logo

Genes within 1Mb (chr6:133476903:G:A):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000028839 TBPL1 -475267 sc-eQTL 3.33e-01 0.0894 0.0921 0.25 B L1
ENSG00000079950 STX7 963705 sc-eQTL 2.63e-01 0.0411 0.0366 0.25 B L1
ENSG00000112303 VNN2 713444 sc-eQTL 9.17e-01 0.00723 0.0691 0.25 B L1
ENSG00000112306 RPS12 662334 sc-eQTL 5.13e-01 0.0274 0.0417 0.25 B L1
ENSG00000118515 SGK1 -841209 sc-eQTL 1.10e-01 0.103 0.064 0.25 B L1
ENSG00000146409 SLC18B1 663564 sc-eQTL 3.41e-01 0.0837 0.0877 0.25 B L1
ENSG00000028839 TBPL1 -475267 sc-eQTL 3.37e-01 0.0658 0.0684 0.25 CD4T L1
ENSG00000079950 STX7 963705 sc-eQTL 3.16e-02 0.153 0.0705 0.25 CD4T L1
ENSG00000112303 VNN2 713444 sc-eQTL 8.70e-01 -0.0101 0.0617 0.25 CD4T L1
ENSG00000112306 RPS12 662334 sc-eQTL 7.92e-01 -0.0111 0.042 0.25 CD4T L1
ENSG00000118515 SGK1 -841209 sc-eQTL 5.91e-01 -0.0303 0.0564 0.25 CD4T L1
ENSG00000146409 SLC18B1 663564 sc-eQTL 2.76e-02 0.186 0.0839 0.25 CD4T L1
ENSG00000028839 TBPL1 -475267 sc-eQTL 3.73e-01 0.0603 0.0675 0.25 CD8T L1
ENSG00000079950 STX7 963705 sc-eQTL 9.89e-01 0.000973 0.0706 0.25 CD8T L1
ENSG00000112303 VNN2 713444 sc-eQTL 5.29e-01 -0.0519 0.0824 0.25 CD8T L1
ENSG00000112306 RPS12 662334 sc-eQTL 2.59e-01 -0.0318 0.0281 0.25 CD8T L1
ENSG00000118515 SGK1 -841209 sc-eQTL 1.63e-01 -0.0605 0.0432 0.25 CD8T L1
ENSG00000146409 SLC18B1 663564 sc-eQTL 3.76e-01 0.0755 0.085 0.25 CD8T L1
ENSG00000028839 TBPL1 -475267 sc-eQTL 9.10e-01 -0.0121 0.106 0.257 DC L1
ENSG00000079950 STX7 963705 sc-eQTL 6.49e-01 -0.0301 0.0661 0.257 DC L1
ENSG00000093134 VNN3 742138 sc-eQTL 6.33e-01 -0.0392 0.082 0.257 DC L1
ENSG00000112299 VNN1 762848 sc-eQTL 1.74e-01 0.12 0.0881 0.257 DC L1
ENSG00000112303 VNN2 713444 sc-eQTL 7.05e-01 -0.0358 0.0947 0.257 DC L1
ENSG00000112306 RPS12 662334 sc-eQTL 3.19e-01 -0.0529 0.053 0.257 DC L1
ENSG00000118515 SGK1 -841209 sc-eQTL 3.60e-01 0.0564 0.0615 0.257 DC L1
ENSG00000146409 SLC18B1 663564 sc-eQTL 6.99e-01 0.0325 0.084 0.257 DC L1
ENSG00000286438 AL591115.1 373775 sc-eQTL 8.67e-02 0.131 0.0759 0.257 DC L1
ENSG00000286887 AL355881.1 -819398 sc-eQTL 1.71e-01 0.13 0.0949 0.257 DC L1
ENSG00000028839 TBPL1 -475267 sc-eQTL 2.73e-01 0.0805 0.0732 0.25 Mono L1
ENSG00000079950 STX7 963705 sc-eQTL 3.73e-01 0.0438 0.049 0.25 Mono L1
ENSG00000093134 VNN3 742138 sc-eQTL 8.78e-01 0.0129 0.0843 0.25 Mono L1
ENSG00000112299 VNN1 762848 sc-eQTL 3.28e-01 0.0887 0.0905 0.25 Mono L1
ENSG00000112303 VNN2 713444 sc-eQTL 1.56e-01 -0.0906 0.0637 0.25 Mono L1
ENSG00000112306 RPS12 662334 sc-eQTL 9.54e-01 0.0022 0.0384 0.25 Mono L1
ENSG00000118515 SGK1 -841209 sc-eQTL 9.95e-01 -0.000342 0.0542 0.25 Mono L1
ENSG00000146409 SLC18B1 663564 sc-eQTL 4.37e-01 -0.0591 0.0758 0.25 Mono L1
ENSG00000286887 AL355881.1 -819398 sc-eQTL 4.03e-01 0.0624 0.0745 0.25 Mono L1
ENSG00000028839 TBPL1 -475267 sc-eQTL 4.00e-01 0.0671 0.0796 0.251 NK L1
ENSG00000079950 STX7 963705 sc-eQTL 7.05e-01 0.0279 0.0737 0.251 NK L1
ENSG00000112303 VNN2 713444 sc-eQTL 5.27e-01 -0.058 0.0916 0.251 NK L1
ENSG00000112306 RPS12 662334 sc-eQTL 7.00e-01 -0.0146 0.0379 0.251 NK L1
ENSG00000118515 SGK1 -841209 sc-eQTL 2.85e-01 -0.075 0.07 0.251 NK L1
ENSG00000028839 TBPL1 -475267 sc-eQTL 5.48e-01 -0.0552 0.0918 0.25 Other_T L1
ENSG00000079950 STX7 963705 sc-eQTL 2.36e-01 0.0856 0.0721 0.25 Other_T L1
ENSG00000112303 VNN2 713444 sc-eQTL 1.79e-01 -0.117 0.0871 0.25 Other_T L1
ENSG00000112306 RPS12 662334 sc-eQTL 8.05e-02 -0.0604 0.0344 0.25 Other_T L1
ENSG00000118515 SGK1 -841209 sc-eQTL 5.54e-01 0.0378 0.0637 0.25 Other_T L1
ENSG00000146409 SLC18B1 663564 sc-eQTL 4.75e-01 0.0678 0.0948 0.25 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000028839 TBPL1 -475267 sc-eQTL 7.75e-01 -0.0313 0.109 0.242 B_Activated L2
ENSG00000079950 STX7 963705 sc-eQTL 8.16e-01 -0.0218 0.0935 0.242 B_Activated L2
ENSG00000112303 VNN2 713444 sc-eQTL 6.61e-01 0.0437 0.0994 0.242 B_Activated L2
ENSG00000112306 RPS12 662334 sc-eQTL 8.03e-01 0.0133 0.0533 0.242 B_Activated L2
ENSG00000118515 SGK1 -841209 sc-eQTL 4.41e-01 0.0733 0.0949 0.242 B_Activated L2
ENSG00000146409 SLC18B1 663564 sc-eQTL 2.88e-01 -0.0992 0.0931 0.242 B_Activated L2
ENSG00000028839 TBPL1 -475267 sc-eQTL 1.67e-01 0.143 0.103 0.249 B_Intermediate L2
ENSG00000079950 STX7 963705 sc-eQTL 2.44e-02 0.133 0.0587 0.249 B_Intermediate L2
ENSG00000112303 VNN2 713444 sc-eQTL 9.31e-01 -0.00776 0.0894 0.249 B_Intermediate L2
ENSG00000112306 RPS12 662334 sc-eQTL 9.48e-01 -0.00355 0.0548 0.249 B_Intermediate L2
ENSG00000118515 SGK1 -841209 sc-eQTL 6.14e-01 0.0479 0.0947 0.249 B_Intermediate L2
ENSG00000146409 SLC18B1 663564 sc-eQTL 8.37e-01 0.0203 0.0987 0.249 B_Intermediate L2
ENSG00000028839 TBPL1 -475267 sc-eQTL 4.92e-01 -0.0675 0.0981 0.25 B_Memory L2
ENSG00000079950 STX7 963705 sc-eQTL 4.29e-02 0.143 0.0704 0.25 B_Memory L2
ENSG00000112303 VNN2 713444 sc-eQTL 6.38e-02 0.172 0.0922 0.25 B_Memory L2
ENSG00000112306 RPS12 662334 sc-eQTL 5.45e-01 0.0271 0.0448 0.25 B_Memory L2
ENSG00000118515 SGK1 -841209 sc-eQTL 1.21e-03 0.263 0.0801 0.25 B_Memory L2
ENSG00000146409 SLC18B1 663564 sc-eQTL 9.80e-01 0.00231 0.0935 0.25 B_Memory L2
ENSG00000028839 TBPL1 -475267 sc-eQTL 6.42e-01 0.0433 0.093 0.25 B_Naive1 L2
ENSG00000079950 STX7 963705 sc-eQTL 2.75e-01 0.0488 0.0446 0.25 B_Naive1 L2
ENSG00000112303 VNN2 713444 sc-eQTL 2.51e-01 -0.0997 0.0865 0.25 B_Naive1 L2
ENSG00000112306 RPS12 662334 sc-eQTL 5.22e-01 0.0317 0.0494 0.25 B_Naive1 L2
ENSG00000118515 SGK1 -841209 sc-eQTL 7.32e-02 0.138 0.0768 0.25 B_Naive1 L2
ENSG00000146409 SLC18B1 663564 sc-eQTL 9.22e-01 0.0094 0.0954 0.25 B_Naive1 L2
ENSG00000028839 TBPL1 -475267 sc-eQTL 4.23e-01 0.0795 0.099 0.249 B_Naive2 L2
ENSG00000079950 STX7 963705 sc-eQTL 9.28e-01 0.00479 0.0527 0.249 B_Naive2 L2
ENSG00000112303 VNN2 713444 sc-eQTL 5.48e-01 0.0581 0.0966 0.249 B_Naive2 L2
ENSG00000112306 RPS12 662334 sc-eQTL 4.75e-01 0.0366 0.0511 0.249 B_Naive2 L2
ENSG00000118515 SGK1 -841209 sc-eQTL 8.63e-01 0.0156 0.0905 0.249 B_Naive2 L2
ENSG00000146409 SLC18B1 663564 sc-eQTL 1.64e-01 0.136 0.0972 0.249 B_Naive2 L2
ENSG00000028839 TBPL1 -475267 sc-eQTL 2.45e-01 0.116 0.0991 0.252 CD4_CTL L2
ENSG00000079950 STX7 963705 sc-eQTL 2.25e-01 0.12 0.0984 0.252 CD4_CTL L2
ENSG00000112303 VNN2 713444 sc-eQTL 6.78e-01 -0.0414 0.0996 0.252 CD4_CTL L2
ENSG00000112306 RPS12 662334 sc-eQTL 4.95e-01 -0.0315 0.046 0.252 CD4_CTL L2
ENSG00000118515 SGK1 -841209 sc-eQTL 2.20e-01 0.0978 0.0795 0.252 CD4_CTL L2
ENSG00000146409 SLC18B1 663564 sc-eQTL 6.00e-01 0.0487 0.0928 0.252 CD4_CTL L2
ENSG00000028839 TBPL1 -475267 sc-eQTL 9.52e-01 0.00474 0.0789 0.25 CD4_Naive L2
ENSG00000079950 STX7 963705 sc-eQTL 1.19e-01 0.121 0.0769 0.25 CD4_Naive L2
ENSG00000112303 VNN2 713444 sc-eQTL 6.45e-01 0.0331 0.0716 0.25 CD4_Naive L2
ENSG00000112306 RPS12 662334 sc-eQTL 9.20e-01 -0.00468 0.0465 0.25 CD4_Naive L2
ENSG00000118515 SGK1 -841209 sc-eQTL 7.45e-01 0.0186 0.0569 0.25 CD4_Naive L2
ENSG00000146409 SLC18B1 663564 sc-eQTL 1.39e-02 0.219 0.0882 0.25 CD4_Naive L2
ENSG00000028839 TBPL1 -475267 sc-eQTL 4.56e-01 -0.0638 0.0853 0.25 CD4_TCM L2
ENSG00000079950 STX7 963705 sc-eQTL 2.52e-01 0.0985 0.0857 0.25 CD4_TCM L2
ENSG00000112303 VNN2 713444 sc-eQTL 2.82e-01 -0.0911 0.0845 0.25 CD4_TCM L2
ENSG00000112306 RPS12 662334 sc-eQTL 7.57e-02 -0.0778 0.0436 0.25 CD4_TCM L2
ENSG00000118515 SGK1 -841209 sc-eQTL 6.88e-01 -0.0247 0.0615 0.25 CD4_TCM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 663564 sc-eQTL 3.03e-01 0.105 0.101 0.25 CD4_TCM L2
ENSG00000028839 TBPL1 -475267 sc-eQTL 1.43e-01 0.144 0.098 0.25 CD4_TEM L2
ENSG00000079950 STX7 963705 sc-eQTL 1.10e-01 0.157 0.098 0.25 CD4_TEM L2
ENSG00000112303 VNN2 713444 sc-eQTL 3.08e-01 0.0965 0.0944 0.25 CD4_TEM L2
ENSG00000112306 RPS12 662334 sc-eQTL 2.24e-01 -0.0471 0.0387 0.25 CD4_TEM L2
ENSG00000118515 SGK1 -841209 sc-eQTL 8.57e-01 0.0121 0.0667 0.25 CD4_TEM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 663564 sc-eQTL 5.83e-01 0.0531 0.0964 0.25 CD4_TEM L2
ENSG00000028839 TBPL1 -475267 sc-eQTL 1.87e-01 0.115 0.087 0.25 CD8_CTL L2
ENSG00000079950 STX7 963705 sc-eQTL 6.13e-01 -0.0413 0.0816 0.25 CD8_CTL L2
ENSG00000112303 VNN2 713444 sc-eQTL 9.10e-01 -0.0105 0.0928 0.25 CD8_CTL L2
ENSG00000112306 RPS12 662334 sc-eQTL 1.50e-01 -0.0714 0.0494 0.25 CD8_CTL L2
ENSG00000118515 SGK1 -841209 sc-eQTL 6.35e-01 0.0398 0.0838 0.25 CD8_CTL L2
ENSG00000146409 SLC18B1 663564 sc-eQTL 7.28e-01 0.0335 0.0962 0.25 CD8_CTL L2
ENSG00000028839 TBPL1 -475267 sc-eQTL 4.00e-01 0.0784 0.0929 0.25 CD8_Naive L2
ENSG00000079950 STX7 963705 sc-eQTL 5.75e-01 0.0556 0.099 0.25 CD8_Naive L2
ENSG00000112303 VNN2 713444 sc-eQTL 2.81e-01 -0.0922 0.0853 0.25 CD8_Naive L2
ENSG00000112306 RPS12 662334 sc-eQTL 5.69e-01 -0.0279 0.0489 0.25 CD8_Naive L2
ENSG00000118515 SGK1 -841209 sc-eQTL 6.54e-02 -0.113 0.061 0.25 CD8_Naive L2
ENSG00000146409 SLC18B1 663564 sc-eQTL 9.36e-01 -0.00791 0.0982 0.25 CD8_Naive L2
ENSG00000028839 TBPL1 -475267 sc-eQTL 6.93e-01 -0.0413 0.104 0.252 CD8_TCM L2
ENSG00000079950 STX7 963705 sc-eQTL 3.26e-01 0.0949 0.0964 0.252 CD8_TCM L2
ENSG00000112303 VNN2 713444 sc-eQTL 6.44e-01 0.0444 0.0958 0.252 CD8_TCM L2
ENSG00000112306 RPS12 662334 sc-eQTL 2.67e-01 -0.0519 0.0466 0.252 CD8_TCM L2
ENSG00000118515 SGK1 -841209 sc-eQTL 9.38e-02 0.129 0.0768 0.252 CD8_TCM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 663564 sc-eQTL 3.19e-01 0.102 0.102 0.252 CD8_TCM L2
ENSG00000028839 TBPL1 -475267 sc-eQTL 2.32e-01 -0.116 0.0965 0.251 CD8_TEM L2
ENSG00000079950 STX7 963705 sc-eQTL 2.67e-01 -0.117 0.105 0.251 CD8_TEM L2
ENSG00000112303 VNN2 713444 sc-eQTL 1.67e-01 0.145 0.105 0.251 CD8_TEM L2
ENSG00000112306 RPS12 662334 sc-eQTL 9.19e-01 0.00579 0.0566 0.251 CD8_TEM L2
ENSG00000118515 SGK1 -841209 sc-eQTL 6.79e-01 -0.0384 0.0926 0.251 CD8_TEM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 663564 sc-eQTL 4.98e-01 0.0725 0.107 0.251 CD8_TEM L2
ENSG00000028839 TBPL1 -475267 sc-eQTL 4.99e-01 -0.0669 0.0987 0.253 MAIT L2
ENSG00000079950 STX7 963705 sc-eQTL 9.49e-02 0.156 0.0933 0.253 MAIT L2
ENSG00000112303 VNN2 713444 sc-eQTL 9.78e-01 -0.00259 0.0955 0.253 MAIT L2
ENSG00000112306 RPS12 662334 sc-eQTL 1.29e-02 -0.116 0.0463 0.253 MAIT L2
ENSG00000118515 SGK1 -841209 sc-eQTL 9.09e-01 -0.00759 0.0661 0.253 MAIT L2
ENSG00000146409 SLC18B1 663564 sc-eQTL 4.17e-01 0.0799 0.0983 0.253 MAIT L2
ENSG00000028839 TBPL1 -475267 sc-eQTL 9.92e-01 -0.0011 0.109 0.247 NK_CD56bright L2
ENSG00000079950 STX7 963705 sc-eQTL 7.00e-01 0.0388 0.101 0.247 NK_CD56bright L2
ENSG00000112303 VNN2 713444 sc-eQTL 8.31e-01 0.0218 0.102 0.247 NK_CD56bright L2
ENSG00000112306 RPS12 662334 sc-eQTL 9.69e-02 -0.0943 0.0565 0.247 NK_CD56bright L2
ENSG00000118515 SGK1 -841209 sc-eQTL 8.34e-01 0.0178 0.0851 0.247 NK_CD56bright L2
ENSG00000028839 TBPL1 -475267 sc-eQTL 4.56e-01 0.0637 0.0853 0.252 NK_CD56dim L2
ENSG00000079950 STX7 963705 sc-eQTL 9.22e-01 -0.00769 0.0782 0.252 NK_CD56dim L2
ENSG00000112303 VNN2 713444 sc-eQTL 3.52e-02 -0.205 0.0968 0.252 NK_CD56dim L2
ENSG00000112306 RPS12 662334 sc-eQTL 4.43e-01 -0.0298 0.0388 0.252 NK_CD56dim L2
ENSG00000118515 SGK1 -841209 sc-eQTL 7.27e-01 0.03 0.086 0.252 NK_CD56dim L2
ENSG00000028839 TBPL1 -475267 sc-eQTL 8.16e-01 0.0255 0.109 0.249 NK_HLA L2
ENSG00000079950 STX7 963705 sc-eQTL 7.99e-01 0.0253 0.0995 0.249 NK_HLA L2
ENSG00000112303 VNN2 713444 sc-eQTL 3.46e-01 -0.0949 0.1 0.249 NK_HLA L2
ENSG00000112306 RPS12 662334 sc-eQTL 5.33e-01 0.0293 0.0469 0.249 NK_HLA L2
ENSG00000118515 SGK1 -841209 sc-eQTL 5.71e-01 -0.0527 0.0927 0.249 NK_HLA L2
ENSG00000028839 TBPL1 -475267 sc-eQTL 5.38e-01 0.0549 0.0889 0.252 NK_cytokine L2
ENSG00000079950 STX7 963705 sc-eQTL 2.11e-01 0.108 0.0858 0.252 NK_cytokine L2
ENSG00000112303 VNN2 713444 sc-eQTL 1.62e-01 0.135 0.0964 0.252 NK_cytokine L2
ENSG00000112306 RPS12 662334 sc-eQTL 9.95e-01 -0.000298 0.0526 0.252 NK_cytokine L2
ENSG00000118515 SGK1 -841209 sc-eQTL 9.45e-02 -0.146 0.0869 0.252 NK_cytokine L2
ENSG00000028839 TBPL1 -475267 sc-eQTL 8.04e-01 0.0297 0.119 0.252 PB L2
ENSG00000079950 STX7 963705 sc-eQTL 6.01e-01 -0.0445 0.0848 0.252 PB L2
ENSG00000112303 VNN2 713444 sc-eQTL 7.58e-01 -0.0321 0.104 0.252 PB L2
ENSG00000112306 RPS12 662334 sc-eQTL 1.70e-01 -0.0807 0.0584 0.252 PB L2
ENSG00000118515 SGK1 -841209 sc-eQTL 3.88e-01 0.0822 0.0949 0.252 PB L2
ENSG00000146409 SLC18B1 663564 sc-eQTL 3.42e-01 0.105 0.11 0.252 PB L2
ENSG00000028839 TBPL1 -475267 sc-eQTL 4.93e-01 -0.0691 0.1 0.248 Pro_T L2
ENSG00000079950 STX7 963705 sc-eQTL 1.05e-01 0.145 0.0893 0.248 Pro_T L2
ENSG00000112303 VNN2 713444 sc-eQTL 4.63e-01 -0.0708 0.0962 0.248 Pro_T L2
ENSG00000112306 RPS12 662334 sc-eQTL 2.17e-01 -0.045 0.0363 0.248 Pro_T L2
ENSG00000118515 SGK1 -841209 sc-eQTL 3.76e-01 0.0647 0.0729 0.248 Pro_T L2
ENSG00000146409 SLC18B1 663564 sc-eQTL 7.63e-01 0.0285 0.0943 0.248 Pro_T L2
ENSG00000028839 TBPL1 -475267 sc-eQTL 6.22e-01 0.0502 0.102 0.25 Treg L2
ENSG00000079950 STX7 963705 sc-eQTL 3.41e-02 0.202 0.0949 0.25 Treg L2
ENSG00000112303 VNN2 713444 sc-eQTL 9.38e-01 0.00632 0.0807 0.25 Treg L2
ENSG00000112306 RPS12 662334 sc-eQTL 7.72e-01 -0.0104 0.0357 0.25 Treg L2
ENSG00000118515 SGK1 -841209 sc-eQTL 2.63e-01 -0.0841 0.075 0.25 Treg L2
ENSG00000146409 SLC18B1 663564 sc-eQTL 8.92e-01 0.0137 0.101 0.25 Treg L2
ENSG00000028839 TBPL1 -475267 sc-eQTL 9.50e-01 0.00659 0.104 0.268 cDC L2
ENSG00000079950 STX7 963705 sc-eQTL 9.83e-01 0.00178 0.0818 0.268 cDC L2
ENSG00000093134 VNN3 742138 sc-eQTL 8.24e-01 -0.0181 0.0812 0.268 cDC L2
ENSG00000112299 VNN1 762848 sc-eQTL 3.15e-01 0.0959 0.0952 0.268 cDC L2
ENSG00000112303 VNN2 713444 sc-eQTL 5.14e-01 -0.0607 0.0929 0.268 cDC L2
ENSG00000112306 RPS12 662334 sc-eQTL 3.78e-01 -0.0405 0.0458 0.268 cDC L2
ENSG00000118515 SGK1 -841209 sc-eQTL 1.33e-01 0.116 0.0769 0.268 cDC L2
ENSG00000146409 SLC18B1 663564 sc-eQTL 2.09e-01 0.114 0.0906 0.268 cDC L2
ENSG00000286438 AL591115.1 373775 sc-eQTL 4.77e-01 0.0518 0.0726 0.268 cDC L2
ENSG00000286887 AL355881.1 -819398 sc-eQTL 2.50e-02 0.199 0.0882 0.268 cDC L2
ENSG00000028839 TBPL1 -475267 sc-eQTL 5.74e-01 0.0467 0.0829 0.25 cMono_IL1B L2
ENSG00000079950 STX7 963705 sc-eQTL 6.78e-01 -0.0261 0.0629 0.25 cMono_IL1B L2
ENSG00000093134 VNN3 742138 sc-eQTL 5.15e-01 0.0579 0.0889 0.25 cMono_IL1B L2
ENSG00000112299 VNN1 762848 sc-eQTL 2.09e-01 0.113 0.0894 0.25 cMono_IL1B L2
ENSG00000112303 VNN2 713444 sc-eQTL 1.90e-01 -0.094 0.0715 0.25 cMono_IL1B L2
ENSG00000112306 RPS12 662334 sc-eQTL 8.60e-01 0.00705 0.0399 0.25 cMono_IL1B L2
ENSG00000118515 SGK1 -841209 sc-eQTL 8.08e-01 0.0145 0.0594 0.25 cMono_IL1B L2
ENSG00000146409 SLC18B1 663564 sc-eQTL 8.25e-01 0.017 0.0769 0.25 cMono_IL1B L2
ENSG00000286887 AL355881.1 -819398 sc-eQTL 8.89e-02 0.136 0.0795 0.25 cMono_IL1B L2
ENSG00000028839 TBPL1 -475267 sc-eQTL 6.64e-01 0.0407 0.0936 0.25 cMono_S100A L2
ENSG00000079950 STX7 963705 sc-eQTL 9.81e-02 0.112 0.0672 0.25 cMono_S100A L2
ENSG00000093134 VNN3 742138 sc-eQTL 8.50e-01 0.016 0.0845 0.25 cMono_S100A L2
ENSG00000112299 VNN1 762848 sc-eQTL 2.37e-01 0.108 0.0914 0.25 cMono_S100A L2
ENSG00000112303 VNN2 713444 sc-eQTL 2.44e-01 -0.07 0.0599 0.25 cMono_S100A L2
ENSG00000112306 RPS12 662334 sc-eQTL 6.23e-01 0.0213 0.0433 0.25 cMono_S100A L2
ENSG00000118515 SGK1 -841209 sc-eQTL 5.95e-01 0.0263 0.0495 0.25 cMono_S100A L2
ENSG00000146409 SLC18B1 663564 sc-eQTL 5.10e-02 -0.156 0.0794 0.25 cMono_S100A L2
ENSG00000286887 AL355881.1 -819398 sc-eQTL 9.06e-01 -0.00931 0.0783 0.25 cMono_S100A L2
ENSG00000028839 TBPL1 -475267 sc-eQTL 2.90e-01 0.134 0.126 0.255 gdT L2
ENSG00000079950 STX7 963705 sc-eQTL 4.19e-01 -0.0879 0.108 0.255 gdT L2
ENSG00000112303 VNN2 713444 sc-eQTL 2.91e-02 -0.261 0.118 0.255 gdT L2
ENSG00000112306 RPS12 662334 sc-eQTL 3.76e-01 -0.0406 0.0457 0.255 gdT L2
ENSG00000118515 SGK1 -841209 sc-eQTL 4.41e-01 0.0667 0.0863 0.255 gdT L2
ENSG00000146409 SLC18B1 663564 sc-eQTL 3.21e-01 -0.117 0.118 0.255 gdT L2
ENSG00000028839 TBPL1 -475267 sc-eQTL 2.59e-02 0.212 0.0944 0.256 intMono L2
ENSG00000079950 STX7 963705 sc-eQTL 7.46e-01 0.0296 0.0913 0.256 intMono L2
ENSG00000093134 VNN3 742138 sc-eQTL 8.72e-01 -0.0148 0.0922 0.256 intMono L2
ENSG00000112299 VNN1 762848 sc-eQTL 4.15e-01 0.0744 0.091 0.256 intMono L2
ENSG00000112303 VNN2 713444 sc-eQTL 2.04e-01 0.118 0.0923 0.256 intMono L2
ENSG00000112306 RPS12 662334 sc-eQTL 3.21e-01 -0.04 0.0402 0.256 intMono L2
ENSG00000118515 SGK1 -841209 sc-eQTL 6.91e-01 0.027 0.0677 0.256 intMono L2
ENSG00000146409 SLC18B1 663564 sc-eQTL 4.97e-01 0.0666 0.098 0.256 intMono L2
ENSG00000286887 AL355881.1 -819398 sc-eQTL 2.06e-01 0.119 0.0935 0.256 intMono L2
ENSG00000028839 TBPL1 -475267 sc-eQTL 5.39e-01 0.0616 0.1 0.249 ncMono L2
ENSG00000079950 STX7 963705 sc-eQTL 9.91e-01 0.000765 0.0678 0.249 ncMono L2
ENSG00000093134 VNN3 742138 sc-eQTL 9.18e-01 0.00984 0.0957 0.249 ncMono L2
ENSG00000112299 VNN1 762848 sc-eQTL 6.76e-01 0.0397 0.095 0.249 ncMono L2
ENSG00000112303 VNN2 713444 sc-eQTL 6.92e-01 0.0362 0.0913 0.249 ncMono L2
ENSG00000112306 RPS12 662334 sc-eQTL 8.04e-01 0.0114 0.0458 0.249 ncMono L2
ENSG00000118515 SGK1 -841209 sc-eQTL 8.38e-02 0.112 0.0643 0.249 ncMono L2
ENSG00000146409 SLC18B1 663564 sc-eQTL 3.66e-01 0.0732 0.0808 0.249 ncMono L2
ENSG00000286887 AL355881.1 -819398 sc-eQTL 4.25e-01 0.0683 0.0854 0.249 ncMono L2
ENSG00000028839 TBPL1 -475267 sc-eQTL 9.24e-01 0.0113 0.117 0.254 pDC L2
ENSG00000079950 STX7 963705 sc-eQTL 5.45e-01 -0.0473 0.078 0.254 pDC L2
ENSG00000093134 VNN3 742138 sc-eQTL 2.25e-01 -0.0952 0.0782 0.254 pDC L2
ENSG00000112299 VNN1 762848 sc-eQTL 7.59e-01 0.0246 0.08 0.254 pDC L2
ENSG00000112303 VNN2 713444 sc-eQTL 4.57e-01 -0.0709 0.0951 0.254 pDC L2
ENSG00000112306 RPS12 662334 sc-eQTL 5.64e-01 0.0379 0.0655 0.254 pDC L2
ENSG00000118515 SGK1 -841209 sc-eQTL 8.66e-01 0.0113 0.0666 0.254 pDC L2
ENSG00000146409 SLC18B1 663564 sc-eQTL 2.79e-01 -0.105 0.0967 0.254 pDC L2
ENSG00000286438 AL591115.1 373775 sc-eQTL 8.74e-02 0.158 0.092 0.254 pDC L2
ENSG00000286887 AL355881.1 -819398 sc-eQTL 7.65e-01 0.0247 0.0824 0.254 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000028839 TBPL1 -475267 sc-eQTL 9.10e-02 0.167 0.0986 0.25 B_Memory LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 963705 sc-eQTL 6.66e-02 0.1 0.0542 0.25 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 713444 sc-eQTL 1.16e-01 0.136 0.0859 0.25 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 662334 sc-eQTL 7.59e-01 0.0152 0.0492 0.25 B_Memory LOneK1K
ENSG00000118515 SGK1 -841209 sc-eQTL 1.64e-01 0.107 0.0767 0.25 B_Memory LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 663564 sc-eQTL 9.19e-01 -0.00919 0.0904 0.25 B_Memory LOneK1K
ENSG00000028839 TBPL1 -475267 sc-eQTL 2.19e-01 0.114 0.0926 0.25 B_Naive LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 963705 sc-eQTL 3.29e-01 0.0409 0.0418 0.25 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 713444 sc-eQTL 6.14e-01 -0.041 0.0812 0.25 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 662334 sc-eQTL 3.55e-01 0.0455 0.0491 0.25 B_Naive LOneK1K
ENSG00000118515 SGK1 -841209 sc-eQTL 1.28e-01 0.116 0.0757 0.25 B_Naive LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 663564 sc-eQTL 4.98e-01 0.0629 0.0927 0.25 B_Naive LOneK1K
ENSG00000028839 TBPL1 -475267 sc-eQTL 5.88e-01 0.0411 0.0757 0.25 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 963705 sc-eQTL 5.48e-01 0.0317 0.0526 0.25 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000093134 VNN3 742138 sc-eQTL 6.93e-01 0.034 0.0858 0.25 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112299 VNN1 762848 sc-eQTL 1.43e-01 0.131 0.0891 0.25 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 713444 sc-eQTL 1.60e-01 -0.083 0.0589 0.25 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 662334 sc-eQTL 7.36e-01 0.0137 0.0406 0.25 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000118515 SGK1 -841209 sc-eQTL 8.89e-01 0.00773 0.0553 0.25 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 663564 sc-eQTL 4.27e-01 -0.0574 0.0721 0.25 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000286887 AL355881.1 -819398 sc-eQTL 2.86e-01 0.0808 0.0755 0.25 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000028839 TBPL1 -475267 sc-eQTL 1.07e-01 0.157 0.0973 0.252 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 963705 sc-eQTL 7.66e-01 0.0192 0.0646 0.252 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000093134 VNN3 742138 sc-eQTL 9.56e-01 -0.0053 0.0951 0.252 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112299 VNN1 762848 sc-eQTL 2.90e-01 0.0996 0.0939 0.252 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 713444 sc-eQTL 4.78e-01 0.0631 0.0887 0.252 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 662334 sc-eQTL 8.84e-01 -0.00553 0.0377 0.252 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000118515 SGK1 -841209 sc-eQTL 3.19e-01 0.0568 0.0569 0.252 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 663564 sc-eQTL 7.22e-01 0.0326 0.0915 0.252 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000286887 AL355881.1 -819398 sc-eQTL 3.00e-01 0.0857 0.0825 0.252 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000028839 TBPL1 -475267 sc-eQTL 3.78e-01 0.0693 0.0784 0.252 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 963705 sc-eQTL 6.09e-01 0.0378 0.0737 0.252 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 713444 sc-eQTL 4.15e-01 -0.0762 0.0932 0.252 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 662334 sc-eQTL 6.52e-01 -0.0172 0.0381 0.252 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000118515 SGK1 -841209 sc-eQTL 5.54e-01 -0.0466 0.0787 0.252 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000079950 STX7 963705 pQTL 0.0637 -0.0482 0.0259 0.00142 0.0 0.254
ENSG00000079950 STX7 963705 eQTL 0.00727 0.0501 0.0186 0.0 0.0 0.245
ENSG00000112299 VNN1 762848 pQTL 0.00249 0.121 0.04 0.0 0.0 0.254

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina