logo

Genes within 1Mb (chr6:133482871:G:GAGTT):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000028839 TBPL1 -469299 sc-eQTL 2.36e-01 0.109 0.092 0.248 B L1
ENSG00000079950 STX7 969673 sc-eQTL 2.32e-01 0.0439 0.0367 0.248 B L1
ENSG00000112303 VNN2 719412 sc-eQTL 9.01e-01 -0.00865 0.0691 0.248 B L1
ENSG00000112306 RPS12 668302 sc-eQTL 5.62e-01 0.0242 0.0418 0.248 B L1
ENSG00000118515 SGK1 -835241 sc-eQTL 1.64e-01 0.0897 0.0642 0.248 B L1
ENSG00000146409 SLC18B1 669532 sc-eQTL 4.64e-01 0.0645 0.0879 0.248 B L1
ENSG00000028839 TBPL1 -469299 sc-eQTL 3.22e-01 0.0678 0.0684 0.248 CD4T L1
ENSG00000079950 STX7 969673 sc-eQTL 4.30e-02 0.144 0.0706 0.248 CD4T L1
ENSG00000112303 VNN2 719412 sc-eQTL 8.80e-01 -0.0093 0.0617 0.248 CD4T L1
ENSG00000112306 RPS12 668302 sc-eQTL 8.43e-01 -0.0083 0.042 0.248 CD4T L1
ENSG00000118515 SGK1 -835241 sc-eQTL 7.07e-01 -0.0212 0.0564 0.248 CD4T L1
ENSG00000146409 SLC18B1 669532 sc-eQTL 3.58e-02 0.177 0.084 0.248 CD4T L1
ENSG00000028839 TBPL1 -469299 sc-eQTL 3.65e-01 0.0613 0.0675 0.248 CD8T L1
ENSG00000079950 STX7 969673 sc-eQTL 8.14e-01 0.0166 0.0706 0.248 CD8T L1
ENSG00000112303 VNN2 719412 sc-eQTL 6.48e-01 -0.0377 0.0824 0.248 CD8T L1
ENSG00000112306 RPS12 668302 sc-eQTL 3.31e-01 -0.0274 0.0281 0.248 CD8T L1
ENSG00000118515 SGK1 -835241 sc-eQTL 2.05e-01 -0.055 0.0433 0.248 CD8T L1
ENSG00000146409 SLC18B1 669532 sc-eQTL 3.33e-01 0.0825 0.085 0.248 CD8T L1
ENSG00000028839 TBPL1 -469299 sc-eQTL 9.59e-01 -0.0054 0.106 0.255 DC L1
ENSG00000079950 STX7 969673 sc-eQTL 7.12e-01 -0.0244 0.0659 0.255 DC L1
ENSG00000093134 VNN3 748106 sc-eQTL 7.55e-01 -0.0255 0.0817 0.255 DC L1
ENSG00000112299 VNN1 768816 sc-eQTL 1.40e-01 0.13 0.0877 0.255 DC L1
ENSG00000112303 VNN2 719412 sc-eQTL 7.22e-01 -0.0336 0.0944 0.255 DC L1
ENSG00000112306 RPS12 668302 sc-eQTL 3.33e-01 -0.0513 0.0528 0.255 DC L1
ENSG00000118515 SGK1 -835241 sc-eQTL 4.11e-01 0.0505 0.0613 0.255 DC L1
ENSG00000146409 SLC18B1 669532 sc-eQTL 6.88e-01 0.0337 0.0837 0.255 DC L1
ENSG00000286438 AL591115.1 379743 sc-eQTL 1.58e-01 0.107 0.0758 0.255 DC L1
ENSG00000286887 AL355881.1 -813430 sc-eQTL 2.84e-01 0.102 0.0947 0.255 DC L1
ENSG00000028839 TBPL1 -469299 sc-eQTL 3.15e-01 0.0737 0.0732 0.248 Mono L1
ENSG00000079950 STX7 969673 sc-eQTL 4.80e-01 0.0347 0.049 0.248 Mono L1
ENSG00000093134 VNN3 748106 sc-eQTL 6.95e-01 0.0331 0.0842 0.248 Mono L1
ENSG00000112299 VNN1 768816 sc-eQTL 2.88e-01 0.0963 0.0904 0.248 Mono L1
ENSG00000112303 VNN2 719412 sc-eQTL 2.26e-01 -0.0774 0.0637 0.248 Mono L1
ENSG00000112306 RPS12 668302 sc-eQTL 7.82e-01 0.0106 0.0383 0.248 Mono L1
ENSG00000118515 SGK1 -835241 sc-eQTL 7.93e-01 -0.0142 0.0541 0.248 Mono L1
ENSG00000146409 SLC18B1 669532 sc-eQTL 5.97e-01 -0.0402 0.0758 0.248 Mono L1
ENSG00000286887 AL355881.1 -813430 sc-eQTL 4.95e-01 0.0509 0.0744 0.248 Mono L1
ENSG00000028839 TBPL1 -469299 sc-eQTL 4.63e-01 0.0585 0.0796 0.249 NK L1
ENSG00000079950 STX7 969673 sc-eQTL 7.83e-01 0.0203 0.0737 0.249 NK L1
ENSG00000112303 VNN2 719412 sc-eQTL 4.60e-01 -0.0678 0.0916 0.249 NK L1
ENSG00000112306 RPS12 668302 sc-eQTL 8.80e-01 -0.00574 0.0379 0.249 NK L1
ENSG00000118515 SGK1 -835241 sc-eQTL 2.51e-01 -0.0805 0.0699 0.249 NK L1
ENSG00000028839 TBPL1 -469299 sc-eQTL 6.40e-01 -0.0429 0.0917 0.248 Other_T L1
ENSG00000079950 STX7 969673 sc-eQTL 1.96e-01 0.0932 0.0719 0.248 Other_T L1
ENSG00000112303 VNN2 719412 sc-eQTL 3.23e-01 -0.0864 0.0871 0.248 Other_T L1
ENSG00000112306 RPS12 668302 sc-eQTL 1.45e-01 -0.0504 0.0344 0.248 Other_T L1
ENSG00000118515 SGK1 -835241 sc-eQTL 6.47e-01 0.0292 0.0636 0.248 Other_T L1
ENSG00000146409 SLC18B1 669532 sc-eQTL 6.49e-01 0.0431 0.0947 0.248 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000028839 TBPL1 -469299 sc-eQTL 6.07e-01 -0.0562 0.109 0.242 B_Activated L2
ENSG00000079950 STX7 969673 sc-eQTL 8.48e-01 -0.0179 0.0933 0.242 B_Activated L2
ENSG00000112303 VNN2 719412 sc-eQTL 5.68e-01 0.0567 0.0992 0.242 B_Activated L2
ENSG00000112306 RPS12 668302 sc-eQTL 9.30e-01 0.00467 0.0532 0.242 B_Activated L2
ENSG00000118515 SGK1 -835241 sc-eQTL 3.89e-01 0.0818 0.0947 0.242 B_Activated L2
ENSG00000146409 SLC18B1 669532 sc-eQTL 2.56e-01 -0.106 0.0929 0.242 B_Activated L2
ENSG00000028839 TBPL1 -469299 sc-eQTL 1.39e-01 0.152 0.103 0.247 B_Intermediate L2
ENSG00000079950 STX7 969673 sc-eQTL 1.99e-02 0.137 0.0586 0.247 B_Intermediate L2
ENSG00000112303 VNN2 719412 sc-eQTL 9.26e-01 -0.00827 0.0893 0.247 B_Intermediate L2
ENSG00000112306 RPS12 668302 sc-eQTL 8.18e-01 -0.0126 0.0547 0.247 B_Intermediate L2
ENSG00000118515 SGK1 -835241 sc-eQTL 6.99e-01 0.0366 0.0946 0.247 B_Intermediate L2
ENSG00000146409 SLC18B1 669532 sc-eQTL 9.61e-01 -0.00481 0.0986 0.247 B_Intermediate L2
ENSG00000028839 TBPL1 -469299 sc-eQTL 7.08e-01 -0.0368 0.0981 0.248 B_Memory L2
ENSG00000079950 STX7 969673 sc-eQTL 2.31e-02 0.161 0.0701 0.248 B_Memory L2
ENSG00000112303 VNN2 719412 sc-eQTL 6.88e-02 0.169 0.0922 0.248 B_Memory L2
ENSG00000112306 RPS12 668302 sc-eQTL 5.50e-01 0.0268 0.0447 0.248 B_Memory L2
ENSG00000118515 SGK1 -835241 sc-eQTL 8.52e-04 0.271 0.0799 0.248 B_Memory L2
ENSG00000146409 SLC18B1 669532 sc-eQTL 8.34e-01 0.0196 0.0934 0.248 B_Memory L2
ENSG00000028839 TBPL1 -469299 sc-eQTL 5.56e-01 0.0549 0.093 0.248 B_Naive1 L2
ENSG00000079950 STX7 969673 sc-eQTL 3.03e-01 0.0461 0.0446 0.248 B_Naive1 L2
ENSG00000112303 VNN2 719412 sc-eQTL 1.58e-01 -0.123 0.0865 0.248 B_Naive1 L2
ENSG00000112306 RPS12 668302 sc-eQTL 6.54e-01 0.0222 0.0494 0.248 B_Naive1 L2
ENSG00000118515 SGK1 -835241 sc-eQTL 1.29e-01 0.117 0.077 0.248 B_Naive1 L2
ENSG00000146409 SLC18B1 669532 sc-eQTL 9.09e-01 0.0109 0.0955 0.248 B_Naive1 L2
ENSG00000028839 TBPL1 -469299 sc-eQTL 2.69e-01 0.11 0.0989 0.247 B_Naive2 L2
ENSG00000079950 STX7 969673 sc-eQTL 8.36e-01 0.011 0.0527 0.247 B_Naive2 L2
ENSG00000112303 VNN2 719412 sc-eQTL 5.67e-01 0.0555 0.0967 0.247 B_Naive2 L2
ENSG00000112306 RPS12 668302 sc-eQTL 5.56e-01 0.0302 0.0512 0.247 B_Naive2 L2
ENSG00000118515 SGK1 -835241 sc-eQTL 9.90e-01 0.00109 0.0905 0.247 B_Naive2 L2
ENSG00000146409 SLC18B1 669532 sc-eQTL 2.33e-01 0.117 0.0974 0.247 B_Naive2 L2
ENSG00000028839 TBPL1 -469299 sc-eQTL 3.85e-01 0.0866 0.0994 0.25 CD4_CTL L2
ENSG00000079950 STX7 969673 sc-eQTL 1.89e-01 0.13 0.0985 0.25 CD4_CTL L2
ENSG00000112303 VNN2 719412 sc-eQTL 6.47e-01 -0.0458 0.0997 0.25 CD4_CTL L2
ENSG00000112306 RPS12 668302 sc-eQTL 5.84e-01 -0.0253 0.0461 0.25 CD4_CTL L2
ENSG00000118515 SGK1 -835241 sc-eQTL 2.53e-01 0.0913 0.0797 0.25 CD4_CTL L2
ENSG00000146409 SLC18B1 669532 sc-eQTL 5.35e-01 0.0576 0.0929 0.25 CD4_CTL L2
ENSG00000028839 TBPL1 -469299 sc-eQTL 9.29e-01 0.00699 0.0789 0.248 CD4_Naive L2
ENSG00000079950 STX7 969673 sc-eQTL 2.09e-01 0.0971 0.077 0.248 CD4_Naive L2
ENSG00000112303 VNN2 719412 sc-eQTL 6.60e-01 0.0316 0.0716 0.248 CD4_Naive L2
ENSG00000112306 RPS12 668302 sc-eQTL 8.93e-01 -0.00624 0.0465 0.248 CD4_Naive L2
ENSG00000118515 SGK1 -835241 sc-eQTL 5.58e-01 0.0334 0.0569 0.248 CD4_Naive L2
ENSG00000146409 SLC18B1 669532 sc-eQTL 1.98e-02 0.207 0.0883 0.248 CD4_Naive L2
ENSG00000028839 TBPL1 -469299 sc-eQTL 5.84e-01 -0.0468 0.0854 0.248 CD4_TCM L2
ENSG00000079950 STX7 969673 sc-eQTL 1.77e-01 0.116 0.0857 0.248 CD4_TCM L2
ENSG00000112303 VNN2 719412 sc-eQTL 2.17e-01 -0.105 0.0845 0.248 CD4_TCM L2
ENSG00000112306 RPS12 668302 sc-eQTL 8.12e-02 -0.0765 0.0437 0.248 CD4_TCM L2
ENSG00000118515 SGK1 -835241 sc-eQTL 7.25e-01 -0.0217 0.0615 0.248 CD4_TCM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 669532 sc-eQTL 3.44e-01 0.0965 0.102 0.248 CD4_TCM L2
ENSG00000028839 TBPL1 -469299 sc-eQTL 1.52e-01 0.141 0.0979 0.248 CD4_TEM L2
ENSG00000079950 STX7 969673 sc-eQTL 1.21e-01 0.152 0.0979 0.248 CD4_TEM L2
ENSG00000112303 VNN2 719412 sc-eQTL 4.26e-01 0.0753 0.0944 0.248 CD4_TEM L2
ENSG00000112306 RPS12 668302 sc-eQTL 2.34e-01 -0.0461 0.0386 0.248 CD4_TEM L2
ENSG00000118515 SGK1 -835241 sc-eQTL 9.63e-01 0.00311 0.0666 0.248 CD4_TEM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 669532 sc-eQTL 5.02e-01 0.0646 0.0962 0.248 CD4_TEM L2
ENSG00000028839 TBPL1 -469299 sc-eQTL 1.31e-01 0.132 0.087 0.248 CD8_CTL L2
ENSG00000079950 STX7 969673 sc-eQTL 8.19e-01 -0.0187 0.0817 0.248 CD8_CTL L2
ENSG00000112303 VNN2 719412 sc-eQTL 8.97e-01 0.012 0.0928 0.248 CD8_CTL L2
ENSG00000112306 RPS12 668302 sc-eQTL 2.02e-01 -0.0634 0.0495 0.248 CD8_CTL L2
ENSG00000118515 SGK1 -835241 sc-eQTL 6.46e-01 0.0386 0.0839 0.248 CD8_CTL L2
ENSG00000146409 SLC18B1 669532 sc-eQTL 6.73e-01 0.0406 0.0963 0.248 CD8_CTL L2
ENSG00000028839 TBPL1 -469299 sc-eQTL 4.65e-01 0.0678 0.0928 0.248 CD8_Naive L2
ENSG00000079950 STX7 969673 sc-eQTL 5.67e-01 0.0567 0.0989 0.248 CD8_Naive L2
ENSG00000112303 VNN2 719412 sc-eQTL 2.53e-01 -0.0976 0.0851 0.248 CD8_Naive L2
ENSG00000112306 RPS12 668302 sc-eQTL 4.93e-01 -0.0336 0.0488 0.248 CD8_Naive L2
ENSG00000118515 SGK1 -835241 sc-eQTL 1.07e-01 -0.0987 0.061 0.248 CD8_Naive L2
ENSG00000146409 SLC18B1 669532 sc-eQTL 9.57e-01 -0.00533 0.0981 0.248 CD8_Naive L2
ENSG00000028839 TBPL1 -469299 sc-eQTL 6.18e-01 -0.052 0.104 0.25 CD8_TCM L2
ENSG00000079950 STX7 969673 sc-eQTL 2.59e-01 0.109 0.0962 0.25 CD8_TCM L2
ENSG00000112303 VNN2 719412 sc-eQTL 7.74e-01 0.0276 0.0958 0.25 CD8_TCM L2
ENSG00000112306 RPS12 668302 sc-eQTL 2.05e-01 -0.0591 0.0465 0.25 CD8_TCM L2
ENSG00000118515 SGK1 -835241 sc-eQTL 5.90e-02 0.146 0.0766 0.25 CD8_TCM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 669532 sc-eQTL 1.98e-01 0.132 0.102 0.25 CD8_TCM L2
ENSG00000028839 TBPL1 -469299 sc-eQTL 1.99e-01 -0.124 0.0966 0.249 CD8_TEM L2
ENSG00000079950 STX7 969673 sc-eQTL 1.38e-01 -0.157 0.105 0.249 CD8_TEM L2
ENSG00000112303 VNN2 719412 sc-eQTL 2.04e-01 0.134 0.105 0.249 CD8_TEM L2
ENSG00000112306 RPS12 668302 sc-eQTL 7.57e-01 0.0175 0.0566 0.249 CD8_TEM L2
ENSG00000118515 SGK1 -835241 sc-eQTL 9.97e-01 0.000391 0.0928 0.249 CD8_TEM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 669532 sc-eQTL 4.68e-01 0.0777 0.107 0.249 CD8_TEM L2
ENSG00000028839 TBPL1 -469299 sc-eQTL 6.12e-01 -0.0503 0.099 0.251 MAIT L2
ENSG00000079950 STX7 969673 sc-eQTL 1.13e-01 0.149 0.0935 0.251 MAIT L2
ENSG00000112303 VNN2 719412 sc-eQTL 7.68e-01 0.0283 0.0957 0.251 MAIT L2
ENSG00000112306 RPS12 668302 sc-eQTL 2.51e-02 -0.105 0.0465 0.251 MAIT L2
ENSG00000118515 SGK1 -835241 sc-eQTL 7.37e-01 -0.0223 0.0663 0.251 MAIT L2
ENSG00000146409 SLC18B1 669532 sc-eQTL 5.12e-01 0.0648 0.0986 0.251 MAIT L2
ENSG00000028839 TBPL1 -469299 sc-eQTL 9.99e-01 0.00011 0.109 0.244 NK_CD56bright L2
ENSG00000079950 STX7 969673 sc-eQTL 7.53e-01 0.0318 0.101 0.244 NK_CD56bright L2
ENSG00000112303 VNN2 719412 sc-eQTL 9.72e-01 -0.00362 0.102 0.244 NK_CD56bright L2
ENSG00000112306 RPS12 668302 sc-eQTL 1.51e-01 -0.0817 0.0567 0.244 NK_CD56bright L2
ENSG00000118515 SGK1 -835241 sc-eQTL 9.02e-01 0.0105 0.0852 0.244 NK_CD56bright L2
ENSG00000028839 TBPL1 -469299 sc-eQTL 5.25e-01 0.0543 0.0854 0.25 NK_CD56dim L2
ENSG00000079950 STX7 969673 sc-eQTL 9.64e-01 -0.00351 0.0782 0.25 NK_CD56dim L2
ENSG00000112303 VNN2 719412 sc-eQTL 3.45e-02 -0.206 0.0968 0.25 NK_CD56dim L2
ENSG00000112306 RPS12 668302 sc-eQTL 5.85e-01 -0.0212 0.0388 0.25 NK_CD56dim L2
ENSG00000118515 SGK1 -835241 sc-eQTL 6.46e-01 0.0396 0.086 0.25 NK_CD56dim L2
ENSG00000028839 TBPL1 -469299 sc-eQTL 6.29e-01 0.0529 0.109 0.247 NK_HLA L2
ENSG00000079950 STX7 969673 sc-eQTL 7.99e-01 0.0253 0.0994 0.247 NK_HLA L2
ENSG00000112303 VNN2 719412 sc-eQTL 3.46e-01 -0.0948 0.1 0.247 NK_HLA L2
ENSG00000112306 RPS12 668302 sc-eQTL 3.90e-01 0.0403 0.0468 0.247 NK_HLA L2
ENSG00000118515 SGK1 -835241 sc-eQTL 5.18e-01 -0.0599 0.0925 0.247 NK_HLA L2
ENSG00000028839 TBPL1 -469299 sc-eQTL 6.82e-01 0.0364 0.0889 0.25 NK_cytokine L2
ENSG00000079950 STX7 969673 sc-eQTL 3.31e-01 0.0837 0.0859 0.25 NK_cytokine L2
ENSG00000112303 VNN2 719412 sc-eQTL 2.42e-01 0.113 0.0965 0.25 NK_cytokine L2
ENSG00000112306 RPS12 668302 sc-eQTL 8.31e-01 0.0112 0.0525 0.25 NK_cytokine L2
ENSG00000118515 SGK1 -835241 sc-eQTL 7.14e-02 -0.157 0.0867 0.25 NK_cytokine L2
ENSG00000028839 TBPL1 -469299 sc-eQTL 8.04e-01 0.0297 0.119 0.252 PB L2
ENSG00000079950 STX7 969673 sc-eQTL 6.01e-01 -0.0445 0.0848 0.252 PB L2
ENSG00000112303 VNN2 719412 sc-eQTL 7.58e-01 -0.0321 0.104 0.252 PB L2
ENSG00000112306 RPS12 668302 sc-eQTL 1.70e-01 -0.0807 0.0584 0.252 PB L2
ENSG00000118515 SGK1 -835241 sc-eQTL 3.88e-01 0.0822 0.0949 0.252 PB L2
ENSG00000146409 SLC18B1 669532 sc-eQTL 3.42e-01 0.105 0.11 0.252 PB L2
ENSG00000028839 TBPL1 -469299 sc-eQTL 4.39e-01 -0.0778 0.1 0.246 Pro_T L2
ENSG00000079950 STX7 969673 sc-eQTL 7.24e-02 0.161 0.089 0.246 Pro_T L2
ENSG00000112303 VNN2 719412 sc-eQTL 5.25e-01 -0.0613 0.0961 0.246 Pro_T L2
ENSG00000112306 RPS12 668302 sc-eQTL 1.74e-01 -0.0494 0.0362 0.246 Pro_T L2
ENSG00000118515 SGK1 -835241 sc-eQTL 5.98e-01 0.0386 0.0729 0.246 Pro_T L2
ENSG00000146409 SLC18B1 669532 sc-eQTL 9.02e-01 0.0117 0.0942 0.246 Pro_T L2
ENSG00000028839 TBPL1 -469299 sc-eQTL 7.11e-01 0.0377 0.102 0.248 Treg L2
ENSG00000079950 STX7 969673 sc-eQTL 3.97e-02 0.196 0.0948 0.248 Treg L2
ENSG00000112303 VNN2 719412 sc-eQTL 7.63e-01 0.0243 0.0806 0.248 Treg L2
ENSG00000112306 RPS12 668302 sc-eQTL 7.72e-01 -0.0103 0.0356 0.248 Treg L2
ENSG00000118515 SGK1 -835241 sc-eQTL 3.35e-01 -0.0724 0.0749 0.248 Treg L2
ENSG00000146409 SLC18B1 669532 sc-eQTL 9.83e-01 0.00209 0.101 0.248 Treg L2
ENSG00000028839 TBPL1 -469299 sc-eQTL 8.35e-01 0.0217 0.104 0.266 cDC L2
ENSG00000079950 STX7 969673 sc-eQTL 9.92e-01 -0.000807 0.0817 0.266 cDC L2
ENSG00000093134 VNN3 748106 sc-eQTL 8.88e-01 -0.0115 0.0811 0.266 cDC L2
ENSG00000112299 VNN1 768816 sc-eQTL 2.94e-01 0.1 0.0951 0.266 cDC L2
ENSG00000112303 VNN2 719412 sc-eQTL 5.14e-01 -0.0607 0.0928 0.266 cDC L2
ENSG00000112306 RPS12 668302 sc-eQTL 3.15e-01 -0.0461 0.0458 0.266 cDC L2
ENSG00000118515 SGK1 -835241 sc-eQTL 1.39e-01 0.114 0.0769 0.266 cDC L2
ENSG00000146409 SLC18B1 669532 sc-eQTL 2.01e-01 0.116 0.0905 0.266 cDC L2
ENSG00000286438 AL591115.1 379743 sc-eQTL 4.61e-01 0.0536 0.0726 0.266 cDC L2
ENSG00000286887 AL355881.1 -813430 sc-eQTL 4.17e-02 0.181 0.0884 0.266 cDC L2
ENSG00000028839 TBPL1 -469299 sc-eQTL 6.46e-01 0.038 0.0827 0.248 cMono_IL1B L2
ENSG00000079950 STX7 969673 sc-eQTL 6.31e-01 -0.0302 0.0628 0.248 cMono_IL1B L2
ENSG00000093134 VNN3 748106 sc-eQTL 4.14e-01 0.0725 0.0886 0.248 cMono_IL1B L2
ENSG00000112299 VNN1 768816 sc-eQTL 2.37e-01 0.106 0.0893 0.248 cMono_IL1B L2
ENSG00000112303 VNN2 719412 sc-eQTL 1.92e-01 -0.0933 0.0713 0.248 cMono_IL1B L2
ENSG00000112306 RPS12 668302 sc-eQTL 6.84e-01 0.0162 0.0398 0.248 cMono_IL1B L2
ENSG00000118515 SGK1 -835241 sc-eQTL 9.29e-01 0.00529 0.0593 0.248 cMono_IL1B L2
ENSG00000146409 SLC18B1 669532 sc-eQTL 6.00e-01 0.0402 0.0767 0.248 cMono_IL1B L2
ENSG00000286887 AL355881.1 -813430 sc-eQTL 1.34e-01 0.12 0.0795 0.248 cMono_IL1B L2
ENSG00000028839 TBPL1 -469299 sc-eQTL 5.55e-01 0.0552 0.0935 0.248 cMono_S100A L2
ENSG00000079950 STX7 969673 sc-eQTL 1.08e-01 0.109 0.0672 0.248 cMono_S100A L2
ENSG00000093134 VNN3 748106 sc-eQTL 5.73e-01 0.0476 0.0844 0.248 cMono_S100A L2
ENSG00000112299 VNN1 768816 sc-eQTL 2.03e-01 0.117 0.0913 0.248 cMono_S100A L2
ENSG00000112303 VNN2 719412 sc-eQTL 4.06e-01 -0.0499 0.0599 0.248 cMono_S100A L2
ENSG00000112306 RPS12 668302 sc-eQTL 5.43e-01 0.0263 0.0432 0.248 cMono_S100A L2
ENSG00000118515 SGK1 -835241 sc-eQTL 8.50e-01 0.00934 0.0494 0.248 cMono_S100A L2
ENSG00000146409 SLC18B1 669532 sc-eQTL 7.28e-02 -0.143 0.0794 0.248 cMono_S100A L2
ENSG00000286887 AL355881.1 -813430 sc-eQTL 9.04e-01 -0.00949 0.0783 0.248 cMono_S100A L2
ENSG00000028839 TBPL1 -469299 sc-eQTL 2.30e-01 0.151 0.125 0.252 gdT L2
ENSG00000079950 STX7 969673 sc-eQTL 5.73e-01 -0.061 0.108 0.252 gdT L2
ENSG00000112303 VNN2 719412 sc-eQTL 3.47e-02 -0.251 0.118 0.252 gdT L2
ENSG00000112306 RPS12 668302 sc-eQTL 4.44e-01 -0.0349 0.0454 0.252 gdT L2
ENSG00000118515 SGK1 -835241 sc-eQTL 5.27e-01 0.0544 0.0858 0.252 gdT L2
ENSG00000146409 SLC18B1 669532 sc-eQTL 1.84e-01 -0.156 0.117 0.252 gdT L2
ENSG00000028839 TBPL1 -469299 sc-eQTL 3.24e-02 0.203 0.0941 0.253 intMono L2
ENSG00000079950 STX7 969673 sc-eQTL 7.11e-01 0.0337 0.0909 0.253 intMono L2
ENSG00000093134 VNN3 748106 sc-eQTL 9.86e-01 0.00157 0.0918 0.253 intMono L2
ENSG00000112299 VNN1 768816 sc-eQTL 5.06e-01 0.0604 0.0906 0.253 intMono L2
ENSG00000112303 VNN2 719412 sc-eQTL 1.72e-01 0.126 0.0918 0.253 intMono L2
ENSG00000112306 RPS12 668302 sc-eQTL 3.43e-01 -0.0381 0.04 0.253 intMono L2
ENSG00000118515 SGK1 -835241 sc-eQTL 8.14e-01 0.0158 0.0674 0.253 intMono L2
ENSG00000146409 SLC18B1 669532 sc-eQTL 5.65e-01 0.0562 0.0976 0.253 intMono L2
ENSG00000286887 AL355881.1 -813430 sc-eQTL 2.08e-01 0.117 0.093 0.253 intMono L2
ENSG00000028839 TBPL1 -469299 sc-eQTL 8.32e-01 0.0213 0.1 0.247 ncMono L2
ENSG00000079950 STX7 969673 sc-eQTL 9.25e-01 -0.00642 0.0678 0.247 ncMono L2
ENSG00000093134 VNN3 748106 sc-eQTL 9.13e-01 0.0105 0.0956 0.247 ncMono L2
ENSG00000112299 VNN1 768816 sc-eQTL 6.49e-01 0.0432 0.0949 0.247 ncMono L2
ENSG00000112303 VNN2 719412 sc-eQTL 5.83e-01 0.0502 0.0912 0.247 ncMono L2
ENSG00000112306 RPS12 668302 sc-eQTL 5.28e-01 0.0289 0.0457 0.247 ncMono L2
ENSG00000118515 SGK1 -835241 sc-eQTL 1.28e-01 0.0984 0.0644 0.247 ncMono L2
ENSG00000146409 SLC18B1 669532 sc-eQTL 3.03e-01 0.0833 0.0806 0.247 ncMono L2
ENSG00000286887 AL355881.1 -813430 sc-eQTL 4.25e-01 0.0682 0.0853 0.247 ncMono L2
ENSG00000028839 TBPL1 -469299 sc-eQTL 9.91e-01 0.00131 0.117 0.254 pDC L2
ENSG00000079950 STX7 969673 sc-eQTL 5.54e-01 -0.0463 0.0781 0.254 pDC L2
ENSG00000093134 VNN3 748106 sc-eQTL 2.41e-01 -0.0922 0.0783 0.254 pDC L2
ENSG00000112299 VNN1 768816 sc-eQTL 5.82e-01 0.0441 0.08 0.254 pDC L2
ENSG00000112303 VNN2 719412 sc-eQTL 5.29e-01 -0.06 0.0952 0.254 pDC L2
ENSG00000112306 RPS12 668302 sc-eQTL 5.61e-01 0.0382 0.0656 0.254 pDC L2
ENSG00000118515 SGK1 -835241 sc-eQTL 8.76e-01 0.0104 0.0667 0.254 pDC L2
ENSG00000146409 SLC18B1 669532 sc-eQTL 2.44e-01 -0.113 0.0968 0.254 pDC L2
ENSG00000286438 AL591115.1 379743 sc-eQTL 1.67e-01 0.128 0.0924 0.254 pDC L2
ENSG00000286887 AL355881.1 -813430 sc-eQTL 8.03e-01 0.0206 0.0825 0.254 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000028839 TBPL1 -469299 sc-eQTL 6.15e-02 0.185 0.0984 0.248 B_Memory LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 969673 sc-eQTL 4.30e-02 0.11 0.0541 0.248 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 719412 sc-eQTL 1.20e-01 0.134 0.0859 0.248 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 668302 sc-eQTL 8.69e-01 0.00811 0.0492 0.248 B_Memory LOneK1K
ENSG00000118515 SGK1 -835241 sc-eQTL 1.73e-01 0.105 0.0766 0.248 B_Memory LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 669532 sc-eQTL 8.15e-01 -0.0211 0.0903 0.248 B_Memory LOneK1K
ENSG00000028839 TBPL1 -469299 sc-eQTL 1.60e-01 0.131 0.0926 0.248 B_Naive LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 969673 sc-eQTL 3.66e-01 0.0379 0.0418 0.248 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 719412 sc-eQTL 5.14e-01 -0.0531 0.0813 0.248 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 668302 sc-eQTL 4.23e-01 0.0395 0.0492 0.248 B_Naive LOneK1K
ENSG00000118515 SGK1 -835241 sc-eQTL 2.38e-01 0.09 0.076 0.248 B_Naive LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 669532 sc-eQTL 6.12e-01 0.0471 0.0928 0.248 B_Naive LOneK1K
ENSG00000028839 TBPL1 -469299 sc-eQTL 5.70e-01 0.043 0.0756 0.248 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 969673 sc-eQTL 5.83e-01 0.0289 0.0526 0.248 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000093134 VNN3 748106 sc-eQTL 4.90e-01 0.0592 0.0856 0.248 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112299 VNN1 768816 sc-eQTL 1.37e-01 0.133 0.0889 0.248 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 719412 sc-eQTL 2.39e-01 -0.0695 0.0589 0.248 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 668302 sc-eQTL 6.19e-01 0.0202 0.0405 0.248 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000118515 SGK1 -835241 sc-eQTL 9.13e-01 -0.00605 0.0552 0.248 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 669532 sc-eQTL 6.42e-01 -0.0336 0.0721 0.248 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000286887 AL355881.1 -813430 sc-eQTL 3.99e-01 0.0638 0.0755 0.248 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000028839 TBPL1 -469299 sc-eQTL 1.97e-01 0.126 0.0973 0.25 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 969673 sc-eQTL 8.56e-01 0.0117 0.0644 0.25 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000093134 VNN3 748106 sc-eQTL 9.52e-01 -0.0057 0.0948 0.25 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112299 VNN1 768816 sc-eQTL 2.59e-01 0.106 0.0937 0.25 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 719412 sc-eQTL 3.44e-01 0.0838 0.0884 0.25 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 668302 sc-eQTL 8.92e-01 0.00513 0.0376 0.25 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000118515 SGK1 -835241 sc-eQTL 4.06e-01 0.0473 0.0568 0.25 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 669532 sc-eQTL 7.05e-01 0.0346 0.0912 0.25 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000286887 AL355881.1 -813430 sc-eQTL 3.02e-01 0.0852 0.0823 0.25 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000028839 TBPL1 -469299 sc-eQTL 4.29e-01 0.0621 0.0783 0.25 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 969673 sc-eQTL 7.07e-01 0.0277 0.0737 0.25 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 719412 sc-eQTL 3.75e-01 -0.0827 0.0931 0.25 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 668302 sc-eQTL 8.20e-01 -0.00867 0.0381 0.25 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000118515 SGK1 -835241 sc-eQTL 5.23e-01 -0.0503 0.0786 0.25 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000079950 STX7 969673 pQTL 0.0747 -0.0462 0.0259 0.0013 0.0 0.255
ENSG00000079950 STX7 969673 eQTL 0.00897 0.0487 0.0186 0.0 0.0 0.245
ENSG00000112299 VNN1 768816 pQTL 0.00362 0.117 0.04 0.0 0.0 0.255

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina