logo

Genes within 1Mb (chr6:133479570:GTTTTA:G):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000028839 TBPL1 -472600 sc-eQTL 1.86e-01 0.124 0.0932 0.246 B L1
ENSG00000079950 STX7 966372 sc-eQTL 2.62e-01 0.0418 0.0372 0.246 B L1
ENSG00000112303 VNN2 716111 sc-eQTL 8.83e-01 -0.0103 0.0701 0.246 B L1
ENSG00000112306 RPS12 665001 sc-eQTL 4.56e-01 0.0316 0.0423 0.246 B L1
ENSG00000118515 SGK1 -838542 sc-eQTL 1.52e-01 0.0935 0.065 0.246 B L1
ENSG00000146409 SLC18B1 666231 sc-eQTL 2.28e-01 0.108 0.0889 0.246 B L1
ENSG00000028839 TBPL1 -472600 sc-eQTL 4.36e-01 0.0542 0.0695 0.246 CD4T L1
ENSG00000079950 STX7 966372 sc-eQTL 1.30e-02 0.179 0.0713 0.246 CD4T L1
ENSG00000112303 VNN2 716111 sc-eQTL 8.32e-01 -0.0133 0.0627 0.246 CD4T L1
ENSG00000112306 RPS12 665001 sc-eQTL 7.41e-01 -0.0141 0.0426 0.246 CD4T L1
ENSG00000118515 SGK1 -838542 sc-eQTL 6.49e-01 -0.0261 0.0573 0.246 CD4T L1
ENSG00000146409 SLC18B1 666231 sc-eQTL 2.49e-02 0.192 0.0852 0.246 CD4T L1
ENSG00000028839 TBPL1 -472600 sc-eQTL 5.29e-01 0.0432 0.0686 0.246 CD8T L1
ENSG00000079950 STX7 966372 sc-eQTL 9.91e-01 0.000822 0.0717 0.246 CD8T L1
ENSG00000112303 VNN2 716111 sc-eQTL 4.44e-01 -0.0641 0.0836 0.246 CD8T L1
ENSG00000112306 RPS12 665001 sc-eQTL 2.82e-01 -0.0308 0.0285 0.246 CD8T L1
ENSG00000118515 SGK1 -838542 sc-eQTL 1.83e-01 -0.0586 0.0439 0.246 CD8T L1
ENSG00000146409 SLC18B1 666231 sc-eQTL 4.51e-01 0.0652 0.0864 0.246 CD8T L1
ENSG00000028839 TBPL1 -472600 sc-eQTL 9.26e-01 -0.01 0.108 0.255 DC L1
ENSG00000079950 STX7 966372 sc-eQTL 6.32e-01 -0.032 0.0669 0.255 DC L1
ENSG00000093134 VNN3 744805 sc-eQTL 5.69e-01 -0.0473 0.0829 0.255 DC L1
ENSG00000112299 VNN1 765515 sc-eQTL 2.23e-01 0.109 0.0893 0.255 DC L1
ENSG00000112303 VNN2 716111 sc-eQTL 7.66e-01 -0.0286 0.0959 0.255 DC L1
ENSG00000112306 RPS12 665001 sc-eQTL 3.49e-01 -0.0504 0.0536 0.255 DC L1
ENSG00000118515 SGK1 -838542 sc-eQTL 3.39e-01 0.0597 0.0622 0.255 DC L1
ENSG00000146409 SLC18B1 666231 sc-eQTL 8.72e-01 0.0137 0.0851 0.255 DC L1
ENSG00000286438 AL591115.1 376442 sc-eQTL 1.48e-01 0.112 0.077 0.255 DC L1
ENSG00000286887 AL355881.1 -816731 sc-eQTL 2.10e-01 0.121 0.0961 0.255 DC L1
ENSG00000028839 TBPL1 -472600 sc-eQTL 2.82e-01 0.0801 0.0743 0.246 Mono L1
ENSG00000079950 STX7 966372 sc-eQTL 3.43e-01 0.0473 0.0497 0.246 Mono L1
ENSG00000093134 VNN3 744805 sc-eQTL 9.92e-01 -0.000863 0.0856 0.246 Mono L1
ENSG00000112299 VNN1 765515 sc-eQTL 2.99e-01 0.0957 0.0918 0.246 Mono L1
ENSG00000112303 VNN2 716111 sc-eQTL 1.62e-01 -0.0909 0.0647 0.246 Mono L1
ENSG00000112306 RPS12 665001 sc-eQTL 7.40e-01 0.0129 0.0389 0.246 Mono L1
ENSG00000118515 SGK1 -838542 sc-eQTL 9.73e-01 -0.00186 0.055 0.246 Mono L1
ENSG00000146409 SLC18B1 666231 sc-eQTL 5.18e-01 -0.0498 0.077 0.246 Mono L1
ENSG00000286887 AL355881.1 -816731 sc-eQTL 3.65e-01 0.0686 0.0756 0.246 Mono L1
ENSG00000028839 TBPL1 -472600 sc-eQTL 4.52e-01 0.0606 0.0805 0.247 NK L1
ENSG00000079950 STX7 966372 sc-eQTL 7.35e-01 0.0253 0.0745 0.247 NK L1
ENSG00000112303 VNN2 716111 sc-eQTL 3.99e-01 -0.0783 0.0926 0.247 NK L1
ENSG00000112306 RPS12 665001 sc-eQTL 5.41e-01 -0.0235 0.0384 0.247 NK L1
ENSG00000118515 SGK1 -838542 sc-eQTL 2.95e-01 -0.0743 0.0708 0.247 NK L1
ENSG00000028839 TBPL1 -472600 sc-eQTL 3.06e-01 -0.0951 0.0927 0.246 Other_T L1
ENSG00000079950 STX7 966372 sc-eQTL 1.91e-01 0.0956 0.0728 0.246 Other_T L1
ENSG00000112303 VNN2 716111 sc-eQTL 2.19e-01 -0.109 0.0881 0.246 Other_T L1
ENSG00000112306 RPS12 665001 sc-eQTL 7.79e-02 -0.0616 0.0348 0.246 Other_T L1
ENSG00000118515 SGK1 -838542 sc-eQTL 5.67e-01 0.0369 0.0645 0.246 Other_T L1
ENSG00000146409 SLC18B1 666231 sc-eQTL 5.39e-01 0.059 0.0959 0.246 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000028839 TBPL1 -472600 sc-eQTL 7.55e-01 -0.0345 0.111 0.24 B_Activated L2
ENSG00000079950 STX7 966372 sc-eQTL 7.58e-01 -0.0292 0.0947 0.24 B_Activated L2
ENSG00000112303 VNN2 716111 sc-eQTL 5.65e-01 0.0581 0.101 0.24 B_Activated L2
ENSG00000112306 RPS12 665001 sc-eQTL 6.61e-01 0.0237 0.054 0.24 B_Activated L2
ENSG00000118515 SGK1 -838542 sc-eQTL 4.06e-01 0.0802 0.0962 0.24 B_Activated L2
ENSG00000146409 SLC18B1 666231 sc-eQTL 2.99e-01 -0.0984 0.0944 0.24 B_Activated L2
ENSG00000028839 TBPL1 -472600 sc-eQTL 1.06e-01 0.169 0.104 0.245 B_Intermediate L2
ENSG00000079950 STX7 966372 sc-eQTL 2.06e-02 0.139 0.0594 0.245 B_Intermediate L2
ENSG00000112303 VNN2 716111 sc-eQTL 8.76e-01 -0.0142 0.0906 0.245 B_Intermediate L2
ENSG00000112306 RPS12 665001 sc-eQTL 9.76e-01 -0.00168 0.0555 0.245 B_Intermediate L2
ENSG00000118515 SGK1 -838542 sc-eQTL 5.74e-01 0.054 0.0959 0.245 B_Intermediate L2
ENSG00000146409 SLC18B1 666231 sc-eQTL 7.39e-01 0.0333 0.1 0.245 B_Intermediate L2
ENSG00000028839 TBPL1 -472600 sc-eQTL 5.27e-01 -0.063 0.0994 0.246 B_Memory L2
ENSG00000079950 STX7 966372 sc-eQTL 2.07e-02 0.166 0.071 0.246 B_Memory L2
ENSG00000112303 VNN2 716111 sc-eQTL 1.14e-01 0.148 0.0936 0.246 B_Memory L2
ENSG00000112306 RPS12 665001 sc-eQTL 6.41e-01 0.0212 0.0453 0.246 B_Memory L2
ENSG00000118515 SGK1 -838542 sc-eQTL 1.68e-03 0.259 0.0812 0.246 B_Memory L2
ENSG00000146409 SLC18B1 666231 sc-eQTL 8.07e-01 0.0232 0.0946 0.246 B_Memory L2
ENSG00000028839 TBPL1 -472600 sc-eQTL 4.41e-01 0.0729 0.0944 0.246 B_Naive1 L2
ENSG00000079950 STX7 966372 sc-eQTL 2.95e-01 0.0476 0.0453 0.246 B_Naive1 L2
ENSG00000112303 VNN2 716111 sc-eQTL 2.05e-01 -0.112 0.0879 0.246 B_Naive1 L2
ENSG00000112306 RPS12 665001 sc-eQTL 5.50e-01 0.03 0.0502 0.246 B_Naive1 L2
ENSG00000118515 SGK1 -838542 sc-eQTL 1.15e-01 0.124 0.0782 0.246 B_Naive1 L2
ENSG00000146409 SLC18B1 666231 sc-eQTL 8.15e-01 0.0227 0.097 0.246 B_Naive1 L2
ENSG00000028839 TBPL1 -472600 sc-eQTL 2.85e-01 0.108 0.1 0.245 B_Naive2 L2
ENSG00000079950 STX7 966372 sc-eQTL 8.57e-01 0.00962 0.0535 0.245 B_Naive2 L2
ENSG00000112303 VNN2 716111 sc-eQTL 6.52e-01 0.0443 0.0981 0.245 B_Naive2 L2
ENSG00000112306 RPS12 665001 sc-eQTL 4.53e-01 0.0391 0.0519 0.245 B_Naive2 L2
ENSG00000118515 SGK1 -838542 sc-eQTL 7.54e-01 0.0288 0.0918 0.245 B_Naive2 L2
ENSG00000146409 SLC18B1 666231 sc-eQTL 1.26e-01 0.151 0.0986 0.245 B_Naive2 L2
ENSG00000028839 TBPL1 -472600 sc-eQTL 2.40e-01 0.118 0.1 0.248 CD4_CTL L2
ENSG00000079950 STX7 966372 sc-eQTL 1.49e-01 0.144 0.0996 0.248 CD4_CTL L2
ENSG00000112303 VNN2 716111 sc-eQTL 6.13e-01 -0.0512 0.101 0.248 CD4_CTL L2
ENSG00000112306 RPS12 665001 sc-eQTL 4.84e-01 -0.0327 0.0466 0.248 CD4_CTL L2
ENSG00000118515 SGK1 -838542 sc-eQTL 1.42e-01 0.119 0.0804 0.248 CD4_CTL L2
ENSG00000146409 SLC18B1 666231 sc-eQTL 6.24e-01 0.0462 0.094 0.248 CD4_CTL L2
ENSG00000028839 TBPL1 -472600 sc-eQTL 8.73e-01 -0.0128 0.0801 0.246 CD4_Naive L2
ENSG00000079950 STX7 966372 sc-eQTL 6.04e-02 0.147 0.0779 0.246 CD4_Naive L2
ENSG00000112303 VNN2 716111 sc-eQTL 6.06e-01 0.0376 0.0727 0.246 CD4_Naive L2
ENSG00000112306 RPS12 665001 sc-eQTL 9.38e-01 -0.00366 0.0472 0.246 CD4_Naive L2
ENSG00000118515 SGK1 -838542 sc-eQTL 7.03e-01 0.0221 0.0578 0.246 CD4_Naive L2
ENSG00000146409 SLC18B1 666231 sc-eQTL 1.28e-02 0.225 0.0896 0.246 CD4_Naive L2
ENSG00000028839 TBPL1 -472600 sc-eQTL 4.33e-01 -0.0683 0.087 0.246 CD4_TCM L2
ENSG00000079950 STX7 966372 sc-eQTL 2.09e-01 0.11 0.0874 0.246 CD4_TCM L2
ENSG00000112303 VNN2 716111 sc-eQTL 1.52e-01 -0.124 0.086 0.246 CD4_TCM L2
ENSG00000112306 RPS12 665001 sc-eQTL 7.83e-02 -0.0787 0.0445 0.246 CD4_TCM L2
ENSG00000118515 SGK1 -838542 sc-eQTL 7.95e-01 -0.0163 0.0627 0.246 CD4_TCM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 666231 sc-eQTL 3.04e-01 0.107 0.104 0.246 CD4_TCM L2
ENSG00000028839 TBPL1 -472600 sc-eQTL 8.38e-02 0.173 0.0995 0.246 CD4_TEM L2
ENSG00000079950 STX7 966372 sc-eQTL 1.44e-01 0.146 0.0998 0.246 CD4_TEM L2
ENSG00000112303 VNN2 716111 sc-eQTL 2.46e-01 0.112 0.0959 0.246 CD4_TEM L2
ENSG00000112306 RPS12 665001 sc-eQTL 2.28e-01 -0.0475 0.0393 0.246 CD4_TEM L2
ENSG00000118515 SGK1 -838542 sc-eQTL 7.47e-01 0.0219 0.0678 0.246 CD4_TEM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 666231 sc-eQTL 5.66e-01 0.0564 0.098 0.246 CD4_TEM L2
ENSG00000028839 TBPL1 -472600 sc-eQTL 3.26e-01 0.0871 0.0885 0.246 CD8_CTL L2
ENSG00000079950 STX7 966372 sc-eQTL 6.19e-01 -0.0413 0.0828 0.246 CD8_CTL L2
ENSG00000112303 VNN2 716111 sc-eQTL 7.26e-01 -0.033 0.0941 0.246 CD8_CTL L2
ENSG00000112306 RPS12 665001 sc-eQTL 1.68e-01 -0.0693 0.0502 0.246 CD8_CTL L2
ENSG00000118515 SGK1 -838542 sc-eQTL 6.48e-01 0.0389 0.0851 0.246 CD8_CTL L2
ENSG00000146409 SLC18B1 666231 sc-eQTL 8.52e-01 0.0182 0.0977 0.246 CD8_CTL L2
ENSG00000028839 TBPL1 -472600 sc-eQTL 3.77e-01 0.0832 0.0941 0.246 CD8_Naive L2
ENSG00000079950 STX7 966372 sc-eQTL 5.12e-01 0.0659 0.1 0.246 CD8_Naive L2
ENSG00000112303 VNN2 716111 sc-eQTL 2.91e-01 -0.0915 0.0864 0.246 CD8_Naive L2
ENSG00000112306 RPS12 665001 sc-eQTL 5.92e-01 -0.0266 0.0496 0.246 CD8_Naive L2
ENSG00000118515 SGK1 -838542 sc-eQTL 8.57e-02 -0.107 0.0618 0.246 CD8_Naive L2
ENSG00000146409 SLC18B1 666231 sc-eQTL 9.90e-01 -0.00128 0.0996 0.246 CD8_Naive L2
ENSG00000028839 TBPL1 -472600 sc-eQTL 7.19e-01 -0.038 0.106 0.25 CD8_TCM L2
ENSG00000079950 STX7 966372 sc-eQTL 2.89e-01 0.104 0.0975 0.25 CD8_TCM L2
ENSG00000112303 VNN2 716111 sc-eQTL 6.04e-01 0.0504 0.097 0.25 CD8_TCM L2
ENSG00000112306 RPS12 665001 sc-eQTL 3.01e-01 -0.0489 0.0472 0.25 CD8_TCM L2
ENSG00000118515 SGK1 -838542 sc-eQTL 8.62e-02 0.134 0.0777 0.25 CD8_TCM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 666231 sc-eQTL 3.69e-01 0.0931 0.103 0.25 CD8_TCM L2
ENSG00000028839 TBPL1 -472600 sc-eQTL 2.45e-01 -0.114 0.098 0.247 CD8_TEM L2
ENSG00000079950 STX7 966372 sc-eQTL 2.71e-01 -0.118 0.107 0.247 CD8_TEM L2
ENSG00000112303 VNN2 716111 sc-eQTL 1.84e-01 0.142 0.106 0.247 CD8_TEM L2
ENSG00000112306 RPS12 665001 sc-eQTL 8.53e-01 0.0106 0.0574 0.247 CD8_TEM L2
ENSG00000118515 SGK1 -838542 sc-eQTL 7.42e-01 -0.0309 0.094 0.247 CD8_TEM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 666231 sc-eQTL 4.12e-01 0.089 0.108 0.247 CD8_TEM L2
ENSG00000028839 TBPL1 -472600 sc-eQTL 3.25e-01 -0.0984 0.0997 0.249 MAIT L2
ENSG00000079950 STX7 966372 sc-eQTL 7.13e-02 0.171 0.0942 0.249 MAIT L2
ENSG00000112303 VNN2 716111 sc-eQTL 7.94e-01 0.0252 0.0966 0.249 MAIT L2
ENSG00000112306 RPS12 665001 sc-eQTL 5.02e-03 -0.132 0.0466 0.249 MAIT L2
ENSG00000118515 SGK1 -838542 sc-eQTL 8.50e-01 -0.0127 0.0669 0.249 MAIT L2
ENSG00000146409 SLC18B1 666231 sc-eQTL 4.95e-01 0.068 0.0995 0.249 MAIT L2
ENSG00000028839 TBPL1 -472600 sc-eQTL 9.07e-01 0.0128 0.11 0.242 NK_CD56bright L2
ENSG00000079950 STX7 966372 sc-eQTL 8.58e-01 0.0183 0.102 0.242 NK_CD56bright L2
ENSG00000112303 VNN2 716111 sc-eQTL 9.31e-01 -0.00897 0.103 0.242 NK_CD56bright L2
ENSG00000112306 RPS12 665001 sc-eQTL 9.46e-02 -0.0962 0.0573 0.242 NK_CD56bright L2
ENSG00000118515 SGK1 -838542 sc-eQTL 9.33e-01 0.00727 0.0862 0.242 NK_CD56bright L2
ENSG00000028839 TBPL1 -472600 sc-eQTL 5.35e-01 0.0536 0.0864 0.248 NK_CD56dim L2
ENSG00000079950 STX7 966372 sc-eQTL 8.48e-01 -0.0152 0.0791 0.248 NK_CD56dim L2
ENSG00000112303 VNN2 716111 sc-eQTL 2.72e-02 -0.218 0.0978 0.248 NK_CD56dim L2
ENSG00000112306 RPS12 665001 sc-eQTL 3.45e-01 -0.0371 0.0392 0.248 NK_CD56dim L2
ENSG00000118515 SGK1 -838542 sc-eQTL 7.73e-01 0.0251 0.087 0.248 NK_CD56dim L2
ENSG00000028839 TBPL1 -472600 sc-eQTL 8.85e-01 0.016 0.111 0.244 NK_HLA L2
ENSG00000079950 STX7 966372 sc-eQTL 8.33e-01 0.0213 0.101 0.244 NK_HLA L2
ENSG00000112303 VNN2 716111 sc-eQTL 4.23e-01 -0.0817 0.102 0.244 NK_HLA L2
ENSG00000112306 RPS12 665001 sc-eQTL 6.31e-01 0.0228 0.0475 0.244 NK_HLA L2
ENSG00000118515 SGK1 -838542 sc-eQTL 7.12e-01 -0.0347 0.0939 0.244 NK_HLA L2
ENSG00000028839 TBPL1 -472600 sc-eQTL 5.61e-01 0.0524 0.09 0.248 NK_cytokine L2
ENSG00000079950 STX7 966372 sc-eQTL 2.05e-01 0.11 0.0869 0.248 NK_cytokine L2
ENSG00000112303 VNN2 716111 sc-eQTL 2.57e-01 0.111 0.0978 0.248 NK_cytokine L2
ENSG00000112306 RPS12 665001 sc-eQTL 9.01e-01 -0.00662 0.0532 0.248 NK_cytokine L2
ENSG00000118515 SGK1 -838542 sc-eQTL 9.33e-02 -0.148 0.088 0.248 NK_cytokine L2
ENSG00000028839 TBPL1 -472600 sc-eQTL 6.50e-01 0.0541 0.119 0.248 PB L2
ENSG00000079950 STX7 966372 sc-eQTL 6.05e-01 -0.0439 0.0846 0.248 PB L2
ENSG00000112303 VNN2 716111 sc-eQTL 7.44e-01 -0.0338 0.103 0.248 PB L2
ENSG00000112306 RPS12 665001 sc-eQTL 1.51e-01 -0.0841 0.0582 0.248 PB L2
ENSG00000118515 SGK1 -838542 sc-eQTL 3.76e-01 0.0841 0.0945 0.248 PB L2
ENSG00000146409 SLC18B1 666231 sc-eQTL 3.69e-01 0.099 0.11 0.248 PB L2
ENSG00000028839 TBPL1 -472600 sc-eQTL 4.11e-01 -0.0837 0.102 0.243 Pro_T L2
ENSG00000079950 STX7 966372 sc-eQTL 1.53e-01 0.13 0.0905 0.243 Pro_T L2
ENSG00000112303 VNN2 716111 sc-eQTL 4.31e-01 -0.0769 0.0974 0.243 Pro_T L2
ENSG00000112306 RPS12 665001 sc-eQTL 2.37e-01 -0.0436 0.0368 0.243 Pro_T L2
ENSG00000118515 SGK1 -838542 sc-eQTL 3.12e-01 0.0749 0.0738 0.243 Pro_T L2
ENSG00000146409 SLC18B1 666231 sc-eQTL 6.98e-01 0.0371 0.0955 0.243 Pro_T L2
ENSG00000028839 TBPL1 -472600 sc-eQTL 7.55e-01 0.0323 0.103 0.246 Treg L2
ENSG00000079950 STX7 966372 sc-eQTL 4.32e-02 0.196 0.0965 0.246 Treg L2
ENSG00000112303 VNN2 716111 sc-eQTL 8.89e-01 0.0115 0.082 0.246 Treg L2
ENSG00000112306 RPS12 665001 sc-eQTL 8.83e-01 -0.00534 0.0363 0.246 Treg L2
ENSG00000118515 SGK1 -838542 sc-eQTL 3.40e-01 -0.0729 0.0762 0.246 Treg L2
ENSG00000146409 SLC18B1 666231 sc-eQTL 8.36e-01 0.0213 0.102 0.246 Treg L2
ENSG00000028839 TBPL1 -472600 sc-eQTL 9.54e-01 0.00607 0.105 0.266 cDC L2
ENSG00000079950 STX7 966372 sc-eQTL 9.73e-01 0.00279 0.0828 0.266 cDC L2
ENSG00000093134 VNN3 744805 sc-eQTL 7.17e-01 -0.0299 0.0822 0.266 cDC L2
ENSG00000112299 VNN1 765515 sc-eQTL 3.90e-01 0.0832 0.0965 0.266 cDC L2
ENSG00000112303 VNN2 716111 sc-eQTL 6.07e-01 -0.0485 0.0941 0.266 cDC L2
ENSG00000112306 RPS12 665001 sc-eQTL 4.11e-01 -0.0383 0.0464 0.266 cDC L2
ENSG00000118515 SGK1 -838542 sc-eQTL 1.17e-01 0.123 0.0778 0.266 cDC L2
ENSG00000146409 SLC18B1 666231 sc-eQTL 2.35e-01 0.109 0.0918 0.266 cDC L2
ENSG00000286438 AL591115.1 376442 sc-eQTL 5.60e-01 0.043 0.0736 0.266 cDC L2
ENSG00000286887 AL355881.1 -816731 sc-eQTL 3.21e-02 0.193 0.0895 0.266 cDC L2
ENSG00000028839 TBPL1 -472600 sc-eQTL 4.93e-01 0.0577 0.084 0.246 cMono_IL1B L2
ENSG00000079950 STX7 966372 sc-eQTL 6.74e-01 -0.0268 0.0638 0.246 cMono_IL1B L2
ENSG00000093134 VNN3 744805 sc-eQTL 5.63e-01 0.0523 0.0901 0.246 cMono_IL1B L2
ENSG00000112299 VNN1 765515 sc-eQTL 1.51e-01 0.13 0.0905 0.246 cMono_IL1B L2
ENSG00000112303 VNN2 716111 sc-eQTL 2.20e-01 -0.0892 0.0725 0.246 cMono_IL1B L2
ENSG00000112306 RPS12 665001 sc-eQTL 6.28e-01 0.0196 0.0404 0.246 cMono_IL1B L2
ENSG00000118515 SGK1 -838542 sc-eQTL 8.35e-01 0.0125 0.0602 0.246 cMono_IL1B L2
ENSG00000146409 SLC18B1 666231 sc-eQTL 7.79e-01 0.0218 0.0779 0.246 cMono_IL1B L2
ENSG00000286887 AL355881.1 -816731 sc-eQTL 9.19e-02 0.136 0.0806 0.246 cMono_IL1B L2
ENSG00000028839 TBPL1 -472600 sc-eQTL 7.39e-01 0.0316 0.0948 0.246 cMono_S100A L2
ENSG00000079950 STX7 966372 sc-eQTL 9.15e-02 0.115 0.068 0.246 cMono_S100A L2
ENSG00000093134 VNN3 744805 sc-eQTL 9.95e-01 0.000505 0.0855 0.246 cMono_S100A L2
ENSG00000112299 VNN1 765515 sc-eQTL 2.58e-01 0.105 0.0925 0.246 cMono_S100A L2
ENSG00000112303 VNN2 716111 sc-eQTL 2.14e-01 -0.0756 0.0606 0.246 cMono_S100A L2
ENSG00000112306 RPS12 665001 sc-eQTL 4.45e-01 0.0335 0.0437 0.246 cMono_S100A L2
ENSG00000118515 SGK1 -838542 sc-eQTL 5.29e-01 0.0315 0.05 0.246 cMono_S100A L2
ENSG00000146409 SLC18B1 666231 sc-eQTL 7.50e-02 -0.144 0.0804 0.246 cMono_S100A L2
ENSG00000286887 AL355881.1 -816731 sc-eQTL 9.50e-01 0.00498 0.0793 0.246 cMono_S100A L2
ENSG00000028839 TBPL1 -472600 sc-eQTL 3.48e-01 0.121 0.128 0.252 gdT L2
ENSG00000079950 STX7 966372 sc-eQTL 4.03e-01 -0.0926 0.11 0.252 gdT L2
ENSG00000112303 VNN2 716111 sc-eQTL 2.96e-02 -0.265 0.12 0.252 gdT L2
ENSG00000112306 RPS12 665001 sc-eQTL 4.59e-01 -0.0345 0.0465 0.252 gdT L2
ENSG00000118515 SGK1 -838542 sc-eQTL 4.39e-01 0.0682 0.0878 0.252 gdT L2
ENSG00000146409 SLC18B1 666231 sc-eQTL 4.09e-01 -0.0995 0.12 0.252 gdT L2
ENSG00000028839 TBPL1 -472600 sc-eQTL 2.21e-02 0.221 0.096 0.251 intMono L2
ENSG00000079950 STX7 966372 sc-eQTL 8.79e-01 0.0142 0.0928 0.251 intMono L2
ENSG00000093134 VNN3 744805 sc-eQTL 8.32e-01 -0.0199 0.0937 0.251 intMono L2
ENSG00000112299 VNN1 765515 sc-eQTL 4.42e-01 0.0713 0.0925 0.251 intMono L2
ENSG00000112303 VNN2 716111 sc-eQTL 2.25e-01 0.114 0.0938 0.251 intMono L2
ENSG00000112306 RPS12 665001 sc-eQTL 3.96e-01 -0.0348 0.0409 0.251 intMono L2
ENSG00000118515 SGK1 -838542 sc-eQTL 7.68e-01 0.0203 0.0688 0.251 intMono L2
ENSG00000146409 SLC18B1 666231 sc-eQTL 3.93e-01 0.0852 0.0996 0.251 intMono L2
ENSG00000286887 AL355881.1 -816731 sc-eQTL 2.46e-01 0.111 0.0951 0.251 intMono L2
ENSG00000028839 TBPL1 -472600 sc-eQTL 5.20e-01 0.0658 0.102 0.244 ncMono L2
ENSG00000079950 STX7 966372 sc-eQTL 9.06e-01 0.0082 0.069 0.244 ncMono L2
ENSG00000093134 VNN3 744805 sc-eQTL 8.60e-01 0.0172 0.0974 0.244 ncMono L2
ENSG00000112299 VNN1 765515 sc-eQTL 7.43e-01 0.0317 0.0967 0.244 ncMono L2
ENSG00000112303 VNN2 716111 sc-eQTL 7.55e-01 0.029 0.093 0.244 ncMono L2
ENSG00000112306 RPS12 665001 sc-eQTL 8.15e-01 0.0109 0.0466 0.244 ncMono L2
ENSG00000118515 SGK1 -838542 sc-eQTL 6.90e-02 0.12 0.0654 0.244 ncMono L2
ENSG00000146409 SLC18B1 666231 sc-eQTL 3.23e-01 0.0813 0.0822 0.244 ncMono L2
ENSG00000286887 AL355881.1 -816731 sc-eQTL 3.68e-01 0.0785 0.0869 0.244 ncMono L2
ENSG00000028839 TBPL1 -472600 sc-eQTL 9.38e-01 0.00924 0.119 0.251 pDC L2
ENSG00000079950 STX7 966372 sc-eQTL 4.68e-01 -0.0575 0.079 0.251 pDC L2
ENSG00000093134 VNN3 744805 sc-eQTL 2.35e-01 -0.0946 0.0793 0.251 pDC L2
ENSG00000112299 VNN1 765515 sc-eQTL 7.37e-01 0.0273 0.0811 0.251 pDC L2
ENSG00000112303 VNN2 716111 sc-eQTL 3.86e-01 -0.0837 0.0963 0.251 pDC L2
ENSG00000112306 RPS12 665001 sc-eQTL 5.01e-01 0.0448 0.0664 0.251 pDC L2
ENSG00000118515 SGK1 -838542 sc-eQTL 7.61e-01 0.0206 0.0676 0.251 pDC L2
ENSG00000146409 SLC18B1 666231 sc-eQTL 1.58e-01 -0.139 0.0978 0.251 pDC L2
ENSG00000286438 AL591115.1 376442 sc-eQTL 1.59e-01 0.133 0.0936 0.251 pDC L2
ENSG00000286887 AL355881.1 -816731 sc-eQTL 7.56e-01 0.026 0.0835 0.251 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000028839 TBPL1 -472600 sc-eQTL 1.19e-01 0.157 0.1 0.246 B_Memory LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 966372 sc-eQTL 4.15e-02 0.113 0.055 0.246 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 716111 sc-eQTL 1.57e-01 0.124 0.0875 0.246 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 665001 sc-eQTL 7.89e-01 0.0134 0.0501 0.246 B_Memory LOneK1K
ENSG00000118515 SGK1 -838542 sc-eQTL 1.72e-01 0.107 0.078 0.246 B_Memory LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 666231 sc-eQTL 9.27e-01 0.00842 0.092 0.246 B_Memory LOneK1K
ENSG00000028839 TBPL1 -472600 sc-eQTL 1.09e-01 0.151 0.0938 0.246 B_Naive LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 966372 sc-eQTL 3.18e-01 0.0425 0.0424 0.246 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 716111 sc-eQTL 4.71e-01 -0.0595 0.0825 0.246 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 665001 sc-eQTL 3.58e-01 0.0459 0.0499 0.246 B_Naive LOneK1K
ENSG00000118515 SGK1 -838542 sc-eQTL 1.58e-01 0.109 0.077 0.246 B_Naive LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 666231 sc-eQTL 3.83e-01 0.0823 0.0941 0.246 B_Naive LOneK1K
ENSG00000028839 TBPL1 -472600 sc-eQTL 5.76e-01 0.043 0.0767 0.246 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 966372 sc-eQTL 5.42e-01 0.0326 0.0533 0.246 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000093134 VNN3 744805 sc-eQTL 8.02e-01 0.0218 0.087 0.246 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112299 VNN1 765515 sc-eQTL 1.19e-01 0.141 0.0902 0.246 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 716111 sc-eQTL 1.67e-01 -0.0828 0.0597 0.246 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 665001 sc-eQTL 5.20e-01 0.0265 0.0411 0.246 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000118515 SGK1 -838542 sc-eQTL 8.86e-01 0.00807 0.0561 0.246 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 666231 sc-eQTL 4.77e-01 -0.0521 0.0731 0.246 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000286887 AL355881.1 -816731 sc-eQTL 2.53e-01 0.0877 0.0765 0.246 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000028839 TBPL1 -472600 sc-eQTL 9.51e-02 0.166 0.0989 0.248 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 966372 sc-eQTL 7.98e-01 0.0169 0.0657 0.248 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000093134 VNN3 744805 sc-eQTL 9.61e-01 -0.00467 0.0967 0.248 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112299 VNN1 765515 sc-eQTL 2.91e-01 0.101 0.0955 0.248 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 716111 sc-eQTL 5.18e-01 0.0585 0.0902 0.248 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 665001 sc-eQTL 1.00e+00 1.29e-05 0.0383 0.248 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000118515 SGK1 -838542 sc-eQTL 3.28e-01 0.0567 0.0579 0.248 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 666231 sc-eQTL 6.03e-01 0.0485 0.093 0.248 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000286887 AL355881.1 -816731 sc-eQTL 3.20e-01 0.0836 0.0839 0.248 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000028839 TBPL1 -472600 sc-eQTL 4.46e-01 0.0606 0.0794 0.248 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 966372 sc-eQTL 6.39e-01 0.0351 0.0746 0.248 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 716111 sc-eQTL 3.14e-01 -0.0951 0.0943 0.248 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 665001 sc-eQTL 5.09e-01 -0.0255 0.0385 0.248 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000118515 SGK1 -838542 sc-eQTL 5.55e-01 -0.0471 0.0796 0.248 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000079950 STX7 966372 pQTL 0.0842 -0.045 0.026 0.00154 0.0 0.249
ENSG00000079950 STX7 966372 eQTL 0.0062 0.0513 0.0187 0.0 0.0 0.238
ENSG00000112299 VNN1 765515 pQTL 0.00471 0.114 0.0402 0.0 0.0 0.249

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina