112306 RPS12 673470 sc-eQTL 4.25e-01 0.0349 0.0437 0.25 cMono_S100A L2
ENSG00000118515 SGK1 -830073 sc-eQTL 5.83e-01 0.0275 0.0501 0.25 cMono_S100A L2
ENSG00000146409 SLC18B1 674700 sc-eQTL 6.73e-02 -0.148 0.0804 0.25 cMono_S100A L2
ENSG00000286887 AL355881.1 -808262 sc-eQTL 9.72e-01 -0.00282 0.0793 0.25 cMono_S100A L2
ENSG00000028839 TBPL1 -464131 sc-eQTL 3.74e-01 0.114 0.127 0.255 gdT L2
ENSG00000079950 STX7 974841 sc-eQTL 3.88e-01 -0.0949 0.11 0.255 gdT L2
ENSG00000112303 VNN2 724580 sc-eQTL 2.75e-02 -0.266 0.12 0.255 gdT L2
ENSG00000112306 RPS12 673470 sc-eQTL 3.90e-01 -0.0398 0.0462 0.255 gdT L2
ENSG00000118515 SGK1 -830073 sc-eQTL 5.32e-01 0.0547 0.0873 0.255 gdT L2
ENSG00000146409 SLC18B1 674700 sc-eQTL 3.36e-01 -0.115 0.119 0.255 gdT L2
ENSG00000028839 TBPL1 -464131 sc-eQTL 2.02e-02 0.223 0.0952 0.256 intMono L2
ENSG00000079950 STX7 974841 sc-eQTL 7.63e-01 0.0279 0.0921 0.256 intMono L2
ENSG00000093134 VNN3 753274 sc-eQTL 9.44e-01 0.00651 0.093 0.256 intMono L2
ENSG00000112299 VNN1 773984 sc-eQTL 3.56e-01 0.0848 0.0918 0.256 intMono L2
ENSG00000112303 VNN2 724580 sc-eQTL 2.19e-01 0.115 0.0931 0.256 intMono L2
ENSG00000112306 RPS12 673470 sc-eQTL 4.44e-01 -0.0312 0.0406 0.256 intMono L2
ENSG00000118515 SGK1 -830073 sc-eQTL 7.00e-01 0.0263 0.0683 0.256 intMono L2
ENSG00000146409 SLC18B1 674700 sc-eQTL 6.11e-01 0.0504 0.0989 0.256 intMono L2
ENSG00000286887 AL355881.1 -808262 sc-eQTL 1.95e-01 0.123 0.0943 0.256 intMono L2
ENSG00000028839 TBPL1 -464131 sc-eQTL 6.37e-01 0.048 0.101 0.249 ncMono L2
ENSG00000079950 STX7 974841 sc-eQTL 9.71e-01 -0.00248 0.0686 0.249 ncMono L2
ENSG00000093134 VNN3 753274 sc-eQTL 9.02e-01 0.012 0.0968 0.249 ncMono L2
ENSG00000112299 VNN1 773984 sc-eQTL 5.04e-01 0.0643 0.096 0.249 ncMono L2
ENSG00000112303 VNN2 724580 sc-eQTL 6.99e-01 0.0357 0.0924 0.249 ncMono L2
ENSG00000112306 RPS12 673470 sc-eQTL 5.75e-01 0.026 0.0463 0.249 ncMono L2
ENSG00000118515 SGK1 -830073 sc-eQTL 6.61e-02 0.12 0.065 0.249 ncMono L2
ENSG00000146409 SLC18B1 674700 sc-eQTL 3.39e-01 0.0782 0.0817 0.249 ncMono L2
ENSG00000286887 AL355881.1 -808262 sc-eQTL 3.75e-01 0.0767 0.0864 0.249 ncMono L2
ENSG00000028839 TBPL1 -464131 sc-eQTL 9.18e-01 0.0122 0.119 0.254 pDC L2
ENSG00000079950 STX7 974841 sc-eQTL 4.73e-01 -0.0569 0.0791 0.254 pDC L2
ENSG00000093134 VNN3 753274 sc-eQTL 2.09e-01 -0.1 0.0793 0.254 pDC L2
ENSG00000112299 VNN1 773984 sc-eQTL 6.04e-01 0.0422 0.0811 0.254 pDC L2
ENSG00000112303 VNN2 724580 sc-eQTL 4.53e-01 -0.0726 0.0964 0.254 pDC L2
ENSG00000112306 RPS12 673470 sc-eQTL 5.35e-01 0.0413 0.0665 0.254 pDC L2
ENSG00000118515 SGK1 -830073 sc-eQTL 7.19e-01 0.0243 0.0676 0.254 pDC L2
ENSG00000146409 SLC18B1 674700 sc-eQTL 1.86e-01 -0.13 0.0979 0.254 pDC L2
ENSG00000286438 AL591115.1 384911 sc-eQTL 1.98e-01 0.121 0.0937 0.254 pDC L2
ENSG00000286887 AL355881.1 -808262 sc-eQTL 8.74e-01 0.0133 0.0836 0.254 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000028839 TBPL1 -464131 sc-eQTL 6.10e-02 0.188 0.1 0.25 B_Memory LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 974841 sc-eQTL 4.10e-02 0.113 0.0549 0.25 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 724580 sc-eQTL 1.32e-01 0.132 0.0873 0.25 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 673470 sc-eQTL 6.99e-01 0.0194 0.05 0.25 B_Memory LOneK1K
ENSG00000118515 SGK1 -830073 sc-eQTL 1.34e-01 0.117 0.0778 0.25 B_Memory LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 674700 sc-eQTL 1.00e+00 -5.11e-06 0.0918 0.25 B_Memory LOneK1K
ENSG00000028839 TBPL1 -464131 sc-eQTL 1.37e-01 0.14 0.0938 0.25 B_Naive LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 974841 sc-eQTL 3.07e-01 0.0434 0.0424 0.25 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 724580 sc-eQTL 4.80e-01 -0.0582 0.0824 0.25 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 673470 sc-eQTL 2.88e-01 0.053 0.0498 0.25 B_Naive LOneK1K
ENSG00000118515 SGK1 -830073 sc-eQTL 2.13e-01 0.0962 0.077 0.25 B_Naive LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 674700 sc-eQTL 4.56e-01 0.0703 0.094 0.25 B_Naive LOneK1K
ENSG00000028839 TBPL1 -464131 sc-eQTL 4.35e-01 0.0599 0.0766 0.25 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 974841 sc-eQTL 5.88e-01 0.0289 0.0533 0.25 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000093134 VNN3 753274 sc-eQTL 6.64e-01 0.0378 0.0869 0.25 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112299 VNN1 773984 sc-eQTL 1.07e-01 0.146 0.0901 0.25 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 724580 sc-eQTL 2.02e-01 -0.0765 0.0597 0.25 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 673470 sc-eQTL 4.76e-01 0.0293 0.0411 0.25 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000118515 SGK1 -830073 sc-eQTL 9.00e-01 0.00707 0.056 0.25 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 674700 sc-eQTL 5.50e-01 -0.0437 0.0731 0.25 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000286887 AL355881.1 -808262 sc-eQTL 2.57e-01 0.087 0.0765 0.25 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000028839 TBPL1 -464131 sc-eQTL 1.09e-01 0.158 0.0983 0.252 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 974841 sc-eQTL 7.99e-01 0.0167 0.0653 0.252 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000093134 VNN3 753274 sc-eQTL 9.88e-01 0.00145 0.096 0.252 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112299 VNN1 773984 sc-eQTL 1.73e-01 0.13 0.0947 0.252 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 724580 sc-eQTL 4.76e-01 0.064 0.0896 0.252 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 673470 sc-eQTL 8.72e-01 0.00615 0.0381 0.252 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000118515 SGK1 -830073 sc-eQTL 2.74e-01 0.063 0.0575 0.252 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 674700 sc-eQTL 7.56e-01 0.0288 0.0924 0.252 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000286887 AL355881.1 -808262 sc-eQTL 2.92e-01 0.088 0.0834 0.252 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000028839 TBPL1 -464131 sc-eQTL 4.32e-01 0.0625 0.0794 0.252 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 974841 sc-eQTL 6.33e-01 0.0357 0.0747 0.252 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 724580 sc-eQTL 3.51e-01 -0.0882 0.0944 0.252 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 673470 sc-eQTL 7.44e-01 -0.0126 0.0386 0.252 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000118515 SGK1 -830073 sc-eQTL 5.61e-01 -0.0464 0.0797 0.252 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000079950 STX7 974841 pQTL 0.0704 -0.0469 0.0259 0.00136 0.0 0.255
ENSG00000079950 STX7 974841 eQTL 0.00896 0.0486 0.0186 0.0 0.0 0.245
ENSG00000112299 VNN1 773984 pQTL 0.00246 0.121 0.04 0.0 0.0 0.255

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina