logo

Genes within 1Mb (chr6:133457771:C:T):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000028839 TBPL1 -494399 sc-eQTL 4.63e-01 -0.0717 0.0976 0.267 B L1
ENSG00000079950 STX7 944573 sc-eQTL 9.97e-01 -0.000126 0.0389 0.267 B L1
ENSG00000112303 VNN2 694312 sc-eQTL 7.55e-01 0.0229 0.0732 0.267 B L1
ENSG00000112306 RPS12 643202 sc-eQTL 8.82e-02 0.0753 0.0439 0.267 B L1
ENSG00000118515 SGK1 -860341 sc-eQTL 1.60e-01 -0.0957 0.0679 0.267 B L1
ENSG00000146409 SLC18B1 644432 sc-eQTL 4.07e-01 0.0773 0.093 0.267 B L1
ENSG00000028839 TBPL1 -494399 sc-eQTL 3.19e-01 0.0733 0.0734 0.267 CD4T L1
ENSG00000079950 STX7 944573 sc-eQTL 3.68e-01 -0.0689 0.0763 0.267 CD4T L1
ENSG00000112303 VNN2 694312 sc-eQTL 3.70e-01 -0.0594 0.0661 0.267 CD4T L1
ENSG00000112306 RPS12 643202 sc-eQTL 2.44e-01 0.0525 0.0449 0.267 CD4T L1
ENSG00000118515 SGK1 -860341 sc-eQTL 2.31e-02 -0.137 0.0598 0.267 CD4T L1
ENSG00000146409 SLC18B1 644432 sc-eQTL 6.43e-01 0.0423 0.091 0.267 CD4T L1
ENSG00000028839 TBPL1 -494399 sc-eQTL 9.31e-01 0.0062 0.072 0.267 CD8T L1
ENSG00000079950 STX7 944573 sc-eQTL 3.19e-02 0.161 0.0743 0.267 CD8T L1
ENSG00000112303 VNN2 694312 sc-eQTL 5.02e-01 0.0589 0.0877 0.267 CD8T L1
ENSG00000112306 RPS12 643202 sc-eQTL 3.68e-02 0.0624 0.0297 0.267 CD8T L1
ENSG00000118515 SGK1 -860341 sc-eQTL 8.22e-02 -0.0801 0.0459 0.267 CD8T L1
ENSG00000146409 SLC18B1 644432 sc-eQTL 2.35e-01 0.108 0.0904 0.267 CD8T L1
ENSG00000028839 TBPL1 -494399 sc-eQTL 9.92e-01 -0.00107 0.107 0.261 DC L1
ENSG00000079950 STX7 944573 sc-eQTL 7.34e-01 -0.0227 0.0667 0.261 DC L1
ENSG00000093134 VNN3 723006 sc-eQTL 3.07e-01 0.0845 0.0825 0.261 DC L1
ENSG00000112299 VNN1 743716 sc-eQTL 4.43e-01 0.0685 0.0892 0.261 DC L1
ENSG00000112303 VNN2 694312 sc-eQTL 5.19e-01 0.0617 0.0954 0.261 DC L1
ENSG00000112306 RPS12 643202 sc-eQTL 2.29e-01 0.0644 0.0534 0.261 DC L1
ENSG00000118515 SGK1 -860341 sc-eQTL 3.36e-01 -0.0598 0.062 0.261 DC L1
ENSG00000146409 SLC18B1 644432 sc-eQTL 1.75e-01 -0.115 0.0844 0.261 DC L1
ENSG00000286438 AL591115.1 354643 sc-eQTL 8.42e-01 0.0154 0.0771 0.261 DC L1
ENSG00000286887 AL355881.1 -838530 sc-eQTL 8.18e-01 -0.0221 0.0962 0.261 DC L1
ENSG00000028839 TBPL1 -494399 sc-eQTL 9.23e-01 0.00743 0.0771 0.267 Mono L1
ENSG00000079950 STX7 944573 sc-eQTL 3.81e-01 0.0452 0.0515 0.267 Mono L1
ENSG00000093134 VNN3 723006 sc-eQTL 5.31e-02 0.171 0.0878 0.267 Mono L1
ENSG00000112299 VNN1 743716 sc-eQTL 1.64e-01 -0.132 0.0948 0.267 Mono L1
ENSG00000112303 VNN2 694312 sc-eQTL 6.83e-01 0.0275 0.0672 0.267 Mono L1
ENSG00000112306 RPS12 643202 sc-eQTL 9.86e-01 -0.000691 0.0403 0.267 Mono L1
ENSG00000118515 SGK1 -860341 sc-eQTL 2.25e-01 -0.069 0.0567 0.267 Mono L1
ENSG00000146409 SLC18B1 644432 sc-eQTL 5.75e-01 0.0447 0.0797 0.267 Mono L1
ENSG00000286887 AL355881.1 -838530 sc-eQTL 5.96e-02 -0.147 0.0777 0.267 Mono L1
ENSG00000028839 TBPL1 -494399 sc-eQTL 9.17e-01 0.00885 0.0845 0.268 NK L1
ENSG00000079950 STX7 944573 sc-eQTL 5.59e-02 0.149 0.0775 0.268 NK L1
ENSG00000112303 VNN2 694312 sc-eQTL 8.54e-01 0.0179 0.0972 0.268 NK L1
ENSG00000112306 RPS12 643202 sc-eQTL 3.48e-01 0.0378 0.0402 0.268 NK L1
ENSG00000118515 SGK1 -860341 sc-eQTL 3.71e-01 -0.0665 0.0743 0.268 NK L1
ENSG00000028839 TBPL1 -494399 sc-eQTL 6.33e-01 0.0462 0.0966 0.267 Other_T L1
ENSG00000079950 STX7 944573 sc-eQTL 6.99e-01 0.0295 0.0761 0.267 Other_T L1
ENSG00000112303 VNN2 694312 sc-eQTL 4.44e-01 -0.0706 0.0919 0.267 Other_T L1
ENSG00000112306 RPS12 643202 sc-eQTL 8.45e-01 -0.00712 0.0365 0.267 Other_T L1
ENSG00000118515 SGK1 -860341 sc-eQTL 1.30e-01 -0.101 0.0668 0.267 Other_T L1
ENSG00000146409 SLC18B1 644432 sc-eQTL 6.26e-01 0.0488 0.0998 0.267 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000028839 TBPL1 -494399 sc-eQTL 1.11e-01 0.177 0.11 0.265 B_Activated L2
ENSG00000079950 STX7 944573 sc-eQTL 3.36e-01 0.0915 0.0948 0.265 B_Activated L2
ENSG00000112303 VNN2 694312 sc-eQTL 7.98e-01 0.0259 0.101 0.265 B_Activated L2
ENSG00000112306 RPS12 643202 sc-eQTL 4.83e-01 0.0381 0.0541 0.265 B_Activated L2
ENSG00000118515 SGK1 -860341 sc-eQTL 1.06e-01 -0.156 0.096 0.265 B_Activated L2
ENSG00000146409 SLC18B1 644432 sc-eQTL 4.80e-01 0.0671 0.0948 0.265 B_Activated L2
ENSG00000028839 TBPL1 -494399 sc-eQTL 2.21e-01 -0.131 0.107 0.266 B_Intermediate L2
ENSG00000079950 STX7 944573 sc-eQTL 4.87e-01 0.0429 0.0616 0.266 B_Intermediate L2
ENSG00000112303 VNN2 694312 sc-eQTL 3.13e-01 0.0937 0.0927 0.266 B_Intermediate L2
ENSG00000112306 RPS12 643202 sc-eQTL 1.02e-01 0.0927 0.0565 0.266 B_Intermediate L2
ENSG00000118515 SGK1 -860341 sc-eQTL 5.94e-03 -0.268 0.0966 0.266 B_Intermediate L2
ENSG00000146409 SLC18B1 644432 sc-eQTL 8.99e-01 -0.013 0.102 0.266 B_Intermediate L2
ENSG00000028839 TBPL1 -494399 sc-eQTL 6.27e-01 -0.0507 0.104 0.267 B_Memory L2
ENSG00000079950 STX7 944573 sc-eQTL 8.82e-01 0.0112 0.0754 0.267 B_Memory L2
ENSG00000112303 VNN2 694312 sc-eQTL 5.46e-01 -0.0596 0.0985 0.267 B_Memory L2
ENSG00000112306 RPS12 643202 sc-eQTL 1.92e-02 0.111 0.0469 0.267 B_Memory L2
ENSG00000118515 SGK1 -860341 sc-eQTL 4.35e-01 -0.0681 0.087 0.267 B_Memory L2
ENSG00000146409 SLC18B1 644432 sc-eQTL 1.75e-01 -0.134 0.0987 0.267 B_Memory L2
ENSG00000028839 TBPL1 -494399 sc-eQTL 6.39e-01 0.0454 0.0966 0.267 B_Naive1 L2
ENSG00000079950 STX7 944573 sc-eQTL 5.19e-01 -0.03 0.0464 0.267 B_Naive1 L2
ENSG00000112303 VNN2 694312 sc-eQTL 6.71e-01 0.0384 0.0901 0.267 B_Naive1 L2
ENSG00000112306 RPS12 643202 sc-eQTL 6.44e-01 0.0238 0.0513 0.267 B_Naive1 L2
ENSG00000118515 SGK1 -860341 sc-eQTL 5.70e-01 -0.0456 0.0803 0.267 B_Naive1 L2
ENSG00000146409 SLC18B1 644432 sc-eQTL 4.21e-01 0.0797 0.0989 0.267 B_Naive1 L2
ENSG00000028839 TBPL1 -494399 sc-eQTL 9.35e-01 0.00834 0.103 0.268 B_Naive2 L2
ENSG00000079950 STX7 944573 sc-eQTL 5.20e-01 0.0352 0.0545 0.268 B_Naive2 L2
ENSG00000112303 VNN2 694312 sc-eQTL 5.61e-01 0.0582 0.1 0.268 B_Naive2 L2
ENSG00000112306 RPS12 643202 sc-eQTL 3.82e-01 0.0464 0.053 0.268 B_Naive2 L2
ENSG00000118515 SGK1 -860341 sc-eQTL 1.54e-01 -0.133 0.0933 0.268 B_Naive2 L2
ENSG00000146409 SLC18B1 644432 sc-eQTL 8.52e-02 0.174 0.101 0.268 B_Naive2 L2
ENSG00000028839 TBPL1 -494399 sc-eQTL 5.15e-01 -0.0663 0.102 0.273 CD4_CTL L2
ENSG00000079950 STX7 944573 sc-eQTL 3.04e-01 -0.104 0.101 0.273 CD4_CTL L2
ENSG00000112303 VNN2 694312 sc-eQTL 9.16e-01 -0.0108 0.102 0.273 CD4_CTL L2
ENSG00000112306 RPS12 643202 sc-eQTL 4.84e-01 0.033 0.0471 0.273 CD4_CTL L2
ENSG00000118515 SGK1 -860341 sc-eQTL 7.54e-02 -0.145 0.0811 0.273 CD4_CTL L2
ENSG00000146409 SLC18B1 644432 sc-eQTL 9.98e-01 -0.000263 0.095 0.273 CD4_CTL L2
ENSG00000028839 TBPL1 -494399 sc-eQTL 2.50e-01 0.0962 0.0833 0.267 CD4_Naive L2
ENSG00000079950 STX7 944573 sc-eQTL 1.77e-01 -0.111 0.0816 0.267 CD4_Naive L2
ENSG00000112303 VNN2 694312 sc-eQTL 1.80e-01 -0.102 0.0756 0.267 CD4_Naive L2
ENSG00000112306 RPS12 643202 sc-eQTL 6.94e-01 0.0194 0.0492 0.267 CD4_Naive L2
ENSG00000118515 SGK1 -860341 sc-eQTL 8.52e-03 -0.158 0.0593 0.267 CD4_Naive L2
ENSG00000146409 SLC18B1 644432 sc-eQTL 4.55e-01 0.0709 0.0947 0.267 CD4_Naive L2
ENSG00000028839 TBPL1 -494399 sc-eQTL 1.35e-01 0.137 0.0912 0.267 CD4_TCM L2
ENSG00000079950 STX7 944573 sc-eQTL 4.84e-01 0.0647 0.0922 0.267 CD4_TCM L2
ENSG00000112303 VNN2 694312 sc-eQTL 5.08e-01 0.0603 0.0909 0.267 CD4_TCM L2
ENSG00000112306 RPS12 643202 sc-eQTL 7.07e-02 0.0851 0.0468 0.267 CD4_TCM L2
ENSG00000118515 SGK1 -860341 sc-eQTL 4.96e-01 -0.0449 0.066 0.267 CD4_TCM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 644432 sc-eQTL 9.46e-01 0.00741 0.109 0.267 CD4_TCM L2
ENSG00000028839 TBPL1 -494399 sc-eQTL 1.98e-01 0.134 0.104 0.267 CD4_TEM L2
ENSG00000079950 STX7 944573 sc-eQTL 9.71e-01 -0.00382 0.104 0.267 CD4_TEM L2
ENSG00000112303 VNN2 694312 sc-eQTL 5.43e-01 0.0609 0.1 0.267 CD4_TEM L2
ENSG00000112306 RPS12 643202 sc-eQTL 7.69e-01 0.0121 0.041 0.267 CD4_TEM L2
ENSG00000118515 SGK1 -860341 sc-eQTL 1.14e-01 -0.111 0.0701 0.267 CD4_TEM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 644432 sc-eQTL 9.66e-01 0.00436 0.102 0.267 CD4_TEM L2
ENSG00000028839 TBPL1 -494399 sc-eQTL 9.96e-02 0.151 0.0911 0.267 CD8_CTL L2
ENSG00000079950 STX7 944573 sc-eQTL 2.51e-02 0.191 0.0847 0.267 CD8_CTL L2
ENSG00000112303 VNN2 694312 sc-eQTL 5.35e-01 0.0605 0.0973 0.267 CD8_CTL L2
ENSG00000112306 RPS12 643202 sc-eQTL 8.16e-01 0.0121 0.0521 0.267 CD8_CTL L2
ENSG00000118515 SGK1 -860341 sc-eQTL 4.62e-03 -0.247 0.0863 0.267 CD8_CTL L2
ENSG00000146409 SLC18B1 644432 sc-eQTL 7.09e-01 0.0377 0.101 0.267 CD8_CTL L2
ENSG00000028839 TBPL1 -494399 sc-eQTL 4.58e-01 -0.0711 0.0955 0.267 CD8_Naive L2
ENSG00000079950 STX7 944573 sc-eQTL 1.74e-01 0.138 0.101 0.267 CD8_Naive L2
ENSG00000112303 VNN2 694312 sc-eQTL 9.48e-01 0.00571 0.088 0.267 CD8_Naive L2
ENSG00000112306 RPS12 643202 sc-eQTL 9.61e-02 0.0836 0.05 0.267 CD8_Naive L2
ENSG00000118515 SGK1 -860341 sc-eQTL 9.28e-03 -0.163 0.0622 0.267 CD8_Naive L2
ENSG00000146409 SLC18B1 644432 sc-eQTL 1.05e-01 0.164 0.1 0.267 CD8_Naive L2
ENSG00000028839 TBPL1 -494399 sc-eQTL 7.02e-01 -0.0416 0.108 0.271 CD8_TCM L2
ENSG00000079950 STX7 944573 sc-eQTL 9.31e-01 0.00875 0.1 0.271 CD8_TCM L2
ENSG00000112303 VNN2 694312 sc-eQTL 4.29e-01 0.0788 0.0993 0.271 CD8_TCM L2
ENSG00000112306 RPS12 643202 sc-eQTL 4.53e-01 0.0364 0.0484 0.271 CD8_TCM L2
ENSG00000118515 SGK1 -860341 sc-eQTL 3.64e-03 -0.231 0.0786 0.271 CD8_TCM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 644432 sc-eQTL 8.84e-01 0.0155 0.106 0.271 CD8_TCM L2
ENSG00000028839 TBPL1 -494399 sc-eQTL 5.45e-02 -0.194 0.1 0.256 CD8_TEM L2
ENSG00000079950 STX7 944573 sc-eQTL 3.58e-01 -0.102 0.11 0.256 CD8_TEM L2
ENSG00000112303 VNN2 694312 sc-eQTL 1.62e-01 -0.153 0.109 0.256 CD8_TEM L2
ENSG00000112306 RPS12 643202 sc-eQTL 5.45e-01 -0.0358 0.059 0.256 CD8_TEM L2
ENSG00000118515 SGK1 -860341 sc-eQTL 4.63e-01 -0.0711 0.0967 0.256 CD8_TEM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 644432 sc-eQTL 9.55e-01 -0.00629 0.112 0.256 CD8_TEM L2
ENSG00000028839 TBPL1 -494399 sc-eQTL 6.28e-01 -0.0495 0.102 0.268 MAIT L2
ENSG00000079950 STX7 944573 sc-eQTL 3.99e-01 0.0819 0.0969 0.268 MAIT L2
ENSG00000112303 VNN2 694312 sc-eQTL 9.43e-01 0.00711 0.0988 0.268 MAIT L2
ENSG00000112306 RPS12 643202 sc-eQTL 7.11e-01 0.018 0.0486 0.268 MAIT L2
ENSG00000118515 SGK1 -860341 sc-eQTL 3.55e-01 -0.0633 0.0682 0.268 MAIT L2
ENSG00000146409 SLC18B1 644432 sc-eQTL 8.27e-01 -0.0223 0.102 0.268 MAIT L2
ENSG00000028839 TBPL1 -494399 sc-eQTL 3.00e-01 0.113 0.108 0.267 NK_CD56bright L2
ENSG00000079950 STX7 944573 sc-eQTL 7.09e-01 -0.0376 0.101 0.267 NK_CD56bright L2
ENSG00000112303 VNN2 694312 sc-eQTL 4.47e-01 -0.0779 0.102 0.267 NK_CD56bright L2
ENSG00000112306 RPS12 643202 sc-eQTL 5.50e-01 0.0341 0.0569 0.267 NK_CD56bright L2
ENSG00000118515 SGK1 -860341 sc-eQTL 7.85e-01 0.0233 0.0852 0.267 NK_CD56bright L2
ENSG00000028839 TBPL1 -494399 sc-eQTL 8.95e-01 0.0121 0.0913 0.269 NK_CD56dim L2
ENSG00000079950 STX7 944573 sc-eQTL 8.31e-02 0.144 0.083 0.269 NK_CD56dim L2
ENSG00000112303 VNN2 694312 sc-eQTL 5.68e-01 0.0598 0.104 0.269 NK_CD56dim L2
ENSG00000112306 RPS12 643202 sc-eQTL 2.99e-01 0.0431 0.0414 0.269 NK_CD56dim L2
ENSG00000118515 SGK1 -860341 sc-eQTL 3.93e-02 -0.189 0.0909 0.269 NK_CD56dim L2
ENSG00000028839 TBPL1 -494399 sc-eQTL 7.62e-01 0.034 0.112 0.267 NK_HLA L2
ENSG00000079950 STX7 944573 sc-eQTL 2.51e-01 0.117 0.102 0.267 NK_HLA L2
ENSG00000112303 VNN2 694312 sc-eQTL 6.12e-01 -0.0527 0.104 0.267 NK_HLA L2
ENSG00000112306 RPS12 643202 sc-eQTL 3.65e-01 0.0437 0.0482 0.267 NK_HLA L2
ENSG00000118515 SGK1 -860341 sc-eQTL 4.10e-01 0.0786 0.0953 0.267 NK_HLA L2
ENSG00000028839 TBPL1 -494399 sc-eQTL 4.78e-01 -0.066 0.0929 0.269 NK_cytokine L2
ENSG00000079950 STX7 944573 sc-eQTL 8.71e-01 0.0146 0.09 0.269 NK_cytokine L2
ENSG00000112303 VNN2 694312 sc-eQTL 6.65e-01 -0.0439 0.101 0.269 NK_cytokine L2
ENSG00000112306 RPS12 643202 sc-eQTL 5.72e-01 0.0311 0.0549 0.269 NK_cytokine L2
ENSG00000118515 SGK1 -860341 sc-eQTL 3.81e-01 -0.0801 0.0912 0.269 NK_cytokine L2
ENSG00000028839 TBPL1 -494399 sc-eQTL 2.11e-01 -0.154 0.123 0.263 PB L2
ENSG00000079950 STX7 944573 sc-eQTL 8.43e-01 0.0175 0.088 0.263 PB L2
ENSG00000112303 VNN2 694312 sc-eQTL 2.40e-01 0.126 0.107 0.263 PB L2
ENSG00000112306 RPS12 643202 sc-eQTL 6.92e-01 0.0242 0.061 0.263 PB L2
ENSG00000118515 SGK1 -860341 sc-eQTL 1.16e-01 -0.154 0.0975 0.263 PB L2
ENSG00000146409 SLC18B1 644432 sc-eQTL 9.41e-01 0.00842 0.114 0.263 PB L2
ENSG00000028839 TBPL1 -494399 sc-eQTL 4.30e-01 0.081 0.103 0.265 Pro_T L2
ENSG00000079950 STX7 944573 sc-eQTL 3.18e-01 -0.0916 0.0915 0.265 Pro_T L2
ENSG00000112303 VNN2 694312 sc-eQTL 7.05e-01 0.0373 0.0983 0.265 Pro_T L2
ENSG00000112306 RPS12 643202 sc-eQTL 3.09e-01 -0.0379 0.0371 0.265 Pro_T L2
ENSG00000118515 SGK1 -860341 sc-eQTL 5.89e-01 -0.0404 0.0745 0.265 Pro_T L2
ENSG00000146409 SLC18B1 644432 sc-eQTL 3.67e-01 0.0868 0.0961 0.265 Pro_T L2
ENSG00000028839 TBPL1 -494399 sc-eQTL 4.73e-01 -0.0778 0.108 0.267 Treg L2
ENSG00000079950 STX7 944573 sc-eQTL 8.06e-02 -0.178 0.101 0.267 Treg L2
ENSG00000112303 VNN2 694312 sc-eQTL 2.48e-01 0.0992 0.0856 0.267 Treg L2
ENSG00000112306 RPS12 643202 sc-eQTL 5.50e-01 -0.0227 0.038 0.267 Treg L2
ENSG00000118515 SGK1 -860341 sc-eQTL 3.91e-01 -0.0687 0.0799 0.267 Treg L2
ENSG00000146409 SLC18B1 644432 sc-eQTL 9.73e-01 0.00358 0.107 0.267 Treg L2
ENSG00000028839 TBPL1 -494399 sc-eQTL 9.90e-01 0.0013 0.108 0.254 cDC L2
ENSG00000079950 STX7 944573 sc-eQTL 9.17e-01 0.00891 0.0849 0.254 cDC L2
ENSG00000093134 VNN3 723006 sc-eQTL 4.26e-01 0.0671 0.0842 0.254 cDC L2
ENSG00000112299 VNN1 743716 sc-eQTL 3.45e-01 0.0937 0.0989 0.254 cDC L2
ENSG00000112303 VNN2 694312 sc-eQTL 6.91e-01 -0.0385 0.0966 0.254 cDC L2
ENSG00000112306 RPS12 643202 sc-eQTL 1.29e-01 0.0722 0.0474 0.254 cDC L2
ENSG00000118515 SGK1 -860341 sc-eQTL 4.02e-02 -0.164 0.0795 0.254 cDC L2
ENSG00000146409 SLC18B1 644432 sc-eQTL 4.68e-01 -0.0686 0.0944 0.254 cDC L2
ENSG00000286438 AL591115.1 354643 sc-eQTL 2.40e-01 0.0887 0.0753 0.254 cDC L2
ENSG00000286887 AL355881.1 -838530 sc-eQTL 2.75e-01 -0.101 0.0926 0.254 cDC L2
ENSG00000028839 TBPL1 -494399 sc-eQTL 7.73e-01 -0.0253 0.0877 0.267 cMono_IL1B L2
ENSG00000079950 STX7 944573 sc-eQTL 1.91e-01 0.087 0.0663 0.267 cMono_IL1B L2
ENSG00000093134 VNN3 723006 sc-eQTL 1.67e-01 0.13 0.0937 0.267 cMono_IL1B L2
ENSG00000112299 VNN1 743716 sc-eQTL 1.90e-01 -0.124 0.0946 0.267 cMono_IL1B L2
ENSG00000112303 VNN2 694312 sc-eQTL 5.67e-01 0.0435 0.0759 0.267 cMono_IL1B L2
ENSG00000112306 RPS12 643202 sc-eQTL 8.38e-01 0.00861 0.0422 0.267 cMono_IL1B L2
ENSG00000118515 SGK1 -860341 sc-eQTL 3.01e-01 -0.065 0.0627 0.267 cMono_IL1B L2
ENSG00000146409 SLC18B1 644432 sc-eQTL 9.33e-01 0.00685 0.0813 0.267 cMono_IL1B L2
ENSG00000286887 AL355881.1 -838530 sc-eQTL 1.87e-01 -0.112 0.0844 0.267 cMono_IL1B L2
ENSG00000028839 TBPL1 -494399 sc-eQTL 5.81e-01 0.0547 0.0989 0.267 cMono_S100A L2
ENSG00000079950 STX7 944573 sc-eQTL 5.76e-01 -0.0401 0.0715 0.267 cMono_S100A L2
ENSG00000093134 VNN3 723006 sc-eQTL 3.23e-02 0.19 0.0884 0.267 cMono_S100A L2
ENSG00000112299 VNN1 743716 sc-eQTL 2.69e-01 -0.107 0.0967 0.267 cMono_S100A L2
ENSG00000112303 VNN2 694312 sc-eQTL 5.10e-01 0.0419 0.0635 0.267 cMono_S100A L2
ENSG00000112306 RPS12 643202 sc-eQTL 8.18e-01 0.0105 0.0457 0.267 cMono_S100A L2
ENSG00000118515 SGK1 -860341 sc-eQTL 1.28e-01 -0.0794 0.052 0.267 cMono_S100A L2
ENSG00000146409 SLC18B1 644432 sc-eQTL 9.89e-02 0.139 0.0841 0.267 cMono_S100A L2
ENSG00000286887 AL355881.1 -838530 sc-eQTL 9.69e-02 -0.137 0.0823 0.267 cMono_S100A L2
ENSG00000028839 TBPL1 -494399 sc-eQTL 6.26e-01 0.0645 0.132 0.255 gdT L2
ENSG00000079950 STX7 944573 sc-eQTL 7.85e-01 0.031 0.114 0.255 gdT L2
ENSG00000112303 VNN2 694312 sc-eQTL 3.53e-01 -0.117 0.125 0.255 gdT L2
ENSG00000112306 RPS12 643202 sc-eQTL 7.58e-01 0.0148 0.0479 0.255 gdT L2
ENSG00000118515 SGK1 -860341 sc-eQTL 5.61e-03 -0.247 0.0879 0.255 gdT L2
ENSG00000146409 SLC18B1 644432 sc-eQTL 9.21e-01 0.0123 0.124 0.255 gdT L2
ENSG00000028839 TBPL1 -494399 sc-eQTL 7.01e-01 0.0389 0.101 0.262 intMono L2
ENSG00000079950 STX7 944573 sc-eQTL 9.06e-01 -0.0114 0.0966 0.262 intMono L2
ENSG00000093134 VNN3 723006 sc-eQTL 8.53e-02 0.167 0.0968 0.262 intMono L2
ENSG00000112299 VNN1 743716 sc-eQTL 1.51e-01 -0.138 0.0959 0.262 intMono L2
ENSG00000112303 VNN2 694312 sc-eQTL 2.28e-01 -0.118 0.0976 0.262 intMono L2
ENSG00000112306 RPS12 643202 sc-eQTL 8.53e-01 -0.0079 0.0426 0.262 intMono L2
ENSG00000118515 SGK1 -860341 sc-eQTL 8.34e-01 -0.015 0.0716 0.262 intMono L2
ENSG00000146409 SLC18B1 644432 sc-eQTL 2.58e-02 -0.23 0.103 0.262 intMono L2
ENSG00000286887 AL355881.1 -838530 sc-eQTL 1.15e-01 -0.156 0.0987 0.262 intMono L2
ENSG00000028839 TBPL1 -494399 sc-eQTL 9.80e-01 0.00271 0.105 0.265 ncMono L2
ENSG00000079950 STX7 944573 sc-eQTL 7.18e-01 0.0258 0.0713 0.265 ncMono L2
ENSG00000093134 VNN3 723006 sc-eQTL 7.26e-01 0.0353 0.101 0.265 ncMono L2
ENSG00000112299 VNN1 743716 sc-eQTL 3.49e-01 -0.0937 0.0997 0.265 ncMono L2
ENSG00000112303 VNN2 694312 sc-eQTL 4.18e-01 -0.0779 0.0959 0.265 ncMono L2
ENSG00000112306 RPS12 643202 sc-eQTL 9.11e-01 0.00541 0.0482 0.265 ncMono L2
ENSG00000118515 SGK1 -860341 sc-eQTL 2.30e-01 -0.0818 0.0679 0.265 ncMono L2
ENSG00000146409 SLC18B1 644432 sc-eQTL 9.13e-01 0.00932 0.0851 0.265 ncMono L2
ENSG00000286887 AL355881.1 -838530 sc-eQTL 2.51e-01 -0.103 0.0897 0.265 ncMono L2
ENSG00000028839 TBPL1 -494399 sc-eQTL 6.09e-01 0.0614 0.12 0.246 pDC L2
ENSG00000079950 STX7 944573 sc-eQTL 2.52e-01 0.0913 0.0795 0.246 pDC L2
ENSG00000093134 VNN3 723006 sc-eQTL 3.72e-01 0.0718 0.0801 0.246 pDC L2
ENSG00000112299 VNN1 743716 sc-eQTL 4.88e-01 0.0567 0.0816 0.246 pDC L2
ENSG00000112303 VNN2 694312 sc-eQTL 1.96e-03 0.297 0.0943 0.246 pDC L2
ENSG00000112306 RPS12 643202 sc-eQTL 8.87e-01 0.00951 0.067 0.246 pDC L2
ENSG00000118515 SGK1 -860341 sc-eQTL 7.52e-01 -0.0216 0.0681 0.246 pDC L2
ENSG00000146409 SLC18B1 644432 sc-eQTL 5.29e-01 -0.0625 0.0991 0.246 pDC L2
ENSG00000286438 AL591115.1 354643 sc-eQTL 8.43e-01 0.0189 0.0949 0.246 pDC L2
ENSG00000286887 AL355881.1 -838530 sc-eQTL 9.31e-01 -0.00735 0.0842 0.246 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000028839 TBPL1 -494399 sc-eQTL 2.99e-01 -0.108 0.104 0.267 B_Memory LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 944573 sc-eQTL 5.35e-01 0.0356 0.0572 0.267 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 694312 sc-eQTL 9.78e-01 -0.00247 0.0906 0.267 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 643202 sc-eQTL 1.02e-01 0.0842 0.0513 0.267 B_Memory LOneK1K
ENSG00000118515 SGK1 -860341 sc-eQTL 1.63e-02 -0.193 0.0796 0.267 B_Memory LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 644432 sc-eQTL 3.97e-01 -0.0803 0.0946 0.267 B_Memory LOneK1K
ENSG00000028839 TBPL1 -494399 sc-eQTL 9.85e-01 0.00177 0.0972 0.267 B_Naive LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 944573 sc-eQTL 6.69e-01 -0.0187 0.0438 0.267 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 694312 sc-eQTL 5.50e-01 0.0508 0.0849 0.267 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 643202 sc-eQTL 5.01e-01 0.0346 0.0514 0.267 B_Naive LOneK1K
ENSG00000118515 SGK1 -860341 sc-eQTL 2.77e-01 -0.0865 0.0794 0.267 B_Naive LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 644432 sc-eQTL 1.83e-01 0.129 0.0966 0.267 B_Naive LOneK1K
ENSG00000028839 TBPL1 -494399 sc-eQTL 9.06e-01 -0.0094 0.0798 0.267 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 944573 sc-eQTL 3.61e-01 0.0507 0.0554 0.267 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000093134 VNN3 723006 sc-eQTL 7.34e-02 0.161 0.0897 0.267 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112299 VNN1 743716 sc-eQTL 1.38e-01 -0.14 0.0938 0.267 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 694312 sc-eQTL 7.64e-01 0.0187 0.0623 0.267 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 643202 sc-eQTL 8.53e-01 0.00793 0.0428 0.267 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000118515 SGK1 -860341 sc-eQTL 1.80e-01 -0.078 0.058 0.267 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 644432 sc-eQTL 4.33e-01 0.0597 0.076 0.267 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000286887 AL355881.1 -838530 sc-eQTL 1.45e-01 -0.116 0.0794 0.267 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000028839 TBPL1 -494399 sc-eQTL 4.66e-01 0.0754 0.103 0.267 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 944573 sc-eQTL 5.84e-01 0.0374 0.0681 0.267 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000093134 VNN3 723006 sc-eQTL 6.06e-02 0.188 0.0995 0.267 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112299 VNN1 743716 sc-eQTL 4.59e-01 -0.0736 0.0993 0.267 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 694312 sc-eQTL 3.35e-01 -0.0903 0.0935 0.267 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 643202 sc-eQTL 9.57e-01 0.00217 0.0398 0.267 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000118515 SGK1 -860341 sc-eQTL 4.36e-01 -0.0469 0.0601 0.267 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 644432 sc-eQTL 1.49e-01 -0.139 0.0961 0.267 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000286887 AL355881.1 -838530 sc-eQTL 1.16e-02 -0.219 0.086 0.267 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000028839 TBPL1 -494399 sc-eQTL 7.18e-01 -0.0305 0.0842 0.269 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 944573 sc-eQTL 4.00e-02 0.162 0.0783 0.269 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 694312 sc-eQTL 6.81e-01 0.0412 0.1 0.269 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 643202 sc-eQTL 3.09e-01 0.0416 0.0408 0.269 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000118515 SGK1 -860341 sc-eQTL 8.25e-02 -0.146 0.0838 0.269 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000112299 VNN1 743716 pQTL 0.00228 -0.122 0.0399 0.0 0.0 0.232

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina