logo

Genes within 1Mb (chr6:133469378:G:A):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000028839 TBPL1 -482792 sc-eQTL 1.65e-01 0.128 0.0921 0.25 B L1
ENSG00000079950 STX7 956180 sc-eQTL 2.38e-01 0.0434 0.0367 0.25 B L1
ENSG00000112303 VNN2 705919 sc-eQTL 7.15e-01 -0.0254 0.0693 0.25 B L1
ENSG00000112306 RPS12 654809 sc-eQTL 5.13e-01 0.0274 0.0418 0.25 B L1
ENSG00000118515 SGK1 -848734 sc-eQTL 1.48e-01 0.0934 0.0643 0.25 B L1
ENSG00000146409 SLC18B1 656039 sc-eQTL 3.29e-01 0.0861 0.088 0.25 B L1
ENSG00000028839 TBPL1 -482792 sc-eQTL 4.38e-01 0.0535 0.0688 0.25 CD4T L1
ENSG00000079950 STX7 956180 sc-eQTL 2.57e-02 0.159 0.0708 0.25 CD4T L1
ENSG00000112303 VNN2 705919 sc-eQTL 8.21e-01 -0.0141 0.0621 0.25 CD4T L1
ENSG00000112306 RPS12 654809 sc-eQTL 7.30e-01 -0.0146 0.0422 0.25 CD4T L1
ENSG00000118515 SGK1 -848734 sc-eQTL 7.34e-01 -0.0193 0.0567 0.25 CD4T L1
ENSG00000146409 SLC18B1 656039 sc-eQTL 2.56e-02 0.19 0.0844 0.25 CD4T L1
ENSG00000028839 TBPL1 -482792 sc-eQTL 5.53e-01 0.0404 0.0679 0.25 CD8T L1
ENSG00000079950 STX7 956180 sc-eQTL 9.08e-01 0.00826 0.071 0.25 CD8T L1
ENSG00000112303 VNN2 705919 sc-eQTL 5.00e-01 -0.0559 0.0828 0.25 CD8T L1
ENSG00000112306 RPS12 654809 sc-eQTL 2.43e-01 -0.0331 0.0282 0.25 CD8T L1
ENSG00000118515 SGK1 -848734 sc-eQTL 2.51e-01 -0.05 0.0435 0.25 CD8T L1
ENSG00000146409 SLC18B1 656039 sc-eQTL 3.59e-01 0.0786 0.0855 0.25 CD8T L1
ENSG00000028839 TBPL1 -482792 sc-eQTL 9.81e-01 -0.00259 0.106 0.259 DC L1
ENSG00000079950 STX7 956180 sc-eQTL 6.85e-01 -0.0268 0.066 0.259 DC L1
ENSG00000093134 VNN3 734613 sc-eQTL 5.60e-01 -0.0478 0.0818 0.259 DC L1
ENSG00000112299 VNN1 755323 sc-eQTL 1.27e-01 0.135 0.0879 0.259 DC L1
ENSG00000112303 VNN2 705919 sc-eQTL 8.19e-01 -0.0217 0.0946 0.259 DC L1
ENSG00000112306 RPS12 654809 sc-eQTL 3.24e-01 -0.0523 0.0529 0.259 DC L1
ENSG00000118515 SGK1 -848734 sc-eQTL 3.85e-01 0.0535 0.0614 0.259 DC L1
ENSG00000146409 SLC18B1 656039 sc-eQTL 6.22e-01 0.0414 0.0839 0.259 DC L1
ENSG00000286438 AL591115.1 366250 sc-eQTL 1.10e-01 0.122 0.0759 0.259 DC L1
ENSG00000286887 AL355881.1 -826923 sc-eQTL 2.40e-01 0.112 0.0949 0.259 DC L1
ENSG00000028839 TBPL1 -482792 sc-eQTL 2.23e-01 0.0896 0.0733 0.25 Mono L1
ENSG00000079950 STX7 956180 sc-eQTL 5.19e-01 0.0317 0.0492 0.25 Mono L1
ENSG00000093134 VNN3 734613 sc-eQTL 6.80e-01 0.0349 0.0844 0.25 Mono L1
ENSG00000112299 VNN1 755323 sc-eQTL 3.30e-01 0.0885 0.0907 0.25 Mono L1
ENSG00000112303 VNN2 705919 sc-eQTL 1.92e-01 -0.0837 0.0639 0.25 Mono L1
ENSG00000112306 RPS12 654809 sc-eQTL 8.15e-01 0.00901 0.0384 0.25 Mono L1
ENSG00000118515 SGK1 -848734 sc-eQTL 9.43e-01 -0.00388 0.0543 0.25 Mono L1
ENSG00000146409 SLC18B1 656039 sc-eQTL 5.44e-01 -0.0461 0.076 0.25 Mono L1
ENSG00000286887 AL355881.1 -826923 sc-eQTL 3.61e-01 0.0683 0.0746 0.25 Mono L1
ENSG00000028839 TBPL1 -482792 sc-eQTL 4.25e-01 0.0637 0.0797 0.251 NK L1
ENSG00000079950 STX7 956180 sc-eQTL 7.61e-01 0.0225 0.0738 0.251 NK L1
ENSG00000112303 VNN2 705919 sc-eQTL 3.93e-01 -0.0785 0.0917 0.251 NK L1
ENSG00000112306 RPS12 654809 sc-eQTL 5.27e-01 -0.0241 0.038 0.251 NK L1
ENSG00000118515 SGK1 -848734 sc-eQTL 3.13e-01 -0.0709 0.0702 0.251 NK L1
ENSG00000028839 TBPL1 -482792 sc-eQTL 3.93e-01 -0.0785 0.0917 0.25 Other_T L1
ENSG00000079950 STX7 956180 sc-eQTL 1.71e-01 0.0988 0.072 0.25 Other_T L1
ENSG00000112303 VNN2 705919 sc-eQTL 2.48e-01 -0.101 0.0872 0.25 Other_T L1
ENSG00000112306 RPS12 654809 sc-eQTL 9.70e-02 -0.0574 0.0344 0.25 Other_T L1
ENSG00000118515 SGK1 -848734 sc-eQTL 6.33e-01 0.0305 0.0638 0.25 Other_T L1
ENSG00000146409 SLC18B1 656039 sc-eQTL 6.31e-01 0.0456 0.0949 0.25 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000028839 TBPL1 -482792 sc-eQTL 6.31e-01 -0.0525 0.109 0.245 B_Activated L2
ENSG00000079950 STX7 956180 sc-eQTL 8.12e-01 -0.0222 0.0934 0.245 B_Activated L2
ENSG00000112303 VNN2 705919 sc-eQTL 6.50e-01 0.0451 0.0994 0.245 B_Activated L2
ENSG00000112306 RPS12 654809 sc-eQTL 8.42e-01 0.0107 0.0533 0.245 B_Activated L2
ENSG00000118515 SGK1 -848734 sc-eQTL 3.62e-01 0.0866 0.0948 0.245 B_Activated L2
ENSG00000146409 SLC18B1 656039 sc-eQTL 2.65e-01 -0.104 0.093 0.245 B_Activated L2
ENSG00000028839 TBPL1 -482792 sc-eQTL 1.59e-01 0.146 0.103 0.249 B_Intermediate L2
ENSG00000079950 STX7 956180 sc-eQTL 2.39e-02 0.134 0.0587 0.249 B_Intermediate L2
ENSG00000112303 VNN2 705919 sc-eQTL 8.47e-01 -0.0172 0.0895 0.249 B_Intermediate L2
ENSG00000112306 RPS12 654809 sc-eQTL 8.51e-01 -0.0103 0.0548 0.249 B_Intermediate L2
ENSG00000118515 SGK1 -848734 sc-eQTL 6.76e-01 0.0396 0.0947 0.249 B_Intermediate L2
ENSG00000146409 SLC18B1 656039 sc-eQTL 9.86e-01 0.00174 0.0987 0.249 B_Intermediate L2
ENSG00000028839 TBPL1 -482792 sc-eQTL 7.12e-01 -0.0363 0.0983 0.25 B_Memory L2
ENSG00000079950 STX7 956180 sc-eQTL 1.89e-02 0.166 0.0702 0.25 B_Memory L2
ENSG00000112303 VNN2 705919 sc-eQTL 1.16e-01 0.146 0.0925 0.25 B_Memory L2
ENSG00000112306 RPS12 654809 sc-eQTL 6.48e-01 0.0205 0.0448 0.25 B_Memory L2
ENSG00000118515 SGK1 -848734 sc-eQTL 6.65e-04 0.276 0.08 0.25 B_Memory L2
ENSG00000146409 SLC18B1 656039 sc-eQTL 7.58e-01 0.0289 0.0935 0.25 B_Memory L2
ENSG00000028839 TBPL1 -482792 sc-eQTL 4.07e-01 0.0776 0.0934 0.25 B_Naive1 L2
ENSG00000079950 STX7 956180 sc-eQTL 2.89e-01 0.0476 0.0449 0.25 B_Naive1 L2
ENSG00000112303 VNN2 705919 sc-eQTL 1.69e-01 -0.12 0.0869 0.25 B_Naive1 L2
ENSG00000112306 RPS12 654809 sc-eQTL 6.42e-01 0.0231 0.0497 0.25 B_Naive1 L2
ENSG00000118515 SGK1 -848734 sc-eQTL 1.29e-01 0.118 0.0774 0.25 B_Naive1 L2
ENSG00000146409 SLC18B1 656039 sc-eQTL 8.64e-01 0.0165 0.096 0.25 B_Naive1 L2
ENSG00000028839 TBPL1 -482792 sc-eQTL 2.44e-01 0.116 0.0993 0.249 B_Naive2 L2
ENSG00000079950 STX7 956180 sc-eQTL 8.07e-01 0.0129 0.0529 0.249 B_Naive2 L2
ENSG00000112303 VNN2 705919 sc-eQTL 7.60e-01 0.0297 0.0971 0.249 B_Naive2 L2
ENSG00000112306 RPS12 654809 sc-eQTL 5.43e-01 0.0313 0.0514 0.249 B_Naive2 L2
ENSG00000118515 SGK1 -848734 sc-eQTL 8.85e-01 0.0131 0.0909 0.249 B_Naive2 L2
ENSG00000146409 SLC18B1 656039 sc-eQTL 1.56e-01 0.139 0.0976 0.249 B_Naive2 L2
ENSG00000028839 TBPL1 -482792 sc-eQTL 2.58e-01 0.113 0.0993 0.252 CD4_CTL L2
ENSG00000079950 STX7 956180 sc-eQTL 1.88e-01 0.13 0.0985 0.252 CD4_CTL L2
ENSG00000112303 VNN2 705919 sc-eQTL 5.63e-01 -0.0578 0.0997 0.252 CD4_CTL L2
ENSG00000112306 RPS12 654809 sc-eQTL 5.08e-01 -0.0306 0.0461 0.252 CD4_CTL L2
ENSG00000118515 SGK1 -848734 sc-eQTL 2.16e-01 0.0989 0.0797 0.252 CD4_CTL L2
ENSG00000146409 SLC18B1 656039 sc-eQTL 6.55e-01 0.0416 0.0929 0.252 CD4_CTL L2
ENSG00000028839 TBPL1 -482792 sc-eQTL 8.71e-01 -0.013 0.0794 0.25 CD4_Naive L2
ENSG00000079950 STX7 956180 sc-eQTL 1.12e-01 0.124 0.0774 0.25 CD4_Naive L2
ENSG00000112303 VNN2 705919 sc-eQTL 6.98e-01 0.0281 0.0721 0.25 CD4_Naive L2
ENSG00000112306 RPS12 654809 sc-eQTL 8.80e-01 -0.00707 0.0468 0.25 CD4_Naive L2
ENSG00000118515 SGK1 -848734 sc-eQTL 5.61e-01 0.0333 0.0573 0.25 CD4_Naive L2
ENSG00000146409 SLC18B1 656039 sc-eQTL 1.21e-02 0.225 0.0888 0.25 CD4_Naive L2
ENSG00000028839 TBPL1 -482792 sc-eQTL 4.28e-01 -0.0682 0.0859 0.25 CD4_TCM L2
ENSG00000079950 STX7 956180 sc-eQTL 2.35e-01 0.103 0.0863 0.25 CD4_TCM L2
ENSG00000112303 VNN2 705919 sc-eQTL 2.29e-01 -0.103 0.0851 0.25 CD4_TCM L2
ENSG00000112306 RPS12 654809 sc-eQTL 8.35e-02 -0.0764 0.0439 0.25 CD4_TCM L2
ENSG00000118515 SGK1 -848734 sc-eQTL 7.50e-01 -0.0198 0.0619 0.25 CD4_TCM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 656039 sc-eQTL 3.61e-01 0.0937 0.102 0.25 CD4_TCM L2
ENSG00000028839 TBPL1 -482792 sc-eQTL 1.11e-01 0.158 0.0984 0.25 CD4_TEM L2
ENSG00000079950 STX7 956180 sc-eQTL 1.42e-01 0.145 0.0986 0.25 CD4_TEM L2
ENSG00000112303 VNN2 705919 sc-eQTL 2.93e-01 0.0999 0.0949 0.25 CD4_TEM L2
ENSG00000112306 RPS12 654809 sc-eQTL 1.94e-01 -0.0507 0.0389 0.25 CD4_TEM L2
ENSG00000118515 SGK1 -848734 sc-eQTL 7.26e-01 0.0235 0.067 0.25 CD4_TEM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 656039 sc-eQTL 5.56e-01 0.0572 0.0969 0.25 CD4_TEM L2
ENSG00000028839 TBPL1 -482792 sc-eQTL 2.70e-01 0.0967 0.0875 0.25 CD8_CTL L2
ENSG00000079950 STX7 956180 sc-eQTL 7.81e-01 -0.0228 0.082 0.25 CD8_CTL L2
ENSG00000112303 VNN2 705919 sc-eQTL 8.30e-01 -0.02 0.0932 0.25 CD8_CTL L2
ENSG00000112306 RPS12 654809 sc-eQTL 1.73e-01 -0.0679 0.0497 0.25 CD8_CTL L2
ENSG00000118515 SGK1 -848734 sc-eQTL 7.07e-01 0.0317 0.0842 0.25 CD8_CTL L2
ENSG00000146409 SLC18B1 656039 sc-eQTL 8.05e-01 0.0239 0.0966 0.25 CD8_CTL L2
ENSG00000028839 TBPL1 -482792 sc-eQTL 4.54e-01 0.0699 0.0931 0.25 CD8_Naive L2
ENSG00000079950 STX7 956180 sc-eQTL 6.53e-01 0.0446 0.0993 0.25 CD8_Naive L2
ENSG00000112303 VNN2 705919 sc-eQTL 2.66e-01 -0.0954 0.0855 0.25 CD8_Naive L2
ENSG00000112306 RPS12 654809 sc-eQTL 5.45e-01 -0.0298 0.049 0.25 CD8_Naive L2
ENSG00000118515 SGK1 -848734 sc-eQTL 1.28e-01 -0.0937 0.0613 0.25 CD8_Naive L2
ENSG00000146409 SLC18B1 656039 sc-eQTL 8.68e-01 0.0164 0.0985 0.25 CD8_Naive L2
ENSG00000028839 TBPL1 -482792 sc-eQTL 7.32e-01 -0.0357 0.104 0.255 CD8_TCM L2
ENSG00000079950 STX7 956180 sc-eQTL 3.14e-01 0.0974 0.0964 0.255 CD8_TCM L2
ENSG00000112303 VNN2 705919 sc-eQTL 6.06e-01 0.0496 0.0959 0.255 CD8_TCM L2
ENSG00000112306 RPS12 654809 sc-eQTL 2.40e-01 -0.0549 0.0466 0.255 CD8_TCM L2
ENSG00000118515 SGK1 -848734 sc-eQTL 6.05e-02 0.145 0.0767 0.255 CD8_TCM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 656039 sc-eQTL 2.35e-01 0.122 0.102 0.255 CD8_TCM L2
ENSG00000028839 TBPL1 -482792 sc-eQTL 1.77e-01 -0.131 0.0966 0.251 CD8_TEM L2
ENSG00000079950 STX7 956180 sc-eQTL 1.97e-01 -0.136 0.105 0.251 CD8_TEM L2
ENSG00000112303 VNN2 705919 sc-eQTL 2.09e-01 0.132 0.105 0.251 CD8_TEM L2
ENSG00000112306 RPS12 654809 sc-eQTL 8.06e-01 0.0139 0.0566 0.251 CD8_TEM L2
ENSG00000118515 SGK1 -848734 sc-eQTL 8.74e-01 -0.0148 0.0928 0.251 CD8_TEM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 656039 sc-eQTL 5.17e-01 0.0695 0.107 0.251 CD8_TEM L2
ENSG00000028839 TBPL1 -482792 sc-eQTL 4.00e-01 -0.0832 0.0987 0.253 MAIT L2
ENSG00000079950 STX7 956180 sc-eQTL 6.08e-02 0.176 0.0932 0.253 MAIT L2
ENSG00000112303 VNN2 705919 sc-eQTL 7.31e-01 0.0329 0.0955 0.253 MAIT L2
ENSG00000112306 RPS12 654809 sc-eQTL 8.37e-03 -0.123 0.0462 0.253 MAIT L2
ENSG00000118515 SGK1 -848734 sc-eQTL 7.19e-01 -0.0239 0.0661 0.253 MAIT L2
ENSG00000146409 SLC18B1 656039 sc-eQTL 4.40e-01 0.0761 0.0984 0.253 MAIT L2
ENSG00000028839 TBPL1 -482792 sc-eQTL 9.96e-01 0.000571 0.109 0.247 NK_CD56bright L2
ENSG00000079950 STX7 956180 sc-eQTL 8.15e-01 0.0236 0.101 0.247 NK_CD56bright L2
ENSG00000112303 VNN2 705919 sc-eQTL 8.91e-01 -0.014 0.102 0.247 NK_CD56bright L2
ENSG00000112306 RPS12 654809 sc-eQTL 1.01e-01 -0.0934 0.0566 0.247 NK_CD56bright L2
ENSG00000118515 SGK1 -848734 sc-eQTL 8.71e-01 0.0139 0.0852 0.247 NK_CD56bright L2
ENSG00000028839 TBPL1 -482792 sc-eQTL 5.06e-01 0.0569 0.0855 0.252 NK_CD56dim L2
ENSG00000079950 STX7 956180 sc-eQTL 8.82e-01 -0.0117 0.0783 0.252 NK_CD56dim L2
ENSG00000112303 VNN2 705919 sc-eQTL 3.53e-02 -0.205 0.0969 0.252 NK_CD56dim L2
ENSG00000112306 RPS12 654809 sc-eQTL 3.56e-01 -0.0359 0.0388 0.252 NK_CD56dim L2
ENSG00000118515 SGK1 -848734 sc-eQTL 6.66e-01 0.0372 0.0861 0.252 NK_CD56dim L2
ENSG00000028839 TBPL1 -482792 sc-eQTL 7.49e-01 0.0351 0.109 0.249 NK_HLA L2
ENSG00000079950 STX7 956180 sc-eQTL 9.11e-01 0.0111 0.0996 0.249 NK_HLA L2
ENSG00000112303 VNN2 705919 sc-eQTL 2.40e-01 -0.118 0.1 0.249 NK_HLA L2
ENSG00000112306 RPS12 654809 sc-eQTL 6.62e-01 0.0205 0.0469 0.249 NK_HLA L2
ENSG00000118515 SGK1 -848734 sc-eQTL 6.10e-01 -0.0474 0.0928 0.249 NK_HLA L2
ENSG00000028839 TBPL1 -482792 sc-eQTL 5.93e-01 0.0477 0.0891 0.252 NK_cytokine L2
ENSG00000079950 STX7 956180 sc-eQTL 2.20e-01 0.106 0.086 0.252 NK_cytokine L2
ENSG00000112303 VNN2 705919 sc-eQTL 2.59e-01 0.11 0.0968 0.252 NK_cytokine L2
ENSG00000112306 RPS12 654809 sc-eQTL 8.93e-01 -0.0071 0.0527 0.252 NK_cytokine L2
ENSG00000118515 SGK1 -848734 sc-eQTL 6.72e-02 -0.16 0.087 0.252 NK_cytokine L2
ENSG00000028839 TBPL1 -482792 sc-eQTL 6.50e-01 0.0541 0.119 0.248 PB L2
ENSG00000079950 STX7 956180 sc-eQTL 6.05e-01 -0.0439 0.0846 0.248 PB L2
ENSG00000112303 VNN2 705919 sc-eQTL 7.44e-01 -0.0338 0.103 0.248 PB L2
ENSG00000112306 RPS12 654809 sc-eQTL 1.51e-01 -0.0841 0.0582 0.248 PB L2
ENSG00000118515 SGK1 -848734 sc-eQTL 3.76e-01 0.0841 0.0945 0.248 PB L2
ENSG00000146409 SLC18B1 656039 sc-eQTL 3.69e-01 0.099 0.11 0.248 PB L2
ENSG00000028839 TBPL1 -482792 sc-eQTL 4.49e-01 -0.0762 0.101 0.248 Pro_T L2
ENSG00000079950 STX7 956180 sc-eQTL 9.85e-02 0.148 0.0893 0.248 Pro_T L2
ENSG00000112303 VNN2 705919 sc-eQTL 4.91e-01 -0.0664 0.0963 0.248 Pro_T L2
ENSG00000112306 RPS12 654809 sc-eQTL 2.50e-01 -0.0419 0.0364 0.248 Pro_T L2
ENSG00000118515 SGK1 -848734 sc-eQTL 4.89e-01 0.0506 0.073 0.248 Pro_T L2
ENSG00000146409 SLC18B1 656039 sc-eQTL 8.54e-01 0.0174 0.0944 0.248 Pro_T L2
ENSG00000028839 TBPL1 -482792 sc-eQTL 6.43e-01 0.0474 0.102 0.25 Treg L2
ENSG00000079950 STX7 956180 sc-eQTL 4.90e-02 0.189 0.0954 0.25 Treg L2
ENSG00000112303 VNN2 705919 sc-eQTL 8.37e-01 0.0167 0.081 0.25 Treg L2
ENSG00000112306 RPS12 654809 sc-eQTL 9.31e-01 -0.00312 0.0358 0.25 Treg L2
ENSG00000118515 SGK1 -848734 sc-eQTL 2.98e-01 -0.0785 0.0753 0.25 Treg L2
ENSG00000146409 SLC18B1 656039 sc-eQTL 9.79e-01 0.00269 0.101 0.25 Treg L2
ENSG00000028839 TBPL1 -482792 sc-eQTL 8.41e-01 0.021 0.104 0.271 cDC L2
ENSG00000079950 STX7 956180 sc-eQTL 9.95e-01 0.000555 0.0818 0.271 cDC L2
ENSG00000093134 VNN3 734613 sc-eQTL 7.52e-01 -0.0257 0.0812 0.271 cDC L2
ENSG00000112299 VNN1 755323 sc-eQTL 2.47e-01 0.111 0.0952 0.271 cDC L2
ENSG00000112303 VNN2 705919 sc-eQTL 5.76e-01 -0.0521 0.093 0.271 cDC L2
ENSG00000112306 RPS12 654809 sc-eQTL 4.22e-01 -0.037 0.0459 0.271 cDC L2
ENSG00000118515 SGK1 -848734 sc-eQTL 1.31e-01 0.117 0.0769 0.271 cDC L2
ENSG00000146409 SLC18B1 656039 sc-eQTL 2.25e-01 0.11 0.0906 0.271 cDC L2
ENSG00000286438 AL591115.1 366250 sc-eQTL 5.11e-01 0.0479 0.0727 0.271 cDC L2
ENSG00000286887 AL355881.1 -826923 sc-eQTL 3.57e-02 0.187 0.0884 0.271 cDC L2
ENSG00000028839 TBPL1 -482792 sc-eQTL 4.72e-01 0.0598 0.0831 0.25 cMono_IL1B L2
ENSG00000079950 STX7 956180 sc-eQTL 5.45e-01 -0.0383 0.0631 0.25 cMono_IL1B L2
ENSG00000093134 VNN3 734613 sc-eQTL 3.48e-01 0.0838 0.089 0.25 cMono_IL1B L2
ENSG00000112299 VNN1 755323 sc-eQTL 2.23e-01 0.11 0.0897 0.25 cMono_IL1B L2
ENSG00000112303 VNN2 705919 sc-eQTL 1.93e-01 -0.0937 0.0717 0.25 cMono_IL1B L2
ENSG00000112306 RPS12 654809 sc-eQTL 6.38e-01 0.0188 0.0399 0.25 cMono_IL1B L2
ENSG00000118515 SGK1 -848734 sc-eQTL 8.80e-01 0.00903 0.0596 0.25 cMono_IL1B L2
ENSG00000146409 SLC18B1 656039 sc-eQTL 7.26e-01 0.027 0.0771 0.25 cMono_IL1B L2
ENSG00000286887 AL355881.1 -826923 sc-eQTL 8.13e-02 0.14 0.0797 0.25 cMono_IL1B L2
ENSG00000028839 TBPL1 -482792 sc-eQTL 5.07e-01 0.0623 0.0937 0.25 cMono_S100A L2
ENSG00000079950 STX7 956180 sc-eQTL 1.61e-01 0.0948 0.0674 0.25 cMono_S100A L2
ENSG00000093134 VNN3 734613 sc-eQTL 7.47e-01 0.0273 0.0846 0.25 cMono_S100A L2
ENSG00000112299 VNN1 755323 sc-eQTL 2.51e-01 0.105 0.0916 0.25 cMono_S100A L2
ENSG00000112303 VNN2 705919 sc-eQTL 3.71e-01 -0.0539 0.0601 0.25 cMono_S100A L2
ENSG00000112306 RPS12 654809 sc-eQTL 5.39e-01 0.0266 0.0433 0.25 cMono_S100A L2
ENSG00000118515 SGK1 -848734 sc-eQTL 6.41e-01 0.0231 0.0495 0.25 cMono_S100A L2
ENSG00000146409 SLC18B1 656039 sc-eQTL 8.66e-02 -0.137 0.0796 0.25 cMono_S100A L2
ENSG00000286887 AL355881.1 -826923 sc-eQTL 9.76e-01 -0.00238 0.0784 0.25 cMono_S100A L2
ENSG00000028839 TBPL1 -482792 sc-eQTL 3.14e-01 0.126 0.125 0.258 gdT L2
ENSG00000079950 STX7 956180 sc-eQTL 4.04e-01 -0.0902 0.108 0.258 gdT L2
ENSG00000112303 VNN2 705919 sc-eQTL 2.72e-02 -0.262 0.118 0.258 gdT L2
ENSG00000112306 RPS12 654809 sc-eQTL 3.17e-01 -0.0456 0.0454 0.258 gdT L2
ENSG00000118515 SGK1 -848734 sc-eQTL 5.33e-01 0.0537 0.0858 0.258 gdT L2
ENSG00000146409 SLC18B1 656039 sc-eQTL 2.61e-01 -0.132 0.117 0.258 gdT L2
ENSG00000028839 TBPL1 -482792 sc-eQTL 3.44e-02 0.202 0.0949 0.256 intMono L2
ENSG00000079950 STX7 956180 sc-eQTL 8.95e-01 0.0121 0.0916 0.256 intMono L2
ENSG00000093134 VNN3 734613 sc-eQTL 9.54e-01 0.00529 0.0925 0.256 intMono L2
ENSG00000112299 VNN1 755323 sc-eQTL 5.77e-01 0.0511 0.0914 0.256 intMono L2
ENSG00000112303 VNN2 705919 sc-eQTL 3.03e-01 0.0957 0.0927 0.256 intMono L2
ENSG00000112306 RPS12 654809 sc-eQTL 3.54e-01 -0.0375 0.0404 0.256 intMono L2
ENSG00000118515 SGK1 -848734 sc-eQTL 8.14e-01 0.016 0.0679 0.256 intMono L2
ENSG00000146409 SLC18B1 656039 sc-eQTL 5.15e-01 0.0641 0.0984 0.256 intMono L2
ENSG00000286887 AL355881.1 -826923 sc-eQTL 2.09e-01 0.118 0.0938 0.256 intMono L2
ENSG00000028839 TBPL1 -482792 sc-eQTL 5.84e-01 0.0552 0.101 0.249 ncMono L2
ENSG00000079950 STX7 956180 sc-eQTL 9.39e-01 0.00521 0.0682 0.249 ncMono L2
ENSG00000093134 VNN3 734613 sc-eQTL 7.86e-01 0.0262 0.0962 0.249 ncMono L2
ENSG00000112299 VNN1 755323 sc-eQTL 7.61e-01 0.0291 0.0955 0.249 ncMono L2
ENSG00000112303 VNN2 705919 sc-eQTL 7.45e-01 0.0299 0.0918 0.249 ncMono L2
ENSG00000112306 RPS12 654809 sc-eQTL 8.86e-01 0.00661 0.0461 0.249 ncMono L2
ENSG00000118515 SGK1 -848734 sc-eQTL 7.74e-02 0.115 0.0647 0.249 ncMono L2
ENSG00000146409 SLC18B1 656039 sc-eQTL 2.64e-01 0.0909 0.0811 0.249 ncMono L2
ENSG00000286887 AL355881.1 -826923 sc-eQTL 4.05e-01 0.0717 0.0859 0.249 ncMono L2
ENSG00000028839 TBPL1 -482792 sc-eQTL 9.04e-01 0.0142 0.117 0.257 pDC L2
ENSG00000079950 STX7 956180 sc-eQTL 5.51e-01 -0.0466 0.078 0.257 pDC L2
ENSG00000093134 VNN3 734613 sc-eQTL 2.01e-01 -0.1 0.0782 0.257 pDC L2
ENSG00000112299 VNN1 755323 sc-eQTL 6.26e-01 0.039 0.0799 0.257 pDC L2
ENSG00000112303 VNN2 705919 sc-eQTL 5.29e-01 -0.06 0.0951 0.257 pDC L2
ENSG00000112306 RPS12 654809 sc-eQTL 5.99e-01 0.0345 0.0655 0.257 pDC L2
ENSG00000118515 SGK1 -848734 sc-eQTL 8.23e-01 0.0149 0.0666 0.257 pDC L2
ENSG00000146409 SLC18B1 656039 sc-eQTL 3.19e-01 -0.0968 0.0968 0.257 pDC L2
ENSG00000286438 AL591115.1 366250 sc-eQTL 1.12e-01 0.147 0.0921 0.257 pDC L2
ENSG00000286887 AL355881.1 -826923 sc-eQTL 8.81e-01 0.0123 0.0824 0.257 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000028839 TBPL1 -482792 sc-eQTL 1.24e-01 0.153 0.0991 0.25 B_Memory LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 956180 sc-eQTL 4.17e-02 0.111 0.0543 0.25 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 705919 sc-eQTL 1.85e-01 0.115 0.0864 0.25 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 654809 sc-eQTL 8.91e-01 0.0068 0.0494 0.25 B_Memory LOneK1K
ENSG00000118515 SGK1 -848734 sc-eQTL 1.51e-01 0.111 0.0769 0.25 B_Memory LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 656039 sc-eQTL 9.11e-01 -0.0101 0.0907 0.25 B_Memory LOneK1K
ENSG00000028839 TBPL1 -482792 sc-eQTL 9.41e-02 0.156 0.0927 0.25 B_Naive LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 956180 sc-eQTL 3.11e-01 0.0426 0.042 0.25 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 705919 sc-eQTL 3.82e-01 -0.0714 0.0815 0.25 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 654809 sc-eQTL 4.28e-01 0.0392 0.0493 0.25 B_Naive LOneK1K
ENSG00000118515 SGK1 -848734 sc-eQTL 1.97e-01 0.0986 0.0762 0.25 B_Naive LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 656039 sc-eQTL 4.65e-01 0.0682 0.0931 0.25 B_Naive LOneK1K
ENSG00000028839 TBPL1 -482792 sc-eQTL 4.21e-01 0.0612 0.0758 0.25 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 956180 sc-eQTL 7.61e-01 0.0161 0.0528 0.25 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000093134 VNN3 734613 sc-eQTL 5.01e-01 0.0579 0.086 0.25 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112299 VNN1 755323 sc-eQTL 1.50e-01 0.129 0.0893 0.25 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 705919 sc-eQTL 2.05e-01 -0.0753 0.0591 0.25 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 654809 sc-eQTL 5.77e-01 0.0227 0.0407 0.25 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000118515 SGK1 -848734 sc-eQTL 9.58e-01 0.00292 0.0555 0.25 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 656039 sc-eQTL 5.37e-01 -0.0448 0.0724 0.25 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000286887 AL355881.1 -826923 sc-eQTL 2.50e-01 0.0873 0.0757 0.25 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000028839 TBPL1 -482792 sc-eQTL 1.37e-01 0.146 0.0978 0.252 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 956180 sc-eQTL 8.51e-01 0.0122 0.0649 0.252 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000093134 VNN3 734613 sc-eQTL 8.89e-01 0.0133 0.0954 0.252 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112299 VNN1 755323 sc-eQTL 3.15e-01 0.0951 0.0943 0.252 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 705919 sc-eQTL 5.02e-01 0.0599 0.0891 0.252 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 654809 sc-eQTL 8.81e-01 -0.00569 0.0378 0.252 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000118515 SGK1 -848734 sc-eQTL 3.30e-01 0.0558 0.0571 0.252 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 656039 sc-eQTL 6.36e-01 0.0435 0.0918 0.252 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000286887 AL355881.1 -826923 sc-eQTL 3.02e-01 0.0857 0.0828 0.252 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000028839 TBPL1 -482792 sc-eQTL 4.00e-01 0.0662 0.0785 0.252 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 956180 sc-eQTL 6.61e-01 0.0324 0.0739 0.252 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 705919 sc-eQTL 3.26e-01 -0.092 0.0933 0.252 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 654809 sc-eQTL 4.95e-01 -0.0261 0.0381 0.252 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000118515 SGK1 -848734 sc-eQTL 5.57e-01 -0.0463 0.0788 0.252 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000079950 STX7 956180 pQTL 0.0817 -0.0453 0.026 0.00153 0.0 0.249
ENSG00000079950 STX7 956180 eQTL 0.00623 0.0512 0.0187 0.0 0.0 0.239
ENSG00000112299 VNN1 755323 pQTL 0.00458 0.114 0.0402 0.0 0.0 0.249

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina