logo

Genes within 1Mb (chr6:133483573:A:G):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000028839 TBPL1 -468597 sc-eQTL 2.23e-01 0.114 0.0933 0.25 B L1
ENSG00000079950 STX7 970375 sc-eQTL 2.44e-01 0.0434 0.0372 0.25 B L1
ENSG00000112303 VNN2 720114 sc-eQTL 8.75e-01 -0.011 0.0701 0.25 B L1
ENSG00000112306 RPS12 669004 sc-eQTL 4.48e-01 0.0322 0.0424 0.25 B L1
ENSG00000118515 SGK1 -834539 sc-eQTL 1.53e-01 0.0934 0.0651 0.25 B L1
ENSG00000146409 SLC18B1 670234 sc-eQTL 3.04e-01 0.0917 0.089 0.25 B L1
ENSG00000028839 TBPL1 -468597 sc-eQTL 3.87e-01 0.0601 0.0694 0.25 CD4T L1
ENSG00000079950 STX7 970375 sc-eQTL 4.22e-02 0.146 0.0716 0.25 CD4T L1
ENSG00000112303 VNN2 720114 sc-eQTL 8.26e-01 -0.0138 0.0626 0.25 CD4T L1
ENSG00000112306 RPS12 669004 sc-eQTL 9.15e-01 -0.00457 0.0426 0.25 CD4T L1
ENSG00000118515 SGK1 -834539 sc-eQTL 6.19e-01 -0.0284 0.0572 0.25 CD4T L1
ENSG00000146409 SLC18B1 670234 sc-eQTL 3.14e-02 0.184 0.0852 0.25 CD4T L1
ENSG00000028839 TBPL1 -468597 sc-eQTL 4.28e-01 0.0545 0.0686 0.25 CD8T L1
ENSG00000079950 STX7 970375 sc-eQTL 9.99e-01 0.0001 0.0717 0.25 CD8T L1
ENSG00000112303 VNN2 720114 sc-eQTL 4.57e-01 -0.0623 0.0836 0.25 CD8T L1
ENSG00000112306 RPS12 669004 sc-eQTL 3.10e-01 -0.029 0.0285 0.25 CD8T L1
ENSG00000118515 SGK1 -834539 sc-eQTL 1.65e-01 -0.0611 0.0439 0.25 CD8T L1
ENSG00000146409 SLC18B1 670234 sc-eQTL 3.18e-01 0.0864 0.0863 0.25 CD8T L1
ENSG00000028839 TBPL1 -468597 sc-eQTL 9.98e-01 -0.000312 0.108 0.257 DC L1
ENSG00000079950 STX7 970375 sc-eQTL 6.68e-01 -0.0287 0.0668 0.257 DC L1
ENSG00000093134 VNN3 748808 sc-eQTL 4.99e-01 -0.0562 0.0828 0.257 DC L1
ENSG00000112299 VNN1 769518 sc-eQTL 1.65e-01 0.124 0.0891 0.257 DC L1
ENSG00000112303 VNN2 720114 sc-eQTL 8.83e-01 -0.0141 0.0958 0.257 DC L1
ENSG00000112306 RPS12 669004 sc-eQTL 3.53e-01 -0.0498 0.0536 0.257 DC L1
ENSG00000118515 SGK1 -834539 sc-eQTL 3.63e-01 0.0567 0.0622 0.257 DC L1
ENSG00000146409 SLC18B1 670234 sc-eQTL 7.88e-01 0.0229 0.085 0.257 DC L1
ENSG00000286438 AL591115.1 380445 sc-eQTL 1.83e-01 0.103 0.077 0.257 DC L1
ENSG00000286887 AL355881.1 -812728 sc-eQTL 2.90e-01 0.102 0.0961 0.257 DC L1
ENSG00000028839 TBPL1 -468597 sc-eQTL 2.05e-01 0.0939 0.0739 0.25 Mono L1
ENSG00000079950 STX7 970375 sc-eQTL 3.75e-01 0.044 0.0496 0.25 Mono L1
ENSG00000093134 VNN3 748808 sc-eQTL 8.60e-01 0.0151 0.0852 0.25 Mono L1
ENSG00000112299 VNN1 769518 sc-eQTL 2.32e-01 0.11 0.0914 0.25 Mono L1
ENSG00000112303 VNN2 720114 sc-eQTL 1.88e-01 -0.0851 0.0644 0.25 Mono L1
ENSG00000112306 RPS12 669004 sc-eQTL 6.44e-01 0.0179 0.0388 0.25 Mono L1
ENSG00000118515 SGK1 -834539 sc-eQTL 9.85e-01 0.001 0.0548 0.25 Mono L1
ENSG00000146409 SLC18B1 670234 sc-eQTL 5.34e-01 -0.0478 0.0767 0.25 Mono L1
ENSG00000286887 AL355881.1 -812728 sc-eQTL 3.68e-01 0.0679 0.0752 0.25 Mono L1
ENSG00000028839 TBPL1 -468597 sc-eQTL 4.38e-01 0.0626 0.0806 0.251 NK L1
ENSG00000079950 STX7 970375 sc-eQTL 7.42e-01 0.0246 0.0746 0.251 NK L1
ENSG00000112303 VNN2 720114 sc-eQTL 4.40e-01 -0.0717 0.0927 0.251 NK L1
ENSG00000112306 RPS12 669004 sc-eQTL 7.99e-01 -0.00977 0.0384 0.251 NK L1
ENSG00000118515 SGK1 -834539 sc-eQTL 3.15e-01 -0.0714 0.0709 0.251 NK L1
ENSG00000028839 TBPL1 -468597 sc-eQTL 4.58e-01 -0.069 0.0928 0.25 Other_T L1
ENSG00000079950 STX7 970375 sc-eQTL 2.44e-01 0.0852 0.0729 0.25 Other_T L1
ENSG00000112303 VNN2 720114 sc-eQTL 2.18e-01 -0.109 0.0881 0.25 Other_T L1
ENSG00000112306 RPS12 669004 sc-eQTL 1.55e-01 -0.0498 0.0349 0.25 Other_T L1
ENSG00000118515 SGK1 -834539 sc-eQTL 5.67e-01 0.037 0.0645 0.25 Other_T L1
ENSG00000146409 SLC18B1 670234 sc-eQTL 6.35e-01 0.0456 0.096 0.25 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000028839 TBPL1 -468597 sc-eQTL 6.11e-01 -0.0563 0.111 0.242 B_Activated L2
ENSG00000079950 STX7 970375 sc-eQTL 7.55e-01 -0.0296 0.0947 0.242 B_Activated L2
ENSG00000112303 VNN2 720114 sc-eQTL 5.54e-01 0.0596 0.101 0.242 B_Activated L2
ENSG00000112306 RPS12 669004 sc-eQTL 6.97e-01 0.021 0.054 0.242 B_Activated L2
ENSG00000118515 SGK1 -834539 sc-eQTL 3.30e-01 0.0938 0.0961 0.242 B_Activated L2
ENSG00000146409 SLC18B1 670234 sc-eQTL 2.74e-01 -0.103 0.0943 0.242 B_Activated L2
ENSG00000028839 TBPL1 -468597 sc-eQTL 7.10e-02 0.189 0.104 0.249 B_Intermediate L2
ENSG00000079950 STX7 970375 sc-eQTL 1.70e-02 0.143 0.0594 0.249 B_Intermediate L2
ENSG00000112303 VNN2 720114 sc-eQTL 8.90e-01 -0.0125 0.0907 0.249 B_Intermediate L2
ENSG00000112306 RPS12 669004 sc-eQTL 9.97e-01 0.0002 0.0555 0.249 B_Intermediate L2
ENSG00000118515 SGK1 -834539 sc-eQTL 5.60e-01 0.0561 0.096 0.249 B_Intermediate L2
ENSG00000146409 SLC18B1 670234 sc-eQTL 8.29e-01 0.0216 0.1 0.249 B_Intermediate L2
ENSG00000028839 TBPL1 -468597 sc-eQTL 5.40e-01 -0.061 0.0994 0.25 B_Memory L2
ENSG00000079950 STX7 970375 sc-eQTL 1.49e-02 0.174 0.0709 0.25 B_Memory L2
ENSG00000112303 VNN2 720114 sc-eQTL 8.60e-02 0.161 0.0935 0.25 B_Memory L2
ENSG00000112306 RPS12 669004 sc-eQTL 4.69e-01 0.0329 0.0453 0.25 B_Memory L2
ENSG00000118515 SGK1 -834539 sc-eQTL 5.62e-04 0.283 0.0809 0.25 B_Memory L2
ENSG00000146409 SLC18B1 670234 sc-eQTL 7.24e-01 0.0335 0.0946 0.25 B_Memory L2
ENSG00000028839 TBPL1 -468597 sc-eQTL 5.19e-01 0.061 0.0944 0.25 B_Naive1 L2
ENSG00000079950 STX7 970375 sc-eQTL 2.88e-01 0.0482 0.0453 0.25 B_Naive1 L2
ENSG00000112303 VNN2 720114 sc-eQTL 1.67e-01 -0.122 0.0877 0.25 B_Naive1 L2
ENSG00000112306 RPS12 669004 sc-eQTL 4.61e-01 0.037 0.0501 0.25 B_Naive1 L2
ENSG00000118515 SGK1 -834539 sc-eQTL 1.38e-01 0.116 0.0781 0.25 B_Naive1 L2
ENSG00000146409 SLC18B1 670234 sc-eQTL 9.36e-01 0.00776 0.0969 0.25 B_Naive1 L2
ENSG00000028839 TBPL1 -468597 sc-eQTL 2.93e-01 0.106 0.1 0.249 B_Naive2 L2
ENSG00000079950 STX7 970375 sc-eQTL 8.46e-01 0.0104 0.0534 0.249 B_Naive2 L2
ENSG00000112303 VNN2 720114 sc-eQTL 5.97e-01 0.0519 0.098 0.249 B_Naive2 L2
ENSG00000112306 RPS12 669004 sc-eQTL 4.05e-01 0.0433 0.0518 0.249 B_Naive2 L2
ENSG00000118515 SGK1 -834539 sc-eQTL 9.13e-01 0.0101 0.0918 0.249 B_Naive2 L2
ENSG00000146409 SLC18B1 670234 sc-eQTL 1.34e-01 0.148 0.0985 0.249 B_Naive2 L2
ENSG00000028839 TBPL1 -468597 sc-eQTL 2.41e-01 0.118 0.1 0.252 CD4_CTL L2
ENSG00000079950 STX7 970375 sc-eQTL 1.52e-01 0.143 0.0995 0.252 CD4_CTL L2
ENSG00000112303 VNN2 720114 sc-eQTL 5.20e-01 -0.0649 0.101 0.252 CD4_CTL L2
ENSG00000112306 RPS12 669004 sc-eQTL 6.03e-01 -0.0243 0.0466 0.252 CD4_CTL L2
ENSG00000118515 SGK1 -834539 sc-eQTL 1.97e-01 0.104 0.0805 0.252 CD4_CTL L2
ENSG00000146409 SLC18B1 670234 sc-eQTL 6.39e-01 0.0442 0.0939 0.252 CD4_CTL L2
ENSG00000028839 TBPL1 -468597 sc-eQTL 8.95e-01 -0.0105 0.08 0.25 CD4_Naive L2
ENSG00000079950 STX7 970375 sc-eQTL 1.40e-01 0.115 0.078 0.25 CD4_Naive L2
ENSG00000112303 VNN2 720114 sc-eQTL 6.47e-01 0.0333 0.0726 0.25 CD4_Naive L2
ENSG00000112306 RPS12 669004 sc-eQTL 9.18e-01 -0.00485 0.0471 0.25 CD4_Naive L2
ENSG00000118515 SGK1 -834539 sc-eQTL 6.45e-01 0.0267 0.0577 0.25 CD4_Naive L2
ENSG00000146409 SLC18B1 670234 sc-eQTL 2.09e-02 0.208 0.0896 0.25 CD4_Naive L2
ENSG00000028839 TBPL1 -468597 sc-eQTL 4.99e-01 -0.059 0.0871 0.25 CD4_TCM L2
ENSG00000079950 STX7 970375 sc-eQTL 2.73e-01 0.0961 0.0875 0.25 CD4_TCM L2
ENSG00000112303 VNN2 720114 sc-eQTL 1.98e-01 -0.111 0.0862 0.25 CD4_TCM L2
ENSG00000112306 RPS12 669004 sc-eQTL 1.05e-01 -0.0725 0.0446 0.25 CD4_TCM L2
ENSG00000118515 SGK1 -834539 sc-eQTL 7.45e-01 -0.0204 0.0627 0.25 CD4_TCM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 670234 sc-eQTL 2.46e-01 0.12 0.104 0.25 CD4_TCM L2
ENSG00000028839 TBPL1 -468597 sc-eQTL 9.26e-02 0.167 0.0991 0.25 CD4_TEM L2
ENSG00000079950 STX7 970375 sc-eQTL 1.47e-01 0.145 0.0994 0.25 CD4_TEM L2
ENSG00000112303 VNN2 720114 sc-eQTL 2.88e-01 0.102 0.0956 0.25 CD4_TEM L2
ENSG00000112306 RPS12 669004 sc-eQTL 3.02e-01 -0.0406 0.0392 0.25 CD4_TEM L2
ENSG00000118515 SGK1 -834539 sc-eQTL 8.17e-01 0.0157 0.0676 0.25 CD4_TEM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 670234 sc-eQTL 6.40e-01 0.0458 0.0977 0.25 CD4_TEM L2
ENSG00000028839 TBPL1 -468597 sc-eQTL 1.97e-01 0.115 0.0885 0.25 CD8_CTL L2
ENSG00000079950 STX7 970375 sc-eQTL 6.51e-01 -0.0376 0.083 0.25 CD8_CTL L2
ENSG00000112303 VNN2 720114 sc-eQTL 8.40e-01 -0.019 0.0943 0.25 CD8_CTL L2
ENSG00000112306 RPS12 669004 sc-eQTL 1.99e-01 -0.0648 0.0503 0.25 CD8_CTL L2
ENSG00000118515 SGK1 -834539 sc-eQTL 5.85e-01 0.0466 0.0852 0.25 CD8_CTL L2
ENSG00000146409 SLC18B1 670234 sc-eQTL 7.10e-01 0.0364 0.0978 0.25 CD8_CTL L2
ENSG00000028839 TBPL1 -468597 sc-eQTL 5.41e-01 0.0577 0.0943 0.25 CD8_Naive L2
ENSG00000079950 STX7 970375 sc-eQTL 5.85e-01 0.0549 0.1 0.25 CD8_Naive L2
ENSG00000112303 VNN2 720114 sc-eQTL 2.11e-01 -0.108 0.0864 0.25 CD8_Naive L2
ENSG00000112306 RPS12 669004 sc-eQTL 5.63e-01 -0.0288 0.0496 0.25 CD8_Naive L2
ENSG00000118515 SGK1 -834539 sc-eQTL 8.06e-02 -0.109 0.0619 0.25 CD8_Naive L2
ENSG00000146409 SLC18B1 670234 sc-eQTL 8.96e-01 0.013 0.0996 0.25 CD8_Naive L2
ENSG00000028839 TBPL1 -468597 sc-eQTL 7.60e-01 -0.0324 0.106 0.252 CD8_TCM L2
ENSG00000079950 STX7 970375 sc-eQTL 2.77e-01 0.106 0.0975 0.252 CD8_TCM L2
ENSG00000112303 VNN2 720114 sc-eQTL 5.67e-01 0.0557 0.097 0.252 CD8_TCM L2
ENSG00000112306 RPS12 669004 sc-eQTL 2.72e-01 -0.052 0.0472 0.252 CD8_TCM L2
ENSG00000118515 SGK1 -834539 sc-eQTL 5.48e-02 0.15 0.0776 0.252 CD8_TCM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 670234 sc-eQTL 2.76e-01 0.113 0.103 0.252 CD8_TCM L2
ENSG00000028839 TBPL1 -468597 sc-eQTL 2.43e-01 -0.115 0.0984 0.251 CD8_TEM L2
ENSG00000079950 STX7 970375 sc-eQTL 2.26e-01 -0.13 0.107 0.251 CD8_TEM L2
ENSG00000112303 VNN2 720114 sc-eQTL 2.44e-01 0.125 0.107 0.251 CD8_TEM L2
ENSG00000112306 RPS12 669004 sc-eQTL 7.15e-01 0.0211 0.0576 0.251 CD8_TEM L2
ENSG00000118515 SGK1 -834539 sc-eQTL 8.41e-01 -0.019 0.0944 0.251 CD8_TEM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 670234 sc-eQTL 4.43e-01 0.0836 0.109 0.251 CD8_TEM L2
ENSG00000028839 TBPL1 -468597 sc-eQTL 4.41e-01 -0.0774 0.1 0.253 MAIT L2
ENSG00000079950 STX7 970375 sc-eQTL 9.39e-02 0.159 0.0947 0.253 MAIT L2
ENSG00000112303 VNN2 720114 sc-eQTL 9.16e-01 0.0103 0.097 0.253 MAIT L2
ENSG00000112306 RPS12 669004 sc-eQTL 2.37e-02 -0.107 0.0471 0.253 MAIT L2
ENSG00000118515 SGK1 -834539 sc-eQTL 8.85e-01 -0.00969 0.0671 0.253 MAIT L2
ENSG00000146409 SLC18B1 670234 sc-eQTL 6.44e-01 0.0462 0.1 0.253 MAIT L2
ENSG00000028839 TBPL1 -468597 sc-eQTL 8.27e-01 0.024 0.11 0.247 NK_CD56bright L2
ENSG00000079950 STX7 970375 sc-eQTL 9.43e-01 0.00733 0.102 0.247 NK_CD56bright L2
ENSG00000112303 VNN2 720114 sc-eQTL 9.52e-01 0.00622 0.103 0.247 NK_CD56bright L2
ENSG00000112306 RPS12 669004 sc-eQTL 1.91e-01 -0.0752 0.0573 0.247 NK_CD56bright L2
ENSG00000118515 SGK1 -834539 sc-eQTL 7.60e-01 0.0263 0.086 0.247 NK_CD56bright L2
ENSG00000028839 TBPL1 -468597 sc-eQTL 4.89e-01 0.06 0.0865 0.252 NK_CD56dim L2
ENSG00000079950 STX7 970375 sc-eQTL 9.07e-01 -0.00925 0.0793 0.252 NK_CD56dim L2
ENSG00000112303 VNN2 720114 sc-eQTL 3.84e-02 -0.204 0.0981 0.252 NK_CD56dim L2
ENSG00000112306 RPS12 669004 sc-eQTL 5.63e-01 -0.0228 0.0393 0.252 NK_CD56dim L2
ENSG00000118515 SGK1 -834539 sc-eQTL 7.31e-01 0.03 0.0871 0.252 NK_CD56dim L2
ENSG00000028839 TBPL1 -468597 sc-eQTL 9.11e-01 0.0125 0.111 0.249 NK_HLA L2
ENSG00000079950 STX7 970375 sc-eQTL 7.86e-01 0.0274 0.101 0.249 NK_HLA L2
ENSG00000112303 VNN2 720114 sc-eQTL 3.57e-01 -0.0942 0.102 0.249 NK_HLA L2
ENSG00000112306 RPS12 669004 sc-eQTL 4.70e-01 0.0344 0.0475 0.249 NK_HLA L2
ENSG00000118515 SGK1 -834539 sc-eQTL 6.24e-01 -0.0462 0.094 0.249 NK_HLA L2
ENSG00000028839 TBPL1 -468597 sc-eQTL 6.46e-01 0.0415 0.09 0.252 NK_cytokine L2
ENSG00000079950 STX7 970375 sc-eQTL 2.40e-01 0.103 0.087 0.252 NK_cytokine L2
ENSG00000112303 VNN2 720114 sc-eQTL 2.54e-01 0.112 0.0978 0.252 NK_cytokine L2
ENSG00000112306 RPS12 669004 sc-eQTL 8.52e-01 0.00991 0.0532 0.252 NK_cytokine L2
ENSG00000118515 SGK1 -834539 sc-eQTL 9.52e-02 -0.147 0.088 0.252 NK_cytokine L2
ENSG00000028839 TBPL1 -468597 sc-eQTL 8.04e-01 0.0297 0.119 0.252 PB L2
ENSG00000079950 STX7 970375 sc-eQTL 6.01e-01 -0.0445 0.0848 0.252 PB L2
ENSG00000112303 VNN2 720114 sc-eQTL 7.58e-01 -0.0321 0.104 0.252 PB L2
ENSG00000112306 RPS12 669004 sc-eQTL 1.70e-01 -0.0807 0.0584 0.252 PB L2
ENSG00000118515 SGK1 -834539 sc-eQTL 3.88e-01 0.0822 0.0949 0.252 PB L2
ENSG00000146409 SLC18B1 670234 sc-eQTL 3.42e-01 0.105 0.11 0.252 PB L2
ENSG00000028839 TBPL1 -468597 sc-eQTL 4.16e-01 -0.0828 0.102 0.248 Pro_T L2
ENSG00000079950 STX7 970375 sc-eQTL 1.59e-01 0.128 0.0904 0.248 Pro_T L2
ENSG00000112303 VNN2 720114 sc-eQTL 5.04e-01 -0.0652 0.0974 0.248 Pro_T L2
ENSG00000112306 RPS12 669004 sc-eQTL 2.37e-01 -0.0436 0.0367 0.248 Pro_T L2
ENSG00000118515 SGK1 -834539 sc-eQTL 3.83e-01 0.0644 0.0738 0.248 Pro_T L2
ENSG00000146409 SLC18B1 670234 sc-eQTL 6.75e-01 0.0401 0.0954 0.248 Pro_T L2
ENSG00000028839 TBPL1 -468597 sc-eQTL 7.31e-01 0.0355 0.103 0.25 Treg L2
ENSG00000079950 STX7 970375 sc-eQTL 6.77e-02 0.177 0.0965 0.25 Treg L2
ENSG00000112303 VNN2 720114 sc-eQTL 7.95e-01 0.0213 0.0818 0.25 Treg L2
ENSG00000112306 RPS12 669004 sc-eQTL 9.93e-01 0.000334 0.0362 0.25 Treg L2
ENSG00000118515 SGK1 -834539 sc-eQTL 3.71e-01 -0.0682 0.0761 0.25 Treg L2
ENSG00000146409 SLC18B1 670234 sc-eQTL 9.22e-01 0.0101 0.102 0.25 Treg L2
ENSG00000028839 TBPL1 -468597 sc-eQTL 8.44e-01 0.0208 0.106 0.268 cDC L2
ENSG00000079950 STX7 970375 sc-eQTL 9.85e-01 0.00154 0.0829 0.268 cDC L2
ENSG00000093134 VNN3 748808 sc-eQTL 6.47e-01 -0.0377 0.0822 0.268 cDC L2
ENSG00000112299 VNN1 769518 sc-eQTL 3.10e-01 0.0983 0.0965 0.268 cDC L2
ENSG00000112303 VNN2 720114 sc-eQTL 6.74e-01 -0.0397 0.0942 0.268 cDC L2
ENSG00000112306 RPS12 669004 sc-eQTL 4.57e-01 -0.0346 0.0465 0.268 cDC L2
ENSG00000118515 SGK1 -834539 sc-eQTL 1.15e-01 0.123 0.0779 0.268 cDC L2
ENSG00000146409 SLC18B1 670234 sc-eQTL 2.52e-01 0.105 0.0919 0.268 cDC L2
ENSG00000286438 AL591115.1 380445 sc-eQTL 5.97e-01 0.039 0.0736 0.268 cDC L2
ENSG00000286887 AL355881.1 -812728 sc-eQTL 4.55e-02 0.181 0.0897 0.268 cDC L2
ENSG00000028839 TBPL1 -468597 sc-eQTL 5.05e-01 0.0561 0.0839 0.25 cMono_IL1B L2
ENSG00000079950 STX7 970375 sc-eQTL 5.91e-01 -0.0343 0.0637 0.25 cMono_IL1B L2
ENSG00000093134 VNN3 748808 sc-eQTL 4.83e-01 0.0632 0.09 0.25 cMono_IL1B L2
ENSG00000112299 VNN1 769518 sc-eQTL 1.94e-01 0.118 0.0905 0.25 cMono_IL1B L2
ENSG00000112303 VNN2 720114 sc-eQTL 2.00e-01 -0.0931 0.0724 0.25 cMono_IL1B L2
ENSG00000112306 RPS12 669004 sc-eQTL 5.66e-01 0.0232 0.0403 0.25 cMono_IL1B L2
ENSG00000118515 SGK1 -834539 sc-eQTL 8.18e-01 0.0139 0.0602 0.25 cMono_IL1B L2
ENSG00000146409 SLC18B1 670234 sc-eQTL 6.70e-01 0.0332 0.0778 0.25 cMono_IL1B L2
ENSG00000286887 AL355881.1 -812728 sc-eQTL 8.50e-02 0.139 0.0805 0.25 cMono_IL1B L2
ENSG00000028839 TBPL1 -468597 sc-eQTL 5.05e-01 0.0633 0.0947 0.25 cMono_S100A L2
ENSG00000079950 STX7 970375 sc-eQTL 8.95e-02 0.116 0.068 0.25 cMono_S100A L2
ENSG00000093134 VNN3 748808 sc-eQTL 8.44e-01 0.0169 0.0855 0.25 cMono_S100A L2
ENSG00000112299 VNN1 769518 sc-eQTL 1.67e-01 0.128 0.0924 0.25 cMono_S100A L2
ENSG00000112303 VNN2 720114 sc-eQTL 3.66e-01 -0.0549 0.0607 0.25 cMono_S100A L2
ENSG00000112306 RPS12 669004 sc-eQTL 4.25e-01 0.0349 0.0437 0.25 cMono_S100A L2
ENSG00000118515 SGK1 -834539 sc-eQTL 5.83e-01 0.0275 0.0501 0.25 cMono_S100A L2
ENSG00000146409 SLC18B1 670234 sc-eQTL 6.73e-02 -0.148 0.0804 0.25 cMono_S100A L2
ENSG00000286887 AL355881.1 -812728 sc-eQTL 9.72e-01 -0.00282 0.0793 0.25 cMono_S100A L2
ENSG00000028839 TBPL1 -468597 sc-eQTL 3.74e-01 0.114 0.127 0.255 gdT L2
ENSG00000079950 STX7 970375 sc-eQTL 3.88e-01 -0.0949 0.11 0.255 gdT L2
ENSG00000112303 VNN2 720114 sc-eQTL 2.75e-02 -0.266 0.12 0.255 gdT L2
ENSG00000112306 RPS12 669004 sc-eQTL 3.90e-01 -0.0398 0.0462 0.255 gdT L2
ENSG00000118515 SGK1 -834539 sc-eQTL 5.32e-01 0.0547 0.0873 0.255 gdT L2
ENSG00000146409 SLC18B1 670234 sc-eQTL 3.36e-01 -0.115 0.119 0.255 gdT L2
ENSG00000028839 TBPL1 -468597 sc-eQTL 2.02e-02 0.223 0.0952 0.256 intMono L2
ENSG00000079950 STX7 970375 sc-eQTL 7.63e-01 0.0279 0.0921 0.256 intMono L2
ENSG00000093134 VNN3 748808 sc-eQTL 9.44e-01 0.00651 0.093 0.256 intMono L2
ENSG00000112299 VNN1 769518 sc-eQTL 3.56e-01 0.0848 0.0918 0.256 intMono L2
ENSG00000112303 VNN2 720114 sc-eQTL 2.19e-01 0.115 0.0931 0.256 intMono L2
ENSG00000112306 RPS12 669004 sc-eQTL 4.44e-01 -0.0312 0.0406 0.256 intMono L2
ENSG00000118515 SGK1 -834539 sc-eQTL 7.00e-01 0.0263 0.0683 0.256 intMono L2
ENSG00000146409 SLC18B1 670234 sc-eQTL 6.11e-01 0.0504 0.0989 0.256 intMono L2
ENSG00000286887 AL355881.1 -812728 sc-eQTL 1.95e-01 0.123 0.0943 0.256 intMono L2
ENSG00000028839 TBPL1 -468597 sc-eQTL 6.37e-01 0.048 0.101 0.249 ncMono L2
ENSG00000079950 STX7 970375 sc-eQTL 9.71e-01 -0.00248 0.0686 0.249 ncMono L2
ENSG00000093134 VNN3 748808 sc-eQTL 9.02e-01 0.012 0.0968 0.249 ncMono L2
ENSG00000112299 VNN1 769518 sc-eQTL 5.04e-01 0.0643 0.096 0.249 ncMono L2
ENSG00000112303 VNN2 720114 sc-eQTL 6.99e-01 0.0357 0.0924 0.249 ncMono L2
ENSG00000112306 RPS12 669004 sc-eQTL 5.75e-01 0.026 0.0463 0.249 ncMono L2
ENSG00000118515 SGK1 -834539 sc-eQTL 6.61e-02 0.12 0.065 0.249 ncMono L2
ENSG00000146409 SLC18B1 670234 sc-eQTL 3.39e-01 0.0782 0.0817 0.249 ncMono L2
ENSG00000286887 AL355881.1 -812728 sc-eQTL 3.75e-01 0.0767 0.0864 0.249 ncMono L2
ENSG00000028839 TBPL1 -468597 sc-eQTL 9.18e-01 0.0122 0.119 0.254 pDC L2
ENSG00000079950 STX7 970375 sc-eQTL 4.73e-01 -0.0569 0.0791 0.254 pDC L2
ENSG00000093134 VNN3 748808 sc-eQTL 2.09e-01 -0.1 0.0793 0.254 pDC L2
ENSG00000112299 VNN1 769518 sc-eQTL 6.04e-01 0.0422 0.0811 0.254 pDC L2
ENSG00000112303 VNN2 720114 sc-eQTL 4.53e-01 -0.0726 0.0964 0.254 pDC L2
ENSG00000112306 RPS12 669004 sc-eQTL 5.35e-01 0.0413 0.0665 0.254 pDC L2
ENSG00000118515 SGK1 -834539 sc-eQTL 7.19e-01 0.0243 0.0676 0.254 pDC L2
ENSG00000146409 SLC18B1 670234 sc-eQTL 1.86e-01 -0.13 0.0979 0.254 pDC L2
ENSG00000286438 AL591115.1 380445 sc-eQTL 1.98e-01 0.121 0.0937 0.254 pDC L2
ENSG00000286887 AL355881.1 -812728 sc-eQTL 8.74e-01 0.0133 0.0836 0.254 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000028839 TBPL1 -468597 sc-eQTL 6.10e-02 0.188 0.1 0.25 B_Memory LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 970375 sc-eQTL 4.10e-02 0.113 0.0549 0.25 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 720114 sc-eQTL 1.32e-01 0.132 0.0873 0.25 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 669004 sc-eQTL 6.99e-01 0.0194 0.05 0.25 B_Memory LOneK1K
ENSG00000118515 SGK1 -834539 sc-eQTL 1.34e-01 0.117 0.0778 0.25 B_Memory LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 670234 sc-eQTL 1.00e+00 -5.11e-06 0.0918 0.25 B_Memory LOneK1K
ENSG00000028839 TBPL1 -468597 sc-eQTL 1.37e-01 0.14 0.0938 0.25 B_Naive LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 970375 sc-eQTL 3.07e-01 0.0434 0.0424 0.25 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 720114 sc-eQTL 4.80e-01 -0.0582 0.0824 0.25 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 669004 sc-eQTL 2.88e-01 0.053 0.0498 0.25 B_Naive LOneK1K
ENSG00000118515 SGK1 -834539 sc-eQTL 2.13e-01 0.0962 0.077 0.25 B_Naive LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 670234 sc-eQTL 4.56e-01 0.0703 0.094 0.25 B_Naive LOneK1K
ENSG00000028839 TBPL1 -468597 sc-eQTL 4.35e-01 0.0599 0.0766 0.25 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 970375 sc-eQTL 5.88e-01 0.0289 0.0533 0.25 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000093134 VNN3 748808 sc-eQTL 6.64e-01 0.0378 0.0869 0.25 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112299 VNN1 769518 sc-eQTL 1.07e-01 0.146 0.0901 0.25 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 720114 sc-eQTL 2.02e-01 -0.0765 0.0597 0.25 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 669004 sc-eQTL 4.76e-01 0.0293 0.0411 0.25 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000118515 SGK1 -834539 sc-eQTL 9.00e-01 0.00707 0.056 0.25 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 670234 sc-eQTL 5.50e-01 -0.0437 0.0731 0.25 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000286887 AL355881.1 -812728 sc-eQTL 2.57e-01 0.087 0.0765 0.25 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000028839 TBPL1 -468597 sc-eQTL 1.09e-01 0.158 0.0983 0.252 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 970375 sc-eQTL 7.99e-01 0.0167 0.0653 0.252 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000093134 VNN3 748808 sc-eQTL 9.88e-01 0.00145 0.096 0.252 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112299 VNN1 769518 sc-eQTL 1.73e-01 0.13 0.0947 0.252 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 720114 sc-eQTL 4.76e-01 0.064 0.0896 0.252 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 669004 sc-eQTL 8.72e-01 0.00615 0.0381 0.252 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000118515 SGK1 -834539 sc-eQTL 2.74e-01 0.063 0.0575 0.252 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 670234 sc-eQTL 7.56e-01 0.0288 0.0924 0.252 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000286887 AL355881.1 -812728 sc-eQTL 2.92e-01 0.088 0.0834 0.252 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000028839 TBPL1 -468597 sc-eQTL 4.32e-01 0.0625 0.0794 0.252 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 970375 sc-eQTL 6.33e-01 0.0357 0.0747 0.252 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 720114 sc-eQTL 3.51e-01 -0.0882 0.0944 0.252 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 669004 sc-eQTL 7.44e-01 -0.0126 0.0386 0.252 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000118515 SGK1 -834539 sc-eQTL 5.61e-01 -0.0464 0.0797 0.252 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000079950 STX7 970375 pQTL 0.0696 -0.0471 0.0259 0.00137 0.0 0.255
ENSG00000079950 STX7 970375 eQTL 0.00895 0.0486 0.0186 0.0 0.0 0.245
ENSG00000112299 VNN1 769518 pQTL 0.00238 0.122 0.04 0.0 0.0 0.255

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina