logo

Genes within 1Mb (chr6:133482544:C:T):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000028839 TBPL1 -469626 sc-eQTL 2.23e-01 0.114 0.0933 0.25 B L1
ENSG00000079950 STX7 969346 sc-eQTL 2.44e-01 0.0434 0.0372 0.25 B L1
ENSG00000112303 VNN2 719085 sc-eQTL 8.75e-01 -0.011 0.0701 0.25 B L1
ENSG00000112306 RPS12 667975 sc-eQTL 4.48e-01 0.0322 0.0424 0.25 B L1
ENSG00000118515 SGK1 -835568 sc-eQTL 1.53e-01 0.0934 0.0651 0.25 B L1
ENSG00000146409 SLC18B1 669205 sc-eQTL 3.04e-01 0.0917 0.089 0.25 B L1
ENSG00000028839 TBPL1 -469626 sc-eQTL 3.87e-01 0.0601 0.0694 0.25 CD4T L1
ENSG00000079950 STX7 969346 sc-eQTL 4.22e-02 0.146 0.0716 0.25 CD4T L1
ENSG00000112303 VNN2 719085 sc-eQTL 8.26e-01 -0.0138 0.0626 0.25 CD4T L1
ENSG00000112306 RPS12 667975 sc-eQTL 9.15e-01 -0.00457 0.0426 0.25 CD4T L1
ENSG00000118515 SGK1 -835568 sc-eQTL 6.19e-01 -0.0284 0.0572 0.25 CD4T L1
ENSG00000146409 SLC18B1 669205 sc-eQTL 3.14e-02 0.184 0.0852 0.25 CD4T L1
ENSG00000028839 TBPL1 -469626 sc-eQTL 4.28e-01 0.0545 0.0686 0.25 CD8T L1
ENSG00000079950 STX7 969346 sc-eQTL 9.99e-01 0.0001 0.0717 0.25 CD8T L1
ENSG00000112303 VNN2 719085 sc-eQTL 4.57e-01 -0.0623 0.0836 0.25 CD8T L1
ENSG00000112306 RPS12 667975 sc-eQTL 3.10e-01 -0.029 0.0285 0.25 CD8T L1
ENSG00000118515 SGK1 -835568 sc-eQTL 1.65e-01 -0.0611 0.0439 0.25 CD8T L1
ENSG00000146409 SLC18B1 669205 sc-eQTL 3.18e-01 0.0864 0.0863 0.25 CD8T L1
ENSG00000028839 TBPL1 -469626 sc-eQTL 9.98e-01 -0.000312 0.108 0.257 DC L1
ENSG00000079950 STX7 969346 sc-eQTL 6.68e-01 -0.0287 0.0668 0.257 DC L1
ENSG00000093134 VNN3 747779 sc-eQTL 4.99e-01 -0.0562 0.0828 0.257 DC L1
ENSG00000112299 VNN1 768489 sc-eQTL 1.65e-01 0.124 0.0891 0.257 DC L1
ENSG00000112303 VNN2 719085 sc-eQTL 8.83e-01 -0.0141 0.0958 0.257 DC L1
ENSG00000112306 RPS12 667975 sc-eQTL 3.53e-01 -0.0498 0.0536 0.257 DC L1
ENSG00000118515 SGK1 -835568 sc-eQTL 3.63e-01 0.0567 0.0622 0.257 DC L1
ENSG00000146409 SLC18B1 669205 sc-eQTL 7.88e-01 0.0229 0.085 0.257 DC L1
ENSG00000286438 AL591115.1 379416 sc-eQTL 1.83e-01 0.103 0.077 0.257 DC L1
ENSG00000286887 AL355881.1 -813757 sc-eQTL 2.90e-01 0.102 0.0961 0.257 DC L1
ENSG00000028839 TBPL1 -469626 sc-eQTL 2.05e-01 0.0939 0.0739 0.25 Mono L1
ENSG00000079950 STX7 969346 sc-eQTL 3.75e-01 0.044 0.0496 0.25 Mono L1
ENSG00000093134 VNN3 747779 sc-eQTL 8.60e-01 0.0151 0.0852 0.25 Mono L1
ENSG00000112299 VNN1 768489 sc-eQTL 2.32e-01 0.11 0.0914 0.25 Mono L1
ENSG00000112303 VNN2 719085 sc-eQTL 1.88e-01 -0.0851 0.0644 0.25 Mono L1
ENSG00000112306 RPS12 667975 sc-eQTL 6.44e-01 0.0179 0.0388 0.25 Mono L1
ENSG00000118515 SGK1 -835568 sc-eQTL 9.85e-01 0.001 0.0548 0.25 Mono L1
ENSG00000146409 SLC18B1 669205 sc-eQTL 5.34e-01 -0.0478 0.0767 0.25 Mono L1
ENSG00000286887 AL355881.1 -813757 sc-eQTL 3.68e-01 0.0679 0.0752 0.25 Mono L1
ENSG00000028839 TBPL1 -469626 sc-eQTL 4.38e-01 0.0626 0.0806 0.251 NK L1
ENSG00000079950 STX7 969346 sc-eQTL 7.42e-01 0.0246 0.0746 0.251 NK L1
ENSG00000112303 VNN2 719085 sc-eQTL 4.40e-01 -0.0717 0.0927 0.251 NK L1
ENSG00000112306 RPS12 667975 sc-eQTL 7.99e-01 -0.00977 0.0384 0.251 NK L1
ENSG00000118515 SGK1 -835568 sc-eQTL 3.15e-01 -0.0714 0.0709 0.251 NK L1
ENSG00000028839 TBPL1 -469626 sc-eQTL 4.58e-01 -0.069 0.0928 0.25 Other_T L1
ENSG00000079950 STX7 969346 sc-eQTL 2.44e-01 0.0852 0.0729 0.25 Other_T L1
ENSG00000112303 VNN2 719085 sc-eQTL 2.18e-01 -0.109 0.0881 0.25 Other_T L1
ENSG00000112306 RPS12 667975 sc-eQTL 1.55e-01 -0.0498 0.0349 0.25 Other_T L1
ENSG00000118515 SGK1 -835568 sc-eQTL 5.67e-01 0.037 0.0645 0.25 Other_T L1
ENSG00000146409 SLC18B1 669205 sc-eQTL 6.35e-01 0.0456 0.096 0.25 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000028839 TBPL1 -469626 sc-eQTL 6.11e-01 -0.0563 0.111 0.242 B_Activated L2
ENSG00000079950 STX7 969346 sc-eQTL 7.55e-01 -0.0296 0.0947 0.242 B_Activated L2
ENSG00000112303 VNN2 719085 sc-eQTL 5.54e-01 0.0596 0.101 0.242 B_Activated L2
ENSG00000112306 RPS12 667975 sc-eQTL 6.97e-01 0.021 0.054 0.242 B_Activated L2
ENSG00000118515 SGK1 -835568 sc-eQTL 3.30e-01 0.0938 0.0961 0.242 B_Activated L2
ENSG00000146409 SLC18B1 669205 sc-eQTL 2.74e-01 -0.103 0.0943 0.242 B_Activated L2
ENSG00000028839 TBPL1 -469626 sc-eQTL 7.10e-02 0.189 0.104 0.249 B_Intermediate L2
ENSG00000079950 STX7 969346 sc-eQTL 1.70e-02 0.143 0.0594 0.249 B_Intermediate L2
ENSG00000112303 VNN2 719085 sc-eQTL 8.90e-01 -0.0125 0.0907 0.249 B_Intermediate L2
ENSG00000112306 RPS12 667975 sc-eQTL 9.97e-01 0.0002 0.0555 0.249 B_Intermediate L2
ENSG00000118515 SGK1 -835568 sc-eQTL 5.60e-01 0.0561 0.096 0.249 B_Intermediate L2
ENSG00000146409 SLC18B1 669205 sc-eQTL 8.29e-01 0.0216 0.1 0.249 B_Intermediate L2
ENSG00000028839 TBPL1 -469626 sc-eQTL 5.40e-01 -0.061 0.0994 0.25 B_Memory L2
ENSG00000079950 STX7 969346 sc-eQTL 1.49e-02 0.174 0.0709 0.25 B_Memory L2
ENSG00000112303 VNN2 719085 sc-eQTL 8.60e-02 0.161 0.0935 0.25 B_Memory L2
ENSG00000112306 RPS12 667975 sc-eQTL 4.69e-01 0.0329 0.0453 0.25 B_Memory L2
ENSG00000118515 SGK1 -835568 sc-eQTL 5.62e-04 0.283 0.0809 0.25 B_Memory L2
ENSG00000146409 SLC18B1 669205 sc-eQTL 7.24e-01 0.0335 0.0946 0.25 B_Memory L2
ENSG00000028839 TBPL1 -469626 sc-eQTL 5.19e-01 0.061 0.0944 0.25 B_Naive1 L2
ENSG00000079950 STX7 969346 sc-eQTL 2.88e-01 0.0482 0.0453 0.25 B_Naive1 L2
ENSG00000112303 VNN2 719085 sc-eQTL 1.67e-01 -0.122 0.0877 0.25 B_Naive1 L2
ENSG00000112306 RPS12 667975 sc-eQTL 4.61e-01 0.037 0.0501 0.25 B_Naive1 L2
ENSG00000118515 SGK1 -835568 sc-eQTL 1.38e-01 0.116 0.0781 0.25 B_Naive1 L2
ENSG00000146409 SLC18B1 669205 sc-eQTL 9.36e-01 0.00776 0.0969 0.25 B_Naive1 L2
ENSG00000028839 TBPL1 -469626 sc-eQTL 2.93e-01 0.106 0.1 0.249 B_Naive2 L2
ENSG00000079950 STX7 969346 sc-eQTL 8.46e-01 0.0104 0.0534 0.249 B_Naive2 L2
ENSG00000112303 VNN2 719085 sc-eQTL 5.97e-01 0.0519 0.098 0.249 B_Naive2 L2
ENSG00000112306 RPS12 667975 sc-eQTL 4.05e-01 0.0433 0.0518 0.249 B_Naive2 L2
ENSG00000118515 SGK1 -835568 sc-eQTL 9.13e-01 0.0101 0.0918 0.249 B_Naive2 L2
ENSG00000146409 SLC18B1 669205 sc-eQTL 1.34e-01 0.148 0.0985 0.249 B_Naive2 L2
ENSG00000028839 TBPL1 -469626 sc-eQTL 2.41e-01 0.118 0.1 0.252 CD4_CTL L2
ENSG00000079950 STX7 969346 sc-eQTL 1.52e-01 0.143 0.0995 0.252 CD4_CTL L2
ENSG00000112303 VNN2 719085 sc-eQTL 5.20e-01 -0.0649 0.101 0.252 CD4_CTL L2
ENSG00000112306 RPS12 667975 sc-eQTL 6.03e-01 -0.0243 0.0466 0.252 CD4_CTL L2
ENSG00000118515 SGK1 -835568 sc-eQTL 1.97e-01 0.104 0.0805 0.252 CD4_CTL L2
ENSG00000146409 SLC18B1 669205 sc-eQTL 6.39e-01 0.0442 0.0939 0.252 CD4_CTL L2
ENSG00000028839 TBPL1 -469626 sc-eQTL 8.95e-01 -0.0105 0.08 0.25 CD4_Naive L2
ENSG00000079950 STX7 969346 sc-eQTL 1.40e-01 0.115 0.078 0.25 CD4_Naive L2
ENSG00000112303 VNN2 719085 sc-eQTL 6.47e-01 0.0333 0.0726 0.25 CD4_Naive L2
ENSG00000112306 RPS12 667975 sc-eQTL 9.18e-01 -0.00485 0.0471 0.25 CD4_Naive L2
ENSG00000118515 SGK1 -835568 sc-eQTL 6.45e-01 0.0267 0.0577 0.25 CD4_Naive L2
ENSG00000146409 SLC18B1 669205 sc-eQTL 2.09e-02 0.208 0.0896 0.25 CD4_Naive L2
ENSG00000028839 TBPL1 -469626 sc-eQTL 4.99e-01 -0.059 0.0871 0.25 CD4_TCM L2
ENSG00000079950 STX7 969346 sc-eQTL 2.73e-01 0.0961 0.0875 0.25 CD4_TCM L2
ENSG00000112303 VNN2 719085 sc-eQTL 1.98e-01 -0.111 0.0862 0.25 CD4_TCM L2
ENSG00000112306 RPS12 667975 sc-eQTL 1.05e-01 -0.0725 0.0446 0.25 CD4_TCM L2
ENSG00000118515 SGK1 -835568 sc-eQTL 7.45e-01 -0.0204 0.0627 0.25 CD4_TCM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 669205 sc-eQTL 2.46e-01 0.12 0.104 0.25 CD4_TCM L2
ENSG00000028839 TBPL1 -469626 sc-eQTL 9.26e-02 0.167 0.0991 0.25 CD4_TEM L2
ENSG00000079950 STX7 969346 sc-eQTL 1.47e-01 0.145 0.0994 0.25 CD4_TEM L2
ENSG00000112303 VNN2 719085 sc-eQTL 2.88e-01 0.102 0.0956 0.25 CD4_TEM L2
ENSG00000112306 RPS12 667975 sc-eQTL 3.02e-01 -0.0406 0.0392 0.25 CD4_TEM L2
ENSG00000118515 SGK1 -835568 sc-eQTL 8.17e-01 0.0157 0.0676 0.25 CD4_TEM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 669205 sc-eQTL 6.40e-01 0.0458 0.0977 0.25 CD4_TEM L2
ENSG00000028839 TBPL1 -469626 sc-eQTL 1.97e-01 0.115 0.0885 0.25 CD8_CTL L2
ENSG00000079950 STX7 969346 sc-eQTL 6.51e-01 -0.0376 0.083 0.25 CD8_CTL L2
ENSG00000112303 VNN2 719085 sc-eQTL 8.40e-01 -0.019 0.0943 0.25 CD8_CTL L2
ENSG00000112306 RPS12 667975 sc-eQTL 1.99e-01 -0.0648 0.0503 0.25 CD8_CTL L2
ENSG00000118515 SGK1 -835568 sc-eQTL 5.85e-01 0.0466 0.0852 0.25 CD8_CTL L2
ENSG00000146409 SLC18B1 669205 sc-eQTL 7.10e-01 0.0364 0.0978 0.25 CD8_CTL L2
ENSG00000028839 TBPL1 -469626 sc-eQTL 5.41e-01 0.0577 0.0943 0.25 CD8_Naive L2
ENSG00000079950 STX7 969346 sc-eQTL 5.85e-01 0.0549 0.1 0.25 CD8_Naive L2
ENSG00000112303 VNN2 719085 sc-eQTL 2.11e-01 -0.108 0.0864 0.25 CD8_Naive L2
ENSG00000112306 RPS12 667975 sc-eQTL 5.63e-01 -0.0288 0.0496 0.25 CD8_Naive L2
ENSG00000118515 SGK1 -835568 sc-eQTL 8.06e-02 -0.109 0.0619 0.25 CD8_Naive L2
ENSG00000146409 SLC18B1 669205 sc-eQTL 8.96e-01 0.013 0.0996 0.25 CD8_Naive L2
ENSG00000028839 TBPL1 -469626 sc-eQTL 7.60e-01 -0.0324 0.106 0.252 CD8_TCM L2
ENSG00000079950 STX7 969346 sc-eQTL 2.77e-01 0.106 0.0975 0.252 CD8_TCM L2
ENSG00000112303 VNN2 719085 sc-eQTL 5.67e-01 0.0557 0.097 0.252 CD8_TCM L2
ENSG00000112306 RPS12 667975 sc-eQTL 2.72e-01 -0.052 0.0472 0.252 CD8_TCM L2
ENSG00000118515 SGK1 -835568 sc-eQTL 5.48e-02 0.15 0.0776 0.252 CD8_TCM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 669205 sc-eQTL 2.76e-01 0.113 0.103 0.252 CD8_TCM L2
ENSG00000028839 TBPL1 -469626 sc-eQTL 2.43e-01 -0.115 0.0984 0.251 CD8_TEM L2
ENSG00000079950 STX7 969346 sc-eQTL 2.26e-01 -0.13 0.107 0.251 CD8_TEM L2
ENSG00000112303 VNN2 719085 sc-eQTL 2.44e-01 0.125 0.107 0.251 CD8_TEM L2
ENSG00000112306 RPS12 667975 sc-eQTL 7.15e-01 0.0211 0.0576 0.251 CD8_TEM L2
ENSG00000118515 SGK1 -835568 sc-eQTL 8.41e-01 -0.019 0.0944 0.251 CD8_TEM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 669205 sc-eQTL 4.43e-01 0.0836 0.109 0.251 CD8_TEM L2
ENSG00000028839 TBPL1 -469626 sc-eQTL 4.41e-01 -0.0774 0.1 0.253 MAIT L2
ENSG00000079950 STX7 969346 sc-eQTL 9.39e-02 0.159 0.0947 0.253 MAIT L2
ENSG00000112303 VNN2 719085 sc-eQTL 9.16e-01 0.0103 0.097 0.253 MAIT L2
ENSG00000112306 RPS12 667975 sc-eQTL 2.37e-02 -0.107 0.0471 0.253 MAIT L2
ENSG00000118515 SGK1 -835568 sc-eQTL 8.85e-01 -0.00969 0.0671 0.253 MAIT L2
ENSG00000146409 SLC18B1 669205 sc-eQTL 6.44e-01 0.0462 0.1 0.253 MAIT L2
ENSG00000028839 TBPL1 -469626 sc-eQTL 8.27e-01 0.024 0.11 0.247 NK_CD56bright L2
ENSG00000079950 STX7 969346 sc-eQTL 9.43e-01 0.00733 0.102 0.247 NK_CD56bright L2
ENSG00000112303 VNN2 719085 sc-eQTL 9.52e-01 0.00622 0.103 0.247 NK_CD56bright L2
ENSG00000112306 RPS12 667975 sc-eQTL 1.91e-01 -0.0752 0.0573 0.247 NK_CD56bright L2
ENSG00000118515 SGK1 -835568 sc-eQTL 7.60e-01 0.0263 0.086 0.247 NK_CD56bright L2
ENSG00000028839 TBPL1 -469626 sc-eQTL 4.89e-01 0.06 0.0865 0.252 NK_CD56dim L2
ENSG00000079950 STX7 969346 sc-eQTL 9.07e-01 -0.00925 0.0793 0.252 NK_CD56dim L2
ENSG00000112303 VNN2 719085 sc-eQTL 3.84e-02 -0.204 0.0981 0.252 NK_CD56dim L2
ENSG00000112306 RPS12 667975 sc-eQTL 5.63e-01 -0.0228 0.0393 0.252 NK_CD56dim L2
ENSG00000118515 SGK1 -835568 sc-eQTL 7.31e-01 0.03 0.0871 0.252 NK_CD56dim L2
ENSG00000028839 TBPL1 -469626 sc-eQTL 9.11e-01 0.0125 0.111 0.249 NK_HLA L2
ENSG00000079950 STX7 969346 sc-eQTL 7.86e-01 0.0274 0.101 0.249 NK_HLA L2
ENSG00000112303 VNN2 719085 sc-eQTL 3.57e-01 -0.0942 0.102 0.249 NK_HLA L2
ENSG00000112306 RPS12 667975 sc-eQTL 4.70e-01 0.0344 0.0475 0.249 NK_HLA L2
ENSG00000118515 SGK1 -835568 sc-eQTL 6.24e-01 -0.0462 0.094 0.249 NK_HLA L2
ENSG00000028839 TBPL1 -469626 sc-eQTL 6.46e-01 0.0415 0.09 0.252 NK_cytokine L2
ENSG00000079950 STX7 969346 sc-eQTL 2.40e-01 0.103 0.087 0.252 NK_cytokine L2
ENSG00000112303 VNN2 719085 sc-eQTL 2.54e-01 0.112 0.0978 0.252 NK_cytokine L2
ENSG00000112306 RPS12 667975 sc-eQTL 8.52e-01 0.00991 0.0532 0.252 NK_cytokine L2
ENSG00000118515 SGK1 -835568 sc-eQTL 9.52e-02 -0.147 0.088 0.252 NK_cytokine L2
ENSG00000028839 TBPL1 -469626 sc-eQTL 8.04e-01 0.0297 0.119 0.252 PB L2
ENSG00000079950 STX7 969346 sc-eQTL 6.01e-01 -0.0445 0.0848 0.252 PB L2
ENSG00000112303 VNN2 719085 sc-eQTL 7.58e-01 -0.0321 0.104 0.252 PB L2
ENSG00000112306 RPS12 667975 sc-eQTL 1.70e-01 -0.0807 0.0584 0.252 PB L2
ENSG00000118515 SGK1 -835568 sc-eQTL 3.88e-01 0.0822 0.0949 0.252 PB L2
ENSG00000146409 SLC18B1 669205 sc-eQTL 3.42e-01 0.105 0.11 0.252 PB L2
ENSG00000028839 TBPL1 -469626 sc-eQTL 4.16e-01 -0.0828 0.102 0.248 Pro_T L2
ENSG00000079950 STX7 969346 sc-eQTL 1.59e-01 0.128 0.0904 0.248 Pro_T L2
ENSG00000112303 VNN2 719085 sc-eQTL 5.04e-01 -0.0652 0.0974 0.248 Pro_T L2
ENSG00000112306 RPS12 667975 sc-eQTL 2.37e-01 -0.0436 0.0367 0.248 Pro_T L2
ENSG00000118515 SGK1 -835568 sc-eQTL 3.83e-01 0.0644 0.0738 0.248 Pro_T L2
ENSG00000146409 SLC18B1 669205 sc-eQTL 6.75e-01 0.0401 0.0954 0.248 Pro_T L2
ENSG00000028839 TBPL1 -469626 sc-eQTL 7.31e-01 0.0355 0.103 0.25 Treg L2
ENSG00000079950 STX7 969346 sc-eQTL 6.77e-02 0.177 0.0965 0.25 Treg L2
ENSG00000112303 VNN2 719085 sc-eQTL 7.95e-01 0.0213 0.0818 0.25 Treg L2
ENSG00000112306 RPS12 667975 sc-eQTL 9.93e-01 0.000334 0.0362 0.25 Treg L2
ENSG00000118515 SGK1 -835568 sc-eQTL 3.71e-01 -0.0682 0.0761 0.25 Treg L2
ENSG00000146409 SLC18B1 669205 sc-eQTL 9.22e-01 0.0101 0.102 0.25 Treg L2
ENSG00000028839 TBPL1 -469626 sc-eQTL 8.44e-01 0.0208 0.106 0.268 cDC L2
ENSG00000079950 STX7 969346 sc-eQTL 9.85e-01 0.00154 0.0829 0.268 cDC L2
ENSG00000093134 VNN3 747779 sc-eQTL 6.47e-01 -0.0377 0.0822 0.268 cDC L2
ENSG00000112299 VNN1 768489 sc-eQTL 3.10e-01 0.0983 0.0965 0.268 cDC L2
ENSG00000112303 VNN2 719085 sc-eQTL 6.74e-01 -0.0397 0.0942 0.268 cDC L2
ENSG00000112306 RPS12 667975 sc-eQTL 4.57e-01 -0.0346 0.0465 0.268 cDC L2
ENSG00000118515 SGK1 -835568 sc-eQTL 1.15e-01 0.123 0.0779 0.268 cDC L2
ENSG00000146409 SLC18B1 669205 sc-eQTL 2.52e-01 0.105 0.0919 0.268 cDC L2
ENSG00000286438 AL591115.1 379416 sc-eQTL 5.97e-01 0.039 0.0736 0.268 cDC L2
ENSG00000286887 AL355881.1 -813757 sc-eQTL 4.55e-02 0.181 0.0897 0.268 cDC L2
ENSG00000028839 TBPL1 -469626 sc-eQTL 5.05e-01 0.0561 0.0839 0.25 cMono_IL1B L2
ENSG00000079950 STX7 969346 sc-eQTL 5.91e-01 -0.0343 0.0637 0.25 cMono_IL1B L2
ENSG00000093134 VNN3 747779 sc-eQTL 4.83e-01 0.0632 0.09 0.25 cMono_IL1B L2
ENSG00000112299 VNN1 768489 sc-eQTL 1.94e-01 0.118 0.0905 0.25 cMono_IL1B L2
ENSG00000112303 VNN2 719085 sc-eQTL 2.00e-01 -0.0931 0.0724 0.25 cMono_IL1B L2
ENSG00000112306 RPS12 667975 sc-eQTL 5.66e-01 0.0232 0.0403 0.25 cMono_IL1B L2
ENSG00000118515 SGK1 -835568 sc-eQTL 8.18e-01 0.0139 0.0602 0.25 cMono_IL1B L2
ENSG00000146409 SLC18B1 669205 sc-eQTL 6.70e-01 0.0332 0.0778 0.25 cMono_IL1B L2
ENSG00000286887 AL355881.1 -813757 sc-eQTL 8.50e-02 0.139 0.0805 0.25 cMono_IL1B L2
ENSG00000028839 TBPL1 -469626 sc-eQTL 5.05e-01 0.0633 0.0947 0.25 cMono_S100A L2
ENSG00000079950 STX7 969346 sc-eQTL 8.95e-02 0.116 0.068 0.25 cMono_S100A L2
ENSG00000093134 VNN3 747779 sc-eQTL 8.44e-01 0.0169 0.0855 0.25 cMono_S100A L2
ENSG00000112299 VNN1 768489 sc-eQTL 1.67e-01 0.128 0.0924 0.25 cMono_S100A L2
ENSG00000112303 VNN2 719085 sc-eQTL 3.66e-01 -0.0549 0.0607 0.25 cMono_S100A L2
ENSG00000112306 RPS12 667975 sc-eQTL 4.25e-01 0.0349 0.0437 0.25 cMono_S100A L2
ENSG00000118515 SGK1 -835568 sc-eQTL 5.83e-01 0.0275 0.0501 0.25 cMono_S100A L2
ENSG00000146409 SLC18B1 669205 sc-eQTL 6.73e-02 -0.148 0.0804 0.25 cMono_S100A L2
ENSG00000286887 AL355881.1 -813757 sc-eQTL 9.72e-01 -0.00282 0.0793 0.25 cMono_S100A L2
ENSG00000028839 TBPL1 -469626 sc-eQTL 3.74e-01 0.114 0.127 0.255 gdT L2
ENSG00000079950 STX7 969346 sc-eQTL 3.88e-01 -0.0949 0.11 0.255 gdT L2
ENSG00000112303 VNN2 719085 sc-eQTL 2.75e-02 -0.266 0.12 0.255 gdT L2
ENSG00000112306 RPS12 667975 sc-eQTL 3.90e-01 -0.0398 0.0462 0.255 gdT L2
ENSG00000118515 SGK1 -835568 sc-eQTL 5.32e-01 0.0547 0.0873 0.255 gdT L2
ENSG00000146409 SLC18B1 669205 sc-eQTL 3.36e-01 -0.115 0.119 0.255 gdT L2
ENSG00000028839 TBPL1 -469626 sc-eQTL 2.02e-02 0.223 0.0952 0.256 intMono L2
ENSG00000079950 STX7 969346 sc-eQTL 7.63e-01 0.0279 0.0921 0.256 intMono L2
ENSG00000093134 VNN3 747779 sc-eQTL 9.44e-01 0.00651 0.093 0.256 intMono L2
ENSG00000112299 VNN1 768489 sc-eQTL 3.56e-01 0.0848 0.0918 0.256 intMono L2
ENSG00000112303 VNN2 719085 sc-eQTL 2.19e-01 0.115 0.0931 0.256 intMono L2
ENSG00000112306 RPS12 667975 sc-eQTL 4.44e-01 -0.0312 0.0406 0.256 intMono L2
ENSG00000118515 SGK1 -835568 sc-eQTL 7.00e-01 0.0263 0.0683 0.256 intMono L2
ENSG00000146409 SLC18B1 669205 sc-eQTL 6.11e-01 0.0504 0.0989 0.256 intMono L2
ENSG00000286887 AL355881.1 -813757 sc-eQTL 1.95e-01 0.123 0.0943 0.256 intMono L2
ENSG00000028839 TBPL1 -469626 sc-eQTL 6.37e-01 0.048 0.101 0.249 ncMono L2
ENSG00000079950 STX7 969346 sc-eQTL 9.71e-01 -0.00248 0.0686 0.249 ncMono L2
ENSG00000093134 VNN3 747779 sc-eQTL 9.02e-01 0.012 0.0968 0.249 ncMono L2
ENSG00000112299 VNN1 768489 sc-eQTL 5.04e-01 0.0643 0.096 0.249 ncMono L2
ENSG00000112303 VNN2 719085 sc-eQTL 6.99e-01 0.0357 0.0924 0.249 ncMono L2
ENSG00000112306 RPS12 667975 sc-eQTL 5.75e-01 0.026 0.0463 0.249 ncMono L2
ENSG00000118515 SGK1 -835568 sc-eQTL 6.61e-02 0.12 0.065 0.249 ncMono L2
ENSG00000146409 SLC18B1 669205 sc-eQTL 3.39e-01 0.0782 0.0817 0.249 ncMono L2
ENSG00000286887 AL355881.1 -813757 sc-eQTL 3.75e-01 0.0767 0.0864 0.249 ncMono L2
ENSG00000028839 TBPL1 -469626 sc-eQTL 9.18e-01 0.0122 0.119 0.254 pDC L2
ENSG00000079950 STX7 969346 sc-eQTL 4.73e-01 -0.0569 0.0791 0.254 pDC L2
ENSG00000093134 VNN3 747779 sc-eQTL 2.09e-01 -0.1 0.0793 0.254 pDC L2
ENSG00000112299 VNN1 768489 sc-eQTL 6.04e-01 0.0422 0.0811 0.254 pDC L2
ENSG00000112303 VNN2 719085 sc-eQTL 4.53e-01 -0.0726 0.0964 0.254 pDC L2
ENSG00000112306 RPS12 667975 sc-eQTL 5.35e-01 0.0413 0.0665 0.254 pDC L2
ENSG00000118515 SGK1 -835568 sc-eQTL 7.19e-01 0.0243 0.0676 0.254 pDC L2
ENSG00000146409 SLC18B1 669205 sc-eQTL 1.86e-01 -0.13 0.0979 0.254 pDC L2
ENSG00000286438 AL591115.1 379416 sc-eQTL 1.98e-01 0.121 0.0937 0.254 pDC L2
ENSG00000286887 AL355881.1 -813757 sc-eQTL 8.74e-01 0.0133 0.0836 0.254 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000028839 TBPL1 -469626 sc-eQTL 6.10e-02 0.188 0.1 0.25 B_Memory LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 969346 sc-eQTL 4.10e-02 0.113 0.0549 0.25 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 719085 sc-eQTL 1.32e-01 0.132 0.0873 0.25 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 667975 sc-eQTL 6.99e-01 0.0194 0.05 0.25 B_Memory LOneK1K
ENSG00000118515 SGK1 -835568 sc-eQTL 1.34e-01 0.117 0.0778 0.25 B_Memory LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 669205 sc-eQTL 1.00e+00 -5.11e-06 0.0918 0.25 B_Memory LOneK1K
ENSG00000028839 TBPL1 -469626 sc-eQTL 1.37e-01 0.14 0.0938 0.25 B_Naive LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 969346 sc-eQTL 3.07e-01 0.0434 0.0424 0.25 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 719085 sc-eQTL 4.80e-01 -0.0582 0.0824 0.25 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 667975 sc-eQTL 2.88e-01 0.053 0.0498 0.25 B_Naive LOneK1K
ENSG00000118515 SGK1 -835568 sc-eQTL 2.13e-01 0.0962 0.077 0.25 B_Naive LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 669205 sc-eQTL 4.56e-01 0.0703 0.094 0.25 B_Naive LOneK1K
ENSG00000028839 TBPL1 -469626 sc-eQTL 4.35e-01 0.0599 0.0766 0.25 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 969346 sc-eQTL 5.88e-01 0.0289 0.0533 0.25 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000093134 VNN3 747779 sc-eQTL 6.64e-01 0.0378 0.0869 0.25 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112299 VNN1 768489 sc-eQTL 1.07e-01 0.146 0.0901 0.25 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 719085 sc-eQTL 2.02e-01 -0.0765 0.0597 0.25 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 667975 sc-eQTL 4.76e-01 0.0293 0.0411 0.25 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000118515 SGK1 -835568 sc-eQTL 9.00e-01 0.00707 0.056 0.25 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 669205 sc-eQTL 5.50e-01 -0.0437 0.0731 0.25 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000286887 AL355881.1 -813757 sc-eQTL 2.57e-01 0.087 0.0765 0.25 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000028839 TBPL1 -469626 sc-eQTL 1.09e-01 0.158 0.0983 0.252 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 969346 sc-eQTL 7.99e-01 0.0167 0.0653 0.252 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000093134 VNN3 747779 sc-eQTL 9.88e-01 0.00145 0.096 0.252 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112299 VNN1 768489 sc-eQTL 1.73e-01 0.13 0.0947 0.252 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 719085 sc-eQTL 4.76e-01 0.064 0.0896 0.252 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 667975 sc-eQTL 8.72e-01 0.00615 0.0381 0.252 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000118515 SGK1 -835568 sc-eQTL 2.74e-01 0.063 0.0575 0.252 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 669205 sc-eQTL 7.56e-01 0.0288 0.0924 0.252 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000286887 AL355881.1 -813757 sc-eQTL 2.92e-01 0.088 0.0834 0.252 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000028839 TBPL1 -469626 sc-eQTL 4.32e-01 0.0625 0.0794 0.252 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 969346 sc-eQTL 6.33e-01 0.0357 0.0747 0.252 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 719085 sc-eQTL 3.51e-01 -0.0882 0.0944 0.252 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 667975 sc-eQTL 7.44e-01 -0.0126 0.0386 0.252 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000118515 SGK1 -835568 sc-eQTL 5.61e-01 -0.0464 0.0797 0.252 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000079950 STX7 969346 pQTL 0.0704 -0.0469 0.0259 0.00135 0.0 0.255
ENSG00000079950 STX7 969346 eQTL 0.00902 0.0486 0.0186 0.0 0.0 0.245
ENSG00000112299 VNN1 768489 pQTL 0.00245 0.121 0.04 0.0 0.0 0.255

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina