logo

Genes within 1Mb (chr6:133454356:C:T):

View on , UCSC , GTEx , gnomAD

Immune cell-type specific single cell cis-eQTLs in OASIS
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000028839 TBPL1 -497814 sc-eQTL 7.54e-01 -0.03 0.0956 0.269 B L1
ENSG00000079950 STX7 941158 sc-eQTL 9.24e-01 -0.00363 0.0381 0.269 B L1
ENSG00000112303 VNN2 690897 sc-eQTL 7.82e-01 0.0198 0.0716 0.269 B L1
ENSG00000112306 RPS12 639787 sc-eQTL 6.15e-02 0.0807 0.0429 0.269 B L1
ENSG00000118515 SGK1 -863756 sc-eQTL 1.34e-01 -0.0999 0.0664 0.269 B L1
ENSG00000146409 SLC18B1 641017 sc-eQTL 3.58e-01 0.0837 0.0909 0.269 B L1
ENSG00000028839 TBPL1 -497814 sc-eQTL 2.13e-01 0.09 0.0721 0.269 CD4T L1
ENSG00000079950 STX7 941158 sc-eQTL 2.85e-01 -0.0805 0.075 0.269 CD4T L1
ENSG00000112303 VNN2 690897 sc-eQTL 4.34e-01 -0.051 0.0651 0.269 CD4T L1
ENSG00000112306 RPS12 639787 sc-eQTL 2.01e-01 0.0566 0.0441 0.269 CD4T L1
ENSG00000118515 SGK1 -863756 sc-eQTL 2.14e-02 -0.136 0.0588 0.269 CD4T L1
ENSG00000146409 SLC18B1 641017 sc-eQTL 6.29e-01 0.0433 0.0896 0.269 CD4T L1
ENSG00000028839 TBPL1 -497814 sc-eQTL 9.70e-01 0.00264 0.0706 0.269 CD8T L1
ENSG00000079950 STX7 941158 sc-eQTL 3.18e-02 0.158 0.0729 0.269 CD8T L1
ENSG00000112303 VNN2 690897 sc-eQTL 4.33e-01 0.0675 0.086 0.269 CD8T L1
ENSG00000112306 RPS12 639787 sc-eQTL 2.43e-02 0.0659 0.0291 0.269 CD8T L1
ENSG00000118515 SGK1 -863756 sc-eQTL 9.54e-02 -0.0755 0.045 0.269 CD8T L1
ENSG00000146409 SLC18B1 641017 sc-eQTL 1.13e-01 0.141 0.0884 0.269 CD8T L1
ENSG00000028839 TBPL1 -497814 sc-eQTL 9.31e-01 0.00907 0.105 0.264 DC L1
ENSG00000079950 STX7 941158 sc-eQTL 6.41e-01 -0.0306 0.0655 0.264 DC L1
ENSG00000093134 VNN3 719591 sc-eQTL 3.62e-01 0.074 0.081 0.264 DC L1
ENSG00000112299 VNN1 740301 sc-eQTL 3.73e-01 0.0781 0.0875 0.264 DC L1
ENSG00000112303 VNN2 690897 sc-eQTL 5.30e-01 0.059 0.0937 0.264 DC L1
ENSG00000112306 RPS12 639787 sc-eQTL 1.67e-01 0.0726 0.0523 0.264 DC L1
ENSG00000118515 SGK1 -863756 sc-eQTL 2.34e-01 -0.0725 0.0608 0.264 DC L1
ENSG00000146409 SLC18B1 641017 sc-eQTL 2.55e-01 -0.0946 0.083 0.264 DC L1
ENSG00000286438 AL591115.1 351228 sc-eQTL 9.70e-01 0.00282 0.0757 0.264 DC L1
ENSG00000286887 AL355881.1 -841945 sc-eQTL 7.52e-01 -0.0298 0.0944 0.264 DC L1
ENSG00000028839 TBPL1 -497814 sc-eQTL 5.63e-01 0.044 0.076 0.269 Mono L1
ENSG00000079950 STX7 941158 sc-eQTL 6.90e-01 0.0203 0.0508 0.269 Mono L1
ENSG00000093134 VNN3 719591 sc-eQTL 3.36e-02 0.185 0.0864 0.269 Mono L1
ENSG00000112299 VNN1 740301 sc-eQTL 1.22e-01 -0.145 0.0934 0.269 Mono L1
ENSG00000112303 VNN2 690897 sc-eQTL 3.68e-01 0.0597 0.0662 0.269 Mono L1
ENSG00000112306 RPS12 639787 sc-eQTL 7.61e-01 0.0121 0.0397 0.269 Mono L1
ENSG00000118515 SGK1 -863756 sc-eQTL 1.73e-01 -0.0763 0.0559 0.269 Mono L1
ENSG00000146409 SLC18B1 641017 sc-eQTL 4.05e-01 0.0655 0.0785 0.269 Mono L1
ENSG00000286887 AL355881.1 -841945 sc-eQTL 1.19e-01 -0.12 0.0768 0.269 Mono L1
ENSG00000028839 TBPL1 -497814 sc-eQTL 9.77e-01 0.00243 0.0828 0.27 NK L1
ENSG00000079950 STX7 941158 sc-eQTL 1.34e-01 0.114 0.0761 0.27 NK L1
ENSG00000112303 VNN2 690897 sc-eQTL 9.48e-01 -0.00622 0.0952 0.27 NK L1
ENSG00000112306 RPS12 639787 sc-eQTL 3.29e-01 0.0385 0.0393 0.27 NK L1
ENSG00000118515 SGK1 -863756 sc-eQTL 3.89e-01 -0.0628 0.0728 0.27 NK L1
ENSG00000028839 TBPL1 -497814 sc-eQTL 5.94e-01 0.0503 0.0942 0.269 Other_T L1
ENSG00000079950 STX7 941158 sc-eQTL 7.93e-01 0.0195 0.0742 0.269 Other_T L1
ENSG00000112303 VNN2 690897 sc-eQTL 6.19e-01 -0.0447 0.0897 0.269 Other_T L1
ENSG00000112306 RPS12 639787 sc-eQTL 9.70e-01 -0.00133 0.0356 0.269 Other_T L1
ENSG00000118515 SGK1 -863756 sc-eQTL 1.41e-01 -0.0962 0.0651 0.269 Other_T L1
ENSG00000146409 SLC18B1 641017 sc-eQTL 8.36e-01 0.0202 0.0974 0.269 Other_T L1
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000028839 TBPL1 -497814 sc-eQTL 1.06e-01 0.174 0.107 0.268 B_Activated L2
ENSG00000079950 STX7 941158 sc-eQTL 3.70e-01 0.083 0.0924 0.268 B_Activated L2
ENSG00000112303 VNN2 690897 sc-eQTL 6.96e-01 0.0385 0.0985 0.268 B_Activated L2
ENSG00000112306 RPS12 639787 sc-eQTL 5.02e-01 0.0355 0.0527 0.268 B_Activated L2
ENSG00000118515 SGK1 -863756 sc-eQTL 1.24e-01 -0.145 0.0935 0.268 B_Activated L2
ENSG00000146409 SLC18B1 641017 sc-eQTL 4.01e-01 0.0778 0.0923 0.268 B_Activated L2
ENSG00000028839 TBPL1 -497814 sc-eQTL 2.37e-01 -0.124 0.105 0.268 B_Intermediate L2
ENSG00000079950 STX7 941158 sc-eQTL 5.89e-01 0.0327 0.0604 0.268 B_Intermediate L2
ENSG00000112303 VNN2 690897 sc-eQTL 2.13e-01 0.113 0.0906 0.268 B_Intermediate L2
ENSG00000112306 RPS12 639787 sc-eQTL 1.31e-01 0.0839 0.0554 0.268 B_Intermediate L2
ENSG00000118515 SGK1 -863756 sc-eQTL 5.46e-03 -0.265 0.0945 0.268 B_Intermediate L2
ENSG00000146409 SLC18B1 641017 sc-eQTL 9.58e-01 -0.00524 0.1 0.268 B_Intermediate L2
ENSG00000028839 TBPL1 -497814 sc-eQTL 6.29e-01 -0.0492 0.102 0.269 B_Memory L2
ENSG00000079950 STX7 941158 sc-eQTL 8.64e-01 0.0127 0.0737 0.269 B_Memory L2
ENSG00000112303 VNN2 690897 sc-eQTL 5.07e-01 -0.064 0.0963 0.269 B_Memory L2
ENSG00000112306 RPS12 639787 sc-eQTL 1.09e-02 0.118 0.0457 0.269 B_Memory L2
ENSG00000118515 SGK1 -863756 sc-eQTL 4.90e-01 -0.0589 0.0851 0.269 B_Memory L2
ENSG00000146409 SLC18B1 641017 sc-eQTL 2.32e-01 -0.116 0.0966 0.269 B_Memory L2
ENSG00000028839 TBPL1 -497814 sc-eQTL 3.23e-01 0.0933 0.0941 0.269 B_Naive1 L2
ENSG00000079950 STX7 941158 sc-eQTL 4.25e-01 -0.0362 0.0453 0.269 B_Naive1 L2
ENSG00000112303 VNN2 690897 sc-eQTL 6.36e-01 0.0417 0.088 0.269 B_Naive1 L2
ENSG00000112306 RPS12 639787 sc-eQTL 5.86e-01 0.0273 0.0501 0.269 B_Naive1 L2
ENSG00000118515 SGK1 -863756 sc-eQTL 3.51e-01 -0.0732 0.0783 0.269 B_Naive1 L2
ENSG00000146409 SLC18B1 641017 sc-eQTL 3.51e-01 0.0903 0.0966 0.269 B_Naive1 L2
ENSG00000028839 TBPL1 -497814 sc-eQTL 8.62e-01 0.0175 0.1 0.27 B_Naive2 L2
ENSG00000079950 STX7 941158 sc-eQTL 5.28e-01 0.0337 0.0533 0.27 B_Naive2 L2
ENSG00000112303 VNN2 690897 sc-eQTL 5.87e-01 0.0533 0.0979 0.27 B_Naive2 L2
ENSG00000112306 RPS12 639787 sc-eQTL 3.80e-01 0.0455 0.0518 0.27 B_Naive2 L2
ENSG00000118515 SGK1 -863756 sc-eQTL 8.81e-02 -0.156 0.091 0.27 B_Naive2 L2
ENSG00000146409 SLC18B1 641017 sc-eQTL 8.51e-02 0.17 0.0983 0.27 B_Naive2 L2
ENSG00000028839 TBPL1 -497814 sc-eQTL 3.47e-01 -0.094 0.0997 0.275 CD4_CTL L2
ENSG00000079950 STX7 941158 sc-eQTL 3.79e-01 -0.0874 0.099 0.275 CD4_CTL L2
ENSG00000112303 VNN2 690897 sc-eQTL 9.71e-01 -0.00361 0.1 0.275 CD4_CTL L2
ENSG00000112306 RPS12 639787 sc-eQTL 3.92e-01 0.0396 0.0462 0.275 CD4_CTL L2
ENSG00000118515 SGK1 -863756 sc-eQTL 7.55e-02 -0.142 0.0796 0.275 CD4_CTL L2
ENSG00000146409 SLC18B1 641017 sc-eQTL 9.97e-01 0.000351 0.0933 0.275 CD4_CTL L2
ENSG00000028839 TBPL1 -497814 sc-eQTL 1.12e-01 0.131 0.0819 0.269 CD4_Naive L2
ENSG00000079950 STX7 941158 sc-eQTL 1.35e-01 -0.121 0.0804 0.269 CD4_Naive L2
ENSG00000112303 VNN2 690897 sc-eQTL 1.51e-01 -0.107 0.0745 0.269 CD4_Naive L2
ENSG00000112306 RPS12 639787 sc-eQTL 6.20e-01 0.0241 0.0485 0.269 CD4_Naive L2
ENSG00000118515 SGK1 -863756 sc-eQTL 1.03e-02 -0.152 0.0585 0.269 CD4_Naive L2
ENSG00000146409 SLC18B1 641017 sc-eQTL 4.39e-01 0.0724 0.0933 0.269 CD4_Naive L2
ENSG00000028839 TBPL1 -497814 sc-eQTL 1.35e-01 0.134 0.0896 0.269 CD4_TCM L2
ENSG00000079950 STX7 941158 sc-eQTL 6.13e-01 0.0459 0.0906 0.269 CD4_TCM L2
ENSG00000112303 VNN2 690897 sc-eQTL 3.69e-01 0.0804 0.0892 0.269 CD4_TCM L2
ENSG00000112306 RPS12 639787 sc-eQTL 6.72e-02 0.0846 0.046 0.269 CD4_TCM L2
ENSG00000118515 SGK1 -863756 sc-eQTL 3.56e-01 -0.0599 0.0647 0.269 CD4_TCM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 641017 sc-eQTL 9.19e-01 0.011 0.107 0.269 CD4_TCM L2
ENSG00000028839 TBPL1 -497814 sc-eQTL 2.20e-01 0.125 0.102 0.269 CD4_TEM L2
ENSG00000079950 STX7 941158 sc-eQTL 9.36e-01 -0.00818 0.102 0.269 CD4_TEM L2
ENSG00000112303 VNN2 690897 sc-eQTL 4.92e-01 0.0674 0.098 0.269 CD4_TEM L2
ENSG00000112306 RPS12 639787 sc-eQTL 7.19e-01 0.0145 0.0402 0.269 CD4_TEM L2
ENSG00000118515 SGK1 -863756 sc-eQTL 1.09e-01 -0.111 0.0687 0.269 CD4_TEM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 641017 sc-eQTL 9.58e-01 0.00523 0.0999 0.269 CD4_TEM L2
ENSG00000028839 TBPL1 -497814 sc-eQTL 8.21e-02 0.156 0.0891 0.269 CD8_CTL L2
ENSG00000079950 STX7 941158 sc-eQTL 1.96e-02 0.195 0.0828 0.269 CD8_CTL L2
ENSG00000112303 VNN2 690897 sc-eQTL 4.01e-01 0.0801 0.0951 0.269 CD8_CTL L2
ENSG00000112306 RPS12 639787 sc-eQTL 8.21e-01 0.0116 0.051 0.269 CD8_CTL L2
ENSG00000118515 SGK1 -863756 sc-eQTL 5.94e-03 -0.235 0.0846 0.269 CD8_CTL L2
ENSG00000146409 SLC18B1 641017 sc-eQTL 6.16e-01 0.0496 0.0988 0.269 CD8_CTL L2
ENSG00000028839 TBPL1 -497814 sc-eQTL 3.94e-01 -0.0804 0.0942 0.269 CD8_Naive L2
ENSG00000079950 STX7 941158 sc-eQTL 1.72e-01 0.137 0.1 0.269 CD8_Naive L2
ENSG00000112303 VNN2 690897 sc-eQTL 9.61e-01 0.00423 0.0867 0.269 CD8_Naive L2
ENSG00000112306 RPS12 639787 sc-eQTL 1.27e-01 0.0756 0.0494 0.269 CD8_Naive L2
ENSG00000118515 SGK1 -863756 sc-eQTL 1.88e-02 -0.146 0.0615 0.269 CD8_Naive L2
ENSG00000146409 SLC18B1 641017 sc-eQTL 3.35e-02 0.211 0.0986 0.269 CD8_Naive L2
ENSG00000028839 TBPL1 -497814 sc-eQTL 6.36e-01 -0.0503 0.106 0.273 CD8_TCM L2
ENSG00000079950 STX7 941158 sc-eQTL 9.23e-01 -0.00953 0.0983 0.273 CD8_TCM L2
ENSG00000112303 VNN2 690897 sc-eQTL 4.34e-01 0.0763 0.0974 0.273 CD8_TCM L2
ENSG00000112306 RPS12 639787 sc-eQTL 5.30e-01 0.0299 0.0475 0.273 CD8_TCM L2
ENSG00000118515 SGK1 -863756 sc-eQTL 7.28e-03 -0.21 0.0773 0.273 CD8_TCM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 641017 sc-eQTL 7.52e-01 0.033 0.104 0.273 CD8_TCM L2
ENSG00000028839 TBPL1 -497814 sc-eQTL 7.33e-02 -0.177 0.0982 0.26 CD8_TEM L2
ENSG00000079950 STX7 941158 sc-eQTL 3.14e-01 -0.109 0.108 0.26 CD8_TEM L2
ENSG00000112303 VNN2 690897 sc-eQTL 1.24e-01 -0.165 0.107 0.26 CD8_TEM L2
ENSG00000112306 RPS12 639787 sc-eQTL 6.22e-01 -0.0286 0.0578 0.26 CD8_TEM L2
ENSG00000118515 SGK1 -863756 sc-eQTL 6.04e-01 -0.0492 0.0947 0.26 CD8_TEM L2
ENSG00000146409 SLC18B1 641017 sc-eQTL 9.23e-01 0.0106 0.109 0.26 CD8_TEM L2
ENSG00000028839 TBPL1 -497814 sc-eQTL 5.18e-01 -0.0648 0.1 0.271 MAIT L2
ENSG00000079950 STX7 941158 sc-eQTL 4.27e-01 0.0756 0.095 0.271 MAIT L2
ENSG00000112303 VNN2 690897 sc-eQTL 6.20e-01 0.048 0.0967 0.271 MAIT L2
ENSG00000112306 RPS12 639787 sc-eQTL 6.52e-01 0.0215 0.0476 0.271 MAIT L2
ENSG00000118515 SGK1 -863756 sc-eQTL 3.88e-01 -0.0579 0.0669 0.271 MAIT L2
ENSG00000146409 SLC18B1 641017 sc-eQTL 7.37e-01 -0.0335 0.0998 0.271 MAIT L2
ENSG00000028839 TBPL1 -497814 sc-eQTL 3.07e-01 0.109 0.106 0.269 NK_CD56bright L2
ENSG00000079950 STX7 941158 sc-eQTL 5.64e-01 -0.0569 0.0985 0.269 NK_CD56bright L2
ENSG00000112303 VNN2 690897 sc-eQTL 3.15e-01 -0.101 0.0998 0.269 NK_CD56bright L2
ENSG00000112306 RPS12 639787 sc-eQTL 4.00e-01 0.0469 0.0557 0.269 NK_CD56bright L2
ENSG00000118515 SGK1 -863756 sc-eQTL 6.57e-01 0.037 0.0833 0.269 NK_CD56bright L2
ENSG00000028839 TBPL1 -497814 sc-eQTL 9.50e-01 0.00559 0.0893 0.272 NK_CD56dim L2
ENSG00000079950 STX7 941158 sc-eQTL 1.60e-01 0.115 0.0813 0.272 NK_CD56dim L2
ENSG00000112303 VNN2 690897 sc-eQTL 5.74e-01 0.0575 0.102 0.272 NK_CD56dim L2
ENSG00000112306 RPS12 639787 sc-eQTL 2.82e-01 0.0436 0.0404 0.272 NK_CD56dim L2
ENSG00000118515 SGK1 -863756 sc-eQTL 6.04e-02 -0.168 0.0891 0.272 NK_CD56dim L2
ENSG00000028839 TBPL1 -497814 sc-eQTL 7.65e-01 0.0328 0.109 0.269 NK_HLA L2
ENSG00000079950 STX7 941158 sc-eQTL 4.14e-01 0.0814 0.0995 0.269 NK_HLA L2
ENSG00000112303 VNN2 690897 sc-eQTL 6.30e-01 -0.0487 0.101 0.269 NK_HLA L2
ENSG00000112306 RPS12 639787 sc-eQTL 3.60e-01 0.043 0.0469 0.269 NK_HLA L2
ENSG00000118515 SGK1 -863756 sc-eQTL 6.34e-01 0.0443 0.0928 0.269 NK_HLA L2
ENSG00000028839 TBPL1 -497814 sc-eQTL 3.48e-01 -0.0853 0.0906 0.272 NK_cytokine L2
ENSG00000079950 STX7 941158 sc-eQTL 9.63e-01 -0.00407 0.088 0.272 NK_cytokine L2
ENSG00000112303 VNN2 690897 sc-eQTL 4.86e-01 -0.0689 0.0988 0.272 NK_cytokine L2
ENSG00000112306 RPS12 639787 sc-eQTL 5.56e-01 0.0316 0.0536 0.272 NK_cytokine L2
ENSG00000118515 SGK1 -863756 sc-eQTL 3.44e-01 -0.0846 0.0891 0.272 NK_cytokine L2
ENSG00000028839 TBPL1 -497814 sc-eQTL 2.82e-01 -0.131 0.121 0.267 PB L2
ENSG00000079950 STX7 941158 sc-eQTL 9.75e-01 0.00276 0.0864 0.267 PB L2
ENSG00000112303 VNN2 690897 sc-eQTL 2.14e-01 0.131 0.105 0.267 PB L2
ENSG00000112306 RPS12 639787 sc-eQTL 7.61e-01 0.0183 0.0599 0.267 PB L2
ENSG00000118515 SGK1 -863756 sc-eQTL 1.12e-01 -0.153 0.0958 0.267 PB L2
ENSG00000146409 SLC18B1 641017 sc-eQTL 8.87e-01 0.016 0.112 0.267 PB L2
ENSG00000028839 TBPL1 -497814 sc-eQTL 4.17e-01 0.0813 0.1 0.267 Pro_T L2
ENSG00000079950 STX7 941158 sc-eQTL 2.87e-01 -0.0952 0.0892 0.267 Pro_T L2
ENSG00000112303 VNN2 690897 sc-eQTL 8.04e-01 0.0238 0.0959 0.267 Pro_T L2
ENSG00000112306 RPS12 639787 sc-eQTL 3.17e-01 -0.0363 0.0362 0.267 Pro_T L2
ENSG00000118515 SGK1 -863756 sc-eQTL 4.46e-01 -0.0554 0.0726 0.267 Pro_T L2
ENSG00000146409 SLC18B1 641017 sc-eQTL 4.53e-01 0.0704 0.0938 0.267 Pro_T L2
ENSG00000028839 TBPL1 -497814 sc-eQTL 7.62e-01 -0.0324 0.107 0.269 Treg L2
ENSG00000079950 STX7 941158 sc-eQTL 4.83e-02 -0.198 0.0996 0.269 Treg L2
ENSG00000112303 VNN2 690897 sc-eQTL 2.66e-01 0.0941 0.0843 0.269 Treg L2
ENSG00000112306 RPS12 639787 sc-eQTL 7.13e-01 -0.0138 0.0374 0.269 Treg L2
ENSG00000118515 SGK1 -863756 sc-eQTL 4.27e-01 -0.0627 0.0787 0.269 Treg L2
ENSG00000146409 SLC18B1 641017 sc-eQTL 9.35e-01 -0.00856 0.106 0.269 Treg L2
ENSG00000028839 TBPL1 -497814 sc-eQTL 8.84e-01 0.0155 0.107 0.256 cDC L2
ENSG00000079950 STX7 941158 sc-eQTL 8.40e-01 -0.0169 0.0837 0.256 cDC L2
ENSG00000093134 VNN3 719591 sc-eQTL 4.88e-01 0.0577 0.083 0.256 cDC L2
ENSG00000112299 VNN1 740301 sc-eQTL 3.06e-01 0.1 0.0974 0.256 cDC L2
ENSG00000112303 VNN2 690897 sc-eQTL 6.08e-01 -0.0489 0.0951 0.256 cDC L2
ENSG00000112306 RPS12 639787 sc-eQTL 9.98e-02 0.0772 0.0466 0.256 cDC L2
ENSG00000118515 SGK1 -863756 sc-eQTL 3.19e-02 -0.169 0.0782 0.256 cDC L2
ENSG00000146409 SLC18B1 641017 sc-eQTL 4.11e-01 -0.0765 0.0929 0.256 cDC L2
ENSG00000286438 AL591115.1 351228 sc-eQTL 2.36e-01 0.0881 0.0741 0.256 cDC L2
ENSG00000286887 AL355881.1 -841945 sc-eQTL 2.78e-01 -0.0993 0.0912 0.256 cDC L2
ENSG00000028839 TBPL1 -497814 sc-eQTL 9.57e-01 -0.00463 0.0866 0.269 cMono_IL1B L2
ENSG00000079950 STX7 941158 sc-eQTL 3.96e-01 0.0558 0.0656 0.269 cMono_IL1B L2
ENSG00000093134 VNN3 719591 sc-eQTL 1.30e-01 0.14 0.0923 0.269 cMono_IL1B L2
ENSG00000112299 VNN1 740301 sc-eQTL 1.19e-01 -0.146 0.0931 0.269 cMono_IL1B L2
ENSG00000112303 VNN2 690897 sc-eQTL 3.60e-01 0.0686 0.0748 0.269 cMono_IL1B L2
ENSG00000112306 RPS12 639787 sc-eQTL 6.31e-01 0.02 0.0416 0.269 cMono_IL1B L2
ENSG00000118515 SGK1 -863756 sc-eQTL 2.21e-01 -0.0758 0.0618 0.269 cMono_IL1B L2
ENSG00000146409 SLC18B1 641017 sc-eQTL 7.60e-01 0.0245 0.0802 0.269 cMono_IL1B L2
ENSG00000286887 AL355881.1 -841945 sc-eQTL 2.95e-01 -0.0874 0.0833 0.269 cMono_IL1B L2
ENSG00000028839 TBPL1 -497814 sc-eQTL 2.59e-01 0.11 0.0971 0.269 cMono_S100A L2
ENSG00000079950 STX7 941158 sc-eQTL 4.15e-01 -0.0573 0.0702 0.269 cMono_S100A L2
ENSG00000093134 VNN3 719591 sc-eQTL 1.59e-02 0.211 0.0867 0.269 cMono_S100A L2
ENSG00000112299 VNN1 740301 sc-eQTL 1.92e-01 -0.124 0.095 0.269 cMono_S100A L2
ENSG00000112303 VNN2 690897 sc-eQTL 2.51e-01 0.0717 0.0623 0.269 cMono_S100A L2
ENSG00000112306 RPS12 639787 sc-eQTL 7.48e-01 0.0145 0.045 0.269 cMono_S100A L2
ENSG00000118515 SGK1 -863756 sc-eQTL 9.37e-02 -0.0861 0.0511 0.269 cMono_S100A L2
ENSG00000146409 SLC18B1 641017 sc-eQTL 6.94e-02 0.151 0.0826 0.269 cMono_S100A L2
ENSG00000286887 AL355881.1 -841945 sc-eQTL 1.19e-01 -0.127 0.081 0.269 cMono_S100A L2
ENSG00000028839 TBPL1 -497814 sc-eQTL 6.31e-01 0.0629 0.131 0.255 gdT L2
ENSG00000079950 STX7 941158 sc-eQTL 9.11e-01 0.0126 0.112 0.255 gdT L2
ENSG00000112303 VNN2 690897 sc-eQTL 3.73e-01 -0.111 0.124 0.255 gdT L2
ENSG00000112306 RPS12 639787 sc-eQTL 8.79e-01 0.00724 0.0474 0.255 gdT L2
ENSG00000118515 SGK1 -863756 sc-eQTL 4.50e-03 -0.251 0.0869 0.255 gdT L2
ENSG00000146409 SLC18B1 641017 sc-eQTL 8.92e-01 -0.0166 0.122 0.255 gdT L2
ENSG00000028839 TBPL1 -497814 sc-eQTL 8.56e-01 0.0181 0.0998 0.264 intMono L2
ENSG00000079950 STX7 941158 sc-eQTL 8.22e-01 -0.0215 0.0954 0.264 intMono L2
ENSG00000093134 VNN3 719591 sc-eQTL 5.13e-02 0.187 0.0954 0.264 intMono L2
ENSG00000112299 VNN1 740301 sc-eQTL 9.75e-02 -0.157 0.0945 0.264 intMono L2
ENSG00000112303 VNN2 690897 sc-eQTL 2.83e-01 -0.104 0.0965 0.264 intMono L2
ENSG00000112306 RPS12 639787 sc-eQTL 9.32e-01 -0.00359 0.0421 0.264 intMono L2
ENSG00000118515 SGK1 -863756 sc-eQTL 7.13e-01 -0.026 0.0707 0.264 intMono L2
ENSG00000146409 SLC18B1 641017 sc-eQTL 2.00e-02 -0.237 0.101 0.264 intMono L2
ENSG00000286887 AL355881.1 -841945 sc-eQTL 1.84e-01 -0.13 0.0976 0.264 intMono L2
ENSG00000028839 TBPL1 -497814 sc-eQTL 9.56e-01 -0.00567 0.103 0.267 ncMono L2
ENSG00000079950 STX7 941158 sc-eQTL 7.77e-01 0.0198 0.0699 0.267 ncMono L2
ENSG00000093134 VNN3 719591 sc-eQTL 6.74e-01 0.0415 0.0986 0.267 ncMono L2
ENSG00000112299 VNN1 740301 sc-eQTL 4.11e-01 -0.0806 0.0978 0.267 ncMono L2
ENSG00000112303 VNN2 690897 sc-eQTL 5.05e-01 -0.0629 0.0941 0.267 ncMono L2
ENSG00000112306 RPS12 639787 sc-eQTL 7.73e-01 0.0136 0.0472 0.267 ncMono L2
ENSG00000118515 SGK1 -863756 sc-eQTL 2.22e-01 -0.0815 0.0666 0.267 ncMono L2
ENSG00000146409 SLC18B1 641017 sc-eQTL 7.56e-01 0.026 0.0834 0.267 ncMono L2
ENSG00000286887 AL355881.1 -841945 sc-eQTL 3.32e-01 -0.0856 0.088 0.267 ncMono L2
ENSG00000028839 TBPL1 -497814 sc-eQTL 6.68e-01 0.0499 0.116 0.249 pDC L2
ENSG00000079950 STX7 941158 sc-eQTL 1.85e-01 0.103 0.0771 0.249 pDC L2
ENSG00000093134 VNN3 719591 sc-eQTL 4.69e-01 0.0565 0.0779 0.249 pDC L2
ENSG00000112299 VNN1 740301 sc-eQTL 3.67e-01 0.0717 0.0792 0.249 pDC L2
ENSG00000112303 VNN2 690897 sc-eQTL 1.64e-03 0.293 0.0915 0.249 pDC L2
ENSG00000112306 RPS12 639787 sc-eQTL 5.40e-01 0.0399 0.065 0.249 pDC L2
ENSG00000118515 SGK1 -863756 sc-eQTL 7.99e-01 -0.0169 0.0661 0.249 pDC L2
ENSG00000146409 SLC18B1 641017 sc-eQTL 7.43e-01 -0.0316 0.0963 0.249 pDC L2
ENSG00000286438 AL591115.1 351228 sc-eQTL 9.86e-01 0.00164 0.0922 0.249 pDC L2
ENSG00000286887 AL355881.1 -841945 sc-eQTL 8.25e-01 -0.0182 0.0818 0.249 pDC L2
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
MAF
Cell type
Cluster resolution
ENSG00000028839 TBPL1 -497814 sc-eQTL 2.65e-01 -0.113 0.101 0.269 B_Memory LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 941158 sc-eQTL 6.20e-01 0.0278 0.056 0.269 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 690897 sc-eQTL 9.73e-01 0.00298 0.0886 0.269 B_Memory LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 639787 sc-eQTL 1.13e-01 0.0799 0.0502 0.269 B_Memory LOneK1K
ENSG00000118515 SGK1 -863756 sc-eQTL 1.62e-02 -0.189 0.0778 0.269 B_Memory LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 641017 sc-eQTL 5.50e-01 -0.0554 0.0925 0.269 B_Memory LOneK1K
ENSG00000028839 TBPL1 -497814 sc-eQTL 6.35e-01 0.0452 0.095 0.269 B_Naive LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 941158 sc-eQTL 5.60e-01 -0.025 0.0428 0.269 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 690897 sc-eQTL 5.17e-01 0.0539 0.0831 0.269 B_Naive LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 639787 sc-eQTL 4.41e-01 0.0388 0.0503 0.269 B_Naive LOneK1K
ENSG00000118515 SGK1 -863756 sc-eQTL 1.29e-01 -0.118 0.0775 0.269 B_Naive LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 641017 sc-eQTL 1.62e-01 0.133 0.0945 0.269 B_Naive LOneK1K
ENSG00000028839 TBPL1 -497814 sc-eQTL 6.28e-01 0.0381 0.0786 0.269 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 941158 sc-eQTL 6.65e-01 0.0237 0.0547 0.269 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000093134 VNN3 719591 sc-eQTL 4.56e-02 0.178 0.0883 0.269 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112299 VNN1 740301 sc-eQTL 8.15e-02 -0.162 0.0923 0.269 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 690897 sc-eQTL 4.33e-01 0.0482 0.0614 0.269 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 639787 sc-eQTL 6.81e-01 0.0174 0.0421 0.269 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000118515 SGK1 -863756 sc-eQTL 1.32e-01 -0.0865 0.0571 0.269 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 641017 sc-eQTL 2.91e-01 0.0792 0.0748 0.269 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000286887 AL355881.1 -841945 sc-eQTL 2.32e-01 -0.094 0.0784 0.269 CD14_Mono LOneK1K
ENSG00000028839 TBPL1 -497814 sc-eQTL 5.75e-01 0.0571 0.102 0.269 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 941158 sc-eQTL 6.67e-01 0.0289 0.0671 0.269 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000093134 VNN3 719591 sc-eQTL 4.98e-02 0.193 0.0979 0.269 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112299 VNN1 740301 sc-eQTL 5.05e-01 -0.0653 0.0978 0.269 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 690897 sc-eQTL 4.77e-01 -0.0657 0.0922 0.269 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 639787 sc-eQTL 8.58e-01 0.00701 0.0392 0.269 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000118515 SGK1 -863756 sc-eQTL 4.09e-01 -0.0489 0.0592 0.269 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000146409 SLC18B1 641017 sc-eQTL 1.85e-01 -0.126 0.0947 0.269 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000286887 AL355881.1 -841945 sc-eQTL 2.19e-02 -0.196 0.0849 0.269 CD16_Mono LOneK1K
ENSG00000028839 TBPL1 -497814 sc-eQTL 6.25e-01 -0.0404 0.0824 0.272 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000079950 STX7 941158 sc-eQTL 9.45e-02 0.129 0.0769 0.272 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112303 VNN2 690897 sc-eQTL 8.10e-01 0.0236 0.098 0.272 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000112306 RPS12 639787 sc-eQTL 3.10e-01 0.0406 0.0399 0.272 NK_CD56dim LOneK1K
ENSG00000118515 SGK1 -863756 sc-eQTL 8.49e-02 -0.142 0.0821 0.272 NK_CD56dim LOneK1K

Statistical fine-mapping results from Japan COVID-19 Task Force
(Shown only for PIP>0.001)
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Category
P-value
Effect Size
Effect Size (se)
PIP (SuSiE)
PIP (FINEMAP)
MAF
ENSG00000112299 VNN1 740301 pQTL 0.0019 -0.124 0.0398 0.0 0.0 0.233

Expression Modifier Score(EMS) for GTEx 49tissues
Gene ID
Gene Symbol
TSS Distance
Whole Blood
Muscle Skeletal
Liver
Brain Cerebellum
Prostate
Spleen
Skin Sun Exposed Lower leg
Artery Coronary
Esophagus Muscularis
Esophagus Gastroesophageal Junction
Artery Tibial
Heart Atrial Appendage
Nerve Tibial
Heart Left Ventricle
Adrenal Gland
Adipose Visceral Omentum
Pancreas
Lung
Pituitary
Brain Nucleus accumbens basal ganglia
Colon Transverse
Adipose Subcutaneous
Esophagus Mucosa
Brain Cortex
Thyroid
Stomach
Breast Mammary Tissue
Colon Sigmoid
Skin Not Sun Exposed Suprapubic
Testis
Artery Aorta
Brain Amygdala
Brain Anterior cingulate cortex BA24
Brain Caudate basal ganglia
Brain Cerebellar Hemisphere
Brain Frontal Cortex BA9
Brain Hippocampus
Brain Hypothalamus
Brain Putamen basal ganglia
Brain Spinal cord cervical c-1
Brain Substantia nigra
Cells Cultured fibroblasts
Cells EBV-transformed lymphocytes
Kidney Cortex
Minor Salivary Gland
Ovary
Small Intestine Terminal Ileum
Uterus
Vagina