logo

Genes within 1Mb (chr6:133484429:T:C):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000028839 TBPL1 -467741 sc-eQTL 3.33e-01 0.0894 0.0921 0.25 B L1
ENSG00000079950 STX7 971231 sc-eQTL 2.63e-01 0.0411 0.0366 0.25 B L1
ENSG00000112303 VNN2 720970 sc-eQTL 9.17e-01 0.00723 0.0691 0.25 B L1
ENSG00000112306 RPS12 669860 sc-eQTL 5.13e-01 0.0274 0.0417 0.25 B L1
ENSG00000118515 SGK1 -833683 sc-eQTL 1.10e-01 0.103 0.064 0.25 B L1
ENSG00000146409 SLC18B1 671090 sc-eQTL 3.41e-01 0.0837 0.0877 0.25 B L1
ENSG00000028839 TBPL1 -467741 sc-eQTL 3.37e-01 0.0658 0.0684 0.25 CD4T L1
ENSG00000079950 STX7 971231 sc-eQTL 3.16e-02 0.153 0.0705 0.25 CD4T L1
ENSG00000112303 VNN2 720970 sc-eQTL 8.70e-01 -0.0101 0.0617 0.25 CD4T L1
ENSG00000112306 RPS12 669860 sc-eQTL 7.92e-01 -0.0111 0.042 0.25 CD4T L1
ENSG00000118515 SGK1 -833683 sc-eQTL 5.91e-01 -0.0303 0.0564 0.25 CD4T L1
ENSG00000146409 SLC18B1 671090 sc-eQTL 2.76e-02 0.186 0.0839 0.25 CD4T L1
ENSG00000028839 TBPL1 -467741 sc-eQTL 3.73e-01 0.0603 0.0675 0.25 CD8T L1
ENSG00000079950 STX7 971231 sc-eQTL 9.89e-01 0.000973 0.0706 0.25 CD8T L1
ENSG00000112303 VNN2 720970 sc-eQTL 5.29e-01 -0.0519 0.0824 0.25 CD8T L1
ENSG00000112306 RPS12 669860 sc-eQTL 2.59e-01 -0.0318 0.0281 0.25 CD8T L1
ENSG00000118515 SGK1 -833683 sc-eQTL 1.63e-01 -0.0605 0.0432 0.25 CD8T L1
ENSG00000146409 SLC18B1 671090 sc-eQTL 3.76e-01 0.0755 0.085 0.25 CD8T L1
ENSG00000028839 TBPL1 -467741 sc-eQTL 9.10e-01 -0.0121 0.106 0.257 DC L1
ENSG00000079950 STX7 971231 sc-eQTL 6.49e-01 -0.0301 0.0661 0.257 DC L1
ENSG00000093134 VNN3 749664 sc-eQTL 6.33e-01 -0.0392 0.082 0.257 DC L1
ENSG00000112299 VNN1 770374 sc-eQTL 1.74e-01 0.12 0.0881 0.257 DC L1
ENSG00000112303 VNN2 720970 sc-eQTL 7.05e-01 -0.0358 0.0947 0.257 DC L1
ENSG00000112306 RPS12 669860 sc-eQTL 3.19e-01 -0.0529 0.053 0.257 DC L1
ENSG00000118515 SGK1 -833683 sc-eQTL 3.60e-01 0.0564 0.0615 0.257 DC L1
ENSG00000146409 SLC18B1 671090 sc-eQTL 6.99e-01 0.0325 0.084 0.257 DC L1
ENSG00000286438 AL591115.1 381301 sc-eQTL 8.67e-02 0.131 0.0759 0.257 DC L1
ENSG00000286887 AL355881.1 -811872 sc-eQTL 1.71e-01 0.13 0.0949 0.257 DC L1
ENSG00000028839 TBPL1 -467741 sc-eQTL 2.73e-01 0.0805 0.0732 0.25 Mono L1
ENSG00000079950 STX7 971231 sc-eQTL 3.73e-01 0.0438 0.049 0.25 Mono L1
ENSG00000093134 VNN3 749664 sc-eQTL 8.78e-01 0.0129 0.0843 0.25 Mono L1
ENSG00000112299 VNN1 770374 sc-eQTL 3.28e-01 0.0887 0.0905 0.25 Mono L1
ENSG00000112303 VNN2 720970 sc-eQTL 1.56e-01 -0.0906 0.0637 0.25 Mono L1
ENSG00000112306 RPS12 669860 sc-eQTL 9.54e-01 0.0022 0.0384 0.25 Mono L1
ENSG00000118515 SGK1 -833683 sc-eQTL 9.95e-01 -0.000342 0.0542 0.25 Mono L1
ENSG00000146409 SLC18B1 671090 sc-eQTL 4.37e-01 -0.0591 0.0758 0.25 Mono L1
ENSG00000286887 AL355881.1 -811872 sc-eQTL 4.03e-01 0.0624 0.0745 0.25 Mono L1
ENSG00000028839 TBPL1 -467741 sc-eQTL 4.00e-01 0.0671 0.0796 0.251 NK L1
ENSG00000079950 STX7 971231 sc-eQTL 7.05e-01 0.0279 0.0737 0.251 NK L1
ENSG00000112303 VNN2 720970 sc-eQTL 5.27e-01 -0.058 0.0916 0.251 NK L1
ENSG00000112306 RPS12 669860 sc-eQTL 7.00e-01 -0.0146 0.0379 0.251 NK L1
ENSG00000118515 SGK1 -833683 sc-eQTL 2.85e-01 -0.075 0.07 0.251 NK L1
ENSG00000028839 TBPL1 -467741 sc-eQTL 5.48e-01 -0.0552 0.0918 0.25 Other_T L1
ENSG00000079950 STX7 971231 sc-eQTL 2.36e-01 0.0856 0.0721 0.25 Other_T L1
ENSG00000112303 VNN2 720970 sc-eQTL 1.79e-01 -0.117 0.0871 0.25 Other_T L1
ENSG00000112306 RPS12 669860 sc-eQTL 8.05e-02 -0.0604 0.0344 0.25 Other_T L1
ENSG00000118515 SGK1 -833683 sc-eQTL 5.54e-01 0.0378 0.0637 0.25 Other_T L1
ENSG00000146409 SLC18B1 671090 sc-eQTL 4.75e-01 0.0678 0.0948 0.25 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000028839 TBPL1 -467741 sc-eQTL 7.75e-01 -0.0313 0.109 0.242 B_Activated L2
ENSG00000079950 STX7 971231 sc-eQTL 8.16e-01 -0.0218 0.0935 0.242 B_Activated L2
ENSG00000112303 VNN2 720970 sc-eQTL 6.61e-01 0.0437 0.0994 0.242 B_Activated L2
ENSG00000112306 RPS12 669860 sc-eQTL 8.03e-01 0.0133 0.0533 0.242 B_Activated L2
ENSG00000118515 SGK1 -833683 sc-eQTL 4.41e-01 0.0733 0.0949 0.242 B_Activated L2
ENSG00000146409 SLC18B1 671090 sc-eQTL 2.88e-01 -0.0992 0.0931 0.242 B_Activated L2
ENSG00000028839 TBPL1 -467741 sc-eQTL 1.67e-01 0.143 0.103 0.249 B_Intermediate L2
ENSG00000079950 STX7 971231 sc-eQTL 2.44e-02 0.133 0.0587 0.249 B_Intermediate L2
ENSG00000112303 VNN2 720970 sc-eQTL 9.31e-01 -0.00776 0.0894 0.249 B_Intermediate L2
ENSG00000112306 RPS12 669860 sc-eQTL 9.48e-01 -0.00355 0.0548 0.249 B_Intermediate L2
ENSG00000118515 SGK1 -833683 sc-eQTL 6.14e-01 0.0479 0.0947 0.249 B_Intermediate L2
ENSG00000146409 SLC18B1 671090 sc-eQTL 8.37e-01 0.0203 0.0987 0.249 B_Intermediate L2
ENSG00000028839 TBPL1 -467741 sc-eQTL 4.92e-01 -0.0675 0.0981 0.25 B_Memory L2
ENSG00000079950 STX7 971231 sc-eQTL 4.29e-02 0.143 0.0704 0.25 B_Memory L2
ENSG00000112303 VNN2 720970 sc-eQTL 6.38e-02 0.172 0.0922 0.25 B_Memory L2
ENSG00000112306 RPS12 669860 sc-eQTL 5.45e-01 0.0271 0.0448 0.25 B_Memory L2
ENSG00000118515 SGK1 -833683 sc-eQTL 1.21e-03 0.263 0.0801 0.25 B_Memory L2
ENSG00000146409 SLC18B1 671090 sc-eQTL 9.80e-01 0.00231 0.0935 0.25 B_Memory L2
ENSG00000028839 TBPL1 -467741 sc-eQTL 6.42e-01 0.0433 0.093 0.25 B_Naive1 L2
ENSG00000079950 STX7 971231 sc-eQTL 2.75e-01 0.0488 0.0446 0.25 B_Naive1 L2
ENSG00000112303 VNN2 720970 sc-eQTL 2.51e-01 -0.0997 0.0865 0.25 B_Naive1 L2
ENSG00000112306 RPS12 669860 sc-eQTL 5.22e-01 0.0317 0.0494 0.25 B_Naive1 L2
ENSG00000118515 SGK1 -833683 sc-eQTL 7.32e-02 0.138 0.0768 0.25 B_Naive1 L2
ENSG00000146409 SLC18B1 671090 sc-eQTL 9.22e-01 0.0094 0.0954 0.25 B_Naive1 L2
ENSG00000028839 TBPL1 -467741 sc-eQTL 4.23e-01 0.0795 0.099 0.249 B_Naive2 L2
ENSG00000079950 STX7 971231 sc-eQTL 9.28e-01 0.00479 0.0527 0.249 B_Naive2 L2
ENSG00000112303 VNN2 720970 sc-eQTL 5.48e-01 0.0581 0.0966 0.249 B_Naive2 L2
ENSG00000112306 RPS12 669860 sc-eQTL 4.75e-01 0.0366 0.0511 0.249 B_Naive2 L2
ENSG00000118515 SGK1 -833683 sc-eQTL 8.63e-01 0.0156 0.0905 0.249 B_Naive2 L2
ENSG00000146409 SLC18B1 671090 sc-eQTL 1.64e-01 0.136 0.0972 0.249 B_Naive2 L2
ENSG00000028839 TBPL1 -467741 sc-eQTL 2.45e-01 0.116 0.0991 0.252 CD4_CTL L2
ENSG00000079950 STX7 971231 sc-eQTL 2.25e-01 0.12 0.0984 0.252 CD4_CTL L2
ENSG00000112303 VNN2 720970 sc-eQTL 6.78e-01 -0.0414 0.0996 0.252 CD4_CTL L2
ENSG00000112306 RPS12 669860 sc-eQTL 4.95e-01 -0.0315 0.046 0.252 CD4_CTL L2
ENSG00000118515 SGK1 -833683 sc-eQTL 2.20e-01 0.0978 0.0795 0.252 CD4_CTL L2
ENSG00000146409 SLC18B1 671090 sc-eQTL 6.00e-01 0.0487 0.0928 0.252 CD4_CTL L2
ENSG00000028839 TBPL1 -467741 sc-eQTL 9.52e-01 0.00474 0.0789 0.25 CD4_Naive L2
ENSG00000079950 STX7 971231 sc-eQTL 1.19e-01 0.121 0.0769 0.25 CD4_Naive L2
ENSG00000112303 VNN2 720970 sc-eQTL 6.45e-01 0.0331 0.0716 0.25 CD4_Naive L2
ENSG00000112306 RPS12 669860 sc-eQTL 9.20e-01 -0.00468 0.0465 0.25 CD4_Naive L2
ENSG00000118515 SGK1 -833683 sc-eQTL 7.45e-01 0.0186 0.0569 0.25 CD4_Naive L2
ENSG00000146409 SLC18B1 671090 sc-eQTL 1.39e-02 0.219 0.0882 0.25 CD4_Naive L2
ENSG00000028839 TBPL1 -467741 sc-eQTL 4.56e-01 -0.0638 0.0853 0.25 CD4_TCM L2
ENSG00000079950 STX7 971231 sc-eQTL 2.52e-01 0.0985 0.0857 0.25 CD4_TCM L2
ENSG00000112303 VNN2 720970 sc-eQTL 2.82e-01 -0.0911 0.0845 0.25 CD4_TCM L2
ENSG00000112306 RPS12 669860 sc-eQTL 7.57e-02 -0.0778 0.0436 0.25 CD4_TCM L2
ENSG00000118515 SGK1 -833683 sc-eQTL 6.88e-01 -0.0247 0.0615 0.25 CD4_TCM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 671090 sc-eQTL 3.03e-01 0.105 0.101 0.25 CD4_TCM L2
ENSG00000028839 TBPL1 -467741 sc-eQTL 1.43e-01 0.144 0.098 0.25 CD4_TEM L2
ENSG00000079950 STX7 971231 sc-eQTL 1.10e-01 0.157 0.098 0.25 CD4_TEM L2
ENSG00000112303 VNN2 720970 sc-eQTL 3.08e-01 0.0965 0.0944 0.25 CD4_TEM L2
ENSG00000112306 RPS12 669860 sc-eQTL 2.24e-01 -0.0471 0.0387 0.25 CD4_TEM L2
ENSG00000118515 SGK1 -833683 sc-eQTL 8.57e-01 0.0121 0.0667 0.25 CD4_TEM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 671090 sc-eQTL 5.83e-01 0.0531 0.0964 0.25 CD4_TEM L2
ENSG00000028839 TBPL1 -467741 sc-eQTL 1.87e-01 0.115 0.087 0.25 CD8_CTL L2
ENSG00000079950 STX7 971231 sc-eQTL 6.13e-01 -0.0413 0.0816 0.25 CD8_CTL L2
ENSG00000112303 VNN2 720970 sc-eQTL 9.10e-01 -0.0105 0.0928 0.25 CD8_CTL L2
ENSG00000112306 RPS12 669860 sc-eQTL 1.50e-01 -0.0714 0.0494 0.25 CD8_CTL L2
ENSG00000118515 SGK1 -833683 sc-eQTL 6.35e-01 0.0398 0.0838 0.25 CD8_CTL L2
ENSG00000146409 SLC18B1 671090 sc-eQTL 7.28e-01 0.0335 0.0962 0.25 CD8_CTL L2
ENSG00000028839 TBPL1 -467741 sc-eQTL 4.00e-01 0.0784 0.0929 0.25 CD8_Naive L2
ENSG00000079950 STX7 971231 sc-eQTL 5.75e-01 0.0556 0.099 0.25 CD8_Naive L2
ENSG00000112303 VNN2 720970 sc-eQTL 2.81e-01 -0.0922 0.0853 0.25 CD8_Naive L2
ENSG00000112306 RPS12 669860 sc-eQTL 5.69e-01 -0.0279 0.0489 0.25 CD8_Naive L2
ENSG00000118515 SGK1 -833683 sc-eQTL 6.54e-02 -0.113 0.061 0.25 CD8_Naive L2
ENSG00000146409 SLC18B1 671090 sc-eQTL 9.36e-01 -0.00791 0.0982 0.25 CD8_Naive L2
ENSG00000028839 TBPL1 -467741 sc-eQTL 6.93e-01 -0.0413 0.104 0.252 CD8_TCM L2
ENSG00000079950 STX7 971231 sc-eQTL 3.26e-01 0.0949 0.0964 0.252 CD8_TCM L2
ENSG00000112303 VNN2 720970 sc-eQTL 6.44e-01 0.0444 0.0958 0.252 CD8_TCM L2
ENSG00000112306 RPS12 669860 sc-eQTL 2.67e-01 -0.0519 0.0466 0.252 CD8_TCM L2
ENSG00000118515 SGK1 -833683 sc-eQTL 9.38e-02 0.129 0.0768 0.252 CD8_TCM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 671090 sc-eQTL 3.19e-01 0.102 0.102 0.252 CD8_TCM L2
ENSG00000028839 TBPL1 -467741 sc-eQTL 2.32e-01 -0.116 0.0965 0.251 CD8_TEM L2
ENSG00000079950 STX7 971231 sc-eQTL 2.67e-01 -0.117 0.105 0.251 CD8_TEM L2
ENSG00000112303 VNN2 720970 sc-eQTL 1.67e-01 0.145 0.105 0.251 CD8_TEM L2
ENSG00000112306 RPS12 669860 sc-eQTL 9.19e-01 0.00579 0.0566 0.251 CD8_TEM L2
ENSG00000118515 SGK1 -833683 sc-eQTL 6.79e-01 -0.0384 0.0926 0.251 CD8_TEM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 671090 sc-eQTL 4.98e-01 0.0725 0.107 0.251 CD8_TEM L2
ENSG00000028839 TBPL1 -467741 sc-eQTL 4.99e-01 -0.0669 0.0987 0.253 MAIT L2
ENSG00000079950 STX7 971231 sc-eQTL 9.49e-02 0.156 0.0933 0.253 MAIT L2
ENSG00000112303 VNN2 720970 sc-eQTL 9.78e-01 -0.00259 0.0955 0.253 MAIT L2
ENSG00000112306 RPS12 669860 sc-eQTL 1.29e-02 -0.116 0.0463 0.253 MAIT L2
ENSG00000118515 SGK1 -833683 sc-eQTL 9.09e-01 -0.00759 0.0661 0.253 MAIT L2
ENSG00000146409 SLC18B1 671090 sc-eQTL 4.17e-01 0.0799 0.0983 0.253 MAIT L2
ENSG00000028839 TBPL1 -467741 sc-eQTL 9.92e-01 -0.0011 0.109 0.247 NK_CD56bright L2
ENSG00000079950 STX7 971231 sc-eQTL 7.00e-01 0.0388 0.101 0.247 NK_CD56bright L2
ENSG00000112303 VNN2 720970 sc-eQTL 8.31e-01 0.0218 0.102 0.247 NK_CD56bright L2
ENSG00000112306 RPS12 669860 sc-eQTL 9.69e-02 -0.0943 0.0565 0.247 NK_CD56bright L2
ENSG00000118515 SGK1 -833683 sc-eQTL 8.34e-01 0.0178 0.0851 0.247 NK_CD56bright L2
ENSG00000028839 TBPL1 -467741 sc-eQTL 4.56e-01 0.0637 0.0853 0.252 NK_CD56dim L2
ENSG00000079950 STX7 971231 sc-eQTL 9.22e-01 -0.00769 0.0782 0.252 NK_CD56dim L2
ENSG00000112303 VNN2 720970 sc-eQTL 3.52e-02 -0.205 0.0968 0.252 NK_CD56dim L2
ENSG00000112306 RPS12 669860 sc-eQTL 4.43e-01 -0.0298 0.0388 0.252 NK_CD56dim L2
ENSG00000118515 SGK1 -833683 sc-eQTL 7.27e-01 0.03 0.086 0.252 NK_CD56dim L2
ENSG00000028839 TBPL1 -467741 sc-eQTL 8.16e-01 0.0255 0.109 0.249 NK_HLA L2
ENSG00000079950 STX7 971231 sc-eQTL 7.99e-01 0.0253 0.0995 0.249 NK_HLA L2
ENSG00000112303 VNN2 720970 sc-eQTL 3.46e-01 -0.0949 0.1 0.249 NK_HLA L2
ENSG00000112306 RPS12 669860 sc-eQTL 5.33e-01 0.0293 0.0469 0.249 NK_HLA L2
ENSG00000118515 SGK1 -833683 sc-eQTL 5.71e-01 -0.0527 0.0927 0.249 NK_HLA L2
ENSG00000028839 TBPL1 -467741 sc-eQTL 5.38e-01 0.0549 0.0889 0.252 NK_cytokine L2
ENSG00000079950 STX7 971231 sc-eQTL 2.11e-01 0.108 0.0858 0.252 NK_cytokine L2
ENSG00000112303 VNN2 720970 sc-eQTL 1.62e-01 0.135 0.0964 0.252 NK_cytokine L2
ENSG00000112306 RPS12 669860 sc-eQTL 9.95e-01 -0.000298 0.0526 0.252 NK_cytokine L2
ENSG00000118515 SGK1 -833683 sc-eQTL 9.45e-02 -0.146 0.0869 0.252 NK_cytokine L2
ENSG00000028839 TBPL1 -467741 sc-eQTL 8.04e-01 0.0297 0.119 0.252 PB L2
ENSG00000079950 STX7 971231 sc-eQTL 6.01e-01 -0.0445 0.0848 0.252 PB L2
ENSG00000112303 VNN2 720970 sc-eQTL 7.58e-01 -0.0321 0.104 0.252 PB L2
ENSG00000112306 RPS12 669860 sc-eQTL 1.70e-01 -0.0807 0.0584 0.252 PB L2
ENSG00000118515 SGK1 -833683 sc-eQTL 3.88e-01 0.0822 0.0949 0.252 PB L2
ENSG00000146409 SLC18B1 671090 sc-eQTL 3.42e-01 0.105 0.11 0.252 PB L2
ENSG00000028839 TBPL1 -467741 sc-eQTL 4.93e-01 -0.0691 0.1 0.248 Pro_T L2
ENSG00000079950 STX7 971231 sc-eQTL 1.05e-01 0.145 0.0893 0.248 Pro_T L2
ENSG00000112303 VNN2 720970 sc-eQTL 4.63e-01 -0.0708 0.0962 0.248 Pro_T L2
ENSG00000112306 RPS12 669860 sc-eQTL 2.17e-01 -0.045 0.0363 0.248 Pro_T L2
ENSG00000118515 SGK1 -833683 sc-eQTL 3.76e-01 0.0647 0.0729 0.248 Pro_T L2
ENSG00000146409 SLC18B1 671090 sc-eQTL 7.63e-01 0.0285 0.0943 0.248 Pro_T L2
ENSG00000028839 TBPL1 -467741 sc-eQTL 6.22e-01 0.0502 0.102 0.25 Treg L2
ENSG00000079950 STX7 971231 sc-eQTL 3.41e-02 0.202 0.0949 0.25 Treg L2
ENSG00000112303 VNN2 720970 sc-eQTL 9.38e-01 0.00632 0.0807 0.25 Treg L2
ENSG00000112306 RPS12 669860 sc-eQTL 7.72e-01 -0.0104 0.0357 0.25 Treg L2
ENSG00000118515 SGK1 -833683 sc-eQTL 2.63e-01 -0.0841 0.075 0.25 Treg L2
ENSG00000146409 SLC18B1 671090 sc-eQTL 8.92e-01 0.0137 0.101 0.25 Treg L2
ENSG00000028839 TBPL1 -467741 sc-eQTL 9.50e-01 0.00659 0.104 0.268 cDC L2
ENSG00000079950 STX7 971231 sc-eQTL 9.83e-01 0.00178 0.0818 0.268 cDC L2
ENSG00000093134 VNN3 749664 sc-eQTL 8.24e-01 -0.0181 0.0812 0.268 cDC L2
ENSG00000112299 VNN1 770374 sc-eQTL 3.15e-01 0.0959 0.0952 0.268 cDC L2
ENSG00000112303 VNN2 720970 sc-eQTL 5.14e-01 -0.0607 0.0929 0.268 cDC L2
ENSG00000112306 RPS12 669860 sc-eQTL 3.78e-01 -0.0405 0.0458 0.268 cDC L2
ENSG00000118515 SGK1 -833683 sc-eQTL 1.33e-01 0.116 0.0769 0.268 cDC L2
ENSG00000146409 SLC18B1 671090 sc-eQTL 2.09e-01 0.114 0.0906 0.268 cDC L2
ENSG00000286438 AL591115.1 381301 sc-eQTL 4.77e-01 0.0518 0.0726 0.268 cDC L2
ENSG00000286887 AL355881.1 -811872 sc-eQTL 2.50e-02 0.199 0.0882 0.268 cDC L2
ENSG00000028839 TBPL1 -467741 sc-eQTL 5.74e-01 0.0467 0.0829 0.25 cMono_IL1B L2
ENSG00000079950 STX7 971231 sc-eQTL 6.78e-01 -0.0261 0.0629 0.25 cMono_IL1B L2
ENSG00000093134 VNN3 749664 sc-eQTL 5.15e-01 0.0579 0.0889 0.25 cMono_IL1B L2
ENSG00000112299 VNN1 770374 sc-eQTL 2.09e-01 0.113 0.0894 0.25 cMono_IL1B L2
ENSG00000112303 VNN2 720970 sc-eQTL 1.90e-01 -0.094 0.0715 0.25 cMono_IL1B L2
ENSG00000112306 RPS12 669860 sc-eQTL 8.60e-01 0.00705 0.0399 0.25 cMono_IL1B L2
ENSG00000118515 SGK1 -833683 sc-eQTL 8.08e-01 0.0145 0.0594 0.25 cMono_IL1B L2
ENSG00000146409 SLC18B1 671090 sc-eQTL 8.25e-01 0.017 0.0769 0.25 cMono_IL1B L2
ENSG00000286887 AL355881.1 -811872 sc-eQTL 8.89e-02 0.136 0.0795 0.25 cMono_IL1B L2
ENSG00000028839 TBPL1 -467741 sc-eQTL 6.64e-01 0.0407 0.0936 0.25 cMono_S100A L2
ENSG00000079950 STX7 971231 sc-eQTL 9.81e-02 0.112 0.0672 0.25 cMono_S100A L2
ENSG00000093134 VNN3 749664 sc-eQTL 8.50e-01 0.016 0.0845 0.25 cMono_S100A L2
ENSG00000112299 VNN1 770374 sc-eQTL 2.37e-01 0.108 0.0914 0.25 cMono_S100A L2
ENSG00000112303 VNN2 720970 sc-eQTL 2.44e-01 -0.07 0.0599 0.25 cMono_S100A L2
ENSG00000112306 RPS12 669860 sc-eQTL 6.23e-01 0.0213 0.0433 0.25 cMono_S100A L2
ENSG00000118515 SGK1 -833683 sc-eQTL 5.95e-01 0.0263 0.0495 0.25 cMono_S100A L2
ENSG00000146409 SLC18B1 671090 sc-eQTL 5.10e-02 -0.156 0.0794 0.25 cMono_S100A L2
ENSG00000286887 AL355881.1 -811872 sc-eQTL 9.06e-01 -0.00931 0.0783 0.25 cMono_S100A L2
ENSG00000028839 TBPL1 -467741 sc-eQTL 2.90e-01 0.134 0.126 0.255 gdT L2
ENSG00000079950 STX7 971231 sc-eQTL 4.19e-01 -0.0879 0.108 0.255 gdT L2
ENSG00000112303 VNN2 720970 sc-eQTL 2.91e-02 -0.261 0.118 0.255 gdT L2
ENSG00000112306 RPS12 669860 sc-eQTL 3.76e-01 -0.0406 0.0457 0.255 gdT L2
ENSG00000118515 SGK1 -833683 sc-eQTL 4.41e-01 0.0667 0.0863 0.255 gdT L2
ENSG00000146409 SLC18B1 671090 sc-eQTL 3.21e-01 -0.117 0.118 0.255 gdT L2
ENSG00000028839 TBPL1 -467741 sc-eQTL 2.59e-02 0.212 0.0944 0.256 intMono L2
ENSG00000079950 STX7 971231 sc-eQTL 7.46e-01 0.0296 0.0913 0.256 intMono L2
ENSG00000093134 VNN3 749664 sc-eQTL 8.72e-01 -0.0148 0.0922 0.256 intMono L2
ENSG00000112299 VNN1 770374 sc-eQTL 4.15e-01 0.0744 0.091 0.256 intMono L2
ENSG00000112303 VNN2 720970 sc-eQTL 2.04e-01 0.118 0.0923 0.256 intMono L2
ENSG00000112306 RPS12 669860 sc-eQTL 3.21e-01 -0.04 0.0402 0.256 intMono L2
ENSG00000118515 SGK1 -833683 sc-eQTL 6.91e-01 0.027 0.0677 0.256 intMono L2
ENSG00000146409 SLC18B1 671090 sc-eQTL 4.97e-01 0.0666 0.098 0.256 intMono L2
ENSG00000286887 AL355881.1 -811872 sc-eQTL 2.06e-01 0.119 0.0935 0.256 intMono L2
ENSG00000028839 TBPL1 -467741 sc-eQTL 5.39e-01 0.0616 0.1 0.249 ncMono L2
ENSG00000079950 STX7 971231 sc-eQTL 9.91e-01 0.000765 0.0678 0.249 ncMono L2
ENSG00000093134 VNN3 749664 sc-eQTL 9.18e-01 0.00984 0.0957 0.249 ncMono L2
ENSG00000112299 VNN1 770374 sc-eQTL 6.76e-01 0.0397 0.095 0.249 ncMono L2
ENSG00000112303 VNN2 720970 sc-eQTL 6.92e-01 0.0362 0.0913 0.249 ncMono L2
ENSG00000112306 RPS12 669860 sc-eQTL 8.04e-01 0.0114 0.0458 0.249 ncMono L2
ENSG00000118515 SGK1 -833683 sc-eQTL 8.38e-02 0.112 0.0643 0.249 ncMono L2
ENSG00000146409 SLC18B1 671090 sc-eQTL 3.66e-01 0.0732 0.0808 0.249 ncMono L2
ENSG00000286887 AL355881.1 -811872 sc-eQTL 4.25e-01 0.0683 0.0854 0.249 ncMono L2
ENSG00000028839 TBPL1 -467741 sc-eQTL 9.24e-01 0.0113 0.117 0.254 pDC L2
ENSG00000079950 STX7 971231 sc-eQTL 5.45e-01 -0.0473 0.078 0.254 pDC L2
ENSG00000093134 VNN3 749664 sc-eQTL 2.25e-01 -0.0952 0.0782 0.254 pDC L2
ENSG00000112299 VNN1 770374 sc-eQTL 7.59e-01 0.0246 0.08 0.254 pDC L2
ENSG00000112303 VNN2 720970 sc-eQTL 4.57e-01 -0.0709 0.0951 0.254 pDC L2
ENSG00000112306 RPS12 669860 sc-eQTL 5.64e-01 0.0379 0.0655 0.254 pDC L2
ENSG00000118515 SGK1 -833683 sc-eQTL 8.66e-01 0.0113 0.0666 0.254 pDC L2
ENSG00000146409 SLC18B1 671090 sc-eQTL 2.79e-01 -0.105 0.0967 0.254 pDC L2
ENSG00000286438 AL591115.1 381301 sc-eQTL 8.74e-02 0.158 0.092 0.254 pDC L2
ENSG00000286887 AL355881.1 -811872 sc-eQTL 7.65e-01 0.0247 0.0824 0.254 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000028839 TBPL1 -467741 sc-eQTL 9.10e-02 0.167 0.0986 0.25 B_Memory LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 971231 sc-eQTL 6.66e-02 0.1 0.0542 0.25 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 720970 sc-eQTL 1.16e-01 0.136 0.0859 0.25 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 669860 sc-eQTL 7.59e-01 0.0152 0.0492 0.25 B_Memory LOneK1K
ENSG00000118515 SGK1 -833683 sc-eQTL 1.64e-01 0.107 0.0767 0.25 B_Memory LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 671090 sc-eQTL 9.19e-01 -0.00919 0.0904 0.25 B_Memory LOneK1K
ENSG00000028839 TBPL1 -467741 sc-eQTL 2.19e-01 0.114 0.0926 0.25 B_Naive LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 971231 sc-eQTL 3.29e-01 0.0409 0.0418 0.25 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 720970 sc-eQTL 6.14e-01 -0.041 0.0812 0.25 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 669860 sc-eQTL 3.55e-01 0.0455 0.0491 0.25 B_Naive LOneK1K
ENSG00000118515 SGK1 -833683 sc-eQTL 1.28e-01 0.116 0.0757 0.25 B_Naive LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 671090 sc-eQTL 4.98e-01 0.0629 0.0927 0.25 B_Naive LOneK1K
ENSG00000028839 TBPL1 -467741 sc-eQTL 5.88e-01 0.0411 0.0757 0.25 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 971231 sc-eQTL 5.48e-01 0.0317 0.0526 0.25 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000093134 VNN3 749664 sc-eQTL 6.93e-01 0.034 0.0858 0.25 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112299 VNN1 770374 sc-eQTL 1.43e-01 0.131 0.0891 0.25 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 720970 sc-eQTL 1.60e-01 -0.083 0.0589 0.25 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 669860 sc-eQTL 7.36e-01 0.0137 0.0406 0.25 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000118515 SGK1 -833683 sc-eQTL 8.89e-01 0.00773 0.0553 0.25 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 671090 sc-eQTL 4.27e-01 -0.0574 0.0721 0.25 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000286887 AL355881.1 -811872 sc-eQTL 2.86e-01 0.0808 0.0755 0.25 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000028839 TBPL1 -467741 sc-eQTL 1.07e-01 0.157 0.0973 0.252 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 971231 sc-eQTL 7.66e-01 0.0192 0.0646 0.252 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000093134 VNN3 749664 sc-eQTL 9.56e-01 -0.0053 0.0951 0.252 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112299 VNN1 770374 sc-eQTL 2.90e-01 0.0996 0.0939 0.252 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 720970 sc-eQTL 4.78e-01 0.0631 0.0887 0.252 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 669860 sc-eQTL 8.84e-01 -0.00553 0.0377 0.252 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000118515 SGK1 -833683 sc-eQTL 3.19e-01 0.0568 0.0569 0.252 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 671090 sc-eQTL 7.22e-01 0.0326 0.0915 0.252 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000286887 AL355881.1 -811872 sc-eQTL 3.00e-01 0.0857 0.0825 0.252 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000028839 TBPL1 -467741 sc-eQTL 3.78e-01 0.0693 0.0784 0.252 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 971231 sc-eQTL 6.09e-01 0.0378 0.0737 0.252 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 720970 sc-eQTL 4.15e-01 -0.0762 0.0932 0.252 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 669860 sc-eQTL 6.52e-01 -0.0172 0.0381 0.252 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000118515 SGK1 -833683 sc-eQTL 5.54e-01 -0.0466 0.0787 0.252 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000079950 STX7 971231 pQTL 0.0672 -0.0474 0.0259 0.00139 0.0 0.254
ENSG00000079950 STX7 971231 eQTL 0.00898 0.0486 0.0186 0.0 0.0 0.245
ENSG00000112299 VNN1 770374 pQTL 0.00249 0.121 0.0399 0.0 0.0 0.254

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina