logo

Genes within 1Mb (chr6:133487109:T:G):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000028839 TBPL1 -465061 sc-eQTL 3.33e-01 0.0894 0.0921 0.25 B L1
ENSG00000079950 STX7 973911 sc-eQTL 2.63e-01 0.0411 0.0366 0.25 B L1
ENSG00000112303 VNN2 723650 sc-eQTL 9.17e-01 0.00723 0.0691 0.25 B L1
ENSG00000112306 RPS12 672540 sc-eQTL 5.13e-01 0.0274 0.0417 0.25 B L1
ENSG00000118515 SGK1 -831003 sc-eQTL 1.10e-01 0.103 0.064 0.25 B L1
ENSG00000146409 SLC18B1 673770 sc-eQTL 3.41e-01 0.0837 0.0877 0.25 B L1
ENSG00000028839 TBPL1 -465061 sc-eQTL 3.37e-01 0.0658 0.0684 0.25 CD4T L1
ENSG00000079950 STX7 973911 sc-eQTL 3.16e-02 0.153 0.0705 0.25 CD4T L1
ENSG00000112303 VNN2 723650 sc-eQTL 8.70e-01 -0.0101 0.0617 0.25 CD4T L1
ENSG00000112306 RPS12 672540 sc-eQTL 7.92e-01 -0.0111 0.042 0.25 CD4T L1
ENSG00000118515 SGK1 -831003 sc-eQTL 5.91e-01 -0.0303 0.0564 0.25 CD4T L1
ENSG00000146409 SLC18B1 673770 sc-eQTL 2.76e-02 0.186 0.0839 0.25 CD4T L1
ENSG00000028839 TBPL1 -465061 sc-eQTL 3.73e-01 0.0603 0.0675 0.25 CD8T L1
ENSG00000079950 STX7 973911 sc-eQTL 9.89e-01 0.000973 0.0706 0.25 CD8T L1
ENSG00000112303 VNN2 723650 sc-eQTL 5.29e-01 -0.0519 0.0824 0.25 CD8T L1
ENSG00000112306 RPS12 672540 sc-eQTL 2.59e-01 -0.0318 0.0281 0.25 CD8T L1
ENSG00000118515 SGK1 -831003 sc-eQTL 1.63e-01 -0.0605 0.0432 0.25 CD8T L1
ENSG00000146409 SLC18B1 673770 sc-eQTL 3.76e-01 0.0755 0.085 0.25 CD8T L1
ENSG00000028839 TBPL1 -465061 sc-eQTL 9.10e-01 -0.0121 0.106 0.257 DC L1
ENSG00000079950 STX7 973911 sc-eQTL 6.49e-01 -0.0301 0.0661 0.257 DC L1
ENSG00000093134 VNN3 752344 sc-eQTL 6.33e-01 -0.0392 0.082 0.257 DC L1
ENSG00000112299 VNN1 773054 sc-eQTL 1.74e-01 0.12 0.0881 0.257 DC L1
ENSG00000112303 VNN2 723650 sc-eQTL 7.05e-01 -0.0358 0.0947 0.257 DC L1
ENSG00000112306 RPS12 672540 sc-eQTL 3.19e-01 -0.0529 0.053 0.257 DC L1
ENSG00000118515 SGK1 -831003 sc-eQTL 3.60e-01 0.0564 0.0615 0.257 DC L1
ENSG00000146409 SLC18B1 673770 sc-eQTL 6.99e-01 0.0325 0.084 0.257 DC L1
ENSG00000286438 AL591115.1 383981 sc-eQTL 8.67e-02 0.131 0.0759 0.257 DC L1
ENSG00000286887 AL355881.1 -809192 sc-eQTL 1.71e-01 0.13 0.0949 0.257 DC L1
ENSG00000028839 TBPL1 -465061 sc-eQTL 2.73e-01 0.0805 0.0732 0.25 Mono L1
ENSG00000079950 STX7 973911 sc-eQTL 3.73e-01 0.0438 0.049 0.25 Mono L1
ENSG00000093134 VNN3 752344 sc-eQTL 8.78e-01 0.0129 0.0843 0.25 Mono L1
ENSG00000112299 VNN1 773054 sc-eQTL 3.28e-01 0.0887 0.0905 0.25 Mono L1
ENSG00000112303 VNN2 723650 sc-eQTL 1.56e-01 -0.0906 0.0637 0.25 Mono L1
ENSG00000112306 RPS12 672540 sc-eQTL 9.54e-01 0.0022 0.0384 0.25 Mono L1
ENSG00000118515 SGK1 -831003 sc-eQTL 9.95e-01 -0.000342 0.0542 0.25 Mono L1
ENSG00000146409 SLC18B1 673770 sc-eQTL 4.37e-01 -0.0591 0.0758 0.25 Mono L1
ENSG00000286887 AL355881.1 -809192 sc-eQTL 4.03e-01 0.0624 0.0745 0.25 Mono L1
ENSG00000028839 TBPL1 -465061 sc-eQTL 4.00e-01 0.0671 0.0796 0.251 NK L1
ENSG00000079950 STX7 973911 sc-eQTL 7.05e-01 0.0279 0.0737 0.251 NK L1
ENSG00000112303 VNN2 723650 sc-eQTL 5.27e-01 -0.058 0.0916 0.251 NK L1
ENSG00000112306 RPS12 672540 sc-eQTL 7.00e-01 -0.0146 0.0379 0.251 NK L1
ENSG00000118515 SGK1 -831003 sc-eQTL 2.85e-01 -0.075 0.07 0.251 NK L1
ENSG00000028839 TBPL1 -465061 sc-eQTL 5.48e-01 -0.0552 0.0918 0.25 Other_T L1
ENSG00000079950 STX7 973911 sc-eQTL 2.36e-01 0.0856 0.0721 0.25 Other_T L1
ENSG00000112303 VNN2 723650 sc-eQTL 1.79e-01 -0.117 0.0871 0.25 Other_T L1
ENSG00000112306 RPS12 672540 sc-eQTL 8.05e-02 -0.0604 0.0344 0.25 Other_T L1
ENSG00000118515 SGK1 -831003 sc-eQTL 5.54e-01 0.0378 0.0637 0.25 Other_T L1
ENSG00000146409 SLC18B1 673770 sc-eQTL 4.75e-01 0.0678 0.0948 0.25 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000028839 TBPL1 -465061 sc-eQTL 7.75e-01 -0.0313 0.109 0.242 B_Activated L2
ENSG00000079950 STX7 973911 sc-eQTL 8.16e-01 -0.0218 0.0935 0.242 B_Activated L2
ENSG00000112303 VNN2 723650 sc-eQTL 6.61e-01 0.0437 0.0994 0.242 B_Activated L2
ENSG00000112306 RPS12 672540 sc-eQTL 8.03e-01 0.0133 0.0533 0.242 B_Activated L2
ENSG00000118515 SGK1 -831003 sc-eQTL 4.41e-01 0.0733 0.0949 0.242 B_Activated L2
ENSG00000146409 SLC18B1 673770 sc-eQTL 2.88e-01 -0.0992 0.0931 0.242 B_Activated L2
ENSG00000028839 TBPL1 -465061 sc-eQTL 1.67e-01 0.143 0.103 0.249 B_Intermediate L2
ENSG00000079950 STX7 973911 sc-eQTL 2.44e-02 0.133 0.0587 0.249 B_Intermediate L2
ENSG00000112303 VNN2 723650 sc-eQTL 9.31e-01 -0.00776 0.0894 0.249 B_Intermediate L2
ENSG00000112306 RPS12 672540 sc-eQTL 9.48e-01 -0.00355 0.0548 0.249 B_Intermediate L2
ENSG00000118515 SGK1 -831003 sc-eQTL 6.14e-01 0.0479 0.0947 0.249 B_Intermediate L2
ENSG00000146409 SLC18B1 673770 sc-eQTL 8.37e-01 0.0203 0.0987 0.249 B_Intermediate L2
ENSG00000028839 TBPL1 -465061 sc-eQTL 4.92e-01 -0.0675 0.0981 0.25 B_Memory L2
ENSG00000079950 STX7 973911 sc-eQTL 4.29e-02 0.143 0.0704 0.25 B_Memory L2
ENSG00000112303 VNN2 723650 sc-eQTL 6.38e-02 0.172 0.0922 0.25 B_Memory L2
ENSG00000112306 RPS12 672540 sc-eQTL 5.45e-01 0.0271 0.0448 0.25 B_Memory L2
ENSG00000118515 SGK1 -831003 sc-eQTL 1.21e-03 0.263 0.0801 0.25 B_Memory L2
ENSG00000146409 SLC18B1 673770 sc-eQTL 9.80e-01 0.00231 0.0935 0.25 B_Memory L2
ENSG00000028839 TBPL1 -465061 sc-eQTL 6.42e-01 0.0433 0.093 0.25 B_Naive1 L2
ENSG00000079950 STX7 973911 sc-eQTL 2.75e-01 0.0488 0.0446 0.25 B_Naive1 L2
ENSG00000112303 VNN2 723650 sc-eQTL 2.51e-01 -0.0997 0.0865 0.25 B_Naive1 L2
ENSG00000112306 RPS12 672540 sc-eQTL 5.22e-01 0.0317 0.0494 0.25 B_Naive1 L2
ENSG00000118515 SGK1 -831003 sc-eQTL 7.32e-02 0.138 0.0768 0.25 B_Naive1 L2
ENSG00000146409 SLC18B1 673770 sc-eQTL 9.22e-01 0.0094 0.0954 0.25 B_Naive1 L2
ENSG00000028839 TBPL1 -465061 sc-eQTL 4.23e-01 0.0795 0.099 0.249 B_Naive2 L2
ENSG00000079950 STX7 973911 sc-eQTL 9.28e-01 0.00479 0.0527 0.249 B_Naive2 L2
ENSG00000112303 VNN2 723650 sc-eQTL 5.48e-01 0.0581 0.0966 0.249 B_Naive2 L2
ENSG00000112306 RPS12 672540 sc-eQTL 4.75e-01 0.0366 0.0511 0.249 B_Naive2 L2
ENSG00000118515 SGK1 -831003 sc-eQTL 8.63e-01 0.0156 0.0905 0.249 B_Naive2 L2
ENSG00000146409 SLC18B1 673770 sc-eQTL 1.64e-01 0.136 0.0972 0.249 B_Naive2 L2
ENSG00000028839 TBPL1 -465061 sc-eQTL 2.45e-01 0.116 0.0991 0.252 CD4_CTL L2
ENSG00000079950 STX7 973911 sc-eQTL 2.25e-01 0.12 0.0984 0.252 CD4_CTL L2
ENSG00000112303 VNN2 723650 sc-eQTL 6.78e-01 -0.0414 0.0996 0.252 CD4_CTL L2
ENSG00000112306 RPS12 672540 sc-eQTL 4.95e-01 -0.0315 0.046 0.252 CD4_CTL L2
ENSG00000118515 SGK1 -831003 sc-eQTL 2.20e-01 0.0978 0.0795 0.252 CD4_CTL L2
ENSG00000146409 SLC18B1 673770 sc-eQTL 6.00e-01 0.0487 0.0928 0.252 CD4_CTL L2
ENSG00000028839 TBPL1 -465061 sc-eQTL 9.52e-01 0.00474 0.0789 0.25 CD4_Naive L2
ENSG00000079950 STX7 973911 sc-eQTL 1.19e-01 0.121 0.0769 0.25 CD4_Naive L2
ENSG00000112303 VNN2 723650 sc-eQTL 6.45e-01 0.0331 0.0716 0.25 CD4_Naive L2
ENSG00000112306 RPS12 672540 sc-eQTL 9.20e-01 -0.00468 0.0465 0.25 CD4_Naive L2
ENSG00000118515 SGK1 -831003 sc-eQTL 7.45e-01 0.0186 0.0569 0.25 CD4_Naive L2
ENSG00000146409 SLC18B1 673770 sc-eQTL 1.39e-02 0.219 0.0882 0.25 CD4_Naive L2
ENSG00000028839 TBPL1 -465061 sc-eQTL 4.56e-01 -0.0638 0.0853 0.25 CD4_TCM L2
ENSG00000079950 STX7 973911 sc-eQTL 2.52e-01 0.0985 0.0857 0.25 CD4_TCM L2
ENSG00000112303 VNN2 723650 sc-eQTL 2.82e-01 -0.0911 0.0845 0.25 CD4_TCM L2
ENSG00000112306 RPS12 672540 sc-eQTL 7.57e-02 -0.0778 0.0436 0.25 CD4_TCM L2
ENSG00000118515 SGK1 -831003 sc-eQTL 6.88e-01 -0.0247 0.0615 0.25 CD4_TCM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 673770 sc-eQTL 3.03e-01 0.105 0.101 0.25 CD4_TCM L2
ENSG00000028839 TBPL1 -465061 sc-eQTL 1.43e-01 0.144 0.098 0.25 CD4_TEM L2
ENSG00000079950 STX7 973911 sc-eQTL 1.10e-01 0.157 0.098 0.25 CD4_TEM L2
ENSG00000112303 VNN2 723650 sc-eQTL 3.08e-01 0.0965 0.0944 0.25 CD4_TEM L2
ENSG00000112306 RPS12 672540 sc-eQTL 2.24e-01 -0.0471 0.0387 0.25 CD4_TEM L2
ENSG00000118515 SGK1 -831003 sc-eQTL 8.57e-01 0.0121 0.0667 0.25 CD4_TEM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 673770 sc-eQTL 5.83e-01 0.0531 0.0964 0.25 CD4_TEM L2
ENSG00000028839 TBPL1 -465061 sc-eQTL 1.87e-01 0.115 0.087 0.25 CD8_CTL L2
ENSG00000079950 STX7 973911 sc-eQTL 6.13e-01 -0.0413 0.0816 0.25 CD8_CTL L2
ENSG00000112303 VNN2 723650 sc-eQTL 9.10e-01 -0.0105 0.0928 0.25 CD8_CTL L2
ENSG00000112306 RPS12 672540 sc-eQTL 1.50e-01 -0.0714 0.0494 0.25 CD8_CTL L2
ENSG00000118515 SGK1 -831003 sc-eQTL 6.35e-01 0.0398 0.0838 0.25 CD8_CTL L2
ENSG00000146409 SLC18B1 673770 sc-eQTL 7.28e-01 0.0335 0.0962 0.25 CD8_CTL L2
ENSG00000028839 TBPL1 -465061 sc-eQTL 4.00e-01 0.0784 0.0929 0.25 CD8_Naive L2
ENSG00000079950 STX7 973911 sc-eQTL 5.75e-01 0.0556 0.099 0.25 CD8_Naive L2
ENSG00000112303 VNN2 723650 sc-eQTL 2.81e-01 -0.0922 0.0853 0.25 CD8_Naive L2
ENSG00000112306 RPS12 672540 sc-eQTL 5.69e-01 -0.0279 0.0489 0.25 CD8_Naive L2
ENSG00000118515 SGK1 -831003 sc-eQTL 6.54e-02 -0.113 0.061 0.25 CD8_Naive L2
ENSG00000146409 SLC18B1 673770 sc-eQTL 9.36e-01 -0.00791 0.0982 0.25 CD8_Naive L2
ENSG00000028839 TBPL1 -465061 sc-eQTL 6.93e-01 -0.0413 0.104 0.252 CD8_TCM L2
ENSG00000079950 STX7 973911 sc-eQTL 3.26e-01 0.0949 0.0964 0.252 CD8_TCM L2
ENSG00000112303 VNN2 723650 sc-eQTL 6.44e-01 0.0444 0.0958 0.252 CD8_TCM L2
ENSG00000112306 RPS12 672540 sc-eQTL 2.67e-01 -0.0519 0.0466 0.252 CD8_TCM L2
ENSG00000118515 SGK1 -831003 sc-eQTL 9.38e-02 0.129 0.0768 0.252 CD8_TCM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 673770 sc-eQTL 3.19e-01 0.102 0.102 0.252 CD8_TCM L2
ENSG00000028839 TBPL1 -465061 sc-eQTL 2.32e-01 -0.116 0.0965 0.251 CD8_TEM L2
ENSG00000079950 STX7 973911 sc-eQTL 2.67e-01 -0.117 0.105 0.251 CD8_TEM L2
ENSG00000112303 VNN2 723650 sc-eQTL 1.67e-01 0.145 0.105 0.251 CD8_TEM L2
ENSG00000112306 RPS12 672540 sc-eQTL 9.19e-01 0.00579 0.0566 0.251 CD8_TEM L2
ENSG00000118515 SGK1 -831003 sc-eQTL 6.79e-01 -0.0384 0.0926 0.251 CD8_TEM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 673770 sc-eQTL 4.98e-01 0.0725 0.107 0.251 CD8_TEM L2
ENSG00000028839 TBPL1 -465061 sc-eQTL 4.99e-01 -0.0669 0.0987 0.253 MAIT L2
ENSG00000079950 STX7 973911 sc-eQTL 9.49e-02 0.156 0.0933 0.253 MAIT L2
ENSG00000112303 VNN2 723650 sc-eQTL 9.78e-01 -0.00259 0.0955 0.253 MAIT L2
ENSG00000112306 RPS12 672540 sc-eQTL 1.29e-02 -0.116 0.0463 0.253 MAIT L2
ENSG00000118515 SGK1 -831003 sc-eQTL 9.09e-01 -0.00759 0.0661 0.253 MAIT L2
ENSG00000146409 SLC18B1 673770 sc-eQTL 4.17e-01 0.0799 0.0983 0.253 MAIT L2
ENSG00000028839 TBPL1 -465061 sc-eQTL 9.92e-01 -0.0011 0.109 0.247 NK_CD56bright L2
ENSG00000079950 STX7 973911 sc-eQTL 7.00e-01 0.0388 0.101 0.247 NK_CD56bright L2
ENSG00000112303 VNN2 723650 sc-eQTL 8.31e-01 0.0218 0.102 0.247 NK_CD56bright L2
ENSG00000112306 RPS12 672540 sc-eQTL 9.69e-02 -0.0943 0.0565 0.247 NK_CD56bright L2
ENSG00000118515 SGK1 -831003 sc-eQTL 8.34e-01 0.0178 0.0851 0.247 NK_CD56bright L2
ENSG00000028839 TBPL1 -465061 sc-eQTL 4.56e-01 0.0637 0.0853 0.252 NK_CD56dim L2
ENSG00000079950 STX7 973911 sc-eQTL 9.22e-01 -0.00769 0.0782 0.252 NK_CD56dim L2
ENSG00000112303 VNN2 723650 sc-eQTL 3.52e-02 -0.205 0.0968 0.252 NK_CD56dim L2
ENSG00000112306 RPS12 672540 sc-eQTL 4.43e-01 -0.0298 0.0388 0.252 NK_CD56dim L2
ENSG00000118515 SGK1 -831003 sc-eQTL 7.27e-01 0.03 0.086 0.252 NK_CD56dim L2
ENSG00000028839 TBPL1 -465061 sc-eQTL 8.16e-01 0.0255 0.109 0.249 NK_HLA L2
ENSG00000079950 STX7 973911 sc-eQTL 7.99e-01 0.0253 0.0995 0.249 NK_HLA L2
ENSG00000112303 VNN2 723650 sc-eQTL 3.46e-01 -0.0949 0.1 0.249 NK_HLA L2
ENSG00000112306 RPS12 672540 sc-eQTL 5.33e-01 0.0293 0.0469 0.249 NK_HLA L2
ENSG00000118515 SGK1 -831003 sc-eQTL 5.71e-01 -0.0527 0.0927 0.249 NK_HLA L2
ENSG00000028839 TBPL1 -465061 sc-eQTL 5.38e-01 0.0549 0.0889 0.252 NK_cytokine L2
ENSG00000079950 STX7 973911 sc-eQTL 2.11e-01 0.108 0.0858 0.252 NK_cytokine L2
ENSG00000112303 VNN2 723650 sc-eQTL 1.62e-01 0.135 0.0964 0.252 NK_cytokine L2
ENSG00000112306 RPS12 672540 sc-eQTL 9.95e-01 -0.000298 0.0526 0.252 NK_cytokine L2
ENSG00000118515 SGK1 -831003 sc-eQTL 9.45e-02 -0.146 0.0869 0.252 NK_cytokine L2
ENSG00000028839 TBPL1 -465061 sc-eQTL 8.04e-01 0.0297 0.119 0.252 PB L2
ENSG00000079950 STX7 973911 sc-eQTL 6.01e-01 -0.0445 0.0848 0.252 PB L2
ENSG00000112303 VNN2 723650 sc-eQTL 7.58e-01 -0.0321 0.104 0.252 PB L2
ENSG00000112306 RPS12 672540 sc-eQTL 1.70e-01 -0.0807 0.0584 0.252 PB L2
ENSG00000118515 SGK1 -831003 sc-eQTL 3.88e-01 0.0822 0.0949 0.252 PB L2
ENSG00000146409 SLC18B1 673770 sc-eQTL 3.42e-01 0.105 0.11 0.252 PB L2
ENSG00000028839 TBPL1 -465061 sc-eQTL 4.93e-01 -0.0691 0.1 0.248 Pro_T L2
ENSG00000079950 STX7 973911 sc-eQTL 1.05e-01 0.145 0.0893 0.248 Pro_T L2
ENSG00000112303 VNN2 723650 sc-eQTL 4.63e-01 -0.0708 0.0962 0.248 Pro_T L2
ENSG00000112306 RPS12 672540 sc-eQTL 2.17e-01 -0.045 0.0363 0.248 Pro_T L2
ENSG00000118515 SGK1 -831003 sc-eQTL 3.76e-01 0.0647 0.0729 0.248 Pro_T L2
ENSG00000146409 SLC18B1 673770 sc-eQTL 7.63e-01 0.0285 0.0943 0.248 Pro_T L2
ENSG00000028839 TBPL1 -465061 sc-eQTL 6.22e-01 0.0502 0.102 0.25 Treg L2
ENSG00000079950 STX7 973911 sc-eQTL 3.41e-02 0.202 0.0949 0.25 Treg L2
ENSG00000112303 VNN2 723650 sc-eQTL 9.38e-01 0.00632 0.0807 0.25 Treg L2
ENSG00000112306 RPS12 672540 sc-eQTL 7.72e-01 -0.0104 0.0357 0.25 Treg L2
ENSG00000118515 SGK1 -831003 sc-eQTL 2.63e-01 -0.0841 0.075 0.25 Treg L2
ENSG00000146409 SLC18B1 673770 sc-eQTL 8.92e-01 0.0137 0.101 0.25 Treg L2
ENSG00000028839 TBPL1 -465061 sc-eQTL 9.50e-01 0.00659 0.104 0.268 cDC L2
ENSG00000079950 STX7 973911 sc-eQTL 9.83e-01 0.00178 0.0818 0.268 cDC L2
ENSG00000093134 VNN3 752344 sc-eQTL 8.24e-01 -0.0181 0.0812 0.268 cDC L2
ENSG00000112299 VNN1 773054 sc-eQTL 3.15e-01 0.0959 0.0952 0.268 cDC L2
ENSG00000112303 VNN2 723650 sc-eQTL 5.14e-01 -0.0607 0.0929 0.268 cDC L2
ENSG00000112306 RPS12 672540 sc-eQTL 3.78e-01 -0.0405 0.0458 0.268 cDC L2
ENSG00000118515 SGK1 -831003 sc-eQTL 1.33e-01 0.116 0.0769 0.268 cDC L2
ENSG00000146409 SLC18B1 673770 sc-eQTL 2.09e-01 0.114 0.0906 0.268 cDC L2
ENSG00000286438 AL591115.1 383981 sc-eQTL 4.77e-01 0.0518 0.0726 0.268 cDC L2
ENSG00000286887 AL355881.1 -809192 sc-eQTL 2.50e-02 0.199 0.0882 0.268 cDC L2
ENSG00000028839 TBPL1 -465061 sc-eQTL 5.74e-01 0.0467 0.0829 0.25 cMono_IL1B L2
ENSG00000079950 STX7 973911 sc-eQTL 6.78e-01 -0.0261 0.0629 0.25 cMono_IL1B L2
ENSG00000093134 VNN3 752344 sc-eQTL 5.15e-01 0.0579 0.0889 0.25 cMono_IL1B L2
ENSG00000112299 VNN1 773054 sc-eQTL 2.09e-01 0.113 0.0894 0.25 cMono_IL1B L2
ENSG00000112303 VNN2 723650 sc-eQTL 1.90e-01 -0.094 0.0715 0.25 cMono_IL1B L2
ENSG00000112306 RPS12 672540 sc-eQTL 8.60e-01 0.00705 0.0399 0.25 cMono_IL1B L2
ENSG00000118515 SGK1 -831003 sc-eQTL 8.08e-01 0.0145 0.0594 0.25 cMono_IL1B L2
ENSG00000146409 SLC18B1 673770 sc-eQTL 8.25e-01 0.017 0.0769 0.25 cMono_IL1B L2
ENSG00000286887 AL355881.1 -809192 sc-eQTL 8.89e-02 0.136 0.0795 0.25 cMono_IL1B L2
ENSG00000028839 TBPL1 -465061 sc-eQTL 6.64e-01 0.0407 0.0936 0.25 cMono_S100A L2
ENSG00000079950 STX7 973911 sc-eQTL 9.81e-02 0.112 0.0672 0.25 cMono_S100A L2
ENSG00000093134 VNN3 752344 sc-eQTL 8.50e-01 0.016 0.0845 0.25 cMono_S100A L2
ENSG00000112299 VNN1 773054 sc-eQTL 2.37e-01 0.108 0.0914 0.25 cMono_S100A L2
ENSG00000112303 VNN2 723650 sc-eQTL 2.44e-01 -0.07 0.0599 0.25 cMono_S100A L2
ENSG00000112306 RPS12 672540 sc-eQTL 6.23e-01 0.0213 0.0433 0.25 cMono_S100A L2
ENSG00000118515 SGK1 -831003 sc-eQTL 5.95e-01 0.0263 0.0495 0.25 cMono_S100A L2
ENSG00000146409 SLC18B1 673770 sc-eQTL 5.10e-02 -0.156 0.0794 0.25 cMono_S100A L2
ENSG00000286887 AL355881.1 -809192 sc-eQTL 9.06e-01 -0.00931 0.0783 0.25 cMono_S100A L2
ENSG00000028839 TBPL1 -465061 sc-eQTL 2.90e-01 0.134 0.126 0.255 gdT L2
ENSG00000079950 STX7 973911 sc-eQTL 4.19e-01 -0.0879 0.108 0.255 gdT L2
ENSG00000112303 VNN2 723650 sc-eQTL 2.91e-02 -0.261 0.118 0.255 gdT L2
ENSG00000112306 RPS12 672540 sc-eQTL 3.76e-01 -0.0406 0.0457 0.255 gdT L2
ENSG00000118515 SGK1 -831003 sc-eQTL 4.41e-01 0.0667 0.0863 0.255 gdT L2
ENSG00000146409 SLC18B1 673770 sc-eQTL 3.21e-01 -0.117 0.118 0.255 gdT L2
ENSG00000028839 TBPL1 -465061 sc-eQTL 2.59e-02 0.212 0.0944 0.256 intMono L2
ENSG00000079950 STX7 973911 sc-eQTL 7.46e-01 0.0296 0.0913 0.256 intMono L2
ENSG00000093134 VNN3 752344 sc-eQTL 8.72e-01 -0.0148 0.0922 0.256 intMono L2
ENSG00000112299 VNN1 773054 sc-eQTL 4.15e-01 0.0744 0.091 0.256 intMono L2
ENSG00000112303 VNN2 723650 sc-eQTL 2.04e-01 0.118 0.0923 0.256 intMono L2
ENSG00000112306 RPS12 672540 sc-eQTL 3.21e-01 -0.04 0.0402 0.256 intMono L2
ENSG00000118515 SGK1 -831003 sc-eQTL 6.91e-01 0.027 0.0677 0.256 intMono L2
ENSG00000146409 SLC18B1 673770 sc-eQTL 4.97e-01 0.0666 0.098 0.256 intMono L2
ENSG00000286887 AL355881.1 -809192 sc-eQTL 2.06e-01 0.119 0.0935 0.256 intMono L2
ENSG00000028839 TBPL1 -465061 sc-eQTL 5.39e-01 0.0616 0.1 0.249 ncMono L2
ENSG00000079950 STX7 973911 sc-eQTL 9.91e-01 0.000765 0.0678 0.249 ncMono L2
ENSG00000093134 VNN3 752344 sc-eQTL 9.18e-01 0.00984 0.0957 0.249 ncMono L2
ENSG00000112299 VNN1 773054 sc-eQTL 6.76e-01 0.0397 0.095 0.249 ncMono L2
ENSG00000112303 VNN2 723650 sc-eQTL 6.92e-01 0.0362 0.0913 0.249 ncMono L2
ENSG00000112306 RPS12 672540 sc-eQTL 8.04e-01 0.0114 0.0458 0.249 ncMono L2
ENSG00000118515 SGK1 -831003 sc-eQTL 8.38e-02 0.112 0.0643 0.249 ncMono L2
ENSG00000146409 SLC18B1 673770 sc-eQTL 3.66e-01 0.0732 0.0808 0.249 ncMono L2
ENSG00000286887 AL355881.1 -809192 sc-eQTL 4.25e-01 0.0683 0.0854 0.249 ncMono L2
ENSG00000028839 TBPL1 -465061 sc-eQTL 9.24e-01 0.0113 0.117 0.254 pDC L2
ENSG00000079950 STX7 973911 sc-eQTL 5.45e-01 -0.0473 0.078 0.254 pDC L2
ENSG00000093134 VNN3 752344 sc-eQTL 2.25e-01 -0.0952 0.0782 0.254 pDC L2
ENSG00000112299 VNN1 773054 sc-eQTL 7.59e-01 0.0246 0.08 0.254 pDC L2
ENSG00000112303 VNN2 723650 sc-eQTL 4.57e-01 -0.0709 0.0951 0.254 pDC L2
ENSG00000112306 RPS12 672540 sc-eQTL 5.64e-01 0.0379 0.0655 0.254 pDC L2
ENSG00000118515 SGK1 -831003 sc-eQTL 8.66e-01 0.0113 0.0666 0.254 pDC L2
ENSG00000146409 SLC18B1 673770 sc-eQTL 2.79e-01 -0.105 0.0967 0.254 pDC L2
ENSG00000286438 AL591115.1 383981 sc-eQTL 8.74e-02 0.158 0.092 0.254 pDC L2
ENSG00000286887 AL355881.1 -809192 sc-eQTL 7.65e-01 0.0247 0.0824 0.254 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000028839 TBPL1 -465061 sc-eQTL 9.10e-02 0.167 0.0986 0.25 B_Memory LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 973911 sc-eQTL 6.66e-02 0.1 0.0542 0.25 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 723650 sc-eQTL 1.16e-01 0.136 0.0859 0.25 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 672540 sc-eQTL 7.59e-01 0.0152 0.0492 0.25 B_Memory LOneK1K
ENSG00000118515 SGK1 -831003 sc-eQTL 1.64e-01 0.107 0.0767 0.25 B_Memory LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 673770 sc-eQTL 9.19e-01 -0.00919 0.0904 0.25 B_Memory LOneK1K
ENSG00000028839 TBPL1 -465061 sc-eQTL 2.19e-01 0.114 0.0926 0.25 B_Naive LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 973911 sc-eQTL 3.29e-01 0.0409 0.0418 0.25 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 723650 sc-eQTL 6.14e-01 -0.041 0.0812 0.25 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 672540 sc-eQTL 3.55e-01 0.0455 0.0491 0.25 B_Naive LOneK1K
ENSG00000118515 SGK1 -831003 sc-eQTL 1.28e-01 0.116 0.0757 0.25 B_Naive LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 673770 sc-eQTL 4.98e-01 0.0629 0.0927 0.25 B_Naive LOneK1K
ENSG00000028839 TBPL1 -465061 sc-eQTL 5.88e-01 0.0411 0.0757 0.25 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 973911 sc-eQTL 5.48e-01 0.0317 0.0526 0.25 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000093134 VNN3 752344 sc-eQTL 6.93e-01 0.034 0.0858 0.25 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112299 VNN1 773054 sc-eQTL 1.43e-01 0.131 0.0891 0.25 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 723650 sc-eQTL 1.60e-01 -0.083 0.0589 0.25 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 672540 sc-eQTL 7.36e-01 0.0137 0.0406 0.25 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000118515 SGK1 -831003 sc-eQTL 8.89e-01 0.00773 0.0553 0.25 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 673770 sc-eQTL 4.27e-01 -0.0574 0.0721 0.25 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000286887 AL355881.1 -809192 sc-eQTL 2.86e-01 0.0808 0.0755 0.25 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000028839 TBPL1 -465061 sc-eQTL 1.07e-01 0.157 0.0973 0.252 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 973911 sc-eQTL 7.66e-01 0.0192 0.0646 0.252 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000093134 VNN3 752344 sc-eQTL 9.56e-01 -0.0053 0.0951 0.252 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112299 VNN1 773054 sc-eQTL 2.90e-01 0.0996 0.0939 0.252 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 723650 sc-eQTL 4.78e-01 0.0631 0.0887 0.252 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 672540 sc-eQTL 8.84e-01 -0.00553 0.0377 0.252 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000118515 SGK1 -831003 sc-eQTL 3.19e-01 0.0568 0.0569 0.252 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 673770 sc-eQTL 7.22e-01 0.0326 0.0915 0.252 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000286887 AL355881.1 -809192 sc-eQTL 3.00e-01 0.0857 0.0825 0.252 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000028839 TBPL1 -465061 sc-eQTL 3.78e-01 0.0693 0.0784 0.252 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 973911 sc-eQTL 6.09e-01 0.0378 0.0737 0.252 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 723650 sc-eQTL 4.15e-01 -0.0762 0.0932 0.252 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 672540 sc-eQTL 6.52e-01 -0.0172 0.0381 0.252 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000118515 SGK1 -831003 sc-eQTL 5.54e-01 -0.0466 0.0787 0.252 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000079950 STX7 973911 pQTL 0.0681 -0.0473 0.0259 0.00138 0.0 0.254
ENSG00000079950 STX7 973911 eQTL 0.00894 0.0486 0.0186 0.0 0.0 0.245
ENSG00000112299 VNN1 773054 pQTL 0.00248 0.121 0.04 0.0 0.0 0.254

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina