logo

Genes within 1Mb (chr6:133481873:C:G):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000028839 TBPL1 -470297 sc-eQTL 3.42e-01 -0.098 0.103 0.244 B L1
ENSG00000079950 STX7 968675 sc-eQTL 8.40e-01 0.00831 0.041 0.244 B L1
ENSG00000112303 VNN2 718414 sc-eQTL 1.49e-01 -0.111 0.0768 0.244 B L1
ENSG00000112306 RPS12 667304 sc-eQTL 5.48e-01 -0.028 0.0466 0.244 B L1
ENSG00000118515 SGK1 -836239 sc-eQTL 6.59e-01 0.0318 0.0719 0.244 B L1
ENSG00000146409 SLC18B1 668534 sc-eQTL 5.27e-01 -0.0621 0.0981 0.244 B L1
ENSG00000028839 TBPL1 -470297 sc-eQTL 9.98e-01 -0.000227 0.0753 0.244 CD4T L1
ENSG00000079950 STX7 968675 sc-eQTL 4.61e-01 -0.0578 0.0782 0.244 CD4T L1
ENSG00000112303 VNN2 718414 sc-eQTL 9.09e-01 0.00779 0.0678 0.244 CD4T L1
ENSG00000112306 RPS12 667304 sc-eQTL 5.44e-01 -0.028 0.0461 0.244 CD4T L1
ENSG00000118515 SGK1 -836239 sc-eQTL 3.96e-01 0.0526 0.0619 0.244 CD4T L1
ENSG00000146409 SLC18B1 668534 sc-eQTL 1.16e-01 -0.146 0.0927 0.244 CD4T L1
ENSG00000028839 TBPL1 -470297 sc-eQTL 3.72e-01 -0.0681 0.0761 0.244 CD8T L1
ENSG00000079950 STX7 968675 sc-eQTL 3.29e-01 -0.0777 0.0794 0.244 CD8T L1
ENSG00000112303 VNN2 718414 sc-eQTL 2.27e-01 -0.112 0.0926 0.244 CD8T L1
ENSG00000112306 RPS12 667304 sc-eQTL 8.81e-01 -0.00476 0.0317 0.244 CD8T L1
ENSG00000118515 SGK1 -836239 sc-eQTL 7.67e-01 0.0145 0.0489 0.244 CD8T L1
ENSG00000146409 SLC18B1 668534 sc-eQTL 1.56e-01 -0.136 0.0955 0.244 CD8T L1
ENSG00000028839 TBPL1 -470297 sc-eQTL 9.69e-01 0.00443 0.115 0.234 DC L1
ENSG00000079950 STX7 968675 sc-eQTL 3.27e-01 -0.0701 0.0714 0.234 DC L1
ENSG00000093134 VNN3 747108 sc-eQTL 6.23e-01 0.0436 0.0886 0.234 DC L1
ENSG00000112299 VNN1 767818 sc-eQTL 3.39e-02 -0.202 0.0947 0.234 DC L1
ENSG00000112303 VNN2 718414 sc-eQTL 3.22e-01 -0.101 0.102 0.234 DC L1
ENSG00000112306 RPS12 667304 sc-eQTL 6.01e-01 -0.03 0.0574 0.234 DC L1
ENSG00000118515 SGK1 -836239 sc-eQTL 5.38e-01 -0.0411 0.0666 0.234 DC L1
ENSG00000146409 SLC18B1 668534 sc-eQTL 8.47e-01 0.0176 0.0909 0.234 DC L1
ENSG00000286438 AL591115.1 378745 sc-eQTL 4.06e-01 -0.0688 0.0826 0.234 DC L1
ENSG00000286887 AL355881.1 -814428 sc-eQTL 4.76e-01 0.0735 0.103 0.234 DC L1
ENSG00000028839 TBPL1 -470297 sc-eQTL 5.28e-01 -0.0504 0.0796 0.244 Mono L1
ENSG00000079950 STX7 968675 sc-eQTL 9.91e-01 0.000626 0.0533 0.244 Mono L1
ENSG00000093134 VNN3 747108 sc-eQTL 6.09e-01 -0.0469 0.0915 0.244 Mono L1
ENSG00000112299 VNN1 767818 sc-eQTL 6.30e-01 0.0475 0.0984 0.244 Mono L1
ENSG00000112303 VNN2 718414 sc-eQTL 4.40e-02 -0.139 0.0688 0.244 Mono L1
ENSG00000112306 RPS12 667304 sc-eQTL 5.06e-01 0.0277 0.0416 0.244 Mono L1
ENSG00000118515 SGK1 -836239 sc-eQTL 2.62e-01 0.0659 0.0586 0.244 Mono L1
ENSG00000146409 SLC18B1 668534 sc-eQTL 4.51e-02 -0.164 0.0816 0.244 Mono L1
ENSG00000286887 AL355881.1 -814428 sc-eQTL 2.57e-02 0.18 0.08 0.244 Mono L1
ENSG00000028839 TBPL1 -470297 sc-eQTL 8.65e-01 -0.015 0.0881 0.242 NK L1
ENSG00000079950 STX7 968675 sc-eQTL 1.19e-01 -0.127 0.081 0.242 NK L1
ENSG00000112303 VNN2 718414 sc-eQTL 5.56e-01 0.0597 0.101 0.242 NK L1
ENSG00000112306 RPS12 667304 sc-eQTL 8.01e-01 0.0106 0.042 0.242 NK L1
ENSG00000118515 SGK1 -836239 sc-eQTL 1.33e-02 0.191 0.0765 0.242 NK L1
ENSG00000028839 TBPL1 -470297 sc-eQTL 2.09e-01 0.128 0.101 0.244 Other_T L1
ENSG00000079950 STX7 968675 sc-eQTL 3.96e-01 -0.0679 0.0798 0.244 Other_T L1
ENSG00000112303 VNN2 718414 sc-eQTL 5.98e-01 0.051 0.0967 0.244 Other_T L1
ENSG00000112306 RPS12 667304 sc-eQTL 1.94e-01 0.0498 0.0382 0.244 Other_T L1
ENSG00000118515 SGK1 -836239 sc-eQTL 7.08e-02 0.127 0.07 0.244 Other_T L1
ENSG00000146409 SLC18B1 668534 sc-eQTL 4.89e-01 -0.0728 0.105 0.244 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000028839 TBPL1 -470297 sc-eQTL 6.20e-01 0.0608 0.122 0.245 B_Activated L2
ENSG00000079950 STX7 968675 sc-eQTL 8.10e-01 0.0253 0.105 0.245 B_Activated L2
ENSG00000112303 VNN2 718414 sc-eQTL 8.99e-01 -0.0142 0.112 0.245 B_Activated L2
ENSG00000112306 RPS12 667304 sc-eQTL 1.24e-01 -0.0917 0.0594 0.245 B_Activated L2
ENSG00000118515 SGK1 -836239 sc-eQTL 6.38e-01 0.0502 0.107 0.245 B_Activated L2
ENSG00000146409 SLC18B1 668534 sc-eQTL 6.61e-01 -0.046 0.105 0.245 B_Activated L2
ENSG00000028839 TBPL1 -470297 sc-eQTL 7.24e-01 -0.0396 0.112 0.245 B_Intermediate L2
ENSG00000079950 STX7 968675 sc-eQTL 2.37e-01 -0.0762 0.0642 0.245 B_Intermediate L2
ENSG00000112303 VNN2 718414 sc-eQTL 1.93e-01 -0.126 0.0966 0.245 B_Intermediate L2
ENSG00000112306 RPS12 667304 sc-eQTL 9.73e-01 0.00203 0.0594 0.245 B_Intermediate L2
ENSG00000118515 SGK1 -836239 sc-eQTL 1.73e-01 0.14 0.102 0.245 B_Intermediate L2
ENSG00000146409 SLC18B1 668534 sc-eQTL 6.96e-01 -0.0419 0.107 0.245 B_Intermediate L2
ENSG00000028839 TBPL1 -470297 sc-eQTL 5.13e-01 0.07 0.107 0.244 B_Memory L2
ENSG00000079950 STX7 968675 sc-eQTL 5.89e-01 -0.0419 0.0773 0.244 B_Memory L2
ENSG00000112303 VNN2 718414 sc-eQTL 8.95e-03 -0.263 0.0995 0.244 B_Memory L2
ENSG00000112306 RPS12 667304 sc-eQTL 6.18e-01 -0.0244 0.0487 0.244 B_Memory L2
ENSG00000118515 SGK1 -836239 sc-eQTL 9.48e-01 0.00582 0.0894 0.244 B_Memory L2
ENSG00000146409 SLC18B1 668534 sc-eQTL 2.77e-01 0.111 0.101 0.244 B_Memory L2
ENSG00000028839 TBPL1 -470297 sc-eQTL 1.31e-01 -0.158 0.104 0.244 B_Naive1 L2
ENSG00000079950 STX7 968675 sc-eQTL 5.95e-01 0.0268 0.0504 0.244 B_Naive1 L2
ENSG00000112303 VNN2 718414 sc-eQTL 1.21e-01 0.151 0.0974 0.244 B_Naive1 L2
ENSG00000112306 RPS12 667304 sc-eQTL 5.42e-01 -0.034 0.0557 0.244 B_Naive1 L2
ENSG00000118515 SGK1 -836239 sc-eQTL 7.52e-01 -0.0275 0.0872 0.244 B_Naive1 L2
ENSG00000146409 SLC18B1 668534 sc-eQTL 5.35e-01 -0.0669 0.107 0.244 B_Naive1 L2
ENSG00000028839 TBPL1 -470297 sc-eQTL 5.12e-02 -0.217 0.111 0.242 B_Naive2 L2
ENSG00000079950 STX7 968675 sc-eQTL 7.84e-01 0.0163 0.0593 0.242 B_Naive2 L2
ENSG00000112303 VNN2 718414 sc-eQTL 1.18e-01 -0.17 0.108 0.242 B_Naive2 L2
ENSG00000112306 RPS12 667304 sc-eQTL 4.18e-01 -0.0468 0.0576 0.242 B_Naive2 L2
ENSG00000118515 SGK1 -836239 sc-eQTL 6.88e-01 -0.041 0.102 0.242 B_Naive2 L2
ENSG00000146409 SLC18B1 668534 sc-eQTL 1.14e-01 -0.174 0.109 0.242 B_Naive2 L2
ENSG00000028839 TBPL1 -470297 sc-eQTL 6.63e-01 0.0475 0.109 0.239 CD4_CTL L2
ENSG00000079950 STX7 968675 sc-eQTL 8.73e-01 -0.0172 0.108 0.239 CD4_CTL L2
ENSG00000112303 VNN2 718414 sc-eQTL 1.92e-01 -0.142 0.109 0.239 CD4_CTL L2
ENSG00000112306 RPS12 667304 sc-eQTL 8.22e-01 0.0114 0.0504 0.239 CD4_CTL L2
ENSG00000118515 SGK1 -836239 sc-eQTL 8.90e-01 -0.0121 0.0873 0.239 CD4_CTL L2
ENSG00000146409 SLC18B1 668534 sc-eQTL 9.89e-01 -0.00135 0.102 0.239 CD4_CTL L2
ENSG00000028839 TBPL1 -470297 sc-eQTL 7.39e-01 -0.0287 0.086 0.244 CD4_Naive L2
ENSG00000079950 STX7 968675 sc-eQTL 7.37e-01 0.0283 0.0844 0.244 CD4_Naive L2
ENSG00000112303 VNN2 718414 sc-eQTL 9.44e-01 -0.00551 0.0782 0.244 CD4_Naive L2
ENSG00000112306 RPS12 667304 sc-eQTL 7.45e-01 -0.0165 0.0507 0.244 CD4_Naive L2
ENSG00000118515 SGK1 -836239 sc-eQTL 5.47e-01 0.0374 0.062 0.244 CD4_Naive L2
ENSG00000146409 SLC18B1 668534 sc-eQTL 2.18e-01 -0.12 0.0973 0.244 CD4_Naive L2
ENSG00000028839 TBPL1 -470297 sc-eQTL 7.29e-01 0.0323 0.0929 0.244 CD4_TCM L2
ENSG00000079950 STX7 968675 sc-eQTL 2.76e-01 -0.102 0.0933 0.244 CD4_TCM L2
ENSG00000112303 VNN2 718414 sc-eQTL 5.45e-01 0.0559 0.0922 0.244 CD4_TCM L2
ENSG00000112306 RPS12 667304 sc-eQTL 8.39e-01 0.00972 0.0478 0.244 CD4_TCM L2
ENSG00000118515 SGK1 -836239 sc-eQTL 6.78e-01 0.0278 0.0669 0.244 CD4_TCM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 668534 sc-eQTL 6.59e-02 -0.203 0.11 0.244 CD4_TCM L2
ENSG00000028839 TBPL1 -470297 sc-eQTL 7.64e-01 -0.0323 0.107 0.244 CD4_TEM L2
ENSG00000079950 STX7 968675 sc-eQTL 8.98e-01 -0.0138 0.108 0.244 CD4_TEM L2
ENSG00000112303 VNN2 718414 sc-eQTL 9.46e-01 -0.00694 0.103 0.244 CD4_TEM L2
ENSG00000112306 RPS12 667304 sc-eQTL 8.76e-01 0.00663 0.0423 0.244 CD4_TEM L2
ENSG00000118515 SGK1 -836239 sc-eQTL 1.62e-01 0.102 0.0724 0.244 CD4_TEM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 668534 sc-eQTL 6.65e-01 -0.0456 0.105 0.244 CD4_TEM L2
ENSG00000028839 TBPL1 -470297 sc-eQTL 2.02e-01 -0.124 0.0969 0.244 CD8_CTL L2
ENSG00000079950 STX7 968675 sc-eQTL 3.69e-01 -0.0818 0.0907 0.244 CD8_CTL L2
ENSG00000112303 VNN2 718414 sc-eQTL 1.03e-01 -0.168 0.103 0.244 CD8_CTL L2
ENSG00000112306 RPS12 667304 sc-eQTL 5.73e-01 0.0312 0.0552 0.244 CD8_CTL L2
ENSG00000118515 SGK1 -836239 sc-eQTL 4.85e-01 0.0653 0.0933 0.244 CD8_CTL L2
ENSG00000146409 SLC18B1 668534 sc-eQTL 2.55e-01 -0.122 0.107 0.244 CD8_CTL L2
ENSG00000028839 TBPL1 -470297 sc-eQTL 3.28e-01 0.098 0.1 0.244 CD8_Naive L2
ENSG00000079950 STX7 968675 sc-eQTL 2.24e-02 -0.243 0.106 0.244 CD8_Naive L2
ENSG00000112303 VNN2 718414 sc-eQTL 6.61e-01 0.0405 0.0921 0.244 CD8_Naive L2
ENSG00000112306 RPS12 667304 sc-eQTL 4.53e-01 -0.0397 0.0527 0.244 CD8_Naive L2
ENSG00000118515 SGK1 -836239 sc-eQTL 1.39e-01 0.098 0.0659 0.244 CD8_Naive L2
ENSG00000146409 SLC18B1 668534 sc-eQTL 8.30e-02 -0.183 0.105 0.244 CD8_Naive L2
ENSG00000028839 TBPL1 -470297 sc-eQTL 8.58e-01 0.0211 0.118 0.234 CD8_TCM L2
ENSG00000079950 STX7 968675 sc-eQTL 8.98e-01 0.0139 0.109 0.234 CD8_TCM L2
ENSG00000112303 VNN2 718414 sc-eQTL 9.67e-01 -0.00444 0.108 0.234 CD8_TCM L2
ENSG00000112306 RPS12 667304 sc-eQTL 6.58e-01 0.0234 0.0527 0.234 CD8_TCM L2
ENSG00000118515 SGK1 -836239 sc-eQTL 7.53e-01 0.0275 0.0873 0.234 CD8_TCM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 668534 sc-eQTL 1.59e-01 -0.163 0.115 0.234 CD8_TCM L2
ENSG00000028839 TBPL1 -470297 sc-eQTL 7.38e-01 -0.0342 0.102 0.253 CD8_TEM L2
ENSG00000079950 STX7 968675 sc-eQTL 1.71e-02 0.264 0.11 0.253 CD8_TEM L2
ENSG00000112303 VNN2 718414 sc-eQTL 3.04e-01 -0.114 0.11 0.253 CD8_TEM L2
ENSG00000112306 RPS12 667304 sc-eQTL 9.97e-01 -0.000261 0.0596 0.253 CD8_TEM L2
ENSG00000118515 SGK1 -836239 sc-eQTL 1.86e-01 -0.129 0.0972 0.253 CD8_TEM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 668534 sc-eQTL 7.39e-01 -0.0375 0.113 0.253 CD8_TEM L2
ENSG00000028839 TBPL1 -470297 sc-eQTL 1.95e-03 0.331 0.106 0.245 MAIT L2
ENSG00000079950 STX7 968675 sc-eQTL 4.90e-01 -0.0709 0.103 0.245 MAIT L2
ENSG00000112303 VNN2 718414 sc-eQTL 5.90e-01 -0.0563 0.104 0.245 MAIT L2
ENSG00000112306 RPS12 667304 sc-eQTL 2.32e-01 0.0613 0.0512 0.245 MAIT L2
ENSG00000118515 SGK1 -836239 sc-eQTL 6.52e-02 0.133 0.0717 0.245 MAIT L2
ENSG00000146409 SLC18B1 668534 sc-eQTL 5.91e-01 -0.0579 0.108 0.245 MAIT L2
ENSG00000028839 TBPL1 -470297 sc-eQTL 7.41e-01 0.0385 0.116 0.24 NK_CD56bright L2
ENSG00000079950 STX7 968675 sc-eQTL 5.37e-01 -0.0667 0.108 0.24 NK_CD56bright L2
ENSG00000112303 VNN2 718414 sc-eQTL 8.89e-01 0.0153 0.11 0.24 NK_CD56bright L2
ENSG00000112306 RPS12 667304 sc-eQTL 1.97e-01 -0.0788 0.0608 0.24 NK_CD56bright L2
ENSG00000118515 SGK1 -836239 sc-eQTL 1.00e-01 0.15 0.0907 0.24 NK_CD56bright L2
ENSG00000028839 TBPL1 -470297 sc-eQTL 5.76e-01 0.0531 0.0949 0.239 NK_CD56dim L2
ENSG00000079950 STX7 968675 sc-eQTL 1.25e-01 -0.133 0.0864 0.239 NK_CD56dim L2
ENSG00000112303 VNN2 718414 sc-eQTL 1.16e-01 0.17 0.108 0.239 NK_CD56dim L2
ENSG00000112306 RPS12 667304 sc-eQTL 8.43e-01 0.00854 0.0431 0.239 NK_CD56dim L2
ENSG00000118515 SGK1 -836239 sc-eQTL 5.15e-01 0.0623 0.0955 0.239 NK_CD56dim L2
ENSG00000028839 TBPL1 -470297 sc-eQTL 5.52e-01 0.0707 0.119 0.242 NK_HLA L2
ENSG00000079950 STX7 968675 sc-eQTL 5.14e-01 -0.0706 0.108 0.242 NK_HLA L2
ENSG00000112303 VNN2 718414 sc-eQTL 6.82e-01 -0.045 0.109 0.242 NK_HLA L2
ENSG00000112306 RPS12 667304 sc-eQTL 9.69e-01 0.00195 0.051 0.242 NK_HLA L2
ENSG00000118515 SGK1 -836239 sc-eQTL 4.45e-01 -0.0771 0.101 0.242 NK_HLA L2
ENSG00000028839 TBPL1 -470297 sc-eQTL 9.30e-01 -0.0086 0.0981 0.239 NK_cytokine L2
ENSG00000079950 STX7 968675 sc-eQTL 9.76e-01 0.00292 0.095 0.239 NK_cytokine L2
ENSG00000112303 VNN2 718414 sc-eQTL 9.60e-01 -0.00537 0.107 0.239 NK_cytokine L2
ENSG00000112306 RPS12 667304 sc-eQTL 7.49e-01 -0.0186 0.0579 0.239 NK_cytokine L2
ENSG00000118515 SGK1 -836239 sc-eQTL 2.97e-02 0.209 0.0954 0.239 NK_cytokine L2
ENSG00000028839 TBPL1 -470297 sc-eQTL 2.78e-01 0.143 0.131 0.248 PB L2
ENSG00000079950 STX7 968675 sc-eQTL 9.43e-01 -0.00676 0.094 0.248 PB L2
ENSG00000112303 VNN2 718414 sc-eQTL 3.80e-01 -0.101 0.114 0.248 PB L2
ENSG00000112306 RPS12 667304 sc-eQTL 5.07e-01 0.0433 0.065 0.248 PB L2
ENSG00000118515 SGK1 -836239 sc-eQTL 2.00e-01 0.135 0.105 0.248 PB L2
ENSG00000146409 SLC18B1 668534 sc-eQTL 8.10e-01 -0.0295 0.122 0.248 PB L2
ENSG00000028839 TBPL1 -470297 sc-eQTL 5.32e-01 -0.0681 0.109 0.246 Pro_T L2
ENSG00000079950 STX7 968675 sc-eQTL 5.08e-01 -0.0644 0.0971 0.246 Pro_T L2
ENSG00000112303 VNN2 718414 sc-eQTL 5.31e-01 -0.0654 0.104 0.246 Pro_T L2
ENSG00000112306 RPS12 667304 sc-eQTL 7.59e-01 0.0121 0.0394 0.246 Pro_T L2
ENSG00000118515 SGK1 -836239 sc-eQTL 8.31e-01 -0.0169 0.0791 0.246 Pro_T L2
ENSG00000146409 SLC18B1 668534 sc-eQTL 9.21e-01 -0.0102 0.102 0.246 Pro_T L2
ENSG00000028839 TBPL1 -470297 sc-eQTL 7.40e-01 -0.0366 0.11 0.244 Treg L2
ENSG00000079950 STX7 968675 sc-eQTL 7.87e-01 0.0281 0.104 0.244 Treg L2
ENSG00000112303 VNN2 718414 sc-eQTL 1.34e-01 -0.131 0.0869 0.244 Treg L2
ENSG00000112306 RPS12 667304 sc-eQTL 6.91e-01 -0.0154 0.0386 0.244 Treg L2
ENSG00000118515 SGK1 -836239 sc-eQTL 4.16e-01 0.0663 0.0813 0.244 Treg L2
ENSG00000146409 SLC18B1 668534 sc-eQTL 4.57e-01 0.0813 0.109 0.244 Treg L2
ENSG00000028839 TBPL1 -470297 sc-eQTL 9.51e-01 -0.00713 0.116 0.234 cDC L2
ENSG00000079950 STX7 968675 sc-eQTL 8.31e-01 0.0195 0.0911 0.234 cDC L2
ENSG00000093134 VNN3 747108 sc-eQTL 8.60e-01 -0.016 0.0905 0.234 cDC L2
ENSG00000112299 VNN1 767818 sc-eQTL 6.30e-02 -0.197 0.105 0.234 cDC L2
ENSG00000112303 VNN2 718414 sc-eQTL 1.23e-01 -0.16 0.103 0.234 cDC L2
ENSG00000112306 RPS12 667304 sc-eQTL 3.42e-01 -0.0486 0.051 0.234 cDC L2
ENSG00000118515 SGK1 -836239 sc-eQTL 9.04e-01 -0.0104 0.0862 0.234 cDC L2
ENSG00000146409 SLC18B1 668534 sc-eQTL 2.90e-01 -0.107 0.101 0.234 cDC L2
ENSG00000286438 AL591115.1 378745 sc-eQTL 9.34e-01 -0.00669 0.081 0.234 cDC L2
ENSG00000286887 AL355881.1 -814428 sc-eQTL 6.24e-01 0.0489 0.0996 0.234 cDC L2
ENSG00000028839 TBPL1 -470297 sc-eQTL 2.13e-01 -0.114 0.0915 0.244 cMono_IL1B L2
ENSG00000079950 STX7 968675 sc-eQTL 6.57e-01 -0.0309 0.0696 0.244 cMono_IL1B L2
ENSG00000093134 VNN3 747108 sc-eQTL 8.70e-01 -0.0162 0.0985 0.244 cMono_IL1B L2
ENSG00000112299 VNN1 767818 sc-eQTL 6.92e-01 0.0394 0.0993 0.244 cMono_IL1B L2
ENSG00000112303 VNN2 718414 sc-eQTL 1.12e-01 -0.126 0.079 0.244 cMono_IL1B L2
ENSG00000112306 RPS12 667304 sc-eQTL 6.86e-01 0.0179 0.0441 0.244 cMono_IL1B L2
ENSG00000118515 SGK1 -836239 sc-eQTL 6.09e-01 0.0337 0.0658 0.244 cMono_IL1B L2
ENSG00000146409 SLC18B1 668534 sc-eQTL 1.10e-01 -0.136 0.0846 0.244 cMono_IL1B L2
ENSG00000286887 AL355881.1 -814428 sc-eQTL 1.00e-01 0.145 0.0881 0.244 cMono_IL1B L2
ENSG00000028839 TBPL1 -470297 sc-eQTL 5.00e-01 0.0703 0.104 0.244 cMono_S100A L2
ENSG00000079950 STX7 968675 sc-eQTL 9.72e-01 0.00265 0.0752 0.244 cMono_S100A L2
ENSG00000093134 VNN3 747108 sc-eQTL 1.34e-01 -0.14 0.0935 0.244 cMono_S100A L2
ENSG00000112299 VNN1 767818 sc-eQTL 6.90e-01 -0.0407 0.102 0.244 cMono_S100A L2
ENSG00000112303 VNN2 718414 sc-eQTL 6.18e-03 -0.182 0.0656 0.244 cMono_S100A L2
ENSG00000112306 RPS12 667304 sc-eQTL 2.56e-01 0.0546 0.048 0.244 cMono_S100A L2
ENSG00000118515 SGK1 -836239 sc-eQTL 1.70e-01 0.0754 0.0548 0.244 cMono_S100A L2
ENSG00000146409 SLC18B1 668534 sc-eQTL 1.02e-01 -0.145 0.0885 0.244 cMono_S100A L2
ENSG00000286887 AL355881.1 -814428 sc-eQTL 5.29e-01 0.0548 0.087 0.244 cMono_S100A L2
ENSG00000028839 TBPL1 -470297 sc-eQTL 4.97e-01 -0.095 0.139 0.252 gdT L2
ENSG00000079950 STX7 968675 sc-eQTL 2.98e-01 -0.125 0.12 0.252 gdT L2
ENSG00000112303 VNN2 718414 sc-eQTL 4.84e-03 0.37 0.129 0.252 gdT L2
ENSG00000112306 RPS12 667304 sc-eQTL 6.15e-01 0.0254 0.0505 0.252 gdT L2
ENSG00000118515 SGK1 -836239 sc-eQTL 1.59e-01 0.134 0.0948 0.252 gdT L2
ENSG00000146409 SLC18B1 668534 sc-eQTL 6.45e-01 -0.0603 0.131 0.252 gdT L2
ENSG00000028839 TBPL1 -470297 sc-eQTL 6.09e-01 -0.0546 0.107 0.236 intMono L2
ENSG00000079950 STX7 968675 sc-eQTL 6.40e-01 0.0476 0.102 0.236 intMono L2
ENSG00000093134 VNN3 747108 sc-eQTL 5.31e-01 -0.0645 0.103 0.236 intMono L2
ENSG00000112299 VNN1 767818 sc-eQTL 8.75e-01 -0.016 0.102 0.236 intMono L2
ENSG00000112303 VNN2 718414 sc-eQTL 1.74e-01 -0.14 0.103 0.236 intMono L2
ENSG00000112306 RPS12 667304 sc-eQTL 6.90e-01 0.0179 0.0449 0.236 intMono L2
ENSG00000118515 SGK1 -836239 sc-eQTL 3.23e-01 0.0746 0.0753 0.236 intMono L2
ENSG00000146409 SLC18B1 668534 sc-eQTL 8.81e-01 -0.0164 0.109 0.236 intMono L2
ENSG00000286887 AL355881.1 -814428 sc-eQTL 3.72e-01 0.0933 0.104 0.236 intMono L2
ENSG00000028839 TBPL1 -470297 sc-eQTL 8.57e-01 0.0201 0.111 0.251 ncMono L2
ENSG00000079950 STX7 968675 sc-eQTL 8.34e-01 0.0157 0.0752 0.251 ncMono L2
ENSG00000093134 VNN3 747108 sc-eQTL 2.49e-01 -0.122 0.106 0.251 ncMono L2
ENSG00000112299 VNN1 767818 sc-eQTL 9.30e-01 -0.00928 0.105 0.251 ncMono L2
ENSG00000112303 VNN2 718414 sc-eQTL 3.22e-01 -0.1 0.101 0.251 ncMono L2
ENSG00000112306 RPS12 667304 sc-eQTL 8.53e-01 0.00944 0.0508 0.251 ncMono L2
ENSG00000118515 SGK1 -836239 sc-eQTL 5.38e-01 0.0443 0.0718 0.251 ncMono L2
ENSG00000146409 SLC18B1 668534 sc-eQTL 8.36e-01 -0.0186 0.0897 0.251 ncMono L2
ENSG00000286887 AL355881.1 -814428 sc-eQTL 7.98e-02 0.166 0.0941 0.251 ncMono L2
ENSG00000028839 TBPL1 -470297 sc-eQTL 7.91e-01 0.0336 0.126 0.234 pDC L2
ENSG00000079950 STX7 968675 sc-eQTL 1.06e-02 -0.213 0.0824 0.234 pDC L2
ENSG00000093134 VNN3 747108 sc-eQTL 6.86e-01 0.0343 0.0847 0.234 pDC L2
ENSG00000112299 VNN1 767818 sc-eQTL 3.78e-04 -0.301 0.0828 0.234 pDC L2
ENSG00000112303 VNN2 718414 sc-eQTL 5.17e-01 -0.0667 0.103 0.234 pDC L2
ENSG00000112306 RPS12 667304 sc-eQTL 4.43e-01 -0.0543 0.0706 0.234 pDC L2
ENSG00000118515 SGK1 -836239 sc-eQTL 9.28e-01 0.00648 0.0719 0.234 pDC L2
ENSG00000146409 SLC18B1 668534 sc-eQTL 2.09e-02 0.24 0.103 0.234 pDC L2
ENSG00000286438 AL591115.1 378745 sc-eQTL 4.15e-01 -0.0818 0.1 0.234 pDC L2
ENSG00000286887 AL355881.1 -814428 sc-eQTL 9.95e-01 -0.000587 0.0889 0.234 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000028839 TBPL1 -470297 sc-eQTL 8.91e-01 -0.0148 0.107 0.244 B_Memory LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 968675 sc-eQTL 5.70e-01 -0.0336 0.059 0.244 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 718414 sc-eQTL 4.30e-02 -0.188 0.0925 0.244 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 667304 sc-eQTL 8.68e-01 -0.00887 0.0532 0.244 B_Memory LOneK1K
ENSG00000118515 SGK1 -836239 sc-eQTL 1.97e-01 0.107 0.0829 0.244 B_Memory LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 668534 sc-eQTL 9.14e-01 -0.0106 0.0977 0.244 B_Memory LOneK1K
ENSG00000028839 TBPL1 -470297 sc-eQTL 3.16e-02 -0.226 0.104 0.244 B_Naive LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 968675 sc-eQTL 4.08e-01 0.0393 0.0474 0.244 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 718414 sc-eQTL 8.93e-01 -0.0124 0.0922 0.244 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 667304 sc-eQTL 4.09e-01 -0.0461 0.0557 0.244 B_Naive LOneK1K
ENSG00000118515 SGK1 -836239 sc-eQTL 8.19e-01 -0.0198 0.0863 0.244 B_Naive LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 668534 sc-eQTL 3.98e-01 -0.089 0.105 0.244 B_Naive LOneK1K
ENSG00000028839 TBPL1 -470297 sc-eQTL 6.64e-01 -0.0364 0.0836 0.244 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 968675 sc-eQTL 8.20e-01 -0.0132 0.0582 0.244 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000093134 VNN3 747108 sc-eQTL 7.54e-01 -0.0298 0.0948 0.244 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112299 VNN1 767818 sc-eQTL 8.15e-01 0.0232 0.0989 0.244 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 718414 sc-eQTL 6.42e-02 -0.121 0.0649 0.244 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 667304 sc-eQTL 4.95e-01 0.0306 0.0448 0.244 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000118515 SGK1 -836239 sc-eQTL 4.31e-01 0.0482 0.061 0.244 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 668534 sc-eQTL 4.82e-02 -0.157 0.0791 0.244 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000286887 AL355881.1 -814428 sc-eQTL 1.34e-01 0.125 0.0832 0.244 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000028839 TBPL1 -470297 sc-eQTL 8.59e-01 -0.0191 0.107 0.241 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 968675 sc-eQTL 3.20e-01 0.0703 0.0705 0.241 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000093134 VNN3 747108 sc-eQTL 2.45e-01 -0.121 0.104 0.241 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112299 VNN1 767818 sc-eQTL 7.46e-01 -0.0333 0.103 0.241 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 718414 sc-eQTL 1.59e-01 -0.137 0.0967 0.241 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 667304 sc-eQTL 7.94e-01 0.0108 0.0412 0.241 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000118515 SGK1 -836239 sc-eQTL 3.23e-01 0.0616 0.0622 0.241 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 668534 sc-eQTL 7.32e-01 0.0343 0.1 0.241 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000286887 AL355881.1 -814428 sc-eQTL 1.52e-02 0.218 0.0892 0.241 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000028839 TBPL1 -470297 sc-eQTL 5.73e-01 0.0494 0.0874 0.239 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 968675 sc-eQTL 1.21e-01 -0.127 0.0817 0.239 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 718414 sc-eQTL 5.75e-01 0.0583 0.104 0.239 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 667304 sc-eQTL 8.32e-01 0.00903 0.0425 0.239 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000118515 SGK1 -836239 sc-eQTL 7.09e-02 0.158 0.087 0.239 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000112303 VNN2 718414 pQTL 0.0187 -0.067 0.0285 0.0 0.0 0.268
ENSG00000112303 VNN2 718414 eQTL 0.0128 -0.0369 0.0148 0.0 0.0 0.273

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina