logo

Genes within 1Mb (chr6:133458023:A:G):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000028839 TBPL1 -494147 sc-eQTL 6.33e-01 -0.0458 0.0957 0.274 B L1
ENSG00000079950 STX7 944825 sc-eQTL 6.98e-01 0.0148 0.0381 0.274 B L1
ENSG00000112303 VNN2 694564 sc-eQTL 9.37e-01 0.00564 0.0717 0.274 B L1
ENSG00000112306 RPS12 643454 sc-eQTL 8.85e-02 0.0737 0.0431 0.274 B L1
ENSG00000118515 SGK1 -860089 sc-eQTL 9.33e-02 -0.112 0.0664 0.274 B L1
ENSG00000146409 SLC18B1 644684 sc-eQTL 3.84e-01 0.0795 0.0911 0.274 B L1
ENSG00000028839 TBPL1 -494147 sc-eQTL 3.07e-01 0.0742 0.0725 0.274 CD4T L1
ENSG00000079950 STX7 944825 sc-eQTL 3.26e-01 -0.0741 0.0754 0.274 CD4T L1
ENSG00000112303 VNN2 694564 sc-eQTL 3.69e-01 -0.0588 0.0653 0.274 CD4T L1
ENSG00000112306 RPS12 643454 sc-eQTL 1.65e-01 0.0616 0.0443 0.274 CD4T L1
ENSG00000118515 SGK1 -860089 sc-eQTL 3.11e-02 -0.128 0.0591 0.274 CD4T L1
ENSG00000146409 SLC18B1 644684 sc-eQTL 4.86e-01 0.0627 0.0899 0.274 CD4T L1
ENSG00000028839 TBPL1 -494147 sc-eQTL 9.66e-01 0.00305 0.0709 0.274 CD8T L1
ENSG00000079950 STX7 944825 sc-eQTL 1.80e-02 0.174 0.073 0.274 CD8T L1
ENSG00000112303 VNN2 694564 sc-eQTL 4.40e-01 0.0668 0.0863 0.274 CD8T L1
ENSG00000112306 RPS12 643454 sc-eQTL 3.61e-02 0.0616 0.0292 0.274 CD8T L1
ENSG00000118515 SGK1 -860089 sc-eQTL 1.20e-01 -0.0706 0.0453 0.274 CD8T L1
ENSG00000146409 SLC18B1 644684 sc-eQTL 1.40e-01 0.131 0.0888 0.274 CD8T L1
ENSG00000028839 TBPL1 -494147 sc-eQTL 9.08e-01 0.0123 0.106 0.268 DC L1
ENSG00000079950 STX7 944825 sc-eQTL 8.80e-01 -0.00997 0.0659 0.268 DC L1
ENSG00000093134 VNN3 723258 sc-eQTL 3.85e-01 0.0711 0.0815 0.268 DC L1
ENSG00000112299 VNN1 743968 sc-eQTL 3.96e-01 0.075 0.088 0.268 DC L1
ENSG00000112303 VNN2 694564 sc-eQTL 4.58e-01 0.07 0.0942 0.268 DC L1
ENSG00000112306 RPS12 643454 sc-eQTL 2.63e-01 0.0593 0.0527 0.268 DC L1
ENSG00000118515 SGK1 -860089 sc-eQTL 2.69e-01 -0.0678 0.0612 0.268 DC L1
ENSG00000146409 SLC18B1 644684 sc-eQTL 2.36e-01 -0.0991 0.0834 0.268 DC L1
ENSG00000286438 AL591115.1 354895 sc-eQTL 7.03e-01 0.029 0.0762 0.268 DC L1
ENSG00000286887 AL355881.1 -838278 sc-eQTL 6.99e-01 -0.0367 0.095 0.268 DC L1
ENSG00000028839 TBPL1 -494147 sc-eQTL 8.04e-01 0.019 0.0765 0.274 Mono L1
ENSG00000079950 STX7 944825 sc-eQTL 4.43e-01 0.0393 0.0511 0.274 Mono L1
ENSG00000093134 VNN3 723258 sc-eQTL 3.19e-02 0.188 0.0869 0.274 Mono L1
ENSG00000112299 VNN1 743968 sc-eQTL 2.26e-01 -0.114 0.0942 0.274 Mono L1
ENSG00000112303 VNN2 694564 sc-eQTL 3.01e-01 0.0689 0.0665 0.274 Mono L1
ENSG00000112306 RPS12 643454 sc-eQTL 8.42e-01 0.00797 0.04 0.274 Mono L1
ENSG00000118515 SGK1 -860089 sc-eQTL 1.41e-01 -0.083 0.0562 0.274 Mono L1
ENSG00000146409 SLC18B1 644684 sc-eQTL 5.58e-01 0.0464 0.079 0.274 Mono L1
ENSG00000286887 AL355881.1 -838278 sc-eQTL 9.63e-02 -0.129 0.0772 0.274 Mono L1
ENSG00000028839 TBPL1 -494147 sc-eQTL 9.43e-01 0.00598 0.0829 0.275 NK L1
ENSG00000079950 STX7 944825 sc-eQTL 2.94e-02 0.166 0.0758 0.275 NK L1
ENSG00000112303 VNN2 694564 sc-eQTL 8.48e-01 0.0183 0.0954 0.275 NK L1
ENSG00000112306 RPS12 643454 sc-eQTL 2.92e-01 0.0416 0.0394 0.275 NK L1
ENSG00000118515 SGK1 -860089 sc-eQTL 4.37e-01 -0.0568 0.0729 0.275 NK L1
ENSG00000028839 TBPL1 -494147 sc-eQTL 6.71e-01 0.0403 0.0949 0.274 Other_T L1
ENSG00000079950 STX7 944825 sc-eQTL 7.08e-01 0.028 0.0747 0.274 Other_T L1
ENSG00000112303 VNN2 694564 sc-eQTL 5.19e-01 -0.0584 0.0903 0.274 Other_T L1
ENSG00000112306 RPS12 643454 sc-eQTL 9.30e-01 0.00315 0.0358 0.274 Other_T L1
ENSG00000118515 SGK1 -860089 sc-eQTL 1.27e-01 -0.101 0.0656 0.274 Other_T L1
ENSG00000146409 SLC18B1 644684 sc-eQTL 6.09e-01 0.0502 0.0981 0.274 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000028839 TBPL1 -494147 sc-eQTL 1.50e-01 0.156 0.108 0.273 B_Activated L2
ENSG00000079950 STX7 944825 sc-eQTL 2.89e-01 0.0985 0.0927 0.273 B_Activated L2
ENSG00000112303 VNN2 694564 sc-eQTL 7.81e-01 0.0275 0.099 0.273 B_Activated L2
ENSG00000112306 RPS12 643454 sc-eQTL 4.83e-01 0.0373 0.053 0.273 B_Activated L2
ENSG00000118515 SGK1 -860089 sc-eQTL 1.29e-01 -0.143 0.094 0.273 B_Activated L2
ENSG00000146409 SLC18B1 644684 sc-eQTL 4.24e-01 0.0743 0.0927 0.273 B_Activated L2
ENSG00000028839 TBPL1 -494147 sc-eQTL 1.88e-01 -0.139 0.105 0.273 B_Intermediate L2
ENSG00000079950 STX7 944825 sc-eQTL 3.91e-01 0.0521 0.0606 0.273 B_Intermediate L2
ENSG00000112303 VNN2 694564 sc-eQTL 3.01e-01 0.0945 0.0912 0.273 B_Intermediate L2
ENSG00000112306 RPS12 643454 sc-eQTL 1.24e-01 0.0861 0.0557 0.273 B_Intermediate L2
ENSG00000118515 SGK1 -860089 sc-eQTL 4.28e-03 -0.274 0.095 0.273 B_Intermediate L2
ENSG00000146409 SLC18B1 644684 sc-eQTL 8.57e-01 -0.0182 0.101 0.273 B_Intermediate L2
ENSG00000028839 TBPL1 -494147 sc-eQTL 8.64e-01 -0.0175 0.102 0.274 B_Memory L2
ENSG00000079950 STX7 944825 sc-eQTL 7.68e-01 0.0219 0.074 0.274 B_Memory L2
ENSG00000112303 VNN2 694564 sc-eQTL 4.82e-01 -0.0681 0.0967 0.274 B_Memory L2
ENSG00000112306 RPS12 643454 sc-eQTL 1.09e-02 0.118 0.046 0.274 B_Memory L2
ENSG00000118515 SGK1 -860089 sc-eQTL 5.82e-01 -0.0472 0.0855 0.274 B_Memory L2
ENSG00000146409 SLC18B1 644684 sc-eQTL 2.29e-01 -0.117 0.097 0.274 B_Memory L2
ENSG00000028839 TBPL1 -494147 sc-eQTL 5.14e-01 0.0619 0.0947 0.274 B_Naive1 L2
ENSG00000079950 STX7 944825 sc-eQTL 7.90e-01 -0.0122 0.0456 0.274 B_Naive1 L2
ENSG00000112303 VNN2 694564 sc-eQTL 7.99e-01 0.0225 0.0885 0.274 B_Naive1 L2
ENSG00000112306 RPS12 643454 sc-eQTL 6.47e-01 0.0231 0.0504 0.274 B_Naive1 L2
ENSG00000118515 SGK1 -860089 sc-eQTL 3.03e-01 -0.0812 0.0787 0.274 B_Naive1 L2
ENSG00000146409 SLC18B1 644684 sc-eQTL 3.86e-01 0.0843 0.0971 0.274 B_Naive1 L2
ENSG00000028839 TBPL1 -494147 sc-eQTL 8.70e-01 0.0165 0.101 0.275 B_Naive2 L2
ENSG00000079950 STX7 944825 sc-eQTL 3.23e-01 0.0529 0.0535 0.275 B_Naive2 L2
ENSG00000112303 VNN2 694564 sc-eQTL 6.02e-01 0.0514 0.0984 0.275 B_Naive2 L2
ENSG00000112306 RPS12 643454 sc-eQTL 3.58e-01 0.0479 0.052 0.275 B_Naive2 L2
ENSG00000118515 SGK1 -860089 sc-eQTL 8.30e-02 -0.159 0.0914 0.275 B_Naive2 L2
ENSG00000146409 SLC18B1 644684 sc-eQTL 7.57e-02 0.176 0.0987 0.275 B_Naive2 L2
ENSG00000028839 TBPL1 -494147 sc-eQTL 3.75e-01 -0.0892 0.1 0.28 CD4_CTL L2
ENSG00000079950 STX7 944825 sc-eQTL 4.99e-01 -0.0675 0.0997 0.28 CD4_CTL L2
ENSG00000112303 VNN2 694564 sc-eQTL 9.70e-01 0.00375 0.101 0.28 CD4_CTL L2
ENSG00000112306 RPS12 643454 sc-eQTL 4.48e-01 0.0354 0.0465 0.28 CD4_CTL L2
ENSG00000118515 SGK1 -860089 sc-eQTL 7.98e-02 -0.141 0.0801 0.28 CD4_CTL L2
ENSG00000146409 SLC18B1 644684 sc-eQTL 9.81e-01 -0.00229 0.0938 0.28 CD4_CTL L2
ENSG00000028839 TBPL1 -494147 sc-eQTL 2.61e-01 0.093 0.0824 0.274 CD4_Naive L2
ENSG00000079950 STX7 944825 sc-eQTL 1.30e-01 -0.123 0.0806 0.274 CD4_Naive L2
ENSG00000112303 VNN2 694564 sc-eQTL 1.72e-01 -0.103 0.0748 0.274 CD4_Naive L2
ENSG00000112306 RPS12 643454 sc-eQTL 5.99e-01 0.0256 0.0487 0.274 CD4_Naive L2
ENSG00000118515 SGK1 -860089 sc-eQTL 1.62e-02 -0.143 0.0588 0.274 CD4_Naive L2
ENSG00000146409 SLC18B1 644684 sc-eQTL 3.54e-01 0.0869 0.0936 0.274 CD4_Naive L2
ENSG00000028839 TBPL1 -494147 sc-eQTL 1.20e-01 0.141 0.0901 0.274 CD4_TCM L2
ENSG00000079950 STX7 944825 sc-eQTL 4.81e-01 0.0643 0.0911 0.274 CD4_TCM L2
ENSG00000112303 VNN2 694564 sc-eQTL 4.78e-01 0.0638 0.0898 0.274 CD4_TCM L2
ENSG00000112306 RPS12 643454 sc-eQTL 4.36e-02 0.0937 0.0462 0.274 CD4_TCM L2
ENSG00000118515 SGK1 -860089 sc-eQTL 4.70e-01 -0.0471 0.0651 0.274 CD4_TCM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 644684 sc-eQTL 8.30e-01 0.0232 0.108 0.274 CD4_TCM L2
ENSG00000028839 TBPL1 -494147 sc-eQTL 1.75e-01 0.139 0.102 0.274 CD4_TEM L2
ENSG00000079950 STX7 944825 sc-eQTL 8.95e-01 0.0136 0.103 0.274 CD4_TEM L2
ENSG00000112303 VNN2 694564 sc-eQTL 7.30e-01 0.0341 0.0986 0.274 CD4_TEM L2
ENSG00000112306 RPS12 643454 sc-eQTL 6.55e-01 0.0181 0.0404 0.274 CD4_TEM L2
ENSG00000118515 SGK1 -860089 sc-eQTL 1.52e-01 -0.0995 0.0692 0.274 CD4_TEM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 644684 sc-eQTL 8.78e-01 0.0154 0.101 0.274 CD4_TEM L2
ENSG00000028839 TBPL1 -494147 sc-eQTL 1.12e-01 0.143 0.0894 0.274 CD8_CTL L2
ENSG00000079950 STX7 944825 sc-eQTL 1.27e-02 0.208 0.0828 0.274 CD8_CTL L2
ENSG00000112303 VNN2 694564 sc-eQTL 4.17e-01 0.0775 0.0954 0.274 CD8_CTL L2
ENSG00000112306 RPS12 643454 sc-eQTL 8.33e-01 0.0108 0.0511 0.274 CD8_CTL L2
ENSG00000118515 SGK1 -860089 sc-eQTL 5.61e-03 -0.237 0.0848 0.274 CD8_CTL L2
ENSG00000146409 SLC18B1 644684 sc-eQTL 6.56e-01 0.0442 0.099 0.274 CD8_CTL L2
ENSG00000028839 TBPL1 -494147 sc-eQTL 3.97e-01 -0.0801 0.0944 0.274 CD8_Naive L2
ENSG00000079950 STX7 944825 sc-eQTL 1.76e-01 0.136 0.1 0.274 CD8_Naive L2
ENSG00000112303 VNN2 694564 sc-eQTL 9.23e-01 0.00841 0.087 0.274 CD8_Naive L2
ENSG00000112306 RPS12 643454 sc-eQTL 1.00e-01 0.0817 0.0495 0.274 CD8_Naive L2
ENSG00000118515 SGK1 -860089 sc-eQTL 2.53e-02 -0.139 0.0618 0.274 CD8_Naive L2
ENSG00000146409 SLC18B1 644684 sc-eQTL 4.53e-02 0.199 0.099 0.274 CD8_Naive L2
ENSG00000028839 TBPL1 -494147 sc-eQTL 6.66e-01 -0.046 0.106 0.278 CD8_TCM L2
ENSG00000079950 STX7 944825 sc-eQTL 9.09e-01 0.0112 0.0985 0.278 CD8_TCM L2
ENSG00000112303 VNN2 694564 sc-eQTL 4.56e-01 0.0729 0.0976 0.278 CD8_TCM L2
ENSG00000112306 RPS12 643454 sc-eQTL 5.28e-01 0.0301 0.0476 0.278 CD8_TCM L2
ENSG00000118515 SGK1 -860089 sc-eQTL 8.02e-03 -0.208 0.0775 0.278 CD8_TCM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 644684 sc-eQTL 7.05e-01 0.0396 0.104 0.278 CD8_TCM L2
ENSG00000028839 TBPL1 -494147 sc-eQTL 7.09e-02 -0.178 0.0981 0.263 CD8_TEM L2
ENSG00000079950 STX7 944825 sc-eQTL 2.50e-01 -0.124 0.108 0.263 CD8_TEM L2
ENSG00000112303 VNN2 694564 sc-eQTL 1.42e-01 -0.157 0.107 0.263 CD8_TEM L2
ENSG00000112306 RPS12 643454 sc-eQTL 6.95e-01 -0.0226 0.0577 0.263 CD8_TEM L2
ENSG00000118515 SGK1 -860089 sc-eQTL 6.08e-01 -0.0485 0.0945 0.263 CD8_TEM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 644684 sc-eQTL 9.43e-01 0.00785 0.109 0.263 CD8_TEM L2
ENSG00000028839 TBPL1 -494147 sc-eQTL 5.62e-01 -0.0585 0.101 0.275 MAIT L2
ENSG00000079950 STX7 944825 sc-eQTL 4.05e-01 0.0799 0.0957 0.275 MAIT L2
ENSG00000112303 VNN2 694564 sc-eQTL 7.94e-01 0.0254 0.0975 0.275 MAIT L2
ENSG00000112306 RPS12 643454 sc-eQTL 5.70e-01 0.0273 0.0479 0.275 MAIT L2
ENSG00000118515 SGK1 -860089 sc-eQTL 3.49e-01 -0.0632 0.0673 0.275 MAIT L2
ENSG00000146409 SLC18B1 644684 sc-eQTL 9.24e-01 -0.00964 0.101 0.275 MAIT L2
ENSG00000028839 TBPL1 -494147 sc-eQTL 2.37e-01 0.126 0.106 0.273 NK_CD56bright L2
ENSG00000079950 STX7 944825 sc-eQTL 5.91e-01 -0.053 0.0987 0.273 NK_CD56bright L2
ENSG00000112303 VNN2 694564 sc-eQTL 3.77e-01 -0.0887 0.1 0.273 NK_CD56bright L2
ENSG00000112306 RPS12 643454 sc-eQTL 3.69e-01 0.0503 0.0558 0.273 NK_CD56bright L2
ENSG00000118515 SGK1 -860089 sc-eQTL 5.54e-01 0.0495 0.0834 0.273 NK_CD56bright L2
ENSG00000028839 TBPL1 -494147 sc-eQTL 9.75e-01 -0.00276 0.0896 0.276 NK_CD56dim L2
ENSG00000079950 STX7 944825 sc-eQTL 3.98e-02 0.168 0.0812 0.276 NK_CD56dim L2
ENSG00000112303 VNN2 694564 sc-eQTL 4.62e-01 0.0754 0.102 0.276 NK_CD56dim L2
ENSG00000112306 RPS12 643454 sc-eQTL 2.72e-01 0.0447 0.0406 0.276 NK_CD56dim L2
ENSG00000118515 SGK1 -860089 sc-eQTL 6.78e-02 -0.164 0.0895 0.276 NK_CD56dim L2
ENSG00000028839 TBPL1 -494147 sc-eQTL 9.00e-01 0.0138 0.11 0.274 NK_HLA L2
ENSG00000079950 STX7 944825 sc-eQTL 3.01e-01 0.104 0.1 0.274 NK_HLA L2
ENSG00000112303 VNN2 694564 sc-eQTL 7.30e-01 -0.0351 0.102 0.274 NK_HLA L2
ENSG00000112306 RPS12 643454 sc-eQTL 2.40e-01 0.0556 0.0472 0.274 NK_HLA L2
ENSG00000118515 SGK1 -860089 sc-eQTL 3.71e-01 0.0838 0.0934 0.274 NK_HLA L2
ENSG00000028839 TBPL1 -494147 sc-eQTL 4.41e-01 -0.0703 0.091 0.276 NK_cytokine L2
ENSG00000079950 STX7 944825 sc-eQTL 8.33e-01 0.0186 0.0883 0.276 NK_cytokine L2
ENSG00000112303 VNN2 694564 sc-eQTL 5.74e-01 -0.0558 0.0992 0.276 NK_cytokine L2
ENSG00000112306 RPS12 643454 sc-eQTL 4.75e-01 0.0385 0.0538 0.276 NK_cytokine L2
ENSG00000118515 SGK1 -860089 sc-eQTL 3.52e-01 -0.0834 0.0894 0.276 NK_cytokine L2
ENSG00000028839 TBPL1 -494147 sc-eQTL 4.66e-01 -0.0888 0.121 0.27 PB L2
ENSG00000079950 STX7 944825 sc-eQTL 9.35e-01 0.00704 0.0866 0.27 PB L2
ENSG00000112303 VNN2 694564 sc-eQTL 1.89e-01 0.139 0.105 0.27 PB L2
ENSG00000112306 RPS12 643454 sc-eQTL 8.34e-01 0.0126 0.0601 0.27 PB L2
ENSG00000118515 SGK1 -860089 sc-eQTL 1.00e-01 -0.159 0.0959 0.27 PB L2
ENSG00000146409 SLC18B1 644684 sc-eQTL 8.54e-01 0.0208 0.113 0.27 PB L2
ENSG00000028839 TBPL1 -494147 sc-eQTL 4.60e-01 0.0745 0.101 0.272 Pro_T L2
ENSG00000079950 STX7 944825 sc-eQTL 5.19e-01 -0.058 0.0899 0.272 Pro_T L2
ENSG00000112303 VNN2 694564 sc-eQTL 8.47e-01 0.0187 0.0965 0.272 Pro_T L2
ENSG00000112306 RPS12 643454 sc-eQTL 2.97e-01 -0.0381 0.0364 0.272 Pro_T L2
ENSG00000118515 SGK1 -860089 sc-eQTL 3.43e-01 -0.0695 0.073 0.272 Pro_T L2
ENSG00000146409 SLC18B1 644684 sc-eQTL 5.21e-01 0.0606 0.0944 0.272 Pro_T L2
ENSG00000028839 TBPL1 -494147 sc-eQTL 6.06e-01 -0.0553 0.107 0.274 Treg L2
ENSG00000079950 STX7 944825 sc-eQTL 5.56e-02 -0.193 0.1 0.274 Treg L2
ENSG00000112303 VNN2 694564 sc-eQTL 1.88e-01 0.112 0.0846 0.274 Treg L2
ENSG00000112306 RPS12 643454 sc-eQTL 9.09e-01 -0.00431 0.0376 0.274 Treg L2
ENSG00000118515 SGK1 -860089 sc-eQTL 4.54e-01 -0.0593 0.079 0.274 Treg L2
ENSG00000146409 SLC18B1 644684 sc-eQTL 9.07e-01 -0.0124 0.106 0.274 Treg L2
ENSG00000028839 TBPL1 -494147 sc-eQTL 8.85e-01 0.0156 0.107 0.261 cDC L2
ENSG00000079950 STX7 944825 sc-eQTL 9.74e-01 -0.00277 0.0841 0.261 cDC L2
ENSG00000093134 VNN3 723258 sc-eQTL 4.85e-01 0.0583 0.0834 0.261 cDC L2
ENSG00000112299 VNN1 743968 sc-eQTL 3.24e-01 0.097 0.098 0.261 cDC L2
ENSG00000112303 VNN2 694564 sc-eQTL 7.98e-01 -0.0245 0.0957 0.261 cDC L2
ENSG00000112306 RPS12 643454 sc-eQTL 1.42e-01 0.0693 0.047 0.261 cDC L2
ENSG00000118515 SGK1 -860089 sc-eQTL 3.23e-02 -0.17 0.0786 0.261 cDC L2
ENSG00000146409 SLC18B1 644684 sc-eQTL 3.35e-01 -0.0902 0.0933 0.261 cDC L2
ENSG00000286438 AL591115.1 354895 sc-eQTL 1.97e-01 0.0964 0.0745 0.261 cDC L2
ENSG00000286887 AL355881.1 -838278 sc-eQTL 2.50e-01 -0.106 0.0917 0.261 cDC L2
ENSG00000028839 TBPL1 -494147 sc-eQTL 8.33e-01 -0.0184 0.0872 0.274 cMono_IL1B L2
ENSG00000079950 STX7 944825 sc-eQTL 2.39e-01 0.0778 0.0659 0.274 cMono_IL1B L2
ENSG00000093134 VNN3 723258 sc-eQTL 1.20e-01 0.145 0.0929 0.274 cMono_IL1B L2
ENSG00000112299 VNN1 743968 sc-eQTL 2.12e-01 -0.118 0.094 0.274 cMono_IL1B L2
ENSG00000112303 VNN2 694564 sc-eQTL 2.81e-01 0.0813 0.0752 0.274 cMono_IL1B L2
ENSG00000112306 RPS12 643454 sc-eQTL 7.03e-01 0.016 0.0419 0.274 cMono_IL1B L2
ENSG00000118515 SGK1 -860089 sc-eQTL 1.90e-01 -0.0817 0.0622 0.274 cMono_IL1B L2
ENSG00000146409 SLC18B1 644684 sc-eQTL 9.31e-01 0.00702 0.0808 0.274 cMono_IL1B L2
ENSG00000286887 AL355881.1 -838278 sc-eQTL 2.82e-01 -0.0906 0.0839 0.274 cMono_IL1B L2
ENSG00000028839 TBPL1 -494147 sc-eQTL 3.38e-01 0.0939 0.0979 0.274 cMono_S100A L2
ENSG00000079950 STX7 944825 sc-eQTL 5.72e-01 -0.04 0.0708 0.274 cMono_S100A L2
ENSG00000093134 VNN3 723258 sc-eQTL 1.69e-02 0.21 0.0873 0.274 cMono_S100A L2
ENSG00000112299 VNN1 743968 sc-eQTL 2.91e-01 -0.102 0.0958 0.274 cMono_S100A L2
ENSG00000112303 VNN2 694564 sc-eQTL 1.95e-01 0.0814 0.0627 0.274 cMono_S100A L2
ENSG00000112306 RPS12 643454 sc-eQTL 7.77e-01 0.0128 0.0453 0.274 cMono_S100A L2
ENSG00000118515 SGK1 -860089 sc-eQTL 6.64e-02 -0.0949 0.0514 0.274 cMono_S100A L2
ENSG00000146409 SLC18B1 644684 sc-eQTL 6.56e-02 0.154 0.0832 0.274 cMono_S100A L2
ENSG00000286887 AL355881.1 -838278 sc-eQTL 9.77e-02 -0.136 0.0815 0.274 cMono_S100A L2
ENSG00000028839 TBPL1 -494147 sc-eQTL 7.91e-01 0.0349 0.131 0.261 gdT L2
ENSG00000079950 STX7 944825 sc-eQTL 7.13e-01 0.0415 0.113 0.261 gdT L2
ENSG00000112303 VNN2 694564 sc-eQTL 3.79e-01 -0.11 0.124 0.261 gdT L2
ENSG00000112306 RPS12 643454 sc-eQTL 8.35e-01 0.00993 0.0475 0.261 gdT L2
ENSG00000118515 SGK1 -860089 sc-eQTL 2.93e-03 -0.263 0.0869 0.261 gdT L2
ENSG00000146409 SLC18B1 644684 sc-eQTL 9.43e-01 0.00885 0.123 0.261 gdT L2
ENSG00000028839 TBPL1 -494147 sc-eQTL 9.12e-01 0.0111 0.101 0.269 intMono L2
ENSG00000079950 STX7 944825 sc-eQTL 7.84e-01 -0.0264 0.0961 0.269 intMono L2
ENSG00000093134 VNN3 723258 sc-eQTL 6.61e-02 0.178 0.0962 0.269 intMono L2
ENSG00000112299 VNN1 743968 sc-eQTL 1.30e-01 -0.145 0.0954 0.269 intMono L2
ENSG00000112303 VNN2 694564 sc-eQTL 3.09e-01 -0.0992 0.0973 0.269 intMono L2
ENSG00000112306 RPS12 643454 sc-eQTL 8.88e-01 -0.00597 0.0424 0.269 intMono L2
ENSG00000118515 SGK1 -860089 sc-eQTL 6.72e-01 -0.0302 0.0713 0.269 intMono L2
ENSG00000146409 SLC18B1 644684 sc-eQTL 1.60e-02 -0.247 0.102 0.269 intMono L2
ENSG00000286887 AL355881.1 -838278 sc-eQTL 2.05e-01 -0.125 0.0984 0.269 intMono L2
ENSG00000028839 TBPL1 -494147 sc-eQTL 7.57e-01 -0.0321 0.104 0.271 ncMono L2
ENSG00000079950 STX7 944825 sc-eQTL 6.51e-01 0.0317 0.07 0.271 ncMono L2
ENSG00000093134 VNN3 723258 sc-eQTL 7.54e-01 0.0311 0.0989 0.271 ncMono L2
ENSG00000112299 VNN1 743968 sc-eQTL 4.34e-01 -0.0768 0.098 0.271 ncMono L2
ENSG00000112303 VNN2 694564 sc-eQTL 5.36e-01 -0.0585 0.0943 0.271 ncMono L2
ENSG00000112306 RPS12 643454 sc-eQTL 9.47e-01 0.00317 0.0474 0.271 ncMono L2
ENSG00000118515 SGK1 -860089 sc-eQTL 1.75e-01 -0.0908 0.0667 0.271 ncMono L2
ENSG00000146409 SLC18B1 644684 sc-eQTL 9.93e-01 -0.000705 0.0836 0.271 ncMono L2
ENSG00000286887 AL355881.1 -838278 sc-eQTL 3.27e-01 -0.0867 0.0882 0.271 ncMono L2
ENSG00000028839 TBPL1 -494147 sc-eQTL 6.58e-01 0.0518 0.117 0.254 pDC L2
ENSG00000079950 STX7 944825 sc-eQTL 1.87e-01 0.103 0.0774 0.254 pDC L2
ENSG00000093134 VNN3 723258 sc-eQTL 4.73e-01 0.0563 0.0782 0.254 pDC L2
ENSG00000112299 VNN1 743968 sc-eQTL 3.90e-01 0.0685 0.0796 0.254 pDC L2
ENSG00000112303 VNN2 694564 sc-eQTL 1.65e-03 0.295 0.0919 0.254 pDC L2
ENSG00000112306 RPS12 643454 sc-eQTL 9.14e-01 0.00706 0.0654 0.254 pDC L2
ENSG00000118515 SGK1 -860089 sc-eQTL 7.49e-01 -0.0213 0.0664 0.254 pDC L2
ENSG00000146409 SLC18B1 644684 sc-eQTL 6.96e-01 -0.0379 0.0968 0.254 pDC L2
ENSG00000286438 AL591115.1 354895 sc-eQTL 6.59e-01 0.0409 0.0926 0.254 pDC L2
ENSG00000286887 AL355881.1 -838278 sc-eQTL 7.39e-01 -0.0274 0.0821 0.254 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000028839 TBPL1 -494147 sc-eQTL 3.09e-01 -0.104 0.102 0.274 B_Memory LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 944825 sc-eQTL 4.28e-01 0.0446 0.0561 0.274 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 694564 sc-eQTL 8.98e-01 -0.0114 0.0889 0.274 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 643454 sc-eQTL 1.03e-01 0.0823 0.0503 0.274 B_Memory LOneK1K
ENSG00000118515 SGK1 -860089 sc-eQTL 1.59e-02 -0.19 0.0781 0.274 B_Memory LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 644684 sc-eQTL 4.35e-01 -0.0727 0.0928 0.274 B_Memory LOneK1K
ENSG00000028839 TBPL1 -494147 sc-eQTL 8.74e-01 0.0152 0.0954 0.274 B_Naive LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 944825 sc-eQTL 9.87e-01 0.000697 0.043 0.274 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 694564 sc-eQTL 6.59e-01 0.0369 0.0834 0.274 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 643454 sc-eQTL 4.60e-01 0.0373 0.0504 0.274 B_Naive LOneK1K
ENSG00000118515 SGK1 -860089 sc-eQTL 9.95e-02 -0.129 0.0777 0.274 B_Naive LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 644684 sc-eQTL 1.64e-01 0.132 0.0948 0.274 B_Naive LOneK1K
ENSG00000028839 TBPL1 -494147 sc-eQTL 8.30e-01 0.0171 0.0792 0.274 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 944825 sc-eQTL 4.03e-01 0.0461 0.055 0.274 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000093134 VNN3 723258 sc-eQTL 4.17e-02 0.182 0.0889 0.274 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112299 VNN1 743968 sc-eQTL 1.65e-01 -0.13 0.0932 0.274 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 694564 sc-eQTL 3.34e-01 0.0599 0.0618 0.274 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 643454 sc-eQTL 7.64e-01 0.0128 0.0424 0.274 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000118515 SGK1 -860089 sc-eQTL 1.04e-01 -0.094 0.0575 0.274 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 644684 sc-eQTL 3.78e-01 0.0666 0.0754 0.274 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000286887 AL355881.1 -838278 sc-eQTL 2.00e-01 -0.101 0.0789 0.274 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000028839 TBPL1 -494147 sc-eQTL 6.67e-01 0.0441 0.102 0.274 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 944825 sc-eQTL 6.13e-01 0.0341 0.0674 0.274 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000093134 VNN3 723258 sc-eQTL 7.09e-02 0.179 0.0984 0.274 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112299 VNN1 743968 sc-eQTL 5.58e-01 -0.0577 0.0982 0.274 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 694564 sc-eQTL 5.02e-01 -0.0623 0.0926 0.274 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 643454 sc-eQTL 9.40e-01 0.00295 0.0393 0.274 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000118515 SGK1 -860089 sc-eQTL 3.51e-01 -0.0556 0.0594 0.274 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 644684 sc-eQTL 1.21e-01 -0.148 0.0949 0.274 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000286887 AL355881.1 -838278 sc-eQTL 2.13e-02 -0.198 0.0853 0.274 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000028839 TBPL1 -494147 sc-eQTL 6.23e-01 -0.0407 0.0826 0.276 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 944825 sc-eQTL 1.82e-02 0.182 0.0766 0.276 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 694564 sc-eQTL 6.52e-01 0.0444 0.0982 0.276 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 643454 sc-eQTL 2.75e-01 0.0437 0.04 0.276 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000118515 SGK1 -860089 sc-eQTL 9.91e-02 -0.136 0.0823 0.276 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000112299 VNN1 743968 pQTL 0.0019 -0.124 0.0397 0.0 0.0 0.233

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina