logo

Genes within 1Mb (chr6:133466526:C:G):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000028839 TBPL1 -485644 sc-eQTL 4.45e-01 0.0701 0.0916 0.241 B L1
ENSG00000079950 STX7 953328 sc-eQTL 1.31e-01 0.055 0.0363 0.241 B L1
ENSG00000112303 VNN2 703067 sc-eQTL 6.41e-01 -0.032 0.0686 0.241 B L1
ENSG00000112306 RPS12 651957 sc-eQTL 4.14e-01 0.0339 0.0414 0.241 B L1
ENSG00000118515 SGK1 -851586 sc-eQTL 3.58e-01 0.0589 0.0639 0.241 B L1
ENSG00000146409 SLC18B1 653187 sc-eQTL 2.66e-01 0.0972 0.0871 0.241 B L1
ENSG00000028839 TBPL1 -485644 sc-eQTL 4.93e-01 0.0462 0.0673 0.241 CD4T L1
ENSG00000079950 STX7 953328 sc-eQTL 2.87e-02 0.152 0.0692 0.241 CD4T L1
ENSG00000112303 VNN2 703067 sc-eQTL 5.59e-01 0.0355 0.0606 0.241 CD4T L1
ENSG00000112306 RPS12 651957 sc-eQTL 5.30e-01 -0.0259 0.0412 0.241 CD4T L1
ENSG00000118515 SGK1 -851586 sc-eQTL 7.45e-01 -0.018 0.0554 0.241 CD4T L1
ENSG00000146409 SLC18B1 653187 sc-eQTL 1.47e-01 0.121 0.083 0.241 CD4T L1
ENSG00000028839 TBPL1 -485644 sc-eQTL 5.84e-01 0.0366 0.0667 0.241 CD8T L1
ENSG00000079950 STX7 953328 sc-eQTL 9.78e-01 -0.00188 0.0697 0.241 CD8T L1
ENSG00000112303 VNN2 703067 sc-eQTL 4.40e-01 -0.0629 0.0813 0.241 CD8T L1
ENSG00000112306 RPS12 651957 sc-eQTL 5.76e-01 -0.0156 0.0278 0.241 CD8T L1
ENSG00000118515 SGK1 -851586 sc-eQTL 7.77e-01 -0.0121 0.0429 0.241 CD8T L1
ENSG00000146409 SLC18B1 653187 sc-eQTL 2.50e-01 0.0968 0.0838 0.241 CD8T L1
ENSG00000028839 TBPL1 -485644 sc-eQTL 8.39e-01 0.0206 0.102 0.245 DC L1
ENSG00000079950 STX7 953328 sc-eQTL 8.84e-01 0.0092 0.0631 0.245 DC L1
ENSG00000093134 VNN3 731761 sc-eQTL 3.93e-01 -0.0668 0.0781 0.245 DC L1
ENSG00000112299 VNN1 752471 sc-eQTL 1.97e-01 0.109 0.0841 0.245 DC L1
ENSG00000112303 VNN2 703067 sc-eQTL 7.77e-01 -0.0256 0.0904 0.245 DC L1
ENSG00000112306 RPS12 651957 sc-eQTL 2.91e-01 -0.0535 0.0505 0.245 DC L1
ENSG00000118515 SGK1 -851586 sc-eQTL 1.32e-01 0.0884 0.0585 0.245 DC L1
ENSG00000146409 SLC18B1 653187 sc-eQTL 6.68e-01 -0.0344 0.0802 0.245 DC L1
ENSG00000286438 AL591115.1 363398 sc-eQTL 4.30e-01 0.0577 0.0729 0.245 DC L1
ENSG00000286887 AL355881.1 -829775 sc-eQTL 4.63e-01 0.0668 0.0909 0.245 DC L1
ENSG00000028839 TBPL1 -485644 sc-eQTL 9.16e-01 0.0075 0.0713 0.241 Mono L1
ENSG00000079950 STX7 953328 sc-eQTL 7.22e-01 0.017 0.0477 0.241 Mono L1
ENSG00000093134 VNN3 731761 sc-eQTL 6.81e-01 -0.0337 0.0818 0.241 Mono L1
ENSG00000112299 VNN1 752471 sc-eQTL 3.63e-02 0.184 0.0872 0.241 Mono L1
ENSG00000112303 VNN2 703067 sc-eQTL 2.65e-01 -0.0693 0.062 0.241 Mono L1
ENSG00000112306 RPS12 651957 sc-eQTL 1.93e-01 -0.0485 0.0371 0.241 Mono L1
ENSG00000118515 SGK1 -851586 sc-eQTL 1.66e-01 0.0727 0.0524 0.241 Mono L1
ENSG00000146409 SLC18B1 653187 sc-eQTL 5.32e-01 -0.0461 0.0736 0.241 Mono L1
ENSG00000286887 AL355881.1 -829775 sc-eQTL 2.32e-01 0.0866 0.0722 0.241 Mono L1
ENSG00000028839 TBPL1 -485644 sc-eQTL 7.72e-01 0.0226 0.0776 0.24 NK L1
ENSG00000079950 STX7 953328 sc-eQTL 7.82e-01 0.0199 0.0718 0.24 NK L1
ENSG00000112303 VNN2 703067 sc-eQTL 1.55e-01 -0.127 0.0889 0.24 NK L1
ENSG00000112306 RPS12 651957 sc-eQTL 2.07e-01 -0.0466 0.0368 0.24 NK L1
ENSG00000118515 SGK1 -851586 sc-eQTL 9.96e-01 0.000333 0.0684 0.24 NK L1
ENSG00000028839 TBPL1 -485644 sc-eQTL 2.25e-01 -0.111 0.0911 0.241 Other_T L1
ENSG00000079950 STX7 953328 sc-eQTL 1.14e-01 0.114 0.0715 0.241 Other_T L1
ENSG00000112303 VNN2 703067 sc-eQTL 9.06e-01 -0.0103 0.087 0.241 Other_T L1
ENSG00000112306 RPS12 651957 sc-eQTL 2.80e-01 -0.0373 0.0344 0.241 Other_T L1
ENSG00000118515 SGK1 -851586 sc-eQTL 6.43e-01 0.0294 0.0635 0.241 Other_T L1
ENSG00000146409 SLC18B1 653187 sc-eQTL 8.04e-01 0.0235 0.0945 0.241 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000028839 TBPL1 -485644 sc-eQTL 4.68e-01 -0.078 0.107 0.23 B_Activated L2
ENSG00000079950 STX7 953328 sc-eQTL 4.96e-01 -0.0627 0.0919 0.23 B_Activated L2
ENSG00000112303 VNN2 703067 sc-eQTL 1.47e-01 0.142 0.0973 0.23 B_Activated L2
ENSG00000112306 RPS12 651957 sc-eQTL 9.47e-01 -0.00349 0.0525 0.23 B_Activated L2
ENSG00000118515 SGK1 -851586 sc-eQTL 1.20e-01 0.145 0.0929 0.23 B_Activated L2
ENSG00000146409 SLC18B1 653187 sc-eQTL 3.71e-01 -0.0822 0.0917 0.23 B_Activated L2
ENSG00000028839 TBPL1 -485644 sc-eQTL 7.24e-02 0.181 0.1 0.24 B_Intermediate L2
ENSG00000079950 STX7 953328 sc-eQTL 5.91e-02 0.109 0.0575 0.24 B_Intermediate L2
ENSG00000112303 VNN2 703067 sc-eQTL 6.23e-01 -0.043 0.0873 0.24 B_Intermediate L2
ENSG00000112306 RPS12 651957 sc-eQTL 8.60e-01 0.00943 0.0535 0.24 B_Intermediate L2
ENSG00000118515 SGK1 -851586 sc-eQTL 2.77e-01 0.101 0.0922 0.24 B_Intermediate L2
ENSG00000146409 SLC18B1 653187 sc-eQTL 2.04e-01 0.122 0.096 0.24 B_Intermediate L2
ENSG00000028839 TBPL1 -485644 sc-eQTL 1.81e-01 -0.129 0.0962 0.241 B_Memory L2
ENSG00000079950 STX7 953328 sc-eQTL 3.68e-03 0.201 0.0685 0.241 B_Memory L2
ENSG00000112303 VNN2 703067 sc-eQTL 8.44e-02 0.157 0.0908 0.241 B_Memory L2
ENSG00000112306 RPS12 651957 sc-eQTL 8.67e-01 0.00741 0.044 0.241 B_Memory L2
ENSG00000118515 SGK1 -851586 sc-eQTL 2.25e-02 0.183 0.0798 0.241 B_Memory L2
ENSG00000146409 SLC18B1 653187 sc-eQTL 2.13e-01 0.114 0.0916 0.241 B_Memory L2
ENSG00000028839 TBPL1 -485644 sc-eQTL 6.39e-01 0.0432 0.0918 0.241 B_Naive1 L2
ENSG00000079950 STX7 953328 sc-eQTL 3.24e-01 0.0435 0.044 0.241 B_Naive1 L2
ENSG00000112303 VNN2 703067 sc-eQTL 6.31e-02 -0.159 0.085 0.241 B_Naive1 L2
ENSG00000112306 RPS12 651957 sc-eQTL 2.27e-01 0.0589 0.0486 0.241 B_Naive1 L2
ENSG00000118515 SGK1 -851586 sc-eQTL 1.97e-01 0.0985 0.0761 0.241 B_Naive1 L2
ENSG00000146409 SLC18B1 653187 sc-eQTL 9.46e-01 -0.00635 0.0942 0.241 B_Naive1 L2
ENSG00000028839 TBPL1 -485644 sc-eQTL 9.69e-01 -0.00384 0.0978 0.24 B_Naive2 L2
ENSG00000079950 STX7 953328 sc-eQTL 4.01e-01 0.0436 0.0518 0.24 B_Naive2 L2
ENSG00000112303 VNN2 703067 sc-eQTL 7.71e-01 0.0278 0.0953 0.24 B_Naive2 L2
ENSG00000112306 RPS12 651957 sc-eQTL 1.74e-01 0.0686 0.0503 0.24 B_Naive2 L2
ENSG00000118515 SGK1 -851586 sc-eQTL 4.85e-01 0.0624 0.0891 0.24 B_Naive2 L2
ENSG00000146409 SLC18B1 653187 sc-eQTL 7.82e-01 0.0266 0.0963 0.24 B_Naive2 L2
ENSG00000028839 TBPL1 -485644 sc-eQTL 9.07e-02 0.165 0.097 0.243 CD4_CTL L2
ENSG00000079950 STX7 953328 sc-eQTL 3.96e-01 0.0824 0.0969 0.243 CD4_CTL L2
ENSG00000112303 VNN2 703067 sc-eQTL 6.40e-01 0.0459 0.0978 0.243 CD4_CTL L2
ENSG00000112306 RPS12 651957 sc-eQTL 8.52e-01 -0.00843 0.0452 0.243 CD4_CTL L2
ENSG00000118515 SGK1 -851586 sc-eQTL 3.05e-01 0.0805 0.0782 0.243 CD4_CTL L2
ENSG00000146409 SLC18B1 653187 sc-eQTL 2.73e-01 0.1 0.0909 0.243 CD4_CTL L2
ENSG00000028839 TBPL1 -485644 sc-eQTL 2.84e-01 -0.0827 0.077 0.241 CD4_Naive L2
ENSG00000079950 STX7 953328 sc-eQTL 2.47e-02 0.169 0.0748 0.241 CD4_Naive L2
ENSG00000112303 VNN2 703067 sc-eQTL 3.56e-01 0.0648 0.07 0.241 CD4_Naive L2
ENSG00000112306 RPS12 651957 sc-eQTL 7.44e-01 -0.0149 0.0455 0.241 CD4_Naive L2
ENSG00000118515 SGK1 -851586 sc-eQTL 8.32e-01 0.0118 0.0557 0.241 CD4_Naive L2
ENSG00000146409 SLC18B1 653187 sc-eQTL 1.24e-01 0.134 0.0871 0.241 CD4_Naive L2
ENSG00000028839 TBPL1 -485644 sc-eQTL 6.56e-01 0.0371 0.0833 0.241 CD4_TCM L2
ENSG00000079950 STX7 953328 sc-eQTL 5.12e-01 0.0551 0.0838 0.241 CD4_TCM L2
ENSG00000112303 VNN2 703067 sc-eQTL 6.52e-02 -0.152 0.0821 0.241 CD4_TCM L2
ENSG00000112306 RPS12 651957 sc-eQTL 1.44e-01 -0.0625 0.0427 0.241 CD4_TCM L2
ENSG00000118515 SGK1 -851586 sc-eQTL 5.88e-01 0.0325 0.06 0.241 CD4_TCM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 653187 sc-eQTL 3.93e-01 0.0848 0.0991 0.241 CD4_TCM L2
ENSG00000028839 TBPL1 -485644 sc-eQTL 4.01e-01 0.0805 0.0956 0.241 CD4_TEM L2
ENSG00000079950 STX7 953328 sc-eQTL 9.68e-01 -0.00391 0.0958 0.241 CD4_TEM L2
ENSG00000112303 VNN2 703067 sc-eQTL 9.96e-02 0.151 0.0914 0.241 CD4_TEM L2
ENSG00000112306 RPS12 651957 sc-eQTL 2.01e-01 -0.0482 0.0376 0.241 CD4_TEM L2
ENSG00000118515 SGK1 -851586 sc-eQTL 8.96e-01 0.00847 0.0648 0.241 CD4_TEM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 653187 sc-eQTL 1.16e-01 0.147 0.0932 0.241 CD4_TEM L2
ENSG00000028839 TBPL1 -485644 sc-eQTL 7.75e-01 0.0246 0.086 0.241 CD8_CTL L2
ENSG00000079950 STX7 953328 sc-eQTL 5.45e-01 -0.0487 0.0803 0.241 CD8_CTL L2
ENSG00000112303 VNN2 703067 sc-eQTL 6.35e-01 -0.0434 0.0913 0.241 CD8_CTL L2
ENSG00000112306 RPS12 651957 sc-eQTL 7.63e-01 -0.0148 0.0489 0.241 CD8_CTL L2
ENSG00000118515 SGK1 -851586 sc-eQTL 5.01e-02 0.161 0.0818 0.241 CD8_CTL L2
ENSG00000146409 SLC18B1 653187 sc-eQTL 7.42e-01 -0.0312 0.0947 0.241 CD8_CTL L2
ENSG00000028839 TBPL1 -485644 sc-eQTL 5.72e-01 0.0519 0.0918 0.241 CD8_Naive L2
ENSG00000079950 STX7 953328 sc-eQTL 4.90e-01 0.0675 0.0977 0.241 CD8_Naive L2
ENSG00000112303 VNN2 703067 sc-eQTL 2.63e-01 -0.0945 0.0842 0.241 CD8_Naive L2
ENSG00000112306 RPS12 651957 sc-eQTL 5.48e-01 -0.029 0.0483 0.241 CD8_Naive L2
ENSG00000118515 SGK1 -851586 sc-eQTL 4.65e-01 -0.0443 0.0606 0.241 CD8_Naive L2
ENSG00000146409 SLC18B1 653187 sc-eQTL 2.11e-01 0.121 0.0966 0.241 CD8_Naive L2
ENSG00000028839 TBPL1 -485644 sc-eQTL 2.16e-01 -0.125 0.1 0.248 CD8_TCM L2
ENSG00000079950 STX7 953328 sc-eQTL 1.02e-01 0.152 0.0927 0.248 CD8_TCM L2
ENSG00000112303 VNN2 703067 sc-eQTL 4.31e-01 -0.0731 0.0925 0.248 CD8_TCM L2
ENSG00000112306 RPS12 651957 sc-eQTL 4.46e-01 -0.0344 0.0451 0.248 CD8_TCM L2
ENSG00000118515 SGK1 -851586 sc-eQTL 6.33e-02 0.139 0.0741 0.248 CD8_TCM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 653187 sc-eQTL 9.34e-01 0.00823 0.099 0.248 CD8_TCM L2
ENSG00000028839 TBPL1 -485644 sc-eQTL 9.79e-01 0.00245 0.0932 0.242 CD8_TEM L2
ENSG00000079950 STX7 953328 sc-eQTL 3.78e-01 -0.0897 0.102 0.242 CD8_TEM L2
ENSG00000112303 VNN2 703067 sc-eQTL 3.38e-01 0.0969 0.101 0.242 CD8_TEM L2
ENSG00000112306 RPS12 651957 sc-eQTL 1.17e-01 0.0852 0.0541 0.242 CD8_TEM L2
ENSG00000118515 SGK1 -851586 sc-eQTL 8.30e-01 -0.0192 0.0892 0.242 CD8_TEM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 653187 sc-eQTL 5.27e-02 0.199 0.102 0.242 CD8_TEM L2
ENSG00000028839 TBPL1 -485644 sc-eQTL 8.97e-01 -0.0125 0.0964 0.24 MAIT L2
ENSG00000079950 STX7 953328 sc-eQTL 7.04e-01 0.0348 0.0916 0.24 MAIT L2
ENSG00000112303 VNN2 703067 sc-eQTL 9.51e-01 -0.00576 0.0932 0.24 MAIT L2
ENSG00000112306 RPS12 651957 sc-eQTL 2.09e-02 -0.105 0.0453 0.24 MAIT L2
ENSG00000118515 SGK1 -851586 sc-eQTL 5.83e-01 0.0355 0.0645 0.24 MAIT L2
ENSG00000146409 SLC18B1 653187 sc-eQTL 8.82e-01 0.0142 0.0961 0.24 MAIT L2
ENSG00000028839 TBPL1 -485644 sc-eQTL 8.68e-01 0.0177 0.106 0.236 NK_CD56bright L2
ENSG00000079950 STX7 953328 sc-eQTL 9.24e-01 -0.00941 0.0982 0.236 NK_CD56bright L2
ENSG00000112303 VNN2 703067 sc-eQTL 8.08e-01 -0.0243 0.0997 0.236 NK_CD56bright L2
ENSG00000112306 RPS12 651957 sc-eQTL 2.46e-01 -0.0644 0.0554 0.236 NK_CD56bright L2
ENSG00000118515 SGK1 -851586 sc-eQTL 9.47e-01 0.00552 0.083 0.236 NK_CD56bright L2
ENSG00000028839 TBPL1 -485644 sc-eQTL 9.65e-01 -0.00363 0.0832 0.241 NK_CD56dim L2
ENSG00000079950 STX7 953328 sc-eQTL 9.12e-01 -0.00844 0.0762 0.241 NK_CD56dim L2
ENSG00000112303 VNN2 703067 sc-eQTL 6.43e-02 -0.176 0.0945 0.241 NK_CD56dim L2
ENSG00000112306 RPS12 651957 sc-eQTL 4.72e-01 -0.0272 0.0378 0.241 NK_CD56dim L2
ENSG00000118515 SGK1 -851586 sc-eQTL 3.57e-01 0.0772 0.0836 0.241 NK_CD56dim L2
ENSG00000028839 TBPL1 -485644 sc-eQTL 3.20e-01 0.105 0.105 0.24 NK_HLA L2
ENSG00000079950 STX7 953328 sc-eQTL 7.88e-01 0.0257 0.0957 0.24 NK_HLA L2
ENSG00000112303 VNN2 703067 sc-eQTL 1.77e-01 -0.131 0.0965 0.24 NK_HLA L2
ENSG00000112306 RPS12 651957 sc-eQTL 4.62e-01 -0.0332 0.0451 0.24 NK_HLA L2
ENSG00000118515 SGK1 -851586 sc-eQTL 8.80e-01 -0.0135 0.0893 0.24 NK_HLA L2
ENSG00000028839 TBPL1 -485644 sc-eQTL 9.93e-01 -0.000741 0.0864 0.241 NK_cytokine L2
ENSG00000079950 STX7 953328 sc-eQTL 9.31e-02 0.14 0.0831 0.241 NK_cytokine L2
ENSG00000112303 VNN2 703067 sc-eQTL 9.10e-01 -0.0107 0.094 0.241 NK_cytokine L2
ENSG00000112306 RPS12 651957 sc-eQTL 6.87e-01 -0.0206 0.051 0.241 NK_cytokine L2
ENSG00000118515 SGK1 -851586 sc-eQTL 3.68e-01 -0.0764 0.0848 0.241 NK_cytokine L2
ENSG00000028839 TBPL1 -485644 sc-eQTL 2.84e-01 0.124 0.115 0.237 PB L2
ENSG00000079950 STX7 953328 sc-eQTL 3.46e-01 -0.0777 0.0821 0.237 PB L2
ENSG00000112303 VNN2 703067 sc-eQTL 2.76e-01 -0.11 0.1 0.237 PB L2
ENSG00000112306 RPS12 651957 sc-eQTL 2.16e-01 -0.0707 0.0568 0.237 PB L2
ENSG00000118515 SGK1 -851586 sc-eQTL 2.62e-01 0.104 0.0919 0.237 PB L2
ENSG00000146409 SLC18B1 653187 sc-eQTL 9.94e-01 0.000762 0.107 0.237 PB L2
ENSG00000028839 TBPL1 -485644 sc-eQTL 6.71e-01 -0.0425 0.0998 0.241 Pro_T L2
ENSG00000079950 STX7 953328 sc-eQTL 6.17e-02 0.166 0.0884 0.241 Pro_T L2
ENSG00000112303 VNN2 703067 sc-eQTL 3.97e-01 -0.0811 0.0955 0.241 Pro_T L2
ENSG00000112306 RPS12 651957 sc-eQTL 9.21e-01 -0.00358 0.0362 0.241 Pro_T L2
ENSG00000118515 SGK1 -851586 sc-eQTL 3.73e-01 0.0647 0.0724 0.241 Pro_T L2
ENSG00000146409 SLC18B1 653187 sc-eQTL 3.63e-01 0.0852 0.0935 0.241 Pro_T L2
ENSG00000028839 TBPL1 -485644 sc-eQTL 6.71e-01 -0.042 0.0987 0.241 Treg L2
ENSG00000079950 STX7 953328 sc-eQTL 9.59e-02 0.155 0.0925 0.241 Treg L2
ENSG00000112303 VNN2 703067 sc-eQTL 9.98e-01 -0.000222 0.0783 0.241 Treg L2
ENSG00000112306 RPS12 651957 sc-eQTL 7.89e-01 0.00929 0.0346 0.241 Treg L2
ENSG00000118515 SGK1 -851586 sc-eQTL 7.68e-01 0.0215 0.073 0.241 Treg L2
ENSG00000146409 SLC18B1 653187 sc-eQTL 9.34e-01 -0.00813 0.0979 0.241 Treg L2
ENSG00000028839 TBPL1 -485644 sc-eQTL 9.34e-01 -0.00861 0.104 0.246 cDC L2
ENSG00000079950 STX7 953328 sc-eQTL 7.51e-01 0.0258 0.0812 0.246 cDC L2
ENSG00000093134 VNN3 731761 sc-eQTL 8.86e-01 -0.0116 0.0807 0.246 cDC L2
ENSG00000112299 VNN1 752471 sc-eQTL 3.88e-01 0.0819 0.0947 0.246 cDC L2
ENSG00000112303 VNN2 703067 sc-eQTL 6.74e-01 -0.039 0.0924 0.246 cDC L2
ENSG00000112306 RPS12 651957 sc-eQTL 2.66e-01 -0.0507 0.0455 0.246 cDC L2
ENSG00000118515 SGK1 -851586 sc-eQTL 3.48e-02 0.162 0.076 0.246 cDC L2
ENSG00000146409 SLC18B1 653187 sc-eQTL 2.61e-01 0.102 0.0901 0.246 cDC L2
ENSG00000286438 AL591115.1 363398 sc-eQTL 4.69e-01 -0.0524 0.0722 0.246 cDC L2
ENSG00000286887 AL355881.1 -829775 sc-eQTL 7.60e-02 0.157 0.0881 0.246 cDC L2
ENSG00000028839 TBPL1 -485644 sc-eQTL 7.89e-01 -0.0219 0.0815 0.241 cMono_IL1B L2
ENSG00000079950 STX7 953328 sc-eQTL 8.67e-01 -0.0103 0.0618 0.241 cMono_IL1B L2
ENSG00000093134 VNN3 731761 sc-eQTL 9.81e-01 0.00214 0.0874 0.241 cMono_IL1B L2
ENSG00000112299 VNN1 752471 sc-eQTL 9.53e-03 0.227 0.0868 0.241 cMono_IL1B L2
ENSG00000112303 VNN2 703067 sc-eQTL 1.85e-01 -0.0934 0.0702 0.241 cMono_IL1B L2
ENSG00000112306 RPS12 651957 sc-eQTL 3.00e-01 -0.0406 0.039 0.241 cMono_IL1B L2
ENSG00000118515 SGK1 -851586 sc-eQTL 2.66e-01 0.0649 0.0582 0.241 cMono_IL1B L2
ENSG00000146409 SLC18B1 653187 sc-eQTL 6.63e-01 0.0329 0.0755 0.241 cMono_IL1B L2
ENSG00000286887 AL355881.1 -829775 sc-eQTL 1.70e-01 0.108 0.0783 0.241 cMono_IL1B L2
ENSG00000028839 TBPL1 -485644 sc-eQTL 9.37e-01 0.00729 0.0918 0.241 cMono_S100A L2
ENSG00000079950 STX7 953328 sc-eQTL 2.62e-02 0.147 0.0655 0.241 cMono_S100A L2
ENSG00000093134 VNN3 731761 sc-eQTL 6.07e-01 -0.0427 0.0827 0.241 cMono_S100A L2
ENSG00000112299 VNN1 752471 sc-eQTL 1.32e-01 0.135 0.0894 0.241 cMono_S100A L2
ENSG00000112303 VNN2 703067 sc-eQTL 3.91e-01 -0.0505 0.0588 0.241 cMono_S100A L2
ENSG00000112306 RPS12 651957 sc-eQTL 4.72e-01 -0.0305 0.0423 0.241 cMono_S100A L2
ENSG00000118515 SGK1 -851586 sc-eQTL 2.89e-02 0.105 0.0479 0.241 cMono_S100A L2
ENSG00000146409 SLC18B1 653187 sc-eQTL 1.91e-02 -0.183 0.0774 0.241 cMono_S100A L2
ENSG00000286887 AL355881.1 -829775 sc-eQTL 9.01e-01 0.00959 0.0767 0.241 cMono_S100A L2
ENSG00000028839 TBPL1 -485644 sc-eQTL 7.76e-01 -0.0352 0.123 0.248 gdT L2
ENSG00000079950 STX7 953328 sc-eQTL 2.52e-01 0.121 0.105 0.248 gdT L2
ENSG00000112303 VNN2 703067 sc-eQTL 4.41e-01 -0.0903 0.117 0.248 gdT L2
ENSG00000112306 RPS12 651957 sc-eQTL 9.63e-01 -0.0021 0.0446 0.248 gdT L2
ENSG00000118515 SGK1 -851586 sc-eQTL 4.60e-02 0.167 0.0831 0.248 gdT L2
ENSG00000146409 SLC18B1 653187 sc-eQTL 5.24e-01 -0.0736 0.115 0.248 gdT L2
ENSG00000028839 TBPL1 -485644 sc-eQTL 5.22e-01 0.0604 0.0942 0.242 intMono L2
ENSG00000079950 STX7 953328 sc-eQTL 9.66e-01 0.00384 0.0901 0.242 intMono L2
ENSG00000093134 VNN3 731761 sc-eQTL 1.13e-01 -0.144 0.0903 0.242 intMono L2
ENSG00000112299 VNN1 752471 sc-eQTL 1.13e-01 0.142 0.0893 0.242 intMono L2
ENSG00000112303 VNN2 703067 sc-eQTL 6.59e-01 0.0403 0.0913 0.242 intMono L2
ENSG00000112306 RPS12 651957 sc-eQTL 1.29e-01 -0.0602 0.0395 0.242 intMono L2
ENSG00000118515 SGK1 -851586 sc-eQTL 2.94e-01 0.0701 0.0666 0.242 intMono L2
ENSG00000146409 SLC18B1 653187 sc-eQTL 4.05e-01 0.0806 0.0966 0.242 intMono L2
ENSG00000286887 AL355881.1 -829775 sc-eQTL 8.72e-01 0.0149 0.0925 0.242 intMono L2
ENSG00000028839 TBPL1 -485644 sc-eQTL 5.81e-01 0.0547 0.0989 0.242 ncMono L2
ENSG00000079950 STX7 953328 sc-eQTL 8.88e-01 -0.00943 0.0669 0.242 ncMono L2
ENSG00000093134 VNN3 731761 sc-eQTL 4.13e-01 0.0773 0.0942 0.242 ncMono L2
ENSG00000112299 VNN1 752471 sc-eQTL 2.43e-01 0.109 0.0934 0.242 ncMono L2
ENSG00000112303 VNN2 703067 sc-eQTL 6.00e-01 0.0473 0.09 0.242 ncMono L2
ENSG00000112306 RPS12 651957 sc-eQTL 7.16e-01 -0.0164 0.0452 0.242 ncMono L2
ENSG00000118515 SGK1 -851586 sc-eQTL 2.16e-02 0.146 0.0631 0.242 ncMono L2
ENSG00000146409 SLC18B1 653187 sc-eQTL 7.32e-01 0.0274 0.0798 0.242 ncMono L2
ENSG00000286887 AL355881.1 -829775 sc-eQTL 3.59e-02 0.176 0.0835 0.242 ncMono L2
ENSG00000028839 TBPL1 -485644 sc-eQTL 9.34e-01 -0.0095 0.115 0.257 pDC L2
ENSG00000079950 STX7 953328 sc-eQTL 3.74e-01 -0.068 0.0762 0.257 pDC L2
ENSG00000093134 VNN3 731761 sc-eQTL 1.10e-01 -0.123 0.0763 0.257 pDC L2
ENSG00000112299 VNN1 752471 sc-eQTL 2.89e-01 0.0829 0.078 0.257 pDC L2
ENSG00000112303 VNN2 703067 sc-eQTL 2.69e-01 -0.103 0.0928 0.257 pDC L2
ENSG00000112306 RPS12 651957 sc-eQTL 4.63e-01 -0.0471 0.0641 0.257 pDC L2
ENSG00000118515 SGK1 -851586 sc-eQTL 3.91e-01 0.0559 0.0651 0.257 pDC L2
ENSG00000146409 SLC18B1 653187 sc-eQTL 1.84e-02 -0.222 0.0933 0.257 pDC L2
ENSG00000286438 AL591115.1 363398 sc-eQTL 5.49e-01 0.0545 0.0908 0.257 pDC L2
ENSG00000286887 AL355881.1 -829775 sc-eQTL 9.98e-01 -0.000187 0.0806 0.257 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000028839 TBPL1 -485644 sc-eQTL 2.81e-01 0.105 0.0976 0.241 B_Memory LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 953328 sc-eQTL 1.27e-02 0.133 0.0531 0.241 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 703067 sc-eQTL 8.52e-02 0.146 0.0846 0.241 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 651957 sc-eQTL 6.92e-01 0.0192 0.0485 0.241 B_Memory LOneK1K
ENSG00000118515 SGK1 -851586 sc-eQTL 7.01e-02 0.137 0.0753 0.241 B_Memory LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 653187 sc-eQTL 1.30e-01 0.135 0.0886 0.241 B_Memory LOneK1K
ENSG00000028839 TBPL1 -485644 sc-eQTL 7.12e-01 0.034 0.0918 0.241 B_Naive LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 953328 sc-eQTL 1.47e-01 0.0599 0.0412 0.241 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 703067 sc-eQTL 1.59e-01 -0.113 0.08 0.241 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 651957 sc-eQTL 1.22e-01 0.075 0.0483 0.241 B_Naive LOneK1K
ENSG00000118515 SGK1 -851586 sc-eQTL 2.72e-01 0.0827 0.075 0.241 B_Naive LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 653187 sc-eQTL 9.89e-01 -0.00123 0.0917 0.241 B_Naive LOneK1K
ENSG00000028839 TBPL1 -485644 sc-eQTL 7.10e-01 -0.0275 0.0738 0.241 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 953328 sc-eQTL 4.57e-01 0.0383 0.0513 0.241 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000093134 VNN3 731761 sc-eQTL 7.04e-01 -0.0318 0.0837 0.241 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112299 VNN1 752471 sc-eQTL 1.36e-02 0.214 0.0861 0.241 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 703067 sc-eQTL 2.29e-01 -0.0694 0.0575 0.241 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 651957 sc-eQTL 2.65e-01 -0.0442 0.0395 0.241 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000118515 SGK1 -851586 sc-eQTL 1.91e-01 0.0704 0.0537 0.241 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 653187 sc-eQTL 3.88e-01 -0.0609 0.0703 0.241 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000286887 AL355881.1 -829775 sc-eQTL 3.35e-01 0.0712 0.0737 0.241 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000028839 TBPL1 -485644 sc-eQTL 6.55e-01 0.043 0.0961 0.241 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 953328 sc-eQTL 6.02e-01 -0.0331 0.0634 0.241 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000093134 VNN3 731761 sc-eQTL 4.01e-01 -0.0785 0.0932 0.241 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112299 VNN1 752471 sc-eQTL 7.22e-02 0.166 0.0918 0.241 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 703067 sc-eQTL 3.74e-01 0.0776 0.0871 0.241 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 651957 sc-eQTL 5.60e-01 -0.0216 0.037 0.241 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000118515 SGK1 -851586 sc-eQTL 5.49e-02 0.107 0.0555 0.241 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 653187 sc-eQTL 6.65e-01 0.0389 0.0898 0.241 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000286887 AL355881.1 -829775 sc-eQTL 2.55e-01 0.0925 0.081 0.241 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000028839 TBPL1 -485644 sc-eQTL 7.41e-01 0.0254 0.0767 0.241 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 953328 sc-eQTL 8.34e-01 0.0151 0.0721 0.241 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 703067 sc-eQTL 1.20e-01 -0.142 0.0907 0.241 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 651957 sc-eQTL 2.76e-01 -0.0406 0.0371 0.241 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000118515 SGK1 -851586 sc-eQTL 7.46e-01 0.025 0.0769 0.241 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000079950 STX7 953328 eQTL 0.000135 0.0717 0.0187 0.0 0.0 0.235
ENSG00000112299 VNN1 752471 pQTL 0.000177 0.152 0.0404 0.0 0.0 0.251

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina